2017
Journal articles
- auteur
- Klaus H Maier-Hein, Peter F. Neher, Christophe Houde, Marc-Alexandre Côté, Eleftherios Garyfallidis, Jidan Zhong, Maxime Chamberland, Fang-Chen Yeh, Ying-Chia Lin, Qing Ji, Wilburn E. Reddick, John O. Glass, David Qixiang Chen, Yuanjing Feng, Chengfeng Gao, Ye Wu, Jieyan Ma, H. Renjie, Qiang Li, Carl-Fredrik Westin, Samuel Deslauriers-Gauthier, J. Omar Ocegueda González, Michael Paquette, Samuel St-Jean, Gabriel Girard, François Rheault, Jasmeen Sidhu, Chantal M. W. Tax, Fenghua Guo, Hamed Y. Mesri, Szabolcs Dávid, Martijn Froeling, Anneriet M. Heemskerk, Alexander Leemans, Arnaud Boré, Basile Pinsard, Christophe Bedetti, Matthieu Desrosiers, Bram Brambati, Julien Doyon, Alessia Sarica, Roberta Vasta, Antonio Cerasa, Aldo Quattrone, Jason Yeatman, Ali R. Khan, Wes Hodges, Simon Alexander, David Romascano, Muhamed Barakovic, Anna Auría, Oscar Esteban, Alia Lemkaddem, Jean-Philippe Thiran, H. Ertan Cetingul, Benjamin L. Odry, Boris Mailhé, Mariappan S. Nadar, Fabrizio M Pizzagalli, Gautam Prasad, Julio E. Villalon-Reina, Justin Galvis, Paul M. Thompson, Francisco de Santiago Requejo, Pedro Luque Laguna, Luis Miguel Lacerda, Rachel Barrett, Flavio Dell’acqua, Marco Catani, Laurent Petit, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Tim Dyrby, Tim Holland-Letz, Claus C. Hilgetag, Bram Stieltjes, Maxime Descoteaux
- titre
- The challenge of mapping the human connectome based on diffusion tractography
- article
- Nature Communications, 2017, 8 (1), ⟨10.1038/s41467-017-01285-x⟩
- identifiant
- hal-01631578
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-017-01285-x
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-
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot
- titre
- L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration
- article
- 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩
- identifiant
- inserm-01556476
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30
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-
- auteur
- Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
- titre
- Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
- article
- ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain
- identifiant
- inserm-01579134
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-
2016
Journal articles
- auteur
- Oscar Esteban, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Meritxell Bach-Cuadra, María Ledesma-Carbayo, Andres Santos
- titre
- Diffantom: Whole-Brain Diffusion MRI Phantoms Derived from Real Datasets of the Human Connectome Project
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, 2016, 10, pp.4. ⟨10.3389/fninf.2016.00004⟩
- identifiant
- inserm-03219764
- DOI
- DOI : 10.3389/fninf.2016.00004
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-
- auteur
- Rutger H.J. Fick, Demian Wassermann, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- MAPL: Tissue Microstructure Estimation Using Laplacian-Regularized MAP-MRI and its Application to HCP Data
- article
- NeuroImage, 2016, 134, pp.365-385. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.046⟩
- identifiant
- hal-01291929
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.03.046
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-
Preprints, Working Papers, ...
