Publications HAL de olivier commowick

2022

Conference papers

auteur
Thomas Durantel, Julie Coloigner, Olivier Commowick
titre
A convolutional Wasserstein distance for tractography evaluation : complementary study to state-of-the-art measures
article
ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Calcutta, India. ⟨10.1109/ISBI52829.2022.9761650⟩
identifiant
hal-03630777
DOI
DOI : 10.1109/ISBI52829.2022.9761650
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03630777/file/OT_paper.pdf BibTex
auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Julie Coloigner
titre
Imaging biomarker discovery in major depressive disorder with diffusion MRI multi-compartment models
article
OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom
identifiant
inserm-03934869
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-03934869/file/OHBM.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Benoit Combès, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Julien Cohen-Adad, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
titre
Reproducibility and evolution of diffusion MRI measurements within the cervical spinal cord in multiple sclerosis
article
ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-5
identifiant
inserm-03639907
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https://inserm.hal.science/inserm-03639907/file/Article_ISBI_2022_Feb7_2022.pdf BibTex

Poster communications

auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Gabriel Robert, Julie Coloigner
titre
Imaging biomarker discovery in major depressive disorder with diffusion MRI multi-compartment models
article
OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization of Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom. pp.1-1
identifiant
inserm-03934921
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https://inserm.hal.science/inserm-03934921/file/Pr%C3%A9sentation_OHBM_2022.pdf BibTex

2021

Conference papers

auteur
Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Arthur Masson, Michael Kain, Michel Dojat, Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky
titre
MSSEG-2: Un challenge d'imagerie médicale sur VIP
article
JCAD 2021, Dec 2021, En ligne, France
identifiant
hal-03708108
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03708108/file/Presentation_courte_Orateur_POP_Sorina_MSSEG-2_Un_challenge.pdf BibTex
auteur
Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Arthur Masson, Michael Kain, Michel Dojat, Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky
titre
MSSEG-2: A medical imaging challenge on VIP
article
EGI Conference 2021, Oct 2021, En ligne, France
identifiant
hal-03708105
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https://hal.science/hal-03708105/file/EGI_VIP_MSSEG2_v3.pdf BibTex
auteur
Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Charlotte Laurent, Jean-Christophe Ferré
titre
Patient specific tracts-based analysis of diffusion compartment models: application to multiple sclerosis patients with acute optic neuritis
article
ISMRM 2021 - International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2021, Toronto, Canada. pp.1-6
identifiant
hal-03202059
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https://inria.hal.science/hal-03202059/file/ISMRM_2021.pdf BibTex

2019

Conference papers

auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Tissue microstructure information from T2 relaxometry and diffusion MRI can identify multiple sclerosis (MS) lesions undergoing blood-brain barrier breakdown (BBB)
article
ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montreal, Canada. pp.1-4
identifiant
inserm-02153311
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https://inserm.hal.science/inserm-02153311/file/ISMRM_Chatterjee_2019.pdf BibTex
auteur
Francesca Galassi, Solène Tarride, Emmanuel Vallée, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Deep learning for multi-site ms lesions segmentation: two-step intensity standardization and generalized loss function
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1
identifiant
hal-02052250
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https://hal.science/hal-02052250/file/Template_ISBI2019.pdf BibTex
auteur
Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
titre
Online atlasing using an iterative centroid
article
MICCAI 2019 - 22nd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.366-374, ⟨10.1007/978-3-030-32248-9_41⟩
identifiant
inserm-02317392
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-32248-9_41
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https://inserm.hal.science/inserm-02317392/file/paper2061.pdf BibTex
auteur
Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
titre
Unbiased longitudinal brain atlas creation using robust linear registration and log-Euclidean framework for diffeomorphisms
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. pp.1038-1041, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759508⟩
identifiant
inserm-02099958
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759508
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https://inserm.hal.science/inserm-02099958/file/atlas.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Julien Cohen-Adad, Olivier Commowick, Benoit Combes, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
titre
Geometric evaluation of distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1696-1699, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759196⟩
identifiant
inserm-01986723
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759196
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https://inserm.hal.science/inserm-01986723/file/snoussi-caruyer-etal-isbi2019.pdf BibTex

