Publications HAL de maria, vakalopoulou

2022

Conference papers

titre
Unsupervised Nuclei Segmentation using Spatial Organization Priors
auteur
Loïc Le Bescond, Marvin Lerousseau, Ingrid Garberis, Fabrice André, Stergios Christodoulidis, Maria Vakalopoulou, Hugues Talbot
article
MICCAI 2022 - 25th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2022, Singapore, Singapore
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03644463/file/paper2097.pdf BibTex
titre
Contrastive Masked Transformers for Forecasting Renal Transplant Function
auteur
Leo Milecki, Vicky Kalogeiton, Sylvain Bodard, Dany Anglicheau, Jean-Michel Correas, Marc-Olivier Timsit, Maria Vakalopoulou
article
MICCAI 2022, Sep 2022, Singapore, Singapore
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03738395/file/paper1582.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
GHOST: Graph Higher-Order Similarity Transformation for Classification
auteur
Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article
2022
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-centralesupelec.archives-ouvertes.fr/hal-03563705/file/IEEE_Bare_Demo_Template_for_Conferences.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
COMBING: Clustering in Oncology for Mathematical and Biological Identification of Novel Gene Signatures
auteur
Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Roger Sun, Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Sergey Nikolaev, Émilie Alvarez Andres, Alexandre Carré, Stéphane Niyoteka, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Emilie Alvarez Andres, Eric Deutsch
article
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2021, pp.1-1. ⟨10.1109/TCBB.2021.3123910⟩
DOI
DOI : 10.1109/TCBB.2021.3123910
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-centralesupelec.archives-ouvertes.fr/hal-03530265/file/IEEE_transactions_on_bio_Hal.pdf BibTex
titre
Deep learning for lung disease segmentation on CT: Which reconstruction kernel should be used?
auteur
Trieu-Nghi Hoang-Thi, Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel, Guillaume Chassagnon
article
Diagnostic and Interventional Imaging, Elsevier, 2021, 102 (11), pp.691-695. ⟨10.1016/j.diii.2021.10.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.diii.2021.10.001
Accès au bibtex
BibTex
titre
Using chest CT scan and unsupervised machine learning for predicting and evaluating response to lumacaftor-ivacaftor in people with cystic fibrosis
auteur
Alienor Campredon, Enzo Battistella, Clémence Martin, Isabelle Durieu, Laurent Mely, Christophe Marguet, Chantal Belleguic, Marlène Murris-Espin, Raphaël Chiron, Annlyse Fanton, Stéphanie Bui, Martine Reynaud-Gaubert, Philippe Reix, Trieu-Nghi Hoang-Thi, Maria Vakalopoulou, Marie-Pierre Revel, Jennifer da Silva, Pierre-Régis Burgel, Guillaume Chassagnon
article
European Respiratory Journal, European Respiratory Society, 2021, pp.2101344. ⟨10.1183/13993003.01344-2021⟩
DOI
DOI : 10.1183/13993003.01344-2021
Accès au bibtex
BibTex
titre
Unsupervised Multistep Deformable Registration of Remote Sensing Imagery Based on Deep Learning
auteur
Maria Papadomanolaki, Stergios Christodoulidis, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou
article
Remote Sensing, MDPI, 2021, 13 (7), ⟨10.3390/rs13071294⟩
DOI
DOI : 10.3390/rs13071294
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-03538150/file/remotesensing-13-01294.pdf BibTex
titre
A Deep Multi-Task Learning Framework Coupling Semantic Segmentation and Fully Convolutional LSTM Networks for Urban Change Detection
auteur
Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article
IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2021
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-03140492/file/IEEE_Transactions_on_Geoscience_and_Remote_Sensing.pdf BibTex
titre
AI-driven quantification, staging and outcome prediction of COVID-19 pneumonia
auteur
Guillaume Chassagnon, Maria Vakalopoulou, Enzo Battistella, Stergios Christodoulidis, Trieu-Nghi Hoang-Thi, Severine Dangeard, Eric Deutsch, Fabrice Andre, Enora Guillo, Nara Halm, Stefany El Hajj, Florian Bompard, Sophie Neveu, Chahinez Hani, Ines Saab, Aliénor Campredon, Hasmik Koulakian, Souhail Bennani, Gael Freche, Maxime Barat, Aurelien Lombard, Laure Fournier, Hippolyte Monnier, Téodor Grand, Jules Gregory, Yann Nguyen, Antoine Khalil, Elyas Mahdjoub, Pierre-Yves Brillet, Stéphane Tran Ba, Valérie Bousson, Ahmed Mekki, Robert-Yves Carlier, Marie-Pierre Revel, Nikos Paragios
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2021, 67, pp.101860. ⟨10.1016/j.media.2020.101860⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2020.101860
Accès au bibtex
BibTex
titre
Elastic Registration–driven Deep Learning for Longitudinal Assessment of Systemic Sclerosis Interstitial Lung Disease at CT
auteur
Guillaume Chassagnon, Maria Vakalopoulou, Alexis Régent, Mihir Sahasrabudhe, Rafael Marini, Trieu-Nghi Hoang-Thi, Anh-Tuan Dinh-Xuan, Bertrand Dunogué, Luc Mouthon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article
Radiology, Radiological Society of North America, 2021, 298 (1), pp.189-198. ⟨10.1148/radiol.2020200319⟩
DOI
DOI : 10.1148/radiol.2020200319
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

