2025
Journal articles
- titre
- Validation of an Adaptive Temperature Model for Closed Microalgae Cultivation Systems
- auteur
- Ali Gharib, W. Djema, P. Moñino Fernández, R. Chin-On, M. Janssen, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, In press, pp.103838. ⟨10.1016/j.algal.2024.103838⟩
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-
- titre
- Should hydrodynamics be taken into account when calculating the growth rate of microalgae in a photobioreactor ?
- auteur
- J Ignacio Fierro, Liu-Di Lu, Olivier Bernard
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, In press
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-
2024
Journal articles
- titre
- Adaptive temperature model for microalgae cultivation systems
- auteur
- Ali Gharib, Walid Djema, Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2024, 141, pp.103280. ⟨10.1016/j.jprocont.2024.103280⟩
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-
- titre
- Non-destructive monitoring of microalgae biofilms
- auteur
- David Morgado, Andrea Fanesi, Thierry Martin, Sihem Tebbani, Olivier Bernard, Filipa Lopes
- article
- Bioresource Technology, 2024, 398, pp.130520. ⟨10.1016/j.biortech.2024.130520⟩
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-
- titre
- A plant-wide modelling framework to describe microalgae growth on liquid digestate in agro-zootechnical biomethane plants
- auteur
- D. Carecci, A. Catenacci, S. Rossi, Francesca Casagli, G. Ferretti, A. Leva, E. Ficara
- article
- Chemical Engineering Journal, 2024, 485, pp.149981. ⟨10.1016/j.cej.2024.149981⟩
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-
- titre
- Exploring the dynamics of astaxanthin production in Haematococcus pluvialis biofilms using a rotating biofilm‐based system
- auteur
- David Morgado, Andrea Fanesi, Thierry Martin, Sihem Tebbani, Olivier Bernard, Filipa Lopes
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2024, 121 (3), pp.991-1004. ⟨10.1002/bit.28624⟩
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-
- titre
- The effect of light intensity on microalgae biofilm structures and physiology under continuous illumination
- auteur
- Yan Gao, Olivier Bernard, Andrea Fanesi, Patrick Perré, Filipa Lopes
- article
- Scientific Reports, 2024, 14 (1), ⟨10.1038/s41598-023-50432-6⟩
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-
- titre
- ABACO-2: a comprehensive model for microalgae-bacteria consortia validated outdoor at pilot-scale
- auteur
- Rebecca Nordio, Enrique Rodríguez-Miranda, Francesca Casagli, Ana Sánchez-Zurano, José Luis Guzmán, Gabriel Acién
- article
- Water Research, 2024, 248, pp.120837. ⟨10.1016/j.watres.2023.120837⟩
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-
- titre
- Optimal control of waste recovery process
- auteur
- Othman Cherkaoui-Dekkaki, Walid Djema, Nadia Raissi, Jean-Luc Gouzé, Noha El Khattabi
- article
- International Journal of Dynamics and Control, 2024, ⟨10.1007/s40435-024-01484-7⟩
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-
- titre
- Numerical schemes for mixture theory models with filling constraint: application to biofilm ecosystems
- auteur
- Olivier Bernard, Mickael Bestard, Thierry Goudon, Leo Meyer, Sebastian Minjeaud, Florent Noisette, Bastien Polizzi
- article
- ESAIM: Proceedings and Surveys, 2024, CEMRACS 2022 - Transport in physics, biology and urban traffic, 77, pp.249 - 266. ⟨10.1051/proc/202477249⟩
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-
- titre
- Optimal resource allocation in micro-organisms under periodic nutrient fluctuations
- auteur
- Javier Innerarity Imizcoz, Walid Djema, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Theoretical Biology, In press, ⟨10.1016/j.jtbi.2024.111953⟩
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-
- titre
- Dynamical Metabolic Model for Optimizing Biotin-Regulated Lipid Production in Microalgae-Bacteria Symbiosis
- auteur
- Bruno Assis Pessi, Olivier Bernard
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2024, 58 (14), pp.151-156. ⟨10.1016/j.ifacol.2024.08.329⟩
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-
Conference papers
- titre
- Optimization of microalgae biosynthesis via controlled algal-bacterial symbiosis
- auteur
- Rand Asswad, Walid Djema, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Eugenio Cinquemani
- article
- CDC 2024 - 63rd IEEE Conference on Decision and Control, IEEE CSS, Dec 2024, Milan, Italy. pp.1-6, ⟨10.1109/CDC56724.2024.10886300⟩
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-
- titre
- Optimal control for a combination of cancer therapies in a model of cell competition
- auteur
- Pauline Mazel, Walid Djema, Frédéric Grognard
- article
- CDC 2024 - 63rd IEEE Conference on Decision and Control, IEEE Control Systems Society, Dec 2024, Milan, Italy. pp.1351-1357, ⟨10.1109/CDC56724.2024.10886792⟩
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-
- titre
- A breakthrough in the temperature prediction of microalgal processes
- auteur
- Ali Gharib, Walid Djema, P. Moñino Fernández, R. Chin-On, M. Janssen, Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- AlgaEurope 2024, EABA (European Algal Biomass Association), Dec 2024, Athen, Greece
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-
- titre
- Will machine learning (finally) contribute to the microalgae sector?
- auteur
- Olivier Bernard, Francesca Casagli, Benoît Chachuat, Fabrizio Bezzo
- article
- AlgaEurope 2024, Dec 2024, Athens, Greece
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-
- titre
- Why modelling phototrophic systems?
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer
- article
- PHOTOREFINERIES 2024 - 1st International Conference on Novel PhotoRefineries for Resource Recovery, PurpleGain, Sep 2024, Valladolid, Spain
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-
- titre
- Extending algae-bacteria model to dynamically predict microbialcommunity composition during sanitary wastewater treatment
- auteur
- Bruno Assis Pessi, Gustavo Ribeiro Silva, C.M.E Pompei, Olivier Bernard, Francesca Casagli
- article
- PHOTOREFINERIES 2024 - 1st International Conference on Novel PhotoRefineries for Resource Recovery, University of Valladolid, Sep 2024, Valladolid, Spain
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal cell growth under periodic environment
- auteur
- Javier Innerarity Imizcoz, Walid Djema, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- MTNS 2024 - 26th International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems, Aug 2024, Cambridge (Angleterre), United Kingdom
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-
- titre
- Optimal control of photobioreactor accounting for photoinhibition and photoacclimation
- auteur
- Ignacio Fierro, Benoît Chachuat, Olivier Bernard
- article
- ADCHEM 2024 - 12th IFAC Symposium on Advanced Control of Chemical Processes, Jul 2024, Toronto ( CA ), Canada
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-
Book sections
- titre
- Potential of Microalgae
- auteur
- Hubert Bonnefond, Charlotte Combe, Jean-Paul Cadoret, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Green Chemistry and Agro-food Industry: Towards a Sustainable Bioeconomy, Springer Nature Switzerland, pp.133-153, 2024, 978-3-031-54188-9. ⟨10.1007/978-3-031-54188-9_6⟩
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-
Theses
- titre
- Modelling and control of photobioreactors under dynamic light regimes
- auteur
- Joel Ignacio Fierro Ulloa
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Université Côte d'Azur, 2024. English. ⟨NNT : 2024COAZ4035⟩
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-
- titre
- Environmental impact extrapolation of environmental processes at low Technology Readiness Level (TRL) : application to microalgae-based processes
- auteur
- Diego Penaranda Sandoval
- article
- Modeling and Simulation. Université Côte d'Azur, 2024. English. ⟨NNT : 2024COAZ4007⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- The effect of light intensity on microalgae biofilm structures and physiology under continuous illumination
- auteur
- Yan Gao, Olivier Bernard, Andrea Fanesi, Patrick Perré, Filipa Lopes
- article
- 2024
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-
2023
Journal articles
- titre
- A double-spiral maze and hi-resolution tracking pipeline to study dispersal by groups of minute insects
- auteur
- Melina Cointe, V. Burte, G. Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.5200. ⟨10.1038/s41598-023-31630-8⟩
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-
- titre
- When complex movement yields simple dispersal: behavioural heterogeneity, spatial spread and parasitism in groups of micro-wasps
- auteur
- Victor Burte, Melina Cointe, Guy Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- Movement Ecology, 2023, 11 (1), pp.13. ⟨10.1186/s40462-023-00371-8⟩
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-
- titre
- The impact of light/dark regimes on structure and physiology of Chlorella vulgaris biofilms
- auteur
- Yan Gao, Olivier Bernard, Andrea Fanesi, Patrick Perré, Filipa Lopes
- article
- Frontiers in Microbiology, 2023, 14, ⟨10.3389/fmicb.2023.1250866⟩
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-
- titre
- Stability analysis of a bacterial growth model through computer algebra
- auteur
- Agustín G. Yabo, Mohab Safey El Din, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- MathematicS In Action, 2023, 12 (1), pp.175-189. ⟨10.5802/msia.37⟩
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-
- titre
- Insight into the ionic atmosphere effect: Comparison of theories for electrolytes at the primitive level
- auteur
- Jean-Pierre Simonin, Olivier Bernard
- article
- Fluid Phase Equilibria, 2023, 571, pp.113805. ⟨10.1016/j.fluid.2023.113805⟩
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-
- titre
- Colonisation debt: when invasion history impacts current range expansion
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Marjorie Haond, Lana Dunan, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e59. ⟨10.24072/pcjournal.293⟩
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-
- titre
- Optimal periodic resource allocation in reactive dynamical systems: Application to microalgal production
- auteur
- Olivier Bernard, Liu‐di Lu, Julien Salomon
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2023, 33 (9), pp.4989-5010. ⟨10.1002/rnc.6171⟩
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-
- titre
- Weak synchronization and convergence in coupled genetic regulatory networks: Applications to damped oscillators and multistable circuits
- auteur
- Nicolas Augier, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2023, 33 (9), pp.4867-4892. ⟨10.1002/rnc.6061⟩
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-
- titre
- Resource allocation accounts for the large variability of rate-yield phenotypes across bacterial strains
- auteur
- Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé, Tomas Gedeon, Hidde de Jong
- article
- eLife, 2023, 12, pp.1-29. ⟨10.7554/eLife.79815⟩
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-
- titre
- The proportion of resistant hosts in mixtures should be biased towards the resistance with the lowest breaking cost
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret, Frédéric M. Hamelin
- article
- PLoS Computational Biology, 2023, 19 (5), pp.e1011146. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011146⟩
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-
- titre
- Improving sustainable crop protection using population genetics concepts
- auteur
- Méline Saubin, Clémentine Louet, Lydia Bousset, Frédéric Fabre, Pascal Frey, Isabelle Fudal, Frédéric Grognard, Frédéric M. Hamelin, Ludovic Mailleret, Solenn Stoeckel, Suzanne Touzeau, Benjamin Petre, Fabien Halkett
- article
- Molecular Ecology, 2023, 32 (10), pp.2461-2471. ⟨10.1111/mec.16634⟩
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-
- titre
- Microalgal cultivation on digestate: Process efficiency and economics
- auteur
- Simone Rossi, Marco Mantovani, Francesca Marazzi, Micol Bellucci, Francesca Casagli, Valeria Mezzanotte, Elena Ficara
- article
- Chemical Engineering Journal, 2023, Volume 460 (141753), ⟨10.1016/j.cej.2023.141753⟩
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-
- titre
- Migration pulsedness alters patterns of allele fixation and local adaptation in a mainland-island model
- auteur
- Flora Aubree, Baptiste Lac, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2023, 77 (3), pp.718-730. ⟨10.1093/evolut/qpac067⟩
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-
- titre
- Large satellite constellations and space debris: exploratory analysis of strategic management of the space commons
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps, Georges Zaccour
- article
- European Journal of Operational Research, 2023, 304 (3), pp.1140-1157. ⟨10.1016/j.ejor.2022.04.030⟩
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-
- titre
- Impulsive modelling of rust dynamics and predator releases for biocontrol
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- Mathematical Biosciences, 2023, 356, pp.108968. ⟨10.1016/j.mbs.2023.108968⟩
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-
- titre
- Optimizing resource recovery from wastewater with algae-bacteria membrane reactors
- auteur
- Francesca Casagli, Fabrice Béline, Elena Ficara, Olivier Bernard
- article
- Chemical Engineering Journal, 2023, 451, pp.138488. ⟨10.1016/j.cej.2022.138488⟩
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-
- titre
- Life cycle assessment of an innovative rotating biofilm technology for microalgae production: An eco-design approach
- auteur
- Diego Penaranda, Hubert Bonnefond, Freddy Guihéneuf, Marjorie Morales, Olivier Bernard
- article
- Journal of Cleaner Production, 2023, 384, pp.135600. ⟨10.1016/j.jclepro.2022.135600⟩
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-
- titre
- Optimal Control of Coffee Berry Borers: Synergy Between Bio-insecticide and Traps
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Berge Tsanou, Samuel Bowong
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2023, 196 (3), pp.882-899. ⟨10.1007/s10957-022-02151-7⟩
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-
- titre
- Optimal protein production by a synthetic microbial consortium: Coexistence, distribution of labor, and syntrophy
- auteur
- Carlos Martinez, Eugenio Cinquemani, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2023, 87 (1), pp.1-37. ⟨10.1007/s00285-023-01935-3⟩
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-
- titre
- A universal dynamical metabolic model representing mixotrophic growth of Chlorella sp. on wastes
- auteur
- Bruno Assis Pessi, Caroline Baroukh, Anais Bacquet, Olivier Bernard
- article
- Water Research, 2023, 229, pp.119388. ⟨10.1016/j.watres.2022.119388⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Microalgal biofilm behavior under light/dark cycles
- auteur
- Yan Gao, J. Ignacio Fierro U, Patrick Perré, Filipa Lopes, Olivier Bernard
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2023, 56 (2), pp.9739-9744. ⟨10.1016/j.ifacol.2023.10.288⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Theoretical growth rate of microalgae under high/low-flashing light
- auteur
- Ignacio Fierro, Liu-Di Lu, Olivier Bernard
- article
- Journal of Mathematical Biology, In press, ⟨10.1007/s00285-023-01871-2⟩
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-
Conference papers
- titre
- Hybrid modelling of algae-bacteria processes for resource recovery
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- AlgaEurope 2023, EABA (European Algae Biomass Association), Dec 2023, Prague, Czech Republic
- Accès au bibtex
-
- titre
- Strain optimization by continuous selection pressure: a focus on phycocyanin production
- auteur
- H. Bonnefond, C. Gaviard, E. Pruvost, A. Talec, Antoine Sciandra, O. Bernard
- article
- AlgaEurope 2023, Dec 2023, Prague, Czech Republic
- Accès au bibtex
-
- titre
- Couplage et synchronisation d’horloges circadiennes périphériques
- auteur
- Odile Burckard, Madalena Chaves, Franck Delaunay, Michèle Teboul
- article
- 48ème congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Oct 2023, Paris, France. pp.249, ⟨10.1016/j.msom.2023.10.021⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hybrid Machine LearningMechanistic Modeling Of AlgaeBacteria Processes Under Various Climatologies
- auteur
- Francesca Casagli, Morgan Scalabrino, Ignacio Fierro, Olivier Bernard
- article
- WATERMATEX 2023 - 11th IWA symposium on modelling and integrated assessment, Sep 2023, Quebec city, Canada
- Accès au bibtex
-
- titre
- Non-destructive monitoring tools for biomass and astaxanthinproduction in Haematococcus pluvialis rotating biofilms: aspectroscopy approach
- auteur
- David Morgado Pereira, Andrea Fanesi, Thierry Martin, Sihem Tebbani, Olivier Bernard, Filipa Lopes
- article
- 14th European Congress of Chemical Engineering - ECCE'23 & 7th European Congress of Applied Biotechnology - ECAB'23, Sep 2023, Berlin, Germany
- Accès au bibtex
-
- titre
- Physic-informed neural networks for microalgae modeling
- auteur
- J. Ignacio Fierro U, Olivier Bernard
- article
- ECCE 14 & ECAB 7 - 14th European Congress of Chemical Engineering and 7th European Congress of Applied Biotechnology, Sep 2023, Berlin, Germany
- Accès au bibtex
-
- titre
- Validation of a simple and adaptive prediction model for temperature in outdoor microalgae cultivation systems
- auteur
- Ali Gharib, Francesca Casagli, Walid Djema, Pedro Moñino Fernandez, Rocca Chin-On, Olivier Bernard
- article
- ECCE 14 & ECAB 7 - 14th European Congress of Chemical Engineering and 7th European Congress of Applied Biotechnology, Sep 2023, Berlin, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- LCA for technologies at low technological readiness level: A case study on microalgae cultivation system
- auteur
- Diego Penaranda, Marjorie Morales, Freddy Guihéneuf, Olivier Bernard
- article
- CILCA 2023 - X Conferencia Latinoamericana de Análisis de Ciclo de Vida, Jul 2023, Viña del Mar, Chile
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An auto-adaptive heat transfer model predicting the temperature evolution in photobioreactors
- auteur
- Ali Gharib, Walid Djema, Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- 22nd IFAC World Congress, Jul 2023, Yokohama, Japan. pp.9715-9720, ⟨10.1016/j.ifacol.2023.10.284⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control of microalgae culture accounting for photoinhibition and light attenuation
- auteur
- Ignacio Fierro, Walid Djema, Olivier Bernard
- article
- IFAC World Congress 2023, Jul 2023, Yokohama, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A practical cell density stabilization technique through drug infusions: a simple pathfinding approach
- auteur
- Walid Djema, Catherine Bonnet, Hitay Ozbay, Frederic Mazenc
- article
- 2023 European Control Conference (ECC 2023), Jun 2023, Bucharest, Romania. ⟨10.23919/ECC57647.2023.10178254⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Non-destructive monitoring of biomass and astaxanthin in Haematococcus pluvialis biofilms: a reflectance spectroscopy approach
- auteur
- David Morgado Pereira, Andrea Fanesi, Thierry Martin, Sihem Tebbani, Olivier Bernard, Filipa Lopes
- article
- AlgalBBB 2023 - International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts, Jun 2023, Waikoloa Beach Marriott, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal control of a bioeconomic model applied to the recovery of household waste
- auteur
- Othman Cherkaoui Dekkaki, Walid Djema
- article
- ACC - 2023 American Control Conference, May 2023, San Diego, United States. pp.2135-2140, ⟨10.23919/ACC55779.2023.10156431⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Impulsive modelling of rust dynamics and predator releases
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- CMPD6 - Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2023, Winnipeg, Canada
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling plant - nematode interactions to understand plant tolerance
- auteur
- Joseph Junior Penlap Tamagoua, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Valentina Baldazzi
- article
- MPDEE 2023 - Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- A sex- and stage-structured population dynamics model for pest control using the sterile insect technique
- auteur
- Crésus Kounoudji, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret
- article
- MPDEE 2023 - Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Self-financing model for cabbage crops
- auteur
- Aurelien Kambeu Youmbi, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Berge Tsanou
- article
- MPDEE 2023 - Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pulsed perturbations in population dynamics
- auteur
- Ludovic Mailleret
- article
- MOMI2023 - Le MOnde des Mathématiques Industrielles, Apr 2023, Sophia Antipolis (06), France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How does residual fertility impact the effectiveness of the sterile insect technique in controlling Ceratitis capitata?
- auteur
- Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
- article
- MPDEE 2023 - Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2023, Marseille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Bridging behavior and spatial propagation: a new double spiral maze and image analysis pipeline to study dispersal in groups of minute insects
- auteur
- Mélina Cointe, Victor Burte, Guy Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- UCA Complex Days 2023, Académie Systèmes Complexes, Feb 2023, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Life is not a long quiet river: consequences of migration pulsedness for adaptation and divergence
- auteur
- Flora Aubree, Baptiste Lac, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- Complex Days 2023, Académie Systèmes Complexes 2023, Feb 2023, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hands on Pluto : dynamical systems with reactive Julia notebooks
- auteur
- Ludovic Mailleret
- article
- Julia day, Jan 2023, Sophia Antipolis, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Observer Design via Non-Monotone Lyapunov Functions for Monitoring Heterotrophic Microalgae
- auteur
- Juan Carlos Arceo, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- 22nd IFAC World Congress, 2023, Yokohama, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Neural ODEs for phytoplankton modeling
- auteur
- J. Ignacio Fierro U, Olivier Bernard
- article
- Journées scientifiques INRIA Chile, 2023, Valparaiso (Chile), Chile
- Accès au bibtex
-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Modelling and control of managed ecosystems, from bioreactors to agroecosystems
- auteur
- Frédéric Grognard
- article
- Automatic Control Engineering. Université Côte D'Azur, 2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Life cycle analysis of water resource recovery facilities based on algae-bacteria processes
- auteur
- Diego Penaranda, Francesca Casagli, Fabrice Beline, Olivier Bernard
- article
- Watermatex 2023 - 11th IWA Symposium on Modelling and Integrated Assessment, Sep 2023, Quebec City, QC, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Benchmark for quantitative characterization of circadian clock models
- auteur
- Odile Burckard, Madalena Chaves
- article
- 21st International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2023, Luxembourg City, Luxembourg. , Lecture notes in computer science. Lecture Notes in Bioinformatics, LNCS.LNBI-14137, Computational Methods in Systems Biology 21st International Conference, CMSB 2023, Luxembourg City, Luxembourg, September 13–15, 2023, Proceedings
- Accès au bibtex
-
- titre
- LCA of a next-generation microalgae cultivation system: Eco-design approach for emerging technologies
- auteur
- Diego Penaranda, Marjorie Morales, Freddy Guihéneuf, Olivier Bernard
- article
- LCM 2023 - The 11th International Conference on life cycle Management, Sep 2023, Lille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Real time, non-invasive monitoring of microalgae biofilm-based cultivation systems using reflectance spectroscopy
- auteur
- David Morgado Pereira, Andrea Fanesi, Thierry Martin, Sihem Tebbani, Filipa Lopes, Olivier Bernard
- article
- 8th European Phycological Congress, Aug 2023, Brest, France
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-
- titre
- Sterile Insect Technique for crop protection: accounting for residual fertility
- auteur
- Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
- article
- Le MOnde des Mathématiques Industrielles, MOMI2023, Apr 2023, Sophia Antipolis, France.
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-
- titre
- Ecophysiological modelling of plant-nematode interactions to understand plant tolerance
- auteur
- Joseph Junior Penlap Tamagoua, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Valentina Baldazzi
- article
- DSABNS 2023 Conference - 14th International Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences, Feb 2023, Bilbao, Spain. 2023
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-
- titre
- Sterile insect technique for crop protection: accounting for residual fertility
- auteur
- Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
- article
- DSABNS 2023 - 14th Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences, Feb 2023, Bilbao, Spain, Spain.
