2023
Journal articles
- titre
- Large satellite constellations and space debris: exploratory analysis of strategic management of the space commons ⋆
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps, Georges Zaccour
- article
- European Journal of Operational Research, 2023
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-
- titre
- Impulsive modelling of rust dynamics and predator releases for biocontrol
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- Mathematical Biosciences, 2023, pp.108968. ⟨10.1016/j.mbs.2023.108968⟩
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-
- titre
- Optimizing resource recovery from wastewater with algae-bacteria membrane reactors
- auteur
- Francesca Casagli, Fabrice Béline, Elena Ficara, Olivier Bernard
- article
- Chemical Engineering Journal, 2023, 451, pp.138488. ⟨10.1016/j.cej.2022.138488⟩
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-
- titre
- Life cycle assessment of an innovative rotating biofilm technology for microalgae production: An eco-design approach
- auteur
- Diego Penaranda, Hubert Bonnefond, Freddy Guihéneuf, Marjorie Morales, Olivier Bernard
- article
- Journal of Cleaner Production, 2023, 384, pp.135600. ⟨10.1016/j.jclepro.2022.135600⟩
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-
- titre
- A universal dynamical metabolic model representing mixotrophic growth of Chlorella sp. on wastes
- auteur
- Bruno Assis Pessi, Caroline Baroukh, Anais Bacquet, Olivier Bernard
- article
- Water Research, 2023, 229, pp.119388. ⟨10.1016/j.watres.2022.119388⟩
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-
- titre
- Optimal Control of Coffee Berry Borers: Synergy Between Bio-insecticide and Traps
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Berge Tsanou, Samuel Bowong
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2023, ⟨10.1007/s10957-022-02151-7⟩
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-
- titre
- Theoretical growth rate of microalgae under high/low-flashing light
- auteur
- Ignacio Fierro, Liu-Di Lu, Olivier Bernard
- article
- Journal of Mathematical Biology, In press
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Stability analysis of a bacterial growth model through computer algebra
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo, Mohab Safey El Din, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2023
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-
2022
Journal articles
- titre
- Simulating biotechnological processes affected by meteorology: Application to algae–bacteria systems
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- Journal of Cleaner Production, 2022, 377, pp.134190. ⟨10.1016/j.jclepro.2022.134190⟩
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-
- titre
- Optimal production of microalgae in the presence of grazers
- auteur
- Carlos Martínez, Bruno Assis Pessi, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2022, 118, pp.153-164. ⟨10.1016/j.jprocont.2022.09.001⟩
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-
- titre
- A half-century of research on microalgae-bacteria for wastewater treatment
- auteur
- Jineth Arango Oviedo, Raúl Muñoz, Andrés Donoso-Bravo, Olivier Bernard, Francesca Casagli, David Jeison
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2022, 67, pp.102828. ⟨10.1016/j.algal.2022.102828⟩
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-
- titre
- Coupling live-cell imaging and in situ isolation of the same single cell to profile the transient states of predicted drug-tolerant cells
- auteur
- Benjamin Bian, Agnès Paquet, Marie-Jeanne Arguel, Mickael Meyer, Ludovic Peyre, Asma Chalabi, Marielle Péré, Kevin Lebrigand, Rainer Waldmann, Pascal Barbry, Paul Hofman, Jérémie Roux
- article
- STAR Protocols, 2022, 3 (3), pp.101600. ⟨10.1016/j.xpro.2022.101600⟩
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-
- titre
- The paradoxes hidden behind the Droop model highlighted by a metabolic approach
- auteur
- Caroline Baroukh, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Frontiers in Plant Science, 2022, 13, 16 p. ⟨10.3389/fpls.2022.941230⟩
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-
- titre
- How Heat Transfer Indirectly Affects Performance of Algae-Bacteria Raceways
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- Microorganisms, 2022, 10 (8), pp.1515. ⟨10.3390/microorganisms10081515⟩
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-
- titre
- Coupling heat transfer modelling to ALBA model for full predictions from meteorology
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2022, 55 (20), pp.558-563. ⟨10.1016/j.jclepro.2022.134190⟩
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-
- titre
- Cycle dynamics and synchronization in a coupled network of peripheral circadian clocks
- auteur
- Odile Burckard, Michèle Teboul, Franck Delaunay, Madalena Chaves
- article
- Interface Focus, 2022, 12 (3), pp.20210087. ⟨10.1098/rsfs.2021.0087⟩
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-
- titre
- The architecture and metabolic traits of monospecific photosynthetic biofilms studied in a custom flow‐through system
- auteur
- Andrea Fanesi, Thierry Martin, Cyril Breton, Olivier Bernard, Romain Briandet, Filipa Lopes
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2022, 119, pp. 2459-2470. ⟨10.1002/bit.28147⟩
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-
- titre
- Dynamical Darwinian selection of a more productive strain of Tisochrysis lutea
- auteur
- Hubert Bonnefond, Y. Lie, T. Lacour, B. Saint-Jean, G. Carrier, E. Pruvost, A. Talec, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2022, 65, pp.102743. ⟨10.1016/j.algal.2022.102743⟩
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-
- titre
- Host mixtures for plant disease control: Benefits from pathogen selection and immune priming
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Evolutionary Applications, 2022, ⟨10.1111/eva.13386⟩
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-
- titre
- Optimal periodic resource allocation in reactive dynamical systems: Application to microalgal production
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Julien Salomon
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2022, ⟨10.1002/rnc.6171⟩
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-
- titre
- Ensemble qubit controllability with a single control via adiabatic and rotating wave approximations
- auteur
- Rémi Robin, Nicolas Augier, Ugo Boscain, Mario Sigalotti
- article
- Journal of Differential Equations, 2022, 318, ⟨10.1016/j.jde.2022.02.042⟩
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-
- titre
- Turnpike property in optimal microbial metabolite production
- auteur
- Jean-Baptiste Caillau, Walid Djema, Jean-Luc Gouzé, Sofya Maslovskaya, Jean-Baptiste Pomet
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2022, ⟨10.1007/s10957-022-02023-0⟩
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-
- titre
- Understanding photosynthetic biofilm productivity and structure through 2D simulation
- auteur
- Bastien Polizzi, Andrea Fanesi, Filipa Lopes, Magali Ribot, Olivier Bernard
- article
- PLoS Computational Biology, 2022, 18 (4), pp.e1009904. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009904⟩
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-
- titre
- Optimal Darwinian Selection of Microorganisms with Internal Storage
- auteur
- Walid Djema, Térence Bayen, Olivier Bernard
- article
- Processes, 2022, 10 (3), pp.461. ⟨10.3390/pr10030461⟩
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-
- titre
- Time-optimal control of piecewise affine bistable gene-regulatory networks
- auteur
- Nicolas Augier, Agustín Gabriel Yabo
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2022, ⟨10.1002/rnc.6012⟩
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-
- titre
- Does temperature shift justify microalgae production under greenhouse?
- auteur
- Bruno Assis Pessi, Eric Pruvost, Amélie Talec, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2022, 61, pp.102579. ⟨10.1016/j.algal.2021.102579⟩
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-
- titre
- Effective adiabatic control of a decoupled Hamiltonian obtained by rotating wave approximation
- auteur
- Nicolas Augier, Ugo Boscain, Mario Sigalotti
- article
- Automatica, 2022, 136, pp.110034. ⟨10.1016/j.automatica.2021.110034⟩
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-
- titre
- Qualitative control strategies for synchronization of bistable gene regulatory networks
- auteur
- Nicolas Augier, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- IEEE Transactions on Automatic Control, 2022
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-
- titre
- Improving sustainable crop protection using population genetics concepts
- auteur
- Méline Saubin, Clémentine Louet, Lydia Bousset, Frédéric Fabre, Isabelle Fudal, Frédéric Grognard, Frédéric M. Hamelin, Ludovic Mailleret, Solenn Stoeckel, Suzanne Touzeau, Benjamin Petre, Fabien Halkett
- article
- Molecular Ecology, In press, ⟨10.1111/mec.16634⟩
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-
- titre
- Mathematical modelling of a pest in an age-structured crop model: The coffee berry borer case
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou, Frédéric Grognard, Samuel Bowong
- article
- Applied Mathematical Modelling, 2022, 110, pp.193-206. ⟨10.1016/j.apm.2022.05.042⟩
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-
- titre
- Up and to the light: intra- and interspecific variability of photo- and geo-tactic oviposition preferences in genus Trichogramma
- auteur
- Victor Burte, Guy Perez, Faten Ayed, Géraldine Groussier, Ludovic Mailleret, Louise van Oudenhove, Vincent Calcagno
- article
- Peer Community Journal, 2022, 2, pp.e3. ⟨10.24072/pcjournal.78⟩
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-
- titre
- Optimal optical conditions for Microalgal production in photobioreactors
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu
- article
- Journal of Process Control, 2022, 112, pp.69-77. ⟨10.1016/j.jprocont.2022.03.001⟩
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-
- titre
- Dynamical analysis and optimization of a generalized resource allocation model of microbial growth
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong, Francis Mairet
- article
- SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2022, 21 (1), pp.137-165. ⟨10.1137/21M141097X⟩
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-
- titre
- Weak synchronization and convergence in coupled genetic regulatory networks: Applications to damped oscillators and multistable circuits
- auteur
- Nicolas Augier, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2022
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-
Conference papers
- titre
- Analyzing single-cell trajectories with augmented machine learning methods predicts cancer drugs response in live-cell microscopy assays
- auteur
- Marielle Péré, Diego Oyarzun, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- ICSB 2022 - 21th international conference on systems biology, Oct 2022, Berlin, Germany
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-
- titre
- Bifurcation analysis in a coffee leaf rust epidemiological model
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- 12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Sep 2022, Heidelberg, Germany
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-
- titre
- Host mixtures for plant disease control: benefits from pathogen selection and immune priming
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Frédéric M. Hamelin
- article
- 12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Sep 2022, Heidelberg, Germany
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-
- titre
- Optimal impulsive control of coffee berry borers in a berry age-structured epidemiological model
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Berge Tsanou, Samuel Bowong, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard
- article
- CARI'2022 - Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Sep 2022, Tunis, Tunisia
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-
- titre
- Modeling isogenic cancer cell response upon varying TRAIL stimulations to decipher the kinetic determinants of cell fate decision
- auteur
- Marielle Péré, Diego A. Oyarzun, Jérémie Roux, Madalena Chaves
- article
- Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE), Aug 2022, Cambridge, Massachusetts, United States
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-
- titre
- Optimal allocation of bacterial resources in fed-batch reactors
- auteur
- Agustin Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2022 European Control Conference (ECC), Jul 2022, London, United Kingdom. pp.1466-1471, ⟨10.23919/ECC55457.2022.9838346⟩
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-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-pest interactions: the coffee berry borer
- auteur
- Frédéric Grognard, Samuel Bowong, Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou
- article
- MPDEE 2022 - Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Jun 2022, Torino, Italy
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-
- titre
- Modeling isogenic cancer cell response upon TRAIL treatment in multi-omics studies
- auteur
- Marielle Péré, Asma Chalabi, Jérémie Roux
- article
- Multiple facets of RNA in development and disease conference, Signalife Labex community, Mar 2022, Nice, France
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-
- titre
- Model of Bacteria Mutualism in a Chemostat: Analysis and Optimization with Interval Detector
- auteur
- Juan Carlos Arceo, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2022 - Conference on Decision and Control, 2022, Cancun, Mexico
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-
Book sections
- titre
- Augmentative biological control using entomophagous arthropods
- auteur
- Alexandre Bout, Nicolas Ris, Cécilia Multeau, Ludovic Mailleret
- article
- Xavier Fauvergue; Adrien Rusch; Matthieu Barret; Marc Bardin; Emmanuelle Jacquin-Joly; Thibaut Malausa; Christian Lannou. Extended Biocontrol, Springer Dordrecht, pp.43-53, 2022, 978-94-024-2150-7. ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_4⟩
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-
- titre
- Anticiper les impacts du changement climatique sur la qualité des fruits et le rendement, l’apport de la modélisation
- auteur
- Hélène Gautier, Valentina Baldazzi, Nadia Bertin, G. Vercambre, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Zhanwu Dai, Laurent Julhia, Olivier Pailly
- article
- Quae. Les productions fruitières à l’heure du changement climatique : risques et opportunités en régions tempérées, chapitre 9, Quae, 2022, 9782759232512Qua
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-
Poster communications
- titre
- Integrating machine learning methods to single-cell experimental workflow increases throughput and accuracy for target identification in immuno-oncology
- auteur
- Marielle Péré, Asma Chalabi, Diego Oyarzun, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- Sophia Summit AI, Nov 2022, Sophia Antipolis, France
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-
- titre
- Integrating machine learning methods to single cell signaling analyses increases throughput and accuracy for target identification in immuno-oncology
- auteur
- Marielle Péré, Asma Chalabi, Diego Oyarzun, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- 5th Signalife Labex Meeting, Nov 2022, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Coupling and synchronization of peripheral circadian clocks
- auteur
- Odile Burckard, Michèle Teboul, Franck Delaunay, Madalena Chaves
- article
- 2022 Labex Signalife Meeting, Nov 2022, Nice, France
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-
- titre
- Sterile insect technique against the medfly: modelling, calibration and effect of residual fertility
- auteur
- Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
- article
- ECMTB 2022 - 12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Sep 2022, Heidelberg, Germany.
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-
- titre
- Modelling cell response to cancer drug treatment identifies dynamic features of efficient cell death initiation, enabling prediction and control of therapeutic response heterogeneity
- auteur
- Marielle Péré, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- inSiDE seminars (Signaling Dynamics and Encoding,)Connecting scientists interested in single-cell signaling dynamics, Jun 2022, Online, France
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-
Theses
- titre
- Modelling, analysis and control of coffee berry borer
- auteur
- Yves Fotso Fotso
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. Université de Dschang (Cameroun), 2022. English. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Optimal bacterial resource allocation strategies in batch processing
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Resource allocation accounts for the large variability of rate-yield phenotypes across bacterial strains
- auteur
- Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Tomas Gedeon, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
- titre
- Landscape connectivity alters the evolution of density-dependent dispersal during pushed range expansions
- auteur
- Maxime Dahirel, Aline Bertin, Vincent Calcagno, Camille Duraj, Simon Fellous, Géraldine Groussier, Eric Lombaert, Ludovic Mailleret, Anaël Marchand, Elodie Vercken
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal protein production by a synthetic microbial consortium: Coexistence, distribution of labor, and syntrophy
- auteur
- Carlos Martinez, Eugenio Cinquemani, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
2021
Journal articles
- titre
- Modelling interference between vectors of non-persistently transmitted plant viruses to identify effective control strategies
- auteur
- Marta Zaffaroni, Loup Rimbaud, Ludovic Mailleret, Nik Cunniffe, Daniele Bevacqua
- article
- PLoS Computational Biology, 2021, 17 (12), pp.e1009727. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009727⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- State observation in microbial consortia: A case study on a synthetic producer‐cleaner consortium
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé, Eugenio Cinquemani
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2021, pp.1-12. ⟨10.1002/rnc.5945⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Two-level modeling approach to identify the regulatory dynamics capturing drug response heterogeneity in single-cells
- auteur
- Madalena Chaves, Luis Gomes-Pereira, Jérémie Roux
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-99943-0⟩
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-
- titre
- When expansion stalls: an extension to the concept of range pinning in ecology
- auteur
- Thibaut Morel‐journel, Marjorie Haond, Laurent Lamy, David Muru, Lionel Roques, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Ecography, 2021, ⟨10.1111/ecog.06018⟩
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-
- titre
- When is a Matrix of Dimension 3 Similar to a Metzler Matrix ? Application to Interval Observer Design
- auteur
- Frederic Mazenc, Olivier Bernard
- article
- IEEE Transactions on Automatic Control, 2021, pp.1-1. ⟨10.1109/TAC.2021.3123245⟩
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-
- titre
- Food and habitat supplementation promotes predatory mites and enhances pest control
- auteur
- Lucas Etienne, Cécile Bresch, Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret
- article
- Biological Control, 2021, 159, pp.104604. ⟨10.1016/j.biocontrol.2021.104604⟩
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-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and immune priming to minimize disease prevalence in host mixtures: a model
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Florence Val, Didier Andrivon, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Phytopathology, 2021, 111 (7), pp.1219-1227. ⟨10.1094/PHYTO-09-20-0429-R⟩
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-
- titre
- Microalgal lipids: A review of lipids potential and quantification for 95 phytoplankton species
- auteur
- Marjorie Morales, Claude Aflalo, Olivier Bernard
- article
- Biomass and Bioenergy, 2021, 150, pp.106108. ⟨10.1016/j.biombioe.2021.106108⟩
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-
- titre
- Acquisition of TCF3 and CCND3 Mutations and Transformation to Burkitt Lymphoma in a Case of B-Cell Prolymphocytic Leukemia
- auteur
- M’boyba Diop, Florence Nguyen-Khac, Simon Bouzy, Damien Roos-Weil, Clotilde Bravetti, Agathe Maillon, M 'Boyba Diop, Cécile Doualle, Nathalie Droin, Olivier Bernard, Elise Chapiro
- article
- HemaSphere, 2021, 5 (5), pp.e563. ⟨10.1097/HS9.0000000000000563⟩
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-
- titre
- Optimal and sustainable management of a soilborne banana pest
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Frédéric Grognard, Jean Jules Tewa, Suzanne Touzeau
- article
- Applied Mathematics and Computation, 2021, 397, pp.125883. ⟨10.1016/j.amc.2020.125883⟩
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-
- titre
- Shifts from pulled to pushed range expansions caused by reduction of landscape connectivity
- auteur
- Maxime Dahirel, Aline Bertin, Marjorie Haond, Aurélie Blin, Eric Lombaert, Vincent Calcagno, Simon Fellous, Ludovic Mailleret, Thibaut Malausa, Elodie Vercken
- article
- Oikos, 2021, 130 (5), pp.708-724. ⟨10.1111/oik.08278⟩
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-
- titre
- Optimal Control of Plant Disease Epidemics with Clean Seed Usage
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Brady Bowen, Pierre Bernhard, Vushrali A Bokil
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2021, 83 (5), pp.46. ⟨10.1007/s11538-021-00872-w⟩
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-
- titre
- When and how to fallow: first steps towards banana crop yield improvement through optimal and sustainable control of a soilborne pest
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Frédéric Grognard, Jean-Jules Tewa, Suzanne Touzeau
- article
- Journal of Interdisciplinary Methodologies and Issues in Science, 2021, Digital Agriculture in Africa, ⟨10.18713/JIMIS-120221-8-4⟩
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-
- titre
- Balancing Microalgae and Nitrifiers for Wastewater Treatment: Can Inorganic Carbon Limitation Cause an Environmental Threat?
