2020
Journal articles
- titre
- Standardization of brain MR images across machines and protocols: bridging the gap for MRI-based radiomics
- auteur
- Alexandre Carré, Guillaume Klausner, Myriam Edjlali, Marvin Lerousseau, Jade Briend-Diop, Roger Sun, Samy Ammari, Sylvain Reuzé, Emilie Alvarez Andres, Théo Estienne, Stéphane Niyoteka, Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Frédéric Dhermain, Nikos Paragios, Eric Deutsch, Catherine Oppenheim, Johan Pallud, Charlotte Robert
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.12340. ⟨10.1038/s41598-020-69298-z⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-020-69298-z
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-
- titre
- Deep Learning-Based Concurrent Brain Registration and Tumor Segmentation
- auteur
- Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Maria Vakalopoulou, Emilie Andres, Enzo Battistella, Alexandre Carré, Siddhartha Chandra, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Roger Sun, Charlotte Robert, Hugues Talbot, Nikos Paragios, Eric Deutsch
- article
- Frontiers in Computational Neuroscience, Frontiers, 2020, Multimodal Brain Tumor Segmentation and Beyond, ⟨10.3389/fncom.2020.00017⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fncom.2020.00017
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-
- titre
- Artificial intelligence applications for thoracic imaging
- auteur
- Guillaume Chassagnon, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
- article
- European Journal of Radiology, Elsevier, 2020, 123, pp.108774. ⟨10.1016/j.ejrad.2019.108774⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ejrad.2019.108774
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-
Conference papers
- titre
- Self-supervised Nuclei Segmentation in Histopathological Images Using Attention
- auteur
- Mihir Sahasrabudhe, Stergios Christodoulidis, Roberto Salgado, Stefan Michiels, Sherene Loi, Fabrice André, Nikos Paragios, Maria Vakalopoulou
- article
- MICCAI 2020 - 23rd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru. pp.393-402, ⟨10.1007/978-3-030-59722-1_38⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-59722-1_38
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Deep Multi-Instance Learning Using Multi-Modal Data for Diagnosis of Lymphocytosis
- auteur
- Mihir Sahasrabudhe, Pierre Sujobert, Evangelia Zacharaki, Eugénie Maurin, Béatrice Grange, Laurent Jallades, Nikos Paragios, Maria Vakalopoulou
- article
- 2020
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-
- titre
- Deep learning based registration using spatial gradients and noisy segmentation labels
- auteur
- Théo Estienne, Maria Vakalopoulou, Enzo Battistella, Alexandre Carré, Théophraste Henry, Marvin Lerousseau, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Eric Deutsch
- article
- 2020
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-
2019
Journal articles
- titre
- Deep learning: definition and perspectives for thoracic imaging
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
- article
- European Radiology, Springer Verlag, 2019, ⟨10.1007/s00330-019-06564-3⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s00330-019-06564-3
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-
- titre
- Use of Elastic Registration in Pulmonary MRI for the Assessment of Pulmonary Fibrosis in Patients with Systemic Sclerosis
- auteur
- Guillaume Chassagnon, Charlotte Martin, Rafael Marini, Maria Vakalopoulou, Alexis Régent, Luc Mouthon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
- article
- Radiology, Radiological Society of North America, 2019, 291 (2), pp.487-492. ⟨10.1148/radiol.2019182099⟩
- DOI
- DOI : 10.1148/radiol.2019182099
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-
- titre
- A Novel Object-Based Deep Learning Framework for Semantic Segmentation of Very High-Resolution Remote Sensing Data: Comparison with Convolutional and Fully Convolutional Networks
- auteur
- Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
- article
- Remote Sensing, MDPI, 2019, 11 (6), pp.684. ⟨10.3390/rs11060684⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/rs11060684
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-
Conference papers
- titre
- U-ReSNet: Ultimate Coupling of Registration and Segmentation with Deep Nets
- auteur
- Théo Estienne, Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Enzo Battistella, Marvin Lerousseau, Alexandre Carre, Guillaume Klausner, Roger Sun, Charlotte Robert, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios, Eric Deutsch
- article
- MICCAI 2019: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2019, MICCAI, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.310-319, ⟨10.1007/978-3-030-32248-9_35⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-32248-9_35
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-
- titre
- A multi-task deep learning framework coupling semantic segmentation and image reconstruction for very high resolution imagery
- auteur
- Maria Papadomanolaki, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou
- article
- IGARSS 2019 - IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, Japan
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-
- titre
- Image Registration of Satellite Imagery with Deep Convolutional Neural Networks
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios
- article
- IGARSS 2019 - 2019 IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, France. pp.4939-4942, ⟨10.1109/IGARSS.2019.8898220⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/IGARSS.2019.8898220
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-
- titre
- Detecting urban changes with recurrent neural networks from multitemporal Sentinel-2 data
- auteur
- Maria Papadomanolaki, Sagar Verma, Maria Vakalopoulou, Siddharth Gupta, Konstantinos Karantzalos
- article
- IGARSS 2019 - IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, Japan
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-
- titre
- Gene Expression High-Dimensional Clustering towards a Novel, Robust, Clinically Relevant and Highly Compact Cancer Signature
- auteur
- Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Roger Sun, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Eric Deutsch
- article
- IWBBIO 2019 - 7th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, May 2019, Granada, Spain
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-
2018
Journal articles
- titre
- A radiomics approach to assess tumour-infiltrating CD8 cells and response to anti-PD-1 or anti-PD-L1 immunotherapy: an imaging biomarker, retrospective multicohort study
- auteur
- Roger Sun, Elaine Johanna Limkin, Maria Vakalopoulou, Laurent Dercle, Stéphane Champiat, Shan Rong Han, Loic Verlingue, David Brandao, Andrea Lancia, Samy Ammari, Antoine Hollebecque, Jean-Yves Scoazec, Aurélien Marabelle, Christophe Massard, Jean-Charles Soria, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Éric Deutsch, Charles Ferté
