2020
- titre
- Subject‐specific segregation of functional territories based on deep phenotyping
- auteur_8max
- Ana Luísa Pinho, Alexis Amadon, Murielle Fabre, Elvis Dohmatob, Isabelle Denghien, Juan Jesús Torres, Chantal Ginisty, Séverine Becuwe-Desmidt, Séverine Roger, Laurence Laurier, Véronique Joly-Testault, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Philippe Pinel, Evelyn Eger, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz‐pannier, Bertrand Thirion
- article
- Human Brain Mapping, Wiley, 2020, ⟨10.1002/hbm.25189⟩
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-
- titre
- A Lightweight Neural Model for Biomedical Entity Linking
- auteur_8max
- Lihu Chen, Gaël Varoquaux, Fabian Suchanek
- article
- 2020
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-
- titre
- NeuMiss networks: differentiable programming for supervised learning with missing values
- auteur_8max
- Marine Le Morvan, Julie Josse, Thomas Moreau, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2020 - 34th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2020, Vancouver / Virtual, Canada
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-
- titre
- International electronic health record-derived COVID-19 clinical course profiles: the 4CE consortium
- auteur_8max
- Gabriel Brat, Griffin Weber, Nils Gehlenborg, Paul Avillach, Nathan Palmer, Luca Chiovato, James Cimino, Brett Beaulieu-Jones, Sehi L’ Yi, Mark Keller, Douglas Bell, Robert Follett, Lav Patel, Anne Jannot, Lemuel Waitman, Gilbert Omenn, Alberto Malovini, Jason Moore, Valentina Tibollo, Shawn Murphy, Riccardo Bellazzi, David Hanauer, Arnaud Serret-Larmande, Alba Gutierrez-Sacristan, John Holmes, Douglas Bell, Kenneth Mandl, Jeffrey Klann, Douglas Murad, Luigia Scudeller, Mauro Bucalo, Katie Kirchoff, Jean Craig, Jihad Obeid, Vianney Jouhet, Romain Griffier, Sébastien Cossin, Bertrand Moal, Antonio Bellasi, Hans Prokosch, Detlef Kraska, Piotr Sliz, Amelia Tan, Kee Yuan Ngiam, Alberto Zambelli, Danielle Mowery, Emily Schiver, Batsal Devkota, Robert Bradford, Mohamad Daniar, Christel Daniel, Vincent Benoit, Romain Bey, Nicolas Paris, Patricia Serre, Nina Orlova, Julien Dubiel, Martin Hilka, Stephane Breant, Judith Leblanc, Nicolas Griffon, Anita Burgun, Melodie Bernaux, Arnaud Sandrin, Elisa Salamanca, Sylvie Cormont, Thomas Ganslandt, Tobias Gradinger, Julien Champ, Martin Boeker, Patricia Martel, Loïc Estève, Alexandre Gramfort, Olivier Grisel, Damien Leprovost, Thomas Moreau, Gael Varoquaux, Jill-Jênn Vie, Demian Wassermann, Arthur Mensch, Charlotte Caucheteux, Christian Haverkamp, Guillaume Lemaître, Silvano Bosari, Andrew South, Tianxi Cai, Isaac Kohane
- article
- npj Digital Medicine, Nature Research 2020, 3 (1), pp.#109. ⟨10.1038/s41746-020-00308-0⟩
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-
- titre
- Causal inference methods for combining randomized trials and observational studies: a review
- auteur_8max
- Bénédicte Colnet, Imke Mayer, Guanhua Chen, Awa Dieng, Ruohong Li, Gaël Varoquaux, Jean-Philippe Vert, Julie Josse, Shu Yang
- article
- 2020
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-
- titre
- Hydroxychloroquine with or without azithromycin and in-hospital mortality or discharge in patients hospitalized for COVID-19 infection: a cohort study of 4,642 in-patients in France
- auteur_8max
- Emilie Sbidian, Julie Josse, Guillaume Lemaitre, Imke Mayer, Melodie Bernaux, Alexandre Gramfort, Nathanaël Lapidus, Nicolas Paris, Antoine Neuraz, Ivan Lerner, Nicolas Garcelon, Bastien Rance, Olivier Grisel, Thomas Moreau, Ali Bellamine, Pierre Wolkenstein, Gaël Varoquaux, Eric Caumes, Marc Lavielle, Armand Mekontso Dessap, Etienne Audureau
- article
- 2020
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-
- titre
- Beyond brain age: Empirically-derived proxy measures of mental health
- auteur_8max
- Kamalaker Dadi, Gael Varoquaux, Josselin Houenou, Danilo Bzdok, Bertrand Thirion, Denis Engemann
- article
- 2020
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-
- titre
- Individual Brain Charting dataset extension, second release of high-resolution fMRI data for cognitive mapping
- auteur_8max
- Ana Luísa Pinho, Alexis Amadon, Baptiste Gauthier, Nicolas Clairis, André Knops, Sarah Genon, Elvis Dohmatob, Juan Jesús Torre, Chantal Ginisty, Séverine Becuwe-Desmidt, Séverine Roger, Yann Lecomte, Valérie Berland, Laurence Laurier, Véronique Joly-Testault, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Eric Salmon, Manuela Piazza, David Melcher, Mathias Pessiglione, Virginie van Wassenhove, Evelyn Eger, Gaël Varoquaux, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz-Pannier, Bertrand Thirion
- article
- Scientific Data , Nature Publishing Group, 2020, 7 (1), ⟨10.1038/s41597-020-00670-4⟩
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-
- titre
- Fine-grain atlases of functional modes for fMRI analysis
- auteur_8max
- Kamalaker Dadi, Gaël Varoquaux, Antonia Machlouzarides-Shalit, Krzysztof Gorgolewski, Demian Wassermann, Bertrand Thirion, Arthur Mensch
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2020, pp.117126
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-
- titre
- On the consistency of supervised learning with missing values
- auteur_8max
- Julie Josse, Nicolas Prost, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
- article
- 2020
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-
- titre
- Combining magnetoencephalography with magnetic resonance imaging enhances learning of surrogate-biomarkers
- auteur_8max
- Denis Engemann, Oleh Kozynets, David Sabbagh, Guillaume Lemaître, Gaël Varoquaux, Franziskus Liem, Alexandre Gramfort
- article
- eLife, eLife Sciences Publication, 2020, ⟨10.7554/eLife.54055⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Predictive regression modeling with MEG/EEG: from source power to signals and cognitive states
- auteur_8max
- David Sabbagh, Pierre Ablin, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Denis Engemann
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2020, ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.116893⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- NeuroQuery, comprehensive meta-analysis of human brain mapping
- auteur_8max
- Jérôme Dockès, Russell Poldrack, Romain Primet, Hande Gözükan, Tal Yarkoni, Fabian Suchanek, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- eLife, eLife Sciences Publication, 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fine-grain atlases of functional modes for fMRI analysis
- auteur_8max