- auteur
- Francesca Casagli, Simone Rossi, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard, Elena Ficara
- article
- Environmental Science and Technology, 2021, 55 (6), pp.3940-3955. ⟨10.1021/acs.est.0c05264⟩
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-
- titre
- Modeling the Influence of Temperature, Light Intensity and Oxygen Concentration on Microalgal Growth Rate
- auteur
- Ignacio López Muñoz, Olivier Bernard
- article
- Processes, 2021, 9 (3), pp.496. ⟨10.3390/pr9030496⟩
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-
- titre
- Global dynamics of the chemostat with overflow metabolism
- auteur
- Carlos Martínez, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2021, 82 (3), ⟨10.1007/s00285-021-01566-6⟩
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-
- titre
- ALBA: a comprehensive growth model to optimize algae-bacteria wastewater treatment in raceway ponds
- auteur
- Francesca Casagli, Gaetano Zuccaro, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer, Elena Ficara
- article
- Water Research, 2021, 190, pp.116734. ⟨10.1016/j.watres.2020.116734⟩
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-
- titre
- On Weyl's type theorems and genericity of projective rigidity in sub-Riemannian Geometry
- auteur
- Frédéric Jean, Sofya Maslovskaya, Igor Zelenko
- article
- Geometriae Dedicata, 2021, 213 (1), pp.295-314. ⟨10.1007/s10711-020-00581-z⟩
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-
- titre
- Modelling coffee leaf rust dynamics to control its spread
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Roger Tagne Wafo, Suzanne Touzeau, Samuel Bowong
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2021, 16, pp.26. ⟨10.1051/mmnp/2021018⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelling and optimal strategy to control coffee berry borer
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou, Samuel Bowong, Frédéric Grognard
- article
- Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2021, 44 (18), pp.14569-14592. ⟨10.1002/mma.7726⟩
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-
- titre
- Enhancing PUFA-rich polar lipids in Tisochrysis lutea using adaptive laboratory evolution (ALE) with oscillating thermal stress
- auteur
- Manon Gachelin, Marc Boutoute, Gregory Carrier, Amélie Talec, Eric Pruvost, Freddy Guihéneuf, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, 2021, ⟨10.1007/s00253-020-11000-4⟩
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-
- titre
- Dynamic equilibrium with randomly arriving players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Dynamic Games and Applications, 2021, 11 (2), pp.242-269. ⟨10.1007/s13235-020-00354-z⟩
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-
- titre
- Turnpike features in optimal selection of species represented by quota models
- auteur
- Walid Djema, Laëtitia Giraldi, Sofya Maslovskaya, Olivier Bernard
- article
- Automatica, In press, ⟨10.1016/j.automatica.2021.109804⟩
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-
- titre
- A thermal trade-off between viral production and degradation drives phytoplankton-virus population dynamics
- auteur
- David Demory, Joshua Weitz, Anne-Claire Baudoux, Suzanne Touzeau, Nathalie Simon, Sophie Rabouille, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Ecology Letters, 2021, 24 (6), pp.1133-1144. ⟨10.1111/ele.13722⟩
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-
- titre
- Shear stress affects the architecture and cohesion of Chlorella vulgaris biofilms
- auteur
- Andrea Fanesi, Marc Lavayssière, Cyril Breton, Olivier Bernard, Romain Briandet, Filipa Lopes
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-83523-3⟩
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-
- titre
- Optimal proteome allocation and the temperature dependence of microbial growth laws
- auteur
- Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong
- article
- npj Systems Biology and Applications, In press, 7 (14), ⟨10.1038/s41540-021-00172-y⟩
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-
- titre
- Dynamics and productivity of microalgae in presence of predators
- auteur
- Carlos Martínez, Bruno Assis Pessi, Olivier Bernard
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2021, 54 (3), pp.673-678. ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.319⟩
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-
Conference papers
- titre
- Hierarchical MPC applied to bacterial resource allocation and metabolite synthesis
- auteur
- Agustin Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2021 - 60th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2021, Austin, United States. pp.667-672, ⟨10.1109/CDC45484.2021.9683025⟩
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-
- titre
- Adaptative laboratory evolution for enhanced EPS production in biofilm forming microalgae
- auteur
- Aurélie Pham, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Freddy Guihéneuf, Hubert Bonnefond, Amélie Talec
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2021, OnLine, France
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-
- titre
- Control for synchronization of bistable piecewise affine genetic regulatory networks
- auteur
- Nicolas Augier, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- CHAOS 2021 - 6th IFAC Hybrid Conference on Analysis and Control of Chaotic Systems, Sep 2021, Catania, Italy. ⟨10.1016/j.ifacol.2021.11.044⟩
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-
- titre
- TRAIL-induced apoptosis signaling modeling identifies dynamic signs of efficient cell death initiation, enabling an early prediction of the cell response
- auteur
- Marielle Péré, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- CMSB 2021 - 19th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2021, Bordeaux, France
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-
- titre
- Time-optimal control of piecewise affine bistable gene-regulatory networks: preliminary results
- auteur
- Nicolas Augier, Agustín Gabriel Yabo
- article
- ADHS 2021 - 7th IFAC Conference on Analysis and Design of Hybrid Systems, IFAC, Jul 2021, Brussels, Belgium. ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.499⟩
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-
- titre
- Mathematical modelling and optimal control of the seasonal coffee leaf rust propagation
- auteur
- Clotilde Djuikem, Agustín Gabriel Yabo, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- ADHS 2021 - 7th IFAC Conference on Analysis and Design of Hybrid Systems, IFAC, Jul 2021, Brussels, Belgium. pp.193-198, ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.497⟩
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-
- titre
- Mixing strategies combined with shape design to enhance productivity of a raceway pond
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Julien Salomon
- article
- ADCHEM 2021 - 16th IFAC Symposium on Advanced Control of Chemical Processes, Jun 2021, Venice, Italy. pp.281-286, ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.255⟩
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-
- titre
- Controlling the bottom topography of a microalgal pond to optimize productivity
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Jacques Sainte-Marie, Julien Salomon
- article
- ACC 2021 - American Control Conference, IEEE, May 2021, New Orleans, United States. pp.634-639, ⟨10.23919/ACC50511.2021.9483235⟩
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-
- titre
- Optimizing microalgal productivity in raceway ponds through a controlled mixing device
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Julien Salomon
- article
- ACC 2021 - American Control Conference, IEEE, May 2021, New Orleans, United States. pp.640-645, ⟨10.23919/ACC50511.2021.9482760⟩
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-
- titre
- Impulsive model and hyperparasite-based biocontrol of coffee leaf rust propagation
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2021, Marseille, France
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-
- titre
- Host mixtures for plant disease control: from induced pathogen competition to the benefits of immune priming
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- MPDEE 2021 - Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2021, Marseille, France
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-
- titre
- Optimal bacterial resource allocation
- auteur
- Agustin Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- DCO 2021 - International Conference on Dynamic Control and Optimization, Feb 2021, Aveiro, Portugal
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-
Book sections
- titre
- Qualitative modeling, analysis, and control of synthetic regulatory circuits
- auteur
- Madalena Chaves, Hidde de Jong
- article
- Filippo Menolascina. Synthetic Gene Circuits: Methods and Protocols, 2229, Humana Press, pp.1-40, 2021, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1032-9_1⟩
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Modelling the regulation of biological systems at multiple scales: phenotypic variability and response to environmental changes
- auteur
- Valentina Baldazzi
- article
- Modeling and Simulation. Université Côte d'Azur, 2021
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-
Books
- titre
- OcéanIA: AI, Data, and Models for Understanding the Ocean and Climate Change
- auteur
- Nayat Sanchez-Pi, Luis Marti, Julien Salomon, Jacques Sainte-Marie, Olivier Bernard, Michele Sebag, Marc Schoenauer, Alejandro Maass, Damien Eveillard, André Abreu, Colomban de Vargas, Pablo A. Marquet
- article
- pp.1-64, 2021
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-
Patents
- titre
- Système flottant de production de microalgues sous forme de biofilm
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond, Axel Wakefield, Freddy Guihéneuf
- article
- France, N° de brevet: FR3107900A1. 2021
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-
Reports
- titre
- Turnpike Features in Optimal Selection of Species Represented by Quota Models: Extended Proofs
- auteur
- Walid Djema, Laetitia Giraldi, Sofya Maslovskaya, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-9399, Inria - Sophia Antipolis. 2021, pp.29
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-
Theses
- titre
- Optimal resource allocation in bacterial growth : theoretical study and applications to metabolite production
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Université Côte d'Azur, 2021. English. ⟨NNT : 2021COAZ4095⟩
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-
- titre
- Control and estimation methods for microbial communities
- auteur
- Alex dos Reis de Souza
- article
- Systems and Control [cs.SY]. Université de Lille, 2021. English. ⟨NNT : 2021LILUB002⟩
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-
- titre
- Modelling, analysis and control of plantain plant-parasitic nematodes
- auteur
- Israël Tankam Chedjou
- article
- Mathematics [math]. Université de Yaoundé I, Cameroun, 2021. English. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Optimization of adiabatic control strategies along non-mixing curves with singularities
- auteur
- Nicolas Augier
- article
- 2021
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-
- titre
- The role of interference between vectors in control of plant diseases
- auteur
- Marta Zaffaroni, Loup Rimbaud, Ludovic Mailleret, Nik J Cunniffe, Daniele Bevacqua
- article
- 2021
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-
- titre
- The hidden side of the Allee effect: correlated demographic traits and extinction risk in experimental populations
- auteur
- Elodie Vercken, Géraldine Groussier, Laurent Lamy, Ludovic Mailleret
- article
- 2021
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-
2020
Journal articles
- titre
- Stability switching and hydra effect in a predator–prey metapopulation model
- auteur
- Nicolas Bajeux, Bapan Ghosh
- article
- BioSystems, 2020, 198 (12), pp.104255. ⟨10.1016/j.biosystems.2020.104255⟩
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-
- titre
- Robust Adaptive Estimation in the Competitive Chemostat
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Jean-Luc Gouzé, Denis Efimov, Andrey Polyakov
- article
- Computers & Chemical Engineering, 2020, 142, pp.107030. ⟨10.1016/j.compchemeng.2020.107030⟩
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-
- titre
- Topology-induced dynamics in a network of synthetic oscillators with piecewise affine approximation
- auteur
- Elena Firippi, Madalena Chaves
- article
- Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, 2020, 30 (11), pp.113128. ⟨10.1063/5.0020670⟩
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-
- titre
- Profiling the Non-genetic Origins of Cancer Drug Resistance with a Single-Cell Functional Genomics Approach Using Predictive Cell Dynamics
- auteur
- Mickael Meyer, Agnès Paquet, Marie-Jeanne Arguel, Ludovic Peyre, Luis Gomes-Pereira, Kevin Lebrigand, Baharia Mograbi, Patrick Brest, Rainer Waldmann, Pascal Barbry, Paul Hofman, Jérémie Roux
- article
- Cell Systems, 2020, 11 (4), pp.367-374. ⟨10.1016/j.cels.2020.08.019⟩
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-
- titre
- How mechanistic modelling supports decision making for the control of enzootic infectious diseases
- auteur
- Pauline Ezanno, Mathieu Andraud, Gaël Beaunée, Thierry Hoch, Stéphane Krebs, Arnaud Rault, Suzanne Touzeau, Elisabeta Vergu, Stefan Widgren
- article
- Epidemics, 2020, 32, pp.100398. ⟨10.1016/j.epidem.2020.100398⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How optimal foragers should respond to habitat changes: on the consequences of habitat conversion
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Marie Hamelin, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- Theoretical Ecology, 2020, 13 (2), pp.165-175. ⟨10.1007/s12080-019-00437-7⟩
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-
- titre
- Rotating algal biofilm versus planktonic cultivation: LCA perspective
- auteur
- Marjorie Morales, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- Journal of Cleaner Production, 2020, 257, pp.120547. ⟨10.1016/j.jclepro.2020.120547⟩
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-
- titre
- Cell cycle period control through modulation of clock inputs
- auteur
- Sofia José Figueiredo Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2020, 18 (03), pp.2040006. ⟨10.1142/S0219720020400065⟩
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-
- titre
- Dynamics of the periodically forced light-limited Droop model
- auteur
- Carlos Martínez, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Differential Equations, 2020, ⟨10.1016/j.jde.2020.03.020⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelling and control of a banana soilborne pest in a multi-seasonal framework
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Ludovic Mailleret, Jean Jules Tewa, Frédéric Grognard
- article
- Mathematical Biosciences, 2020, 322, pp.108324. ⟨10.1016/j.mbs.2020.108324⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Separating Two Species of Microalgae in Photobioreactors in Minimal Time
- auteur
- Walid Djema, Olivier Bernard, Laetitia Giraldi
- article
- Journal of Process Control, 2020, 87, pp.120-129. ⟨10.1016/j.jprocont.2020.01.003⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Reducing a model of sugar metabolism in peach to catch different patterns among genotypes
- auteur
- Hussein Kanso, Bénédicte Quilot-Turion, Mohamed-Mahmoud Memah, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Valentina Baldazzi
- article
- Mathematical Biosciences, 2020, 321, pp.108321. ⟨10.1016/j.mbs.2020.108321⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Qualitative control of undesired oscillations in a genetic negative feedback loop with uncertain measurements
- auteur
- Lucie Chambon, Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- Automatica, 2020, 112, pp.108642. ⟨10.1016/j.automatica.2019.108642⟩
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-
- titre
- Transcription-based circadian mechanism controls the duration of molecular clock states in response to signaling inputs
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2020, 484, pp.110015. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.110015⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A dynamic game approach to uninvadable strategies for biotrophic pathogens
- auteur
- Ivan Yegorov, Frédéric Grognard, Ludovic L. Mailleret, Fabien Halkett, Pierre Bernhard
- article
- Dynamic Games and Applications, 2020, 10, pp.257-296. ⟨10.1007/s13235-019-00307-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Enhanced production of heterologous proteins by a synthetic microbial community: Conditions and trade-offs
- auteur
- Marco Mauri, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong, Eugenio Cinquemani
- article
- PLoS Computational Biology, 2020, 16 (4), pp.e1007795. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007795⟩
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-
- titre
- Control of synchronization ratios in clock/cell cycle coupling by growth factors and glucocorticoids
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- Royal Society Open Science, 2020, 7 (2), pp.192054. ⟨10.1098/rsos.192054⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi‐seasonal modelling of plant‐nematode interactions reveals efficient plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Caroline Djian‐caporalino, Philippe Castagnone‐sereno, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret
- article
- Evolutionary Applications, 2020, 13 (9), pp.2206-2221. ⟨10.1111/eva.12989⟩
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-
- titre
- Robust Stabilization of Competing Species in the Chemostat
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Process Control, 2020, 87, pp.138-146. ⟨10.1016/j.jprocont.2020.01.010⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Model-assisted comparison of sugar accumulation patterns in ten fleshy fruits highlights differences between herbaceous and woody species
- auteur
- Coffi Belmys Cakpo, Gilles Vercambre, Valentina Baldazzi, Léa Roch, Zhanwu Dai, Pierre Valsesia, Mohamed-Mahmoud Memah, Sophie Colombie, Annick Moing, Yves Gibon, Michel Génard
- article
- Annals of Botany, 2020, 126 (3), pp.455-470. ⟨10.1093/aob/mcaa082⟩
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-
- titre
- Modeling and analysis of an Absorption Column Connected to a Microalgae Culture
- auteur
- Carlos Martinez, Francis Mairet, Leslie Meier, David Jeison, Andrés Avila
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal bacterial resource allocation: metabolite production in continuous bioreactors
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (6), pp.7074-7100. ⟨10.3934/mbe.2020364⟩
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-
Conference papers
- titre
- Control of negative feedback loops in genetic networks
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé, Roderick Edwards
- article
- CDC 2020 - 59th Conference on Decision and Control, Dec 2020, Jeju Island / Virtual, South Korea
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control separating two microalgae species competing in a chemostat
- auteur
- Walid Djema, Olivier Bernard, Térence Bayen
- article
- CDC 2020 - 59th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2020, Jeju Island / Virtual, South Korea. ⟨10.1109/CDC42340.2020.9304115⟩
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-
- titre
- Artificial Intelligence, Machine Learning and Modeling for Understanding the Oceans and Climate Change
- auteur
- Nayat Sanchez-Pi, Luis Marti, André Abreu, Olivier Bernard, Colomban de Vargas, Damien Eveillard, Alejandro Maass, Pablo A. Marquet, Jacques Sainte-Marie, Julien Salomon, Marc Schoenauer, Michele Sebag
- article
- NeurIPS 2020 Workshop - Tackling Climate Change with Machine Learning, Dec 2020, Santiago / Virtual, Chile
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Microalgae strains improvement by adaptive laboratory evolution applied to biofilm culture
- auteur
- Aurélie Pham, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Freddy Guihéneuf, Hubert Bonnefond
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2020, Rome, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- Core Models of Receptor Reactions to Evaluate Basic Pathway Designs Enabling Heterogeneous Commitments to Apoptosis
- auteur
- Marielle Péré, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- CMSB 2020 - 18th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2020, Konstanz, Germany. pp.298-320, ⟨10.1007/978-3-030-60327-4_16⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Qualitative Analysis of Mammalian Circadian Oscillations: Cycle Dynamics and Robustness
- auteur
- Ousmane Diop, Madalena Chaves, Laurent Tournier
- article
- CMSB 2020 - 18th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2020, Konstanz, Germany. pp.176-192, ⟨10.1007/978-3-030-60327-4_10⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A model of apoptosis receptor reactions to study cell fate decision
- auteur
- Luis Gomes-Pereira, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- MED 2020 - 28th Mediterranean Conference on Control and Automation, Sep 2020, Saint Raphaël, France. pp.887-892, ⟨10.1109/MED48518.2020.9183229⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control of a fed-batch reactor with overflow metabolism
- auteur
- Carlos Martínez, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC 2020 - 1st Virtual World Congress by the International Federation of Automatic Control, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Observer-Based Robust Control of a Continuous Bioreactor with Heterogeneous Community
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC 2020 - 21rst IFAC World Congress, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimizing bacterial resource allocation: metabolite production in continuous bioreactors
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC 2020 - 1st Virtual World Congress by the International Federation of Automatic Control, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The turnpike property in maximization of microbial metabolite production
- auteur
- Jean-Baptiste Caillau, Walid Djema, Laetitia Giraldi, Jean-Luc Gouzé, Sofya Maslovskaya, Jean-Baptiste Pomet
- article
- IFAC 2020 - 21rst IFAC World Congress, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Reducing a model of sugar metabolism in peach fruit to explore genetic diversity
- auteur
- Hussein Kanso, Bénédicte Quilot-Turion, Mohamed-Mahmoud Memah, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Valentina Baldazzi
- article
- iCROPM 2020 : Crop modelling for the Future, Feb 2020, Montpellier, France. pp.1-5
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-
Book sections
- titre
- Potentiel des microalgues
- auteur
- Hubert Bonnefond, Charlotte Combe, Jean-Paul Cadoret, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Stephanie Baumberger. Chimie verte et industries agroalimentaires - Vers une bioéconomie durable, Lavoisier, 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Lutte biologique par augmentation à l’aide d’arthropodes entomophages contre les arthropodes phytophages
- auteur
- Alexandre Bout, Nicolas Ris, Cécilia Multeau, Ludovic Mailleret
- article
- Biocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Editions Quae, 376 p., 2020, Savoir Faire (Quae), 978-2-7592-3076-1
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-
- titre
- Microalgae as a source of edible oils
- auteur
- Jelena Helene Cvejic, Antonio Luca Langellotti, Hubert Bonnefond, Vito Verardo, Olivier Bernard
- article
- Lipids and Edible Oils, Elsevier, pp.175-211, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-817105-9.00005-7⟩
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-
- titre
- Le Modèle de Cournot avec entrées aléatoires de firmes *
