Publications HAL de Emmanuel Caruyer

2023

Poster communications

auteur
Constance Bocquillon, Marc Lapert, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Emmanuel Caruyer
titre
Étude de l’effet du bruit sur l'estimation de l'anisotropie microscopique en IRM de diffusion
article
SFRMBM 2023 - Sixième congrès de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine, Mar 2023, Paris, France
identifiant
hal-04072656
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https://inria.hal.science/hal-04072656/file/sfrmbm-2023.pdf https://inria.hal.science/hal-04072656/file/Bocquillon-Constance-Empenn.pdf BibTex
auteur
Nolwenn Jégou, Elise Bannier, Nora Erhart, Hector H Garcia, Emmanuel Caruyer, Isabelle Corouge
titre
Reproductibilité d'une tâche motrice en NIRS et comparaison à l'IRMf BOLD sur des sujets adultes sains
article
SFRMBM 2023 - 6ème Congrès Scientifique de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine, Mar 2023, Paris, France. pp.1-1
identifiant
hal-04032802
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https://hal.science/hal-04032802/file/NolwennJEGOU_sfrmbm2023.pdf BibTex

2022

Conference papers

auteur
Nolwenn Jégou, Elise Bannier, Emmanuel Caruyer, Isabelle Corouge
titre
Chaînes de traitement de données d'une tâche motrice en NIRS et comparaison avec l'IRM sur des sujets sains
article
Workshop "Acquisition multimodale et analyse des données", Dec 2022, Rennes, France. pp.28
identifiant
hal-04308694
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https://hal.science/hal-04308694/file/Pr%C3%A9sentationWorkshopFinal.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Benoit Combès, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Julien Cohen-Adad, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
titre
Reproducibility and evolution of diffusion MRI measurements within the cervical spinal cord in multiple sclerosis
article
ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-5
identifiant
inserm-03639907
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https://inserm.hal.science/inserm-03639907/file/Article_ISBI_2022_Feb7_2022.pdf BibTex

Poster communications

auteur
Nolwenn Jégou, Elise Bannier, Nora Erhart, Hector H Garcia, Emmanuel Caruyer, Isabelle Corouge
titre
Reproducibility of motor task-based fNIRS and comparison with functional MRI in healthy adults
article
Biennial meeting of the Society for functional Near-Infrared Spectroscopy (fNIRS 2022), Oct 2022, Boston, MA, United States.
identifiant
hal-03783898
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https://hal.science/hal-03783898/file/fNIRS_2022_NolwennJegou.pdf BibTex

2021

Conference papers

auteur
Jonathan Rafael-Patino, Gabriel Girard, Raphaël Truffet, Marco Pizzolato, Jean-Philippe Thiran, Emmanuel Caruyer
titre
The Microstructural Features of the Diffusion-Simulated Connectivity (DiSCo) Dataset
article
CDMRI 2021 - International Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2021, Strasbourg, France. pp.159-170, ⟨10.1007/978-3-030-87615-9_14⟩
identifiant
inserm-03366318
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-87615-9_14
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https://inserm.hal.science/inserm-03366318/file/DiSCo_CDMRI_2021.pdf BibTex
auteur
Simona Schiavi, Mario Ocampo-Pineda, Raphaël Truffet, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Marco Palombo
titre
SANDI-AMICO: an open-source toolbox for fast Soma And Neurite Density Imaging (SANDI) with AMICO
article
27th annual meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2021, Virtual, Singapore
identifiant
inserm-03783770
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https://inserm.hal.science/inserm-03783770/file/OHBM.pdf BibTex

2020

Conference papers

auteur
Raphaël Truffet, Jonathan Rafael-Patino, Gabriel Girard, Marco Pizzolato, Christian Barillot, Jean-Philippe Thiran, Emmanuel Caruyer
titre
An evolutionary framework for microstructure-sensitive generalized diffusion gradient waveforms
article
MICCAI 2020 - 23rd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru. pp.1-11
identifiant
inserm-02910086
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https://inserm.hal.science/inserm-02910086/file/paper396.pdf BibTex

