2023
Journal articles
- auteur
- Gabriel Girard, Jonathan Rafael-Patiño, Raphaël Truffet, Dogu Baran Aydogan, Nagesh Adluru, Veena A Nair, Vivek Prabhakaran, Barbara B Bendlin, Andrew L Alexander, Sara Bosticardo, Ilaria Gabusi, Mario Ocampo-Pineda, Matteo Battocchio, Zuzana Piskorova, Pietro Bontempi, Simona Schiavi, Alessandro Daducci, Aleksandra Stafiej, Dominika Ciupek, Fabian Bogusz, Tomasz Pieciak, Matteo Frigo, Sara Sedlar, Samuel Deslauriers-Gauthier, Ivana Kojčić, Mauro Zucchelli, Hiba Laghrissi, Yang Ji, Rachid Deriche, Kurt G Schilling, Bennett A Landman, Alberto Cacciola, Gianpaolo Antonio Basile, Salvatore Bertino, Nancy Newlin, Praitayini Kanakaraj, Francois Rheault, Patryk Filipiak, Timothy M Shepherd, Ying-Chia Lin, Dimitris G Placantonakis, Fernando E Boada, Steven H Baete, Erick Hernández-Gutiérrez, Alonso Ramírez-Manzanares, Ricardo Coronado-Leija, Pablo Stack-Sánchez, Luis Concha, Maxime Descoteaux, Caio Seguin, Andrew Zalesky, Kenji Marshall, Erick J Canales-Rodríguez, Ye Wu, Sahar Ahmad, Pew-Thian Yap, Antoine Théberge, Florence Gagnon, Frédéric Massi, Elda Fischi-Gomez, Rémy Gardier, Juan Luis Villarreal Haro, Marco Pizzolato, Emmanuel Caruyer, Jean-Philippe Thiran
- titre
- Tractography passes the test: Results from the diffusion-simulated connectivity (disco) challenge
- article
- NeuroImage, 2023, 277, pp.1-11. ⟨10.1016/j.neuroimage.2023.120231⟩
- identifiant
- hal-04390592
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2023.120231
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Haykel Snoussi, Julien Cohen-Adad, Benoît Combès, Élise Bannier, Slimane Tounekti, Anne Kerbrat, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
- titre
- Effectiveness of regional diffusion MRI measures in distinguishing multiple sclerosis abnormalities within the cervical spinal cord
- article
- Brain and Behavior, 2023, 13 (11), pp.e3159. ⟨10.1002/brb3.3159⟩
- identifiant
- inserm-04313206
- DOI
- DOI : 10.1002/brb3.3159
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-
Poster communications
- auteur
- Constance Bocquillon, Marc Lapert, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Emmanuel Caruyer
- titre
- Étude de l’effet du bruit sur l'estimation de l'anisotropie microscopique en IRM de diffusion
- article
- SFRMBM 2023 - Sixième congrès de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine, Mar 2023, Paris, France
- identifiant
- hal-04072656
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-
- auteur
- Nolwenn Jégou, Elise Bannier, Nora Erhart, Hector H Garcia, Emmanuel Caruyer, Isabelle Corouge
- titre
- Reproductibilité d'une tâche motrice en NIRS et comparaison à l'IRMf BOLD sur des sujets adultes sains
- article
- SFRMBM 2023 - 6ème Congrès Scientifique de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine, Mar 2023, Paris, France. pp.1-1
- identifiant
- hal-04032802
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-
Preprints, Working Papers, ...
- auteur
- Thomas Durantel, Gabriel Girard, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Julie Coloigner
- titre
- A Riemannian framework for incorporating white matter bundle priors in ODF-based tractography algorithms.