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Marc Deschamps; Thierry Martin. Cournot, économie et philosophie, Éditions Matériologiques, 2020, E-conomiques, 978-2-37361-262-2
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-
Patents
- titre
- Device for producing microalgae
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond
- article
- France, Patent n° : WO/2020/099590. 2020
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-
Theses
- titre
- Mathematical analysis, coupling and control design for models of synthetic biological oscillators
- auteur
- Eleni Firippi
- article
- Signal and Image Processing. Université Côte d'Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4105⟩
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-
- titre
- Gestion durable des nématodes à galles en culture maraîchère par la modélisation et l’optimisation du déploiement de variétés résistantes
- auteur
- Samuel Nilusmas
- article
- Microbiologie et Parasitologie. Université Côte d'Azur, 2020. Français. ⟨NNT : 2020COAZ4086⟩
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-
- titre
- Control strategies for genetic feedback loops
- auteur
- Lucie Chambon
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Université Côte d'Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4005⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Shape optimization of a microalgal raceway to enhance productivity
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Jacques Sainte-Marie, Julien Salomon
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Shifts from pulled to pushed range expansions caused by reduction of landscape connectedness
- auteur
- Maxime Dahirel, Aline Bertin, Marjorie Haond, Aurélie Blin, Eric Lombaert, Vincent Calcagno, Simon Fellous, Ludovic Mailleret, Thibaut Malausa, Elodie Vercken
- article
- 2020
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-
- titre
- Optimal and sustainable management of a soilborne banana pest
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Frédéric Grognard, Jean Jules Tewa, Suzanne Touzeau
- article
- 2020
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-
2019
Journal articles
- titre
- Optimal integration of microalgae production with photovoltaic panels: environmental impacts and energy balance
- auteur
- Marjorie Morales, Arnaud Hélias, Olivier Bernard
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2019, 12 (1), pp.239. ⟨10.1186/s13068-019-1579-4⟩
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-
- titre
- The impact of light supply to photosynthetic moving biofilms
- auteur
- Jérôme Grenier, Hubert Bonnefond, Filipa Lopes, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2019, 44 (101674), ⟨10.1016/j.algal.2019.101674⟩
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-
- titre
- Evaluation of the feasibility of photosynthetic biogas upgrading: Simulation of a large-scale system
- auteur
- Leslie Meier, Carlos Martínez, Carlos Vílchez, Olivier Bernard, David Jeison
- article
- Energy, 2019, 189, pp.116313. ⟨10.1016/j.energy.2019.116313⟩
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-
- titre
- Perspectives of surface plasmonic resonance optical fibre sensors for anaerobic digestion
- auteur
- Jacob J Lamb, Olivier Bernard, Shiplu Sarker, Kristian M Lien, Dag Roar Hjelme
- article
- Engineering in Life Sciences, 2019, 19 (11), pp.759-769. ⟨10.1002/elsc.201900063⟩
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-
- titre
- Perspectives of surface plasmon resonance sensors for optimized biogas methanation
- auteur
- Jacob J Lamb, Olivier Bernard, Shiplu Sarker, Kristian M Lien, Dag Roar Hjelme
- article
- Engineering in Life Sciences, 2019, 19 (11), pp.759-769. ⟨10.1002/elsc.201900063⟩
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-
- titre
- Organ-wide and ploidy-dependent regulation both contribute to cell-size determination: evidence from a computational model of tomato fruit
- auteur
- Valentina Baldazzi, Pierre Valsesia, Michel Génard, Nadia Bertin
- article
- Journal of Experimental Botany, 2019, 70 (21), pp.6215-6228. ⟨10.1101/450916⟩
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-
- titre
- Perspectives of optical colourimetric sensors for anaerobic digestion
- auteur
- Jacob J Lamb, Olivier Bernard, Shiplu Sarker, Kristian M Lien, Dag Roar Hjelme
- article
- Renewable and Sustainable Energy Reviews, 2019, 111, pp.87-96. ⟨10.1016/j.rser.2019.04.083⟩
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-
- titre
- Twelve quick tips for designing sound dynamical models for bioprocesses
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- PLoS Computational Biology, 2019, 15 (8), pp.e1007222. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007222⟩
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-
- titre
- Gradient-based optimization of a rotating algal biofilm process
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Nina Aguillon, Jacques Sainte-Marie, Jérôme Grenier, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- Automatica, 2019, 105, pp.80-88. ⟨10.1016/j.automatica.2019.02.043⟩
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-
- titre
- Virus epidemics, plant-controlled population bottlenecks and the durability of plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Mélanie Bonneault, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2019, 374 (1775), pp.20180263. ⟨10.1098/rstb.2018.0263⟩
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-
- titre
- Influence of the components of propagule pressure, Allee effects, and stochasticity on the time to establish introduced populations
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic L. Mailleret
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 471, pp.91-107. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.03.012⟩
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-
- titre
- Dynamics and control of a periodically forced microalgae culture
- auteur
- Carlos Martínez, Francis Mairet, Pierre Martinon, Olivier Bernard
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2019, 52, pp.922-927. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.180⟩
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-
- titre
- Its all about connections: hubs and invasion in habitat networks
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Claire Rais Assa, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Ecology Letters, 2019, 22 (2), pp.313-321. ⟨10.1111/ele.13192⟩
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-
- titre
- In search of artificial domatia for predatory mites
- auteur
- Cecile Bresch, Lea Carlesso, Ricardo Suay, Louise van Oudenhove, Suzanne Touzeau, Hicham Fatnassi, Lydia Ottenwaelder, B. Paris, Christine Poncet, Ludovic Mailleret, Gerben J. Messelink, Pia Parolin
- article
- Biocontrol Science and Technology, 2019, 29 (2), pp.1-18. ⟨10.1080/09583157.2018.1540030⟩
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-
- titre
- Modeling the bioconversion of polysaccharides in a continuous reactor: A case study of the production of oligo-galacturonates by Dickeya dadantii
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Sylvie Reverchon, Jean-Luc Gouzé, William Nasser
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2019, 294 (5), pp.1753-1762. ⟨10.1074/jbc.RA118.004615⟩
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-
- titre
- Modeling the bioconversion of polysaccharides in a continuous reactor: A case study of the production of oligogalacturonates by Dickeya dadantii
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Sylvie Reverchon, William Nasser, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2019, 294 (5), pp.1753-1762. ⟨10.1074/jbc.RA118.004615⟩
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-
- titre
- Analysis of a genetic-metabolic oscillator with piecewise linear models
- auteur
- Madalena Chaves, Diego A. Oyarzun, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 462, pp.259 - 269. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.10.026⟩
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-
- titre
- Meteorological Data-Based Optimal Control Strategy for Microalgae Cultivation in Open Pond Systems
- auteur
- Riccardo De-Luca, Fabrizio Bezzo, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- Complexity, 2019, 2019, pp.1-12. ⟨10.1155/2019/4363895⟩
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-
- titre
- How to prevent viremia rebound? Evidence from a PRRSv data-supported model of immune response
- auteur
- Natacha Go, Suzanne Touzeau, Zeenath Islam, Catherine Belloc, Andrea Doeschl-Wilson
- article
- BMC Systems Biology, 2019, 13, pp.15. ⟨10.1186/s12918-018-0666-7⟩
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-
- titre
- Dynamics of complex feedback architectures in metabolic pathways
- auteur
- Madalena Chaves, Diego A. Oyarzun
- article
- Automatica, 2019, 99, pp.323 - 332. ⟨10.1016/j.automatica.2018.10.046⟩
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-
- titre
- Picoeukaryotes of the Micromonas genus: sentinels of a warming ocean
- auteur
- David Demory, Anne-Claire Baudoux, Adam Monier, Nathalie Simon, Christophe Six, Pei Ge, Fabienne Rigaut-Jalabert, Dominique Marie, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Sophie Rabouille
- article
- ISME Journal, 2019, 13 (1), pp.132-146. ⟨10.1038/s41396-018-0248-0⟩
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-
- titre
- Microalgae and cyanobacteria modeling in water resource recovery facilities: A critical review
- auteur
- Brian D. Shoener, Stephanie M. Schramm, Fabrice Béline, Olivier Bernard, Carlos Martínez, Benedek G. Plosz, Spencer Snowling, Jean-Philippe Steyer, Borja Valverde-Pérez, Dorottya Wagner, Jeremy S. Guest
- article
- Water Research X, 2019, 2, pp.18. ⟨10.1016/j.wroa.2018.100024⟩
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-
- titre
- Leaf Production and Expansion: A Generalized Response to Drought Stresses from Cells to Whole Leaf Biomass—A Case Study in the Tomato Compound Leaf
- auteur
- Garance Koch, Gaëlle Rolland, Myriam Dauzat, Alexis Bediée, Valentina Baldazzi, Nadia Bertin, Yann Guédon, Christine Granier
- article
- Plants, 2019, 8 (10), pp.409. ⟨10.3390/plants8100409⟩
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-
- titre
- Why, when and how should exposure be considered at the within-host scale? A modelling contribution to PRRSv infection
- auteur
- Natacha Go, Catherine Belloc, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- Mathematical Medicine and Biology, 2019, 36 (2), pp.179-206. ⟨10.1093/imammb/dqy005⟩
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-
- titre
- Optimal control of bacterial growth for the maximization of metabolite production
- auteur
- Ivan Yegorov, Francis Mairet, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2019, 78 (4), pp.985-1032. ⟨10.1007/s00285-018-1299-6⟩
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-
- titre
- Kalman 1960: The birth of modern system theory
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Mathematical Population Studies, 2019, 26 (3), pp.123-145. ⟨10.1080/08898480.2018.1553393⟩
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-
- titre
- Dynamical reduction of linearized metabolic networks through quasi steady state approximation
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- AIChE Journal, 2019, 65 (1), pp.18-31. ⟨10.1002/aic.16406⟩
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-
- titre
- The architecture of monospecific microalgae biofilms 2
- auteur
- Andrea Fanesi, Armelle Paule, Olivier Bernard, Romain Briandet, Filipa Lopes
- article
- Microorganisms, 2019, 7 (9), pp.352. ⟨10.3390/microorganisms7090352⟩
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-
- titre
- Unusual Patterns of Mitochondrial Inheritance in the Brown Alga Ectocarpus
- auteur
- Laure Mignerot, Chikako Nagasato, Akira F Peters, Marie-Mathilde Perrineau, Delphine Scornet, Florian Pontheaux, Walid Djema, Yacine Badis, Taizo Motomura, Coelho Susana M., J. Mark Cock
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2019, ⟨10.1093/molbev/msz186⟩
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-
Conference papers
- titre
- Singular regimes for the maximization of metabolite production
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France. pp.31-36
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robust Control of a Competitive Environment in the Chemostat using Discontinuous Control Laws
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Global asymptotic stability of a genetic negative feedback loop with an affine control
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Mathematical Biology Seminar, Dec 2019, Corvallis, United States
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-
- titre
- Coupling and synchronization of piecewise linear genetic regulatory systems
- auteur
- Madalena Chaves, Luca Scardovi, Eleni Firippi
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Period Control of the Coupled Clock and Cell Cycle Systems
- auteur
- Sophia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- CSBIO 2019 - 10th International Conference on Computational Systems-Biology and Bioinformatics, Dec 2019, Nice, France. ⟨10.1145/3365953.3365956⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Recent advances in algal biofilm cultivation for fish feed
- auteur
- Freddy Guihéneuf, Alex Wakefield, Quentin Girardin, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Christophe Vasseur, Hubert Bonnefond
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2019, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Enhancing Tetraselmis suecica biofilm productivity by adding organic and inorganic carbon
- auteur
- Margaux Caia, Freddy Guihéneuf, Hubert Bonnefond, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- AlguaEurope Conference, Dec 2019, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pulsed perturbations in population dynamics
- auteur
- Ludovic Mailleret
- article
- Modelife days - Journées de Modélisation, physique et mathématique du vivant, Nov 2019, Mandelieu, France
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-
- titre
- Turnpike Features in Optimal Selection of Microalgae
- auteur
- Walid Djema, Olivier Bernard, Laetitia Giraldi
- article
- FOSBE 2019 - 8th IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, Oct 2019, Valencia, Spain. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.273⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Quantifying the potential of microalgae culture systems to remove nutrients from wastewater
- auteur
- Carlos Martinez, Francis Mairet, Luis Plaza, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- FOSBE 2019 - 8th IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, Oct 2019, València, Spain. pp.287-292, ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.272⟩
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-
- titre
- Global stabilization of a genetic positive feedback loop via the design of a synthetic auto-repression
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE), Oct 2019, Valencia, Spain. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.249⟩
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-
- titre
- Period -control in a coupled system of two genetic oscillators for synthetic biology
- auteur
- Eleni Firippi, Madalena Chaves
- article
- FOSBE 2019 - 8th IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, Oct 2019, Valencia, Spain. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.238⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A reduction strategy to simplify a model of sugar metabolism for application to a large panel of genotypes
- auteur
- Hussein Kanso, Bénédicte Quilot-Turion, Mohamed-Mahmoud Memah, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Valentina Baldazzi
- article
- FOSBE 2019 - 8th Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, IFAC, Oct 2019, Valencia, Spain
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improvement of microalgae strains by dynamic darwinian selection pressure
- auteur
- Hubert Bonnefond, Yann Lie, Eric Pruvost, Amélie Talec, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Alg’in Provence - European Workshop, Oct 2019, Arles, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacterial growth strategies as Optimal Control problems: maximizing metabolite production
- auteur
- Agustín Gabriel Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- FGS'2019 - 19th French-German-Swiss conference on Optimization, Sep 2019, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- On Adaptive Estimation of Bacterial Growth in the Competitive Chemostat
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Jean-Luc Gouzé, Andrey Polyakov, Denis Efimov
- article
- MECHATRONICS 2019 - 8th International-Federation-of-Automatic-Control (IFAC) Symposium on Mechatronic Systems / 11th International-Federation-of-Automatic-Control (IFAC) Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2019, Vienne, Austria. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.11.789⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Recent advances in microalgal biotechnology with an emphasis on biofilm cultivation
- auteur
- Freddy Guihéneuf, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Hubert Bonnefond
- article
- EPC7 - 7th European Phycological Congress, Aug 2019, Zagreb, Croatia
- Accès au bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Journée MODECO - Modélisation des Dynamiques Écologiques, Jul 2019, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- A demo-genetic model of root-knot nematod dynamics with applications to the deployment of plant resistance
- auteur
- Ludovic Mailleret, Samuel Nilusmas, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno
- article
- Journée MODECO - Modélisation des Dynamiques Ecologiques, Jul 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control of bacterial growth for metabolite production: The role of timing and costs of control
- auteur
- Eugenio Cinquemani, Francis Mairet, Ivan Yegorov, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- ECC 2019 - 18th European Control Conference, Jun 2019, Naples, Italy. pp.2657-2662, ⟨10.23919/ECC.2019.8796079⟩
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-
- titre
- Modelling and controlling fungus Hemileia vastatrix, a coffee pest
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau, Samuel Bowong
- article
- BIOMATH 2019 - International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences, Jun 2019, Bedlewo, Poland
- Accès au bibtex
-
- titre
- Agricultural control of Radopholus similis in banana and plantain plantations
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Jean Jules Tewa
- article
- BIOMATH 2019 - International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences, Jun 2019, Bedlewo, Poland
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal control on a simple model of coffee berry borer infestation
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou, Samuel Bowong
- article
- BIOMATH 2019 - International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences, Jun 2019, Bedlewo, Poland
- Accès au bibtex
-
- titre
- A demo-genetic model of root-knot nematod dynamics with applications to the deployment of plant resistance
- auteur
- Samuel Nilusmas, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- CMPD5 - Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2019, Fort Lauderdale, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Frédéric Grognard, Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Marie Hamelin
- article
- CMPD5 - Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2019, Fort Lauderdale, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling, control, and optimization for tropical agriculture
- auteur
- Frédéric Grognard, Israël Tankam Chedjou, Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau
- article
- CMPD5 - Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2019, Fort Lauderdale, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation et contrôle en épidémiologie de cultures tropicales : application aux nématodes phytoparasites du bananier plantain et aux scolytes du caféier
- auteur
- Suzanne Touzeau
- article
- AgriNumA 2019 - Symposium Agriculture Numérique en Afrique, Apr 2019, Dakar, Sénégal
- Accès au bibtex
-
- titre
- An Optimal Control Strategy Separating Two Species of Microalgae in Photobioreactors
- auteur
- Walid Djema, Laetitia Giraldi, Olivier Bernard
- article
- DYCOPS 2019 - 12th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, including Biosystems, Apr 2019, Florianopolis, Brazil. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.178⟩
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-
- titre
- Model Development and Light Effect on a Rotating Algal Biofilm
- auteur
- Ouassim Bara, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- DYCOPS 2019 - 12th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, including Biosystems, Apr 2019, Florianópolis - SC, Brazil. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.091⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A new qualitative control strategy for the genetic Toggle Switch
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- DYCOPS 2019 - 12th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, including Biosystems, Ifac, Apr 2019, Florianopolis, Brazil. pp.532-537, ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.117⟩
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-
- titre
- rPrism -A software for reactive weighted state transition models
- auteur
- Daniel Figueiredo, Eugénio Rocha, Manuel A. Martins, Madalena Chaves
- article
- HSB 2019 - 6th International Workshop, Hybrid Systems Biology, Apr 2019, Prague, Czech Republic. pp.165 - 174
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Séminaire UMR ISA, Mar 2019, Sophia Antipolis, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- RVV 2019 - 17e Rencontres de Virologie Végétale, Jan 2019, Aussois, France
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-
Book sections
- titre
- Life-cycle assessment of microalgal-based biofuel. Chapitre 20
- auteur
- Marjorie Morales, Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Helias, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Biomass, Biofuels, Biochemicals : Biofuels from Algae, 2ème ed., Elsevier, 606 p., 2019, 978-0-444-64192-2. ⟨10.1016/B978-0-444-64192-2.00020-2⟩
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-
Books
- titre
- Molecular Logic and Computational Synthetic Biology First International Symposium, MLCSB 2018, Santiago, Chile, December 17–18, 2018, Revised Selected Papers
- auteur
- Madalena Chaves, Manuel A. Martins
- article
- Madalena Chaves; Manuel A. Martins. Springer, 11415, 2019, LNCS, 978-3-030-19431-4. ⟨10.1007/978-3-030-19432-1⟩
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-
Patents
- titre
- Bioreactor for the selection of microalgae
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond, Antoine Sciandra, Eric Pruvost, Ghjuvan Micaelu Grimaud
- article
- United States, Patent n° : 16/335,390, 2019. 2019
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-
Reports
- titre
- Gradient-based optimization of a rotating algal biofilm process
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Nina Aguillon, Jacques Sainte-Marie, Jérôme Grenier, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-9250, Inria - Sophia antipolis. 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- titre
- Modeling cell response heterogeneity to pro-apoptotic ligands
- auteur
- Luis Carlos Gomes Pereira
- article
- Automatic Control Engineering. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2019. English. ⟨NNT : 2019AZUR4081⟩
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-
- titre
- Modeling, analysis, and control of microalgae growth in dense cultures
- auteur
- Carlos Martinez von Dossow
- article