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-
Theses
- titre
- Modeling cancer drug response dynamics in single-cells to predict the emergence of drug-tolerant cells
- auteur
- Marielle Péré
- article
- Modeling and Simulation. Université Côte d'Azur, 2023. English. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Optimization of microalgae efficiency using reduced metabolic models
- auteur
- Bruno Assis Pessi
- article
- Modeling and Simulation. Université Côte d'Azur, 2023. English. ⟨NNT : 2023COAZ4013⟩
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-
- titre
- Mathematical modelling and control of perennial plant phytopathogens
- auteur
- Clotilde Djuikem
- article
- Automatic Control Engineering. Université Côte d'Azur, 2023. English. ⟨NNT : 2023COAZ4002⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Assessing Inter-Individual Genetic Variability in Peach Sugar Metabolism through Reliable Parameter Estimation of a Kinetic Model
- auteur
- Hussein Kanso, Mohamed-Mahmoud Memah, Valentina Baldazzi, Bénédicte Quilot-Turion, Charlotte Baey
- article
- 2023
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-
- titre
- Numerical approach to the identification of fractional differential equations and applications in epidemics
- auteur
- Jacky Cresson, Marielle Péré, Anna Szafranska
- article
- 2023
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-
2022
Journal articles
- titre
- Simulating biotechnological processes affected by meteorology: Application to algae–bacteria systems
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- Journal of Cleaner Production, 2022, 377, pp.134190. ⟨10.1016/j.jclepro.2022.134190⟩
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-
- titre
- Optimal production of microalgae in the presence of grazers
- auteur
- Carlos Martínez, Bruno Assis Pessi, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2022, 118, pp.153-164. ⟨10.1016/j.jprocont.2022.09.001⟩
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-
- titre
- Coupling live-cell imaging and in situ isolation of the same single cell to profile the transient states of predicted drug-tolerant cells
- auteur
- Benjamin Bian, Agnès Paquet, Marie-Jeanne Arguel, Mickael Meyer, Ludovic Peyre, Asma Chalabi, Marielle Péré, Kevin Lebrigand, Rainer Waldmann, Pascal Barbry, Paul Hofman, Jérémie Roux
- article
- STAR Protocols, 2022, 3 (3), pp.101600. ⟨10.1016/j.xpro.2022.101600⟩
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-
- titre
- A half-century of research on microalgae-bacteria for wastewater treatment
- auteur
- Jineth Arango Oviedo, Raúl Muñoz, Andrés Donoso-Bravo, Olivier Bernard, Francesca Casagli, David Jeison
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2022, 67, pp.102828. ⟨10.1016/j.algal.2022.102828⟩
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-
- titre
- The paradoxes hidden behind the Droop model highlighted by a metabolic approach
- auteur
- Caroline Baroukh, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Frontiers in Plant Science, 2022, 13, 16 p. ⟨10.3389/fpls.2022.941230⟩
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-
- titre
- How Heat Transfer Indirectly Affects Performance of Algae-Bacteria Raceways
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- Microorganisms, 2022, 10 (8), pp.1515. ⟨10.3390/microorganisms10081515⟩
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-
- titre
- Coupling heat transfer modelling to ALBA model for full predictions from meteorology
- auteur
- Francesca Casagli, Olivier Bernard
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2022, 55 (20), pp.558-563. ⟨10.1016/j.ifacol.2022.09.154⟩
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-
- titre
- Cycle dynamics and synchronization in a coupled network of peripheral circadian clocks
- auteur
- Odile Burckard, Michèle Teboul, Franck Delaunay, Madalena Chaves
- article
- Interface Focus, 2022, 12 (3), pp.20210087. ⟨10.1098/rsfs.2021.0087⟩
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-
- titre
- The architecture and metabolic traits of monospecific photosynthetic biofilms studied in a custom flow‐through system
- auteur
- Andrea Fanesi, Thierry Martin, Cyril Breton, Olivier Bernard, Romain Briandet, Filipa Lopes
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2022, 119, pp. 2459-2470. ⟨10.1002/bit.28147⟩
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-
- titre
- Dynamical Darwinian selection of a more productive strain of Tisochrysis lutea
- auteur
- Hubert Bonnefond, Y. Lie, T. Lacour, B. Saint-Jean, G. Carrier, E. Pruvost, Amélie Talec, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2022, 65, pp.102743. ⟨10.1016/j.algal.2022.102743⟩
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-
- titre
- Host mixtures for plant disease control: Benefits from pathogen selection and immune priming
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret, Frédéric Hamelin
- article
- Evolutionary Applications, 2022, 15 (6), pp.967-975. ⟨10.1111/eva.13386⟩
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-
- titre
- Ensemble qubit controllability with a single control via adiabatic and rotating wave approximations
- auteur
- Rémi Robin, Nicolas Augier, Ugo Boscain, Mario Sigalotti
- article
- Journal of Differential Equations, 2022, 318, pp.414-442. ⟨10.1016/j.jde.2022.02.042⟩
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-
- titre
- TET2 regulates immune tolerance in chronically activated mast cells
- auteur
- Riccardo Rigo, Rabie Chelbi, Julie Agopian, Sebastien Letard, Aurélien Griffon, Hussein Ghamlouch, Julien Vernerey, Vasileios Ladopoulos, Edwige Voisset, Paulo de Sepulveda, Geoffrey Guittard, Jacques Nunès, Ghislain Bidaut, Berthold Göttgens, Michael Weber, Olivier Bernard, Patrice Dubreuil, Erinn Soucie
- article
- JCI Insight, 2022, 7 (7), pp.e004244. ⟨10.1172/jci.insight.154191⟩
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-
- titre
- Turnpike property in optimal microbial metabolite production
- auteur
- Jean-Baptiste Caillau, Walid Djema, Jean-Luc Gouzé, Sofya Maslovskaya, Jean-Baptiste Pomet
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2022, ⟨10.1007/s10957-022-02023-0⟩
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-
- titre
- Understanding photosynthetic biofilm productivity and structure through 2D simulation
- auteur
- Bastien Polizzi, Andrea Fanesi, Filipa Lopes, Magali Ribot, Olivier Bernard
- article
- PLoS Computational Biology, 2022, 18 (4), pp.e1009904. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009904⟩
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-
- titre
- Optimal Darwinian Selection of Microorganisms with Internal Storage
- auteur
- Walid Djema, Térence Bayen, Olivier Bernard
- article
- Processes, 2022, 10 (3), pp.461. ⟨10.3390/pr10030461⟩
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-
- titre
- Time-optimal control of piecewise affine bistable gene-regulatory networks
- auteur
- Nicolas Augier, Agustín G. Yabo
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2022, 54 (5), pp.205-210. ⟨10.1002/rnc.6012⟩
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-
- titre
- Does temperature shift justify microalgae production under greenhouse?
- auteur
- Bruno Assis Pessi, Eric Pruvost, Amélie Talec, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2022, 61, pp.102579. ⟨10.1016/j.algal.2021.102579⟩
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-
- titre
- Effective adiabatic control of a decoupled Hamiltonian obtained by rotating wave approximation
- auteur
- Nicolas Augier, Ugo Boscain, Mario Sigalotti
- article
- Automatica, 2022, 136, pp.110034. ⟨10.1016/j.automatica.2021.110034⟩
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-
- titre
- Qualitative control strategies for synchronization of bistable gene regulatory networks
- auteur
- Nicolas Augier, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- IEEE Transactions on Automatic Control, 2022, ⟨10.1109/TAC.2022.3145653⟩
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-
- titre
- Mathematical modelling of a pest in an age-structured crop model: The coffee berry borer case
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou, Frédéric Grognard, Samuel Bowong
- article
- Applied Mathematical Modelling, 2022, 110, pp.193-206. ⟨10.1016/j.apm.2022.05.042⟩
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-
- titre
- Up and to the light: intra- and interspecific variability of photo- and geo-tactic oviposition preferences in genus Trichogramma
- auteur
- Victor Burte, Guy Perez, Faten Ayed, Géraldine Groussier, Ludovic Mailleret, Louise van Oudenhove, Vincent Calcagno
- article
- Peer Community Journal, 2022, 2, pp.e3. ⟨10.24072/pcjournal.78⟩
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-
- titre
- Optimal optical conditions for Microalgal production in photobioreactors
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu
- article
- Journal of Process Control, 2022, 112, pp.69-77. ⟨10.1016/j.jprocont.2022.03.001⟩
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-
- titre
- Dynamical analysis and optimization of a generalized resource allocation model of microbial growth
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong, Francis Mairet
- article
- SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2022, 21 (1), pp.137-165. ⟨10.1137/21M141097X⟩
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-
Conference papers
- titre
- Outdoor N2O emissions measurements in algae-bacteria systems guided by modelling
- auteur
- Francesca Casagli, Jineth Arango Oviedo, David Jeison, Fabrice Beline, Olivier Bernard
- article
- AlgaEurope 2022, EABA (European Algae Biomass Association), Dec 2022, Rome, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- Model of Bacteria Mutualism in a Chemostat: Analysis and Optimization with Interval Detector
- auteur
- Juan Carlos Arceo, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2022 - Conference on Decision and Control, Dec 2022, Cancun, Mexico
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-
- titre
- Host mixtures for plant disease control: Benefits from pathogen selection and immune priming
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret, Frédéric Hamelin
- article
- Seminario franco-argentino sobre agroecologia, Nov 2022, Rosario, Argentina
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-
- titre
- Analyzing single-cell trajectories with augmented machine learning methods predicts cancer drugs response in live-cell microscopy assays
- auteur
- Marielle Péré, Diego Oyarzun, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- ICSB 2022 - 21th international conference on systems biology, Oct 2022, Berlin, Germany
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bifurcation analysis in a coffee leaf rust epidemiological model
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- 12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Sep 2022, Heidelberg, Germany
- Accès au bibtex
-
- titre
- Host mixtures for plant disease control: benefits from pathogen selection and immune priming
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Frédéric Hamelin
- article
- 12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Sep 2022, Heidelberg, Germany
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal impulsive control of coffee berry borers in a berry age-structured epidemiological model
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Berge Tsanou, Samuel Bowong, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard
- article
- CARI'2022 - Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Sep 2022, Tunis, Tunisia
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling isogenic cancer cell response upon varying TRAIL stimulations to decipher the kinetic determinants of cell fate decision
- auteur
- Marielle Péré, Diego A. Oyarzun, Jérémie Roux, Madalena Chaves
- article
- Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE), Aug 2022, Cambridge, Massachusetts, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal allocation of bacterial resources in fed-batch reactors
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2022 European Control Conference (ECC), Jul 2022, London, United Kingdom. pp.1466-1471, ⟨10.23919/ECC55457.2022.9838346⟩
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-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-pest interactions: the coffee berry borer
- auteur
- Frédéric Grognard, Samuel Bowong, Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou
- article
- MPDEE 2022 - Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Jun 2022, Torino, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- The impact of light regimes on Chlorella vulgaris biofilm structural dynamics and physiology.
- auteur
- Yan Gao, Olivier Bernard, Andrea Fanesi, Patrick Perre, Filipa Lopes
- article
- Biofilms10, May 2022, Leipzig, Germany
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling isogenic cancer cell response upon TRAIL treatment in multi-omics studies
- auteur
- Marielle Péré, Asma Chalabi, Jérémie Roux
- article
- Multiple facets of RNA in development and disease conference, Signalife Labex community, Mar 2022, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A demo-genetic model of root-knot nematode dynamics with applications to optimal deployment of plant resistance
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian‐caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- 7th international congress of Nematology, 2022, Antibes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- The proportion of resistant hosts in mixtures should be biased towards the resistance with the lowest breaking cost
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret, Frédéric M. Hamelin
- article
- CMS winter meeting 2022, 2022, Toronto, Canada
- Accès au bibtex
-
- titre
- Immune priming and the limited diversity of resistance genes in host mixtures
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Frédéric M. Hamelin
- article
- 15emes rencontres Plantes Bactéries, 2022, Aussois, France
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Augmentative biological control using entomophagous arthropods
- auteur
- Alexandre Bout, Nicolas Ris, Cécilia Multeau, Ludovic Mailleret
- article
- Xavier Fauvergue; Adrien Rusch; Matthieu Barret; Marc Bardin; Emmanuelle Jacquin-Joly; Thibaut Malausa; Christian Lannou. Extended Biocontrol, Springer Dordrecht, pp.43-53, 2022, 978-94-024-2150-7. ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_4⟩
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-
- titre
- Anticiper les impacts du changement climatique sur la qualité des fruits et le rendement, l’apport de la modélisation
- auteur
- Hélène Gautier, Valentina Baldazzi, Nadia Bertin, G. Vercambre, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Zhanwu Dai, Laurent Julhia, Olivier Pailly
- article
- Quae. Les productions fruitières à l’heure du changement climatique : risques et opportunités en régions tempérées, chapitre 9, Quae, 2022, 9782759232512Qua
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Integrating machine learning methods to single-cell experimental workflow increases throughput and accuracy for target identification in immuno-oncology
- auteur
- Marielle Péré, Diego Oyarzun, Asma Chalabi, Eric Debreuve, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- Sophia Summit AI, Nov 2022, Sophia Antipolis, France
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-
- titre
- Integrating machine learning methods to single cell signaling analyses increases throughput and accuracy for target identification in immuno-oncology
- auteur
- Marielle Péré, Asma Chalabi, Eric Debreuve, Jérémie Roux, Diego Oyarzun, Madalena Chaves
- article
- 5th Signalife Labex Meeting, Nov 2022, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Coupling and synchronization of peripheral circadian clocks
- auteur
- Odile Burckard, Michèle Teboul, Franck Delaunay, Madalena Chaves
- article
- 2022 Labex Signalife Meeting, Nov 2022, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Monitoring high-value compounds production in microalgae biofilm-based systems using FTIR-spectroscopy
- auteur
- David Morgado Pereira, Andrea Fanesi, Thierry Martin, Sihem Tebbani, Olivier Bernard, Filipa Lopes
- article
- Journée « photonique moyen infra-rouge » - MIR-Saclay 2022, Nov 2022, Gif-sur-Yvette, France
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-
- titre
- Influence of the spatial distribution of artificial microhabitats (am) on neoseiulus cucumeris predatory mite
- auteur
- C Bresch, L Capponi, Van Oudenhove, Ludovic L. Mailleret
- article
- Natural Products & Biocontrol, Sep 2022, Perpignan, France
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-
- titre
- Sterile insect technique against the medfly: modelling, calibration and effect of residual fertility
- auteur
- Marine Courtois, Kévan Rastello, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Suzanne Touzeau, Louise van Oudenhove
- article
- ECMTB 2022 - 12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Sep 2022, Heidelberg, Germany.
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling cell response to cancer drug treatment identifies dynamic features of efficient cell death initiation, enabling prediction and control of therapeutic response heterogeneity
- auteur
- Marielle Péré, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- inSiDE seminars (Signaling Dynamics and Encoding,)Connecting scientists interested in single-cell signaling dynamics, Jun 2022, Online, France
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-
- titre
- The impact of light regimes on Chlorella vulgaris biofilm structural dynamics and physiology.
- auteur
- Yan Gao, Olivier Bernard, Andrea Fanesi, Patrick Perre, Filipa Lopes
- article
- Young Algaeneers Symposium 2022, Jun 2022, Online, France
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-
Theses
- titre
- Modelling, analysis and control of coffee berry borer
- auteur
- Yves Fotso Fotso
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. Université de Dschang (Cameroun), 2022. English. ⟨NNT : ⟩
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-
2021
Journal articles
- titre
- Modelling interference between vectors of non-persistently transmitted plant viruses to identify effective control strategies
- auteur
- Marta Zaffaroni, Loup Rimbaud, Ludovic Mailleret, Nik Cunniffe, Daniele Bevacqua
- article
- PLoS Computational Biology, 2021, 17 (12), pp.e1009727. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009727⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- State observation in microbial consortia: A case study on a synthetic producer‐cleaner consortium
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé, Eugenio Cinquemani
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2021, pp.1-12. ⟨10.1002/rnc.5945⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Two-level modeling approach to identify the regulatory dynamics capturing drug response heterogeneity in single-cells
- auteur
- Madalena Chaves, Luis Gomes-Pereira, Jérémie Roux
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-99943-0⟩
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-
- titre
- When expansion stalls: an extension to the concept of range pinning in ecology
- auteur
- Thibaut Morel‐journel, Marjorie Haond, Laurent Lamy, David Muru, Lionel Roques, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Ecography, 2021, ⟨10.1111/ecog.06018⟩
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-
- titre
- When is a Matrix of Dimension 3 Similar to a Metzler Matrix ? Application to Interval Observer Design
- auteur
- Frederic Mazenc, Olivier Bernard
- article
- IEEE Transactions on Automatic Control, 2021, pp.1-1. ⟨10.1109/TAC.2021.3123245⟩
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-
- titre
- Food and habitat supplementation promotes predatory mites and enhances pest control
- auteur
- Lucas Etienne, Cécile Bresch, Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret
- article
- Biological Control, 2021, 159, pp.104604. ⟨10.1016/j.biocontrol.2021.104604⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and immune priming to minimize disease prevalence in host mixtures: a model
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Florence Val, Didier Andrivon, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Phytopathology, 2021, 111 (7), pp.1219-1227. ⟨10.1094/PHYTO-09-20-0429-R⟩
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-
- titre
- Microalgal lipids: A review of lipids potential and quantification for 95 phytoplankton species
- auteur
- Marjorie Morales, Claude Aflalo, Olivier Bernard
- article
- Biomass and Bioenergy, 2021, 150, pp.106108. ⟨10.1016/j.biombioe.2021.106108⟩
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-
- titre
- Shifts from pulled to pushed range expansions caused by reduction of landscape connectivity
- auteur
- Maxime Dahirel, Aline Bertin, Marjorie Haond, Aurélie Blin, Eric Lombaert, Vincent Calcagno, Simon Fellous, Ludovic Mailleret, Thibaut Malausa, Elodie Vercken
- article
- Oikos, 2021, 130 (5), pp.708-724. ⟨10.1111/oik.08278⟩
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-
- titre
- Optimal Control of Plant Disease Epidemics with Clean Seed Usage
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Brady Bowen, Pierre Bernhard, Vushrali A Bokil
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2021, 83 (5), pp.46. ⟨10.1007/s11538-021-00872-w⟩
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-
- titre
- Acquisition of TCF3 and CCND3 Mutations and Transformation to Burkitt Lymphoma in a Case of B-Cell Prolymphocytic Leukemia
- auteur
- M’boyba Diop, Florence Nguyen-Khac, Simon Bouzy, Damien Roos-Weil, Clotilde Bravetti, Agathe Maillon, M 'Boyba Diop, Cécile Doualle, Nathalie Droin, Olivier Bernard, Elise Chapiro
- article
- HemaSphere, 2021, 5 (5), pp.e563. ⟨10.1097/HS9.0000000000000563⟩
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-
- titre
- Optimal and sustainable management of a soilborne banana pest
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Frédéric Grognard, Jean Jules Tewa, Suzanne Touzeau
- article
- Applied Mathematics and Computation, 2021, 397, pp.125883. ⟨10.1016/j.amc.2020.125883⟩
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-
- titre
- When and how to fallow: first steps towards banana crop yield improvement through optimal and sustainable control of a soilborne pest
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Frédéric Grognard, Jean-Jules Tewa, Suzanne Touzeau
- article
- Journal of Interdisciplinary Methodologies and Issues in Science, 2021, Digital Agriculture in Africa, ⟨10.18713/JIMIS-120221-8-4⟩
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-
- titre
- Balancing Microalgae and Nitrifiers for Wastewater Treatment: Can Inorganic Carbon Limitation Cause an Environmental Threat?