- article
- Lancet Oncology, Elsevier, 2018, ⟨10.1016/S1470-2045(18)30413-3⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/S1470-2045(18)30413-3
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-
- titre
- Demystification of AI-driven medical image interpretation: past, present and future
- auteur
- Peter Savadjiev, Jaron Chong, Anthony Dohan, Maria Vakalopoulou, Caroline Reinhold, Nikos Paragios, Benoit Gallix
- article
- European Radiology, Springer Verlag, 2018, ⟨10.1007/s00330-018-5674-x⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s00330-018-5674-x
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-
- titre
- Detailed Land Cover Mapping from Multitemporal Landsat-8 Data of Different Cloud Cover
- auteur
- Christina Karakizi, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou, Georgia Antoniou
- article
- Remote Sensing, MDPI, 2018, 10 (8), ⟨10.3390/rs10081214⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/rs10081214
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-
Conference papers
- titre
- Context Aware 3D CNNs for Brain Tumor Segmentation
- auteur
- Siddhartha Chandra, Maria Vakalopoulou, Lucas Fidon, Enzo Battistella, Théo Estienne, Roger Sun, Charlotte Robert, Eric Deutsch, Nikos Paragios
- article
- MICCAI Brainlesion Workshop, Sep 2018, Granada, Spain
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-
- titre
- Linear and Deformable Image Registration with 3D Convolutional Neural Networks
- auteur
- Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Marie-Pierre Revel, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios
- article
- Reconstruction and Analysis of Moving Body Organs, 21th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2018, Sep 2018, Grenada, Spain
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-
- titre
- AtlasNet: Multi-atlas Non-linear Deep Networks for Medical Image Segmentation
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Norbert Bus, Rafael Marini Silva, Evangelia Zacharaki, Marie-Pierre Revel, Nikos Paragios
- article
- International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2018, Granada, Spain
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-
- titre
- Stacked Encoder-Decoders for Accurate Semantic Segmentation of Very High Resolution Satellite Datasets
- auteur
- Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
- article
- IGARSS 2018 - 38th annual International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2018, Valencia, Spain. pp.1-4
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-
- titre
- Deep patch-based priors under a fully convolutional encoder-decoder architecture for interstitial lung disease segmentation
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel, Evangelia Zacharaki
- article
- ISBI’18 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, D.C., United States
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Identifying the Best Machine Learning Algorithms for Brain Tumor Segmentation, Progression Assessment, and Overall Survival Prediction in the BRATS Challenge
- auteur
- Spyridon Bakas, Mauricio Reyes, Enzo Battistella, Siddhartha Chandra, Théo Estienne, Lucas Fidon, Maria Vakalopoulou, Roger Sun, Et Al., Éric Deutsch, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Bjoern Menze
- article
- 2018
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2017
Conference papers
- titre
- Integrating edge/boundary priors with classification scores for building detection in very high resolution data
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Norbert Bus, Konstantinos Karantzalos, Nikos Paragios
- article
- IEEE International geoscience and remote sensing symposium (IGARSS), Jul 2017, Fort Worth, TX, United States. pp.3309-3312, ⟨10.1109/IGARSS.2017.8127705⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/IGARSS.2017.8127705
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-
- titre
- Per city-block, density estimation at build-up areas from aerial RGB imagery with deep learning
- auteur
- Theodosia Vardoulaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
- article
- Joint Urban Remote Sensing Event (JURSE), Mar 2017, Dubai, United Arab Emirates. ⟨10.1109/JURSE.2017.7924605⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/JURSE.2017.7924605
- Accès au bibtex
-
- titre
- Patch-based deep learning architectures for sparse annotated very high resolution datasets
- auteur
- Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
- article
- Joint Urban Remote Sensing Event (JURSE), Mar 2017, Dubai, United Arab Emirates. ⟨10.1109/JURSE.2017.7924538⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/JURSE.2017.7924538
- Accès au bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Graph-Based Registration, Change Detection, and Classification in Very High Resolution Multitemporal Remote Sensing Data
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
- article
- IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, IEEE, 2016, 9, pp.2940 - 2951. ⟨10.1109/JSTARS.2016.2557081⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/JSTARS.2016.2557081
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-
Conference papers
- titre
- Simultaneous registration, segmentation and change detection from multisensor, multitemporal satellite image pairs.
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Christos Platias, Maria Papadomanolaki, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
- article
- International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), Jul 2016, Beijing, China. ⟨10.1109/IGARSS.2016.7729469⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/IGARSS.2016.7729469
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2015
Conference papers
- titre
- Building detection in very high resolution multispectral data with deep learning features
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
- article
- Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), 2015 IEEE International, Jul 2015, Milan, Italy. pp.1873-1876, ⟨10.1109/IGARSS.2015.7326158⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/IGARSS.2015.7326158
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Simultaneous Registration and Change Detection in Multitemporal, Very High Resolution Remote Sensing Data
- auteur
- Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karatzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
- article
- 2015 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition Workshops (CVPRW), Jun 2015, Boston, United States. pp.61-69, ⟨10.1109/CVPRW.2015.7301384⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/CVPRW.2015.7301384
- Accès au texte intégral et bibtex
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