2019

Conference papers

auteur
Alice Bates, Alessandro Daducci, Emmanuel Caruyer
titre
Multi-Dimensional Diffusion MRI Sampling Scheme: B-tensor Design and Accurate Signal Reconstruction
article
ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montréal, Canada. pp.1-4
identifiant
inserm-02065830
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https://inserm.hal.science/inserm-02065830/file/bates-daducci-etal-ismrm2019.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Julien Cohen-Adad, Olivier Commowick, Benoit Combes, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
titre
Geometric evaluation of distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1696-1699, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759196⟩
identifiant
inserm-01986723
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759196
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https://inserm.hal.science/inserm-01986723/file/snoussi-caruyer-etal-isbi2019.pdf BibTex
auteur
Raphaël Truffet, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
titre
Optimal selection of diffusion-weighting gradient waveforms using compressed sensing and dictionary learning
article
ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montréal, Canada. pp.1-3
identifiant
inserm-02015394
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https://inserm.hal.science/inserm-02015394/file/3487.pdf BibTex

2018

Conference papers

auteur
Abdol Aziz Ould Ismail, Drew Parker, Moises Hernandez-Fernandez, Steven Brem, Simon Alexander, Ofer Pasternak, Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
titre
Characterizing Peritumoral Tissue Using Free Water Elimination in Clinical DTI
article
MICCAI 2018 - 21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention ; Workshop : Brain Lesion, Sep 2018, Granada, Spain. pp.1-9
identifiant
inserm-01867347
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https://inserm.hal.science/inserm-01867347/file/BrainLes-FWE-2018.pdf BibTex

Poster communications

auteur
Raphaël Truffet, Emmanuel Caruyer
titre
Optimal selection of diffusion-weighting gradient waveforms using compressed sensing and dictionary learning
article
AI days 2018, Apr 2018, Rennes, France. pp.1
identifiant
inserm-01939066
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https://inserm.hal.science/inserm-01939066/file/truffet18.pdf BibTex

2017

Conference papers

auteur
Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot
titre
L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration
article
20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩
identifiant
inserm-01556476
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30
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https://inserm.hal.science/inserm-01556476/file/MICCAI17-317.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
titre
Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
article
ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain
identifiant
inserm-01579134
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https://inserm.hal.science/inserm-01579134/file/snoussi_et_al_esmrmb2017.pdf BibTex

2014

Conference papers

auteur
Emmanuel Caruyer, Luke Bloy, Birkan Tunç, Jérémy Lecoeur, Varsha Shankar, Ragini Verma
titre
A comparative study of 16 tractography algorithms for the corticospinal tract: reproducibility and subject-specificity
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy
identifiant
hal-00944649
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https://inria.hal.science/hal-00944649/file/caruyer-bloy-etal-ismrm14.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Maxime Descoteaux, Jean-Christophe Houde, Jean-Philippe Thiran, Ragini Verma
titre
Phantomas: a flexible software library to simulate diffusion MR phantoms
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy
identifiant
hal-00944644
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https://inria.hal.science/hal-00944644/file/caruyer-daducci-etal-ismrm14.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
titre
Rotation-invariant measures for population study in HARDI
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy
identifiant
hal-00944646
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https://inria.hal.science/hal-00944646/file/caruyer-verma-ismrm14.pdf BibTex
auteur
Jean-Christophe Houde, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Maxime Descoteaux
titre
How should tractography go forward? A Tractometer evaluation of local reconstruction and tracking
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.6470
identifiant
hal-01033816
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https://hal.science/hal-01033816/file/houde-caruyer-etal-ismrm14.pdf BibTex
auteur
Jérémy Lecoeur, Emmanuel Caruyer, Mark Elliott, Steven Brem, Luke Macyszyn, Ragini Verma
titre
Addressing the Challenge of Edema in Fiber Tracking
article
MICCAI 2014 DTI Tractography Challenge, Sep 2014, Boston, United States
identifiant
hal-01072222
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https://inria.hal.science/hal-01072222/file/lecoeur-caruyer-etal-miccai-dti-challenge-2014.pdf BibTex