- Earth Sciences. Sorbonne Université, 2019. English. ⟨NNT : 2019SORUS255⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Turnpike Features in Optimal Selection ofMicroalgae
- auteur
- Walid Djema, Laetitia Giraldi, Olivier Bernard
- article
- 2019
- Accès au bibtex
-
- titre
- Separating Two Species of Microalgae in Photobioreactors in Minimal Time
- auteur
- Walid Djema, Olivier Bernard, Laetitia Giraldi
- article
- 2019
- Accès au bibtex
-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use to identify optimal plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret
- article
- 2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2018
Journal articles
- titre
- Impact of genetic drift, selection and accumulation level on virus adaptation to its host plants
- auteur
- Elsa Rousseau, Lucie Tamisier, Frédéric Fabre, Vincent Simon, Marion Szadkowski, Olivier Bouchez, Catherine Zanchetta, Gregory Girardot, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Alain Palloix, Benoît Moury
- article
- Molecular Plant Pathology, 2018, 19 (12), pp.2575-2589. ⟨10.1111/mpp.12730⟩
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-
- titre
- Theory of turbid microalgae cultures
- auteur
- Carlos Martínez, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2018, 456, pp.190 - 200. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.07.016⟩
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-
- titre
- Boolean dynamics revisited through feedback interconnections
- auteur
- Madalena Chaves, Daniel Figueiredo, Manuel A. Martins
- article
- Natural Computing, 2018, ⟨10.1007/s11047-018-9716-8⟩
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-
- titre
- Clustered or scattered? The impact of habitat fragmentation on establishment and early spread
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Maud Hautier, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- Ecography, 2018, 41 (10), pp.1675-1683. ⟨10.1111/ecog.03397⟩
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-
- titre
- Between-group pathogen transmission: From processes to modeling
- auteur
- Thierry Hoch, Suzanne Touzeau, Anne-France Viet, Pauline Ezanno
- article
- Ecological Modelling, 2018, 383, pp.138 - 149. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2018.05.016⟩
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-
- titre
- Analytical Reduction of Nonlinear Metabolic Networks Accounting for Dynamics in Enzymatic Reactions
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- Complexity, 2018, 2018, pp.1 - 22. ⟨10.1155/2018/2342650⟩
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-
- titre
- Explore the best sugar factory: the fruit
- auteur
- Elsa Desnoues, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Valentina Baldazzi
- article
- TheScienceBreaker, 2018
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-
- titre
- Are compound leaves more complex than simple ones? A multi-scale analysis
- auteur
- Garance Koch, Gaelle Rolland, Myriam Dauzat, Alexis Bediee, Valentina Baldazzi, Nadia Bertin, Yann Y. Guédon, Christine Granier
- article
- Annals of Botany, 2018, 122 (7), pp.1173-1185. ⟨10.1093/aob/mcy116⟩
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-
- titre
- Analysis Tools for Interconnected Boolean Networks With Biological Applications
- auteur
- Madalena Chaves, Laurent Tournier
- article
- Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.1-18. ⟨10.3389/fphys.2018.00586⟩
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-
- titre
- How do microalgae perceive light in a high-rate pond? Towards more realistic Lagrangian experiments
- auteur
- David Demory, Charlotte Combe, Philipp Hartmann, Amélie Talec, Eric Pruvost, Raouf Hamouda, Fabien Souillé, Pierre-Olivier Lamare, Marie-Odile Bristeau, Jacques Sainte-Marie, Sophie Rabouille, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Royal Society Open Science, 2018, 5 (5), pp.180523. ⟨10.1098/rsos.180523⟩
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-
- titre
- A kinetic model of sugar metabolism in peach fruit reveals a functional hypothesis of markedly low fructose-to-glucose ratio phenotype
- auteur
- Elsa Desnoues, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Valentina Baldazzi
- article
- Plant Journal, 2018, 94 (4), pp.685-698. ⟨10.1111/tpj.13890⟩
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-
- titre
- A Stability Result for Periodic Solutions of Nonmonotonic Smooth Negative Feedback Systems
- auteur
- Camille Poignard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2018, 17 (2), pp.1091 - 1116. ⟨10.1137/17M1141205⟩
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-
- titre
- Full-scale validation of an algal productivity model including nitrogen limitation
- auteur
- Quentin Béchet, Noémie Coulombier, Christophe Vasseur, Thomas Lasserre, Loic Le Dean, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2018, 31, pp.377-386. ⟨10.1016/j.algal.2018.02.010⟩
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-
- titre
- Optimizing CO2 transfer in algal open ponds
- auteur
- Margaux Caïa, Olivier Bernard, Quentin Béchet
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2018, 35, pp.530-538. ⟨10.1016/j.algal.2018.09.009⟩
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-
- titre
- Optimal feedback strategies for bacterial growth with degradation, recycling and effect of temperature
- auteur
- Ivan Yegorov, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- Optimal Control Applications and Methods, 2018, 39 (2), pp.1084-1109. ⟨10.1002/oca.2398⟩
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-
- titre
- Maximizing microalgae productivity in a light-limited chemostat
- auteur
- Carlos Martínez, Olivier Bernard, Francis Mairet
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2018, 51 (2), pp.735 - 740. ⟨10.1016/j.ifacol.2018.04.001⟩
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-
- titre
- Modelling an Artificial Microalgae-Cyanobacteria Ecosystem
- auteur
- Margaux Caïa, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2018, 51 (2), pp.655 - 660. ⟨10.1016/j.ifacol.2018.03.111⟩
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-
- titre
- Comparative assessment of evaporation models in algal ponds
- auteur
- Quentin Béchet, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer, Andy Shilton, Benoit Guieysse
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2018, 35, pp.283-291. ⟨10.1016/j.algal.2018.08.022⟩
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-
- titre
- Reduction and stability analysis of a transcription-translation model of RNA polymerase
- auteur
- Ismail Belgacem, Stefano Casagranda, Edith Grac, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2018, 80 (2), pp.294-318. ⟨10.1007/s11538-017-0372-4⟩
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-
- titre
- Principal process analysis of biological models
- auteur
- Stefano Casagranda, Suzanne Touzeau, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- BMC Systems Biology, 2018, 12, pp.68. ⟨10.1186/s12918-018-0586-6⟩
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-
Conference papers
- titre
- Ecophysiological modeling of the impact of light quantity and quality on microalgae growth in high-density open ponds
- auteur
- Philippe Le Noac'H, Sakina Dorothée Ayata, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Martin Laviale
- article
- Sfecologie 2018 - International Conference on Ecological Sciences, Oct 2018, Rennes, France
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-
- titre
- A multi-seasonal model of the dynamics of banana plant-parasitic nematodes
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Jean-Jules Tewa
- article
- CARI’2018 - 14. Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Oct 2018, Stellenbosch, South Africa
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-
- titre
- Modelling and control of coffee berry borer infestation
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Frédéric Grognard, Berge Tsanou, Suzanne Touzeau
- article
- CARI’2018 - 14. Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Oct 2018, Stellenbosch, South Africa
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-
- titre
- Uninvadable strategies for biotrophic pathogens, from dynamic games to adaptive dynamics
- auteur
- Frédéric Grognard, Ivan Yegorov, Julien Guegan, Ludovic Mailleret, Fabien Halkett, Pierre Bernhard
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Investigating viremia rebounds using a PRSS data-supported model of immune response
- auteur
- Suzanne Touzeau, Natacha Go, Catherine Belloc, Andrea Doeschl-Wilson
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Sustainable management of root-knot nematodes in horticultural crops by modeling and optimizing resistance gene deployment
- auteur
- Samuel Nilusmas, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Modelling and control of coffee berry borer infestation
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Samuel Bowong, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Berge Tsanou
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Unravelling the contribution of cell cycle and cell expansion in an integrated model of tomato fruit development
- auteur
- Valentina Baldazzi
- article
- ECMTB 2018 - European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Modelling cell-death drug response heterogeneity at the receptor layer
- auteur
- Luis Pereira, Paul Hofman, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2018), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- An agricultural control of Radopholus similis in banana plantations
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Jean-Jules Tewa
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Qualitative control for a genetic negative feedback loop
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2018), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Gene-for-gene epidemic models, systemic acquired resistance, and the evolution of plant parasites
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Clin Pauline, Florence Val, Frédéric Grognard
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Reduction of Metabolic Networks keeping Core Dynamics
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2018), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Stability Analysis of a Nonlinear System with Infinite Distributed Delays Describing Cell Dynamics
- auteur
- Walid Djema, Frédéric Mazenc, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, Emilia Fridman
- article
- ACC 2018 - American Control Conference, Jun 2018, Milwaukee, United States. ⟨10.23919/acc.2018.8430869⟩
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-
- titre
- Gene-for-gene epidemic models, systemic acquired resistance, and the evolution of plant parasites
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Clin Pauline, Florence Val, Frédéric Grognard
- article
- $MB^2$ 3rd Mathematical Biology Modelling Days of Besançon, Jun 2018, Besançon, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Towards a control-theory approach for minimizing unused grid resources
- auteur
- Emmanuel Stahl, Agustín Gabriel Yabo, Olivier Richard, Bruno Bzeznik, Bogdan Robu, Eric Rutten
- article
- AI-Science'18 - workshop on Autonomous Infrastructure for Science, in conjunction with the ACM HPDC 2018, Jun 2018, Tempe, AZ, United States. pp.1-8, ⟨10.1145/3217197.3217201⟩
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-
- titre
- Maximizing microalgae productivity in a light-limited chemostat
- auteur
- Carlos Martínez, Olivier Bernard, Francis Mairet
- article
- Meeting of working Group Medicago sativa, Feb 2018, Vienne, Austria. pp.6, ⟨10.1016/j.ifacol.2018.04.001⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Reduction of Metabolic Networks keeping Dynamics
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- MATHMOD 2018 - 9th Vienna International Conference on Mathematical Modelling, Feb 2018, Vienne, Austria
- Accès au bibtex
-
- titre
- Robust output regulation of 2 x 2 hyperbolic systems: Control law and Input-to-State Stability
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Jean Auriol, Florent Di Meglio, Ulf Jakob F. Aarsnes
- article
- American and Control Conference, 2018, Milwaukee, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Gibbard-Satterthwaite Theorem
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Encyclopedia of Law and Economics, Springer New York, pp.1-7, 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Life-Cycle Assessment of Microalgal-Based Biofuels
- auteur
- Marjorie Morales, Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Hélias, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Biomass, Biofuels and Biochemicals, Elsevier, pp.507-550, 2018
- Accès au bibtex
-
- titre
- Arrow’s (im)possibility theorem
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Encyclopedia of Law and Economics, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Modélisation et contrôle en dynamiques de populations. Applications en protection des plantes.
- auteur
- Ludovic Mailleret
- article
- Automatique. Université Côte d'Azur, 2018
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-
Books
- titre
- Les conquêtes de l’INRA pour le biocontrôle
- auteur
- Thibaut Malausa, Emmanuelle Joly, Brigitte Frerot, Frédéric Marion-Poll, Denis Thiéry, Jean-Claude Martin, Amélie Lefèvre, Maria Navajas, Elisabeth Tabone, Jean-Yves Rasplus, Nicolas Ris, Jean-Claude Ogier, Sylvie Pages, Alain Givaudan, Sophie Gaudriault, Jean-Luc Gatti, Claire Lavigne, Jean-Charles Bouvier, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken, Etienne Klein, Lionel Roques, Nicolas Desneux, Christine Poncet, Marc Bardin, Philippe C. Nicot, Michel Ponchet, Eric Galiana, Marie-Noëlle Brisset
- article
- INRA Sciences & Impact, pp.32, 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Does mixing in suspended cultures enhance photosynthesis? Towards moving biofilms
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond, David Demory, Charlotte Combe, Jacques Sainte-Marie, Filipa Lopes, Antoine Sciandra
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2018, Amsterdam, Netherlands
- Accès au bibtex
-
- titre
- An individual based model to optimize natural enemies deployment in augmentative biological control.
- auteur
- Ludovic Mailleret, David Davtian, Frédéric Grognard
- article
- SFECOLOGY 2018 - International Conference on Ecological Sciences., Oct 2018, Rennes, France.
- Accès au bibtex
-
- titre
- An individual based model to optimize natural enemies deployment in augmentative biological control.
- auteur
- Ludovic Mailleret, David Davtian, Frédéric Grognard
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal.
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evolution of populations of Leptosphaeria maculans, a fungal pathogen of oilseed rape, under resistance selection pressure: insights from two decades of surveys in France
- auteur
- Marie-Helene Balesdent, Clémence Plissonneau, Florence Carpentier, Laurent Coudard, Suzanne Touzeau, Martine Leflon, Magali Ermel, Régine Delourme, Loïc Le Meur, Thierry Rouxel
- article
- 21. Crucifer Genetics Conference - Brassica 2018, Jul 2018, Saint-Malo, France. , 2018
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Synchronization of biological oscillators : modeling, analysis and coupling of the mammalian cell cycle and circadian clock
- auteur
- Sofia José Figueiredo Almeida
- article
- Other [cs.OH]. Université Côte d'Azur, 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4239⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamical reduction of metabolic networks by singular perturbation theory : application to microalgae
- auteur
- Claudia López Zazueta
- article
- Signal and Image processing. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4108⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- How optimal foragers should respond to habitat changes? On the consequences of habitat conversion
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Hamelin, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Organ-wide and ploidy-dependent regulations both contribute to cell size determination: evidence from a computational model of tomato fruit
- auteur
- Valentina Baldazzi, Pierre Valsesia, Michel Génard, Nadia Bertin
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- When higher carrying capacities lead to faster propagation
- auteur
- Marjorie Haond, Thibaut Morel-Journel, Eric Lombaert, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret, Lionel Roques
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Modeling the impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity
- auteur
- Quentin Béchet, Martin Laviale, Nicolas Arsapin, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2017, 10 (1), pp.136. ⟨10.1186/s13068-017-0823-z⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mathematical modelling of microbes: metabolism, gene expression and growth
- auteur
- Hidde de Jong, Stefano Casagranda, Nils Giordano, Eugenio Cinquemani, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of the Royal Society Interface, 2017, 14 (136), pp.1-14. ⟨10.1098/rsif.2017.0502⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimating virus effective population size and selection without neutral markers
- auteur
- Elsa Rousseau, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Rachid Senoussi, Alain Palloix, Vincent Simon, Sophie Valière, Frédéric Grognard, Frédéric Fabre
- article
- PLoS Pathogens, 2017, 13 (11), pp.e1006702. ⟨10.1371/journal.ppat.1006702⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use to identify durable plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- Acta Horticulturae, 2017, 1182, pp.211 - 218. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1182.25⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Cell division, endoreduplication and expansion processes: setting the cell and organ control into an integrated model of tomato fruit development
- auteur
- Valentina Baldazzi, Michel Génard, Nadia Bertin
- article
- Acta Horticulturae, 2017, 1182, pp.257 - 264. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1182.31⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling the temperature effect on the specific growth rate of phytoplankton: a review
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Reviews in Environmental Science and Bio/technology, 2017, ⟨10.1007/s11157-017-9443-0⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Continuous selection pressure to improve temperature acclimation of Tisochrysis lutea
- auteur
- Hubert Bonnefond, Ghjuvan Micaelu Grimaud, Judith Rumin, Gaël Bougaran, Amélie Talec, M O Gachelin, M O Boutoute, Eric Pruvost, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- PLoS ONE, 2017, ⟨10.1371/journal.pone.0183547⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A time-space model for the growth of microalgae biofilms for biofuel production
- auteur
- Bastien Polizzi, O. Bernard, Magali Ribot
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2017, ⟨10.1016/j.jtbi.2017.08.017⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Quantitative trait loci in pepper control the effective population size of two RNA viruses at inoculation
- auteur
- Lucie Tamisier, Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ghislaine Nemouchi, Marion Szadkowski, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Frederic Fabre, Benoît Moury, Alain Palloix
- article
- Journal of General Virology, 2017, 98 (7), pp.1923 - 1931. ⟨10.1099/jgv.0.000835⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Exploiting meteorological forecasts for the optimal operation of algal ponds
- auteur
- Riccardo De-Luca, Fabrizio Bezzo, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2017, 55, pp.55 - 65. ⟨10.1016/j.jprocont.2017.03.010⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dynamic metabolic modeling of heterotrophic and mixotrophic microalgal growth on fermentative wastes
- auteur
- Caroline Baroukh, Violette Turon, Olivier Bernard
- article
- PLoS Computational Biology, 2017, 13 (6), pp.e1005590. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005590⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fast algal eco-toxicity assessment: Influence of light intensity and exposure time on Chlorella vulgaris inhibition by atrazine and DCMU
- auteur
- Alexandre Camuel, Benoit Guieysse, Cynthia Alcántara, Quentin Béchet
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2017, 140, pp.141 - 147. ⟨10.1016/j.ecoenv.2017.02.013⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mate Limitation in Fungal Plant Parasites Can Lead to Cyclic Epidemics in Perennial Host Populations
- auteur
- Virginie Ravigné, Valérie Lemesle, Alicia A Walter, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2017, 73 (3), pp.1 - 447. ⟨10.1007/s11538-016-0240-7⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Coupling and uncoupling of triglyceride and beta-carotene production by Dunaliella salina under nitrogen limitation and starvation
- auteur
- Hubert Bonnefond, Nina Moelants, Amélie Talec, Patrick Mayzaud, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2017, 10 (1), pp.25. ⟨10.1186/s13068-017-0713-4⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Temperature is a key factor in Micromonas-virus interactions
- auteur
- David Demory, Laure Arsenieff, Nathalie Simon, Christophe Six, Fabienne Rigaut-Jalabert, Dominique Marie, Pei Ge, Estelle Bigeard, Stéphan Jacquet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Sophie Rabouille, Anne-Claire Baudoux
- article
- ISME Journal, 2017, 11 (3), pp.601-612. ⟨10.1038/ismej.2016.160⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Infochemical use and dietary specialization in parasitoids: a meta-analysis
- auteur
- Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret, Xavier Fauvergue
- article
- Ecology and Evolution, 2017, 7 (13), pp.4804 - 4811. ⟨10.1002/ece3.2888⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A kinetic model of sugar metabolism in peach fruit allows the exploration of genetic variability
- auteur
- Elsa Desnoues, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Valentina Baldazzi
- article
- Acta Horticulturae, 2017, 1182, pp.169-176. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1182.20⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Augmentative biocontrol when natural enemies are subject to Allee effects
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2017, 74 (7), pp.1561 - 1587. ⟨10.1007/s00285-016-1063-8⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hunting cooperation and Allee effects in predators
- auteur
- Mickaël Teixeira Alves, Frank M. Hilker
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2017, 419, pp.13-22. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.02.002⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The next generation of microalgae production systems under photovoltaic greenhouses
- auteur
- O. Bernard, Ricardo Suay Suay, Q. Bechet, Christine Poncet, Hicham Fatnassi, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Antoine Mangin, D. Coulon, R. Boubekri
- article
- Acta Horticulturae, 2017, 1170, pp.921-928. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1170.118⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimization and control of bio-conversion of polymeric substrate in the chemostat
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- AIChE Journal, 2017, 63 (11), pp.4738-4747. ⟨10.1002/aic.15853⟩
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-
- titre
- Applying differential dynamic logic to reconfigurable biological networks
- auteur
- Daniel Figueiredo, Manuel A Martins, Madalena Chaves
- article
- Mathematical Biosciences, 2017, 291, pp.10 - 20. ⟨10.1016/j.mbs.2017.05.012⟩
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-
- titre
- How to prevent viremia rebound in virus infections ? Evidence from a data-driven mathematical model for PRRS.