- article
- 2023
- identifiant
- hal-04246380
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-
2022
Conference papers
- auteur
- Nolwenn Jégou, Elise Bannier, Emmanuel Caruyer, Isabelle Corouge
- titre
- Chaînes de traitement de données d'une tâche motrice en NIRS et comparaison avec l'IRM sur des sujets sains
- article
- Workshop "Acquisition multimodale et analyse des données", Dec 2022, Rennes, France. pp.28
- identifiant
- hal-04308694
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-
- auteur
- Haykel Snoussi, Benoit Combès, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Julien Cohen-Adad, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
- titre
- Reproducibility and evolution of diffusion MRI measurements within the cervical spinal cord in multiple sclerosis
- article
- ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-5
- identifiant
- inserm-03639907
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-
Book sections
- auteur
- Emmanuel Caruyer
- titre
- Imagerie par résonance magnétique de diffusion
- article
- Le corps en images, pp.1-8, 2022
- identifiant
- inserm-03798395
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-
Habilitation à diriger des recherches
- auteur
- Emmanuel Caruyer
- titre
- Numerical methods for white matter microstructure and brain structural connectivity in diffusion MRI
- article
- Computer science. Université de Rennes 1, 2022
- identifiant
- tel-03894045
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-
Books
- auteur
- Laure Blanc-Féraud, Emmanuel Caruyer, Christian Jutten, Herve Liebgott
- titre
- Le corps en images
- article
- CNRS, 2022, ISBN 9782271143280
- identifiant
- inserm-03798417
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-
Poster communications
- auteur
- Nolwenn Jégou, Elise Bannier, Nora Erhart, Hector H Garcia, Emmanuel Caruyer, Isabelle Corouge
- titre
- Reproducibility of motor task-based fNIRS and comparison with functional MRI in healthy adults
- article
- Biennial meeting of the Society for functional Near-Infrared Spectroscopy (fNIRS 2022), Oct 2022, Boston, MA, United States.
- identifiant
- hal-03783898
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-
2021
Journal articles
- auteur
- Balazs Aczel, Barnabas Szaszi, Gustav Nilsonne, Olmo van den Akker, Casper Albers, Marcel Alm van Assen, Jojanneke Bastiaansen, Daniel Benjamin, Udo Boehm, Rotem Botvinik-Nezer, Laura Bringmann, Niko Busch, Emmanuel Caruyer, Andrea Cataldo, Nelson Cowan, Andrew Delios, Noah van Dongen, Chris Donkin, Johnny van Doorn, Ann Dreber, Gilles Dutilh, Gary Egan, Morton Ann Gernsbacher, Rink Hoekstra, Sabine Hoffmann, Felix Holzmeister, Juergen Huber, Magnus Johannesson, Kai Jonas, Alexander Kindel, Michael Kirchler, Yoram Kunkels, D Stephen Lindsay, Jean-Francois Mangin, Dora Matzke, Marcus Munafò, Ben Newell, Brian Nosek, Russell Poldrack, Don van Ravenzwaaij, Jörg Rieskamp, Matthew Salganik, Alexandra Sarafoglou, Tom Schonberg, Martin Schweinsberg, David Shanks, Raphael Silberzahn, Daniel Simons, Barbara Spellman, Samuel St-Jean, Jeffrey Starns, Eric Luis Uhlmann, Jelte Wicherts, Eric-Jan Wagenmakers
- titre
- Consensus-based guidance for conducting and reporting multi-analyst studies
- article
- eLife, 2021, 10, pp.e72185. ⟨10.7554/eLife.72185⟩
- identifiant
- inserm-03431812
- DOI
- DOI : 10.7554/eLife.72185
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-
- auteur
- Jonathan Rafael-Patino, Gabriel Girard, Raphaël Truffet, Marco Pizzolato, Emmanuel Caruyer, Jean-Philippe Thiran
- titre
- The diffusion-simulated connectivity (DiSCo) dataset
- article
- Data in Brief, 2021, 38, pp.1-7. ⟨10.1016/j.dib.2021.107429⟩
- identifiant
- inserm-03366969
- DOI
- DOI : 10.1016/j.dib.2021.107429
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-
Conference papers
- auteur
- Jonathan Rafael-Patino, Gabriel Girard, Raphaël Truffet, Marco Pizzolato, Jean-Philippe Thiran, Emmanuel Caruyer
- titre
- The Microstructural Features of the Diffusion-Simulated Connectivity (DiSCo) Dataset
- article
- CDMRI 2021 - International Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2021, Strasbourg, France. pp.159-170, ⟨10.1007/978-3-030-87615-9_14⟩
- identifiant
- inserm-03366318
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-87615-9_14
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-
- auteur
- Simona Schiavi, Mario Ocampo-Pineda, Raphaël Truffet, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Marco Palombo
- titre
- SANDI-AMICO: an open-source toolbox for fast Soma And Neurite Density Imaging (SANDI) with AMICO