- auteur
- Francesca Casagli, Simone Rossi, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard, Elena Ficara
- article
- Environmental Science and Technology, 2021, 55 (6), pp.3940-3955. ⟨10.1021/acs.est.0c05264⟩
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-
- titre
- Modeling the Influence of Temperature, Light Intensity and Oxygen Concentration on Microalgal Growth Rate
- auteur
- Ignacio López Muñoz, Olivier Bernard
- article
- Processes, 2021, 9 (3), pp.496. ⟨10.3390/pr9030496⟩
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-
- titre
- Global dynamics of the chemostat with overflow metabolism
- auteur
- Carlos Martínez, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2021, 82 (3), ⟨10.1007/s00285-021-01566-6⟩
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-
- titre
- ALBA: a comprehensive growth model to optimize algae-bacteria wastewater treatment in raceway ponds
- auteur
- Francesca Casagli, Gaetano Zuccaro, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer, Elena Ficara
- article
- Water Research, 2021, 190, pp.116734. ⟨10.1016/j.watres.2020.116734⟩
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-
- titre
- On Weyl's type theorems and genericity of projective rigidity in sub-Riemannian Geometry
- auteur
- Frédéric Jean, Sofya Maslovskaya, Igor Zelenko
- article
- Geometriae Dedicata, 2021, 213 (1), pp.295-314. ⟨10.1007/s10711-020-00581-z⟩
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-
- titre
- Modelling coffee leaf rust dynamics to control its spread
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Roger Tagne Wafo, Suzanne Touzeau, Samuel Bowong
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2021, 16, pp.26. ⟨10.1051/mmnp/2021018⟩
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-
- titre
- Turnpike features in optimal selection of species represented by quota models
- auteur
- Walid Djema, Laëtitia Giraldi, Sofya Maslovskaya, Olivier Bernard
- article
- Automatica, In press, ⟨10.1016/j.automatica.2021.109804⟩
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-
- titre
- Enhancing PUFA-rich polar lipids in Tisochrysis lutea using adaptive laboratory evolution (ALE) with oscillating thermal stress
- auteur
- Manon Gachelin, Marc Boutoute, Gregory Carrier, Amélie Talec, Eric Pruvost, Freddy Guihéneuf, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, 2021, ⟨10.1007/s00253-020-11000-4⟩
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-
- titre
- Dynamic equilibrium with randomly arriving players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Dynamic Games and Applications, 2021, 11 (2), pp.242-269. ⟨10.1007/s13235-020-00354-z⟩
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-
- titre
- When higher carrying capacities lead to faster propagation
- auteur
- Marjorie Haond, Thibaut Morel-Journel, Eric Lombaert, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret, Lionel Roques
- article
- Peer Community In Ecology, 2021, 1, pp.e57. ⟨10.24072/pcjournal.66⟩
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-
- titre
- Modelling and optimal strategy to control coffee berry borer
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou, Samuel Bowong, Frédéric Grognard
- article
- Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2021, 44 (18), pp.14569-14592. ⟨10.1002/mma.7726⟩
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-
- titre
- Shear stress affects the architecture and cohesion of Chlorella vulgaris biofilms
- auteur
- Andrea Fanesi, Marc Lavayssière, Cyril Breton, Olivier Bernard, Romain Briandet, Filipa Lopes
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-83523-3⟩
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-
- titre
- A thermal trade-off between viral production and degradation drives phytoplankton-virus population dynamics
- auteur
- David Demory, Joshua Weitz, Anne-Claire Baudoux, Suzanne Touzeau, Nathalie Simon, Sophie Rabouille, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Ecology Letters, 2021, 24 (6), pp.1133-1144. ⟨10.1111/ele.13722⟩
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-
- titre
- Optimal proteome allocation and the temperature dependence of microbial growth laws
- auteur
- Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong
- article
- npj Systems Biology and Applications, 2021, 7 (14), ⟨10.1038/s41540-021-00172-y⟩
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-
Conference papers
- titre
- Hierarchical MPC applied to bacterial resource allocation and metabolite synthesis
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2021 - 60th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2021, Austin, United States. pp.667-672, ⟨10.1109/CDC45484.2021.9683025⟩
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-
- titre
- Adaptative laboratory evolution for enhanced EPS production in biofilm forming microalgae
- auteur
- Aurélie Pham, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Freddy Guihéneuf, Hubert Bonnefond, Amélie Talec
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2021, OnLine, France
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-
- titre
- Control for synchronization of bistable piecewise affine genetic regulatory networks
- auteur
- Nicolas Augier, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- CHAOS 2021 - 6th IFAC Hybrid Conference on Analysis and Control of Chaotic Systems, Sep 2021, Catania, Italy. ⟨10.1016/j.ifacol.2021.11.044⟩
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-
- titre
- TRAIL-induced apoptosis signaling modeling identifies dynamic signs of efficient cell death initiation, enabling an early prediction of the cell response
- auteur
- Marielle Péré, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- CMSB 2021 - 19th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2021, Bordeaux, France
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-
- titre
- Time-optimal control of piecewise affine bistable gene-regulatory networks: preliminary results
- auteur
- Nicolas Augier, Agustín G. Yabo
- article
- ADHS 2021 - 7th IFAC Conference on Analysis and Design of Hybrid Systems, IFAC, Jul 2021, Brussels, Belgium. ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.499⟩
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-
- titre
- Mathematical modelling and optimal control of the seasonal coffee leaf rust propagation
- auteur
- Clotilde Djuikem, Agustín G. Yabo, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- ADHS 2021 - 7th IFAC Conference on Analysis and Design of Hybrid Systems, IFAC, Jul 2021, Brussels, Belgium. pp.193-198, ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.497⟩
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-
- titre
- Mixing strategies combined with shape design to enhance productivity of a raceway pond
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Julien Salomon
- article
- ADCHEM 2021 - 16th IFAC Symposium on Advanced Control of Chemical Processes, Jun 2021, Venice, Italy. pp.281-286, ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.255⟩
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-
- titre
- Dynamics and productivity of microalgae in presence of predators
- auteur
- Carlos Martínez, Bruno Assis Pessi, Olivier Bernard
- article
- 16th IFAC Symposium on Advanced Control of Chemical Processes ADCHEM 2021, Jun 2021, Venice Italy, Italy. pp.673-678, ⟨10.1016/j.ifacol.2021.08.319⟩
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-
- titre
- Controlling the bottom topography of a microalgal pond to optimize productivity
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Jacques Sainte-Marie, Julien Salomon
- article
- ACC 2021 - American Control Conference, IEEE, May 2021, New Orleans, United States. pp.634-639, ⟨10.23919/ACC50511.2021.9483235⟩
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-
- titre
- Optimizing microalgal productivity in raceway ponds through a controlled mixing device
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Julien Salomon
- article
- ACC 2021 - American Control Conference, IEEE, May 2021, New Orleans, United States. pp.640-645, ⟨10.23919/ACC50511.2021.9482760⟩
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-
- titre
- Impulsive model and hyperparasite-based biocontrol of coffee leaf rust propagation
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau
- article
- Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2021, Marseille, France
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-
- titre
- Host mixtures for plant disease control: from induced pathogen competition to the benefits of immune priming
- auteur
- Pauline Clin, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- MPDEE 2021 - Conference on Mathematical Population Dynamics, Ecology and Evolution, Apr 2021, Marseille, France
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-
- titre
- Optimal bacterial resource allocation
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- DCO 2021 - International Conference on Dynamic Control and Optimization, Feb 2021, Aveiro, Portugal
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-
Book sections
- titre
- Qualitative modeling, analysis, and control of synthetic regulatory circuits
- auteur
- Madalena Chaves, Hidde de Jong
- article
- Filippo Menolascina. Synthetic Gene Circuits: Methods and Protocols, 2229, Humana Press, pp.1-40, 2021, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1032-9_1⟩
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Modelling the regulation of biological systems at multiple scales: phenotypic variability and response to environmental changes
- auteur
- Valentina Baldazzi
- article
- Modeling and Simulation. Université Côte d'Azur, 2021
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-
Books
- titre
- OcéanIA: AI, Data, and Models for Understanding the Ocean and Climate Change
- auteur
- Nayat Sanchez-Pi, Luis Marti, Julien Salomon, Jacques Sainte-Marie, Olivier Bernard, Michele Sebag, Marc Schoenauer, Alejandro Maass, Damien Eveillard, André Abreu, Colomban de Vargas, Pablo A. Marquet
- article
- pp.1-64, 2021
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-
Patents
- titre
- Système flottant de production de microalgues sous forme de biofilm
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond, Axel Wakefield, Freddy Guihéneuf
- article
- France, N° de brevet: FR3107900A1. 2021
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-
Poster communications
- titre
- The impact of light regimes on Chlorella vulgaris biofilm structural dynamics and physiology
- auteur
- Yan Gao, Olivier Bernard, Andrea Fanesi, Patrick Perre, Filipa Lopes
- article
- AlgaEurope 2021, Dec 2021, Online, France
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-
- titre
- The impact of light regimes on Chlorella vulgaris biofilm structural dynamics and physiology
- auteur
- Yan Gao, Olivier Bernard, Andrea Fanesi, Patrick Perre, Filipa Lopes
- article
- Young Algaeneers Symposium 2021, May 2021, Online, France
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-
Reports
- titre
- Turnpike Features in Optimal Selection of Species Represented by Quota Models: Extended Proofs
- auteur
- Walid Djema, Laetitia Giraldi, Sofya Maslovskaya, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-9399, Inria - Sophia Antipolis. 2021, pp.29
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-
Theses
- titre
- Optimal resource allocation in bacterial growth: theoretical study and applications to metabolite production
- auteur
- Agustín G. Yabo
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Université Côte d'Azur, 2021. English. ⟨NNT : 2021COAZ4095⟩
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-
- titre
- Control and estimation methods for microbial communities
- auteur
- Alex dos Reis de Souza
- article
- Systems and Control [cs.SY]. Université de Lille, 2021. English. ⟨NNT : 2021LILUB002⟩
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-
- titre
- Modelling, analysis and control of plantain plant-parasitic nematodes
- auteur
- Israël Tankam Chedjou
- article
- Mathematics [math]. Université de Yaoundé I, Cameroun, 2021. English. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Development of the ALBA model: a comprehensive mathematical tool for raceway systems management and integration in Water Resource Recovery Facilities
- auteur
- Francesca Casagli
- article
- Environmental Sciences. Politecnico di Milano, 2021. English. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Optimization of adiabatic control strategies along non-mixing curves with singularities
- auteur
- Nicolas Augier
- article
- 2021
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-
- titre
- The role of interference between vectors in control of plant diseases
- auteur
- Marta Zaffaroni, Loup Rimbaud, Ludovic Mailleret, Nik J Cunniffe, Daniele Bevacqua
- article
- 2021
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-
- titre
- The hidden side of the Allee effect: correlated demographic traits and extinction risk in experimental populations
- auteur
- Elodie Vercken, Géraldine Groussier, Laurent Lamy, Ludovic Mailleret
- article
- 2021
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-
2020
Journal articles
- titre
- Stability switching and hydra effect in a predator–prey metapopulation model
- auteur
- Nicolas Bajeux, Bapan Ghosh
- article
- BioSystems, 2020, 198 (12), pp.104255. ⟨10.1016/j.biosystems.2020.104255⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Robust Adaptive Estimation in the Competitive Chemostat
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Jean-Luc Gouzé, Denis Efimov, Andrey Polyakov
- article
- Computers & Chemical Engineering, 2020, 142, pp.107030. ⟨10.1016/j.compchemeng.2020.107030⟩
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-
- titre
- Topology-induced dynamics in a network of synthetic oscillators with piecewise affine approximation
- auteur
- Elena Firippi, Madalena Chaves
- article
- Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, 2020, 30 (11), pp.113128. ⟨10.1063/5.0020670⟩
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-
- titre
- Profiling the Non-genetic Origins of Cancer Drug Resistance with a Single-Cell Functional Genomics Approach Using Predictive Cell Dynamics
- auteur
- Mickael Meyer, Agnès Paquet, Marie-Jeanne Arguel, Ludovic Peyre, Luis Gomes-Pereira, Kevin Lebrigand, Baharia Mograbi, Patrick Brest, Rainer Waldmann, Pascal Barbry, Paul Hofman, Jérémie Roux
- article
- Cell Systems, 2020, 11 (4), pp.367-374. ⟨10.1016/j.cels.2020.08.019⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How mechanistic modelling supports decision making for the control of enzootic infectious diseases
- auteur
- Pauline Ezanno, Mathieu Andraud, Gaël Beaunée, Thierry Hoch, Stéphane Krebs, Arnaud Rault, Suzanne Touzeau, Elisabeta Vergu, Stefan Widgren
- article
- Epidemics, 2020, 32, pp.100398. ⟨10.1016/j.epidem.2020.100398⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Rotating algal biofilm versus planktonic cultivation: LCA perspective
- auteur
- Marjorie Morales, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- Journal of Cleaner Production, 2020, 257, pp.120547. ⟨10.1016/j.jclepro.2020.120547⟩
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-
- titre
- How optimal foragers should respond to habitat changes: on the consequences of habitat conversion
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Marie Hamelin, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- Theoretical Ecology, 2020, 13 (2), pp.165-175. ⟨10.1007/s12080-019-00437-7⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cell cycle period control through modulation of clock inputs
- auteur
- Sofia José Figueiredo Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2020, 18 (03), pp.2040006. ⟨10.1142/S0219720020400065⟩
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-
- titre
- Dynamics of the periodically forced light-limited Droop model
- auteur
- Carlos Martínez, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Differential Equations, 2020, ⟨10.1016/j.jde.2020.03.020⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelling and control of a banana soilborne pest in a multi-seasonal framework
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Ludovic Mailleret, Jean Jules Tewa, Frédéric Grognard
- article
- Mathematical Biosciences, 2020, 322, pp.108324. ⟨10.1016/j.mbs.2020.108324⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Separating Two Species of Microalgae in Photobioreactors in Minimal Time
- auteur
- Walid Djema, Olivier Bernard, Laetitia Giraldi
- article
- Journal of Process Control, 2020, 87, pp.120-129. ⟨10.1016/j.jprocont.2020.01.003⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Reducing a model of sugar metabolism in peach to catch different patterns among genotypes
- auteur
- Hussein Kanso, Bénédicte Quilot-Turion, Mohamed-Mahmoud Memah, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Valentina Baldazzi
- article
- Mathematical Biosciences, 2020, 321, pp.108321. ⟨10.1016/j.mbs.2020.108321⟩
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-
- titre
- Qualitative control of undesired oscillations in a genetic negative feedback loop with uncertain measurements
- auteur
- Lucie Chambon, Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- Automatica, 2020, 112, pp.108642. ⟨10.1016/j.automatica.2019.108642⟩
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-
- titre
- Transcription-based circadian mechanism controls the duration of molecular clock states in response to signaling inputs
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2020, 484, pp.110015. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.110015⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A dynamic game approach to uninvadable strategies for biotrophic pathogens
- auteur
- Ivan Yegorov, Frédéric Grognard, Ludovic L. Mailleret, Fabien Halkett, Pierre Bernhard
- article
- Dynamic Games and Applications, 2020, 10, pp.257-296. ⟨10.1007/s13235-019-00307-1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Enhanced production of heterologous proteins by a synthetic microbial community: Conditions and trade-offs
- auteur
- Marco Mauri, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong, Eugenio Cinquemani
- article
- PLoS Computational Biology, 2020, 16 (4), pp.e1007795. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007795⟩
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-
- titre
- Control of synchronization ratios in clock/cell cycle coupling by growth factors and glucocorticoids
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- Royal Society Open Science, 2020, 7 (2), pp.192054. ⟨10.1098/rsos.192054⟩
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-
- titre
- Multi‐seasonal modelling of plant‐nematode interactions reveals efficient plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Caroline Djian‐caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret
- article
- Evolutionary Applications, 2020, 13 (9), pp.2206-2221. ⟨10.1111/eva.12989⟩
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-
- titre
- Robust Stabilization of Competing Species in the Chemostat
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Process Control, 2020, 87, pp.138-146. ⟨10.1016/j.jprocont.2020.01.010⟩
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-
- titre
- Model-assisted comparison of sugar accumulation patterns in ten fleshy fruits highlights differences between herbaceous and woody species
- auteur
- Coffi Belmys Cakpo, Gilles Vercambre, Valentina Baldazzi, Léa Roch, Zhanwu Dai, Pierre Valsesia, Mohamed-Mahmoud Memah, Sophie Colombie, Annick Moing, Yves Gibon, Michel Génard
- article
- Annals of Botany, 2020, 126 (3), pp.455-470. ⟨10.1093/aob/mcaa082⟩
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-
- titre
- Modeling and analysis of an Absorption Column Connected to a Microalgae Culture
- auteur
- Carlos Martinez, Francis Mairet, Leslie Meier, David Jeison, Andrés Avila
- article
- SIAM Journal on Applied Mathematics, 2020, 80 (2), ⟨10.1137/18M1225641⟩
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-
- titre
- Optimal bacterial resource allocation: metabolite production in continuous bioreactors
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- Mathematical Biosciences and Engineering, 2020, 17 (6), pp.7074-7100. ⟨10.3934/mbe.2020364⟩
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-
Conference papers
- titre
- Control of negative feedback loops in genetic networks
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé, Roderick Edwards
- article
- CDC 2020 - 59th Conference on Decision and Control, Dec 2020, Jeju Island / Virtual, South Korea
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control separating two microalgae species competing in a chemostat
- auteur
- Walid Djema, Olivier Bernard, Térence Bayen
- article
- CDC 2020 - 59th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2020, Jeju, South Korea. ⟨10.1109/CDC42340.2020.9304115⟩
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-
- titre
- Artificial Intelligence, Machine Learning and Modeling for Understanding the Oceans and Climate Change
- auteur
- Nayat Sanchez-Pi, Luis Marti, André Abreu, Olivier Bernard, Colomban de Vargas, Damien Eveillard, Alejandro Maass, Pablo A. Marquet, Jacques Sainte-Marie, Julien Salomon, Marc Schoenauer, Michele Sebag
- article
- NeurIPS 2020 Workshop - Tackling Climate Change with Machine Learning, Dec 2020, Santiago / Virtual, Chile
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-
- titre
- Core Models of Receptor Reactions to Evaluate Basic Pathway Designs Enabling Heterogeneous Commitments to Apoptosis
- auteur
- Marielle Péré, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- CMSB 2020 - 18th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2020, Konstanz, Germany. pp.298-320, ⟨10.1007/978-3-030-60327-4_16⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Qualitative Analysis of Mammalian Circadian Oscillations: Cycle Dynamics and Robustness
- auteur
- Ousmane Diop, Madalena Chaves, Laurent Tournier
- article
- CMSB 2020 - 18th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2020, Konstanz, Germany. pp.176-192, ⟨10.1007/978-3-030-60327-4_10⟩
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-
- titre
- A model of apoptosis receptor reactions to study cell fate decision
- auteur
- Luis Gomes-Pereira, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- MED 2020 - 28th Mediterranean Conference on Control and Automation, Sep 2020, Saint Raphaël, France. pp.887-892, ⟨10.1109/MED48518.2020.9183229⟩
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-
- titre
- Observer-Based Robust Control of a Continuous Bioreactor with Heterogeneous Community
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC 2020 - 21rst IFAC World Congress, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimizing bacterial resource allocation: metabolite production in continuous bioreactors
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC 2020 - 1st Virtual World Congress by the International Federation of Automatic Control, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany. ⟨10.1016/j.ifacol.2020.12.1146⟩
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-
- titre
- Optimal control of a fed-batch reactor with overflow metabolism
- auteur
- Carlos Martínez, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC 2020 - 1st Virtual World Congress by the International Federation of Automatic Control, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany
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-
- titre
- The turnpike property in maximization of microbial metabolite production
- auteur
- Jean-Baptiste Caillau, Walid Djema, Laetitia Giraldi, Jean-Luc Gouzé, Sofya Maslovskaya, Jean-Baptiste Pomet
- article
- IFAC 2020 - 21rst IFAC World Congress, Jul 2020, Berlin / Virtual, Germany
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-
- titre
- Reducing a model of sugar metabolism in peach fruit to explore genetic diversity
- auteur
- Hussein Kanso, Bénédicte Quilot-Turion, Mohamed-Mahmoud Memah, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Valentina Baldazzi
- article
- iCROPM 2020 : Crop modelling for the Future, Feb 2020, Montpellier, France. pp.1-5
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Potentiel des microalgues
- auteur
- Hubert Bonnefond, Charlotte Combe, Jean-Paul Cadoret, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Stephanie Baumberger. Chimie verte et industries agroalimentaires - Vers une bioéconomie durable, Lavoisier, 2020
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-
- titre
- Lutte biologique par augmentation à l’aide d’arthropodes entomophages contre les arthropodes phytophages
- auteur
- Alexandre Bout, Nicolas Ris, Cécilia Multeau, Ludovic Mailleret
- article
- Biocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Editions Quae, 376 p., 2020, Savoir Faire (Quae), 978-2-7592-3076-1
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-
- titre
- Microalgae as a source of edible oils
- auteur
- Jelena Helene Cvejic, Antonio Luca Langellotti, Hubert Bonnefond, Vito Verardo, Olivier Bernard
- article
- Lipids and Edible Oils, Elsevier, pp.175-211, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-817105-9.00005-7⟩
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-
- titre
- Le Modèle de Cournot avec entrées aléatoires de firmes
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Marc Deschamps; Thierry Martin. Cournot, économie et philosophie, Éditions Matériologiques, 2020, E-conomiques, 9782373612622
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-
Books
- titre
- The Green Book of the Academy Space, Environment, Risk and Resilience
- auteur
- Pierre-Jean Barre, Christophe den Auwer, Dennis Fox, Frédéric Grognard, Tristan Guillot, Manon Le Gourrierec, Isabelle Manighetti
- article
- 1, 2020, 978-2-9571154-0-2
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-
Patents
- titre
- Device for producing microalgae
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond
- article
- France, Patent n° : WO/2020/099590. 2020
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-
Poster communications
- titre
- Microalgae strains improvement by adaptive laboratory evolution applied to biofilm culture
- auteur
- Aurélie Pham, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Freddy Guihéneuf, Hubert Bonnefond
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2020, Rome, Italy
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-
Theses
- titre
- Mathematical analysis, coupling and control design for models of synthetic biological oscillators
- auteur
- Eleni Firippi
- article
- Signal and Image Processing. Université Côte d'Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4105⟩
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-
- titre
- Sustainable management of root-knot nematodes in horticultural crops by modelling and optimising the deployment of resistant plant varieties
- auteur
- Samuel Nilusmas
- article
- Microbiologie et Parasitologie. Université Côte d'Azur, 2020. Français. ⟨NNT : 2020COAZ4086⟩
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-
- titre
- Control strategies for genetic feedback loops
- auteur
- Lucie Chambon
- article
- Optimization and Control [math.OC]. Université Côte d'Azur, 2020. English. ⟨NNT : 2020COAZ4005⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Shape optimization of a microalgal raceway to enhance productivity
- auteur
- Olivier Bernard, Liu-Di Lu, Jacques Sainte-Marie, Julien Salomon
- article
- 2020
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-
- titre
- Shifts from pulled to pushed range expansions caused by reduction of landscape connectedness
- auteur
- Maxime Dahirel, Aline Bertin, Marjorie Haond, Aurélie Blin, Eric Lombaert, Vincent Calcagno, Simon Fellous, Ludovic Mailleret, Thibaut Malausa, Elodie Vercken
- article
- 2020
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-
2019
Journal articles
- titre
- The impact of light supply to photosynthetic moving biofilms
- auteur
- Jérôme Grenier, Hubert Bonnefond, Filipa Lopes, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2019, 44 (101674), ⟨10.1016/j.algal.2019.101674⟩
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-
- titre
- Optimal integration of microalgae production with photovoltaic panels: environmental impacts and energy balance
- auteur
- Marjorie Morales, Arnaud Hélias, Olivier Bernard
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2019, 12 (1), pp.239. ⟨10.1186/s13068-019-1579-4⟩
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-
- titre
- Evaluation of the feasibility of photosynthetic biogas upgrading: Simulation of a large-scale system
- auteur
- Leslie Meier, Carlos Martínez, Carlos Vílchez, Olivier Bernard, David Jeison
- article
- Energy, 2019, 189, pp.116313. ⟨10.1016/j.energy.2019.116313⟩
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-
- titre
- Perspectives of surface plasmon resonance sensors for optimized biogas methanation
- auteur
- Jacob J Lamb, Olivier Bernard, Shiplu Sarker, Kristian M Lien, Dag Roar Hjelme
- article
- Engineering in Life Sciences, 2019, 19 (11), pp.759-769. ⟨10.1002/elsc.201900063⟩
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-
- titre
- Organ-wide and ploidy-dependent regulation both contribute to cell-size determination: evidence from a computational model of tomato fruit
- auteur
- Valentina Baldazzi, Pierre Valsesia, Michel Génard, Nadia Bertin
- article
- Journal of Experimental Botany, 2019, 70 (21), pp.6215-6228. ⟨10.1101/450916⟩
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-
- titre
- Perspectives of optical colourimetric sensors for anaerobic digestion
- auteur
- Jacob J Lamb, Olivier Bernard, Shiplu Sarker, Kristian M Lien, Dag Roar Hjelme
- article
- Renewable and Sustainable Energy Reviews, 2019, 111, pp.87-96. ⟨10.1016/j.rser.2019.04.083⟩
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-
- titre
- Twelve quick tips for designing sound dynamical models for bioprocesses
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- PLoS Computational Biology, 2019, 15 (8), pp.e1007222. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007222⟩
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-
- titre
- Gradient-based optimization of a rotating algal biofilm process
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Nina Aguillon, Jacques Sainte-Marie, Jérôme Grenier, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- Automatica, 2019, 105, pp.80-88. ⟨10.1016/j.automatica.2019.02.043⟩
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-
- titre
- Virus epidemics, plant-controlled population bottlenecks and the durability of plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Mélanie Bonneault, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2019, 374 (1775), pp.20180263. ⟨10.1098/rstb.2018.0263⟩
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-
- titre
- Influence of the components of propagule pressure, Allee effects, and stochasticity on the time to establish introduced populations
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic L. Mailleret
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 471, pp.91-107. ⟨10.1016/j.jtbi.2019.03.012⟩
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-
- titre
- Dynamics and control of a periodically forced microalgae culture
- auteur
- Carlos Martínez, Francis Mairet, Pierre Martinon, Olivier Bernard
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2019, 52, pp.922-927. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.180⟩
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-
- titre
- In search of artificial domatia for predatory mites
- auteur
- Cecile Bresch, Lea Carlesso, Ricardo Suay, Louise van Oudenhove, Suzanne Touzeau, Hicham Fatnassi, Lydia Ottenwaelder, B. Paris, Christine Poncet, Ludovic Mailleret, Gerben J. Messelink, Pia Parolin
- article
- Biocontrol Science and Technology, 2019, 29 (2), pp.1-18. ⟨10.1080/09583157.2018.1540030⟩
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-
- titre
- Its all about connections: hubs and invasion in habitat networks
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Claire Rais Assa, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Ecology Letters, 2019, 22 (2), pp.313-321. ⟨10.1111/ele.13192⟩