- auteur
- Andrea Doeschl-Wilson, Natacha Go, Suzanne Touzeau
- article
- SAPHIR Newsletters, 2017, 4, pp.9-11
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-
Conference papers
- titre
- Potential of evolution engineering for enhancing productivity of microalgae
- auteur
- Hubert Bonnefond, Amélie Talec, Eric Pruvost, M O Boutoute, Ghjuvan Micaelu Grimaud, Yann Lie, T Sauvée, Antoine Sciandra
- article
- AlgaEurope 2017 Conference, Dec 2017, Berlin, Germany
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-
- titre
- Épidémiologie mathématique : applications en élevage et en agriculture
- auteur
- Suzanne Touzeau
- article
- MADEV17 - Mathématiques Appliquées à des questions de DEVeloppement, Académie des Sciences, France; Académie Hassan II des Sciences et Techniques, Maroc, Oct 2017, Rabat, Maroc
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-
- titre
- How to prevent viremia rebound? Evidence from a PRRSv data-supported model of the immune response
- auteur
- Natacha Go, Suzanne Touzeau, Andrea Doeschl-Wilson, Catherine Belloc
- article
- IDDconf 2017 - Conference of Infectious Disease Dynamics, Sep 2017, Ambleside, Cumbria, United Kingdom
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-
- titre
- A comprehensive reduced model of the mammalian cell cycle
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay, Celine Feillet
- article
- IFAC World Congress 2017, Jul 2017, Toulouse, France. ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.2204⟩
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-
- titre
- Maximizing microalgae productivity by shading outdoor cultures
- auteur
- Carlos Martínez, Olivier Bernard, Francis Mairet
- article
- IFAC 2017 - 20th World Congress of the International Federation of Automatic Control, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jul 2017, Toulouse, France. pp.8734 - 8739, ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.1725⟩
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-
- titre
- Optimal resource allocation for biotrophic plant pathogens
- auteur
- Ivan Yegorov, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Fabien Halkett
- article
- IFAC 2017 - 20th World Congress of the International Federation of Automatic Control, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jul 2017, Toulouse, France. pp.1-6, ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.328⟩
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-
- titre
- Principal Process Analysis and reduction of biological models with order of magnitude
- auteur
- Stefano Casagranda, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jul 2017, Toulouse, France. 15968 p., ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.2241⟩
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-
- titre
- Optimal resource allocation for bacterial growth with degradation
- auteur
- Ivan Yegorov, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jul 2017, Toulouse, France. 15968 p., ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.1593⟩
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-
- titre
- Evolution engineering for enhancing photosynthetic efficiency of high density cultures of Tisochrysis lutea
- auteur
- Hubert Bonnefond, Yann Lie, Eric Pruvost, Amélie Talec, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- 6th congress of the International Society for Applied Phycology, Jun 2017, Nantes, France
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-
- titre
- Impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity: consequence for mass cultivation
- auteur
- Quentin Béchet, Martin Laviale, Nicolas Arsapin, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- 6th congress of the International Society for Applied Phycology (ISAP), Jun 2017, Nantes, France
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-
- titre
- Neutralising antibodies prevent PRRS viremia rebound: evidence from a data-supported model of immune response
- auteur
- Natacha Go, Suzanne Touzeau, Catherine Belloc, Andrea Doeschl-Wilson
- article
- ModAH 2017 - Modelling in Animal Health conference, INRA, Jun 2017, Nantes, France. 69 p
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-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use for durable plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone, Ludovic Mailleret
- article
- EASYs 2017 - Ecology & Agriculture Summit for Young scientists, EAS., Mar 2017, Chizé, France
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-
- titre
- Modeling cell death dynamics at the receptor level
- auteur
- Luis Pereira, Mickael Meyer, Paul Hofman, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- CompSysBio, Advanced Lecture Course on Computational Systems Biology, Mar 2017, Aussois, France
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-
- titre
- Reduction of a complex biotechnological process model using state-variable association method-Application to the anaerobic digestion of micro-algae
- auteur
- Zeyneb Khedim, Boumediene Benyahia, Francis Mairet, Jean-Philippe Steyer, Jérôme Harmand
- article
- 2017 International Conference on Control, Automation and Diagnosis (ICCAD), IEEE, Jan 2017, Hammamet, Tunisia. pp.135-140, ⟨10.1109/CADIAG.2017.8075645⟩
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-
Other publications
- titre
- Manipuler les forces évolutives exercées par les plantes sur les virus pour améliorer la durabilité des gènes de résistance
- auteur
- Benoît Moury, Julie Quenouille-Lederer, Elsa Rousseau, Lucie Tamisier, Ghislaine Nemouchi, Marion Szadkowski, Gregory Girardot, Pauline Millot, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Frédéric Fabre, Alain Palloix
- article
- 2017, pp.63-74
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-
Patents
- titre
- Selective bioreactor for microalgae
- auteur
- Olivier Bernard, Antoine Sciandra, Francis Mairet, Hubert Bonnefond, Eric Pruvost
- article
- France, Patent n° : WO2017174907A1. 2017
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-
Poster communications
- titre
- Impact de la température sur les interactions entre la microalgue marine Micromonas et les virus qui l’infectent
- auteur
- David Demory, Laure Arsenieff, Nathalie Simon, Christophe Six, Fabienne Rigaut-Jalabert, Dominique Marie, Pei Ge, Estelle Bigeard, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Sophie Rabouille, A. C. Baudoux
- article
- VIIIe Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne,, Oct 2017, Camaret-sur-Mer, France
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-
Reports
- titre
- Modélisation du portage des salmonelles dans un élevage porcin
- auteur
- Justine Guillaumont, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- [Rapport Technique] 2017-2, INRA, UR1404 Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement. 2017, pp.47
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-
Theses
- titre
- Modélisation de stratégies d'introduction de populations, effets Allee et stochasticité
- auteur
- Nicolas Bajeux
- article
- Autre. Université Côte d'Azur, 2017. Français. ⟨NNT : 2017AZUR4056⟩
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-
- titre
- Modeling, analysis and reduction of biological systems
- auteur
- Stefano Casagranda
- article
- Other. Université Côte d'Azur, 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4049⟩
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-
2016
Journal articles
- titre
- Optimization of strain selection in evolutionary continuous culture
- auteur
- Terence Bayen, Francis Mairet
- article
- International Journal of Control, 2016, 90 (12), pp.2748-2759. ⟨10.1080/00207179.2016.1264631⟩
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-
- titre
- Evidence for an optimal level of connectivity for establishment and colonisation
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Camille Piponiot, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- Biology Letters, 2016, 12 (11), ⟨10.1098/rsbl.2016.0704⟩
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-
- titre
- Integrating Physiology and Architecture in Models of Fruit Expansion
- auteur
- Mikolaj Cieslak, Ibrahim Cheddadi, Frédéric Boudon, Valentina Baldazzi, Michel Génard, Christophe Godin, Nadia Bertin
- article
- Frontiers in Plant Science, 2016, 7, pp.19. ⟨10.3389/fpls.2016.01739⟩
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-
- titre
- Calibration of a productivity model for the microalgae Dunaliella salina accounting for light and temperature
- auteur
- Quentin Béchet, Philippe Moussion, Olivier A. Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2016, 21, pp.156 - 160. ⟨10.1016/j.algal.2016.11.001⟩
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-
- titre
- Temporal niche differentiation of parasites sharing the same plant host: oak powdery mildew as a case study
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Anne Bisson, Marie-Laure Desprez Loustau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret
- article
- Ecosphere, 2016, 7 (11), pp.e01517. ⟨10.1002/ecs2.1517⟩
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-
- titre
- Influence of temperature on Chlorella vulgaris growth and mortality rates in a photobioreactor
- auteur
- Rui Serra-Maia, Olivier A. Bernard, Ana Gonçalves, Sakina Bensalem, Filipa Lopes
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2016, 18, pp.352 - 359. ⟨10.1016/j.algal.2016.06.016⟩
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-
- titre
- Modelling Salmonella transmission among pigs from farm to slaughterhouse: Interplay between management variability and epidemiological uncertainty
- auteur
- Jordi Ferrer Savall, Caroline Bidot, Mily Leblanc-Maridor, Catherine Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- International Journal of Food Microbiology, 2016, 229, pp.33-43. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2016.03.020⟩
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-
- titre
- Maximizing Productivity and Reducing Environmental Impacts of Full-Scale Algal Production through Optimization of Open Pond Depth and Hydraulic Retention Time
- auteur
- Quentin Béchet, Andy Shilton, Benoit Guieysse
- article
- Environmental Science and Technology, 2016, 50 (7), pp.4102 - 4110. ⟨10.1021/acs.est.5b05412⟩
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-
- titre
- Reply to the Comment on “Mathematical modeling of unicellular microalgae and cyanobacteria metabolism for biofuel production” by Baroukh et al. [Curr. Opin. Biotechnol. 2015, 33:198–205]
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Olivier A. Bernard, Jean-Philippe Steyer
- article
- Current Opinion in Biotechnology, 2016, 38, pp.200 - 202. ⟨10.1016/j.copbio.2016.02.018⟩
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-
- titre
- Dynamical allocation of cellular resources as an optimal control problem: Novel insights into microbial growth strategies
- auteur
- Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- PLoS Computational Biology, 2016, 12 (3), pp.e1004802. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004802⟩
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-
- titre
- Concomitant effects of light and temperature diel variations on the growth rate and lipid production of Dunaliella salina
- auteur
- Hubert Bonnefond, N. Moelants, A. Talec, Olivier Bernard, A. Sciandra
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2016, 14, pp.72-78. ⟨10.1016/j.algal.2015.12.018⟩
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-
- titre
- Sharing a resource with randomly arriving foragers
- auteur
- Pierre Bernhard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Mathematical Biosciences, 2016, 273 (91), pp.91-101. ⟨10.1016/j.mbs.2016.01.004⟩
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-
- titre
- Dynamic coupling of photoacclimation and photoinhibition in a model of microalgae growth
- auteur
- Andreas Nikolaou, Philipp Hartmann, Antoine Sciandra, Benoît Chachuat, Olivier Bernard
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2016, 390, pp.61 - 72. ⟨10.1016/j.jtbi.2015.11.004⟩
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-
- titre
- Robustness of Bioprocess Feedback Control to Biodiversity
- auteur
- Francis Mairet, Olivier A. Bernard
- article
- AIChE Journal, 2016, pp.24. ⟨10.1002/aic.15604⟩
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-
- titre
- On Dynamic Games with Randomly Arriving Players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Dynamic Games and Applications, 2016, pp.34. ⟨10.1007/s13235-016-0197-z⟩
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-
- titre
- Periodic Oscillations for Non Monotonic Smooth Negative Feedback Circuits
- auteur
- Camille Poignard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2016, 15 (1), pp.257-286. ⟨10.1137/15M1033368⟩
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-
- titre
- The importance of being fast: comparative kinetics of vertical migration and non-photochemical quenching of benthic diatoms under light stress
- auteur
- Martin Laviale, Silja Frankenbach, João Serôdio
- article
- Marine Biology, 2016, 163 (1), ⟨10.1007/s00227-015-2793-7⟩
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-
- titre
- Hybrid Control of a Bioreactor with Quantized Measurements
- auteur
- Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- IEEE Transactions on Automatic Control, 2016, 61 (5), pp.1385 - 1390 ⟨10.1109/TAC.2015.2471735⟩
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-
- titre
- An optimisation approach for stability analysis and controller synthesis of linear hyperbolic systems
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Antoine Girard, Christophe Prieur
- article
- ESAIM: Control, Optimisation and Calculus of Variations, 2016, 22 (4), pp.1236-1263. ⟨10.1051/cocv/2016038⟩
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-
Conference papers
- titre
- Theoretical and microcosm approaches to biological invasions
- auteur
- Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- The Physics and Biology of Invasion, Dec 2016, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, T. Morel-Journel, L. Roques, Elodie Vercken
- article
- SFÉCOLOGIE 2016- Colloque de la societe francaise d'ecologie, Oct 2016, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effect of the spatial distribution of resources in experimental mini-landscapes on the fitness of two populations of Trichogramma cacoeciae
- auteur
- Victor Burte, Guy Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- Sfécologie2016 - International Conference on Ecological Sciences, Oct 2016, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Metabolic modeling of C. sorokiniana diauxic heterotrophic growth
- auteur
- Caroline Baroukh, Olivier Bernard
- article
- 6. IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE), Oct 2016, Magdeburg, Germany. pp.330-335, ⟨10.1016/j.ifaco1.2016.12.148⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use for durable plant resistance deployment strategies
- auteur
- S. Nilusmas, M. Mercat, T. Perrot, Suzanne Touzeau, V. Calcagno, C. Djian-Caporalino, P. Castagnone, Ludovic Mailleret
- article
- Hortimodel 2016 - Models for plant growth, environment control and farming management in protected cultivation, Sep 2016, Avignon, France. 8 p
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Model simplification and process analysis of biological models
- auteur
- Stefano Casagranda, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- The 5th International Symposium on Positive Systems (POSTA), Sep 2016, Rome, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- Caractérisation des substances polymériques extracellulaires (EPS) de biofilms de diatomées benthiques marines
- auteur
- Steven G Daniel, Cédric Hubas, Hubert Bonnefond, Sophie Sablé, Olivier Bernard, Martin Laviale
- article
- 35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2016, Belvaux, Luxembourg
- Accès au bibtex
-
- titre
- Quantitative trait loci in pepper genome control the effective population size of two RNA viruses at inoculation
- auteur
- Lucie Tamisier, Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ghislaine Nemouchi, Marion Szadkowski, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Alain Palloix
- article
- 16. Eucarpia Capsicum and Eggplant meeting, Szent István University. Gödöllo, HUN., Sep 2016, Kecskemét, Hungary. 591 p
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, Thibaut Morel Journel, Lionel Roques, Elodie Vercken
- article
- 10. Models in Population Dynamics and Ecology (CMPDE 16), Aix Marseille Université (AMU). Marseille, FRA., Sep 2016, Marseille, France
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-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, Thibaut Morel Journel, Lionel Roques, Elodie Vercken
- article
- MPDE 2016 - International Conference on Models in Population Dynamics and Ecology, Sep 2016, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Introduced populations in a stochastic world
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- CMPDE 16 - 10. Models in Population Dynamics and Ecology, Aix Marseille Université (AMU). FRA., Sep 2016, Marseille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- 2D piecewise affine models approximate real continuous dynamics up to invariant sets
- auteur
- Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- NOLCOS 2016 - 10th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems, Aug 2016, Monterey, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Introduced populations in a stochastic world
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- ECMTB 2016 - European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2016, Nottingham, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Oscillations for non monotonic negative feedback genes networks
- auteur
- Camille Poignard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2016, Nottingham, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Adding an integrator to backstepping: Output disturbances rejection for linear hyperbolic systems
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Florent Di Meglio
- article
- American Control Conference, Jul 2016, Boston, United States. ⟨10.1109/ACC.2016.7525443⟩
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-
- titre
- Joint estimation of effective population size and selection coefficient without neutrel markers: method validation and application to experimental evolution of viruses
- auteur
- Elsa Rousseau, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Rachid R. Senoussi, Alain Palloix, Vincent Simon, Frédéric Grognard, Sophie Valière, Frédéric Fabre
- article
- 13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. 165 p
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal operation of algal ponds accounting for future meteorology
- auteur
- Riccardo De-Luca, Quentin Béchet, Fabrizio Bezzo, Olivier A. Bernard
- article
- 11th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, including Biosystems, Jun 2016, Trondheim, Norway. pp.1062 - 1067, ⟨10.1016/j.ifacol.2016.07.343⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dynamic Flux Balance Analysis of the Metabolism of Microalgae under a Diurnal Light Cycle
- auteur
- Caroline Baroukh, Jean Philippe Steyer, Olvier Bernard, Benoit Chachuat
- article
- DYCOPS-CAB 2016 - 11th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, Including Biosystems DYCOPS-CAB 2016, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jun 2016, Trondheim, Norway. pp.791 - 796, ⟨10.1016/j.ifacol.2016.07.285⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Photoinhibistat: Operating Microalgae Culture under Photoinhibition for Strain Selection
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 11th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems Including Biosystems DYCOPS-CAB , Jun 2016, Trondheim, Norway. ⟨10.1016/j.ifacol.2016.07.344⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Why, when and how should exposure be considered in a model representing the within-host immune response to infection?
- auteur
- Suzanne Touzeau, Natacha Go, Caroline Bidot, Catherine Belloc
- article
- Emerging Trends in Applied Mathematics and Mechanics (ETAMM), May 2016, Perpignan, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, T. Morel-Journel, L. Roques, Elodie Vercken
- article
- ETAMM 2016 - Emerging Trends in Applied Mathematics and Mechanics., May 2016, Perpignan, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Stochastic epidemiological model for the analysis of plant resistance break- down to pathogens subjected to genetic drift
- auteur
- Elsa Rousseau, Mélanie Bonneault, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- Emerging trends in applied mathematics and mechanics (ETAMM 2016), May 2016, Perpignan, France
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-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, Thibaut Morel Journel, Lionel Roques, Elodie Vercken
- article
- Emerging Trends in Applied Mathematics and Mechanics (ETAMM 2016), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD). FRA., May 2016, Perpignan, France
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-
- titre
- Introduced populations in a stochastic world
- auteur
- N. Bajeux, F. Grognard, Ludovic Mailleret, V. Calcagno
- article
- Models in population dynamics and ecology, 2016, Marseille, France
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-
Lectures
- titre
- Modélisation mathématique en épidémiologie animale et végétale
- auteur
- Suzanne Touzeau
- article
- École thématique. École de recherche CIMPA-CETIC Modélisation Mathématique en Sciences du Vivant, Yaoundé, Cameroun. 2016
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-
Patents
- titre
- BIOREACTOR FOR MICROALGAE
- auteur
- Olivier Bernard, Francis Mairet, Charlotte Combe, Antoine Sciandra, Eric Pruvost
- article
- France, Patent n° : WO/2016/151219. 2016
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-
Poster communications
- titre
- Genetic drift as a tool to increase the durability of plant qualitative resistance to viruses
- auteur
- Elsa Rousseau, Mélanie Bonneault, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- 13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. , 165 p., 2016, “Building bridges between disciplines for sustainable management of plant virus diseases”. IPVE 2016. Programme and abstracts
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-
Reports
- titre
- Dynamic equilibrium in games with randomly arriving players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- [Research Report] RR-8961, Université de la Côte d'Azur - INRIA. 2016, pp.38
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-
Theses
- titre
- Modelling the temperature effect on phytoplankton : from acclimation to adaptation
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud
- article
- Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. English. ⟨NNT : 2016NICE4025⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effet de la dérive génétique et de la sélection sur la durabilité de la résistance des plantes aux virus
- auteur
- Elsa Rousseau
- article
- Sciences agricoles. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. Français. ⟨NNT : 2016NICE4024⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Cournot oligopoly with randomly arriving producers
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamic equilibrium in games with randomly arriving players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Shared predation: positive effects of predator distraction
- auteur
- Mickaël Teixeira Alves, Frédéric Grognard, Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret
- article
- 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2015
Journal articles
- titre
- Epidemiological and evolutionary management of plant resistance: optimizing the deployment of cultivar mixtures in time and space in agricultural landscapes
- auteur
- Frédéric Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- Evolutionary Applications, 2015, 8 (10), pp.919-932. ⟨10.1111/eva.12304⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysis of a periodic optimal control problem connected to microalgae anaerobic digestion
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Pierre Martinon, Matthieu Sebbah
- article
- Optimal Control Applications and Methods, 2015, 36 (6), pp.750-773. ⟨10.1002/oca.2127⟩
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-
- titre
- Instrumentation and control of anaerobic digestion processes: a review and some research challenges
- auteur
- Julie Jimenez, Eric Latrille, Jérome Harmand, Daniel Gaida, Christian Wolf, Francis Mairet, Olivier Bernard, Victor Alcaraz-Gonzalez, Hugo Mendez-Acosta, Daniel Zitomer, Dennis Totzke, Henri Spanjers, Fabian Jacobi, Alan Guwy, Richard Dinsdale, Sofiane Mazhegrane, Gonzalo Ruiz-Filippi, Aurora Seco, Thierry Ribeiro, André Pauss, Jean-Philippe Steyer
- article
- Reviews in Environmental Science and Bio/technology, 2015, 14 (4), pp.615-648. ⟨10.1007/s11157-015-9382-6⟩
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-
- titre
- The highs and lows of dispersal: how connectivity and initial population size jointly shape establishment dynamics in discrete landscapes
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Pierre Girod, Ludovic Mailleret, Alexandra Auguste, Aurélie Blin, Elodie Vercken
- article
- Oikos, 2015, 125 (6), pp.769-777. ⟨10.1111/oik.02718⟩
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-
- titre
- Recommendations for Life Cycle Assessment of algal fuels
- auteur
- Pierre Collet, Arnaud Hélias, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Applied Energy, 2015, 154, pp.1089-1102. ⟨10.1016/j.apenergy.2015.03.056⟩
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-
- titre
- Production of a methyl ester from the microalgae Nannochloropsis grown in raceways on the French west coast
- auteur
- Béatrice Perrier, Christelle Crampon, Olivier Guézet, Coralie Simon, François Maire, Olivier Lépine, Jeremy Pruvost, Paul Lozano, Olivier Bernard, Elisabeth Badens
- article
- Fuel, 2015, 153, pp.640-649. ⟨10.1016/j.fuel.2015.03.011⟩
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-
- titre
- Temporal autocorrelation in host density increases establishment success of parasitoids in an experimental system
- auteur
- Elodie Vercken, Xavier Fauvergue, Nicolas Ris, Didier Crochard, Ludovic Mailleret
- article
- Ecology and Evolution, 2015, 5 (13), pp.2684-2693. ⟨10.1002/ece3.1505⟩
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-
- titre
- Analysis of an optimal control problem connected to bioprocesses involving a saturated singular arc
- auteur
- Térence Bayen, Marc Mazade, Francis Mairet
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, 2015, 20 (1), pp.39-58. ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.39⟩
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-
- titre
- Long-term adaptive response to high-frequency light signals in the unicellular photosynthetic eukaryote Dunaliella salina
- auteur
- Charlotte Combe, Philipp Hartmann, Sophie Rabouille, Amélie Talec, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2015, 112 (6), pp.1111-1121. ⟨10.1002/bit.25526⟩
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-
- titre
- Optimal feeding strategy for the minimal time problem of a fed-batch bioreactor with mortality rate
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
- article
- Optimal Control Applications and Methods, 2015, 36 (1), pp.77-92. ⟨10.1002/oca.2102⟩
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-
- titre
- L’hétérogénéité intraclonale des tumeurs et son impact sur la médecine de précision
- auteur
- Jérémie Roux, Jean-Luc Gouzé, Paul Hofman
- article
- médecine/sciences, 2015, 31 (1), pp.28-31. ⟨10.1051/medsci/20153101009⟩
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-
- titre
- A state of the art of metabolic networks of unicellular microalgae and cyanobacteria for biofuel production
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Metabolic Engineering, 2015, 30, pp.49-60. ⟨10.1016/j.ymben.2015.03.019⟩
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-
- titre
- Continuous-switch piecewise quadratic models of biological networks: Application to bacterial growth
- auteur
- Alfonso Carta, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- Automatica, 2015, 61, pp.164-172. ⟨10.1016/j.automatica.2015.07.031⟩
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-
- titre
- Design of a bistable switch to control cellular uptake
- auteur
- Diego A. Oyarzún, Madalena Chaves
- article
- Journal of the Royal Society Interface, 2015, 12 (113), pp.20150618. ⟨10.1098/rsif.2015.0618⟩
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-
- titre