titre
Self-Supervised Representation Learning using Visual Field Expansion on Digital Pathology
auteur
Joseph Boyd, Mykola Liashuha, Eric Deutsch, Nikos Paragios, Stergios Christodoulidis, Maria Vakalopoulou
article
2021 IEEE/CVF International Conference on Computer Vision Workshops (ICCVW), Oct 2021, Montreal, Canada. pp.639-647, ⟨10.1109/ICCVW54120.2021.00077⟩
DOI
DOI : 10.1109/ICCVW54120.2021.00077
Accès au bibtex
BibTex
titre
Weakly Supervised Pan-Cancer Segmentation Tool
auteur
Marvin Lerousseau, Marion Classe, Enzo Battistella, Théo Estienne, Théophraste Henry, Amaury Leroy, Roger Sun, Maria Vakalopoulou, Jean-Yves Scoazec, Eric Deutsch, Nikos Paragios
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Stansbroug, France. pp.248-256, ⟨10.1007/978-3-030-87237-3_24⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-87237-3_24
Accès au bibtex
BibTex
titre
SparseConvMIL: Sparse Convolutional Context-Aware Multiple Instance Learning for Whole Slide Image Classification
auteur
Marvin Lerousseau, Maria Vakalopoulou, Eric Deutsch, Nikos Paragios
article
Machine Learning Research 156, Sep 2021, Strasbourg, France
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/2105.02726 BibTex
titre
Deep Reinforcement Learning for L3 Slice Localization in Sarcopenia Assessment
auteur
Othmane Laousy, Guillaume Chassagnon, Edouard Oyallon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel, Maria Vakalopoulou
article
Machine Learning in Medical Imaging @MICCAI, Sep 2021, Strasbourg, France. pp.317-326, ⟨10.1007/978-3-030-87589-3_33⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-87589-3_33
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03532954/file/MLMI_2021_camera_ready.pdf BibTex
titre
Exploring Deep Registration Latent Spaces
auteur
Théo Estienne, Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Enzo Battistella, Théophraste Henry, Marvin Lerousseau, Amaury Leroy, Guillaume Chassagnon, Marie-Pierre Revel, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article
DART in MICCAI 2021, the 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg, France. pp.112-122, ⟨10.1007/978-3-030-87722-4_11⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-87722-4_11
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03524105/file/arxiv_submission.pdf BibTex
titre
Me-NDT: Neural-backed Decision Tree for visual Explainability of deep Medical models
auteur
Guanghui Fu, Ruiqian Wang, Jianqiang Li, Maria Vakalopoulou, Vicky Kalogeiton
article
Medical Imaging with Deep Learning 2021, Jul 2021, Lübeck (virtual), Germany
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-03353559/file/MIDL_2021_MeNDT_NeuralBackedDecisionTree.pdf BibTex
titre
A Joint Spatial and Magnification Based Attention Framework for Large Scale Histopathology Classification
auteur
Jingwei Zhang, Ke Ma, John van Arman, Rajarsi Gupta, Joel Saltz, Maria Vakalopoulou, Dimitris Samaras
article
CVMI, Jun 2021, Nashville, United States. ⟨10.1109/CVPRW53098.2021.00418⟩
DOI
DOI : 10.1109/CVPRW53098.2021.00418
Accès au bibtex
BibTex
titre
3D Unsupervised Kidney Graft Segmentation Based on Deep Learning and Multi-Sequence MRI
auteur
Leo Milecki, Sylvain Bodard, Jean-Michel Correas, Marc-Olivier Timsit, Maria Vakalopoulou
article
IEEE ISBI 2021 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice / Virtual, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03141528/file/ISBI21__home_papercept_embs.papercept.net_www_conferences_conferences_ISBI21_submissions_0601_FI.pdf BibTex