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-
- titre
- Modeling the bioconversion of polysaccharides in a continuous reactor: A case study of the production of oligo-galacturonates by Dickeya dadantii
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Sylvie Reverchon, Jean-Luc Gouzé, William Nasser
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2019, 294 (5), pp.1753-1762. ⟨10.1074/jbc.RA118.004615⟩
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-
- titre
- Analysis of a genetic-metabolic oscillator with piecewise linear models
- auteur
- Madalena Chaves, Diego A. Oyarzun, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2019, 462, pp.259 - 269. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.10.026⟩
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-
- titre
- Meteorological Data-Based Optimal Control Strategy for Microalgae Cultivation in Open Pond Systems
- auteur
- Riccardo De-Luca, Fabrizio Bezzo, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- Complexity, 2019, 2019, pp.1-12. ⟨10.1155/2019/4363895⟩
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-
- titre
- How to prevent viremia rebound? Evidence from a PRRSv data-supported model of immune response
- auteur
- Natacha Go, Suzanne Touzeau, Zeenath Islam, Catherine Belloc, Andrea Doeschl-Wilson
- article
- BMC Systems Biology, 2019, 13, pp.15. ⟨10.1186/s12918-018-0666-7⟩
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-
- titre
- Dynamics of complex feedback architectures in metabolic pathways
- auteur
- Madalena Chaves, Diego A. Oyarzun
- article
- Automatica, 2019, 99, pp.323 - 332. ⟨10.1016/j.automatica.2018.10.046⟩
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-
- titre
- Picoeukaryotes of the Micromonas genus: sentinels of a warming ocean
- auteur
- David Demory, Anne-Claire Baudoux, Adam Monier, Nathalie Simon, Christophe Six, Pei Ge, Fabienne Rigaut-Jalabert, Dominique Marie, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Sophie Rabouille
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2019, 13 (1), pp.132-146. ⟨10.1038/s41396-018-0248-0⟩
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-
- titre
- Dynamical reduction of linearized metabolic networks through quasi steady state approximation
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- AIChE Journal, 2019, 65 (1), pp.18-31. ⟨10.1002/aic.16406⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Kalman 1960: The birth of modern system theory
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Mathematical Population Studies, 2019, 26 (3), pp.123-145. ⟨10.1080/08898480.2018.1553393⟩
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-
- titre
- Why, when and how should exposure be considered at the within-host scale? A modelling contribution to PRRSv infection
- auteur
- Natacha Go, Catherine Belloc, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- Mathematical Medicine and Biology, 2019, 36 (2), pp.179-206. ⟨10.1093/imammb/dqy005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Microalgae and cyanobacteria modeling in water resource recovery facilities: A critical review
- auteur
- Brian D. Shoener, Stephanie M. Schramm, Fabrice Béline, Olivier Bernard, Carlos Martínez, Benedek G. Plosz, Spencer Snowling, Jean-Philippe Steyer, Borja Valverde-Pérez, Dorottya Wagner, Jeremy S. Guest
- article
- Water Research X, 2019, 2, pp.18. ⟨10.1016/j.wroa.2018.100024⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Leaf Production and Expansion: A Generalized Response to Drought Stresses from Cells to Whole Leaf Biomass—A Case Study in the Tomato Compound Leaf
- auteur
- Garance Koch, Gaëlle Rolland, Myriam Dauzat, Alexis Bediée, Valentina Baldazzi, Nadia Bertin, Yann Guédon, Christine Granier
- article
- Plants, 2019, 8 (10), pp.409. ⟨10.3390/plants8100409⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control of bacterial growth for the maximization of metabolite production
- auteur
- Ivan Yegorov, Francis Mairet, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2019, 78 (4), pp.985-1032. ⟨10.1007/s00285-018-1299-6⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The architecture of monospecific microalgae biofilms 2
- auteur
- Andrea Fanesi, Armelle Paule, Olivier Bernard, Romain Briandet, Filipa Lopes
- article
- Microorganisms, 2019, 7 (9), pp.352. ⟨10.3390/microorganisms7090352⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Unusual Patterns of Mitochondrial Inheritance in the Brown Alga Ectocarpus
- auteur
- Laure Mignerot, Chikako Nagasato, Akira F Peters, Marie-Mathilde Perrineau, Delphine Scornet, Florian Pontheaux, Walid Djema, Yacine Badis, Taizo Motomura, Coelho Susana M., J. Mark Cock
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2019, ⟨10.1093/molbev/msz186⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Robust Control of a Competitive Environment in the Chemostat using Discontinuous Control Laws
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Denis Efimov, Andrey Polyakov, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Global asymptotic stability of a genetic negative feedback loop with an affine control
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Singular regimes for the maximization of metabolite production
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France. pp.31-36, ⟨10.1109/CDC40024.2019.9029410⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Mathematical Biology Seminar, Dec 2019, Corvallis, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Coupling and synchronization of piecewise linear genetic regulatory systems
- auteur
- Madalena Chaves, Luca Scardovi, Eleni Firippi
- article
- CDC 2019 - 58th IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Period Control of the Coupled Clock and Cell Cycle Systems
- auteur
- Sophia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay
- article
- CSBIO 2019 - 10th International Conference on Computational Systems-Biology and Bioinformatics, Dec 2019, Nice, France. ⟨10.1145/3365953.3365956⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Recent advances in algal biofilm cultivation for fish feed
- auteur
- Freddy Guihéneuf, Alex Wakefield, Quentin Girardin, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Christophe Vasseur, Hubert Bonnefond
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2019, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Enhancing Tetraselmis suecica biofilm productivity by adding organic and inorganic carbon
- auteur
- Margaux Caia, Freddy Guihéneuf, Hubert Bonnefond, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- AlguaEurope Conference, Dec 2019, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pulsed perturbations in population dynamics
- auteur
- Ludovic Mailleret
- article
- Modelife days - Journées de Modélisation, physique et mathématique du vivant, Nov 2019, Mandelieu, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Turnpike Features in Optimal Selection of Microalgae
- auteur
- Walid Djema, Olivier Bernard, Laetitia Giraldi
- article
- FOSBE 2019 - 8th IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, Oct 2019, Valencia, Spain. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.273⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Period -control in a coupled system of two genetic oscillators for synthetic biology
- auteur
- Eleni Firippi, Madalena Chaves
- article
- FOSBE 2019 - 8th IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, Oct 2019, Valencia, Spain. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.238⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Global stabilization of a genetic positive feedback loop via the design of a synthetic auto-repression
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE), Oct 2019, Valencia, Spain. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.249⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A reduction strategy to simplify a model of sugar metabolism for application to a large panel of genotypes
- auteur
- Hussein Kanso, Bénédicte Quilot-Turion, Mohamed-Mahmoud Memah, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Valentina Baldazzi
- article
- FOSBE 2019 - 8th Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering, IFAC, Oct 2019, Valencia, Spain
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improvement of microalgae strains by dynamic darwinian selection pressure
- auteur
- Hubert Bonnefond, Yann Lie, Eric Pruvost, Amélie Talec, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Alg’in Provence - European Workshop, Oct 2019, Arles, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacterial growth strategies as Optimal Control problems: maximizing metabolite production
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé
- article
- FGS'2019 - 19th French-German-Swiss conference on Optimization, Sep 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On Adaptive Estimation of Bacterial Growth in the Competitive Chemostat
- auteur
- Alex dos Reis de Souza, Jean-Luc Gouzé, Andrey Polyakov, Denis Efimov
- article
- MECHATRONICS 2019 - 8th International-Federation-of-Automatic-Control (IFAC) Symposium on Mechatronic Systems / 11th International-Federation-of-Automatic-Control (IFAC) Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2019, Vienne, Austria. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.11.789⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Recent advances in microalgal biotechnology with an emphasis on biofilm cultivation
- auteur
- Freddy Guihéneuf, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Hubert Bonnefond
- article
- EPC7 - 7th European Phycological Congress, Aug 2019, Zagreb, Croatia
- Accès au bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Journée MODECO - Modélisation des Dynamiques Écologiques, Jul 2019, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- An ecophysiological model of plant-nematodes interactions
- auteur
- Valentina Baldazzi, Thomas Breniere
- article
- MODECO 2019 - Journée Modélisation des Dynamiques Ecologiques, Vincent Calcagno, Jul 2019, Nice (06000), France
- Accès au bibtex
-
- titre
- A demo-genetic model of root-knot nematod dynamics with applications to the deployment of plant resistance
- auteur
- Ludovic Mailleret, Samuel Nilusmas, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno
- article
- Journée MODECO - Modélisation des Dynamiques Ecologiques, Jul 2019, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal control of bacterial growth for metabolite production: The role of timing and costs of control
- auteur
- Eugenio Cinquemani, Francis Mairet, Ivan Yegorov, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- ECC 2019 - 18th European Control Conference, Jun 2019, Naples, Italy. pp.2657-2662, ⟨10.23919/ECC.2019.8796079⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelling and controlling fungus Hemileia vastatrix, a coffee pest
- auteur
- Clotilde Djuikem, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau, Samuel Bowong
- article
- BIOMATH 2019 - International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences, Jun 2019, Bedlewo, Poland
- Accès au bibtex
-
- titre
- Agricultural control of Radopholus similis in banana and plantain plantations
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Jean Jules Tewa
- article
- BIOMATH 2019 - International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences, Jun 2019, Bedlewo, Poland
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal control on a simple model of coffee berry borer infestation
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Frédéric Grognard, Suzanne Touzeau, Berge Tsanou, Samuel Bowong
- article
- BIOMATH 2019 - International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences, Jun 2019, Bedlewo, Poland
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling, control, and optimization for tropical agriculture
- auteur
- Frédéric Grognard, Israël Tankam Chedjou, Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau
- article
- CMPD5 - Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2019, Fort Lauderdale, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- A demo-genetic model of root-knot nematod dynamics with applications to the deployment of plant resistance
- auteur
- Samuel Nilusmas, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- CMPD5 - Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2019, Fort Lauderdale, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Frédéric Grognard, Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Marie Hamelin
- article
- CMPD5 - Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2019, Fort Lauderdale, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation et contrôle en épidémiologie de cultures tropicales : application aux nématodes phytoparasites du bananier plantain et aux scolytes du caféier
- auteur
- Suzanne Touzeau
- article
- AgriNumA 2019 - Symposium Agriculture Numérique en Afrique, Apr 2019, Dakar, Sénégal
- Accès au bibtex
-
- titre
- A new qualitative control strategy for the genetic Toggle Switch
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- DYCOPS 2019 - 12th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, including Biosystems, Ifac, Apr 2019, Florianopolis, Brazil. pp.532-537, ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.117⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An Optimal Control Strategy Separating Two Species of Microalgae in Photobioreactors
- auteur
- Walid Djema, Laetitia Giraldi, Olivier Bernard
- article
- DYCOPS 2019 - 12th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, including Biosystems, Apr 2019, Florianopolis, Brazil. ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.178⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- rPrism -A software for reactive weighted state transition models
- auteur
- Daniel Figueiredo, Eugénio Rocha, Manuel A. Martins, Madalena Chaves
- article
- HSB 2019 - 6th International Workshop, Hybrid Systems Biology, Apr 2019, Prague, Czech Republic. pp.165 - 174
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Séminaire UMR ISA, Mar 2019, Sophia Antipolis, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Taking advantage of pathogen diversity and plant immunity to minimize disease prevalence
- auteur
- Pauline Clin, Florence Val, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- RVV 2019 - 17e Rencontres de Virologie Végétale, Jan 2019, Aussois, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Life is not a long quiet river : consequences of pulsed migration for population genetic divergence
- auteur
- Vincent Calcagno, Flora Aubree, Ludovic Mailleret, Thomas Guillemaud
- article
- Meeting of Society for Mathematical Biology, 2019, Montréal, Canada
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Life-cycle assessment of microalgal-based biofuel. Chapitre 20
- auteur
- Marjorie Morales, Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Helias, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Biomass, Biofuels, Biochemicals : Biofuels from Algae, 2ème ed., Elsevier, 606 p., 2019, 978-0-444-64192-2. ⟨10.1016/B978-0-444-64192-2.00020-2⟩
- Accès au bibtex
-
Books
- titre
- Molecular Logic and Computational Synthetic Biology First International Symposium, MLCSB 2018, Santiago, Chile, December 17–18, 2018, Revised Selected Papers
- auteur
- Madalena Chaves, Manuel A. Martins
- article
- Madalena Chaves; Manuel A. Martins. Springer, 11415, 2019, LNCS, 978-3-030-19431-4. ⟨10.1007/978-3-030-19432-1⟩
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-
Patents
- titre
- Bioreactor for the selection of microalgae
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond, Antoine Sciandra, Eric Pruvost, Ghjuvan Micaelu Grimaud
- article
- United States, Patent n° : 16/335,390, 2019. 2019
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-
Poster communications
- titre
- Pulsed migration and its consequences for population genetic divergence
- auteur
- Flora Aubree, Baptiste Lac, Thomas Guillemaud, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- European Society for Evolutionary Biology, 2019, Turku, Finland
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-
Proceedings
- titre
- Quantifying the potential of microalgae culture systems to remove nutrients from wastewater
- auteur
- Carlos Martinez, Francis Mairet, Luis Plaza, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- 52 (26), pp.287-292, 2019, ⟨10.1016/j.ifacol.2019.12.272⟩
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-
- titre
- Model Development and Light Effect on a Rotating Algal Biofilm
- auteur
- Ouassim Bara, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- 2019, ⟨10.1016/j.ifacol.2019.06.091⟩
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-
Reports
- titre
- Gradient-based optimization of a rotating algal biofilm process
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Nina Aguillon, Jacques Sainte-Marie, Jérôme Grenier, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-9250, Inria - Sophia antipolis. 2019
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-
Theses
- titre
- Modeling cell response heterogeneity to pro-apoptotic ligands
- auteur
- Luis Carlos Gomes Pereira
- article
- Automatic Control Engineering. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2019. English. ⟨NNT : 2019AZUR4081⟩
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-
- titre
- Modeling, analysis, and control of microalgae growth in dense cultures
- auteur
- Carlos Martinez von Dossow
- article
- Earth Sciences. Sorbonne Université, 2019. English. ⟨NNT : 2019SORUS255⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Turnpike Features in Optimal Selection ofMicroalgae
- auteur
- Walid Djema, Laetitia Giraldi, Olivier Bernard
- article
- 2019
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-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use to identify optimal plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret
- article
- 2019
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-
2018
Journal articles
- titre
- Impact of genetic drift, selection and accumulation level on virus adaptation to its host plants
- auteur
- Elsa Rousseau, Lucie Tamisier, Frédéric Fabre, Vincent Simon, Marion Szadkowski, Olivier Bouchez, Catherine Zanchetta, Gregory Girardot, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Alain Palloix, Benoît Moury
- article
- Molecular Plant Pathology, 2018, 19 (12), pp.2575-2589. ⟨10.1111/mpp.12730⟩
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-
- titre
- Optimizing CO2 transfer in algal open ponds
- auteur
- Margaux Caïa, Olivier Bernard, Quentin Béchet
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2018, 35, pp.530-538. ⟨10.1016/j.algal.2018.09.009⟩
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-
- titre
- Theory of turbid microalgae cultures
- auteur
- Carlos Martínez, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2018, 456, pp.190 - 200. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.07.016⟩
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-
- titre
- Boolean dynamics revisited through feedback interconnections
- auteur
- Madalena Chaves, Daniel Figueiredo, Manuel A. Martins
- article
- Natural Computing, 2018, ⟨10.1007/s11047-018-9716-8⟩
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-
- titre
- Clustered or scattered? The impact of habitat fragmentation on establishment and early spread
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Maud Hautier, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- Ecography, 2018, 41 (10), pp.1675-1683. ⟨10.1111/ecog.03397⟩
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-
- titre
- Between-group pathogen transmission: From processes to modeling
- auteur
- Thierry Hoch, Suzanne Touzeau, Anne-France Viet, Pauline Ezanno
- article
- Ecological Modelling, 2018, 383, pp.138 - 149. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2018.05.016⟩
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-
- titre
- Analytical Reduction of Nonlinear Metabolic Networks Accounting for Dynamics in Enzymatic Reactions
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- Complexity, 2018, 2018, pp.1 - 22. ⟨10.1155/2018/2342650⟩
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-
- titre
- Explore the best sugar factory: the fruit
- auteur
- Elsa Desnoues, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Valentina Baldazzi
- article
- TheScienceBreaker, 2018, ⟨10.25250/thescbr.brk124⟩
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-
- titre
- Are compound leaves more complex than simple ones? A multi-scale analysis
- auteur
- Garance Koch, Gaelle Rolland, Myriam Dauzat, Alexis Bediee, Valentina Baldazzi, Nadia Bertin, Yann Y. Guédon, Christine Granier
- article
- Annals of Botany, 2018, 122 (7), pp.1173-1185. ⟨10.1093/aob/mcy116⟩
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-
- titre
- Analysis Tools for Interconnected Boolean Networks With Biological Applications
- auteur
- Madalena Chaves, Laurent Tournier
- article
- Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.1-18. ⟨10.3389/fphys.2018.00586⟩
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-
- titre
- A kinetic model of sugar metabolism in peach fruit reveals a functional hypothesis of markedly low fructose-to-glucose ratio phenotype
- auteur
- Elsa Desnoues, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Valentina Baldazzi
- article
- The Plant Journal, 2018, 94 (4), pp.685-698. ⟨10.1111/tpj.13890⟩
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-
- titre
- How do microalgae perceive light in a high-rate pond? Towards more realistic Lagrangian experiments
- auteur
- David Demory, Charlotte Combe, Philipp Hartmann, Amélie Talec, Eric Pruvost, Raouf Hamouda, Fabien Souillé, Pierre-Olivier Lamare, Marie-Odile Bristeau, Jacques Sainte-Marie, Sophie Rabouille, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Royal Society Open Science, 2018, 5 (5), pp.180523. ⟨10.1098/rsos.180523⟩
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-
- titre
- A Stability Result for Periodic Solutions of Nonmonotonic Smooth Negative Feedback Systems
- auteur
- Camille Poignard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2018, 17 (2), pp.1091 - 1116. ⟨10.1137/17M1141205⟩
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-
- titre
- Full-scale validation of an algal productivity model including nitrogen limitation
- auteur
- Quentin Béchet, Noémie Coulombier, Christophe Vasseur, Thomas Lasserre, Loic Le Dean, Olivier Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2018, 31, pp.377-386. ⟨10.1016/j.algal.2018.02.010⟩
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-
- titre
- Comparative assessment of evaporation models in algal ponds
- auteur
- Quentin Béchet, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer, Andy Shilton, Benoit Guieysse
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2018, 35, pp.283-291. ⟨10.1016/j.algal.2018.08.022⟩
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-
- titre
- Modelling an Artificial Microalgae-Cyanobacteria Ecosystem
- auteur
- Margaux Caïa, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2018, 51 (2), pp.655 - 660. ⟨10.1016/j.ifacol.2018.03.111⟩
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-
- titre
- Maximizing microalgae productivity in a light-limited chemostat
- auteur
- Carlos Martínez, Olivier Bernard, Francis Mairet
- article
- IFAC-PapersOnLine, 2018, 51 (2), pp.735 - 740. ⟨10.1016/j.ifacol.2018.04.001⟩
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-
- titre
- Optimal feedback strategies for bacterial growth with degradation, recycling and effect of temperature
- auteur
- Ivan Yegorov, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- Optimal Control Applications and Methods, 2018, 39 (2), pp.1084-1109. ⟨10.1002/oca.2398⟩
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-
- titre
- Principal process analysis of biological models
- auteur
- Stefano Casagranda, Suzanne Touzeau, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- BMC Systems Biology, 2018, 12, pp.68. ⟨10.1186/s12918-018-0586-6⟩
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-
- titre
- Reduction and stability analysis of a transcription-translation model of RNA polymerase
- auteur
- Ismail Belgacem, Stefano Casagranda, Edith Grac, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2018, 80 (2), pp.294-318. ⟨10.1007/s11538-017-0372-4⟩
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-
Conference papers
- titre
- A multi-seasonal model of the dynamics of banana plant-parasitic nematodes
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Jean-Jules Tewa
- article
- CARI’2018 - 14. Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Oct 2018, Stellenbosch, South Africa
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-
- titre
- Modelling and control of coffee berry borer infestation
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Frédéric Grognard, Berge Tsanou, Suzanne Touzeau
- article
- CARI’2018 - 14. Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Oct 2018, Stellenbosch, South Africa
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-
- titre
- Sustainable management of root-knot nematodes in horticultural crops by modeling and optimizing resistance gene deployment
- auteur
- Samuel Nilusmas, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Modelling and control of coffee berry borer infestation
- auteur
- Yves Fotso Fotso, Suzanne Touzeau, Samuel Bowong, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Berge Tsanou
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Investigating viremia rebounds using a PRSS data-supported model of immune response
- auteur
- Suzanne Touzeau, Natacha Go, Catherine Belloc, Andrea Doeschl-Wilson
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Uninvadable strategies for biotrophic pathogens, from dynamic games to adaptive dynamics
- auteur
- Frédéric Grognard, Ivan Yegorov, Julien Guegan, Ludovic Mailleret, Fabien Halkett, Pierre Bernhard
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Modelling cell-death drug response heterogeneity at the receptor layer
- auteur
- Luis Pereira, Paul Hofman, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2018), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Unravelling the contribution of cell cycle and cell expansion in an integrated model of tomato fruit development
- auteur
- Valentina Baldazzi
- article
- ECMTB 2018 - European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- An agricultural control of Radopholus similis in banana plantations
- auteur
- Israël Tankam Chedjou, Suzanne Touzeau, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Jean-Jules Tewa
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
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-
- titre
- Gene-for-gene epidemic models, systemic acquired resistance, and the evolution of plant parasites
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Clin Pauline, Florence Val, Frédéric Grognard
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Qualitative control for a genetic negative feedback loop
- auteur
- Lucie Chambon, Jean-Luc Gouzé
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2018), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Reduction of Metabolic Networks keeping Core Dynamics
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2018), Jul 2018, Lisbon, Portugal
- Accès au bibtex
-
- titre
- Stability Analysis of a Nonlinear System with Infinite Distributed Delays Describing Cell Dynamics
- auteur
- Walid Djema, Frédéric Mazenc, Catherine Bonnet, Jean Clairambault, Emilia Fridman
- article
- ACC 2018 - American Control Conference, Jun 2018, Milwaukee, United States. ⟨10.23919/acc.2018.8430869⟩
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-
- titre
- Gene-for-gene epidemic models, systemic acquired resistance, and the evolution of plant parasites
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Clin Pauline, Florence Val, Frédéric Grognard
- article
- $MB^2$ 3rd Mathematical Biology Modelling Days of Besançon, Jun 2018, Besançon, France
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-
- titre
- Maximizing microalgae productivity in a light-limited chemostat
- auteur
- Carlos Martínez, Olivier Bernard, Francis Mairet
- article
- Meeting of working Group Medicago sativa, Feb 2018, Vienne, Austria. pp.6, ⟨10.1016/j.ifacol.2018.04.001⟩
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-
- titre
- Reduction of Metabolic Networks keeping Dynamics
- auteur
- Claudia López Zazueta, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé
- article
- MATHMOD 2018 - 9th Vienna International Conference on Mathematical Modelling, Feb 2018, Vienne, Austria. ⟨10.11128/arep.55.a55218⟩
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-
- titre
- Robust output regulation of 2 x 2 hyperbolic systems: Control law and Input-to-State Stability
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Jean Auriol, Florent Di Meglio, Ulf Jakob F. Aarsnes
- article
- American and Control Conference, 2018, Milwaukee, United States. ⟨10.23919/ACC.2018.8431176⟩
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-
Book sections
- titre
- Gibbard-Satterthwaite Theorem
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Encyclopedia of Law and Economics, Springer New York, pp.1-7, 2018, ⟨10.1007/978-1-4614-7883-6_755-2⟩
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-
- titre
- Arrow’s (im)possibility theorem
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Encyclopedia of Law and Economics, Springer, 2018, ⟨10.1007/978-1-4614-7883-6_754-1⟩
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-
- titre
- Life-Cycle Assessment of Microalgal-Based Biofuels
- auteur
- Marjorie Morales, Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Hélias, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Biomass, Biofuels and Biochemicals, Elsevier, pp.507-550, 2018
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Modélisation et contrôle en dynamiques de populations. Applications en protection des plantes.
- auteur
- Ludovic Mailleret
- article
- Automatique. Université Côte d'Azur, 2018
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-
Books
- titre
- Les conquêtes de l’INRA pour le biocontrôle
- auteur
- Thibaut Malausa, Emmanuelle Joly, Brigitte Frerot, Frédéric Marion-Poll, Denis Thiéry, Jean-Claude Martin, Amélie Lefèvre, Maria Navajas, Elisabeth Tabone, Jean-Yves Rasplus, Nicolas Ris, Jean-Claude Ogier, Sylvie Pages, Alain Givaudan, Sophie Gaudriault, Jean-Luc Gatti, Claire Lavigne, Jean-Charles Bouvier, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken, Etienne Klein, Lionel Roques, Nicolas Desneux, Christine Poncet, Marc Bardin, Philippe C. Nicot, Michel Ponchet, Eric Galiana, Marie-Noëlle Brisset
- article
- INRA Sciences & Impact, pp.32, 2018
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-
Poster communications
- titre
- Does mixing in suspended cultures enhance photosynthesis? Towards moving biofilms
- auteur
- Olivier Bernard, Hubert Bonnefond, David Demory, Charlotte Combe, Jacques Sainte-Marie, Filipa Lopes, Antoine Sciandra
- article
- AlgaEurope Conference, Dec 2018, Amsterdam, Netherlands
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-
- titre
- An individual based model to optimize natural enemies deployment in augmentative biological control.
- auteur
- Ludovic Mailleret, David Davtian, Frédéric Grognard
- article
- SFECOLOGY 2018 - International Conference on Ecological Sciences., Oct 2018, Rennes, France.
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-
- titre
- Ecophysiological modeling of the impact of light quantity and quality on microalgae growth in high-density open ponds
- auteur
- Philippe Le Noac'H, Sakina Dorothée Ayata, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Martin Laviale
- article
- Sfecologie 2018 - International Conference on Ecological Sciences, Oct 2018, Rennes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- An individual based model to optimize natural enemies deployment in augmentative biological control.
- auteur
- Ludovic Mailleret, David Davtian, Frédéric Grognard
- article
- 11th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB), Jul 2018, Lisbon, Portugal.