- auteur
- Klaus H Maier-Hein, Peter Neher, Jean-Christophe Houde, Marc-Alexandre Côté, Eleftherios Garyfallidis, Jidan Zhong, Maxime Chamberland, Fang-Cheng Yeh, Ying-Chia Lin, Qing Ji, Wilburn E Reddick, John O Glass, David Qixiang Chen, Yuanjing Feng, Chengfeng Gao, Ye Wu, Jieyan Ma, H Renjie, Qiang Li, Carl-Fredrik Westin, Samuel Deslauriers-Gauthier, J Omar Ocegueda González, Michael Paquette, Samuel St-Jean, Gabriel Girard, François Rheault, Jasmeen Sidhu, Chantal M W Tax, Fenghua Guo, Hamed y Mesri, Szabolcs Dávid, Martijn Froeling, Anneriet M Heemskerk, Alexander Leemans, Arnaud Boré, Basile Pinsard, Christophe Bedetti, Matthieu Desrosiers, Simona Brambati, Julien Doyon, Alessia Sarica, Roberta Vasta, Antonio Cerasa, Aldo Quattrone, Jason Yeatman, Ali R Khan, Wes Hodges, Simon Alexander, David Romascano, Muhamed Barakovic, Anna Auría, Oscar Esteban, Alia Lemkaddem, Jean-Philippe Thiran, H Ertan Cetingul, Benjamin L Odry, Boris Mailhe, Mariappan S Nadar, Fabrizio Pizzagalli, Gautam Prasad, Julio E Villalon-Reina, Justin Galvis, Paul M Thompson, Francisco de Santiago Requejo, Pedro Luque Laguna, Luis Miguel Lacerda, Rachel Barrett, Flavio Dell’acqua, Marco Catani, Laurent Petit, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Tim B Dyrby, Tim Holland-Letz, Claus C Hilgetag, Bram Stieltjes, Maxime Descoteaux
- titre
- Tractography-based connectomes are dominated by false-positive connections
- article
- 2016
- identifiant
- hal-03007290
- DOI
- DOI : 10.1101/084137
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-
2015
Journal articles
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
- titre
- On facilitating the use of HARDI in population studies by creating rotation-invariant markers
- article
- Medical Image Analysis, 2015, 20 (1), pp.87-96. ⟨10.1016/j.media.2014.10.009⟩
- identifiant
- hal-01090154
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2014.10.009
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-
- auteur
- Farshid Sepehrband, Jeiran Choupan, Emmanuel Caruyer, Nyoman D. Kurniawan, Yaniv Gal, Quang M. Tieng, Katie L. Mcmahon, Viktor Vegh, David C. Reutens, Yang Zhengyi
- titre
- lop-DWI: A Novel Scheme for Pre-Processing of Diffusion Weighted Images in the Gradient Direction Domain
- article
- Frontiers in Neurology, 2015, 5 (290), ⟨10.3389/fneur.2014.00290⟩
- identifiant
- hal-01103577
- DOI
- DOI : 10.3389/fneur.2014.00290
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-
2014
Journal articles
- auteur
- Alessandro Daducci, Erick Canales Rodgriguez, Maxime Descoteaux, Eleftherios Garyfallidis, Yaniv Gur, Ying Chia Lin, Merry Mani, Sylvain L. Merlet, Michael Paquette, Alonso Ramirez-Manzanares, Marco Reisert, Paulo Reis Rodrigues, Farshid Sepehrband, Emmanuel Caruyer, Jeiran Choupan, Rachid Deriche, Mathews Jacob, Gloria Menegaz, Vesna Prckovska, Mariano Rivera, Yves Wiaux, Jean-Philippe Thiran
- titre
- Quantitative comparison of reconstruction methods for intra-voxel fiber recovery from diffusion MRI
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2014, 99, pp.384-399. ⟨10.1109/TMI.2013.2285500⟩
- identifiant
- hal-00908289
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2013.2285500
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-
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Luke Bloy, Birkan Tunç, Jérémy Lecoeur, Varsha Shankar, Ragini Verma
- titre
- A comparative study of 16 tractography algorithms for the corticospinal tract: reproducibility and subject-specificity
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy
- identifiant
- hal-00944649
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Maxime Descoteaux, Jean-Christophe Houde, Jean-Philippe Thiran, Ragini Verma
- titre
- Phantomas: a flexible software library to simulate diffusion MR phantoms
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy
- identifiant
- hal-00944644
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Ragini Verma
- titre
- Rotation-invariant measures for population study in HARDI
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy
- identifiant
- hal-00944646
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-
- auteur
- Jean-Christophe Houde, Emmanuel Caruyer, Alessandro Daducci, Maxime Descoteaux
- titre
- How should tractography go forward? A Tractometer evaluation of local reconstruction and tracking
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.6470
- identifiant
- hal-01033816
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-
- auteur
- Jérémy Lecoeur, Emmanuel Caruyer, Mark Elliott, Steven Brem, Luke Macyszyn, Ragini Verma
- titre
- Addressing the Challenge of Edema in Fiber Tracking
- article
- MICCAI 2014 DTI Tractography Challenge, Sep 2014, Boston, United States
- identifiant
- hal-01072222
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-
2013
Journal articles
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Design of multishell sampling schemes with uniform coverage in diffusion MRI
- article
- Magnetic Resonance in Medicine, 2013, 69 (6), pp.1534-1540. ⟨10.1002/mrm.24736⟩
- identifiant
- hal-00821688
- DOI
- DOI : 10.1002/mrm.24736
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Motion Detection in Diffusion MRI via Online ODF Estimation
- article
- International Journal of Biomedical Imaging, 2013, 2013 (Article ID 84936), pp.1-8. ⟨10.1155/2013/849363⟩
- identifiant
- hal-00798582
- DOI
- DOI : 10.1155/2013/849363
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-
- auteur
- Sylvain L. Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
- titre
- A computational diffusion MRI and parametric dictionary learning framework for modeling the diffusion signal and its features
- article
- Medical Image Analysis, 2013, pp.MEDIMA779. ⟨10.1016/j.media.2013.04.011⟩
- identifiant