- article
- 27th annual meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2021, Virtual, Singapore
- identifiant
- inserm-03783770
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-
2020
Journal articles
- auteur
- Alice Bates, Alessandro Daducci, Parastoo Sadeghi, Emmanuel Caruyer
- titre
- A 4D Basis and Sampling Scheme for the Tensor Encoded Multi-Dimensional Diffusion MRI Signal
- article
- IEEE Signal Processing Letters, 2020, 27, pp.790-794. ⟨10.1109/LSP.2020.2991832⟩
- identifiant
- inserm-02881980
- DOI
- DOI : 10.1109/LSP.2020.2991832
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-
- auteur
- Drew Parker, Abdol Aziz Ould Ismail, Ronald Wolf, Steven Brem, Simon Alexander, Wes Hodges, Ofer Pasternak, Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
- titre
- Freewater estimatoR using iNtErpolated iniTialization (FERNET): Characterizing peritumoral edema using clinically feasible diffusion MRI data
- article
- PLoS ONE, 2020, 15 (5), pp.e0233645. ⟨10.1371/journal.pone.0233645⟩
- identifiant
- inserm-02884608
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0233645
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-
Conference papers
- auteur
- Raphaël Truffet, Jonathan Rafael-Patino, Gabriel Girard, Marco Pizzolato, Christian Barillot, Jean-Philippe Thiran, Emmanuel Caruyer
- titre
- An evolutionary framework for microstructure-sensitive generalized diffusion gradient waveforms
- article
- MICCAI 2020 - 23rd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru. pp.1-11
- identifiant
- inserm-02910086
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-
2019
Conference papers
- auteur
- Alice Bates, Alessandro Daducci, Emmanuel Caruyer
- titre
- Multi-Dimensional Diffusion MRI Sampling Scheme: B-tensor Design and Accurate Signal Reconstruction
- article
- ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montréal, Canada. pp.1-4
- identifiant
- inserm-02065830
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-
- auteur
- Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Julien Cohen-Adad, Olivier Commowick, Benoit Combes, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
- titre
- Geometric evaluation of distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
- article
- ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1696-1699, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759196⟩
- identifiant
- inserm-01986723
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759196
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-
- auteur
- Raphaël Truffet, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
- titre
- Optimal selection of diffusion-weighting gradient waveforms using compressed sensing and dictionary learning
- article
- ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montréal, Canada. pp.1-3
- identifiant
- inserm-02015394
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-
Preprints, Working Papers, ...
- auteur
- Abdol Aziz Ould Ismail, Drew Parker, Moises Hernandez-Fernandez, Ronald Wolf, Steven Brem, Simon Alexander, Wes Hodges, Ofer Pasternak, Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
- titre
- Freewater EstimatoR using iNtErpolated iniTialization (FERNET): Toward Accurate Estimation of Free Water in Peritumoral Region Using Single-Shell Diffusion MRI Data
- article
- 2019
- identifiant
- inserm-02309753
- DOI
- DOI : 10.1101/796615
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-
2018
Conference papers
- auteur
- Abdol Aziz Ould Ismail, Drew Parker, Moises Hernandez-Fernandez, Steven Brem, Simon Alexander, Ofer Pasternak, Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
- titre
- Characterizing Peritumoral Tissue Using Free Water Elimination in Clinical DTI
- article
- MICCAI 2018 - 21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention ; Workshop : Brain Lesion, Sep 2018, Granada, Spain. pp.1-9
- identifiant
- inserm-01867347
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-
Poster communications
- auteur
- Raphaël Truffet, Emmanuel Caruyer
- titre
- Optimal selection of diffusion-weighting gradient waveforms using compressed sensing and dictionary learning
- article
- AI days 2018, Apr 2018, Rennes, France. pp.1
- identifiant
- inserm-01939066
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-
2017
Journal articles
- auteur