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evolution of populations of Leptosphaeria maculans, a fungal pathogen of oilseed rape, under resistance selection pressure: insights from two decades of surveys in France
- auteur
- Marie-Helene Balesdent, Clémence Plissonneau, Florence Carpentier, Laurent Coudard, Suzanne Touzeau, Martine Leflon, Magali Ermel, Régine Delourme, Loïc Le Meur, Thierry Rouxel
- article
- 21. Crucifer Genetics Conference - Brassica 2018, Jul 2018, Saint-Malo, France. , 2018
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-
Theses
- titre
- Synchronization of biological oscillators : modeling, analysis and coupling of the mammalian cell cycle and circadian clock
- auteur
- Sofia José Figueiredo Almeida
- article
- Other [cs.OH]. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4239⟩
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-
- titre
- Dynamical reduction of metabolic networks by singular perturbation theory : application to microalgae
- auteur
- Claudia López Zazueta
- article
- Signal and Image processing. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2018. English. ⟨NNT : 2018AZUR4108⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- How optimal foragers should respond to habitat changes? On the consequences of habitat conversion
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Hamelin, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Organ-wide and ploidy-dependent regulations both contribute to cell size determination: evidence from a computational model of tomato fruit
- auteur
- Valentina Baldazzi, Pierre Valsesia, Michel Génard, Nadia Bertin
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Modeling the impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity
- auteur
- Quentin Béchet, Martin Laviale, Nicolas Arsapin, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2017, 10 (1), pp.136. ⟨10.1186/s13068-017-0823-z⟩
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-
- titre
- Mathematical modelling of microbes: metabolism, gene expression and growth
- auteur
- Hidde de Jong, Stefano Casagranda, Nils Giordano, Eugenio Cinquemani, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of the Royal Society Interface, 2017, 14 (136), pp.1-14. ⟨10.1098/rsif.2017.0502⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimating virus effective population size and selection without neutral markers
- auteur
- Elsa Rousseau, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Rachid Senoussi, Alain Palloix, Vincent Simon, Sophie Valière, Frédéric Grognard, Frédéric Fabre
- article
- PLoS Pathogens, 2017, 13 (11), pp.e1006702. ⟨10.1371/journal.ppat.1006702⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use to identify durable plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- Acta Horticulturae, 2017, 1182, pp.211 - 218. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1182.25⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Cell division, endoreduplication and expansion processes: setting the cell and organ control into an integrated model of tomato fruit development
- auteur
- Valentina Baldazzi, Michel Génard, Nadia Bertin
- article
- Acta Horticulturae, 2017, 1182, pp.257 - 264. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1182.31⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Continuous selection pressure to improve temperature acclimation of Tisochrysis lutea
- auteur
- Hubert Bonnefond, Ghjuvan Micaelu Grimaud, Judith Rumin, Gaël Bougaran, Amélie Talec, M O Gachelin, M O Boutoute, Eric Pruvost, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- PLoS ONE, 2017, ⟨10.1371/journal.pone.0183547⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling the temperature effect on the specific growth rate of phytoplankton: a review
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Reviews in Environmental Science and Bio/technology, 2017, ⟨10.1007/s11157-017-9443-0⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A time-space model for the growth of microalgae biofilms for biofuel production
- auteur
- Bastien Polizzi, O. Bernard, Magali Ribot
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2017, ⟨10.1016/j.jtbi.2017.08.017⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Quantitative trait loci in pepper control the effective population size of two RNA viruses at inoculation
- auteur
- Lucie Tamisier, Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ghislaine Nemouchi, Marion Szadkowski, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Frederic Fabre, Benoît Moury, Alain Palloix
- article
- Journal of General Virology, 2017, 98 (7), pp.1923 - 1931. ⟨10.1099/jgv.0.000835⟩
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-
- titre
- Exploiting meteorological forecasts for the optimal operation of algal ponds
- auteur
- Riccardo De-Luca, Fabrizio Bezzo, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2017, 55, pp.55 - 65. ⟨10.1016/j.jprocont.2017.03.010⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dynamic metabolic modeling of heterotrophic and mixotrophic microalgal growth on fermentative wastes
- auteur
- Caroline Baroukh, Violette Turon, Olivier Bernard
- article
- PLoS Computational Biology, 2017, 13 (6), pp.e1005590. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005590⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fast algal eco-toxicity assessment: Influence of light intensity and exposure time on Chlorella vulgaris inhibition by atrazine and DCMU
- auteur
- Alexandre Camuel, Benoit Guieysse, Cynthia Alcántara, Quentin Béchet
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2017, 140, pp.141 - 147. ⟨10.1016/j.ecoenv.2017.02.013⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mate Limitation in Fungal Plant Parasites Can Lead to Cyclic Epidemics in Perennial Host Populations
- auteur
- Virginie Ravigné, Valérie Lemesle, Alicia Walter, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2017, 73 (3), pp.1 - 447. ⟨10.1007/s11538-016-0240-7⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Coupling and uncoupling of triglyceride and beta-carotene production by Dunaliella salina under nitrogen limitation and starvation
- auteur
- Hubert Bonnefond, Nina Moelants, Amélie Talec, Patrick Mayzaud, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2017, 10 (1), pp.25. ⟨10.1186/s13068-017-0713-4⟩
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-
- titre
- Hunting cooperation and Allee effects in predators
- auteur
- Mickaël Teixeira Alves, Frank M. Hilker
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2017, 419, pp.13-22. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.02.002⟩
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-
- titre
- Temperature is a key factor in Micromonas-virus interactions
- auteur
- David Demory, Laure Arsenieff, Nathalie Simon, Christophe Six, Fabienne Rigaut-Jalabert, Dominique Marie, Pei Ge, Estelle Bigeard, Stéphan Jacquet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Sophie Rabouille, Anne-Claire Baudoux
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2017, 11 (3), pp.601-612. ⟨10.1038/ismej.2016.160⟩
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-
- titre
- A kinetic model of sugar metabolism in peach fruit allows the exploration of genetic variability
- auteur
- Elsa Desnoues, Michel Génard, Bénédicte Quilot-Turion, Valentina Baldazzi
- article
- Acta Horticulturae, 2017, 1182, pp.169-176. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1182.20⟩
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-
- titre
- Augmentative biocontrol when natural enemies are subject to Allee effects
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2017, 74 (7), pp.1561 - 1587. ⟨10.1007/s00285-016-1063-8⟩
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-
- titre
- Infochemical use and dietary specialization in parasitoids: a meta-analysis
- auteur
- Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret, Xavier Fauvergue
- article
- Ecology and Evolution, 2017, 7 (13), pp.4804 - 4811. ⟨10.1002/ece3.2888⟩
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-
- titre
- Calibration of a productivity model for the microalgae Dunaliella salina accounting for light and temperature
- auteur
- Quentin Béchet, Philippe Moussion, Olivier A. Bernard
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2017, 21, pp.156 - 160. ⟨10.1016/j.algal.2016.11.001⟩
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-
- titre
- How to prevent viremia rebound in virus infections ? Evidence from a data-driven mathematical model for PRRS
- auteur
- Andrea Doeschl-Wilson, Natacha Go, Suzanne Touzeau
- article
- SAPHIR Newsletters, 2017, 4, pp.9-11
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-
- titre
- Optimization and control of bio-conversion of polymeric substrate in the chemostat
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- AIChE Journal, 2017, 63 (11), pp.4738-4747. ⟨10.1002/aic.15853⟩
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-
- titre
- Applying differential dynamic logic to reconfigurable biological networks
- auteur
- Daniel Figueiredo, Manuel A Martins, Madalena Chaves
- article
- Mathematical Biosciences, 2017, 291, pp.10 - 20. ⟨10.1016/j.mbs.2017.05.012⟩
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-
Conference papers
- titre
- Potential of evolution engineering for enhancing productivity of microalgae
- auteur
- Hubert Bonnefond, Amélie Talec, Eric Pruvost, M O Boutoute, Ghjuvan Micaelu Grimaud, Yann Lie, T Sauvée, Antoine Sciandra
- article
- AlgaEurope 2017 Conference, Dec 2017, Berlin, Germany
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-
- titre
- Épidémiologie mathématique : applications en élevage et en agriculture
- auteur
- Suzanne Touzeau
- article
- MADEV17 - Mathématiques Appliquées à des questions de DEVeloppement, Académie des Sciences, France; Académie Hassan II des Sciences et Techniques, Maroc, Oct 2017, Rabat, Maroc
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-
- titre
- How to prevent viremia rebound? Evidence from a PRRSv data-supported model of the immune response
- auteur
- Natacha Go, Suzanne Touzeau, Andrea Doeschl-Wilson, Catherine Belloc
- article
- IDDconf 2017 - Conference of Infectious Disease Dynamics, Sep 2017, Ambleside, Cumbria, United Kingdom
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-
- titre
- A comprehensive reduced model of the mammalian cell cycle
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Franck Delaunay, Celine Feillet
- article
- IFAC World Congress 2017, Jul 2017, Toulouse, France. ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.2204⟩
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-
- titre
- Optimal resource allocation for biotrophic plant pathogens
- auteur
- Ivan Yegorov, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Fabien Halkett
- article
- IFAC 2017 - 20th World Congress of the International Federation of Automatic Control, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jul 2017, Toulouse, France. pp.1-6, ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.328⟩
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-
- titre
- Principal Process Analysis and reduction of biological models with order of magnitude
- auteur
- Stefano Casagranda, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jul 2017, Toulouse, France. 15968 p., ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.2241⟩
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-
- titre
- Optimal resource allocation for bacterial growth with degradation
- auteur
- Ivan Yegorov, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jul 2017, Toulouse, France. 15968 p., ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.1593⟩
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-
- titre
- Evolution engineering for enhancing photosynthetic efficiency of high density cultures of Tisochrysis lutea
- auteur
- Hubert Bonnefond, Yann Lie, Eric Pruvost, Amélie Talec, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- 6th congress of the International Society for Applied Phycology, Jun 2017, Nantes, France
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-
- titre
- Impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity: consequence for mass cultivation
- auteur
- Quentin Béchet, Martin Laviale, Nicolas Arsapin, Hubert Bonnefond, Olivier Bernard
- article
- 6th congress of the International Society for Applied Phycology (ISAP), Jun 2017, Nantes, France
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-
- titre
- Neutralising antibodies prevent PRRS viremia rebound: evidence from a data-supported model of immune response
- auteur
- Natacha Go, Suzanne Touzeau, Catherine Belloc, Andrea Doeschl-Wilson
- article
- ModAH 2017 - Modelling in Animal Health conference, INRA, Jun 2017, Nantes, France. 69 p
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-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use for durable plant resistance deployment strategies
- auteur
- Samuel Nilusmas, Mathilde Mercat, Thomas Perrot, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- EASYs 2017 - Ecology & Agriculture Summit for Young scientists, EAS., Mar 2017, Chizé, France
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-
- titre
- Modeling cell death dynamics at the receptor level
- auteur
- Luis Pereira, Mickael Meyer, Paul Hofman, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves, Jérémie Roux
- article
- CompSysBio, Advanced Lecture Course on Computational Systems Biology, Mar 2017, Aussois, France
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-
- titre
- Reduction of a complex biotechnological process model using state-variable association method-Application to the anaerobic digestion of micro-algae
- auteur
- Zeyneb Khedim, Boumediene Benyahia, Francis Mairet, Jean-Philippe Steyer, Jérôme Harmand
- article
- 2017 International Conference on Control, Automation and Diagnosis (ICCAD), IEEE, Jan 2017, Hammamet, Tunisia. pp.135-140, ⟨10.1109/CADIAG.2017.8075645⟩
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-
Other publications
- titre
- Manipuler les forces évolutives exercées par les plantes sur les virus pour améliorer la durabilité des gènes de résistance
- auteur
- Benoît Moury, Julie Quenouille-Lederer, Elsa Rousseau, Lucie Tamisier, Ghislaine Nemouchi, Marion Szadkowski, Gregory Girardot, Pauline Millot, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Frédéric Fabre, Alain Palloix
- article
- 2017, pp.63-74
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-
Patents
- titre
- Selective bioreactor for microalgae
- auteur
- Olivier Bernard, Antoine Sciandra, Francis Mairet, Hubert Bonnefond, Eric Pruvost
- article
- France, Patent n° : WO2017174907A1. 2017
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-
Poster communications
- titre
- Impact de la température sur les interactions entre la microalgue marine Micromonas et les virus qui l’infectent
- auteur
- David Demory, Laure Arsenieff, Nathalie Simon, Christophe Six, Fabienne Rigaut-Jalabert, Dominique Marie, Pei Ge, Estelle Bigeard, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Sophie Rabouille, A. C. Baudoux
- article
- VIIIe Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne,, Oct 2017, Camaret-sur-Mer, France
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-
Proceedings
- titre
- Maximizing microalgae productivity by shading outdoor cultures
- auteur
- Carlos Martínez, Olivier Bernard, Francis Mairet
- article
- 50 (1), Elsevier, pp.8734 - 8739, 2017, IFAC papers online, ⟨10.1016/j.ifacol.2017.08.1725⟩
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-
Reports
- titre
- Modélisation du portage des salmonelles dans un élevage porcin
- auteur
- Justine Guillaumont, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- [Rapport Technique] 2017-2, INRA, UR1404 Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement. 2017, pp.47
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-
Theses
- titre
- Modelling populations introduction strategies, Allee effects and stochasticity
- auteur
- Nicolas Bajeux
- article
- Autre. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2017. Français. ⟨NNT : 2017AZUR4056⟩
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-
- titre
- Modeling, analysis and reduction of biological systems
- auteur
- Stefano Casagranda
- article
- Other. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4049⟩
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-
2016
Journal articles
- titre
- Optimization of strain selection in evolutionary continuous culture
- auteur
- Terence Bayen, Francis Mairet
- article
- International Journal of Control, 2016, 90 (12), pp.2748-2759. ⟨10.1080/00207179.2016.1264631⟩
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-
- titre
- Evidence for an optimal level of connectivity for establishment and colonisation
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Camille Piponiot, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- Biology Letters, 2016, 12 (11), ⟨10.1098/rsbl.2016.0704⟩
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-
- titre
- Integrating Physiology and Architecture in Models of Fruit Expansion
- auteur
- Mikolaj Cieslak, Ibrahim Cheddadi, Frédéric Boudon, Valentina Baldazzi, Michel Génard, Christophe Godin, Nadia Bertin
- article
- Frontiers in Plant Science, 2016, 7, pp.19. ⟨10.3389/fpls.2016.01739⟩
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-
- titre
- Temporal niche differentiation of parasites sharing the same plant host: oak powdery mildew as a case study
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Anne Bisson, Marie-Laure Desprez Loustau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret
- article
- Ecosphere, 2016, 7 (11), pp.e01517. ⟨10.1002/ecs2.1517⟩
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-
- titre
- Influence of temperature on Chlorella vulgaris growth and mortality rates in a photobioreactor
- auteur
- Rui Serra-Maia, Olivier A. Bernard, Ana Gonçalves, Sakina Bensalem, Filipa Lopes
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2016, 18, pp.352 - 359. ⟨10.1016/j.algal.2016.06.016⟩
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-
- titre
- Modelling Salmonella transmission among pigs from farm to slaughterhouse: Interplay between management variability and epidemiological uncertainty
- auteur
- Jordi Ferrer Savall, Caroline Bidot, Mily Leblanc-Maridor, Catherine Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- International Journal of Food Microbiology, 2016, 229, pp.33-43. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2016.03.020⟩
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-
- titre
- Maximizing Productivity and Reducing Environmental Impacts of Full-Scale Algal Production through Optimization of Open Pond Depth and Hydraulic Retention Time
- auteur
- Quentin Béchet, Andy Shilton, Benoit Guieysse
- article
- Environmental Science and Technology, 2016, 50 (7), pp.4102 - 4110. ⟨10.1021/acs.est.5b05412⟩
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-
- titre
- Reply to the Comment on “Mathematical modeling of unicellular microalgae and cyanobacteria metabolism for biofuel production” by Baroukh et al. [Curr. Opin. Biotechnol. 2015, 33:198–205]
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Olivier A. Bernard, Jean-Philippe Steyer
- article
- Current Opinion in Biotechnology, 2016, 38, pp.200 - 202. ⟨10.1016/j.copbio.2016.02.018⟩
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-
- titre
- Dynamical allocation of cellular resources as an optimal control problem: Novel insights into microbial growth strategies
- auteur
- Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- PLoS Computational Biology, 2016, 12 (3), pp.e1004802. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004802⟩
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-
- titre
- Concomitant effects of light and temperature diel variations on the growth rate and lipid production of Dunaliella salina
- auteur
- Hubert Bonnefond, N. Moelants, Amélie Talec, Olivier Bernard, A. Sciandra
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2016, 14, pp.72-78. ⟨10.1016/j.algal.2015.12.018⟩
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-
- titre
- Sharing a resource with randomly arriving foragers
- auteur
- Pierre Bernhard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Mathematical Biosciences, 2016, 273 (91), pp.91-101. ⟨10.1016/j.mbs.2016.01.004⟩
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-
- titre
- Dynamic coupling of photoacclimation and photoinhibition in a model of microalgae growth
- auteur
- Andreas Nikolaou, Philipp Hartmann, Antoine Sciandra, Benoît Chachuat, Olivier Bernard
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2016, 390, pp.61 - 72. ⟨10.1016/j.jtbi.2015.11.004⟩
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-
- titre
- Robustness of Bioprocess Feedback Control to Biodiversity
- auteur
- Francis Mairet, Olivier A. Bernard
- article
- AIChE Journal, 2016, pp.24. ⟨10.1002/aic.15604⟩
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-
- titre
- On Dynamic Games with Randomly Arriving Players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- Dynamic Games and Applications, 2016, pp.34. ⟨10.1007/s13235-016-0197-z⟩
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-
- titre
- Periodic Oscillations for Non Monotonic Smooth Negative Feedback Circuits
- auteur
- Camille Poignard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2016, 15 (1), pp.257-286. ⟨10.1137/15M1033368⟩
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-
- titre
- The importance of being fast: comparative kinetics of vertical migration and non-photochemical quenching of benthic diatoms under light stress
- auteur
- Martin Laviale, Silja Frankenbach, João Serôdio
- article
- Marine Biology, 2016, 163 (1), ⟨10.1007/s00227-015-2793-7⟩
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-
- titre
- Hybrid Control of a Bioreactor with Quantized Measurements
- auteur
- Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- IEEE Transactions on Automatic Control, 2016, 61 (5), pp.1385 - 1390 ⟨10.1109/TAC.2015.2471735⟩
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-
- titre
- An optimisation approach for stability analysis and controller synthesis of linear hyperbolic systems
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Antoine Girard, Christophe Prieur
- article
- ESAIM: Control, Optimisation and Calculus of Variations, 2016, 22 (4), pp.1236-1263. ⟨10.1051/cocv/2016038⟩
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-
Conference papers
- titre
- Theoretical and microcosm approaches to biological invasions
- auteur
- Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- The Physics and Biology of Invasion, Dec 2016, Nice, France
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-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, T. Morel-Journel, L. Roques, Elodie Vercken
- article
- SFÉCOLOGIE 2016- Colloque de la societe francaise d'ecologie, Oct 2016, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effect of the spatial distribution of resources in experimental mini-landscapes on the fitness of two populations of Trichogramma cacoeciae
- auteur
- Victor Burte, Guy Perez, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- Sfécologie2016 - International Conference on Ecological Sciences, Oct 2016, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Metabolic modeling of C. sorokiniana diauxic heterotrophic growth
- auteur
- Caroline Baroukh, Olivier Bernard
- article
- 6. IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE), Oct 2016, Magdeburg, Germany. pp.330-335, ⟨10.1016/j.ifaco1.2016.12.148⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A multi-seasonal model of plant-nematode interactions and its use for durable plant resistance deployment strategies
- auteur
- S. Nilusmas, M. Mercat, T. Perrot, Suzanne Touzeau, Vincent Calcagno, Caroline Djian-Caporalino, Philippe Castagnone-Sereno, Ludovic Mailleret
- article
- Hortimodel 2016 - Models for plant growth, environment control and farming management in protected cultivation, Sep 2016, Avignon, France. 8 p
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Model simplification and process analysis of biological models
- auteur
- Stefano Casagranda, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- The 5th International Symposium on Positive Systems (POSTA), Sep 2016, Rome, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- Caractérisation des substances polymériques extracellulaires (EPS) de biofilms de diatomées benthiques marines
- auteur
- Steven G Daniel, Cédric Hubas, Hubert Bonnefond, Sophie Sablé, Olivier Bernard, Martin Laviale
- article
- 35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2016, Belvaux, Luxembourg
- Accès au bibtex
-
- titre
- Quantitative trait loci in pepper genome control the effective population size of two RNA viruses at inoculation
- auteur
- Lucie Tamisier, Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ghislaine Nemouchi, Marion Szadkowski, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Alain Palloix
- article
- 16. Eucarpia Capsicum and Eggplant meeting, Szent István University. Gödöllo, HUN., Sep 2016, Kecskemét, Hungary. 591 p
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, Thibaut Morel Journel, Lionel Roques, Elodie Vercken
- article
- 10. Models in Population Dynamics and Ecology (CMPDE 16), Aix Marseille Université (AMU). Marseille, FRA., Sep 2016, Marseille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Introduced populations in a stochastic world
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Vincent Calcagno
- article
- CMPDE 16 - 10. Models in Population Dynamics and Ecology, Aix Marseille Université (AMU). FRA., Sep 2016, Marseille, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, Thibaut Morel Journel, Lionel Roques, Elodie Vercken
- article
- MPDE 2016 - International Conference on Models in Population Dynamics and Ecology, Sep 2016, Marseille, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- 2D piecewise affine models approximate real continuous dynamics up to invariant sets
- auteur
- Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- NOLCOS 2016 - 10th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems, Aug 2016, Monterey, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Introduced populations in a stochastic world
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- ECMTB 2016 - European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2016, Nottingham, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Oscillations for non monotonic negative feedback genes networks
- auteur
- Camille Poignard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jul 2016, Nottingham, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
- titre
- Adding an integrator to backstepping: Output disturbances rejection for linear hyperbolic systems
- auteur
- Pierre-Olivier Lamare, Florent Di Meglio
- article
- American Control Conference, Jul 2016, Boston, United States. ⟨10.1109/ACC.2016.7525443⟩
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-
- titre
- Optimal operation of algal ponds accounting for future meteorology
- auteur
- Riccardo De-Luca, Quentin Béchet, Fabrizio Bezzo, Olivier A. Bernard
- article
- 11th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, including Biosystems, Jun 2016, Trondheim, Norway. pp.1062 - 1067, ⟨10.1016/j.ifacol.2016.07.343⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Joint estimation of effective population size and selection coefficient without neutrel markers: method validation and application to experimental evolution of viruses
- auteur
- Elsa Rousseau, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Rachid R. Senoussi, Alain Palloix, Vincent Simon, Frédéric Grognard, Sophie Valière, Frédéric Fabre
- article
- 13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. 165 p
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamic Flux Balance Analysis of the Metabolism of Microalgae under a Diurnal Light Cycle
- auteur
- Caroline Baroukh, Jean Philippe Steyer, Olvier Bernard, Benoit Chachuat
- article
- DYCOPS-CAB 2016 - 11th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems, Including Biosystems DYCOPS-CAB 2016, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Jun 2016, Trondheim, Norway. pp.791 - 796, ⟨10.1016/j.ifacol.2016.07.285⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Photoinhibistat: Operating Microalgae Culture under Photoinhibition for Strain Selection
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 11th IFAC Symposium on Dynamics and Control of Process Systems Including Biosystems DYCOPS-CAB , Jun 2016, Trondheim, Norway. ⟨10.1016/j.ifacol.2016.07.344⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Habitat quality and the velocity of spatial population expansion
- auteur
- Marjorie Haond, Ludovic Mailleret, Thibaut Morel Journel, Lionel Roques, Elodie Vercken
- article
- ETAMM 2016 - Emerging Trends in Applied Mathematics and Mechanics, Université de Perpignan Via Domitia (UPVD). FRA., May 2016, Perpignan, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Stochastic epidemiological model for the analysis of plant resistance break- down to pathogens subjected to genetic drift
- auteur
- Elsa Rousseau, Mélanie Bonneault, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- Emerging trends in applied mathematics and mechanics (ETAMM 2016), May 2016, Perpignan, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Why, when and how should exposure be considered in a model representing the within-host immune response to infection?