Book sections

titre
Deep Learning for the Earth Sciences
auteur
Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Nikos Paragios
article
Deep Learning for the Earth Sciences: A Comprehensive Approach to Remote Sensing, Climate Science, and Geosciences, Wiley, 2021, ⟨10.1002/9781119646181.ch9⟩
DOI
DOI : 10.1002/9781119646181.ch9
Accès au bibtex
BibTex

2020

Journal articles

titre
Radiomics to predict outcomes and abscopal response of patients with cancer treated with immunotherapy combined with radiotherapy using a validated signature of CD8 cells
auteur
Roger Sun, Nora Sundahl, Markus Hecht, Florian Putz, Andrea Lancia, Angela Rouyar, Marina Milic, Alexandre Carré, Enzo Battistella, Emilie Alvarez Andres, Stéphane Niyoteka, Edouard Romano, Guillaume Louvel, Jérôme Durand-Labrunie, Sophie Bockel, Rastilav Bahleda, Charlotte Robert, Celine Boutros, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Benjamin Frey, Jean-Charles Soria, Christophe Massard, Charles Ferté, Rainer Fietkau, Piet Ost, Udo Gaipl, Eric Deutsch
article
Journal for Immunotherapy of Cancer, BMJ Publishing Group 2020, 8 (2), pp.e001429. ⟨10.1136/jitc-2020-001429⟩
DOI
DOI : 10.1136/jitc-2020-001429
Accès au bibtex
BibTex
titre
Standardization of brain MR images across machines and protocols: bridging the gap for MRI-based radiomics
auteur
Alexandre Carré, Guillaume Klausner, Myriam Edjlali, Marvin Lerousseau, Jade Briend-Diop, Roger Sun, Samy Ammari, Sylvain Reuzé, Emilie Alvarez Andres, Théo Estienne, Stéphane Niyoteka, Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Frédéric Dhermain, Nikos Paragios, Eric Deutsch, Catherine Oppenheim, Johan Pallud, Charlotte Robert
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.12340. ⟨10.1038/s41598-020-69298-z⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-020-69298-z
Accès au texte intégral et bibtex
https://www.hal.inserm.fr/inserm-02943189/file/s41598-020-69298-z.pdf BibTex
titre
Deep Learning–based Approach for Automated Assessment of Interstitial Lung Disease in Systemic Sclerosis on CT Images
auteur
Guillaume Chassagnon, Maria Vakalopoulou, Alexis Régent, Evangelia Zacharaki, Galit Aviram, Charlotte Martin, Rafael Marini, Norbert Bus, Naïm Jerjir, Arsène Mekinian, Thông Hua-Huy, Laurence Monnier-Cholley, Nouria Benmostefa, Luc Mouthon, Anh-Tuan Dinh-Xuan, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article
Radiology: Artificial Intelligence, RSNA, 2020, 2 (4), pp.e190006. ⟨10.1148/ryai.2020190006⟩
DOI
DOI : 10.1148/ryai.2020190006
Accès au bibtex
BibTex
titre
Deep Learning-Based Concurrent Brain Registration and Tumor Segmentation
auteur
Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Maria Vakalopoulou, Emilie Alvarez Andres, Enzo Battistella, Alexandre Carré, Siddhartha Chandra, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Roger Sun, Charlotte Robert, Hugues Talbot, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article
Frontiers in Computational Neuroscience, Frontiers, 2020, Multimodal Brain Tumor Segmentation and Beyond, ⟨10.3389/fncom.2020.00017⟩
DOI
DOI : 10.3389/fncom.2020.00017
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02974826/file/Frontiers%281%29.pdf BibTex
titre
Artificial intelligence applications for thoracic imaging
auteur
Guillaume Chassagnon, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article
European Journal of Radiology, Elsevier, 2020, 123, pp.108774. ⟨10.1016/j.ejrad.2019.108774⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ejrad.2019.108774
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

