2021
Journal articles
- titre
- Deep learning‐enabled imaging flow cytometry for high‐speed Cryptosporidium and Giardia detection
- auteur
- Shaobo Luo, Tarik Bourouina, Giovanni Chierchia, Hugues Talbot, Ai-Qun Liu, Yuzhi Shi, Kim Truc Nguyen, Shilun Feng, Ahmed Elsayed
- article
- Cytometry Part A, Wiley, 2021, ⟨10.1002/cyto.a.24321⟩
- DOI
- DOI : 10.1002/cyto.a.24321
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-
- titre
- Integrating deep learning CT-scan model, biological and clinical variables to predict severity of COVID-19 patients
- auteur
- Nathalie Lassau, Samy Ammari, Emilie Chouzenoux, Hugo Gortais, Paul Herent, Matthieu Devilder, Samer Soliman, Olivier Meyrignac, Marie-Pauline Talabard, Jean-Philippe Lamarque, Remy Dubois, Nicolas Loiseau, Paul Trichelair, Etienne Bendjebbar, Gabriel Garcia, Corinne Balleyguier, Mansouria Merad, Annabelle Stoclin, Simon Jegou, Franck Griscelli, Nicolas Tetelboum, Yingping Li, Sagar Verma, Matthieu Terris, Tasnim Dardouri, Kavya Gupta, Ana Neacsu, Frank Chemouni, Meriem Sefta, Paul Jehanno, Imad Bousaid, Yannick Boursin, Emmanuel Planchet, Mikael Azoulay, Jocelyn Dachary, Fabien Brulport, Adrian Gonzalez, Olivier Dehaene, Jean-Baptiste Schiratti, Kathryn Schutte, Jean-Christophe Pesquet, Hugues Talbot, Elodie Pronier, Gilles Wainrib, Thomas Clozel, Fabrice Barlesi, Marie-France Bellin, Michael Blum
- article
- Nature Communications, Nature Publishing Group, In press, 12 (634), ⟨10.1038/s41467-020-20657-4⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-020-20657-4
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-
- titre
- Clinical validation of a computer‐based approach for the quantification of the skin ageing process of women using in vivo confocal microscopy
- auteur
- Julie Robic, Alex Nkengne, Benjamin Perret, Michel Couprie, Hugues Talbot, Giovanni Pellacani, Katell Vie
- article
- Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology, Wiley, 2021, 35 (1), ⟨10.1111/jdv.16810⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/jdv.16810
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-
- titre
- An Elastica-driven Digital Curve Evolution Model for Image Segmentation
- auteur
- Daniel Antunes, Jacques-Olivier Lachaud, Hugues Talbot
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2021, 63 (1), pp.1-17. ⟨10.1007/s10851-020-00983-4⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s10851-020-00983-4
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-
- titre
- Influence of Magnetic Field Strength on Magnetic Resonance Imaging Radiomics Features in Brain Imaging, an In Vitro and In Vivo Study
- auteur
- Samy Ammari, Stéphanie Pitre-Champagnat, Laurent Dercle, Emilie Chouzenoux, Salma Moalla, Sylvain Reuze, Hugues Talbot, Tite Mokoyoko, Joya Hadchiti, Sebastien Diffetocq, Andreas Volk, Mickeal El Haik, Sara Lakiss, Corinne Balleyguier, Nathalie Lassau, Francois Bidault
- article
- Frontiers in Oncology, Frontiers, 2021, ⟨10.3389/fonc.2020.541663⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fonc.2020.541663
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-
Conference papers
- titre
- Geo-Spatiotemporal Features and Shape-Based Prior Knowledge for Fine-grained Imbalanced Data Classification
- auteur
- Charles A. Kantor, Marta Skreta, Brice Rauby, Léonard Boussioux, Emmanuel Jehanno, Alexandra Luccioni, David Rolnick, Hugues Talbot
- article
- Proc. IJCAI 2021 Workshop on AI for Social Good (2021), Jan 2021, Tokyo, Japan
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-
2020
Journal articles
- titre
- Machine Learning-Based Pipeline for High Accuracy Bioparticle Sizing
- auteur
- Shaobo Luo, Yi Zhang, Kim Truc Nguyen, Shilun Feng, Yuzhi Shi, Yang Liu, Paul Hutchinson, Giovanni Chierchia, Hugues Talbot, Tarik Bourouina, Xudong Jiang, Ai Liu
- article
- Micromachines, MDPI, 2020, 11 (12), pp.1084. ⟨10.3390/mi11121084⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/mi11121084