- auteur
- Suzanne Touzeau, Natacha Go, Caroline Bidot, Catherine Belloc
- article
- Emerging Trends in Applied Mathematics and Mechanics (ETAMM), May 2016, Perpignan, France
- Accès au bibtex
-
Lectures
- titre
- Modélisation mathématique en épidémiologie animale et végétale
- auteur
- Suzanne Touzeau
- article
- École thématique. École de recherche CIMPA-CETIC Modélisation Mathématique en Sciences du Vivant, Yaoundé, Cameroun. 2016
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-
Patents
- titre
- BIOREACTOR FOR MICROALGAE
- auteur
- Olivier Bernard, Francis Mairet, Charlotte Combe, Antoine Sciandra, Eric Pruvost
- article
- France, Patent n° : WO/2016/151219. 2016
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Genetic drift as a tool to increase the durability of plant qualitative resistance to viruses
- auteur
- Elsa Rousseau, Mélanie Bonneault, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- 13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. , 165 p., 2016, “Building bridges between disciplines for sustainable management of plant virus diseases”. IPVE 2016. Programme and abstracts
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-
Reports
- titre
- Dynamic equilibrium in games with randomly arriving players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- [Research Report] RR-8961, Université de la Côte d'Azur - INRIA. 2016, pp.38
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-
Theses
- titre
- Modelling the temperature effect on phytoplankton : from acclimation to adaptation
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud
- article
- Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. English. ⟨NNT : 2016NICE4025⟩
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-
- titre
- Effect of genetic drift and selection on plant resistance durability to viruses
- auteur
- Elsa Rousseau
- article
- Sciences agricoles. Université Nice Sophia Antipolis, 2016. Français. ⟨NNT : 2016NICE4024⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Cournot oligopoly with randomly arriving producers
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- 2016
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-
- titre
- Dynamic equilibrium in games with randomly arriving players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- 2016
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-
- titre
- Shared predation: positive effects of predator distraction
- auteur
- Mickaël Teixeira Alves, Frédéric Grognard, Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret
- article
- 2016
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-
2015
Journal articles
- titre
- Epidemiological and evolutionary management of plant resistance: optimizing the deployment of cultivar mixtures in time and space in agricultural landscapes
- auteur
- Frédéric Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- Evolutionary Applications, 2015, 8 (10), pp.919-932. ⟨10.1111/eva.12304⟩
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-
- titre
- Analysis of a periodic optimal control problem connected to microalgae anaerobic digestion
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Pierre Martinon, Matthieu Sebbah
- article
- Optimal Control Applications and Methods, 2015, 36 (6), pp.750-773. ⟨10.1002/oca.2127⟩
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-
- titre
- Instrumentation and control of anaerobic digestion processes: a review and some research challenges
- auteur
- Julie Jimenez, Eric Latrille, Jérome Harmand, Daniel Gaida, Christian Wolf, Francis Mairet, Olivier Bernard, Victor Alcaraz-Gonzalez, Hugo Mendez-Acosta, Daniel Zitomer, Dennis Totzke, Henri Spanjers, Fabian Jacobi, Alan Guwy, Richard Dinsdale, Sofiane Mazhegrane, Gonzalo Ruiz-Filippi, Aurora Seco, Thierry Ribeiro, André Pauss, Jean-Philippe Steyer
- article
- Reviews in Environmental Science and Bio/technology, 2015, 14 (4), pp.615-648. ⟨10.1007/s11157-015-9382-6⟩
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-
- titre
- The highs and lows of dispersal: how connectivity and initial population size jointly shape establishment dynamics in discrete landscapes
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Pierre Girod, Ludovic Mailleret, Alexandra Auguste, Aurélie Blin, Elodie Vercken
- article
- Oikos, 2015, 125 (6), pp.769-777. ⟨10.1111/oik.02718⟩
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-
- titre
- Recommendations for Life Cycle Assessment of algal fuels
- auteur
- Pierre Collet, Arnaud Hélias, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Applied Energy, 2015, 154, pp.1089-1102. ⟨10.1016/j.apenergy.2015.03.056⟩
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-
- titre
- Production of a methyl ester from the microalgae Nannochloropsis grown in raceways on the French west coast
- auteur
- Béatrice Perrier, Christelle Crampon, Olivier Guézet, Coralie Simon, François Maire, Olivier Lépine, Jeremy Pruvost, Paul Lozano, Olivier Bernard, Elisabeth Badens
- article
- Fuel, 2015, 153, pp.640-649. ⟨10.1016/j.fuel.2015.03.011⟩
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-
- titre
- Temporal autocorrelation in host density increases establishment success of parasitoids in an experimental system
- auteur
- Elodie Vercken, Xavier Fauvergue, Nicolas Ris, Didier Crochard, Ludovic Mailleret
- article
- Ecology and Evolution, 2015, 5 (13), pp.2684-2693. ⟨10.1002/ece3.1505⟩
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-
- titre
- Intraclonal heterogeneity in tumors and its impact on precision medicine
- auteur
- Jérémie Roux, Jean-Luc Gouzé, Paul Hofman
- article
- Médecine/Sciences, 2015, 31 (1), pp.28-31. ⟨10.1051/medsci/20153101009⟩
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-
- titre
- Analysis of an optimal control problem connected to bioprocesses involving a saturated singular arc
- auteur
- Térence Bayen, Marc Mazade, Francis Mairet
- article
- Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, 2015, 20 (1), pp.39-58. ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.39⟩
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-
- titre
- Long-term adaptive response to high-frequency light signals in the unicellular photosynthetic eukaryote Dunaliella salina
- auteur
- Charlotte Combe, Philipp Hartmann, Sophie Rabouille, Amélie Talec, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2015, 112 (6), pp.1111-1121. ⟨10.1002/bit.25526⟩
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-
- titre
- Optimal feeding strategy for the minimal time problem of a fed-batch bioreactor with mortality rate
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
- article
- Optimal Control Applications and Methods, 2015, 36 (1), pp.77-92. ⟨10.1002/oca.2102⟩
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-
- titre
- The use of fluorescent Nile red and BODIPY for lipid measurement in microalgae
- auteur
- Judith Rumin, Hubert Bonnefond, Bruno Saint-Jean, Catherine Rouxel, Antoine Sciandra, Olivier Bernard, Jean-Paul Cadoret, Gaël Bougaran
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2015, 8 (1), pp.16. ⟨10.1186/s13068-015-0220-4⟩
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-
- titre
- A state of the art of metabolic networks of unicellular microalgae and cyanobacteria for biofuel production
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Metabolic Engineering, 2015, 30, pp.49-60. ⟨10.1016/j.ymben.2015.03.019⟩
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-
- titre
- Proportional Transaction Costs in the Robust Control Approach to Option Pricing: The Uniqueness Theorem
- auteur
- Naïma El Farouq, Pierre Bernhard
- article
- Applied Mathematics and Optimization, 2015, 72 (2), pp.187-202. ⟨10.1007/s00245-014-9276-y⟩
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-
- titre
- Adaptive control of light attenuation for optimizing microalgae production
- auteur
- Francis Mairet, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2015, 30, pp.117-124. ⟨10.1016/j.jprocont.2015.03.010⟩
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-
- titre
- Design of a bistable switch to control cellular uptake
- auteur
- Diego A. Oyarzún, Madalena Chaves
- article
- Journal of the Royal Society Interface, 2015, 12 (113), pp.20150618. ⟨10.1098/rsif.2015.0618⟩
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-
- titre
- Continuous-switch piecewise quadratic models of biological networks: Application to bacterial growth
- auteur
- Alfonso Carta, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- Automatica, 2015, 61, pp.164-172. ⟨10.1016/j.automatica.2015.07.031⟩
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-
- titre
- The utilization of microcosms to test invasion biology hypotheses
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Xavier Fauvergue, Eric Lombaert, Ludovic Mailleret, Thibaut Malausa, Nicolas Ris, Elodie Vercken
- article
- Revue d'Écologie, 2015, 70, pp.16 - 27
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-
- titre
- Mathematical modeling of unicellular microalgae and cyanobacteria metabolism for biofuel production
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer
- article
- Current Opinion in Biotechnology, 2015, 33, pp.198-205. ⟨10.1016/j.copbio.2015.03.002⟩
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-
- titre
- The colorimetric assay of viability for algae (CAVA): a fast and accurate technique
- auteur
- Quentin Béchet, Ivan Feurgard, Benoit Guieysse, Filipa Lopes
- article
- Journal of Applied Phycology, 2015, 27 (6), pp.2289-2297. ⟨10.1007/s10811-014-0508-y⟩
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-
- titre
- Evolutionary Dynamics of the Handicap Principle: An Example
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Dynamic Games and Applications, 2015, 5 (2), pp.214-227. ⟨10.1007/s13235-014-0108-0⟩
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-
- titre
- Natural enemies deployment in patchy environments for augmentative biological control
- auteur
- Bapan Ghosh, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- Applied Mathematics and Computation, 2015, 266 (1), pp.982-999. ⟨10.1016/j.amc.2015.06.021⟩
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-
- titre
- Competition between phytoplankton and bacteria: exclusion and coexistence
- auteur
- Frédéric Grognard, Pierre Masci, Eric Benoît, Olivier Bernard
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2015, 70 (5), pp.959-1006. ⟨10.1007/s00285-014-0783-x⟩
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-
Conference papers
- titre
- Organic matter characterization: towards a unified methodology for biological treatments modelling
- auteur
- Julie Jimenez, Camila Espinoza Cavajal, Quentin Aemig, Sabine Houot, Jean-Philippe Steyer, Fabien Vedrenne, Dominique Patureau
- article
- 14. World Congress on Anaerobic Digestion (AD14), International Water Association (IWA). INT., Nov 2015, Viña del Mar, Chile
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-
- titre
- A new approach to unravel metabolic regulations. Application to microalgae growth and lipid production under day/night cycles and nitrogen starvation
- auteur
- Caroline Baroukh, Olivier Bernard, Jean-Philippe Steyer, Rafael Munoz Tamayo, Benoit Chachuat
- article
- BioSynSys 2015 : 1er colloque du GDR "Biologie de Synthèse et des Systèmes", Sep 2015, Paris, France
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-
- titre
- It’s all about connections: hubs and invasions in habitat networks
- auteur
- Thibaut Morel-Journel, Claire Rais Assa, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Annual Meeting of the Ecological Society of America, Aug 2015, Baltimore, United States
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-
- titre
- Control of bio-conversion of polymeric substrate in the chemostat
- auteur
- Jean-Luc Gouzé, Francis Mairet, Jacques Alexandre Sepulchre
- article
- FOSBE, Aug 2015, Boston, United States
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-
- titre
- The next generation of microalgae production systems under photovoltaic greenhouses
- auteur
- O. Bernard, Ricardo Suay Suay, Q. Bechet, Christine Poncet, Hicham Fatnassi, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Antoine Mangin, D. Coulon, R. Boubekri
- article
- GreenSys2015 - International Symposium on New Technologies and Management for Greenhouses, Jul 2015, Evora, Portugal. pp.921-928, ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1170.118⟩
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-
- titre
- Metabolic modeling of microalgae growth and lipids production during day/night cycles and nitrogen starvation
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Metabolic Pathway Analysis 2015, Jun 2015, Braga, Portugal
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-
- titre
- Towards a better understanding of the within-host dynamics to PRRSv: insights from modelling approach
- auteur
- Natacha Go, Catherine Belloc, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- International Porcine Reproductive And Respiratory Syndrome Congress, Jun 2015, Gand, Belgium
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-
- titre
- Joint estimation of effective population sizes and selection coefficients from time-sampled data: a case study on virus populations submitted to plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- 9. colloque de la Société Française de Phytopathologie, Societe Francaise de Phytopathologie (SFP). FRA., Jun 2015, Colmar, France
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-
- titre
- Contrôle hybride d'un bioréacteur avec des mesures discrètes
- auteur
- Jean-Luc Gouzé
- article
- 35ème Colloque de la Société Francophone de Biologie Théorique, Jun 2015, Poitiers, France
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-
- titre
- Model reduction and process analysis of biological models
- auteur
- Stefano Casagranda, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- 2015 23th Mediterranean Conference on Control and Automation (MED), Jun 2015, Torremolinos, Spain. ⟨10.1109/MED.2015.7158908⟩
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-
- titre
- Discrete synchronization of massively coupled systems using hierarchical couplings
- auteur
- Camille Poignard
- article
- SIAM Conference on Applications of Dynamical Systems, May 2015, Snowbird, United States
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-
- titre
- Estimation of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- Modelling biological evolution 2015: linking mathematical theories with empirical realities, Apr 2015, Leicester, United Kingdom
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-
- titre
- Towards an exploration of PRRSv vaccine efficiency in silico
- auteur
- Natacha Go, Catherine Belloc, Caroline Bidot, Suzanne Touzeau
- article
- European Symposium of Porcine Health Management, Apr 2015, Nantes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Joint estimation of effective population sizes and selection coefficients from time-sampled data: a case study on virus populations exposed to plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- 15. Rencontres de Virologie Végétale (RVV), Jan 2015, Aussois, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A simple Adaptive Dynamics model to study the effect of global warming on marine phytoplankton
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Francis Mairet, Sakina-Dorothée Ayata, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Mathematical Models in Ecology and Evolution, 2015, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling the effect of temperature on phytoplankton growth across the global ocean
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Valérie Le Guennec, Sakina-Dorothée Ayata, Francis Mairet, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- 8th Vienna International Conference on Mathematical Modelling — MATHMOD 2015, 2015, Vienna, Austria. ⟨10.1016/j.ifacol.2015.05.059⟩
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-
Book sections
- titre
- Modelling of Microalgae Culture Systems with Applications to Control and Optimization
- auteur
- Olivier Bernard, Francis Mairet, Benoît Chachuat
- article
- Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology , Microalgae Biotechnology (153), pp. 59-87, 2015, 0724-6145. ⟨10.1007/10_2014_287⟩
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-
- titre
- Linear Quadratic Zero-Sum Two-Person Differential Games
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Encyclopaedia of Systems and Control, Springer-Verlag, pp.6, 2015, ⟨10.1007/978-1-4471-5102-9_29-1⟩
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-
- titre
- Pursuit-Evasion Games and Zero-sum Two-person Differential Games
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Encyclopaedia of Systems and Control, Springer-Verlag, pp.8, 2015, ⟨10.1007/978-1-4471-5102-9_270-1⟩
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-
Other publications
- titre
- « Structures : organisation, complexité, dynamique » des mot-clés au sens inattendu
- auteur
- Thierry Viéville, Sylvie Boldo, Florent Masseglia, Pierre Bernhard
- article
- 2015
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Modeling and coupling biorhythms
- auteur
- Sofia Almeida, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé, Franck Delaunay
- article
- 2nd Labex SIGNALIFE Meeting, Nov 2015, Nice, France. , 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Joint estimation of the strength of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data : a case study on the adaptation of virus populations to host plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- SMBE Satellite meeting SMBEBA 2015 "Investigating biological adaptation with NGS: data and models", May 2015, St Martin de Londres, France. , 2015
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-
- titre
- Estimation of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid R. Senoussi, Frédéric Grognard, Benoît Moury
- article
- Modelling biological evolution 2015: linking mathematical theories with empirical realities, Apr 2015, Leicester, United Kingdom. , 2015
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-
Reports
- titre
- Modélisation de l'interaction entre gènes pour évaluer la durabilité de résistances variétale
- auteur
- Romain Tching Chi Yen
- article
- [Stage] France. Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), FRA. 2015, 27 p
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-
- titre
- Calibration of Personalized Patient Pharmacokinetic Models
- auteur
- Victor A Bernal Arzola
- article
- [Internship report] Université de Nice Sophia Antipolis. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de la production de microalgues sous serre photovoltaique
- auteur
- Philippe Moussion
- article
- [Internship report] ENSAT. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Conception et étude d’un modèle de gestion durable des variétés de plantes résistantes aux virus dans un paysage agricole
- auteur
- Mélanie Bonneault
- article
- [Stage] INSA Lyon. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de la production de biomasse de microalgues dans des bassins sous serres
- auteur
- Margaux Caïa
- article
- [Internship report] ENSAT. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Réduction de la taille des antennes photosynthétiques d'une microalgue par pression de séléction
- auteur
- Yann Lie
- article
- [Internship report] ENSAT. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de l’interaction entre gènes pour évaluer la durabilité de résistances variétales
- auteur
- Romain Tching Chi Yen
- article
- [Stage] INSA Lyon. 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de l'impact des hautes températures sur les microalgues
- auteur
- Nicolas Arsapin
- article
- [Internship report] Université du Sud Toulon Var. 2015
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-
- titre
- Évolution de la virulence chez un nématode phytoparasite : optimisation et analyse de sensibilité des stratégies de déploiement temporel de plantes résistantes
- auteur
- Mathilde Mercat
- article
- [Stage] Université de Rennes 1. 2015, pp.22
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-
- titre
- Réponse physiologique d'une cyanobactérie à la température
- auteur
- Tiphaine Lecieux
- article
- [Stage] Master d’Océanographie – Spécialité Biologie Ecologie Marine, Université Aix-Marseille. 2015
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-
Theses
- titre
- Modelling, analysis and control of biological networks
- auteur
- Ismail Belgacem
- article
- Automatic Control Engineering. Université Nice Sophia-Antipolis, 2015. English. ⟨NNT : ⟩
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Joint estimation of the strength of genetic drift and selection from next generation sequencing time-sampled data : a case study on the adaptation of virus populations to host plant resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Jérôme Coville, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Rachid Senoussi, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- 2015
- Accès au bibtex
-
- titre
- On Dynamic Games with Randomly Arriving Players
- auteur
- Pierre Bernhard, Marc Deschamps
- article
- 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2014
Journal articles
- titre
- Phytoplankton plasticity drives large variability in carbon fixation efficiency
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Marina Lévy, Olivier Aumont, Laure Resplandy, Alessandro Tagliabue, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Geophysical Research Letters, 2014, 41 (24), pp.8994-9000. ⟨10.1002/2014gl062249⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The functional response predicts the effect of resource distribution on the optimal movement rate of consumers
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Grognard, Frédéric Marie Hamelin, Eric Wajnberg, Ludovic Mailleret
- article
- Ecology Letters, 2014, 17 (12), pp.1570-1579. ⟨10.1111/ele.12379⟩
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-
- titre
- Simple signaling games of sexual selection (Grafen’s revisited)
- auteur
- Pierre Bernhard, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2014, 69 (6-7), pp.1719-1742. ⟨10.1007/s00285-013-0745-8⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Links between topology of the transition graph and limit cycles in a two-dimensional piecewise affine biological model
- auteur
- Wassim Abou-Jaoudé, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2014, 69 (6-7), pp.1461-1495. ⟨10.1007/s00285-013-0735-x⟩
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-
- titre
- La production de micro-algues sous serre photovoltaique : évolution ou révolution ?
- auteur
- Olivier Bernard
- article
- Revue de l'Energie, 2014, 621, pp.385-392
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-
- titre
- How optimal foragers should respond to habitat changes: a reanalysis of the Marginal Value Theorem
- auteur
- Vincent Calcagno, Ludovic Mailleret, Eric Wajnberg, Frédéric Grognard
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2014, 69 (5), pp.1237-1265. ⟨10.1007/s00285-013-0734-y⟩
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-
- titre
- Modelling the dynamics of carbon–nitrogen metabolism in the unicellular diazotrophic cyanobacterium Crocosphaera watsonii WH8501, under variable light regimes
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Sophie Rabouille, Anthony Dron, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Ecological Modelling, 2014, 291, pp.121--133. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.07.016⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Direct and apparent compensation in plant-herbivore interactions
- auteur
- Audrey Lebon, Ludovic Mailleret, Yves Dumont, Frédéric Grognard
- article
- Ecological Modelling, 2014, Special Issue of the 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA’12 ) — Special Issue of PMA’12, 290, pp.192-203. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.02.020⟩
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-
- titre
- Pathogen population dynamics in agricultural landscapes: The Ddal modelling framework
- auteur
- Julien Papaïx, Katarzyna Adamczyk-Chauvat, Annie Bouvier, Kiên Kiêu, Suzanne Touzeau, Christian Lannou, Hervé Monod
- article
- Infection, Genetics and Evolution, 2014, 27, pp.509-520. ⟨10.1016/j.meegid.2014.01.022⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Integrative Model of the Immune Response to a Pulmonary Macrophage Infection: What Determines the Infection Duration?
- auteur
- Natacha Go, Caroline Bidot, Catherine Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (9), pp.e107818. ⟨10.1371/journal.pone.0107818⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Can epidemic control be achieved by altering landscape connectivity in agricultural systems?
- auteur
- Julien Papaïx, Suzanne Touzeau, Hervé Monod, Christian Lannou
- article
- Ecological Modelling, 2014, 284 (284), pp.35-47. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.04.014⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Getting the most out of it: optimal experiments for parameter estimation of microalgae growth models
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Pierre Martinon, Gaël Bougaran, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2014, 24 (6), pp.991-1001. ⟨10.1016/j.jprocont.2014.04.021⟩
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-
- titre
- ISS Interval Observers for Nonlinear Systems Transformed Into Triangular Systems
- auteur
- Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2014, 24 (7), pp.1241-1261. ⟨10.1002/rnc.2937⟩
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- titre
- Optimization of the separation of two species in a chemostat
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet
- article
- Automatica, 2014, 50 (4), pp.1243-1248. ⟨10.1016/j.automatica.2014.02.024⟩
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- titre
- Interval observer with near optimal adaptation dynamics. Application to the estimation of lipid quota in microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- International Journal of Robust and Nonlinear Control, 2014, 24 (6), pp.1142-1157. ⟨10.1002/rnc.2934⟩
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-
- titre
- Allee Effects and the Evolution of Polymorphism in Cyclic Parthenogens
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Virginie Ravigné, Frédéric Marie Hamelin
- article
- The American Naturalist, 2014, 183 (3), pp.E75-E88. ⟨10.1086/674828⟩
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-
- titre
- Estimation of neutral lipid and carbohydrate quotas in microalgae using adaptive interval observers
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- Bioprocess and Biosystems Engineering, 2014, 37 (1), pp.51-61. ⟨10.1007/s00449-013-0913-7⟩
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- titre
- DRUM: A new framework for metabolic modeling under non-balanced growth. Application to the carbon metabolism of unicellular microalgae
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (8), pp.e104499. ⟨10.1371/journal.pone.0104499⟩
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- titre
- Attractor computation using interconnected Boolean networks: testing growth rate models in E. Coli
- auteur
- Madalena Chaves, Alfonso Carta
- article
- Theoretical Computer Science, 2014, pp.17. ⟨10.1016/j.tcs.2014.06.021⟩
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-
- titre
- The effect of Time Scales in Photosynthesis on microalgae Productivity
- auteur
- Philipp Hartmann, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- Bioprocess and Biosystems Engineering, 2014, 37 (1), pp.17-25. ⟨10.1007/s00449-013-1031-2⟩
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- titre
- Natural enemy-mediated indirect interactions among prey species: potential for enhancing biocontrol services in agroecosystems
- auteur
- Anaïs Chailleux, Emily K Mohl, Mickaël Teixeira Alves, Gerben J Messelink, Nicolas Desneux
- article
- Pest Management Science, 2014, 70 (12), pp.1769 - 1779. ⟨10.1002/ps.3916⟩
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-
- titre
- Optimal strategies for biomass productivity maximization in a photobioreactor using natural light
- auteur
- Frédéric Grognard, Andrei R. Akhmetzhanov, Olivier Bernard
- article
- Automatica, 2014, 50 (2), pp.359-368. ⟨10.1016/j.automatica.2013.11.014⟩
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-
- titre
- Biodiesel from microalgae – Life cycle assessment and recommendations for potential improvements
- auteur
- Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Helias, Stéphanie Bricout, Isabelle Lombaert-Valot, Béatrice Perrier, Olivier Lépine, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Renewable Energy, 2014, 71, pp.525-533. ⟨10.1016/j.renene.2014.06.009⟩
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-
Conference papers
- titre
- Parasitoid response to herbivore induced plant volatiles: a meta-analysis.
- auteur
- Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret, Xavier Fauvergue
- article
- British Ecological Society - Société Française d'Ecologie Joint Annual Meeting, Dec 2014, Lille, France
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-
- titre
- Clustered or scattered? The impact of habitat distribution on establishment dynamics
- auteur
- Thibaut Morel Journel, Maud Hautier, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- British Ecological Society - Société Française d'Ecologie Joint Annual Meeting, Dec 2014, Lille, France
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-
- titre
- Stability analysis of a reduced transcription-translation model of RNA polymerase
- auteur
- Ismail Belgacem, Edith Grac, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- Proceedings of the 53rd IEEE Conference on Decision and Control, Dec 2014, Los Angeles, CA, United States
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-
- titre
- Clustered or scattered? The impact of habitat distribution on establishment dynamics
- auteur
- Thibaut Morel Journel, Maud Hautier, Elodie Vercken, Ludovic Mailleret
- article
- Conférence du GDR InvaBio, Oct 2014, Rennes, France
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- titre
- From theory to data : temporal niche differentiation of closely related pathogens species sharing the same plant host.