- Kamalaker Dadi, Gaël Varoquaux, Antonia Machlouzarides-Shalit, Krzysztof Jacek Gorgolewski, Demian Wassermann, Bertrand Thirion, Arthur Mensch
- article
- 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Survey of machine-learning experimental methods at NeurIPS2019 and ICLR2020
- auteur_8max
- Xavier Bouthillier, Gaël Varoquaux
- article
- [Research Report] Inria Saclay Ile de France. 2020
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-
- titre
- Linear predictor on linearly-generated data with missing values: non consistency and solutions
- auteur_8max
- Marine Le Morvan, Nicolas Prost, Julie Josse, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
- article
- Proceedings of Machine Learning Research, PMLR, In press
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-
- titre
- Encoding high-cardinality string categorical variables
- auteur_8max
- Patricio Cerda, Gaël Varoquaux
- article
- IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, In press, ⟨10.1109/TKDE.2020.2992529⟩
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-
2019
- titre
- Feature Grouping as a Stochastic Regularizer for High-Dimensional Structured Data
- auteur_8max
- Sergül Aydöre, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2019 - 33th Annual Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparing distributions: $l1$ geometry improves kernel two-sample testing
- auteur_8max
- Meyer Scetbon, Gaël Varoquaux
- article
- NeurIPS 2019 - 33th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Manifold-regression to predict from MEG/EEG brain signals without source modeling
- auteur_8max
- David Sabbagh, Pierre Ablin, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Denis Engemann
- article
- NeurIPS 2019 - 33th Annual Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2019, Vancouver, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Brain-based ranking of cognitive domains to predict schizophrenia
- auteur_8max
- Teresa Karrer, Danielle S. Bassett, Birgit Derntl, Oliver Gruber, Andre Aleman, Renaud Jardri, Angela Laird, Peter Fox, Simon Eickhoff, Olivier Grisel, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Human Brain Mapping, Wiley, 2019, ⟨10.1002/hbm.24716⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Benchmarking functional connectome-based predictive models for resting-state fMRI
- auteur_8max
- Kamalaker Dadi, Mehdi Rahim, Alexandre Abraham, Darya Chyzhyk, Michael Milham, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2019, pp.115-134. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.02.062⟩
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-
- titre
- Predictive models avoid excessive reductionism in cognitive neuroimaging
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Russell Poldrack
- article
- Current Opinion in Neurobiology, Elsevier, In press, 55, ⟨10.1016/j.conb.2018.11.002⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Population shrinkage of covariance (PoSCE) for better individual brain functional-connectivity estimation
- auteur_8max
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Analysis, Elsevier, 2019, ⟨10.1016/j.media.2019.03.001⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2018
- titre
- Atlases of cognition with large-scale human brain mapping
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Russell Poldrack, Baptiste Gauthier, Danilo Bzdok, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2018, 14 (11), pp.e1006565. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006565⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Approximate message-passing for convex optimization with non-separable penalties
- auteur_8max
- Andre Manoel, Florent Krzakala, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Lenka Zdeborová
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Subspecialization within default mode nodes characterized in 10,000 UK Biobank participants
- auteur_8max
- Julius Kernbach, B Yeo, Jonathan Smallwood, Daniel Margulies, Michel Thiebaut de Schotten, Henrik Walter, Mert Sabuncu, Avram Holmes, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2018, ⟨10.1073/pnas.1804876115⟩
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-
- titre
- Extracting Universal Representations of Cognition across Brain-Imaging Studies
- auteur_8max
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Text to brain: predicting the spatial distribution of neuroimaging observations from text reports
- auteur_8max
- Jérôme Dockès, Demian Wassermann, Russell Poldrack, Fabian Suchanek, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- MICCAI 2018 - 21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2018, Granada, Spain. pp.1-18
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Shared Endo-phenotypes of Default Mode Dysfunction in Attention Deficit/Hyperactivity Disorder and Autism Spectrum Disorder
- auteur_8max
- Julius Kernbach, Theodore Satterthwaite, Danielle S. Bassett, Jonathan Smallwood, Daniel Margulies, Sarah Krall, Philip Shaw, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Kerstin Konrad, Danilo Bzdok
- article
- Translational Psychiatry, Nature Pub. Group, 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Individual Brain Charting, a high-resolution fMRI dataset for cognitive mapping
- auteur_8max
- Ana Pinho, Alexis Amadon, Torsten Ruest, Murielle Fabre, Elvis Dohmatob, Isabelle Denghien, Chantal Ginisty, Séverine Becuwe-Desmidt, Séverine Roger, Laurence Laurier, Véronique Joly-Testault, Gaëlle Médiouni-Cloarec, Christine Doublé, Bernadette Martins, Philippe Pinel, Evelyn Eger, Gael Varoquaux, Christophe Pallier, Stanislas Dehaene, Lucie Hertz-Pannier, Bertrand Thirion
- article
- Scientific Data , Nature Publishing Group, 2018, 5, pp.180105. ⟨10.1038/sdata.2018.105⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Similarity encoding for learning with dirty categorical variables
- auteur_8max
- Patricio Cerda, Gaël Varoquaux, Balázs Kégl
- article
- Machine Learning, Springer Verlag, 2018, ⟨10.1007/s10994-018-5724-2⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Controlling a confound in predictive models with a test set minimizing its effect
- auteur_8max
- Darya Chyzhyk, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Michael Milham
- article
- PRNI 2018 - 8th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Prediction and inference diverge in biomedicine: Simulations and real-world data
- auteur_8max
- Danilo Bzdok, Denis Engemann, Olivier Grisel, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inter-subject registration of functional images: do we need anatomical images ?