titre
Weakly Supervised Multiple Instance Learning Histopathological Tumor Segmentation
auteur
Marvin Lerousseau, Maria Vakalopoulou, Marion Classe, Julien Adam, Enzo Battistella, Alexandre Carré, Théo Estienne, Théophraste Henry, Eric Deutsch, Nikos Paragios
article
MICCAI 2020 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru. pp.470-479, ⟨10.1007/978-3-030-59722-1_45⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-59722-1_45
Accès au bibtex
BibTex

Directions of work or proceedings

titre
Self-supervised Nuclei Segmentation in Histopathological Images Using Attention
auteur
Mihir Sahasrabudhe, Stergios Christodoulidis, Roberto Salgado, Stefan Michiels, Sherene Loi, Fabrice André, Nikos Paragios, Maria Vakalopoulou
article
MICCAI 2020 - 23rd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru. pp.393-402, 2020, ⟨10.1007/978-3-030-59722-1_38⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-59722-1_38
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03087006/file/arxiv.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Deep Multi-Instance Learning Using Multi-Modal Data for Diagnosis of Lymphocytosis
auteur
Mihir Sahasrabudhe, Pierre Sujobert, Evangelia I Zacharaki, Eugénie Maurin, Béatrice Grange, Laurent Jallades, Nikos Paragios, Maria Vakalopoulou
article
2020
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03032875/file/hal.pdf BibTex
titre
Deep learning based registration using spatial gradients and noisy segmentation labels
auteur
Théo Estienne, Maria Vakalopoulou, Enzo Battistella, Alexandre Carré, Théophraste Henry, Marvin Lerousseau, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article
2020
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02974930/file/Learn2Reg.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Deep learning: definition and perspectives for thoracic imaging
auteur
Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article
European Radiology, Springer Verlag, 2019, 30, p. 2021-2030. ⟨10.1007/s00330-019-06564-3⟩
DOI
DOI : 10.1007/s00330-019-06564-3
Accès au bibtex
BibTex
titre
Use of Elastic Registration in Pulmonary MRI for the Assessment of Pulmonary Fibrosis in Patients with Systemic Sclerosis
auteur
Guillaume Chassagnon, Charlotte Martin, Rafael Marini, Maria Vakalopoulou, Alexis Régent, Luc Mouthon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article
Radiology, Radiological Society of North America, 2019, 291 (2), pp.487-492. ⟨10.1148/radiol.2019182099⟩
DOI
DOI : 10.1148/radiol.2019182099
Accès au bibtex
BibTex
titre
A Novel Object-Based Deep Learning Framework for Semantic Segmentation of Very High-Resolution Remote Sensing Data: Comparison with Convolutional and Fully Convolutional Networks
auteur
Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article
Remote Sensing, MDPI, 2019, 11 (6), pp.684. ⟨10.3390/rs11060684⟩
DOI
DOI : 10.3390/rs11060684
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02078539/file/MDPI_journal.pdf BibTex