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-
- titre
- Myocardial Perfusion Simulation for Coronary Artery Disease: A Coupled Patient-Specific Multiscale Model
- auteur
- Lazaros Papamanolis, Hyun Kim, Clara Jaquet, Matthew Sinclair, Michiel Schaap, Ibrahim Danad, Pepijn van Diemen, Paul Knaapen, Laurent Najman, Hugues Talbot, Charles Taylor, Irene Vignon-Clementel
- article
- Annals of Biomedical Engineering, Springer Verlag, 2020, ⟨10.1007/s10439-020-02681-z⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s10439-020-02681-z
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-
- titre
- Efficient position estimation of 3D fluorescent spherical beads in confocal microscopy via Poisson denoising
- auteur
- Alessandro Benfenati, Francesco Bonacci, Tarik Bourouina, Hugues Talbot
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2020, 63 (1), pp.56-72. ⟨10.1007/s10851-020-00994-1⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s10851-020-00994-1
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-
- titre
- Automated segmentation of thick confocal microscopy 3D images for the measurement of white matter volumes in zebrafish brains
- auteur
- Sylvain Lempereur, Arnim Jenett, Elodie Machado, Ignacio Arganda-Carreras, Matthieu Simion, Pierre Affaticati, Jean-Stéphane Joly, Hugues Talbot
- article
- Mathematical Morphology - Theory and Applications, De Gruyter 2020, 4 (1), pp.31-45. ⟨10.1515/mathm-2020-0100⟩
- DOI
- DOI : 10.1515/mathm-2020-0100
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-
- titre
- Clarification of Definitions of Hyperprogressive Disease During Immunotherapy for Non–Small Cell Lung Cancer
- auteur
- Baptiste Kas, Hugues Talbot, Roberto Ferrara, Colombe Richard, Jean-Philippe Lamarque, Stéphanie Pitre-Champagnat, David Planchard, Corinne Balleyguier, Benjamin Besse, Laura Mezquita, Nathalie Lassau, Caroline Caramella
- article
- JAMA oncology, American Medical Association, 2020, 6 (7), pp.1039. ⟨10.1001/jamaoncol.2020.1634⟩
- DOI
- DOI : 10.1001/jamaoncol.2020.1634
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-
- titre
- Deep Learning-Based Concurrent Brain Registration and Tumor Segmentation
- auteur
- Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Maria Vakalopoulou, Emilie Andres, Enzo Battistella, Alexandre Carré, Siddhartha Chandra, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Roger Sun, Charlotte Robert, Hugues Talbot, Nikos Paragios, Eric Deutsch
- article
- Frontiers in Computational Neuroscience, Frontiers, 2020, Multimodal Brain Tumor Segmentation and Beyond, ⟨10.3389/fncom.2020.00017⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fncom.2020.00017
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-
- titre
- Shaping for PET image analysis
- auteur
- Eloïse Grossiord, Nicolas Passat, Hugues Talbot, Benoît Naegel, Salim Kanoun, Ilan Tal, Pierre Tervé, Soléakhéna Ken, Olivier Casasnovas, Michel Meignan, Laurent Najman
- article
- Pattern Recognition Letters, Elsevier, 2020, 131, pp.307-313. ⟨10.1016/j.patrec.2020.01.017⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.patrec.2020.01.017
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-
Conference papers
- titre
- Does Super-Resolution Improve OCR Performance in the Real World ? A Case Study on Images of Receipts
- auteur
- Vivien Robert, Hugues Talbot
- article
- ICIP 2020 - IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2020, Abu Dhabi, United Arab Emirates. pp.548-552, ⟨10.1109/ICIP40778.2020.9191067⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ICIP40778.2020.9191067
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-
- titre
- CGO: Multiband Astronomical Source Detection With Component-Graphs
- auteur
- Thanh Xuan Nguyen, Giovanni Chierchia, Laurent Najman, Aku Venhola, Caroline Haigh, Reynier Peletier, Michael H.F. Wilkinson, Hugues Talbot, Benjamin Perret
- article