- auteur_8max
- Elvis Dohmatob, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Frontiers in Neuroscience, Frontiers, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Different shades of default mode disturbance in schizophrenia: Subnodal covariance estimation in structure and function
- auteur_8max
- Jeremy Lefort-Besnard, Danielle S Bassett, Jonathan Smallwood, Daniel S. Margulies, Birgit Derntl, Oliver Gruber, Andre Aleman, Renaud Jardri, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Simon Eickhoff, Danilo Bzdok
- article
- Human Brain Mapping, Wiley, 2018, pp.1-52
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stochastic Subsampling for Factorizing Huge Matrices
- auteur_8max
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- IEEE Transactions on Signal Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 66 (1), pp.113-128. ⟨10.1109/TSP.2017.2752697⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Patterns of Schizophrenia Symptoms: Hidden Structure in the PANSS Questionnaire
- auteur_8max
- Jeremy Lefort-Besnard, Gaël Varoquaux, Birgit Derntl, Oliver Gruber, Andre Aleman, Renaud Jardri, Iris Sommer, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Translational Psychiatry, Nature Pub. Group, In press, ⟨10.1038/s41398-018-0294-4⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Atlases of cognition with large-scale brain mapping
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Russell Poldrack, Baptiste Gauthier, Danilo Bzdok, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- PLoS Computational Biology, Public Library of Science, In press
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
- titre
- Learning Neural Representations of Human Cognition across Many fMRI Studies
- auteur_8max
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Danilo Bzdok, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Neural Information Processing Systems, Dec 2017, Long Beach, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Label scarcity in biomedicine: Data-rich latent factor discovery enhances phenotype prediction
- auteur_8max
- Marc-Andre Schulz, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok
- article
- Neural Information Processing Systems, Machine Learning in Health Workshop, Dec 2017, Long Beach, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Population-shrinkage of covariance to estimate better brain functional connectivity
- auteur_8max
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions, Sep 2017, Quebec city, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Relating Brain Structures To Open-Ended Descriptions Of Cognition
- auteur_8max
- Jérôme Dockès, Olivier Grisel, Joan Massich, Fabian Suchanek, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- CCN 2017 - Conference on Cognitive Computational Neuroscience, Sep 2017, New York, United States. 10 (2), pp.59 - 63, 2017, ⟨10.1016/j.tics.2005.12.004⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Decoding fMRI activity in the time domain improves classification performance
- auteur_8max
- João Loula, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.08.018⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Learning to Discover Sparse Graphical Models
- auteur_8max
- Eugene Belilovsky, Kyle Kastner, Gaël Varoquaux, Matthew Blaschko
- article
- International Conference on Machine Learning , Aug 2017, Sydney, Australia
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hierarchical Region-Network Sparsity for High-Dimensional Inference in Brain Imaging
- auteur_8max
- Danilo Bzdok, Michael Eickenberg, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- International conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI) 2017, Jun 2017, Boone, North Carolina, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Joint prediction of multiple scores captures better individual traits from brain images
- auteur_8max
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Danilo Bzdok, Irène Buvat, Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.06.072⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cross-validation failure: small sample sizes lead to large error bars
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.06.061⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards a Faster Randomized Parcellation Based Inference
- auteur_8max
- Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2017 - 7th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2017, Toronto, Canada
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-output predictions from neuroimaging: assessing reduced-rank linear models
- auteur_8max
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI 2017 - The 7th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.1 - 4, ⟨10.1109/PRNI.2017.7981504⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Distinct alterations in Parkinson's Medication-state and Disease-state Connectivity Running Title: PD altered connectivity
- auteur_8max
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Michael Greicius, Kathleen Poston
- article
- Neuroimage-Clinical, Elsevier, 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- FReM – scalable and stable decoding with fast regularized ensemble of models
- auteur_8max
- Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2017, pp.1-16. ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.10.005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
- titre
- Subsampled online matrix factorization with convergence guarantees
- auteur_8max
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NIPS Workshop on Optimization for Machine Learning, Dec 2016, Barcelone, Spain
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Testing for Differences in Gaussian Graphical Models: Applications to Brain Connectivity
- auteur_8max
- Eugene Belilovsky, Gaël Varoquaux, Matthew B. Blaschko
- article
- Neural Information Processing Systems (NIPS) 2016, Dec 2016, Barcelona, Spain
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Learning brain regions via large-scale online structured sparse dictionary-learning
- auteur_8max
- Elvis Dohmatob, Arthur Mensch, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Neural Information Processing Systems (NIPS), Dec 2016, Barcelona, Spain
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deriving reproducible biomarkers from multi-site resting-state data: An Autism-based example
- auteur_8max
- Alexandre Abraham, Michael Milham, Adriana Di Martino, R. Cameron Craddock, Dimitris Samaras, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.10.045⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exploring the anatomical encoding of voice with a mathematical model of the vocal system.