- Klaus H Maier-Hein, Peter F. Neher, Christophe Houde, Marc-Alexandre Côté, Eleftherios Garyfallidis, Jidan Zhong, Maxime Chamberland, Fang-Chen Yeh, Ying-Chia Lin, Qing Ji, Wilburn E. Reddick, John O. Glass, David Qixiang Chen, Yuanjing Feng, Chengfeng Gao, Ye Wu, Jieyan Ma, H. Renjie, Qiang Li, Carl-Fredrik Westin, Samuel Deslauriers-Gauthier, J. Omar Ocegueda González, Michael Paquette, Samuel St-Jean, Gabriel Girard, François Rheault, Jasmeen Sidhu, Chantal M. W. Tax, Fenghua Guo, Hamed Y. Mesri, Szabolcs Dávid, Martijn Froeling, Anneriet M. Heemskerk, Alexander Leemans, Arnaud Boré, Basile Pinsard, Christophe Bedetti, Matthieu Desrosiers, Bram Brambati, Julien Doyon, Alessia Sarica, Roberta Vasta, Antonio Cerasa, Aldo Quattrone, Jason Yeatman, Ali R. Khan, Wes Hodges, Simon Alexander, David Romascano, Muhamed Barakovic, Anna Auría, Oscar Esteban, Alia Lemkaddem, Jean-Philippe Thiran, H. Ertan Cetingul, Benjamin L. Odry, Boris Mailhé, Mariappan S. Nadar, Fabrizio M Pizzagalli, Gautam Prasad, Julio E. Villalon-Reina, Justin Galvis, Paul M. Thompson, Francisco de Santiago Requejo, Pedro Luque Laguna, Luis Miguel Lacerda, Rachel Barrett, Flavio Dell’acqua, Marco Catani, Laurent Petit, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Tim Dyrby, Tim Holland-Letz, Claus C. Hilgetag, Bram Stieltjes, Maxime Descoteaux
- titre
- The challenge of mapping the human connectome based on diffusion tractography
- article
- Nature Communications, 2017, 8 (1), ⟨10.1038/s41467-017-01285-x⟩
- identifiant
- hal-01631578
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-017-01285-x
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-
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot
- titre
- L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration
- article
- 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩
- identifiant
- inserm-01556476
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
- titre
- Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
- article
- ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain
- identifiant
- inserm-01579134
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-
2016
Journal articles
- auteur
- Oscar Esteban, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Meritxell Bach-Cuadra, María Ledesma-Carbayo, Andres Santos
- titre
- Diffantom: Whole-Brain Diffusion MRI Phantoms Derived from Real Datasets of the Human Connectome Project
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, 2016, 10, pp.4. ⟨10.3389/fninf.2016.00004⟩
- identifiant
- inserm-03219764
- DOI
- DOI : 10.3389/fninf.2016.00004
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- MAPL: Tissue Microstructure Estimation Using Laplacian-Regularized MAP-MRI and its Application to HCP Data
- article
- NeuroImage, 2016, 134, pp.365-385. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.046⟩
- identifiant
- hal-01291929
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.03.046
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- auteur
- Klaus H Maier-Hein, Peter Neher, Jean-Christophe Houde, Marc-Alexandre Côté, Eleftherios Garyfallidis, Jidan Zhong, Maxime Chamberland, Fang-Cheng Yeh, Ying-Chia Lin, Qing Ji, Wilburn E Reddick, John O Glass, David Qixiang Chen, Yuanjing Feng, Chengfeng Gao, Ye Wu, Jieyan Ma, H Renjie, Qiang Li, Carl-Fredrik Westin, Samuel Deslauriers-Gauthier, J Omar Ocegueda González, Michael Paquette, Samuel St-Jean, Gabriel Girard, François Rheault, Jasmeen Sidhu, Chantal M W Tax, Fenghua Guo, Hamed y Mesri, Szabolcs Dávid, Martijn Froeling, Anneriet M Heemskerk, Alexander Leemans, Arnaud Boré, Basile Pinsard, Christophe Bedetti, Matthieu Desrosiers, Simona Brambati, Julien Doyon, Alessia Sarica, Roberta Vasta, Antonio Cerasa, Aldo Quattrone, Jason Yeatman, Ali R Khan, Wes Hodges, Simon Alexander, David Romascano, Muhamed Barakovic, Anna Auría, Oscar Esteban, Alia Lemkaddem, Jean-Philippe Thiran, H Ertan Cetingul, Benjamin L Odry, Boris Mailhe, Mariappan S Nadar, Fabrizio Pizzagalli, Gautam Prasad, Julio E Villalon-Reina, Justin Galvis, Paul M Thompson, Francisco de Santiago Requejo, Pedro Luque Laguna, Luis Miguel Lacerda, Rachel Barrett, Flavio Dell’acqua, Marco Catani, Laurent Petit, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Tim B Dyrby, Tim Holland-Letz, Claus C Hilgetag, Bram Stieltjes, Maxime Descoteaux
- titre
- Tractography-based connectomes are dominated by false-positive connections
- article
- 2016
- identifiant
- hal-03007290
- DOI
- DOI : 10.1101/084137
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2015
Journal articles
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
- titre
- On facilitating the use of HARDI in population studies by creating rotation-invariant markers
- article
- Medical Image Analysis, 2015, 20 (1), pp.87-96. ⟨10.1016/j.media.2014.10.009⟩