Conference papers

titre
U-ReSNet: Ultimate Coupling of Registration and Segmentation with Deep Nets
auteur
Théo Estienne, Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Enzo Battistella, Marvin Lerousseau, Alexandre Carre, Guillaume Klausner, Roger Sun, Charlotte Robert, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article
MICCAI 2019: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2019, MICCAI, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.310-319, ⟨10.1007/978-3-030-32248-9_35⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-32248-9_35
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02365899/file/U_ReSNet.pdf BibTex
titre
Image Registration of Satellite Imagery with Deep Convolutional Neural Networks
auteur
Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios
article
IGARSS 2019 - 2019 IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, France. pp.4939-4942, ⟨10.1109/IGARSS.2019.8898220⟩
DOI
DOI : 10.1109/IGARSS.2019.8898220
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02422555/file/Image_Registration_with_CNNs.pdf BibTex
titre
Detecting urban changes with recurrent neural networks from multitemporal Sentinel-2 data
auteur
Maria Papadomanolaki, Sagar Verma, Maria Vakalopoulou, Siddharth Gupta, Konstantinos Karantzalos
article
IGARSS 2019 - IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, Japan
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02266094/file/20190527122608_825039_4393.pdf BibTex
titre
A multi-task deep learning framework coupling semantic segmentation and image reconstruction for very high resolution imagery
auteur
Maria Papadomanolaki, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou
article
IGARSS 2019 - IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, Japan. ⟨10.1109/igarss.2019.8898133⟩
DOI
DOI : 10.1109/igarss.2019.8898133
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02266085/file/20190527122343_978326_4652.pdf BibTex
titre
Gene Expression High-Dimensional Clustering towards a Novel, Robust, Clinically Relevant and Highly Compact Cancer Signature
auteur
Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Roger Sun, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article
IWBBIO 2019 - 7th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, May 2019, Granada, Spain
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02076104/file/iwbbio19%20%281%29.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
A radiomics approach to assess tumour-infiltrating CD8 cells and response to anti-PD-1 or anti-PD-L1 immunotherapy: an imaging biomarker, retrospective multicohort study
auteur
Roger Sun, Elaine Johanna Limkin, Maria Vakalopoulou, Laurent Dercle, Stéphane Champiat, Shan Rong Han, Loic Verlingue, David Brandao, Andrea Lancia, Samy Ammari, Antoine Hollebecque, Jean-Yves Scoazec, Aurélien Marabelle, Christophe Massard, Jean-Charles Soria, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Éric Deutsch, Charles Ferté
article
Lancet Oncology, Elsevier, 2018, 19 (9), pp.1180-1191. ⟨10.1016/S1470-2045(18)30413-3⟩
DOI
DOI : 10.1016/S1470-2045(18)30413-3
Accès au bibtex
BibTex
titre
Demystification of AI-driven medical image interpretation: past, present and future
auteur
Peter Savadjiev, Jaron Chong, Anthony Dohan, Maria Vakalopoulou, Caroline Reinhold, Nikos Paragios, Benoit Gallix
article
European Radiology, Springer Verlag, 2018, 29, p. 1616-1624. ⟨10.1007/s00330-018-5674-x⟩
DOI
DOI : 10.1007/s00330-018-5674-x
Accès au bibtex
BibTex
titre
Detailed Land Cover Mapping from Multitemporal Landsat-8 Data of Different Cloud Cover
auteur
Christina Karakizi, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou, Georgia Antoniou
article
Remote Sensing, MDPI, 2018, 10 (8), pp.1214. ⟨10.3390/rs10081214⟩
DOI
DOI : 10.3390/rs10081214
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