- auteur_8max
- M Florencia Assaneo, Jacobo Sitt, Gaël Varoquaux, Mariano Sigman, Laurent Cohen, Marcos A Trevisan
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2016, 141, pp.31-9. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.07.033⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Predicting brain-age from multimodal imaging data captures cognitive impairment
- auteur_8max
- Franziskus Liem, Gaël Varoquaux, Jana Kynast, Frauke Beyer, Shahrzad Kharabian Masouleh, Julia M. Huntenburg, Leonie Lampe, Mehdi Rahim, Alexandre Abraham, R. Cameron Craddock, Steffi Riedel-Heller, Tobias Luck, Markus Loeffler, Matthias L. Schroeter, Anja Veronica Witte, Daniel S. Margulies
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.11.005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Transmodal Learning of Functional Networks for Alzheimer's Disease Prediction
- auteur_8max
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Claude Comtat, Gaël Varoquaux
- article
- IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing, IEEE, 2016, 10 (7), pp.1204 - 1213. ⟨10.1109/JSTSP.2016.2600400⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Recursive nearest agglomeration (ReNA): fast clustering for approximation of structured signals
- auteur_8max
- Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Jonas Kahn, Bertrand Thirion
- article
- IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, In press, XX, ⟨10.1109/TPAMI.2018.2815524⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Neuroimaging Research: From Null-Hypothesis Falsification to Out-of-sample Generalization
- auteur_8max
- Danilo Bzdok, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Educational and Psychological Measurement, SAGE Publications, 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Brain Imaging Data Structure: a format for organizing and describing neuroimaging data
- auteur_8max
- Krzysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Vince D Calhoun, Cameron Craddock, Samir Das, Eugene Duff, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Tristan Glatard, Yaroslav Halchenko, Daniel Handwerker, Michael Hanke, David Keator, Xiangrui Li, Zachary Michael, Camille Maumet, B. Nolan Nichols, Thomas E Nichols, Jean-Baptiste Poline, Ariel Rokem, Gunnar Schaefer, Vanessa Sochat, Jessica Turner, Gaël Varoquaux, Russell Poldrack
- article
- 22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2016), Jun 2016, Geneva, Switzerland
- Accès au bibtex
-
- titre
- Social-sparsity brain decoders: faster spatial sparsity
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Matthieu Kowalski, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2016, Trento, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fast brain decoding with random sampling and random projections
- auteur_8max
- Andrés Hoyos-Idrobo, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2016: the 6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2016, Trento, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparing functional connectivity based predictive models across datasets
- auteur_8max
- Kamalaker Dadi, Alexandre Abraham, Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI 2016: 6th International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2016, Trento, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The brain imaging data structure, a format for organizing and describing outputs of neuroimaging experiments
- auteur_8max
- Krzysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Vince Calhoun, Cameron Craddock, Samir Das, Eugene Duff, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Tristan Glatard, Yaroslav Halchenko, Daniel Handwerker, Michael Hanke, David Keator, Xiangrui Li, Zachary Michael, Camille Maumet, Nolan Nichols, Thomas Nichols, John Pellman, Jean-Baptiste Poline, Ariel Rokem, Gunnar Schaefer, Vanessa Sochat, William Triplett, Jessica Turner, Gaël Varoquaux, Russell Poldrack
- article
- Scientific Data , Nature Publishing Group, 2016, 3, pp.160044. ⟨10.1038/sdata.2016.44⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dictionary Learning for Massive Matrix Factorization
- auteur_8max
- Arthur Mensch, Julien Mairal, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- International Conference on Machine Learning, Jun 2016, New York, United States. pp.1737-1746
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Formal Models of the Network Co-occurrence Underlying Mental Operations
- auteur_8max
- Danilo Bzdok, Gaël Varoquaux, Olivier Grisel, Michael Eickenberg, Cyril Poupon, Bertrand Thirion
- article
- PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2016, ⟨10.1371/journal.pcbi.1004994⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Compressed Online Dictionary Learning for Fast Resting-State fMRI Decomposition
- auteur_8max
- Arthur Mensch, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging, IEEE, Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.1282-1285, ⟨10.1109/ISBI.2016.7493501⟩
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-
- titre
- Local Q-Linear Convergence and Finite-time Active Set Identification of ADMM on a Class of Penalized Regression Problems
- auteur_8max
- Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- ICASSP, International Conference on Acoustics, Speach, and Signal Processing, Mar 2016, http://icassp2016.org/default.asp, China
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-
- titre
- Connectivity-Based Parcellation: Critique and Implications
- auteur_8max
- Simon Eickhoff, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Danilo Bzdok
- article
- Human Brain Mapping, Wiley, 2016, pp.22. ⟨10.1002/hbm.22933⟩
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-
- titre
- Beyond computational reproducibility, let us aim for reusability
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux
- article
- IEEE CIS Newsletter on Cognitive and Developmental Systems, IEEE CIS Technical Committee on CDS, 2016, What is Computational Reproducibility?, 13 (2)
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-
- titre
- Seeing it all: Convolutional network layers map the function of the human visual system
- auteur_8max
- Michael Eickenberg, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.10.001⟩
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-
- titre
- Assessing and tuning brain decoders: cross-validation, caveats, and guidelines
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Pradeep Reddy Raamana, Denis Engemann, Andrés Hoyos-Idrobo, Yannick Schwartz, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2016, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.10.038⟩
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-
2015
- titre
- Semi-Supervised Factored Logistic Regression for High-Dimensional Neuroimaging Data
- auteur_8max
- Danilo Bzdok, Michael Eickenberg, Olivier Grisel, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NIPS'15: 28th International Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2015, Montreal, Canada
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-
- titre
- Integrating Multimodal Priors in Predictive Models for the Functional Characterization of Alzheimer's Disease
- auteur_8max
- Mehdi Rahim, Bertrand Thirion, Alexandre Abraham, Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Claude Comtat, Gael Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-24553-9_26⟩
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-
- titre
- Total Variation meets Sparsity: statistical learning with segmenting penalties
- auteur_8max
- Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer Aided Intervention (MICCAI), Oct 2015, München, Germany
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-
- titre
- FAASTA: A fast solver for total-variation regularization of ill-conditioned problems with application to brain imaging
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Michael Eickenberg, Elvis Dohmatob, Bertand Thirion
- article
- Colloque GRETSI, P. Gonçalves, P. Abry, Sep 2015, Lyon, France
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-
- titre
- Correlations of correlations are not reliable statistics: implications for multivariate pattern analysis.