- ICIP 2020 - IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2020, Abu Dhabi, United Arab Emirates. pp.16-20, ⟨10.1109/ICIP40778.2020.9191276⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ICIP40778.2020.9191276
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-
Reports
- titre
- AI-based multi-modal integration (ScanCov scores) of clinical characteristics, lab tests and chest CTs improves COVID-19 outcome prediction of hospitalized patients
- auteur
- Nathalie Lassau, Samy Ammari, Emilie Chouzenoux, Hugo Gortais, Paul Herent, Matthieu Devilder, Samer Soliman, Olivier Meyrignac, Marie-Pauline Talabard, Jean-Philippe Lamarque, Rémy Dubois, Nicolas Loiseau, Paul Trichelair, Etienne Bendjebbar, Gabriel Garcia, Corinne Balleyguier, Mansouria Merad, Annabelle Stoclin, Simon Jegou, Franck Griscelli, Nicolas Tetelboum, Yingping Li, Sagar Verma, Matthieu Terris, Tasnim Dardouri, Kavya Gupta, Ana Neacsu, Frank Chemouni, Meriem Sefta, Paul Jehanno, Imad Bousaid, Yannick Boursin, Emmanuel Planchet, Mikael Azoulay, Jocelyn Dachary, Fabien Brulport, Adrián González, Olivier Dehaene, Jean-Baptiste Schiratti, Kathryn Schutte, Jean-Christophe Pesquet, Hugues Talbot, Elodie Pronier, Gilles Wainrib, Thomas Clozel, Fabrice Barlesi, Marie-France Bellin, Michael Blum
- article
- [Research Report] Inria Saclay Ile de France. 2020
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Distributed Algorithms for Scalable Proximity Operator Computation and Application to Video Denoising
- auteur
- Feriel Abboud, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Hugues Talbot
- article
- 2020
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-
2019
Journal articles
- titre
- Three-dimensional conditional random field for the dermal–epidermal junction segmentation
- auteur
- Julie Robic, Benjamin Perret, Alex Nkengne, Michel Couprie, Hugues Talbot
- article
- Journal of Medical Imaging, SPIE Digital Library, 2019, 6 (02), pp.1. ⟨10.1117/1.JMI.6.2.024003⟩
- DOI
- DOI : 10.1117/1.JMI.6.2.024003
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-
- titre
- Generation of patient-specific cardiac vascular networks: a hybrid image-based and synthetic geometric model
- auteur
- Clara Jaquet, Laurent Najman, Hugues Talbot, Leo Grady, Michiel Schaap, Buzzy Spain, Hyun Kim, Irene Vignon-Clementel, Charles Taylor
- article
- IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, 66 (4), pp.946-955. ⟨10.1109/TBME.2018.2865667⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/TBME.2018.2865667
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-
- titre
- High throughput automated detection of axial malformations in Medaka fish embryo
- auteur
- Diane Genest, Élodie Puybareau, Marc Léonard, Jean Cousty, Noémie de Crozé, Hugues Talbot
- article
- Computers in Biology and Medicine, Elsevier, 2019, 105, pp.157-168. ⟨10.1016/j.compbiomed.2018.12.016⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.compbiomed.2018.12.016
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-
- titre
- nD variational restoration of curvilinear structures with prior-based directional regularization
- auteur
- Odyssée Merveille, Benoît Naegel, Hugues Talbot, Nicolas Passat
- article
- IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, 28 (8), pp.3848-3859. ⟨10.1109/TIP.2019.2901706⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/TIP.2019.2901706
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-
- titre
- Shape-based analysis on component-graphs for multivalued image processing
- auteur
- Eloïse Grossiord, Benoît Naegel, Hugues Talbot, Laurent Najman, Nicolas Passat
- article
- Mathematical Morphology - Theory and Applications, De Gruyter 2019, 3 (1), pp.45-70. ⟨10.1515/mathm-2019-0003⟩
- DOI
- DOI : 10.1515/mathm-2019-0003
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-
Conference papers
- titre
- Spherical Fluorescent Particle Segmentation and Tracking in 3D Confocal Microscopy
- auteur
- Élodie Puybareau, Edwin Carlinet, Alessandro Benfenati, Hugues Talbot
- article