2013

Conference papers

auteur
Jérémy Lecoeur, Emmanuel Caruyer, Luke Macyszyn, Ragini Verma
titre
Improving White Matter Tractography by Resolving the Challenges of Edema
article
MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge, Sep 2013, Nagoya, Japan
identifiant
hal-00850496
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https://inria.hal.science/hal-00850496/file/lecoeur-caruyer-etal-miccai-dti-challenge-13.pdf BibTex

2012

Conference papers

auteur
Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
titre
A Computational Framework for Experimental Design in Diffusion MRI
article
CDMRI - MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2012, Nice, France
identifiant
hal-00747700
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00747700/file/article.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
titre
Optimal Regularization for MR Diffusion Signal Reconstruction
article
ISBI - 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain
identifiant
hal-00660635
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https://inria.hal.science/hal-00660635/file/article.pdf BibTex
auteur
Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
titre
Parametric dictionary learning for modeling EAP and ODF in diffusion MRI
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. 8 p
identifiant
hal-00728067
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https://hal.science/hal-00728067/file/paper_791.pdf BibTex
auteur
Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
titre
Parametric Dictionary Learning in Diffusion MRI
article
HARDI reconstruction workshop - ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Alessandro Daducci and Jean-Philippe Thiran and Yves Wiaux, May 2012, Barcelona, Spain
identifiant
hal-00697102
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00697102/file/merlet-caruyer-etal_HARDI-Contest-ISBI-2012.pdf BibTex

2011

Conference papers

auteur
Emmanuel Caruyer, Jian Cheng, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
titre
Optimal Design of Multiple Q-shells experiments for Diffusion MRI
article
MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI - CDMRI'11, Sep 2011, Toronto, Canada
identifiant
inria-00617663
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00617663/file/article.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
titre
Incremental gradient table for multiple Q-shells diffusion MRI
article
HBM 17th Annual Meeting, Jun 2011, Québec, Canada
identifiant
inria-00617957
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https://inria.hal.science/inria-00617957/file/article.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
titre
On Line Reconstruction and Motion Detection in HARDI
article
19th ISMRM annual meeting, May 2011, Montréal, Canada
identifiant
inria-00560899
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00560899/file/ISMRM11.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
titre
Online Motion Detection in High Angular Resolution Diffusion Imaging
article
International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States
identifiant
inria-00559904
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00559904/file/article.pdf BibTex
auteur
Jian Cheng, Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
titre
Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
article
MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI - CDMRI'11, Sep 2011, Toronto, Canada
identifiant
inria-00615434
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00615434/file/L1-SPFI_CDMRI2011.pdf BibTex
auteur
Jian Cheng, Sylvain Merlet, Aurobrata Ghosh, Emmanuel Caruyer, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
titre
Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
article
ISMRM, May 2011, Montréal, Canada
identifiant
inria-00615437
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00615437/file/L1SPFI_CS_ISMRM_final.pdf BibTex
auteur
Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
titre
Impact of radial and angular sampling on multiple shells acquisition in diffusion MRI
article
MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.113-121
identifiant
hal-00614387
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00614387/file/MICCAI_2011_paperReady.pdf BibTex

2010

Conference papers

auteur
Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Ryan Muetzel, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
titre
Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in HARDI
article
International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands
identifiant
inria-00559884
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00559884/file/article.pdf BibTex

2009

Conference papers

auteur
Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
titre
Adaptive Design of Sampling Directions in Diffusion Tensor MRI and Validation on Human Brain Images
article
MICCAI Workshop on Diffusion Modelling and the Fiber Cup, Sep 2009, Londres, United Kingdom
identifiant
inria-00560054
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00560054/file/miccai09.pdf BibTex