- auteur_8max
- Bertrand Thirion, Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Gaël Varoquaux
- article
- ICML Workshop on Statistics, Machine Learning and Neuroscience (Stamlins 2015), Bertrand Thirion, Lars Kai Hansen, Sanmi Koyejo, Jul 2015, Lille, France
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-
- titre
- Fast clustering for scalable statistical analysis on structured images
- auteur_8max
- Bertrand Thirion, Andrés Hoyos-Idrobo, Jonas Kahn, Gaël Varoquaux
- article
- ICML Workshop on Statistics, Machine Learning and Neuroscience (Stamlins 2015), Bertrand Thirion, Lars Kai Hansen, Sanmi Koyejo, Jul 2015, Lille, France
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-
- titre
- Convex relaxations of penalties for sparse correlated variables with bounded total variation
- auteur_8max
- Eugene Belilovsky, Andreas Argyriou, Gaël Varoquaux, Matthew Blaschko
- article
- Machine Learning, Springer Verlag, 2015, pp.1-21. ⟨10.1007/s10994-015-5511-2⟩
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-
- titre
- NeuroVault.org: new features and a proof of concept analysis
- auteur_8max
- Krzysztof Gorgolewski, Gaël Varoquaux, Gabriel Rivera, Joseph Wexler, Yannick Schwartz, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Thomas E Nichols, Jean Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel Margulies, Russell Poldrack
- article
- 21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
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-
- titre
- SpaceNet: Multivariate brain decoding and segmentation
- auteur_8max
- Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- OHBM, Jun 2015, Honolulu, Hawaii, United States
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-
- titre
- Speeding-up model-selection in GraphNet via early-stopping and univariate feature-screening
- auteur_8max
- Elvis Dohmatob, Michael Eickenberg, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI, Jun 2015, Stanford, United States
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-
- titre
- Improving sparse recovery on structured images with bagged clustering
- auteur_8max
- Andrés Hoyos-Idrobo, Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- International Workshop On Pattern Recognition In Neuroimaging (PRNI), 2015, Jun 2015, Palo alto, United States
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-
- titre
- NeuroVault.org: a web-based repository for collecting and sharing unthresholded statistical maps of the human brain
- auteur_8max
- Krzysztof Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwarz, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Vanessa Sochat, Thomas Nichols, Russell Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel Margulies
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2015, 9 (8), ⟨10.3389/fninf.2015.00008⟩
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-
- titre
- NeuroVault.org: A repository for sharing unthresholded statistical maps, parcellations, and atlases of the human brain
- auteur_8max
- Krzysztof Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwartz, Vanessa Sochat, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Thomas Nichols, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel Margulies, Russell Poldrack
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2015, 124 (Pt B), pp.1242-1244. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.04.016⟩
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-
- titre
- Transport on Riemannian Manifold for Connectivity-based Brain Decoding
- auteur_8max
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Michael D Greicius, Bertrand Thirion
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, PP (99), pp.9. ⟨10.1109/TMI.2015.2463723⟩
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-
- titre
- Scipy Lecture Notes
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Emmanuelle Gouillart, Olav Vahtras, Valentin Haenel, Nicolas P. Rougier, Ralf Gommers, Fabian Pedregosa, Zbigniew Jędrzejewski-Szmek, Pauli Virtanen, Christophe Combelles, Didrik Pinte, Robert Cimrman, André Espaze, Adrien Chauve, Christopher Burns
- article
- Zenodo, 2015, ⟨10.5281/zenodo.31736⟩
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-
2014
- titre
- Identification of Mood-Relevant Brain Connections Using a Continuous, Subject-Driven Rumination Paradigm.
- auteur_8max
- Anna-Clare Milazzo, Bernard Ng, Heidi Jiang, William Shirer, Gael Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Michael D Greicius
- article
- Cerebral Cortex, Oxford University Press (OUP), 2014, pp.12
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-
- titre
- Principal Component Regression predicts functional responses across individuals
- auteur_8max
- Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Olivier Grisel, Cyril Poupon, Philippe Pinel
- article
- MICCAI, Sep 2014, Boston, United States
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-
- titre
- Deriving a multi-subject functional-connectivity atlas to inform connectome estimation
- auteur_8max
- Ronald Phlypo, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. pp.185-192, ⟨10.1007/978-3-319-10443-0_24⟩
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-
- titre
- Transport on Riemannian Manifold for Functional Connectivity-based Classification
- auteur_8max
- Bernard Ng, Martin Dressler, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Michael Greicius, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI - 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Polina Golland, Sep 2014, Boston, United States
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-
- titre
- Region segmentation for sparse decompositions: better brain parcellations from rest fMRI
- auteur_8max
- Alexandre Abraham, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Dimitris Samaras, Gael Varoquaux
- article
- Sparsity Techniques in Medical Imaging, Sep 2014, Boston, United States. pp.8
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-
- titre
- Benchmarking solvers for TV-l1 least-squares and logistic regression in brain imaging
- auteur_8max
- Elvis Dohmatob, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- PRNI 2014 - 4th International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2014, Tübingen, Germany
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-
- titre
- Which fMRI clustering gives good brain parcellations?
- auteur_8max
- Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Elvis Dohmatob, Jean-Baptiste Poline
- article
- Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2014, 8 (167), pp.13. ⟨10.3389/fnins.2014.00167⟩
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-
- titre
- Machine Learning Patterns for Neuroimaging-Genetic Studies in the Cloud
- auteur_8max
- Benoit da Mota, Radu Tudoran, Alexandru Costan, Gaël Varoquaux, Goetz Brasche, Patricia J. Conrod, Hervé Lemaitre, Tomáš Paus, Marcella Rietschel, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Gabriel Antoniu, Bertrand Thirion
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2014, Recent advances and the future generation of neuroinformatics infrastructure, 8, ⟨10.3389/fninf.2014.00031⟩
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-
- titre
- How machine learning is shaping cognitive neuroimaging
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- GigaScience, BioMed Central, 2014, 3, pp.28. ⟨10.1186/2047-217X-3-28⟩
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-
2013
- titre
- Mapping cognitive ontologies to and from the brain
- auteur_8max
- Yannick Schwartz, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- NIPS (Neural Information Processing Systems), Dec 2013, United States
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-
- titre
- Machine Learning for Neuroimaging with Scikit-Learn
- auteur_8max
- Alexandre Abraham, Fabian Pedregosa, Michael Eickenberg, Philippe Gervais, Andreas Muller, Jean Kossaifi, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2013, pp.15. ⟨10.3389/fninf.2014.00014⟩
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-
- titre
- Randomized parcellation based inference.