2018

Conference papers

auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
titre
Identification of Gadolinium contrast enhanced regions in MS lesions using brain tissue microstructure information obtained from diffusion and T2 relaxometry MRI
article
21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2018), Sep 2018, Grenade, Spain. pp.63-71, ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_8⟩
identifiant
hal-01830532
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-00931-1_8
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https://hal.science/hal-01830532/file/MICAAI_2018_Camera_Ready.pdf BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Benoît Combès, Anne Kerbrat, Simon K Warfield, Christian Barillot
titre
A 3-year follow-up study of enhancing and non-enhancing multiple sclerosis (MS) lesions in MS patients demonstrating clinically isolated syndrome (CIS) using a multi-compartment T2 relaxometry (MCT2) model
article
ISMRM Annual Meeting 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1-5
identifiant
hal-01821694
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https://hal.science/hal-01821694/file/HAL_copy_ISMRM_2018-MS-CIS-3yr-followup-study-MCT2.pdf BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
titre
Multi-Compartment Model of Brain Tissues from T2 Relaxometry MRI Using Gamma Distribution
article
ISBI 2018 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington DC, United States. pp.141-144, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363541⟩
identifiant
hal-01744852
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2018.8363541
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https://hal.science/hal-01744852/file/Template_ISBI2018-copy.pdf BibTex
auteur
Francesca Galassi, Olivier Commowick, Emmanuel Vallee, Christian Barillot
titre
Voxel-wise Comparison with a-contrario Analysis for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions from Multimodal MRI
article
MICCAI BrainLes 2018 workshop, Alessandro Crimi; Spyridon Bakas, Sep 2018, Granada, Spain. pp.180-188, ⟨10.1007/978-3-030-11723-8_18⟩
identifiant
inserm-01888928
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-11723-8_18
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https://inserm.hal.science/inserm-01888928/file/miccai2018.pdf BibTex
auteur
Francesca Galassi, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Integration of Probabilistic Atlas and Graph Cuts for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis lesions
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM 2018), Jun 2018, Paris, France. pp.1-6
identifiant
hal-01823801
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https://hal.science/hal-01823801/file/FG_ISMRM_rev1.pdf BibTex
auteur
Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
titre
Anisotropic similarity, a constrained affine transformation: Application to brain development analysis
article
ISMRM 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1
identifiant
inserm-01871274
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https://inserm.hal.science/inserm-01871274/file/1781.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Alessandra Menafoglio, Simon K Warfield
titre
A Bayes Hilbert Space for Compartment Model Computing in Diffusion MRI
article
MICCAI 2018 - International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2018, Grenade, Spain. pp.72-80, ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_9⟩
identifiant
inserm-01937992
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-00931-1_9
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https://inserm.hal.science/inserm-01937992/file/MICCAI2018.pdf BibTex

2017

Conference papers

auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Gaining Insights Into Multiple Sclerosis Lesion Characteristics from Brain Tissue Microstructure Information: A Multi-Compartment T2 Relaxometry Approach
article
ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
identifiant
inserm-01543061
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https://inserm.hal.science/inserm-01543061/file/Gauss-MCM-poster.pdf BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Multi-Compartment T2 Relaxometry Model Using Gamma Distribution Representations: A Framework for Quantitative Estimation of Brain Tissue Microstructures
article
ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
identifiant
inserm-01543073
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BibTex
auteur
Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot
titre
L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration
article
20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩
identifiant
inserm-01556476
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30
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https://inserm.hal.science/inserm-01556476/file/MICCAI17-317.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
titre
Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
article
ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain
identifiant
inserm-01579134
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https://inserm.hal.science/inserm-01579134/file/snoussi_et_al_esmrmb2017.pdf BibTex