- Proportional Transaction Costs in the Robust Control Approach to Option Pricing: The Uniqueness Theorem
- auteur
- Naïma El Farouq, Pierre Bernhard
- article
- Applied Mathematics and Optimization, 2015, 72 (2), pp.187-202. ⟨10.1007/s00245-014-9276-y⟩
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-
- titre
- Adaptive control of light attenuation for optimizing microalgae production
- auteur
- Francis Mairet, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2015, 30, pp.117-124. ⟨10.1016/j.jprocont.2015.03.010⟩
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-
- titre
- The use of fluorescent Nile red and BODIPY for lipid measurement in microalgae
- auteur
- Judith Rumin, Hubert Bonnefond, Bruno Saint-Jean, Catherine Rouxel, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Jean-Paul Cadoret, Gaël Bougaran
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2015, 8 (1), pp.16. ⟨10.1186/s13068-015-0220-4⟩
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-
- titre
- The utilization of microcosms to test invasion biology hypotheses
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Xavier Fauvergue, Eric Lombaert, Ludovic Mailleret, Thibaut Malausa, Nicolas Ris, Elodie Vercken
- article
- Revue d'Ecologie, 2015, 70, pp.16 - 27
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-
- titre
- Mathematical modeling of unicellular microalgae and cyanobacteria metabolism for biofuel production
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer
- article
- Current Opinion in Biotechnology, 2015, 33, pp.198-205. ⟨10.1016/j.copbio.2015.03.002⟩
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-
- titre
- Evolutionary Dynamics of the Handicap Principle: An Example
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Dynamic Games and Applications, 2015, 5 (2), pp.214-227. ⟨10.1007/s13235-014-0108-0⟩
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-
- titre
- The colorimetric assay of viability for algae (CAVA): a fast and accurate technique
- auteur
- Quentin Béchet, Ivan Feurgard, Benoit Guieysse, Filipa Lopes
- article
- Journal of Applied Phycology, 2015, 27 (6), pp.2289-2297. ⟨10.1007/s10811-014-0508-y⟩
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-
- titre
- Competition between phytoplankton and bacteria: exclusion and coexistence
- auteur
- Frédéric Grognard, Pierre Masci, Eric Benoît, Olivier Bernard
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2015, 70 (5), pp.959-1006. ⟨10.1007/s00285-014-0783-x⟩
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-
- titre
- Natural enemies deployment in patchy environments for augmentative biological control
- auteur
- Bapan Ghosh, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- Applied Mathematics and Computation, 2015, 266 (1), pp.982-999. ⟨10.1016/j.amc.2015.06.021⟩
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-
Conference papers
- titre
- Organic matter characterization: towards a unified methodology for biological treatments modelling
- auteur
- Julie Jimenez, Camila Espinoza Cavajal, Quentin Aemig, Sabine Houot, Jean-Philippe Steyer, Fabien Vedrenne, Dominique Patureau
- article
- 14. World Congress on Anaerobic Digestion (AD14), International Water Association (IWA). INT., Nov 2015, Viña del Mar, Chile
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-
- titre
- A new approach to unravel metabolic regulations. Application to microalgae growth and lipid production under day/night cycles and nitrogen starvation
- auteur
- Caroline Baroukh, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer, Rafael Munoz Tamayo, Benoit Chachuat
- article
- BioSynSys 2015 : 1er colloque du GDR "Biologie de Synthèse et des Systèmes", Sep 2015, Paris, France
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-
- titre
- It’s all about connections: hubs and invasions in habitat networks
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Claire Rais Assa, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Annual Meeting of the Ecological Society of America, Aug 2015, Baltimore, United States
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-
- titre
- Control of bio-conversion of polymeric substrate in the chemostat
- auteur
- Jean-Luc Gouzé, Francis Mairet, Jacques Alexandre Sepulchre
- article
- FOSBE, Aug 2015, Boston, United States
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-
- titre
- Metabolic modeling of microalgae growth and lipids production during day/night cycles and nitrogen starvation
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Metabolic Pathway Analysis 2015, Jun 2015, Braga, Portugal
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-
- titre
- Towards a better understanding of the within-host dynamics to PRRSv: insights from modelling approach
- auteur
- Natacha Go, Catherine Belloc, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- International Porcine Reproductive And Respiratory Syndrome Congress, Jun 2015, Gand, Belgium
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-
- titre
- Joint estimation of effective population sizes and selection coefficients from time-sampled data: a case study on virus populations submitted to plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- 9. colloque de la Société Française de Phytopathologie, Societe Francaise de Phytopathologie (SFP). FRA., Jun 2015, Colmar, France
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-
- titre
- Contrôle hybride d'un bioréacteur avec des mesures discrètes
- auteur
- Jean-Luc Gouzé
- article
- 35ème Colloque de la Société Francophone de Biologie Théorique, Jun 2015, Poitiers, France
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-
- titre
- Model reduction and process analysis of biological models
- auteur
- Stefano Casagranda, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2015 23th Mediterranean Conference on Control and Automation (MED), Jun 2015, Torremolinos, Spain. ⟨10.1109/MED.2015.7158908⟩
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-
- titre
- Discrete synchronization of massively coupled systems using hierarchical couplings
- auteur
- Camille Poignard
- article
- SIAM Conference on Applications of Dynamical Systems, May 2015, Snowbird, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Estimation of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- Modelling biological evolution 2015: linking mathematical theories with empirical realities, Apr 2015, Leicester, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Towards an exploration of PRRSv vaccine efficiency in silico
- auteur
- Natacha Go, Catherine Belloc, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- European Symposium of Porcine Health Management, Apr 2015, Nantes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Joint estimation of effective population sizes and selection coefficients from time-sampled data: a case study on virus populations exposed to plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- 15. Rencontres de Virologie Végétale (RVV), Jan 2015, Aussois, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A simple Adaptive Dynamics model to study the effect of global warming on marine phytoplankton
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Francis Mairet, Sakina-Dorothée Ayata, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Mathematical Models in Ecology and Evolution, 2015, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling the effect of temperature on phytoplankton growth across the global ocean
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Valérie Le Guennec, Sakina-Dorothée Ayata, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- 8th Vienna International Conference on Mathematical Modelling — MATHMOD 2015, 2015, Vienna, Austria. ⟨10.1016/j.ifacol.2015.05.059⟩
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-
Book sections
- titre
- Modelling of Microalgae Culture Systems with Applications to Control and Optimization
- auteur
- Olivier Bernard, Francis Mairet, Benoît Chachuat
- article
- Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology , Microalgae Biotechnology (153), pp. 59-87, 2015, 0724-6145. ⟨10.1007/10_2014_287⟩
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-
- titre
- Linear Quadratic Zero-Sum Two-Person Differential Games
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Encyclopaedia of Systems and Control, Springer-Verlag, pp.6, 2015, ⟨10.1007/978-1-4471-5102-9_29-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Pursuit-Evasion Games and Zero-sum Two-person Differential Games
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Encyclopaedia of Systems and Control, Springer-Verlag, pp.8, 2015, ⟨10.1007/978-1-4471-5102-9_270-1⟩
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-
Other publications
- titre
- « Structures : organisation, complexité, dynamique » des mot-clés au sens inattendu
- auteur
- Thierry Viéville, Sylvie Boldo, Florent Masseglia, Pierre Bernhard
- article
- 2015
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Modeling and coupling biorhythms
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé, Franck Delaunay
- article
- 2nd Labex SIGNALIFE Meeting, Nov 2015, Nice, France. , 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Joint estimation of the strength of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data : a case study on the adaptation of virus populations to host plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- SMBE Satellite meeting SMBEBA 2015 "Investigating biological adaptation with NGS: data and models", May 2015, St Martin de Londres, France. , 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimation of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- Modelling biological evolution 2015: linking mathematical theories with empirical realities, Apr 2015, Leicester, United Kingdom. , 2015
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-
Reports
- titre
- Modélisation de l'interaction entre gènes pour évaluer la durabilité de résistances variétale
- auteur
- Romain Tching Chi Yen
- article
- [Stage] France. Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), FRA. 2015, 27 p
- Accès au bibtex
-
- titre
- Calibration of Personalized Patient Pharmacokinetic Models
- auteur
- Victor A Bernal Arzola
- article
- [Internship report] Université de Nice Sophia Antipolis. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Réduction de la taille des antennes photosynthétiques d'une microalgue par pression de séléction
- auteur
- Yann Lie
- article
- [Internship report] ENSAT. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de la production de biomasse de microalgues dans des bassins sous serres
- auteur
- Margaux Caïa
- article
- [Internship report] ENSAT. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Conception et étude d’un modèle de gestion durable des variétés de plantes résistantes aux virus dans un paysage agricole
- auteur
- Mélanie Bonneault
- article
- [Stage] INSA Lyon. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de la production de microalgues sous serre photovoltaique
- auteur
- Philippe Moussion
- article
- [Internship report] ENSAT. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de l’interaction entre gènes pour évaluer la durabilité de résistances variétales
- auteur
- Romain Tching Chi Yen
- article
- [Stage] INSA Lyon. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de l'impact des hautes températures sur les microalgues
- auteur
- Nicolas Arsapin
- article
- [Internship report] Université du Sud Toulon Var. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Évolution de la virulence chez un nématode phytoparasite : optimisation et analyse de sensibilité des stratégies de déploiement temporel de plantes résistantes
- auteur
- Mathilde Mercat
- article
- [Stage] Université de Rennes 1. 2015, pp.22
- Accès au bibtex
-
- titre
- Réponse physiologique d'une cyanobactérie à la température
- auteur
- Tiphaine Lecieux
- article
- [Stage] Master d’Océanographie – Spécialité Biologie Ecologie Marine, Université Aix-Marseille. 2015
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Modelling, analysis and control of biological networks
- auteur
- Ismail Belgacem
- article
- Automatic Control Engineering. Université Nice Sophia-Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Joint estimation of the strength of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data : a case study on the adaptation of virus populations to host plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid Senoussi, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- 2015
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-
- titre
- On Dynamic Games with Randomly Arriving Players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- 2015
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-
2014
Journal articles
- titre
- Phytoplankton plasticity drives large variability in carbon fixation efficiency
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Marina Lévy, Olivier Aumont, Laure Resplandy, Alessandro Tagliabue, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Geophysical Research Letters, 2014, 41 (24), pp.8994-9000. ⟨10.1002/2014gl062249⟩
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-
- titre
- The functional response predicts the effect of resource distribution on the optimal movement rate of consumers
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin, Eric Wajnberg, Ludovic Mailleret
- article
- Ecology Letters, 2014, 17 (12), pp.1570-1579. ⟨10.1111/ele.12379⟩
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-
- titre
- Simple signaling games of sexual selection (Grafen’s revisited)
- auteur
- Pierre Bernhard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2014, 69 (6-7), pp.1719-1742. ⟨10.1007/s00285-013-0745-8⟩
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-
- titre
- Links between topology of the transition graph and limit cycles in a two-dimensional piecewise affine biological model
- auteur
- Wassim Abou-Jaoudé, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2014, 69 (6-7), pp.1461-1495. ⟨10.1007/s00285-013-0735-x⟩
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-
- titre
- La production de micro-algues sous serre photovoltaique : évolution ou révolution ?
- auteur
- Olivier Bernard
- article
- Revue de l'Energie, 2014, 621, pp.385-392
- Accès au bibtex
-
- titre
- How optimal foragers should respond to habitat changes: a reanalysis of the Marginal Value Theorem
- auteur
- Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret, Eric Wajnberg, Frédéric Grognard
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2014, 69 (5), pp.1237-1265. ⟨10.1007/s00285-013-0734-y⟩
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-
- titre
- Modelling the dynamics of carbon–nitrogen metabolism in the unicellular diazotrophic cyanobacterium Crocosphaera watsonii WH8501, under variable light regimes
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Sophie Rabouille, Anthony Dron, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Ecological Modelling, 2014, 291, pp.121--133. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.07.016⟩
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-
- titre
- Direct and apparent compensation in plant-herbivore interactions
- auteur
- Audrey Lebon, Ludovic Mailleret, Yves Dumont, Frédéric Grognard
- article
- Ecological Modelling, 2014, Special Issue of the 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA’12 ) — Special Issue of PMA’12, 290, pp.192-203. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.02.020⟩
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-
- titre
- Pathogen population dynamics in agricultural landscapes: The Ddal modelling framework
- auteur
- Julien Papaïx, Katarzyna Adamczyk-Chauvat, Annie Bouvier, Kiên Kiêu, Suzanne Touzeau, Christian Lannou, Hervé Monod
- article
- Infection, Genetics and Evolution, 2014, 27, pp.509-520. ⟨10.1016/j.meegid.2014.01.022⟩
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-
- titre
- Integrative Model of the Immune Response to a Pulmonary Macrophage Infection: What Determines the Infection Duration?
- auteur
- Natacha Go, Caroline Bidot, Catherine Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (9), pp.e107818. ⟨10.1371/journal.pone.0107818⟩
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-
- titre
- Can epidemic control be achieved by altering landscape connectivity in agricultural systems?
- auteur
- Julien Papaïx, Suzanne Touzeau, Hervé Monod, Christian Lannou
- article
- Ecological Modelling, 2014, 284 (284), pp.35-47. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.04.014⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Getting the most out of it: optimal experiments for parameter estimation of microalgae growth models
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Pierre Martinon, Gaël Bougaran, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2014, 24 (6), pp.991-1001. ⟨10.1016/j.jprocont.2014.04.021⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ISS Interval Observers for Nonlinear Systems Transformed Into Triangular Systems
- auteur
- Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2014, 24 (7), pp.1241-1261. ⟨10.1002/rnc.2937⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimization of the separation of two species in a chemostat
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet
- article
- Automatica, 2014, 50 (4), pp.1243-1248. ⟨10.1016/j.automatica.2014.02.024⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Interval observer with near optimal adaptation dynamics. Application to the estimation of lipid quota in microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2014, 24 (6), pp.1142-1157. ⟨10.1002/rnc.2934⟩
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-
- titre
- Allee Effects and the Evolution of Polymorphism in Cyclic Parthenogens
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Virginie Ravigné, Frédéric Marie Hamelin
- article
- The American Naturalist, 2014, 183 (3), pp.E75-E88. ⟨10.1086/674828⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Estimation of neutral lipid and carbohydrate quotas in microalgae using adaptive interval observers
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- Bioprocess and Biosystems Engineering, 2014, 37 (1), pp.51-61. ⟨10.1007/s00449-013-0913-7⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- DRUM: A new framework for metabolic modeling under non-balanced growth. Application to the carbon metabolism of unicellular microalgae
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (8), pp.e104499. ⟨10.1371/journal.pone.0104499⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Natural enemy-mediated indirect interactions among prey species: potential for enhancing biocontrol services in agroecosystems
- auteur
- Anaïs Chailleux, Emily K Mohl, Mickaël Teixeira Alves, Gerben J Messelink, Nicolas Desneux
- article
- Pest Management Science, 2014, 70 (12), pp.1769 - 1779. ⟨10.1002/ps.3916⟩
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-
- titre
- Attractor computation using interconnected Boolean networks: testing growth rate models in E. Coli
- auteur
- Madalena Chaves, Alfonso Carta
- article
- Theoretical Computer Science, 2014, pp.17. ⟨10.1016/j.tcs.2014.06.021⟩
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-
- titre
- The effect of Time Scales in Photosynthesis on microalgae Productivity
- auteur
- Philipp Hartmann, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- Bioprocess and Biosystems Engineering, 2014, 37 (1), pp.17-25. ⟨10.1007/s00449-013-1031-2⟩
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-
- titre
- Optimal strategies for biomass productivity maximization in a photobioreactor using natural light
- auteur
- Frédéric Grognard, Andrei R. Akhmetzhanov, Olivier Bernard
- article
- Automatica, 2014, 50 (2), pp.359-368. ⟨10.1016/j.automatica.2013.11.014⟩
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-
- titre
- Biodiesel from microalgae – Life cycle assessment and recommendations for potential improvements
- auteur
- Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Helias, Stéphanie Bricout, Isabelle Lombaert-Valot, Béatrice Perrier, Olivier Lépine, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Renewable Energy, 2014, 71, pp.525-533. ⟨10.1016/j.renene.2014.06.009⟩
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-
Conference papers
- titre
- Parasitoid response to herbivore induced plant volatiles: a meta-analysis.
- auteur
- Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret, Xavier Fauvergue
- article
- British Ecological Society - Société Française d'Ecologie Joint Annual Meeting, Dec 2014, Lille, France
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-
- titre
- Clustered or scattered? The impact of habitat distribution on establishment dynamics
- auteur
- Thibaut Morel Journel, Maud Hautier, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- British Ecological Society - Société Française d'Ecologie Joint Annual Meeting, Dec 2014, Lille, France
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-
- titre
- Stability analysis of a reduced transcription-translation model of RNA polymerase
- auteur
- Ismail Belgacem, Edith Grac, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- Proceedings of the 53rd IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2014, Los Angeles, CA, United States
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-
- titre
- Clustered or scattered? The impact of habitat distribution on establishment dynamics
- auteur
- Thibaut Morel Journel, Maud Hautier, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- Conférence du GDR InvaBio, Oct 2014, Rennes, France
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-
- titre
- From theory to data : temporal niche differentiation of closely related pathogens species sharing the same plant host.
- auteur
- Anne Bisson, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Marie Laure Desprez Loustau, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Les maladies infectieuses comme moteur de l’évolution : les défis à venir, Sep 2014, Roscoff, France
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-
- titre
- Hybrid mathematical formalism for analysis of biological regulatory networks
- auteur
- Madalena Chaves
- article
- IEEE International Meeting on Analysis and Applications of Nonsmooth Systems, Sep 2014, COMO, Italy
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-
- titre
- Feedback stabilization of predator-prey systems for impulsive biological control
- auteur
- Frédéric Grognard
- article
- 19th IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Aug 2014, Cape Town, South Africa. 12336 p., ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.00666⟩
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-
- titre
- Growth Rate Estimation of Algae in Raceway Ponds: A Novel Approach
- auteur
- Philipp Hartmann, David Demory, Charlotte Combe, Raouf Hamouda, Jacques Sainte-Marie, Marie-Odile Bristeau, Anne-Céline Boulanger, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer, Sophie Rabouille, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.02408⟩
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-
- titre
- A Dynamical Model to study the Response of Microalgae to Pulse Amplitude Modulated Fluorometry
- auteur
- Frédéric Chazalon, Sophie Rabouille, Philipp Hartmann, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. pp.7152-7157, ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.02162⟩
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-
- titre
- Robustness of Closed-Loop Control to Biodiversity: a Didactic Example
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. pp.5321-5326, ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.02193⟩
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-
- titre
- Modelling thermal adaptation in microalgae : an adaptive dynamics point of view
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. pp.4376-4381, ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.00982⟩
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-
- titre
- Predictive analysis for biological regulatory systems – combining discrete and continuous formalisms
- auteur
- Madalena Chaves
- article
- Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS'14), Jul 2014, Groningen, Netherlands
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-
- titre
- Introduction strategies for biological control agents subject to Allee effects
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Grogningen, Netherlands. 8 p
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-
- titre
- Dynamic optimisation of resource allocation in microorganisms
- auteur
- Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS 2014), University of Groningen. NLD., Jul 2014, Groningen, Netherlands
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-
- titre
- Hybrid models for the interconnection of circadian and genetic cycles in cyanobacteria
- auteur
- Madalena Chaves, Miguel Preto
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Groningen, Netherlands. pp.4
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-
- titre
- A coupled transcription-translation mathematical model of RNA polymerase
- auteur
- Ismail Belgacem, Edith Grac, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Groningen, Netherlands
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-
- titre
- Modeling and control in physical, life, and social sciences: Some remarks
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- At the Boundaries of Dynamic Games, Control, and Viability, Jun 2014, St Nicolas-la-Chapelle, France. pp.29
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-
- titre
- Mathematical study of the global dynamics of a concave gene expression model
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- 22nd Mediterranean Conference of Control and Automation (MED), Jun 2014, Palermo, Italy. ⟨10.1109/MED.2014.6961562⟩
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-
- titre
- Protection of the durability of major resistance genes to plant viruses through quantitative resistance, a modeling approach
- auteur
- Elsa Rousseau, Jérôme Coville, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- ECMTB14 - 9. European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Goteborg, Sweden
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-
- titre
- Optimal natural enemies deployment in patchy environments for augmentative biological control
- auteur
- Bapan Ghosh, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Goteborg, Sweden
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-
- titre
- Modelling populations subjected to pulsed taking regimes
- auteur
- Ludovic Mailleret, Valérie Lemesle, Frédéric Marie Hamelin, Vincent Calcagno, Frédéric Grognard
- article
- 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Goteborg, Sweden
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-
- titre
- Modelling the infection and immune dynamics induced by a pathogen targeting pulmonary macrophages : influence of strain virulence and host exposure
- auteur
- Natacha Go, Caroline Bidot, Catherine Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Göteborg, Sweden. 16p
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-
- titre
- Minimal time problem for a fed-batch bioreactor with a non admissible singular arc
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
- article
- European Control Conference (ECC), Université de Strasbourg (Unistra). Strasbourg, FRA. IEEE Control Systems Society., Jun 2014, Strasbourg, France. pp.165-170, ⟨10.1109/ECC.2014.6862444⟩
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-
- titre
- Les stratégies d'introduction d'agents de lutte biologique soumis aux effets Allee
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- 34ème Séminaire de la Société Francophone de Biologie Théorique, Société Francophone de Biologie Théorique, May 2014, Saint Flour, France
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-
- titre
- Avancés et défis en imagerie médicale ultrasonore basée sur l'échantillonnage compressé (Congrès Français d'Acoustique 2014)
- auteur
- Adrian Basarab, Denis Kouamé, Olivier Bernard, Denis Friboulet, Hervé Liebgott
- article
- 12ème Congrès Français d'Acoustique (CFA 2014), Apr 2014, Poitiers, France
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-
- titre
- Protecting the durability of major resistance genes to plant viruses with quantitative resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Vincent Simon, Sophie Valière, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Conférence Jacques Monod, Apr 2014, Roscoff, France
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-
- titre
- Intégration et changement d’échelle : quels enjeux en santé animale ?