- auteur_8max
- Benoit da Mota, Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Tobias Banaschewski, Gareth J. Barker, Arun L. W. Bokde, Uli Bromberg, Patricia J. Conrod, Jürgen Gallinat, Hugh Garavan, Jean-Luc Martinot, Frauke Nees, Tomáš Paus, Zdenka Pausova, Marcella Rietschel, Michael N. Smolka, Andreas Ströhle, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2013, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.11.012⟩
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-
- titre
- Learning and comparing functional connectomes across subjects
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, R. Cameron Craddock
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2013, 80, pp.405-415. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.04.007⟩
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-
- titre
- API design for machine learning software: experiences from the scikit-learn project
- auteur_8max
- Lars Buitinck, Gilles Louppe, Mathieu Blondel, Fabian Pedregosa, Andreas Mueller, Olivier Grisel, Vlad Niculae, Peter Prettenhofer, Alexandre Gramfort, Jaques Grobler, Robert Layton, Jake Vanderplas, Arnaud Joly, Brian Holt, Gaël Varoquaux
- article
- European Conference on Machine Learning and Principles and Practices of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2013, Prague, Czech Republic
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-
- titre
- Enhancing the Reproducibility of Group Analysis with Randomized Brain Parcellations
- auteur_8max
- Benoit da Mota, Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Vincent Frouin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI - 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Implications of Inconsistencies between fMRI and dMRI on Multimodal Connectivity Estimation
- auteur_8max
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI - 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2013, Kensaku Mori, Sep 2013, Nagoya, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Extracting brain regions from rest fMRI with Total-Variation constrained dictionary learning
- auteur_8max
- Alexandre Abraham, Elvis Dohmatob, Bertrand Thirion, Dimitris Samaras, Gaël Varoquaux
- article
- MICCAI - 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan
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-
- titre
- A framework for inter-subject prediction of functional connectivity from structural networks
- auteur_8max
- Fani Deligianni, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, David Sharp, Christian Ledig, Robert Leech, Daniel Rueckert
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, epub ahead of print, ⟨10.1109/TMI.2013.2276916⟩
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-
- titre
- Cohort-level brain mapping: learning cognitive atoms to single out specialized regions
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Yannick Schwartz, Philippe Pinel, Bertrand Thirion
- article
- IPMI - Information Processing in Medical Imaging - 2013, William M. Wells, Sarang Joshi, Kilian M. Pohl, Jun 2013, Asilomar, United States. pp.438-449, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_37⟩
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-
- titre
- A Novel Sparse Group Gaussian Graphical Model for Functional Connectivity Estimation
- auteur_8max
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Jun 2013, Asilomar, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Comparison of Metrics and Algorithms for Fiber Clustering
- auteur_8max
- Viviana Siless, Sergio Medina, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robust Group-Level Inference in Neuroimaging Genetic Studies
- auteur_8max
- Virgile Fritsch, Benoit da Mota, Gaël Varoquaux, Vincent Frouin, Eva Loth, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in Neuroimaging, Jun 2013, Philadelphie, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hemodynamic estimation based on Consensus Clustering
- auteur_8max
- Solveig Badillo, Gaël Varoquaux, Philippe Ciuciu
- article
- PRNI 2013 -- 3rd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jun 2013, Philadelphia, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identifying predictive regions from fMRI with TV-L1 prior
- auteur_8max
- Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux
- article
- Pattern Recognition in Neuroimaging (PRNI), Jun 2013, Philadelphia, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Spatial vs. Temporal Features in ICA of Resting-State fMRI - A Quantitative and Qualitative Investigation in the Context of Response Inhibition
- auteur_8max
- Lixia Tian, Yazhuo Kong, Juejing Ren, Gaël Varoquaux, Yufeng Zang, Stephen Smith
- article
- PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, ⟨10.1371/journal.pone.0066572⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Publishing scientific software matters
- auteur_8max
- Christophe Pradal, Gaël Varoquaux, Hans Peter Langtangen
- article
- Journal of computational science, Elsevier, 2013, 4 (5), pp.311 - 312. ⟨10.1016/j.jocs.2013.08.001⟩
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-
2012
- titre
- Hyperfrontality and hypoconnectivity during refreshing in schizophrenia.
- auteur_8max
- Marie-Laure Grillon, Catherine Oppenheim, Gaël Varoquaux, Frédérique Charbonneau, Anne-Dominique Devauchelle, Marie-Odile Krebs, Franck Bayle, Bertrand Thirion, Caroline Huron
- article
- Psychiatry Research: Neuroimaging, Elsevier, 2012, 211 (3), pp.226-233. ⟨10.1016/j.pscychresns.2012.09.001⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Learning to rank from medical imaging data
- auteur_8max
- Fabian Pedregosa, Elodie Cauvet, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
- article
- Third International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging - MLMI 2012, INRIA, Oct 2012, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A MapReduce Approach for Ridge Regression in Neuroimaging-Genetic Studies
- auteur_8max
- Benoit da Mota, Michael Eickenberg, Soizic Laguitton, Vincent Frouin, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- DCICTIA-MICCAI - Data- and Compute-Intensive Clinical and Translational Imaging Applications in conjonction with the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2012, Oct 2012, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Non-parametric Density Modeling and Outlier Detection in Medical Imaging Datasets
- auteur_8max
- Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Machine Learning in Medical Imaging - Miccai 2012 workshop, Oct 2012, Nice, France. pp.207-214
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improving accuracy and power with transfer learning using a meta-analytic database
- auteur_8max
- Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Philippe Pinel, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- MICCAI, Oct 2012, Nice, France. pp.1-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Novel Sparse Graphical Approach for Multimodal Brain Connectivity Inference
- auteur_8max
- Bernard Ng, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A fast computational framework for genome-wide association studies with neuroimaging data
- auteur_8max
- Benoit da Mota, Vincent Frouin, Edouard Duchesnay, Soizic Laguitton, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- 20th International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT 2012), Aug 2012, Limassol, Cyprus
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Decoding Visual Percepts Induced by Word Reading with fMRI
- auteur_8max
- Alexandre Gramfort, Christophe Pallier, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition in NeuroImaging (PRNI), 2012 International Workshop on, Jul 2012, Londres, United Kingdom. pp.13-16, ⟨10.1109/PRNI.2012.20⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On spatial selectivity and prediction across conditions with fMRI
- auteur_8max
- Yannick Schwartz, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom. pp.53-56
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Connectivity-informed Sparse Classifiers for fMRI Brain Decoding
- auteur_8max
- Bernard Ng, Viviana Siless, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion, Rafeef Abugharbieh
- article
- Pattern Recognition in Neuroimaging, Christos Davatzikos, Moritz Grosse-Wentrup, Janaina Mourao-Miranda, Dimitri Van De Ville, Jul 2012, London, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improved brain pattern recovery through ranking approaches
- auteur_8max
- Fabian Pedregosa, Elodie Cauvet, Gaël Varoquaux, Christophe Pallier, Bertrand Thirion, Alexandre Gramfort
- article
- PRNI 2012 : 2nd International Workshop on Pattern Recognition in NeuroImaging, Jul 2012, London, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Small-sample brain mapping: sparse recovery on spatially correlated designs with randomization and clustering
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Bertrand Thirion
- article
- International Conference on Machine Learning, Andrew McCallum, Jun 2012, Edimbourg, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- PyXNAT: XNAT in Python
- auteur_8max
- Yannick Schwartz, Alexis Barbot, Benjamin Thyreau, Vincent Frouin, Gaël Varoquaux, Aditya Siram, Daniel Marcus, Jean-Baptiste Poline
- article
- Frontiers in Neuroinformatics, Frontiers, 2012, 6 (12), pp.1-14. ⟨10.3389/fninf.2012.00012⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Detecting Outliers in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Robust Covariance Estimators
- auteur_8max
- Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Benjamin Thyreau, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16, pp.1359-1370. ⟨10.1016/j.media.2012.05.002⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Markov models for fMRI correlation structure: is brain functional connectivity small world, or decomposable into networks?