- identifiant
- hal-01090154
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2014.10.009
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Farshid Sepehrband, Jeiran Choupan, Emmanuel Caruyer, Nyoman D. Kurniawan, Yaniv Gal, Quang M. Tieng, Katie L. Mcmahon, Viktor Vegh, David C. Reutens, Yang Zhengyi
- titre
- lop-DWI: A Novel Scheme for Pre-Processing of Diffusion Weighted Images in the Gradient Direction Domain
- article
- Frontiers in Neurology, 2015, 5 (290), ⟨10.3389/fneur.2014.00290⟩
- identifiant
- hal-01103577
- DOI
- DOI : 10.3389/fneur.2014.00290
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2014
Journal articles
- auteur
- Alessandro Daducci, Erick Canales Rodgriguez, Maxime Descoteaux, Eleftherios Garyfallidis, Yaniv Gur, Ying Chia Lin, Merry Mani, Sylvain L. Merlet, Michael Paquette, Alonso Ramirez-Manzanares, Marco Reisert, Paulo Reis Rodrigues, Farshid Sepehrband, Emmanuel Caruyer, Jeiran Choupan, Rachid Deriche, Mathews Jacob, Gloria Menegaz, Vesna Prckovska, Mariano Rivera, Yves Wiaux, Jean-Philippe Thiran
- titre
- Quantitative comparison of reconstruction methods for intra-voxel fiber recovery from diffusion MRI
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2014, 99, pp.384-399. ⟨10.1109/TMI.2013.2285500⟩
- identifiant
- hal-00908289
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2013.2285500
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-
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Luke Bloy, Birkan Tunç, Jérémy Lecoeur, Varsha Shankar, Ragini Verma
- titre
- A comparative study of 16 tractography algorithms for the corticospinal tract: reproducibility and subject-specificity
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy
- identifiant
- hal-00944649
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Maxime Descoteaux, Jean-Christophe Houde, Jean-Philippe Thiran, Ragini Verma
- titre
- Phantomas: a flexible software library to simulate diffusion MR phantoms
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy
- identifiant
- hal-00944644
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
- titre
- Rotation-invariant measures for population study in HARDI
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy
- identifiant
- hal-00944646
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Jean-Christophe Houde, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Maxime Descoteaux
- titre
- How should tractography go forward? A Tractometer evaluation of local reconstruction and tracking
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.6470
- identifiant
- hal-01033816
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-
- auteur
- Jérémy Lecoeur, Emmanuel Caruyer, Mark Elliott, Steven Brem, Luke Macyszyn, Ragini Verma
- titre
- Addressing the Challenge of Edema in Fiber Tracking
- article
- MICCAI 2014 DTI Tractography Challenge, Sep 2014, Boston, United States
- identifiant
- hal-01072222
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-
2013
Journal articles
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Design of multishell sampling schemes with uniform coverage in diffusion MRI
- article
- Magnetic Resonance in Medicine, 2013, 69 (6), pp.1534-1540. ⟨10.1002/mrm.24736⟩
- identifiant
- hal-00821688
- DOI
- DOI : 10.1002/mrm.24736
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Motion Detection in Diffusion MRI via Online ODF Estimation
- article
- International Journal of Biomedical Imaging, 2013, 2013 (Article ID 84936), pp.1-8. ⟨10.1155/2013/849363⟩
- identifiant
- hal-00798582
- DOI
- DOI : 10.1155/2013/849363
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Sylvain L. Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
- titre
- A computational diffusion MRI and parametric dictionary learning framework for modeling the diffusion signal and its features
- article
- Medical Image Analysis, 2013, pp.MEDIMA779. ⟨10.1016/j.media.2013.04.011⟩
- identifiant
- hal-00820817
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2013.04.011
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- auteur
- Jérémy Lecoeur, Emmanuel Caruyer, Luke Macyszyn, Ragini Verma
- titre
- Improving White Matter Tractography by Resolving the Challenges of Edema
- article
- MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge, Sep 2013, Nagoya, Japan
- identifiant
- hal-00850496
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Journal articles
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Diffusion MRI Signal Reconstruction with Continuity Constraint and Optimal Regularization
- article