2016

Conference papers

auteur
Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Automatic Multiple Sclerosis lesion segmentation from Intensity-Normalized multi-channel MRI
article
Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure - MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece
identifiant
inserm-01424802
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https://inserm.hal.science/inserm-01424802/file/MSSEG_Beaumont_2.pdf BibTex
auteur
Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Multiple Sclerosis lesion segmentation using an automated multimodal Graph Cut
article
Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure – MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece. pp.1-8
identifiant
inserm-01417378
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01417378/file/Beaumont%20et%20al%2C%20MSSEG_Challenge_Proceedings.pdf BibTex
auteur
Benoit Combès, Anne Kerbrat, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
A Bayesian Model to Assess T2 Values and Their Changes Over Time in Quantitative MRI
article
19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.570 - 578, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_66⟩
identifiant
inserm-01349557
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_66
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https://inserm.hal.science/inserm-01349557/file/paper518.pdf BibTex
auteur
Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Simone Vantini, Simon K. Warfield
titre
Maximum Likelihood Estimators of Brain White Matter Microstructure
article
48th Scientific Meeting of the Italian Statistical Society, Jun 2016, Salerno, Italy
identifiant
inserm-01347200
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01347200/file/SIS2016.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Simon K Warfield, Simone Vantini
titre
Comprehensive Maximum Likelihood Estimation of Diffusion Compartment Models Towards Reliable Mapping of Brain Microstructure
article
19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.622 - 630, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_72⟩
identifiant
inserm-01349556
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_72
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https://inserm.hal.science/inserm-01349556/file/MICCAI2016.pdf BibTex

2015

Conference papers

auteur
Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain
titre
Shanoir: Software as a Service Environment to Manage Population Imaging Research Repositories
article
MICCAI Workshop on MAnagement and Processing of images for Population ImagiNG, Oct 2015, Munich, Germany. pp.23-30
identifiant
inserm-01244551
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https://inserm.hal.science/inserm-01244551/file/MICCAI-MAPPING-Workshop-Shanoir.pdf BibTex
auteur
Laurence Catanese, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Automatic graph cut segmentation of multiple sclerosis lesions
article
ISBI Longitudinal Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge, Apr 2015, New York, United States
identifiant
inserm-01304109
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https://inserm.hal.science/inserm-01304109/file/ISBI_Challenge_Catanese.pdf BibTex
auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Christian Barillot
titre
Interpolation and Averaging of Multi-Compartment Model Images
article
18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2015, Munich, Germany. pp.354-362, ⟨10.1007/978-3-319-24571-3_43⟩
identifiant
inserm-01185733
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-24571-3_43
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https://inserm.hal.science/inserm-01185733/file/Miccai_2015_interpolation.pdf BibTex
auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Maxime Taquet, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New York, United States. pp.717-720
identifiant
inserm-01118766
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https://inserm.hal.science/inserm-01118766/file/215_0204.pdf BibTex
auteur
Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Probabilistic One Class Learning for Automatic Detection of Multiple Sclerosis Lesions
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.486-489
identifiant
inserm-01127690
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01127690/file/Yogesh_ISBI_Camera_Ready.pdf BibTex
auteur
Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Robust Detection of Multiple Sclerosis Lesions from Intensity-Normalized Multi-Channel MRI
article
SPIE Medical Imaging, Feb 2015, Orlando, United States
identifiant
inserm-01127692
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https://inserm.hal.science/inserm-01127692/file/Yogesh_camera_ready_SPIE.pdf BibTex
auteur
Jean Pelletier, Jean-Philippe Ranjeva, Ayman Tourbah, Gilles Edan, Christian Barillot, Sophie Le Lamer, Bertrand Audoin, Audrey Rico, Lydie Crespy, Ben Ridley, W Zaaraoui, Sylviane Confort-Gouny, Maxime Guye, Adil Maarouf, Nathalie Caucheteux, Marie-Pierre Chaunu, Christophe Portefaix, Laurent Pierot, Olivier Commowick, Anne Kerbrat, Laurence Catanese, Valerie Cuvier, Julien Veys, Rebecca Pruss, Wilfried Hauke
titre
Results of a Phase 1b study to confirm safety and tolerability of olesoxime in multiple sclerosis patients
article
American Academy of Neurology, Apr 2015, Washington, DC, United States
identifiant
inserm-01244547
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BibTex
auteur
Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Quantification of Myelin Degeneration in Multiple Sclerosis within Clinical Scan Times
article
ISMRM, May 2015, Toronto, Canada
identifiant
inserm-01113277
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BibTex
auteur
Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Quantification de la fraction d’eau piégée dans la myéline – Faisabilité et évaluation clinique en SEP
article
SFRMBM, Mar 2015, Grenoble, France
identifiant
inserm-01121578
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BibTex