titre
AtlasNet: Multi-atlas Non-linear Deep Networks for Medical Image Segmentation
auteur
Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Norbert Bus, Rafael Marini Silva, Evangelia I. Zacharaki, Marie-Pierre Revel, Nikos Paragios
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2018, Granada, Spain
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01958236/file/camera_ready.pdf BibTex
titre
Linear and Deformable Image Registration with 3D Convolutional Neural Networks
auteur
Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Marie-Pierre Revel, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios
article
Reconstruction and Analysis of Moving Body Organs, 21th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2018, Sep 2018, Grenada, Spain
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01935607/file/linear_and_deformable_image_registration_RAMBO2018.pdf BibTex
titre
Context Aware 3D CNNs for Brain Tumor Segmentation
auteur
Siddhartha Chandra, Maria Vakalopoulou, Lucas Fidon, Enzo Battistella, Théo Estienne, Roger Sun, Charlotte Robert, Eric Deutsch, Nikos Paragios
article
MICCAI Brainlesion Workshop, Sep 2018, Granada, Spain
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01959610/file/chandra_etal.pdf BibTex
titre
Stacked Encoder-Decoders for Accurate Semantic Segmentation of Very High Resolution Satellite Datasets
auteur
Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
article
IGARSS 2018 - 38th annual International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2018, Valencia, Spain. pp.1-4
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01870857/file/IGARSS2018_v8.pdf BibTex
titre
Deep patch-based priors under a fully convolutional encoder-decoder architecture for interstitial lung disease segmentation
auteur
Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel, Evangelia I. Zacharaki
article
ISBI’18 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, D.C., United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01721714/file/Vakalopoulou_etal_ISBI18.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Identifying the Best Machine Learning Algorithms for Brain Tumor Segmentation, Progression Assessment, and Overall Survival Prediction in the BRATS Challenge
auteur
Spyridon Bakas, Mauricio Reyes, Enzo Battistella, Siddhartha Chandra, Théo Estienne, Lucas Fidon, Maria Vakalopoulou, Roger Sun, Et Al., Éric Deutsch, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Bjoern Menze
article
2018
Accès au bibtex
BibTex

2017

Conference papers

titre
Integrating edge/boundary priors with classification scores for building detection in very high resolution data
auteur
Maria Vakalopoulou, Norbert Bus, Konstantinos Karantzalos, Nikos Paragios
article
IEEE International geoscience and remote sensing symposium (IGARSS), Jul 2017, Fort Worth, TX, United States. pp.3309-3312, ⟨10.1109/IGARSS.2017.8127705⟩
DOI
DOI : 10.1109/IGARSS.2017.8127705
Accès au bibtex
BibTex
titre
Patch-based deep learning architectures for sparse annotated very high resolution datasets
auteur
Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article
Joint Urban Remote Sensing Event (JURSE), Mar 2017, Dubai, United Arab Emirates. ⟨10.1109/JURSE.2017.7924538⟩
DOI
DOI : 10.1109/JURSE.2017.7924538
Accès au bibtex
BibTex
titre
Per city-block, density estimation at build-up areas from aerial RGB imagery with deep learning
auteur
Theodosia Vardoulaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article
Joint Urban Remote Sensing Event (JURSE), Mar 2017, Dubai, United Arab Emirates. ⟨10.1109/JURSE.2017.7924605⟩
DOI
DOI : 10.1109/JURSE.2017.7924605
Accès au bibtex
BibTex

2016

Journal articles

titre
Graph-Based Registration, Change Detection, and Classification in Very High Resolution Multitemporal Remote Sensing Data
auteur
Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article
IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, IEEE, 2016, 9, pp.2940 - 2951. ⟨10.1109/JSTARS.2016.2557081⟩
DOI
DOI : 10.1109/JSTARS.2016.2557081
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01413419/file/Vak_etal_JSTARS_2016.pdf BibTex

Conference papers

titre
Simultaneous registration, segmentation and change detection from multisensor, multitemporal satellite image pairs.
auteur
Maria Vakalopoulou, Christos Platias, Maria Papadomanolaki, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
article
International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), Jul 2016, Beijing, China. ⟨10.1109/IGARSS.2016.7729469⟩
DOI
DOI : 10.1109/IGARSS.2016.7729469
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01413373/file/vakalopoulou_etal_igarss_2016.pdf BibTex

2015

Conference papers

titre
Building detection in very high resolution multispectral data with deep learning features
auteur
Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article
Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), 2015 IEEE International, Jul 2015, Milan, Italy. pp.1873-1876, ⟨10.1109/IGARSS.2015.7326158⟩
DOI
DOI : 10.1109/IGARSS.2015.7326158
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01264084/file/igarss_vak15.pdf BibTex
titre
Simultaneous Registration and Change Detection in Multitemporal, Very High Resolution Remote Sensing Data
auteur
Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karatzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article
2015 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition Workshops (CVPRW), Jun 2015, Boston, United States. pp.61-69, ⟨10.1109/CVPRW.2015.7301384⟩
DOI
DOI : 10.1109/CVPRW.2015.7301384
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01264072/file/vak_etal_cvprw.pdf BibTex