- auteur
- Anne Bisson, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Marie Laure Desprez Loustau, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Les maladies infectieuses comme moteur de l’évolution : les défis à venir, Sep 2014, Roscoff, France
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-
- titre
- Hybrid mathematical formalism for analysis of biological regulatory networks
- auteur
- Madalena Chaves
- article
- IEEE International Meeting on Analysis and Applications of Nonsmooth Systems, Sep 2014, COMO, Italy
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- titre
- Feedback stabilization of predator-prey systems for impulsive biological control
- auteur
- Frédéric Grognard
- article
- 19th IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). AUT., Aug 2014, Cape Town, South Africa. 12336 p., ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.00666⟩
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-
- titre
- A Dynamical Model to study the Response of Microalgae to Pulse Amplitude Modulated Fluorometry
- auteur
- Frédéric Chazalon, Sophie Rabouille, Philipp Hartmann, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. pp.7152-7157, ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.02162⟩
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-
- titre
- Growth Rate Estimation of Algae in Raceway Ponds: A Novel Approach
- auteur
- Philipp Hartmann, David Demory, Charlotte Combe, Raouf Hamouda, Jacques Sainte-Marie, Marie-Odile Bristeau, Anne-Céline Boulanger, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer, Sophie Rabouille, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.02408⟩
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-
- titre
- Robustness of Closed-Loop Control to Biodiversity: a Didactic Example
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. pp.5321-5326, ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.02193⟩
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-
- titre
- Modelling thermal adaptation in microalgae : an adaptive dynamics point of view
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 19th IFAC World Congress, Aug 2014, Cape Town, South Africa. pp.4376-4381, ⟨10.3182/20140824-6-ZA-1003.00982⟩
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-
- titre
- Dynamic optimisation of resource allocation in microorganisms
- auteur
- Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS 2014), University of Groningen. NLD., Jul 2014, Groningen, Netherlands
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- titre
- Introduction strategies for biological control agents subject to Allee effects
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Grogningen, Netherlands. 8 p
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-
- titre
- Predictive analysis for biological regulatory systems – combining discrete and continuous formalisms
- auteur
- Madalena Chaves
- article
- Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS'14), Jul 2014, Groningen, Netherlands
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- titre
- Hybrid models for the interconnection of circadian and genetic cycles in cyanobacteria
- auteur
- Madalena Chaves, Miguel Preto
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Groningen, Netherlands. pp.4
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- titre
- A coupled transcription-translation mathematical model of RNA polymerase
- auteur
- Ismail Belgacem, Edith Grac, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé
- article
- 21st International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems, Jul 2014, Groningen, Netherlands
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-
- titre
- Modeling and control in physical, life, and social sciences: Some remarks
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- At the Boundaries of Dynamic Games, Control, and Viability, Jun 2014, St Nicolas-la-Chapelle, France. pp.29
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-
- titre
- Mathematical study of the global dynamics of a concave gene expression model
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- 22nd Mediterranean Conference of Control and Automation (MED), Jun 2014, Palermo, Italy. ⟨10.1109/MED.2014.6961562⟩
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- titre
- Optimal natural enemies deployment in patchy environments for augmentative biological control
- auteur
- Bapan Ghosh, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Goteborg, Sweden
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-
- titre
- Protection of the durability of major resistance genes to plant viruses through quantitative resistance, a modeling approach
- auteur
- Elsa Rousseau, Jérôme Coville, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- ECMTB14 - 9. European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Goteborg, Sweden
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- titre
- Modelling populations subjected to pulsed taking regimes
- auteur
- Ludovic Mailleret, Valérie Lemesle, Frédéric Marie Hamelin, Vincent Calcagno, Frédéric Grognard
- article
- 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Goteborg, Sweden
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-
- titre
- Modelling the infection and immune dynamics induced by a pathogen targeting pulmonary macrophages : influence of strain virulence and host exposure
- auteur
- Natacha Go, Caroline Bidot, Catherine Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Jun 2014, Göteborg, Sweden. 16p
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-
- titre
- Minimal time problem for a fed-batch bioreactor with a non admissible singular arc
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
- article
- European Control Conference (ECC), Université de Strasbourg (Unistra). Strasbourg, FRA. IEEE Control Systems Society., Jun 2014, Strasbourg, France. pp.165-170, ⟨10.1109/ECC.2014.6862444⟩
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- titre
- Les stratégies d'introduction d'agents de lutte biologique soumis aux effets Allee
- auteur
- Nicolas Bajeux, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- 34ème Séminaire de la Société Francophone de Biologie Théorique, Société Francophone de Biologie Théorique, May 2014, Saint Flour, France
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- titre
- Avancés et défis en imagerie médicale ultrasonore basée sur l'échantillonnage compressé (Congrès Français d'Acoustique 2014)
- auteur
- Adrian Basarab, Denis Kouamé, Olivier Bernard, Denis Friboulet, Hervé Liebgott
- article
- 12ème Congrès Français d'Acoustique (CFA 2014), Apr 2014, Poitiers, France
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-
- titre
- Protecting the durability of major resistance genes to plant viruses with quantitative resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Vincent Simon, Sophie Valière, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Conférence Jacques Monod, Apr 2014, Roscoff, France
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- titre
- Intégration et changement d’échelle : quels enjeux en santé animale ?
- auteur
- Pauline Ezanno, Elisabeta Vergu, François Beaudeau, Suzanne Touzeau, Catherine C. Belloc
- article
- Colloque "Nouveaux défis de Modélisation pour l'Agro-écologie", Feb 2014, Paris, France
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-
- titre
- Caractérisation des réponses des parasitoïdes aux défenses induites des plantes
- auteur
- Louise van Oudenhove, Ludovic Mailleret, Xavier Fauvergue
- article
- Entomophagistes, Université Catholique de Louvain (UCLouvain). BEL. Earth and Life Institute., 2014, Louvain-la-Neuve, Belgique
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- titre
- Trichogrammas surf on pushed waves: effect of propagule pressure and connectivity of the introduction site on the invasion of an experimental discrete landscape
- auteur
- Thibaut Morel Journel, Pierre Girod, Ludovic Mailleret, Elodie Vercken
- article
- Entomophagistes, 2014, Louvain-la-Neuve, Belgium
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- titre
- Technological and Ecological Approaches to Design and Manage Sustainable Greenhouse Production Systems
- auteur
- Christine Poncet, Pia Parolin, Hicham Fatnassi, Ludovic Mailleret, Alexandre Bout, Jeannine Pizzol, Roger Boll, Bresch Cécile
- article
- 29th International Horticultural Congress, 2014, Brisbane, Australia. ⟨10.17660/ActaHortic.2015.1107.5⟩
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-
- titre
- Mon Océan et Moi" - an outreach concept particularly dedicated to the youth
- auteur
- Carolyn Scheurle, Hervé Claustre, Julia Uitz, Antoine Sciandra
- article
- Ocean Sciences Meeting, 2014, Honolulu, Hawaii, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Allee effects and the evolution of polymorphism in cyclical parthenogens.
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Virginie Ravigné
- article
- NIMBioS workshop on vectored plant viruses, 2014, Knoxville, United States
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Control of a Bioreactor with Quantized Measurements
- auteur
- Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé
- article
- Fages, François and Piazza, Carla. Formal Methods in Macro-Biology, 8738, Springer International Publishing, pp.47-62, 2014, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-319-10398-3. ⟨10.1007/978-3-319-10398-3_5⟩
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-
- titre
- Towards Real-Time Control of Gene Expression at the Single Cell Level: A Stochastic Control Approach
- auteur
- Lakshmeesh Maruthi, Ilya Tkachev, Alfonso Carta, Eugenio Cinquemani, Pascal Hersen, Gregory Batt, Alessandro Abate
- article
- Computational Methods in Systems Biology, 8859, Springer International Publishing, pp.155-172, 2014, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-319-12981-5. ⟨10.1007/978-3-319-12982-2_12⟩
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-
- titre
- Life-cycle assessment of microalgal based biofuels
- auteur
- Pierre Collet, Daniele Spinelli, Laurent Lardon, Arnaud Helias, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Biofuels from algae, Elsevier, 2014, 978-0-444-59558-4
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-
Master thesis
- titre
- Modélisation de l’effet de la température sur la croissance du phytoplancton à l’échelle de l’océan mondial
- auteur
- Valérie Le Guennec
- article
- Automatique. 2014
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolution de la virulence chez un nématode phytoparasite: modélisation et optimisation du déploiement des plantes résistantes.
- auteur
- Thomas Perrot
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. 2014
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Protecting the durability of major resistance genes to plant viruses with quantitative resistance
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Alain Palloix, Vincent Simon, Sophie Valière, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Conférences Jacques Monod : “From emerging to pandemic viruses: interplay between host ecology and viral evolution”, Apr 2014, Roscoff, France. , 2014
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-
Reports
- titre
- Évaluation du gisement potentiel de ressources algales pour l’énergie et la chimie en France à horizon 2030
- auteur
- Guillaume Kerlero de Rosbo, Olivier Bernard
- article
- [Rapport Technique] ADEME. 2014, pp.164
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-
Theses
- titre
- Modelling, analysis and control for systems biology : application to bacterial growth models
- auteur
- Alfonso Carta
- article
- Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. English. ⟨NNT : 2014NICE4024⟩
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-
- titre
- Effect of hydrodynamics on light utilization in large scale cultures of microalgae
- auteur
- Philipp Hartmann
- article
- Other. Université Nice Sophia Antipolis, 2014. English. ⟨NNT : 2014NICE4022⟩
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-
2013
Journal articles
- titre
- A 2D model for hydrodynamics and biology coupling applied to algae growth simulations
- auteur
- Olivier Bernard, Anne-Céline Boulanger, Marie-Odile Bristeau, Jacques Sainte-Marie
- article
- ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2013, 47 (5), pp.1387-1412. ⟨10.1051/m2an/2013072⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Phytoplankton growth formulation in marine ecosystem models: should we take into account photo-acclimation and variable stoichiometry in oligotrophic areas?
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Marina Lévy, Olivier Aumont, Antoine Sciandra, Jacques Sainte-Marie, Alessandro Tagliabue, Olivier Bernard
- article
- Journal of Marine Systems, 2013, 125, pp.29-40. ⟨10.1016/j.jmarsys.2012.12.010⟩
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-
- titre
- A model of network neutrality with usage-based prices
- auteur
- Eitan Altman, Pierre Bernhard, Stephane Caron, George Kesidis, Julio Rojas-Mora, Sulan Wong
- article
- Telecommunication Systems, 2013, 52 (2), pp.601-609. ⟨10.1007/s11235-011-9504-6⟩
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-
- titre
- Optimizing microalgal production in raceway systems
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- Biotechnology Progress, 2013, 29 (2), pp.543--552. ⟨10.1002/btpr.1699⟩
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-
- titre
- Global stability of enzymatic chain of full reversible Michaelis-Menten reactions
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- Acta Biotheoretica, 2013, 61 (3), pp.425-436. ⟨10.1007/s10441-013-9195-3⟩
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-
- titre
- Time-lag in extinction dynamics in experimental populations: evidence for a genetic Allee effect
- auteur
- Elodie Vercken, Flora Vincent, Ludovic Mailleret, Nicolas Ris, Elizabeth Tabone, Xavier Fauvergue
- article
- Journal of Animal Ecology, 2013, 82 (3), pp.621-631. ⟨10.1111/1365-2656.12051⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Probabilistic approach for predicting periodic orbits in piecewise affine differential models
- auteur
- Madalena Chaves, Etienne Farcot, Jean-Luc Gouzé
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2013, 75 (6), pp.967-987. ⟨10.1007/s11538-012-9773-6⟩
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-
- titre
- Optimal synthesis for the minimum time control problems of fed-batch bioprocesses for growth functions with two maxima
- auteur
- Térence Bayen, Pedro Gajardo, Francis Mairet
- article
- Journal of Optimization Theory and Applications, 2013, 158 (2), pp.521-553. ⟨10.1007/s10957-012-0225-0⟩
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-
- titre
- Interconnection of asynchronous Boolean networks, asymptotic and transient dynamics
- auteur
- Laurent Tournier, Madalena Chaves
- article
- Automatica, 2013, 49 (4), pp.884-893. ⟨10.1016/j.automatica.2013.01.015⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stabilizing effect of cannibalism in a two stages population model
- auteur
- Jonathan Rault, Eric Benoît, Jean-Luc Gouzé
- article
- Acta Biotheoretica, 2013, 61, pp.119-139. ⟨10.1007/s10441-013-9172-x⟩
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-
- titre
- Effect of gaseous cement industry effluents on four species of microalgae
- auteur
- Amélie Talec, Myrvline Philistin, Frédérique Ferey, Günther Walenta, Jean-Olivier Irisson, Olivier Bernard, Antoine Sciandra
- article
- Bioresource Technology, 2013, 143, pp.353 - 359. ⟨10.1016/j.biortech.2013.05.104⟩
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-
- titre
- Hydrodynamics-Biology Coupling for Algae Culture and Biofuel Production
- auteur
- Olivier Bernard, Jacques Sainte-Marie, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer
- article
- ERCIM News, 2013, 92, pp.47
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Un zeste de mathématiques pour les biocarburants de demain
- auteur
- Olivier Bernard, Jacques Sainte-Marie, Bruno Sialve
- article
- Mathématiques de la Planète Terre, un jour une brève, 2013
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-
- titre
- Hierarchy of models: From qualitative to quantitative analysis of circadian rhythms in cyanobacteria
- auteur
- Madalena Chaves, Miguel Preto
- article
- Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, 2013, 23 (2), pp.025113. ⟨10.1063/1.4810922⟩
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-
- titre
- Screening and selection of growth-promoting bacteria for ıt Dunaliella cultures
- auteur
- Myriam Le Chevanton, Matthieu Garnier, Gaël Bougaran, Nathalie Schreiber, Ewa Lukomska, Jean-Baptiste Bérard, Eric Fouilland, Olivier Bernard, Jean-Paul Cadoret
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2013, 2, pp.212--222. ⟨10.1016/j.algal.2013.05.003⟩
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-
- titre
- Reducing the Anaerobic Digestion Model No. 1 for its application to an industrial wastewater treatment plant treating winery effluent wastewater
- auteur
- Carlos García-Diéguez, Olivier Bernard, Enrique Roca
- article
- Bioresource Technology, 2013, 132, pp.244 - 253. ⟨10.1016/j.biortech.2012.12.166⟩
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-
- titre
- Temperature effect on microalgae: a crucial factor for outdoor production
- auteur
- Monique Ras, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Reviews in Environmental Science and Bio/technology, 2013, 12 (2), pp.153-164. ⟨10.1007/s11157-013-9310-6⟩
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-
Conference papers
- titre
- Modelling light-dark regime influence on the carbon-nitrogen metabolism in a unicellular diazotrophic cyanobacterium
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud, Anthony Dron, Sophie Rabouille, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- CAB, Dec 2013, Mumbai, India. ⟨10.3182/20131216-3-IN-2044.00025⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Design of Optimal Experiments for Parameter Estimation of Microalgae Growth Models
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Pierre Martinon, Gaël Bougaran, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- International Symposium on Computer Applications to Biotechnology (CAB 2013), Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A new framework for metabolic modeling under non-balanced growth. Application to carbon metabolism of unicellular microalgae
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- CAB 2013 - International on Computer Applications to Biotechnology, Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stability analysis and reduction of gene transcription models
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- 52nd IEEE Conference on Decision and Control (CDC'13), Dec 2013, Florence, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- A linear reformulation of Boolean optimization problems and its application to the problem of estimating the structure of gene regulation networks
- auteur
- Christian Breindl, Madalena Chaves, Frank Allgöwer
- article
- 52nd IEEE Conference on Decision and Control (CDC'13), Dec 2013, Florence, Italy
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analysis and reduction of transcription translation coupled models for gene expression
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- CAB (Computer applied to Biotechnology), IFAC, Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au bibtex
-
- titre
- Adaptive control for optimizing microalgae production
- auteur
- Francis Mairet, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard
- article
- Computer Application in Biotechnology (CAB2013), Dec 2013, Mumbai, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identification of key immune mechanisms for the resolution of PRRSv infection by a modelling approach
- auteur
- Natacha Go, Caroline C. Bidot, Catherine C. Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 4. International Conference on Infectious Disease Dynamics (Epidemics), Nov 2013, Amsterdam, Netherlands
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-
- titre
- A closed-loop controller for optimizing nitrogen removal in a microalgal outdoor pond
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- 11. IWA Conference on Instrumentation Control and Automation, Sep 2013, Narbonne, France
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-
- titre
- A new framework for metabolic modelling under non-balanced growth. Application to photoautotrophic microalgae in day/night cycle.
- auteur
- Caroline Baroukh, Rafael Munoz Tamayo, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Metabolic Pathway Analysis 2013, Sep 2013, Oxford, United Kingdom
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-
- titre
- Fed-batch bioreactor with mortality rate
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Marc Mazade
- article
- 9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2013, Toulouse, France. pp.158-163, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00024⟩
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-
- titre
- A class of Switched Piecewise Quadratic Systems for coupling gene expression with growth rate in bacteria
- auteur
- Alfonso Carta, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- 9th IFAC Symposium Nonlinear Control Systems (NOLCOS'13), Sep 2013, Toulouse, France. pp.271-276, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00140⟩
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-
- titre
- Driving Species Competition in a Light-limited Chemostat
- auteur
- Francis Mairet, Rafael Munoz Tamayo, Olivier Bernard
- article
- 9th IFAC Symposium on Nonlinear Control Systems (NOLCOS), Sep 2013, Toulouse, France
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-
- titre
- Effect of temperature fluctuations on microalgae growth and content: a review
- auteur
- M. Ras, Jean-Philippe Steyer, O. Bernard
- article
- 10. International Phycological Congress, Aug 2013, Orlando, Floride, United States
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-
- titre
- A dynamic Model coupling Photoacclimation and Photoinhibition in Microalgae
- auteur
- Philipp Hartmann, Andrea Nikolaou, Benoît Chachuat, Olivier Bernard
- article
- European Control Conference (ECC13), Jul 2013, Zurich, Switzerland
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-
- titre
- Driving microalgal production in raceway systems to near optimal productivities.
- auteur
- Rafael Munoz Tamayo, Francis Mairet, Olivier Bernard
- article
- European Control Conference (ECC13), Jul 2013, Zurich, Switzerland
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-
- titre
- State estimation for gene networks with intrinsic and extrinsic noise: a case study on E.coli arabinose uptake dynamics
- auteur
- Alfonso Carta, Eugenio Cinquemani
- article
- ECC13 - European Control Conference - 2013, Jul 2013, Zurich, Switzerland
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-
- titre
- Sustainable plant resistance management in agricultural landscapes
- auteur
- Frederic Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- 12. IPVE Symposium, International Institute of Tropical Agriculture, CGIAR (IITA). Ibadan, NGA.; International Society for Plant Pathology (ISPP). International Committee for Plant Virus Epidemiology, St Paul, INT., Jan 2013, Arusha, Tanzania. 256 p
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sustainable plant resistance management in agricultural landscapes
- auteur
- Elsa Rousseau, Benoît Moury, Frederic Fabre, Ludovic Mailleret
- article
- 14. Rencontres de Virologie Végétale (RVV2013), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie du Fruit et Pathologie (1332)., Jan 2013, Aussois, France
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-
- titre
- Parasites also have sex: consequences on host-parasite population dynamics.
- auteur
- Virginie Ravigné, Valérie Lemesle, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- AARMS Mathematical Biology Workshop, 2013, St John's, Canada
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-
- titre
- Allee effects and the evolution of polymorphism in cyclical parthenogens.
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Didier Andrivon, Virginie Ravigné, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Conférences Jacques Monod: Avancées récentes sur l'évolution du sexe et des systèmes génétiques, 2013, Roscoff, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Positive control for global stabilization of predator-prey systems
- auteur
- Frédéric Grognard, Jonathan Rault, Jean-Luc Gouzé
- article
- 9th IFAC Symposium Nonlinear Control Systems (NOLCOS'13), 2013, Toulouse, France. pp.265-270, ⟨10.3182/20130904-3-FR-2041.00136⟩
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-
- titre
- Quantitative comparison of one-step and two-step models of gene expression
- auteur
- Valentin Zulkower, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong
- article
- Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM'13), 2013, Toulouse, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Parasites also have sex: consequences on host-parasite population dynamics.
- auteur
- Virginie Ravigné, Valérie Lemesle, Ludovic Mailleret, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Computational and Mathematical Population Dynamics (CMPD4), 2013, Taiyuan, China
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-
- titre
- Biological and integrated pest control in floriculture.
- auteur
- Christine Poncet, Alexandre Bout, Pia Parolin, Cécile Bresch, Hicham Fatnassi, Ludovic Mailleret
- article
- SUMFLOWER "Sustainable Management of Floriculture", 2013, Vintimiglia, Italy
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-
Book sections
- titre
- Join forces or cheat: evolutionary analysis of a consumer-resource system
- auteur
- Andrei R. Akhmetzhanov, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Pierre Bernhard
- article
- Pierre Cardaliaguet and Ross Cressman. Advances in Dynamic Games, Springer, pp.73-95, 2013, Annals of the International Society of Dynamic Games; v. 12, ⟨10.1007/978-0-8176-8355-9_4⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Le rêve porté par les microalgues
- auteur
- Claude Gudin, Olivier Bernard
- article
- Claude Gudin. La culture de l'invisible - le rêve porté par les microalgues, Ovadia, pp.109, 2013, 2363920325 9782363920324
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling and analysis of gene regulatory networks
- auteur
- Gilles Bernot, Jean-Paul Comet, Adrien Richard, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé, Frédéric Dayan
- article
- Cazals, Frédéric and Kornprobst, Pierre. Modeling in Computational Biology and Biomedicine, Springer, pp.47-80, 2013, 9783642312083 364231208X. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3_2⟩
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-
- titre
- Modélisation et Ingénierie de la Photosynthèse
- auteur
- Jean-François Cornet, Olivier Bernard
- article
- Mosseri, Rémy and Jeandel, Catherine. L'énergie à découvert, 1, CNRS Eds, pp.160-161, 2013, 978-2-271-07678-6 9782271076786
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Predictive analysis of dynamical systems: combining discrete and continuous formalisms
- auteur
- Madalena Chaves
- article
- Dynamical Systems [math.DS]. Université Nice Sophia Antipolis, 2013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Master thesis
- titre
- Étude théorique et expérimentale de l'effet de l'hydrodynamique sur la photosynthèse du phytoplancton par un dispositif novateur à base de LED
- auteur
- David Demory
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. 2013
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de la réponse du photosystème II à un flash de lumière dans un PAM et estimation des paramètres physiologiques
- auteur
- Frédéric Chazalon
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. 2013
- Accès au bibtex
-
- titre
- Influence de la densité dépendance dans les modèles impulsionnels de dynamique de populations
- auteur
- Nicolas Bajeux
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2013
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-
- titre
- Genetic regulatory networks. A discretization approach.
