Publications HAL de maria, vakalopoulou

2019

Journal articles

titre
A Novel Object-Based Deep Learning Framework for Semantic Segmentation of Very High-Resolution Remote Sensing Data: Comparison with Convolutional and Fully Convolutional Networks
auteur
Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article
Remote Sensing, MDPI, 2019, 11 (6), pp.684. ⟨10.3390/rs11060684⟩
DOI
DOI : 10.3390/rs11060684
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https://hal.inria.fr/hal-02078539/file/MDPI_journal.pdf BibTex

Conference papers

titre
Gene Expression High-Dimensional Clustering towards a Novel, Robust, Clinically Relevant and Highly Compact Cancer Signature
auteur
Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Roger Sun, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article
IWBBIO 2019, May 2019, Granada, Spain
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02076104/file/iwbbio19%20%281%29.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
A radiomics approach to assess tumour-infiltrating CD8 cells and response to anti-PD-1 or anti-PD-L1 immunotherapy: an imaging biomarker, retrospective multicohort study
auteur
Roger Sun, Elaine Johanna Limkin, Maria Vakalopoulou, Laurent Dercle, Stéphane Champiat, Shan Rong Han, Loic Verlingue, David Brandao, Andrea Lancia, Samy Ammari, Antoine Hollebecque, Jean-Yves Scoazec, Aurélien Marabelle, Christophe Massard, Jean-Charles Soria, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Éric Deutsch, Charles Ferté
article
Lancet Oncology, Elsevier, 2018
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titre
Demystification of AI-driven medical image interpretation: past, present and future
auteur
Peter Savadjiev, Jaron Chong, Anthony Dohan, Maria Vakalopoulou, Caroline Reinhold, Nikos Paragios, Benoit Gallix
article
European Radiology, 2018
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titre
Detailed Land Cover Mapping from Multitemporal Landsat-8 Data of Different Cloud Cover
auteur
Christina Karakizi, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou, Georgia Antoniou
article
Remote Sensing, MDPI, 2018, 10 (8), ⟨10.3390/rs10081214⟩
DOI
DOI : 10.3390/rs10081214
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Conference papers

titre
Context Aware 3D CNNs for Brain Tumor Segmentation
auteur
Siddhartha Chandra, Maria Vakalopoulou, Lucas Fidon, Enzo Battistella, Théo Estienne, Roger Sun, Charlotte Robert, Eric Deutsch, Nikos Paragios
article
MICCAI Brainlesion Workshop, Sep 2018, Granada, Spain
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https://hal.inria.fr/hal-01959610/file/chandra_etal.pdf BibTex
titre
Linear and Deformable Image Registration with 3D Convolutional Neural Networks
auteur
Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Marie-Pierre Revel, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios
article
Reconstruction and Analysis of Moving Body Organs, 21th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2018, Sep 2018, Grenada, Spain
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01935607/file/linear_and_deformable_image_registration_RAMBO2018.pdf BibTex
titre
AtlasNet: Multi-atlas Non-linear Deep Networks for Medical Image Segmentation
auteur
Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Norbert Bus, Rafael Marini Silva, Evangelia Zacharaki, Marie-Pierre Revel, Nikos Paragios
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2018, Granada, Spain
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https://hal.inria.fr/hal-01958236/file/Vakalopoulou_etal.pdf BibTex
titre
Stacked Encoder-Decoders for Accurate Semantic Segmentation of Very High Resolution Satellite Datasets
auteur
Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
article
IGARSS 2018 - 38th annual International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2018, Valencia, Spain. pp.1-4
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01870857/file/IGARSS2018_v8.pdf BibTex
titre
Deep patch-based priors under a fully convolutional encoder-decoder architecture for interstitial lung disease segmentation
auteur
Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel, Evangelia Zacharaki
article
ISBI’18 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, D.C., United States
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https://hal.inria.fr/hal-01721714/file/Vakalopoulou_etal_ISBI18.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Identifying the Best Machine Learning Algorithms for Brain Tumor Segmentation, Progression Assessment, and Overall Survival Prediction in the BRATS Challenge
auteur
Spyridon Bakas, Mauricio Reyes, Enzo Battistella, Siddhartha Chandra, Théo Estienne, Lucas Fidon, Maria Vakalopoulou, Roger Sun, Et Al., Éric Deutsch, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Bjoern Menze
article
2018
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2016

Journal articles

titre
Graph-Based Registration, Change Detection, and Classification in Very High Resolution Multitemporal Remote Sensing Data
auteur
Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article
IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, IEEE, 2016, 9, pp.2940 - 2951. ⟨10.1109/JSTARS.2016.2557081⟩
DOI
DOI : 10.1109/JSTARS.2016.2557081
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Conference papers

titre
Simultaneous registration, segmentation and change detection from multisensor, multitemporal satellite image pairs.
auteur
Maria Vakalopoulou, Christos Platias, Maria Papadomanolaki, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
article
International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), Jul 2016, Beijing, China. ⟨10.1109/IGARSS.2016.7729469⟩
DOI
DOI : 10.1109/IGARSS.2016.7729469
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2015

Conference papers

titre
Building detection in very high resolution multispectral data with deep learning features
auteur
Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article
Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), 2015 IEEE International, Jul 2015, Milan, Italy. pp.1873-1876, ⟨10.1109/IGARSS.2015.7326158⟩
DOI
DOI : 10.1109/IGARSS.2015.7326158
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01264084/file/igarss_vak15.pdf BibTex
titre
Simultaneous Registration and Change Detection in Multitemporal, Very High Resolution Remote Sensing Data
auteur
Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karatzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article
2015 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition Workshops (CVPRW), Jun 2015, Boston, United States. pp.61-69, ⟨10.1109/CVPRW.2015.7301384⟩
DOI
DOI : 10.1109/CVPRW.2015.7301384
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01264072/file/vak_etal_cvprw.pdf BibTex