- hal-00820817
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2013.04.011
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-
Conference papers
- auteur
- Jérémy Lecoeur, Emmanuel Caruyer, Luke Macyszyn, Ragini Verma
- titre
- Improving White Matter Tractography by Resolving the Challenges of Edema
- article
- MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge, Sep 2013, Nagoya, Japan
- identifiant
- hal-00850496
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-
2012
Journal articles
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Diffusion MRI Signal Reconstruction with Continuity Constraint and Optimal Regularization
- article
- Medical Image Analysis, 2012, 16 (6), pp.1113-1120. ⟨10.1016/j.media.2012.06.011⟩
- identifiant
- hal-00711883
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2012.06.011
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-
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- A Computational Framework for Experimental Design in Diffusion MRI
- article
- CDMRI - MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI, Oct 2012, Nice, France
- identifiant
- hal-00747700
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Optimal Regularization for MR Diffusion Signal Reconstruction
- article
- ISBI - 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Barcelona, Spain
- identifiant
- hal-00660635
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-
- auteur
- Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Parametric dictionary learning for modeling EAP and ODF in diffusion MRI
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. 8 p
- identifiant
- hal-00728067
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-
- auteur
- Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Rachid Deriche
- titre
- Parametric Dictionary Learning in Diffusion MRI
- article
- HARDI reconstruction workshop - ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Alessandro Daducci and Jean-Philippe Thiran and Yves Wiaux, May 2012, Barcelona, Spain
- identifiant
- hal-00697102
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-
Theses
- auteur
- Emmanuel Caruyer
- titre
- IRM de diffusion du Q-space : Acquisition et pré-traitements
- article
- Medical Imaging. Université Nice Sophia Antipolis, 2012. English. ⟨NNT : ⟩
- identifiant
- tel-00750144
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-
2011
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Jian Cheng, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
- titre
- Optimal Design of Multiple Q-shells experiments for Diffusion MRI
- article
- MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI - CDMRI'11, Sep 2011, Toronto, Canada
- identifiant
- inria-00617663
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-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Incremental gradient table for multiple Q-shells diffusion MRI
- article
- HBM 17th Annual Meeting, Jun 2011, Québec, Canada
- identifiant
- inria-00617957
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- On Line Reconstruction and Motion Detection in HARDI
- article
- 19th ISMRM annual meeting, May 2011, Montréal, Canada
- identifiant
- inria-00560899
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Online Motion Detection in High Angular Resolution Diffusion Imaging
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Mar 2011, Chicago, United States
- identifiant
- inria-00559904
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Jian Cheng, Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Aurobrata Ghosh, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
- titre
- Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
- article
- MICCAI Workshop on Computational Diffusion MRI - CDMRI'11, Sep 2011, Toronto, Canada
- identifiant
- inria-00615434
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Jian Cheng, Sylvain Merlet, Aurobrata Ghosh, Emmanuel Caruyer, Tianzi Jiang, Rachid Deriche
- titre
- Compressive Sensing Ensemble Average Propagator Estimation via L1 Spherical Polar Fourier Imaging
- article
- ISMRM, May 2011, Montréal, Canada
- identifiant
- inria-00615437
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Sylvain Merlet, Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Impact of radial and angular sampling on multiple shells acquisition in diffusion MRI
- article
- MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.113-121
- identifiant
- hal-00614387
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2010
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Ryan Muetzel, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in HARDI
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands
- identifiant
- inria-00559884
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2009
Conference papers
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Rachid Deriche
- titre
- Adaptive Design of Sampling Directions in Diffusion Tensor MRI and Validation on Human Brain Images
- article
- MICCAI Workshop on Diffusion Modelling and the Fiber Cup, Sep 2009, Londres, United Kingdom
- identifiant
- inria-00560054
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
- auteur
- Emmanuel Caruyer, Iman Aganj, Christophe Lenglet, Guillermo Sapiro, Rachid Deriche
- titre
- Online orientation distribution function reconstruction in constant solid angle and its application to motion detection in high angular resolution diffusion imaging
- article
- [Research Report] RR-7102, INRIA. 2009, pp.12
- identifiant
- inria-00432959
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Master thesis
- auteur
- Emmanuel Caruyer
- titre
- Signal and Noise in Diffusion Magnetic Resonance Images
- article
- Medical Imaging. 2007
- identifiant
- dumas-00880381
- Accès au texte intégral et bibtex
-