Poster communications

auteur
Renaud Hédouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
article
ESMRMB, Oct 2015, Edimbourg, United Kingdom. 2015
identifiant
inserm-01251208
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BibTex

2014

Conference papers

auteur
Christian Barillot, Yogesh Karpate, Alessandro Crimi, Olivier Commowick
titre
Analyse d'images spatio-temporelles dans la Sclérose en Plaques
article
Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France
identifiant
hal-00988875
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00988875/file/Barillot_RFIA_2014_final.pdf BibTex
auteur
Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Simultaneous Estimation of T1, T2 and B1 Maps From Relaxometry MR Sequences
article
MICCAI Workshop on Intelligent Imaging Linking MR Acquisition and Processing, Sep 2014, United States. pp.16-23
identifiant
inserm-01052853
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01052853/file/cao_intellmr2014.pdf BibTex
auteur
Fang Cao, Olivier Commowick, Camille Maumet, Christian Barillot
titre
Quantitative Relaxation Templates for the Human Brain at 3T
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.57-60
identifiant
inserm-00950843
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00950843/file/paper.pdf BibTex
auteur
Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot, Gilles Edan
titre
Longitudinal Intensity Normalization in Multiple Sclerosis Patients
article
MICCAI Workshop on Clinical Image-based Procedures, Sep 2014, Boston, United States. pp.1-8
identifiant
inserm-01074699
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01074699/file/Yogesh_Camera_Ready_CLIP_2014.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Jolene Singh, Simon K. Warfield
titre
Tracking the Cortico-Spinal Tract as a Multi-Modal Distribution of Streamlines from Local White Matter Microstructure Models
article
MICCAI Challenge on DTI Tractography Proceedings, Sep 2014, Boston, United States. pp.21-32
identifiant
inserm-01066812
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01066812/file/Miccai2014_DTI_Challenge_Stamm_withAcknowlegments.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Stefano Baraldo, Olivier Commowick, Simon K. Warfield
titre
Non-central chi estimation of multi-compartment models improves model selection by reducing overfitting
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2623
identifiant
inserm-00993964
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00993964/file/2623.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Christian Barillot, Simon K. Warfield
titre
Fast and robust detection of the optimal number of fascicles in diffusion images using model averaging theory
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2629
identifiant
inserm-00993965
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00993965/file/2629.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Fast Identification of Optimal Fascicle Configurations from Standard Clinical Diffusion MRI Using Akaike Information Criterion
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.238-241
identifiant
inserm-00987802
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00987802/file/astamm_isbi2014.pdf BibTex

2013

Conference papers

auteur
Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
Semi-Automatic Classification of Lesion Patterns in Patients with Clinically Isolated Syndrome
article
International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1102-1105, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556671⟩
identifiant
inserm-00800723
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556671
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00800723/file/Crimi_Isbi_2013.pdf BibTex
auteur
Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
Multiple Sclerosis Lesions Evolution in Patients with Clinically Isolated Syndrome
article
SPIE Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, United States. pp.86690I-86690I-8
identifiant
inserm-00781478
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00781478/file/8669_17.PDF BibTex
auteur
Sylvain Prima, Olivier Commowick
titre
Using bilateral symmetry to improve non-local means denoising of MR brain images
article
10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'2013), Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1-8, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556703⟩
identifiant
inserm-00804377
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556703
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Sylvain Prima, Olivier Commowick
titre
Multimodal rigid-body registration of 3D brain images using bilateral symmetry
article
Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, Lake Buena Vista (Orlando Area), United States. pp.866911, ⟨10.1117/12.2007075⟩
identifiant
inserm-00766642
DOI
DOI : 10.1117/12.2007075
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00766642/file/8669_36.PDF BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Tracking the Cortico-Spinal Tract from Low Spatial and Angular Resolution Diffusion MRI
article
MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge on Peritumoral White Matter Anatomy for Neurosurgical Decision-Making, Sep 2013, Japan. pp.43-53
identifiant
inserm-00849274
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https://inserm.hal.science/inserm-00849274/file/DTIChallenge_Article_2013.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Christian Barillot, Patrick Pérez
titre
Adaptive Multi-modal Particle Filtering for Probabilistic White Matter Tractography
article
Information Processing in Medical Imaging, Jul 2013, Monterey, United States. pp.594-606, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_50⟩
identifiant
inserm-00849053
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-38868-2_50
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https://inserm.hal.science/inserm-00849053/file/astamm_ipmi2013.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Vallee, Olivier Commowick, Camille Maumet, Aymeric Stamm, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Jean-Christophe Ferré, Clément de Guibert, Christian Barillot
titre
Statistical Analysis of White Matter Integrity for the Clinical Study of Specific Language Impairment in Children
article
MICCAI 2013 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2013, Japan. pp.187-195, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_17⟩
identifiant
inserm-00849267
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-02475-2_17
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https://inserm.hal.science/inserm-00849267/file/CDMRI13_Vallee.pdf BibTex