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Journal of Physiology - Paris, Elsevier, 2012, 106, pp.212-221. ⟨10.1016/j.jphysparis.2012.01.001⟩
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-
- titre
- Changing computational research. The challenges ahead.
- auteur_8max
- Cameron Neylon, Jan Aerts, C Titus Brown, Simon J Coles, Les Hatton, Daniel Lemire, K Jarrod Millman, Peter Murray-Rust, Fernando Perez, Neil Saunders, Nigam Shah, Arfon Smith, Gaël Varoquaux, Egon Willighagen
- article
- Source Code for Biology and Medicine, BioMed Central, 2012, 7 (2), pp.2. ⟨10.1186/1751-0473-7-2⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- In Situ Synchrotron Microtomography Reveals Multiple Reaction Pathways During Soda-Lime Glass Synthesis
- auteur_8max
- Emmanuelle Gouillart, Michael-J. Toplis, Julien Grynberg, Marie-Hélène Chopinet, Elin Sondergard, Luc Salvo, Michel Suéry, Marco Di Michiel, Gaël Varoquaux
- article
- Journal of the American Ceramic Society, Wiley, 2012, 95 (5), pp.1504-1507. ⟨10.1111/j.1551-2916.2012.05151.x⟩
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-
2011
- titre
- A Comparative Study of Algorithms for Intra- and Inter-subjects fMRI Decoding
- auteur_8max
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Evelyn Eger, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- MLINI - Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging - 2011, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. pp.1-8, ⟨10.1007/978-3-642-34713-9_1⟩
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-
- titre
- Statistical Learning for Resting-State fMRI: Successes and Challenges
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- Machine Learning and Interpretation in Neuroimaging, NIPS workshop, Dec 2011, Sierra Nevada, Spain. pp.172-177, ⟨10.1007/978-3-642-34713-9_22⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Beyond brain reading: randomized sparsity and clustering to simultaneously predict and identify
- auteur_8max
- Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- NIPS 2011 MLINI Workshop, Dec 2011, Granada, Spain. pp.9-16, ⟨10.1007/978-3-642-34713-9_2⟩
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-
- titre
- Scikit-learn: Machine Learning in Python
- auteur_8max
- Fabian Pedregosa, Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Vincent Michel, Bertrand Thirion, Olivier Grisel, Mathieu Blondel, Peter Prettenhofer, Ron Weiss, Vincent Dubourg, Jake Vanderplas, Alexandre Passos, David Cournapeau, Matthieu Brucher, Matthieu Perrot, Édouard Duchesnay
- article
- Journal of Machine Learning Research, Microtome Publishing, 2011
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Connectivity-informed fMRI Activation Detection
- auteur_8max
- Bernard Ng, Abugharbieh Rafeef, Gaël Varoquaux, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computed Aided Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.285-292, ⟨10.1007/978-3-642-23629-7_35⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Detecting Outlying Subjects in High-Dimensional Neuroimaging Datasets with Regularized Minimum Covariance Determinant
- auteur_8max
- Virgile Fritsch, Gaël Varoquaux, Thyreau Benjamin, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. pp. 264-271, ⟨10.1007/978-3-642-23626-6_33⟩
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- titre
- A probabilistic framework to infer brain functional connectivity from anatomical connections
- auteur_8max
- Fani Deligianni, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion, Emma Robinson, David Sharp, David Edwards, Daniel Rueckert
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Gábor Székely, Horst Hahn, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. pp.296-307, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_25⟩
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- titre
- Multi-subject dictionary learning to segment an atlas of brain spontaneous activity
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Fabian Pedregosa, Vincent Michel, Bertrand Thirion
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Gábor Székely, Horst Hahn, Jul 2011, Kaufbeuren, Germany. pp.562-573, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_46⟩
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- titre
- A supervised clustering approach for fMRI-based inference of brain states
- auteur_8max
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Evelyn Eger, Christine Keribin, Bertrand Thirion
- article
- Pattern Recognition, Elsevier, 2011, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.patcog.2011.04.006⟩
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- titre
- MULTIFRACTAL ANALYSIS OF RESTING STATE NETWORKS IN FUNCTIONAL MRI
- auteur_8max
- Philippe Ciuciu, Gaël Varoquaux, Patrice Abry, Moty Almog
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2011, Chicago, United States. paper ID 1544
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- titre
- The NumPy array: a structure for efficient numerical computation
- auteur_8max
- Stefan van der Walt, S. Chris Colbert, Gaël Varoquaux
- article
- Computing in Science and Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 13 (2), pp.22-30. ⟨10.1109/MCSE.2011.37⟩
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- titre
- Total variation regularization for fMRI-based prediction of behaviour.
- auteur_8max
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Evelyn Eger, Bertrand Thirion
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (7), pp.1328 - 1340. ⟨10.1109/TMI.2011.2113378⟩
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-
- titre
- Mayavi: 3D visualization of scientific data
- auteur_8max
- Prabhu Ramachandran, Gaël Varoquaux
- article
- Computing in Science and Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 13 (2), pp.40-51. ⟨10.1109/MCSE.2011.35⟩
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-
2010
- titre
- Brain covariance selection: better individual functional connectivity models using population prior
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Alexandre Gramfort, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Advances in Neural Information Processing Systems, John Lafferty, Dec 2010, Vancouver, Canada
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-
- titre
- Detection of brain functional-connectivity difference in post-stroke patients using group-level covariance modeling
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Flore Baronnet, Andreas Kleinschmidt, Pierre Fillard, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Added Intervention, Tianzi Jiang, Sep 2010, Beijing, China. ⟨10.1007/978-3-642-15705-9_25⟩
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- titre
- Accurate Definition of Brain Regions Position Through the Functional Landmark Approach
- auteur_8max
- Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux, Jean-Baptiste Poline
- article
- 13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2010, Beijing, China
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- titre
- Total Variation regularization enhances regression-based brain activity prediction
- auteur_8max
- Vincent Michel, Alexandre Gramfort, Gaël Varoquaux, Bertrand Thirion
- article
- 1st ICPR Workshop on Brain Decoding - Pattern recognition challenges in neuroimaging - 20th International Conference on Pattern Recognition, Aug 2010, Istanbul, Turkey. pp.9-12, ⟨10.1109/WBD.2010.13⟩
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-
- titre
- A group model for stable multi-subject ICA on fMRI datasets.