- auteur
- Florin Todoran
- article
- 2013
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-
Patents
- titre
- Procédé et installation de production de micro-algues
- auteur
- Olivier Bernard, Antoine Sciandra, Eric Pruvost, Filipa Lopes
- article
- France, N° de brevet: 13 56955. 2013
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-
Poster communications
- titre
- Exploration of the macrophage – virus interactions during a PRRSV infection by a modelling approach
- auteur
- Natacha Go, Caroline C. Bidot, Catherine C. Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 64th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. , 2013
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-
- titre
- Impact of quantitative plant resistance on within-host viral demo-genetic dynamics
- auteur
- Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ludovic Mailleret, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- 5. journées des doctorants SPE, Jun 2013, Montpellier, France. pp.1, 2013
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-
- titre
- Impact of quantitative plant resistance on within-host viral demo-genetic dynamics
- auteur
- Elsa Rousseau, Sebastien Barraillé, Ludovic Mailleret, Frédéric Fabre, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Bridging theoretical and experimental evolution, Jun 2013, La Fouly, Switzerland. pp.1, 2013
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-
- titre
- Exploration of the immune response to the Porcine Respiratory and Reproductive Syndrome Virus PRRSV by a modelling approach: conditions for viral clearance
- auteur
- Natacha Go, Caroline C. Bidot, Catherine C. Belloc, Suzanne Touzeau
- article
- 5. European Symposium of Porcine Health Management (ESPHM), May 2013, Edinburgh, United Kingdom. , 2013
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-
Reports
- titre
- Study of a controlled Kolmogorov periodic equation connected to the optimization of periodic bioprocess
- auteur
- Térence Bayen, Francis Mairet, Matthieu Sebbah
- article
- [Research Report] INRIA Sophia Antipolis. 2013
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-
Theses
- titre
- Indirect interactions between prey : modeling and influence of the behavior of a common predator
- auteur
- Mickael Teixeira Alves
- article
- Autre [cs.OH]. Université Nice Sophia Antipolis, 2013. Français. ⟨NNT : 2013NICE4024⟩
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-
2012
Journal articles
- titre
- Exponentially Stable Interval Observers for Linear Systems with Delay.
- auteur
- Frédéric Mazenc, Silviu-Iulian Niculescu, Olivier Bernard
- article
- SIAM Journal on Control and Optimization, 2012, 50 (1), pp.286-305. ⟨10.1137/100812124⟩
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-
- titre
- Cell cycle implication on nitrogen acquisition and synchronization in ıt Thalassiosira weissflogii (Bacillariophyta)
- auteur
- Christophe Mocquet, Antoine Sciandra, Amélie Talec, Olivier Bernard
- article
- Journal of Phycology, 2012, 49 (2), pp.371-380. ⟨10.1111/jpy.12045⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Influence of CO2 and nitrogen limitation on the coccolith volume of Emiliania huxleyi (Haptophyta)
- auteur
- Marius N. Müller, Luc L Beaufort, Olivier Bernard, Maria-Luiza Pedrotti, Amélie Talec, Antoine Sciandra
- article
- Biogeosciences, 2012, 9 (4), pp.4155--4167. ⟨10.5194/bg-9-4155-2012⟩
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-
- titre
- Neutral lipids and carbohydrates productivities as a response to the nitrogen status in the Haptophyceae Isochrysis sp. (T-iso): starvation vs. limitation
- auteur
- Thomas Lacour, Antoine Sciandra, Amélie Talec, Patrick Mayzaud, Olivier Bernard
- article
- Journal of Phycology, 2012, 48 (3), pp.647-656. ⟨10.1111/j.1529-8817.2012.01154.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Durable strategies to deploy plant resistance in agricultural landscapes
- auteur
- Frédéric Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- New Phytologist, 2012, 193 (4), pp.1064-1075. ⟨10.1111/j.1469-8137.2011.04019.x⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Three-reaction model for the anaerobic digestion of microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Elliot Cameron, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Benoît Chachuat
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2012, 109 (2), pp.415-425. ⟨10.1002/bit.23350⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Global stability of reversible enzymatic metabolic chains
- auteur
- Ibrahima Ndiaye, Jean-Luc Gouzé
- article
- Acta Biotheoretica, 2012, 61 (1), pp.41-57. ⟨10.1007/s10441-013-9171-y⟩
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-
- titre
- Global stability for a model of competition in the chemostat with microbial inputs
- auteur
- Gonzalo Robledo, Frédéric Grognard, Jean-Luc Gouzé
- article
- Nonlinear Analysis: Real World Applications, 2012, 13 (2), pp.582-598. ⟨10.1016/j.nonrwa.2011.07.049⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Validation of a simple model accounting for light and temperature effect on microalgal growth
- auteur
- Olivier Bernard, Barbara Rémond
- article
- Bioresource Technology, 2012, 123, pp.520-527. ⟨10.1016/j.biortech.2012.07.022⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Diel variations of carbohydrates and neutral lipids in N-sufficient and N-limited cyclostat cultures of Isochrysis sp.
- auteur
- Thomas Lacour, Antoine Sciandra, Amélie Talec, Patrick Mayzaud, Olivier Bernard
- article
- Journal of Phycology, 2012, 48 (4), pp.966-975. ⟨10.1111/j.1529-8817.2012.01177.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Multistability and oscillations in genetic control of metabolism
- auteur
- Diego A. Oyarzún, Madalena Chaves, Marit Hoff-Hoffmeyer-Zlotnik
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2012, 295, pp.139-153. ⟨10.1016/j.jtbi.2011.11.017⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Durabilité des stratégies de gestion de plantes résistantes aux virus dans un paysage agricole
- auteur
- Elsa Rousseau, Frédéric Fabre, Ludovic Mailleret, Benoît Moury, Frédéric Grognard
- article
- Workshop Modélisation et Régulation des Pollutions, Université Montesquieu (Bordeaux 4). FRA.; Université Montpellier 1 (UM1). FRA.; Université de La Rochelle (ULR). FRA., Dec 2012, La Rochelle, France. pp.35
- Accès au bibtex
-
- titre
- Sustainable plant resistance management in agricultural landscapes
- auteur
- Frederic Fabre, Elsa Rousseau, Ludovic Mailleret, Benoît Moury
- article
- Plant resistance sustainability 2012 international conference, Oct 2012, La Colle-Sur-Loup, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robust estimation for a hybrid model of genetic network
- auteur
- Xiao-Dong Li, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control and Automation, Jul 2012, Barcelona, Spain. pp.145-150
- Accès au bibtex
-
- titre
- Construction of ISS Interval Observers for Triangular Systems
- auteur
- Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
- article
- 51th IEEE Conference on Decision and Control, 2012, Maui, Hawaii, United States. pp.6780-6785
- Accès au bibtex
-
- titre
- Habitat quality and optimal foraging: the Marginal Value Theorem revisited
- auteur
- Vincent Calcagno, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret, Eric Wajnberg
- article
- First Joint Congress on Evolutionary Biology (Evolution 2012), 2012, Ottawa, Canada
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling plant compensatory effects in plant-insect dynamics
- auteur
- Audrey Lebon, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard, Yves Dumont
- article
- 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, (PMA 2012), Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE). USA., 2012, Shanghai, China. pp.212-219, ⟨10.1109/PMA.2012.6524836⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stabilization of an oscillating n-dimensional structured population model
- auteur
- Jonathan Rault, Jean-Luc Gouzé
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control & Automation (MED), 2012, Barcelona, Spain. pp.372-377, ⟨10.1109/MED.2012.6265666⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- ODIN: supervision avancée de procédés de production de bioénergie
- auteur
- Olivier Bernard, Mélaine Gautier
- article
- Journée de la métrologie et de la mesure (J2M), 2012, Le Croisic, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Interaction between Time Scales in Microalgae Based Processes
- auteur
- Philipp Hartmann, Quentin Béchet, Olivier Bernard
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control & Automation (MED), 2012, Barcelona, Spain. pp.561--566, ⟨10.1109/MED.2012.6265697⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Growth and neutral lipid production of Dunaliella salina, in light/dark cycles and periodic temperature variations
- auteur
- Hubert Bonnefond
- article
- Young Algaeneers Symposium, 2012, Wageningen, Netherlands
- Accès au bibtex
-
- titre
- The Ecological Approach of Greenhouse Agro-Ecosystem: Practical Interest for IPM.
- auteur
- Christine Poncet, Ludovic Mailleret, Nicolas Desneux, Marie-Madeleine Müller, Alexandre Bout, Richard Brun, Jeannine Pizzol, Roger Boll, Cécile Bresch, Pia Parolin, Hicham Fatnassi
- article
- Acta Horticulturae, Proceedings of the XXVIII International Horticultural Congress, 2012, Lisbon, Portugal. pp.173-185
- Accès au bibtex
-
- titre
- Global stability of full open reversible Michaelis-Menten reactions
- auteur
- Ismail Belgacem
- article
- 32ème Séminaire de la Société Francophone de Biologie Théorique, 2012, Saint-Flour, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Adaptative interval observer with application to the estimation of biofuel production by microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- 20th Mediterranean Conference on Control Automation (MED), 2012, Barcelona, Spain. pp.567-572, ⟨10.1109/MED.2012.6265698⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- ODIN: plateforme de supervision de bioreacteur
- auteur
- Olivier Bernard, Mélaine Gautier
- article
- Bioenergiesud, 2012, Nîmes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Structure estimation for unate Boolean models of gene regulation networks
- auteur
- Christian Breindl, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé, Frank Allgöwer
- article
- Proc. 16th IFAC Symposium on System Identification, 2012, Brussels, Belgium. pp.1725-1730, ⟨10.3182/20120711-3-BE-2027.00278⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bloom triggering in the Southern Ocean : Sensitivity to biological parameters
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Joan Llort, Alessandro Tagliabue, Marina Lévy
- article
- Workshop TANGGO, 2012, Grenoble, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Population dynamics of thrips and development of an integrated pest management program using the predator ıt Franklinothrips vespiformis
- auteur
- Jeannine Pizzol, Doumar Nammour, Pierre Hervouet, Pascal Maignet, Christine Poncet, Ludovic Mailleret, Nicolas Desneux
- article
- Acta Horticulturae, Proceedings of the XXVIII International Horticultural Congress, 2012, Lisbon, Portugal. pp.173-185
- Accès au bibtex
-
- titre
- French initiatives with a mediterranean-wide perspective for education and outreach
- auteur
- Antoine Sciandra, Hervé Claustre, Carolyn Scheurle, E Raulet
- article
- ASLO Aquatic Sciences Meeting, 2012, Salt Lake City, Utah, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de la croissance du phytoplancton et de la production primaire dans les océans
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Marina Lévy, Olivier Aumont, Olivier Bernard
- article
- Journée de l'IMREDD, 2012, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- A new modelling framework: application to microalgae growth
- auteur
- Caroline Baroukh
- article
- Young Algaeneers Symposium, 2012, Wageningen, Netherlands
- Accès au bibtex
-
- titre
- On the evolutionary ecology of cyclically asexual plant parasites
- auteur
- Magda Castel, Ludovic Mailleret, Virginie Ravigné, Frédéric Marie Hamelin
- article
- Models in Population Dynamics and Ecology (MPDE12), 2012, Santa Maria, Brazil
- Accès au bibtex
-
- titre
- Option pricing in a tychastic market model
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Around Viability Boundaries, 2012, Paris, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Global Stability of Full Open Reversible Michaelis-Menten Reactions
- auteur
- Ismail Belgacem, Jean-Luc Gouzé
- article
- 8th IFAC Symposium Advanced Control of Chemical Processes (ADCHEM), 2012, Furama Riverfront, Singapore. pp.591--596, ⟨10.3182/20120710-4-SG-2026.00039⟩
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- A simple model to control growth rate of synthetic E. coli during the exponential phase: model analysis and parameter estimation
- auteur
- Alfonso Carta, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- David Gilbert and Monika Heiner. Computational Methods in Systems Biology, 7605, Springer, pp.107-126, 2012, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-642-33636-2_8⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Master thesis
- titre
- Création d'outils de simulation pour la vulgarisation scientifique
- auteur
- Aurélie Schmitt
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analysis of cell machinery models in E.coli
- auteur
- Luis Casaccia
- article
- Engineering Sciences [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de l'évolution de maladies virales chez les plantes dans un paysage agricole
- auteur
- Perside Gbehounou
- article
- Engineering Sciences [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lutte biologique inondative et effet Allee chez les prédateurs
- auteur
- Nicolas Bajeux
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation de l'influence de la photopériode sur la dynamique du métabolisme du carbone et de l'azote chez une cyanobactérie diazotrophe, Crocosphaera watsonii WH8501
- auteur
- Ghjuvan Micaelu Grimaud
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Etude expérimentale de la réponse adaptative de Dunaliella salina (Chlorophyta) à des signaux lumineux haute fréquence
- auteur
- Charlotte Combe
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2012
- Accès au bibtex
-
Books
- titre
- The Interval Market Model in Mathematical Finance: Game Theoretic Methods
- auteur
- Pierre Bernhard, Jacob Engwerda, Berend Roorda, Hans Schumacher, Vassili Kolokoltsov, Jean-Pierre Aubin, Patrick Saint-Pierre
- article
- Birkhaüser, pp.XVI-346, 2012, Static & Dynamic Game Theory: Foundations & Applications, ⟨10.1007/978-0-8176-8388-7⟩
- Accès au bibtex
-
Reports
- titre
- Competition between phytoplankton and bacteria: exclusion and coexistence
- auteur
- Pierre Masci, Frédéric Grognard, Eric Benoît, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-8038, INRIA. 2012, pp.47
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Periodic optimal control for biomass productivity maximization in a photobioreactor using natural light
- auteur
- Frédéric Grognard, Andrei R. Akhmetzhanov, Olivier Bernard
- article
- [Research Report] RR-7929, INRIA. 2012, pp.28
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GEMCO Deliverable D2T1: Analysis and reduction of a model of the gene expression machinery in E.coli
- auteur
- Luis Casaccia, Wassim Abou-Jaoudé, Jean-Luc Gouzé
- article
- [Research Report] 2012
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Size structured mathematical models of zooplankton
- auteur
- Jonathan Rault
- article
- Mathématiques générales [math.GM]. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2011
Journal articles
- titre
- Synthèse des observateurs pour une classe de systèmes de dimension infinie
- auteur
- Xiao-Dong Li, Cheng-Zhong Xu
- article
- Journal Européen des Systèmes Automatisés, 2011, 45 (Nouvelles tendances en automatique), pp.363-383
- Accès au bibtex
-
- titre
- Infinite-dimensional Luenberger-like observers for a rotating body-beam system
- auteur
- Xiao-Dong Li, Cheng-Zhong Xu
- article
- Systems and Control Letters, 2011, 60 (2), pp.138-145. ⟨10.1016/j.sysconle.2010.11.005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Interval observers for linear time-invariant systems with disturbances
- auteur
- Frédéric Mazenc, Olivier Bernard
- article
- Automatica, 2011, 47 (1), pp.140-147. ⟨10.1016/j.automatica.2010.10.019⟩
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-
- titre
- Optimal life-history strategies in seasonal consumer-resource dynamics.
- auteur
- Andrei R. Akhmetzhanov, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2011, 65 (11), pp.3113--3125. ⟨10.1111/j.1558-5646.2011.01381.x⟩
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-
- titre
- Seasonality and the evolutionary divergence of plant parasites
- auteur
- Frédéric Marie Hamelin, Magda Castel, Sylvain Poggi, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret
- article
- Ecology, 2011, 92 (12), pp.2159-2166. ⟨10.1890/10-2442.1⟩
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- titre
- Exact control of genetic networks in a qualitative framework: the bistable switch example
- auteur
- Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- Automatica, 2011, 47 (6), pp.1105-1112. ⟨10.1016/j.automatica.2011.01.071⟩
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-
- titre
- Life-cycle assessment of microalgae culture coupled to biogas production
- auteur
- Pierre Collet, Arnaud Hélias, Laurent Lardon, Monique Ras, Romy-Alice Goy, Jean-Philippe Steyer
- article
- Bioresource Technology, 2011, 102 (1), pp.207-214. ⟨10.1016/j.biortech.2010.06.154⟩
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-
- titre
- Hurdles and challenges for modelling and control of microalgae for CO2 mitigation and biofuel production
- auteur
- Olivier Bernard
- article
- Journal of Process Control, 2011, 21 (10), pp.1378--1389. ⟨10.1016/j.jprocont.2011.07.012⟩
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- titre
- A theoretical exploration of birhythmicity in the p53-Mdm2 network
- auteur
- Wassim Abou-Jaoudé, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- PLoS ONE, 2011, 6 (2), pp.e17075. ⟨10.1371/journal.pone.0017075⟩
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-
- titre
- Modeling anaerobic digestion of microalgae using ADM1.
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer
- article
- Bioresource Technology, 2011, 102 (13), pp.6823--6829
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-
- titre
- Modelling neutral lipid production by the microalga Isochrysis affinis galbana under nitrogen limitation
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Pierre Masci, Thomas Lacour, Antoine Sciandra
- article
- Bioresource Technology, 2011, 102, pp.142-149. ⟨10.1016/j.biortech.2010.06.138⟩
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Conference papers
- titre
- An observer for a piecewise affine genetic network model with Boolean observations
- auteur
- Xiao-Dong Li, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves
- article
- IEEE Conference of Decision and Control, Dec 2011, Orlando, United States. pp.4389 - 4394, ⟨10.1109/CDC.2011.6160629⟩
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- titre
- Algae as source of biofuel - Environmental assessment and ecodesign perspectives
- auteur
- Pierre Collet, Juliette Langlois, Melissa Cornelus, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard, Arnaud Helias
- article
- Conference Ecotech & tools, Nov 2011, Montpellier, France
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-
- titre
- Numerical prediction of microalgae productivity and energy requirement during the cultivation process in raceway
- auteur
- Philipp Hartmann, Anne-Céline Boulanger, Jacques Sainte-Marie, Marie-Odile Bristeau, Kerstin Ebert, Antoine Sciandra, Olivier Bernard
- article
- Alg'n'Chem conference, Fédération française pour les sciences de la chimie, Nov 2011, Montpellier, France
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- titre
- Interval estimation of lipid quota in microalgae culture using dynamic tuning parameter
- auteur
- Francis Mairet, Marcelo Moisan, Olivier Bernard
- article
- 9th IEEE International Conference on Control & Automation (IEEE ICCA 2011), 2011, Santiago, Chile. ⟨10.1109/ICCA.2011.6137953⟩
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-
- titre
- Qualitative Control of a Bistable Genetic Network
- auteur
- Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- Robust Optimization in Finance
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Optimization Days 2011, 2011, Montréal, Québec, Canada
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- titre
- Anaerobic digestion of microalgae: evaluation of process performances using ADM1
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer
- article
- Stic & Environnement 2011, 2011, Saint-Etienne, France
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-
- titre
- Global Gene Regulation in Metabolic Networks
- auteur
- Diego A. Oyarzún, Madalena Chaves
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milan, Italy
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- titre
- Evolutionary insights from semi-discrete plant epidemic models
- auteur
- Magda Castel, Frédéric Marie Hamelin, Sylvain Poggi, Didier Andrivon, Ludovic Mailleret
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- Optimal foraging predators in Leslie Gower models with alternative prey
- auteur
- Mickael Teixeira-Alves, Ludovic Mailleret, Frédéric Grognard
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
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- titre
- Comparison of biogeochemical models with increasing complexity in photosynthesis formulation: the importance of taking into account photoadaptation in marine ecosystem models
- auteur
- Sakina-Dorothée Ayata, Olivier Aumont, Olivier Bernard, Marina Lévy
- article
- Advances in Marine Ecosystem Modelling Symposium 2011, 2011, Plymouth, United Kingdom
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- titre
- Spatial and Temporal Associations of Powdery Mildew and Two-Spotted Spider-Mite in Greenhouses.
- auteur
- Alexandre Bout, Marie-Madeleine Müller, Ludovic Mailleret, Roger Boll, Christine Poncet, Rachid Senoussi
- article
- Acta Horticulturae, Proceedings of the XXVIII International Horticultural Congress, 2011, Lisbon, Portugal. pp.23-30
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- titre
- Mechanisms for coexistence of two limit cycles in a biochemical model
- auteur
- Wassim Abou-Jaoudé, Madalena Chaves, Jean-Luc Gouzé
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milan, Italy. ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.00749⟩
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- titre
- A Dynamic Model for Anaerobic Digestion of Microalgae
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milano, Italy. ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.02636⟩
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- titre
- Modelling microalgae growth in nitrogen limited photobiorector for estimating biomass, carbohydrate and neutral lipid productivities
- auteur
- Francis Mairet, Olivier Bernard, Thomas Lacour, Antoine Sciandra
- article
- IFAC World Congress, 2011, Milano, Italy. ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.03165⟩
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- titre
- Anaerobic Digestion of Microalgae: Identification for Optimization and Control
- auteur
- Elliot Cameron, Francis Mairet, Olivier Bernard, Monique Ras, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Benoît Chachuat
- article
- IFAC World Congress, International Federation of Automatic Control (IFAC). Laxenburg, AUT., 2011, Milano, Italy. pp.5052-5057, ⟨10.3182/20110828-6-IT-1002.03196⟩
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- titre
- On the Dynamics of the Handicap Principle
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Mathematical Aspects of Game theory, 2011, Toulouse, France
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- titre
- Predicting the asymptotic dynamics of large biological networks by interconnections of Boolean modules
- auteur
- Madalena Chaves, Laurent Tournier
- article
- 50th IEEE Conference on Decision and Control and European Control Conference, 2011, Orlando, Florida, United States. pp.3026-3031, ⟨10.1109/CDC.2011.6160454⟩
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-
- titre
- Can we produce biofuel from microalgae without a renewable source of electricity and heat?
- auteur
- Pierre Collet, Laurent Lardon, Arnaud Hélias, Stéphanie Bricout, Isabelle Lombaert-Valot, Béatrice Perrier, Olivier Lépine, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard
- article
- Algn'n'Chem conference, 2011, Montpellier, France
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- titre
- Investigating photo inhibition processes in a novel Droop-Han modelling approach
- auteur
- Philipp Hartmann, Olivier Bernard
- article
- Proceedings of the Watermatex conference, 2011, San Sebastian, Spain
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- titre
- Environmental assessment and ecodesign perspectives
- auteur
- Pierre Collet, Juliette Langlois, Melissa Cornelus, Laurent Lardon, Jean-Philippe Steyer, Olivier Bernard, Arnaud Hélias
- article
- Ecotech-tools conference, 2011, Montpellier, France
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- titre
- Stability results on some zooplankton size-structured models
- auteur
- Jonathan Rault, Eric Benoît
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
- Accès au bibtex
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- titre
- Dynamic game for optimal resource allocation of annual plants and grazing consumers
- auteur
- Andrei R. Akhmetzhanov, Pierre Bernhard, Frédéric Grognard, Ludovic Mailleret
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
- Accès au bibtex
-
- titre
- From elaborate to compact seasonal plant epidemic models
- auteur
- Ludovic Mailleret, Magda Castel, Frédéric Marie Hamelin
- article
- European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, 2011, Krakow, Poland
- Accès au bibtex
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Book sections
- titre
- ESS, Population games, replicator dynamics: dynamics and games if not dynamic games
- auteur
- Pierre Bernhard
- article
- Breton, Michèle and Szajowski, Krzysztof. Advances in the Theory and Applications of Dynamic Games, Birkhaüser, pp.291-311, 2011, Annals of the International Society of Dynamic Games, ⟨10.1007/978-0-8176-8089-3_15⟩
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Master thesis
- titre
- Les réseaux de régulation génétique : controle d'un oscillateur
- auteur
- Ismail Belgacem
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
- Accès au bibtex
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- titre
- Elaboration d'un modèle plante-ravageur dans le cadre de la lutte biologique
- auteur
- Audrey Lebon
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
- Accès au bibtex
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- titre
- Modélisation de l'effet de la température sur le taux de croissance spécifique du phytoplancton
- auteur
- Barbara Rémond
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
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- titre
- Effets de chocs osmotiques sur la production de lipides chez ıt Dunaliella salina
- auteur
- Hubert Bonnefond
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
- Accès au bibtex
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- titre
- Conception et étude d'un modèle de gestion durable des variétés de plantes résistantes aux virus dans un paysage
- auteur
- Elsa Rousseau
- article
- Sciences de l'ingénieur [physics]. 2011
- Accès au bibtex
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Reports
- titre
- An observer for a genetic network model with Boolean observations
- auteur
- Xiao-Dong Li, Jean-Luc Gouzé, Madalena Chaves
- article
- 2011, pp.4389 - 4394
- Accès au bibtex
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2010
Patents
- titre
- Procede de fixation de co2 et de traitement de dechets organiques par couplage d'un systeme de digestion anaerobie et d'un systeme de production de microorganismes phytoplanctoniques
- auteur
- Olivier Bernard, Gaël Bougaran, Jean-Paul Cadoret, Raymond Kaas, E. Latrille, Bruno Sialve, Jean-Philippe Steyer
- article
- France, N° de brevet: WO 2010084274 A1. 2010
- Accès au texte intégral et bibtex
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