- auteur
- Pauline Ezanno, Elisabeta Vergu, François Beaudeau, Suzanne Touzeau, Catherine C. Belloc
- article
- Colloque "Nouveaux défis de Modélisation pour l'Agro-écologie", Feb 2014, Paris, France
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-
- titre
- Trichogrammas surf on pushed waves: effect of propagule pressure and connectivity of the introduction site on the invasion of an experimental discrete landscape
- auteur
- Thibaut Morel Journel, Pierre Girod, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Entomophagistes, 2014, Louvain-la-Neuve, Belgium
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-
- titre
- Technological and Ecological Approaches to Design and Manage Sustainable Greenhouse Production Systems
- auteur
- Christine Poncet, Pia Parolin, Hicham Fatnassi, Ludovic Mailleret, Alexandre Bout, Jeannine Pizzol, Roger Boll, Bresch Cécile
- article
- 29th International Horticultural Congress, 2014, Brisbane, Australia. ⟨10.17660/ActaHortic.2015.1107.5⟩
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-
- titre
- Caractérisation des réponses des parasitoïdes aux défenses induites des plantes
- auteur
- Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret, Xavier Fauvergue
- article
- Entomophagistes, Université Catholique de Louvain (UCLouvain). BEL. Earth and Life Institute., 2014, Louvain-la-Neuve, Belgique
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-
- titre
- Allee effects and the evolution of polymorphism in cyclical parthenogens.
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Virginie Ravigné
- article
- NIMBioS workshop on vectored plant viruses, 2014, Knoxville, United States
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-
Book sections
- titre
- Control of a Bioreactor with Quantized Measurements
- auteur
- Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- Fages, François and Piazza, Carla. Formal Methods in Macro-Biology, 8738, Springer International Publishing, pp.47-62, 2014, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-319-10398-3. ⟨10.1007/978-3-319-10398-3_5⟩
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-
- titre
- Towards Real-Time Control of Gene Expression at the Single Cell Level: A Stochastic Control Approach
- auteur
- Lakshmeesh Maruthi, Ilya Tkachev, Alfonso Carta, Eugenio Cinquemani, Pascal Hersen, Gregory Batt, Alessandro Abate
- article
- Computational Methods in Systems Biology, 8859, Springer International Publishing, pp.155-172, 2014, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-319-12981-5. ⟨10.1007/978-3-319-12982-2_12⟩
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-
- titre
- Life-cycle assessment of microalgal based biofuels
- auteur
- Pierre Collet, Daniele Spinelli, Laurent Lardon, Arnaud Helias, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Biofuels from algae, Elsevier, 2014, 978-0-444-59558-4
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-
Master thesis
- titre
- Modélisation de l’effet de la température sur la croissance du phytoplancton à l’échelle de l’océan mondial
- auteur
- Valérie Le Guennec
- article
- Automatique. 2014
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolution de la virulence chez un nématode phytoparasite: modélisation et optimisation du déploiement des plantes résistantes.
- auteur
- Thomas Perrot
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. 2014
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-
Poster communications
- titre
- Protecting the durability of major resistance genes to plant viruses with quantitative resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Vincent Simon, Sophie Valière, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Conférences Jacques Monod : “From emerging to pandemic viruses: interplay between host ecology and viral evolution”, Apr 2014, Roscoff, France. , 2014
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-
Reports
- titre
- Évaluation du gisement potentiel de ressources algales pour l’énergie et la chimie en France à horizon 2030
- auteur
- Guillaume Kerlero de Rosbo, Olivier Bernard
- article
- [Rapport Technique] ADEME. 2014, pp.164
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-
Theses
- titre
- Modelling, analysis and control for systems biology : application to bacterial growth models
- auteur
- Alfonso Carta
- article
- Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. English. ⟨NNT : 2014NICE4024⟩
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-
- titre
- Effect of hydrodynamics on light utilization in large scale cultures of microalgae
- auteur
- Philipp Hartmann
- article
- Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. English. ⟨NNT : 2014NICE4022⟩
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-
2013
Journal articles
- titre
- A 2D model for hydrodynamics and biology coupling applied to algae growth simulations
- auteur
- Olivier Bernard, Anne-Céline Boulanger, Marie-Odile Bristeau, Jacques Sainte-Marie
- article
- ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2013, 47 (5), pp.1387-1412. ⟨10.1051/m2an/2013072⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Phytoplankton growth formulation in marine ecosystem models: should we take into account photo-acclimation and variable stoichiometry in oligotrophic areas?
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Marina Lévy, Olivier Aumont, Antoine Sciandra, Jacques Sainte-Marie, Alessandro Tagliabue, Olivier Bernard
- article
- Journal of Marine Systems, 2013, 125, pp.29-40. ⟨10.1016/j.jmarsys.2012.12.010⟩
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-
- titre
- A model of network neutrality with usage-based prices
- auteur
- Eitan Altman, Pierre Bernhard, Stephane Caron, George Kesidis, Julio Rojas-Mora, Sulan Wong
- article
- Telecommunication Systems, 2013, 52 (2), pp.601-609. ⟨10.1007/s11235-011-9504-6⟩
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-
- titre
- Optimal synthesis for the minimum time control problems of fed-batch bioprocesses for growth functions with two maxima
- auteur
- Térence Bayen, Pedro Gajardo, Francis Mairet
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2013, 158 (2), pp.521-553. ⟨10.1007/s10957-012-0225-0⟩
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-
- titre
- Probabilistic approach for predicting periodic orbits in piecewise affine differential models
- auteur
- Madalena Chaves, Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2013, 75 (6), pp.967-987. ⟨10.1007/s11538-012-9773-6⟩
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-
- titre
- Optimizing microalgal production in raceway systems
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Biotechnology Progress, 2013, 29 (2), pp.543--552. ⟨10.1002/btpr.1699⟩
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-
- titre
- Global stability of enzymatic chain of full reversible Michaelis-Menten reactions
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- Acta Biotheoretica, 2013, 61 (3), pp.425-436. ⟨10.1007/s10441-013-9195-3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Time-lag in extinction dynamics in experimental populations: evidence for a genetic Allee effect
- auteur
- Elodie Vercken, Flora Vincent, Ludovic Mailleret, Nicolas Ris, Elizabeth Tabone, Xavier Fauvergue
- article
- Journal of Animal Ecology, 2013, 82 (3), pp.621-631. ⟨10.1111/1365-2656.12051⟩
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-
- titre
- Interconnection of asynchronous Boolean networks, asymptotic and transient dynamics
- auteur
- Laurent Tournier, Madalena Chaves
- article
- Automatica, 2013, 49 (4), pp.884-893. ⟨10.1016/j.automatica.2013.01.015⟩
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-
- titre
- Stabilizing effect of cannibalism in a two stages population model
- auteur
- Jonathan Rault, Eric Benoît, Jean-Luc Gouzé
- article
- Acta Biotheoretica, 2013, 61, pp.119-139. ⟨10.1007/s10441-013-9172-x⟩
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-
- titre
- Effect of gaseous cement industry effluents on four species of microalgae
- auteur
- Amélie Talec, Myrvline Philistin, Frédérique Ferey, Günther Walenta, Jean-Olivier Irisson, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Bioresource Technology, 2013, 143, pp.353 - 359. ⟨10.1016/j.biortech.2013.05.104⟩
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-
- titre
- Hydrodynamics-Biology Coupling for Algae Culture and Biofuel Production
- auteur
- Olivier Bernard, Jacques Sainte-Marie, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer
- article
- ERCIM News, 2013, 92, pp.47
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-
- titre
- Un zeste de mathématiques pour les biocarburants de demain
- auteur
- Olivier Bernard, Jacques Sainte-Marie, Bruno Sialve
- article
- Mathématiques de la Planète Terre, un jour une brève, 2013
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-
- titre
- Hierarchy of models: From qualitative to quantitative analysis of circadian rhythms in cyanobacteria
- auteur
- Madalena Chaves, Miguel Preto
- article
- Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, 2013, 23 (2), pp.025113. ⟨10.1063/1.4810922⟩
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-
- titre
- Reducing the Anaerobic Digestion Model No. 1 for its application to an industrial wastewater treatment plant treating winery effluent wastewater
- auteur
- Carlos García-Diéguez, Olivier Bernard, Enrique Roca
- article
- Bioresource Technology, 2013, 132, pp.244 - 253. ⟨10.1016/j.biortech.2012.12.166⟩
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-
- titre
- Screening and selection of growth-promoting bacteria for ıt Dunaliella cultures
- auteur
- Myriam Le Chevanton, Matthieu Garnier, Gaël Bougaran, Nathalie Schreiber, Ewa Lukomska, Jean-Baptiste Bérard, Eric Fouilland, Olivier Bernard, Jean-Paul Cadoret
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2013, 2, pp.212--222. ⟨10.1016/j.algal.2013.05.003⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Temperature effect on microalgae: a crucial factor for outdoor production
- auteur
- Monique Ras, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Reviews in Environmental Science and Bio/technology, 2013, 12 (2), pp.153-164. ⟨10.1007/s11157-013-9310-6⟩
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-
Conference papers
- titre
- Design of Optimal Experiments for Parameter Estimation of Microalgae Growth Models
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Pierre Martinon, Gaël Bougaran, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- International Symposium on Computer Applications to Biotechnology (CAB 2013), Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A new framework for metabolic modeling under non-balanced growth. Application to carbon metabolism of unicellular microalgae
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- CAB 2013 - International on Computer Applications to Biotechnology, Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelling light-dark regime influence on the carbon-nitrogen metabolism in a unicellular diazotrophic cyanobacterium
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Anthony Dron, Sophie Rabouille, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- CAB, Dec 2013, Mumbai, India. ⟨10.3182/20131216-3-IN-2044.00025⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A linear reformulation of Boolean optimization problems and its application to the problem of estimating the structure of gene regulation networks
- auteur
- Christian Breindl, Madalena Chaves, Frank Allgöwer
- article
- 52nd IEEE Conference on Decision and Control (CDC'13), Dec 2013, Florence, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- Stability analysis and reduction of gene transcription models
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- 52nd IEEE Conference on Decision and Control (CDC'13), Dec 2013, Florence, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analysis and reduction of transcription translation coupled models for gene expression
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- CAB (Computer applied to Biotechnology), IFAC, Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au bibtex
-
- titre
- Adaptive control for optimizing microalgae production
- auteur
- Francis Mairet, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard
- article
- Computer Application in Biotechnology (CAB2013), Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identification of key immune mechanisms for the resolution of PRRSv infection by a modelling approach
- auteur
- Natacha Go, Caroline C. Bidot, Catherine C. Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 4. International Conference on Infectious Disease Dynamics (Epidemics), Nov 2013, Amsterdam, Netherlands
- Accès au bibtex
-
- titre
- A closed-loop controller for optimizing nitrogen removal in a microalgal outdoor pond
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 11. IWA Conference on Instrumentation Control and Automation, Sep 2013, Narbonne, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- A new framework for metabolic modelling under non-balanced growth. Application to photoautotrophic microalgae in day/night cycle.
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Metabolic Pathway Analysis 2013, Sep 2013, Oxford, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fed-batch bioreactor with mortality rate
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
- article
- 9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2013, Toulouse, France. pp.158-163, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00024⟩
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-
- titre
- A class of Switched Piecewise Quadratic Systems for coupling gene expression with growth rate in bacteria
- auteur
- Alfonso Carta, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- 9th IFAC Symposium Nonlinear Control Systems (NOLCOS'13), Sep 2013, Toulouse, France. pp.271-276, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00140⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Driving Species Competition in a Light-limited Chemostat
- auteur
- Francis Mairet, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard
- article
- 9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2013, Toulouse, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effect of temperature fluctuations on microalgae growth and content: a review
- auteur
- M. Ras, Jean-Philippe Steyer, O. Bernard
- article
- 10. International Phycological Congress, Aug 2013, Orlando, Floride, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- A dynamic Model coupling Photoacclimation and Photoinhibition in Microalgae
- auteur
- Philipp Hartmann, Andrea Nikolaou, Benoît Chachuat, Olivier Bernard
- article
- European Control Conference (ECC13), Jul 2013, Zurich, Switzerland
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Driving microalgal production in raceway systems to near optimal productivities.
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- European Control Conference (ECC13), Jul 2013, Zurich, Switzerland
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- State estimation for gene networks with intrinsic and extrinsic noise: a case study on E.coli arabinose uptake dynamics
- auteur
- Alfonso Carta, Eugenio Cinquemani
- article
- ECC13 - European Control Conference - 2013, Jul 2013, Zurich, Switzerland
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-
- titre
- Sustainable plant resistance management in agricultural landscapes
- auteur
- Frederic Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- 12. IPVE Symposium, International Institute of Tropical Agriculture, CGIAR (IITA). Ibadan, NGA.; International Society for Plant Pathology (ISPP). International Committee for Plant Virus Epidemiology, St Paul, INT., Jan 2013, Arusha, Tanzania. 256 p
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-
- titre
- Sustainable plant resistance management in agricultural landscapes
- auteur
- Elsa Rousseau, Benoît Moury, Frederic Fabre, Ludovic Mailleret
- article
- 14. Rencontres de Virologie Végétale (RVV2013), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie du Fruit et Pathologie (1332)., Jan 2013, Aussois, France
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-
- titre
- Allee effects and the evolution of polymorphism in cyclical parthenogens.
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Virginie Ravigné, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Conférences Jacques Monod: Avancées récentes sur l'évolution du sexe et des systèmes génétiques, 2013, Roscoff, France
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-
- titre
- Positive control for global stabilization of predator-prey systems
- auteur
- Frédéric Grognard, Jonathan Rault, Jean-Luc Gouzé
- article
- 9th IFAC Symposium Nonlinear Control Systems (NOLCOS'13), 2013, Toulouse, France. pp.265-270, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00136⟩
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-
- titre
- Parasites also have sex: consequences on host-parasite population dynamics.
- auteur
- Virginie Ravigné, Valérie Lemesle, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- AARMS Mathematical Biology Workshop, 2013, St John's, Canada
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-
- titre
- Quantitative comparison of one-step and two-step models of gene expression
- auteur
- Valentin Zulkower, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong
- article
- Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM'13), 2013, Toulouse, France
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-
- titre
- Parasites also have sex: consequences on host-parasite population dynamics.
- auteur
- Virginie Ravigné, Valérie Lemesle, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Computational and Mathematical Population Dynamics (CMPD4), 2013, Taiyuan, China
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-
- titre
- Biological and integrated pest control in floriculture.
- auteur
- Christine Poncet, Alexandre Bout, Pia Parolin, Cécile Bresch, Hicham Fatnassi, Ludovic Mailleret
- article
- SUMFLOWER "Sustainable Management of Floriculture", 2013, Vintimiglia, Italy
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-
Book sections
- titre
- Le rêve porté par les microalgues
- auteur
- Claude Gudin, Olivier Bernard
- article
- Claude Gudin. La culture de l'invisible - le rêve porté par les microalgues, Ovadia, pp.109, 2013, 2363920325 9782363920324
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-
- titre
- Modeling and analysis of gene regulatory networks
- auteur
- Gilles Bernot, Jean-Paul Comet, Adrien Richard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé, Frédéric Dayan
- article
- Cazals, Frédéric and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine, Springer, pp.47-80, 2013, 9783642312083 364231208X. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3_2⟩
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-
- titre
- Join forces or cheat: evolutionary analysis of a consumer-resource system
- auteur
- Andrei R. Akhmetzhanov, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Pierre Bernhard
- article
- Pierre Cardaliaguet and Ross Cressman. Advances in Dynamic Games, Springer, pp.73-95, 2013, Annals of the International Society of Dynamic Games; v. 12, ⟨10.1007/978-0-8176-8355-9_4⟩
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-
- titre
- Modélisation et Ingénierie de la Photosynthèse
- auteur
- Jean-François Cornet, Olivier Bernard
- article
- Mosseri, Rémy and Jeandel, Catherine. L'énergie à découvert, 1, CNRS Eds, pp.160-161, 2013, 978-2-271-07678-6 9782271076786
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Predictive analysis of dynamical systems: combining discrete and continuous formalisms
- auteur
- Madalena Chaves
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. Université Nice Sophia Antipolis, 2013
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-
Master thesis
- titre
- Modélisation de la réponse du photosystème II à un flash de lumière dans un PAM et estimation des paramètres physiologiques
- auteur
- Frédéric Chazalon
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. 2013
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-
- titre
- Influence de la densité dépendance dans les modèles impulsionnels de dynamique de populations
- auteur
- Nicolas Bajeux
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2013
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-
- titre
- Étude théorique et expérimentale de l'effet de l'hydrodynamique sur la photosynthèse du phytoplancton par un dispositif novateur à base de LED
- auteur
- David Demory
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. 2013
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-
- titre
- Genetic regulatory networks. A discretization approach.
- auteur
- Florin Todoran
- article
- 2013
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-
Patents
- titre
- Procédé et installation de production de micro-algues
- auteur
- Olivier Bernard, Antoine Sciandra, Eric Pruvost, Filipa Lopes
- article
- France, N° de brevet: 13 56955. 2013
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-
Poster communications
- titre
- Exploration of the macrophage – virus interactions during a PRRSV infection by a modelling approach
- auteur
- Natacha Go, Caroline C. Bidot, Catherine C. Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 64th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. 2013
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-
- titre
- Impact of quantitative plant resistance on within-host viral demo-genetic dynamics
- auteur
- Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ludovic Mailleret, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- 5. journées des doctorants SPE, Jun 2013, Montpellier, France. pp.1, 2013
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-
- titre
- Impact of quantitative plant resistance on within-host viral demo-genetic dynamics
- auteur
- Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ludovic Mailleret, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Bridging theoretical and experimental evolution, Jun 2013, La Fouly, Switzerland. pp.1, 2013
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-
- titre
- Exploration of the immune response to the Porcine Respiratory and Reproductive Syndrome Virus PRRSV by a modelling approach: conditions for viral clearance
- auteur
- Natacha Go, Caroline C. Bidot, Catherine C. Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 5. European Symposium of Porcine Health Management (ESPHM), May 2013, Edinburgh, United Kingdom. , 2013
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-
Reports
- titre
- Study of a controlled Kolmogorov periodic equation connected to the optimization of periodic bioprocess
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Matthieu Sebbah
- article
- [Research Report] INRIA Sophia Antipolis. 2013
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-
Theses
- titre
- Des interactions indirectes entre les proies : modélisation et influence du comportement du prédateur commun
- auteur
- Mickael Teixeira Alves
- article
- Autre [cs.OH]. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. Français. ⟨NNT : 2013NICE4024⟩
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-
2012
Journal articles
- titre
- Neutral lipids and carbohydrates productivities as a response to the nitrogen status in the Haptophyceae Isochrysis sp. (T-iso): starvation vs. limitation
- auteur
- Thomas Lacour, Antoine Sciandra, Amélie Talec, Patrick Mayzaud, Olivier Bernard
- article
- Journal of Phycology, 2012, 48 (3), pp.647-656. ⟨10.1111/j.1529-8817.2012.01154.x⟩
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-
- titre
- Cell cycle implication on nitrogen acquisition and synchronization in ıt Thalassiosira weissflogii (Bacillariophyta)
- auteur
- Christophe Mocquet, Antoine Sciandra, Amélie Talec, Olivier Bernard
- article
- Journal of Phycology, 2012, 49 (2), pp.371-380. ⟨10.1111/jpy.12045⟩
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-
- titre
- Influence of CO_2 and nitrogen limitation on the coccolith volume of Emiliania huxleyi (Haptophyta)
- auteur
- Marius N. Müller, Luc L Beaufort, Olivier Bernard, Maria-Luiza Pedrotti, Amélie Talec, Antoine Sciandra
- article
- Biogeosciences, 2012, 9 (4), pp.4155--4167. ⟨10.5194/bg-9-4155-2012⟩
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-
- titre
- Exponentially Stable Interval Observers for Linear Systems with Delay.