- Medical Image Analysis, 2012, 16 (6), pp.1113-1120. ⟨10.1016/j.media.2012.06.011⟩
- identifiant
- hal-00711883
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2012.06.011
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- A Computational Framework for Experimental Design in Diffusion MRI
- article
- CDMRI - MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2012, Nice, France
- identifiant
- hal-00747700
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Optimal Regularization for MR Diffusion Signal Reconstruction
- article
- ISBI - 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain
- identifiant
- hal-00660635
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Parametric dictionary learning for modeling EAP and ODF in diffusion MRI
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. 8 p
- identifiant
- hal-00728067
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
- titre
- Parametric Dictionary Learning in Diffusion MRI
- article
- HARDI reconstruction workshop - ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Alessandro Daducci and Jean-Philippe Thiran and Yves Wiaux, May 2012, Barcelona, Spain
- identifiant
- hal-00697102
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
- auteur
- Emmanuel Caruyer
- titre
- IRM de diffusion du Q-space : Acquisition et pré-traitements
- article
- Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. ⟨NNT : ⟩
- identifiant
- tel-00750144
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-
2011
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Jian Cheng, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
- titre
- Optimal Design of Multiple Q-shells experiments for Diffusion MRI
- article
- MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI - CDMRI'11, Sep 2011, Toronto, Canada
- identifiant
- inria-00617663
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Incremental gradient table for multiple Q-shells diffusion MRI
- article
- HBM 17th Annual Meeting, Jun 2011, Québec, Canada
- identifiant
- inria-00617957
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- On Line Reconstruction and Motion Detection in HARDI
- article
- 19th ISMRM annual meeting, May 2011, Montréal, Canada
- identifiant
- inria-00560899
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Online Motion Detection in High Angular Resolution Diffusion Imaging
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States
- identifiant
- inria-00559904
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-
- auteur
- Jian Cheng, Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
- titre
- Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
- article
- MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI - CDMRI'11, Sep 2011, Toronto, Canada
- identifiant
- inria-00615434
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-
- auteur
- Jian Cheng, Sylvain Merlet, Aurobrata Ghosh, Emmanuel Caruyer, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
- titre
- Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
- article
- ISMRM, May 2011, Montréal, Canada
- identifiant
- inria-00615437
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-
- auteur
- Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Impact of radial and angular sampling on multiple shells acquisition in diffusion MRI
- article
- MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.113-121
- identifiant
- hal-00614387
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-
2010
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Ryan Muetzel, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in HARDI
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands
- identifiant
- inria-00559884
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-
2009
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Adaptive Design of Sampling Directions in Diffusion Tensor MRI and Validation on Human Brain Images
- article
- MICCAI Workshop on Diffusion Modelling and the Fiber Cup, Sep 2009, Londres, United Kingdom
- identifiant
- inria-00560054
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-
Reports
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in high angular resolution diffusion imaging
- article
- [Research Report] RR-7102, INRIA. 2009, pp.12
- identifiant
- inria-00432959
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-
2007
Master thesis
- auteur
- Emmanuel Caruyer
- titre
- Signal and Noise in Diffusion Magnetic Resonance Images
- article
- Medical Imaging. 2007
- identifiant
- dumas-00880381
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-