- ISMM 2019 - 14th International Symposium on Mathematical Morphology, Bernhard Burgeth; Andreas Kleefeld; Benoît Naegel; Nicolas Passat; Benjamin Perret, Jul 2019, Saarbrücken, Germany. pp.520-531, ⟨10.1007/978-3-030-20867-7_40⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-20867-7_40
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- titre
- Self-dual pattern spectra for characterising the dermal-epidermal junction in 3D reflectance confocal microscopy imaging
- auteur
- Julie Robic, Benjamin Perret, Alex Nkengne, Michel Couprie, Hugues Talbot
- article
- ISMM 2019 - International Symposium on Mathematical Morphology and Its Applications to Signal and Image Processing, Jul 2019, Saarbrücken, Germany. pp.508-519, ⟨10.1007/978-3-030-20867-7_39⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-20867-7_39
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-
- titre
- Atlas-based automated detection of swim bladder in Medaka embryo
- auteur
- Diane Genest, Marc Léonard, Jean Cousty, Noémie de Crozé, Hugues Talbot
- article
- ISMM 2019 - International Symposium on Mathematical Morphology and Its Application to Signal and Image Processing, Bernhard Burgeth; Andreas Kleefeld; Benoit Naegel; Nicolas Passat; Benjamin Perret, Jul 2019, Saarbrücken, Germany. pp.496-507, ⟨10.1007/978-3-030-20867-7_38⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-20867-7_38
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-
- titre
- Digital Curvature Evolution Model for Image Segmentation
- auteur
- Daniel Antunes, Jacques-Olivier Lachaud, Hugues Talbot
- article
- DGCI 2019 - International Conference on Discrete Geometry for Computer Imagery, Mar 2019, Noisy-le-Grand, France. pp.15-26, ⟨10.1007/978-3-030-14085-4_2⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-14085-4_2
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Hyperprogressive disease during immunotherapy: an attempt to clarify different definitions
- auteur
- Baptiste Kas, Hugues Talbot, Roberto Ferrara, C Richard, Benjamin Besse, Laura Mezquita, Nathalie Lassau, Caroline Caramella
- article
- 2019
- Accès au bibtex
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2018
Journal articles
- titre
- Curvilinear structure analysis by ranking the orientation responses of path operators
- auteur
- Odyssée Merveille, Hugues Talbot, Laurent Najman, Nicolas Passat
- article
- IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 40 (2), pp.304-317. ⟨10.1109/TPAMI.2017.2672972⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/TPAMI.2017.2672972
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Conference papers
- titre
- A Multicore Convex Optimization Algorithm with Applications to Video Restoration
- auteur
- Feriel Abboud, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Hugues Talbot
- article
- IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2018, Athens, Greece
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Segmentation 3D des lésions du lymphome à partir de descripteurs multimodaux TEP/TDM
- auteur
- Eloïse Grossiord, Hugues Talbot, Nicolas Passat, Michel Meignan, Laurent Najman
- article
- Journée thématique du GdR ISIS : "Segmentation d'images biomédicales : quels outils pour l'analyse des données massives, hétérogènes et multimodales ?", 2018, Paris, France
- Accès au texte intégral et bibtex
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Directions of work or proceedings
- titre
- Reproducible Research in Pattern Recognition, Second International Workshop, RRPR 2018
- auteur
- Bertrand Kerautret, Miguel Colom, Daniel Lopresti, Pascal Monasse, Hugues Talbot
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
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Preprints, Working Papers, ...
- titre
- A Variational Method for Flicker Removal in High Speed Video Sequences
- auteur
- Ali Kanj, Hugues Talbot, Jean-Christophe Pesquet, Raoul Luparello
- article
- 2018
- Accès au texte intégral et bibtex
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