- auteur
- Frédéric Mazenc, Silviu-Iulian Niculescu, Olivier Bernard
- article
- SIAM Journal on Control and Optimization, 2012, 50 (1), pp.286-305. ⟨10.1137/100812124⟩
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-
- titre
- Durable strategies to deploy plant resistance in agricultural landscapes
- auteur
- Frédéric Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- New Phytologist, 2012, 193 (4), pp.1064-1075. ⟨10.1111/j.1469-8137.2011.04019.x⟩
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-
- titre
- Three-reaction model for the anaerobic digestion of microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Elliot Cameron, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Benoît Chachuat
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2012, 109 (2), pp.415-425. ⟨10.1002/bit.23350⟩
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- titre
- Global stability of reversible enzymatic metabolic chains
- auteur
- Ibrahima Ndiaye, Jean-Luc Gouzé
- article
- Acta Biotheoretica, 2012, 61 (1), pp.41-57. ⟨10.1007/s10441-013-9171-y⟩
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-
- titre
- Global stability for a model of competition in the chemostat with microbial inputs
- auteur
- Gonzalo Robledo, Frédéric Grognard, Jean-Luc Gouzé
- article
- Nonlinear Analysis: Real World Applications, 2012, 13 (2), pp.582-598. ⟨10.1016/j.nonrwa.2011.07.049⟩
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-
- titre
- Validation of a simple model accounting for light and temperature effect on microalgal growth
- auteur
- Olivier Bernard, Barbara Rémond
- article
- Bioresource Technology, 2012, 123, pp.520-527. ⟨10.1016/j.biortech.2012.07.022⟩
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-
- titre
- Diel variations of carbohydrates and neutral lipids in N-sufficient and N-limited cyclostat cultures of Isochrysis sp.
- auteur
- Thomas Lacour, Antoine Sciandra, Amélie Talec, Patrick Mayzaud, Olivier Bernard
- article
- Journal of Phycology, 2012, 48 (4), pp.966-975. ⟨10.1111/j.1529-8817.2012.01177.x⟩
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-
- titre
- Multistability and oscillations in genetic control of metabolism
- auteur
- Diego A. Oyarzún, Madalena Chaves, Marit Hoff-Hoffmeyer-Zlotnik
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2012, 295, pp.139-153. ⟨10.1016/j.jtbi.2011.11.017⟩
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-
Conference papers
- titre
- Durabilité des stratégies de gestion de plantes résistantes aux virus dans un paysage agricole
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Workshop Modélisation et Régulation des Pollutions, Université Montesquieu (Bordeaux 4). FRA.; Université Montpellier 1 (UM1). FRA.; Université de La Rochelle (ULR). FRA., Dec 2012, La Rochelle, France. pp.35
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-
- titre
- Sustainable plant resistance management in agricultural landscapes
- auteur
- Frederic Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- Plant resistance sustainability 2012 international conference, Oct 2012, La Colle-Sur-Loup, France
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-
- titre
- Robust estimation for a hybrid model of genetic network
- auteur
- Xiao-Dong Li, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control and Automation, Jul 2012, Barcelona, Spain. pp.145-150
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-
- titre
- The Ecological Approach of Greenhouse Agro-Ecosystem: Practical Interest for IPM.
- auteur
- Christine Poncet, Ludovic Mailleret, Nicolas Desneux, Marie-Madeleine Müller, Alexandre Bout, Richard Brun, Jeannine Pizzol, Roger Boll, Cécile Bresch, Pia Parolin, Hicham Fatnassi
- article
- Acta Horticulturae, Proceedings of the XXVIII International Horticultural Congress, 2012, Lisbon, Portugal. pp.173-185
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-
- titre
- Interaction between Time Scales in Microalgae Based Processes
- auteur
- Philipp Hartmann, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control & Automation (MED), 2012, Barcelona, Spain. pp.561--566, ⟨10.1109/MED.2012.6265697⟩
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-
- titre
- Stabilization of an oscillating n-dimensional structured population model
- auteur
- Jonathan Rault, Jean-Luc Gouzé
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control & Automation (MED), 2012, Barcelona, Spain. pp.372-377, ⟨10.1109/MED.2012.6265666⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- ODIN: supervision avancée de procédés de production de bioénergie
- auteur
- Olivier Bernard, Mélaine Gautier
- article
- Journée de la métrologie et de la mesure (J2M), 2012, Le Croisic, France
- Accès au bibtex
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- titre
- Growth and neutral lipid production of Dunaliella salina, in light/dark cycles and periodic temperature variations
- auteur
- Hubert Bonnefond
- article
- Young Algaeneers Symposium, 2012, Wageningen, Netherlands
- Accès au bibtex
-
- titre
- Habitat quality and optimal foraging: the Marginal Value Theorem revisited
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Eric Wajnberg
- article
- First Joint Congress on Evolutionary Biology (Evolution 2012), 2012, Ottawa, Canada
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling plant compensatory effects in plant-insect dynamics
- auteur
- Audrey Lebon, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Yves Dumont
- article
- 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, (PMA 2012), Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE). USA., 2012, Shanghai, China. pp.212-219, ⟨10.1109/PMA.2012.6524836⟩
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-
- titre
- Construction of ISS Interval Observers for Triangular Systems
- auteur
- Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
- article
- 51th IEEE Conference on Decision and Control, 2012, Maui, Hawaii, United States. pp.6780-6785
- Accès au bibtex
-
- titre
- Adaptative interval observer with application to the estimation of biofuel production by microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control Automation (MED), 2012, Barcelona, Spain. pp.567-572, ⟨10.1109/MED.2012.6265698⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Global stability of full open reversible Michaelis-Menten reactions
- auteur
- Ismail Belgacem
- article
- 32ème Séminaire de la Société Francophone de Biologie Théorique, 2012, Saint-Flour, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- ODIN: plateforme de supervision de bioreacteur
- auteur
- Olivier Bernard, Mélaine Gautier
- article
- Bioenergiesud, 2012, Nîmes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Population dynamics of thrips and development of an integrated pest management program using the predator ıt Franklinothrips vespiformis
- auteur
- Jeannine Pizzol, Doumar Nammour, Pierre Hervouet, Pascal Maignet, Christine Poncet, Ludovic Mailleret, Nicolas Desneux
- article
- Acta Horticulturae, Proceedings of the XXVIII International Horticultural Congress, 2012, Lisbon, Portugal. pp.173-185
- Accès au bibtex
-
- titre
- Structure estimation for unate Boolean models of gene regulation networks
- auteur
- Christian Breindl, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé, Frank Allgöwer
- article
- Proc. 16th IFAC Symposium on System Identification, 2012, Brussels, Belgium. pp.1725-1730, ⟨10.3182/20120711-3-BE-2027.00278⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bloom triggering in the Southern Ocean : Sensitivity to biological parameters
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Joan Llort, Alessandro Tagliabue, Marina Lévy
- article
- Workshop TANGGO, 2012, Grenoble, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- On the evolutionary ecology of cyclically asexual plant parasites
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Virginie Ravigné, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Models in Population Dynamics and Ecology (MPDE12), 2012, Santa Maria, Brazil
- Accès au bibtex
-
- titre
- A new modelling framework: application to microalgae growth
- auteur
- Caroline Baroukh
- article
- Young Algaeneers Symposium, 2012, Wageningen, Netherlands
- Accès au bibtex
-
- titre
- Global Stability of Full Open Reversible Michaelis-Menten Reactions
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- 8th IFAC Symposium Advanced Control of Chemical Processes (ADCHEM), 2012, Furama Riverfront, Singapore. pp.591--596, ⟨10.3182/20120710-4-SG-2026.00039⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Option pricing in a tychastic market model
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Around Viability Boundaries, 2012, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de la croissance du phytoplancton et de la production primaire dans les océans
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Marina Lévy, Olivier Aumont, Olivier Bernard
- article
- Journée de l'IMREDD, 2012, Nice, France
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- A simple model to control growth rate of synthetic E. coli during the exponential phase: model analysis and parameter estimation
- auteur
- Alfonso Carta, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- David Gilbert and Monika Heiner. Computational Methods in Systems Biology, 7605, Springer, pp.107-126, 2012, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-642-33636-2_8⟩
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-
Master thesis
- titre
- Modélisation de l'évolution de maladies virales chez les plantes dans un paysage agricole
- auteur
- Perside Gbehounou
- article
- Engineering Sciences [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analysis of cell machinery models in E.coli
- auteur
- Luis Casaccia
- article
- Engineering Sciences [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Création d'outils de simulation pour la vulgarisation scientifique
- auteur
- Aurélie Schmitt
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lutte biologique inondative et effet Allee chez les prédateurs
- auteur
- Nicolas Bajeux
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de l'influence de la photopériode sur la dynamique du métabolisme du carbone et de l'azote chez une cyanobactérie diazotrophe, Crocosphaera watsonii WH8501
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Etude expérimentale de la réponse adaptative de Dunaliella salina (Chlorophyta) à des signaux lumineux haute fréquence
- auteur
- Charlotte Combe
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
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-
Books
- titre
- The Interval Market Model in Mathematical Finance: Game Theoretic Methods
- auteur
- Pierre Bernhard, Jacob Engwerda, Berend Roorda, Hans Schumacher, Vassili Kolokoltsov, Jean-Pierre Aubin, Patrick Saint-Pierre
- article
- Birkhaüser, pp.XVI-346, 2012, Static & Dynamic Game Theory: Foundations & Applications, ⟨10.1007/978-0-8176-8388-7⟩
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-
Reports
- titre
- Competition between phytoplankton and bacteria: exclusion and coexistence
- auteur
- Pierre Masci, Frédéric Grognard, Eric Benoît, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-8038, INRIA. 2012, pp.47
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Periodic optimal control for biomass productivity maximization in a photobioreactor using natural light
- auteur
- Frédéric Grognard, Andrei R. Akhmetzhanov, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-7929, INRIA. 2012, pp.28
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GEMCO Deliverable D2T1: Analysis and reduction of a model of the gene expression machinery in E.coli
- auteur
- Luis Casaccia, Wassim Abou-Jaoudé, Jean-Luc Gouzé
- article
- [Research Report] 2012
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Modélisation mathématique structurée en taille du zooplancton
- auteur
- Jonathan Rault
- article
- Mathématiques générales [math.GM]. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
2011
Journal articles
- titre
- Synthèse des observateurs pour une classe de systèmes de dimension infinie
- auteur
- Xiao-Dong Li, Cheng-Zhong Xu
- article
- Journal Européen des Systèmes Automatisés (JESA), 2011, 45 (Nouvelles tendances en automatique), pp.363-383
- Accès au bibtex
-
- titre
- Infinite-dimensional Luenberger-like observers for a rotating body-beam system
- auteur
- Xiao-Dong Li, Cheng-Zhong Xu
- article
- Systems and Control Letters, 2011, 60 (2), pp.138-145. ⟨10.1016/j.sysconle.2010.11.005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Interval observers for linear time-invariant systems with disturbances
- auteur
- Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
- article
- Automatica, 2011, 47 (1), pp.140-147. ⟨10.1016/j.automatica.2010.10.019⟩
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-
- titre
- Seasonality and the evolutionary divergence of plant parasites
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Magda Castel, Sylvain Poggi, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret
- article
- Ecology, 2011, 92 (12), pp.2159-2166. ⟨10.1890/10-2442.1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exact control of genetic networks in a qualitative framework: the bistable switch example
- auteur
- Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- Automatica, 2011, 47 (6), pp.1105-1112. ⟨10.1016/j.automatica.2011.01.071⟩
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-
- titre
- Life-cycle assessment of microalgae culture coupled to biogas production
- auteur
- Pierre Collet, Arnaud Hélias, Laurent Lardon, Monique Ras, Romy-Alice Goy, Jean-Philippe Steyer
- article
- Bioresource Technology, 2011, 102 (1), pp.207-214. ⟨10.1016/j.biortech.2010.06.154⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal life-history strategies in seasonal consumer-resource dynamics.
- auteur
- Andrei R. Akhmetzhanov, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2011, 65 (11), pp.3113--3125. ⟨10.1111/j.1558-5646.2011.01381.x⟩
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-
- titre
- Modeling anaerobic digestion of microalgae using ADM1.
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer
- article
- Bioresource Technology, 2011, 102 (13), pp.6823--6829
- Accès au bibtex
-
- titre
- A theoretical exploration of birhythmicity in the p53-Mdm2 network
- auteur
- Wassim Abou-Jaoudé, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- PLoS ONE, 2011, 6 (2), pp.e17075. ⟨10.1371/journal.pone.0017075⟩
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-
- titre
- Hurdles and challenges for modelling and control of microalgae for CO2 mitigation and biofuel production
- auteur
- Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2011, 21 (10), pp.1378--1389. ⟨10.1016/j.jprocont.2011.07.012⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling neutral lipid production by the microalga Isochrysis affinis galbana under nitrogen limitation
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Pierre Masci, Thomas Lacour, Antoine Sciandra
- article
- Bioresource Technology, 2011, 102, pp.142-149. ⟨10.1016/j.biortech.2010.06.138⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- An observer for a piecewise affine genetic network model with Boolean observations
- auteur
- Xiao-Dong Li, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves
- article
- IEEE Conference of Decision and Control, Dec 2011, Orlando, United States. pp.4389 - 4394, ⟨10.1109/CDC.2011.6160629⟩
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- titre
- Algae as source of biofuel - Environmental assessment and ecodesign perspectives
- auteur
- Pierre Collet, Juliette Langlois, Melissa Cornelus, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard, Arnaud Helias
- article
- Conference Ecotech & tools, Nov 2011, Montpellier, France
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- titre
- Numerical prediction of microalgae productivity and energy requirement during the cultivation process in raceway
- auteur
- Philipp Hartmann, Anne-Céline Boulanger, Jacques Sainte-Marie, Marie-Odile Bristeau, Kerstin Ebert, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Alg'n'Chem conference, Fédération française pour les sciences de la chimie, Nov 2011, Montpellier, France
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- titre
- Anaerobic digestion of microalgae: evaluation of process performances using ADM1
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer
- article
- Stic & Environnement 2011, 2011, Saint-Etienne, France
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- titre
- Global Gene Regulation in Metabolic Networks
- auteur
- Diego A. Oyarzún, Madalena Chaves
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milan, Italy
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- titre
- Spatial and Temporal Associations of Powdery Mildew and Two-Spotted Spider-Mite in Greenhouses.
- auteur
- Alexandre Bout, Marie-Madeleine Müller, Ludovic Mailleret, Roger Boll, Christine Poncet, Rachid Senoussi
- article
- Acta Horticulturae, Proceedings of the XXVIII International Horticultural Congress, 2011, Lisbon, Portugal. pp.23-30
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- titre
- Mechanisms for coexistence of two limit cycles in a biochemical model
- auteur
- Wassim Abou-Jaoudé, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milan, Italy. ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.00749⟩
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- titre
- A Dynamic Model for Anaerobic Digestion of Microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milano, Italy. ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.02636⟩
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- titre
- Optimal foraging predators in Leslie Gower models with alternative prey
- auteur
- Mickael Teixeira-Alves, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- Evolutionary insights from semi-discrete plant epidemic models
- auteur
- Magda Castel, Frédéric Marie Hamelin, Sylvain Poggi, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- Comparison of biogeochemical models with increasing complexity in photosynthesis formulation: the importance of taking into account photoadaptation in marine ecosystem models
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Olivier Aumont, Olivier Bernard, Marina Lévy
- article
- Advances in Marine Ecosystem Modelling Symposium 2011, 2011, Plymouth, United Kingdom
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- titre
- Qualitative Control of a Bistable Genetic Network
- auteur
- Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- Robust Optimization in Finance
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Optimization Days 2011, 2011, Montréal, Québec, Canada
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- titre
- Interval estimation of lipid quota in microalgae culture using dynamic tuning parameter
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- 9th IEEE International Conference on Control & Automation (IEEE ICCA 2011), 2011, Santiago, Chile. ⟨10.1109/ICCA.2011.6137953⟩
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- titre
- Modelling microalgae growth in nitrogen limited photobiorector for estimating biomass, carbohydrate and neutral lipid productivities
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Thomas Lacour, Antoine Sciandra
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milano, Italy. ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.03165⟩
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- titre
- Anaerobic Digestion of Microalgae: Identification for Optimization and Control
- auteur
- Elliot Cameron, Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Benoît Chachuat
- article
- IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). Laxenburg, AUT., 2011, Milano, Italy. pp.5052-5057, ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.03196⟩
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- titre
- Can we produce biofuel from microalgae without a renewable source of electricity and heat?
- auteur
- Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Hélias, Stéphanie Bricout, Isabelle Lombaert-Valot, Béatrice Perrier, Olivier Lépine, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Algn'n'Chem conference, 2011, Montpellier, France
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- titre
- Predicting the asymptotic dynamics of large biological networks by interconnections of Boolean modules
- auteur
- Madalena Chaves, Laurent Tournier
- article
- 50th IEEE Conference on Decision and Control and European Control Conference, 2011, Orlando, Florida, United States. pp.3026-3031, ⟨10.1109/CDC.2011.6160454⟩
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- titre
- On the Dynamics of the Handicap Principle
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Mathematical Aspects of Game theory, 2011, Toulouse, France
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- titre
- Investigating photo inhibition processes in a novel Droop-Han modelling approach
- auteur
- Philipp Hartmann, Olivier Bernard
- article
- Proceedings of the Watermatex conference, 2011, San Sebastian, Spain
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- titre
- Dynamic game for optimal resource allocation of annual plants and grazing consumers
- auteur
- Andrei R. Akhmetzhanov, Pierre Bernhard, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- From elaborate to compact seasonal plant epidemic models
- auteur
- Ludovic Mailleret, Magda Castel, Frédéric Marie Hamelin
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- Stability results on some zooplankton size-structured models
- auteur
- Jonathan Rault, Eric Benoît
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
- Accès au bibtex
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- titre
- Environmental assessment and ecodesign perspectives
- auteur
- Pierre Collet, Juliette Langlois, Melissa Cornelus, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard, Arnaud Hélias
- article
- Ecotech-tools conference, 2011, Montpellier, France
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Book sections
- titre
- ESS, Population games, replicator dynamics: dynamics and games if not dynamic games
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Breton, Michèle and Szajowski, Krzysztof. Advances in the Theory and Applications of Dynamic Games, Birkhaüser, pp.291-311, 2011, Annals of the International Society of Dynamic Games, ⟨10.1007/978-0-8176-8089-3_15⟩
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Master thesis
- titre
- Les réseaux de régulation génétique : controle d'un oscillateur
- auteur
- Ismail Belgacem
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
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- titre
- Elaboration d'un modèle plante-ravageur dans le cadre de la lutte biologique
- auteur
- Audrey Lebon
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
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- titre
- Effets de chocs osmotiques sur la production de lipides chez ıt Dunaliella salina
- auteur
- Hubert Bonnefond
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
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- titre
- Modélisation de l'effet de la température sur le taux de croissance spécifique du phytoplancton
- auteur
- Barbara Rémond
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
- Accès au bibtex
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- titre
- Conception et étude d'un modèle de gestion durable des variétés de plantes résistantes aux virus dans un paysage
- auteur
- Elsa Rousseau
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
- Accès au bibtex
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Reports
- titre
- An observer for a genetic network model with Boolean observations
- auteur
- Xiao-Dong Li, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves
- article
- 2011, pp.4389 - 4394
- Accès au bibtex
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2010
Patents
- titre
- Procede de fixation de co2 et de traitement de dechets organiques par couplage d'un systeme de digestion anaerobie et d'un systeme de production de microorganismes phytoplanctoniques
- auteur
- Olivier Bernard, Gaël Bougaran, Jean-Paul Cadoret, Raymond Kaas, E. Latrille, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer
- article
- France, N° de brevet: WO 2010084274 A1. 2010
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