2012

Conference papers

auteur
Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
MRI Estimation of T1 Relaxation Time Using a Constrained Optimization Algorithm
article
MBIA 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.203-214
identifiant
inserm-00723849
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https://inserm.hal.science/inserm-00723849/file/workshop.pdf BibTex
auteur
Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima
titre
Automated diffeomorphic registration of anatomical structures with rigid parts: application to dynamic cervical MRI.
article
MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.163-70, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_21⟩
identifiant
inserm-00716106
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-33418-4_21
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https://inserm.hal.science/inserm-00716106/file/miccai2012_BMNReg.pdf https://inserm.hal.science/inserm-00716106/file/inserm-00716106_edited.pdf BibTex
auteur
Olivier Commowick, Aymeric Stamm
titre
Non-local robust detection of DTI white matter differences with small databases.
article
MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.476-84, ⟨10.1007/978-3-642-33454-2_59⟩
identifiant
inserm-00716094
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-33454-2_59
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https://inserm.hal.science/inserm-00716094/file/Miccai2012_NLMT.pdf https://inserm.hal.science/inserm-00716094/file/inserm-00716094_edited.pdf BibTex
auteur
Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima
titre
Block-Matching Strategies for Rigid Registration of Multimodal Medical Images
article
9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI'2012), May 2012, Barcelona, Spain. pp.700-703, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235644⟩
identifiant
inserm-00681610
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2012.6235644
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https://inserm.hal.science/inserm-00681610/file/isbi2012.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model: Part II
article
MICCAI 2012 DTI Tractography Challenge, Oct 2012, Nice, France. pp.12-20
identifiant
inserm-00725366
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https://inserm.hal.science/inserm-00725366/file/Workshop_DDITracto.pdf BibTex
auteur
Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield
titre
Registration and Analysis of White Matter Group Differences with a Multi-Fiber Model
article
15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.313-320
identifiant
inserm-00716110
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https://inserm.hal.science/inserm-00716110/file/paper_1124.pdf BibTex

2011

Conference papers

auteur
Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Romuald Seizeur, Patrick Pérez, Christian Barillot, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé
titre
Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model
article
MICCAI 2011 DTI Tractography Challenge Workshop, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.18-24
identifiant
inserm-00627893
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https://inserm.hal.science/inserm-00627893/file/Workshop_DDITracto.pdf BibTex
auteur
Ralph Suarez, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Sanjay Prabhu, Simon K. Warfield
titre
Automated detection of white matter fiber bundles
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2011, Apr 2011, Chicago, IL, United States. pp.845-848, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872536⟩
identifiant
inserm-00607800
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872536
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https://inserm.hal.science/inserm-00607800/file/ISBI-Suarez-FinalDraft_2_.pdf BibTex
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot, Romuald Seizeur, Sylvain Prima
titre
Comparison of 3 Diffusion Models to Track the Hand Motor Fibers within the Corticospinal Tract Using Functional, Anatomical and Diffusion MRI
article
MICCAI 2011 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'11), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.150-157
identifiant
inserm-00628264
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https://inserm.hal.science/inserm-00628264/file/Tractography_CDMRI_2011.pdf BibTex