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Sepideh Sadaghiani, Philippe Pinel, Andreas Kleinschmidt, Jean-Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- NeuroImage, Elsevier, 2010, 51 (1), pp.288-99. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.02.010⟩
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-
- titre
- ICA-based sparse feature recovery from fMRI datasets
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Merlin Keller, Jean Baptiste Poline, Philippe Ciuciu, Bertrand Thirion
- article
- Biomedical Imaging, IEEE International Symposium on, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.1177
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-
2009
- titre
- How to estimate the differential acceleration in a two-species atom interferometer to test the equivalence principle
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Robert Nyman, Rémi Geiger, Patrick Cheinet, Arnaud Landragin, Philippe Bouyer
- article
- New Journal of Physics, Institute of Physics: Open Access Journals, 2009, 11, pp.113010. ⟨10.1088/1367-2630/11/11/113010⟩
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-
- titre
- CanICA: Model-based extraction of reproducible group-level ICA patterns from fMRI time series
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Sepideh Sadaghiani, Jean Baptiste Poline, Bertrand Thirion
- article
- Medical Image Computing and Computer Aided Intervention, Sep 2009, London, United Kingdom. pp.1
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- titre
- Proceedings of the 8th Python in Science conference
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Stefan van der Walt, Jarrod Millman
- article
- SciPy 2009: 8th Python in Science Conference, Aug 2009, Pasadena, United States. pp.1-78
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- titre
- Light-pulse atom interferometry in microgravity
- auteur_8max
- Guillaume Stern, Baptiste Battelier, Rémi Geiger, Gaël Varoquaux, André Villing, Frédéric Moron, Olivier Carraz, Nassim Zahzam, Yannick Bidel, Oualid Chaibi, Frank Pereira dos Santos, Alexandre Bresson, Arnaud Landragin, Philippe Bouyer
- article
- The European Physical Journal D : Atomic, molecular, optical and plasma physics, EDP Sciences, 2009, 53 (3), pp.353. ⟨10.1140/epjd/e2009-00150-5⟩
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- titre
- Python comme langage scientifique
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux
- article
- Linux Magazine France, Diamond Editions, 2009, Explorer les richesses du langage Python, 40
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-
2008
- titre
- Proceedings of the 7th Python in Science conference
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Travis Vaught, Jarrod Millman
- article
- SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. pp.1-78
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- titre
- Mayavi: Making 3D Data Visualization Reusable
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Prabhu Ramachandran
- article
- SciPy 2008: 7th Python in Science Conference, Aug 2008, Pasadena, United States. pp.51
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- titre
- Agile Computer Control of a Complex Experiment
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux
- article
- Computing in Science and Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 10 (2), pp.55-59. ⟨10.1109/MCSE.2008.47⟩
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- titre
- Atomic sources for long-time-of-flight interferometric inertial sensors
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux
- article
- Atomic Physics [physics.atom-ph]. Université Paris Sud - Paris XI; Institut d'Optique, 2008. English
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- titre
- Sagnac effect in superfluid liquids
- auteur_8max
- Eric Varoquaux, Gaël Varoquaux
- article
- Uspekhi Fizicheskikh Nauk, 2008, 51 (2), pp.205-208. ⟨10.1070/PU2008v051n02ABEH006425⟩
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- titre
- Effects of disorder in 2D
- auteur_8max
- Jean-Philippe Brantut, Gaël Varoquaux, Robert Nyman, Jean-François Clément, Martin Robert-De-Saint-Vincent, Thomas Bourdel, Alain Aspect, Philippe Bouyer
- article
- Latsis, Jan 2008, Lausanne, Switzerland
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- titre
- Light-shift tomography in an optical-dipole trap for neutral atoms
- auteur_8max
- Jean-Philippe Brantut, Jean-François Clément, Martin Robert-De-Saint-Vincent, Gaël Varoquaux, Robert Nyman, Alain Aspect, Thomas Bourdel, Philippe Bouyer
- article
- Physical Review A, American Physical Society, 2008, 78, pp.031401 (R). ⟨10.1103/PhysRevA.78.031401⟩
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- titre
- All-optical evaporative cooling in a versatile optical-dipole trap at telecom wavelength
- auteur_8max
- Martin Robert-De-Saint-Vincent, Alain Aspect, Thomas Bourdel, Philippe Bouyer, Gaël Varoquaux, Jean-Philippe Brantut, Jean-François Clément, Robert Nyman
- article
- YAO, 2008, Florence, Italy
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2007
- titre
- I.C.E.: An Ultra-Cold Atom Source for Long-Baseline Interferometric Inertial Sensors in Reduced Gravity
- auteur_8max
- Gaël Varoquaux, Nassim Zahzam, Walid Chaibi, Jean-François Clément, Olivier Carraz, Jean-Philippe Brantut, Robert Nyman, Franck Pereira dos Santos, Linda Mondin, Michel Rouzé, Yannick Bidel, Alexandre Bresson, Arnaud Landragin, Philippe Bouyer
- article
- Rencontres de Moriond Gravitational Waves and Experimental Gravity, Mar 2007, La Thuile, Val d'Aosta, Italy
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2006
- titre
- I.C.E.: a Transportable Atomic Inertial Sensor for Test in Microgravity
- auteur_8max
- Robert Nyman, Gaël Varoquaux, Fabien Lienhart, Damien Chambon, Salah Boussen, Jean-François Clément, T. Muller, Giorgio Santarelli, Frank Pereira dos Santos, André Clairon, Alexandre Bresson, Arnaud Landragin, Philippe Bouyer
- article
- Applied Physics B - Laser and Optics, Springer Verlag, 2006, 84, pp.673-681. ⟨10.1007/s00340-006-2395-7⟩
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- titre
- Tapered-amplified AR-coated laser diodes for Potassium and Rubidium atomic-physics experiments
- auteur_8max
- Robert Nyman, Gaël Varoquaux, Brice Villier, Delphine Sacchet, Frédéric Moron, Yann Le Coq, Alain Aspect, Philippe Bouyer
- article
- Review of Scientific Instruments, American Institute of Physics, 2006, 77, pp.033105. ⟨10.1063/1.2186809⟩
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