2010

Conference papers

auteur
Olivier Commowick, Simon K Warfield
titre
Incorporating priors on expert performance parameters for segmentation validation and label fusion: a maximum a posteriori STAPLE.
article
Med Image Comput Comput Assist Interv, Sep 2010, China. pp.25-32
identifiant
inserm-00550016
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https://inserm.hal.science/inserm-00550016/file/CommowickMiccai2010.pdf BibTex
auteur
Vincent Garcia, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
titre
A Robust and Efficient Block Matching Framework for Non Linear Registration of Thoracic CT Images
article
Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China. pp.1-10
identifiant
inria-00616148
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https://inria.hal.science/inria-00616148/file/Garcia_2010_EMPIRE10_2.pdf BibTex
auteur
Liliane Ramus, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
titre
Construction of patient specific atlases from locally most similar anatomical pieces.
article
Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI), Sep 2010, China. pp.155-162
identifiant
inserm-00550024
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https://inserm.hal.science/inserm-00550024/file/RamusMiccai2010.pdf https://inserm.hal.science/inserm-00550024/file/inserm-00550024_edited.pdf BibTex

2009

Conference papers

auteur
Olivier Commowick, Simon K. K. Warfield, Grégoire Malandain
titre
Using Frankenstein's Creature Paradigm to Build a Patient Specific Atlas
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United States. pp.993--1000, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3_120⟩
identifiant
inria-00616133
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-04271-3_120
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https://inria.hal.science/inria-00616133/file/CommowickMiccai2009.pdf BibTex

2008

Conference papers

auteur
Olivier Commowick, Pierre Fillard, Olivier Clatz, Simon K Warfield
titre
Detection of DTI white matter abnormalities in multiple sclerosis patients.
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York City, United States. pp.975-82, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_116⟩
identifiant
inria-00502709
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-85988-8_116
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2007

Conference papers

auteur
Olivier Commowick, Grégoire Malandain
titre
Efficient Selection of the Most Similar Image in a Database for Critical Structures Segmentation
article
Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Part II, 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.203--210
identifiant
inria-00616045
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2006

Conference papers

auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Statistics on Diffeomorphisms in a Log-Euclidean Framework
article
1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.14-15
identifiant
inria-00635671
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https://inria.hal.science/inria-00635671/file/Arsigny_MFCA06.pdf BibTex
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms
article
MICCAI 2006 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Part I, 2006, Copenhaguen, Denmark. pp.924--931, ⟨10.1007/11866565_113⟩
identifiant
inria-00615594
DOI
DOI : 10.1007/11866565_113
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https://inria.hal.science/inria-00615594/file/arsigny_miccai06-1.pdf BibTex
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration
article
Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.120-127, ⟨10.1007/11784012_15⟩
identifiant
inria-00615607
DOI
DOI : 10.1007/11784012_15
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auteur
Olivier Commowick, Grégoire Malandain
titre
Evaluation of Atlas Construction Strategies in the Context of Radiotherapy Planning
article
Proceedings of the SA2PM Workshop (From Statistical Atlases to Personalized Models), 2006, Copenhagen, Denmark
identifiant
inria-00615605
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auteur
Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Jimena Costa, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
titre
An Efficient Locally Affine Framework for the Registration of Anatomical Structures
article
Proceedings of the Third IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.478-481
identifiant
inria-00615606
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2005

Conference papers

auteur
Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
titre
Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.927-34, ⟨10.1007/11566489_114⟩
identifiant
inria-00502673
DOI
DOI : 10.1007/11566489_114
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2004

Conference papers

auteur
Radu Stefanescu, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Non-Rigid Atlas to Subject Registration with Pathologies for Conformal Brain Radiotherapy
article
MICCAI 2004 - 7th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2004, Saint-Malo, France. pp.704-711, ⟨10.1007/978-3-540-30135-6_86⟩
identifiant
hal-03989487
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-30135-6_86
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https://inria.hal.science/hal-03989487/file/MICCAI04_paper.pdf BibTex