2023
Journal articles
- auteur
- Olivier Commowick, Benoît Combès, Frédéric Cervenansky, Michel Dojat
- titre
- Editorial: Automatic methods for multiple sclerosis new lesions detection and segmentation
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2023, 17, pp.1176625. ⟨10.3389/fnins.2023.1176625⟩
- identifiant
- hal-04076125
- DOI
- DOI : 10.3389/fnins.2023.1176625
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-
Preprints, Working Papers, ...
- auteur
- Thomas Durantel, Gabriel Girard, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Julie Coloigner
- titre
- A Riemannian framework for incorporating white matter bundle priors in ODF-based tractography algorithms.
- article
- 2023
- identifiant
- hal-04246380
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-
2022
Journal articles
- auteur
- Antoine Legouhy, François Rousseau, Christian Barillot, Olivier Commowick
- titre
- An iterative centroid approach for diffeomorphic online atlasing
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2022, 41 (9), pp.2521-2531. ⟨10.1109/tmi.2022.3166593⟩
- identifiant
- hal-03672588
- DOI
- DOI : 10.1109/tmi.2022.3166593
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-
Conference papers
- auteur
- Thomas Durantel, Julie Coloigner, Olivier Commowick
- titre
- A convolutional Wasserstein distance for tractography evaluation : complementary study to state-of-the-art measures
- article
- ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Calcutta, India. ⟨10.1109/ISBI52829.2022.9761650⟩
- identifiant
- hal-03630777
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI52829.2022.9761650
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-
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Julie Coloigner
- titre
- Imaging biomarker discovery in major depressive disorder with diffusion MRI multi-compartment models
- article
- OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom
- identifiant
- inserm-03934869
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-
- auteur
- Haykel Snoussi, Benoit Combès, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Julien Cohen-Adad, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
- titre
- Reproducibility and evolution of diffusion MRI measurements within the cervical spinal cord in multiple sclerosis
- article
- ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-5
- identifiant
- inserm-03639907
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-
Book sections
- auteur
- François Rousseau, Olivier Commowick, Julien Jomier, Nicolas Passat, Fabrice Wallois
- titre
- L’imagerie cérébrale néonatale
- article
- Le corps en images. Les nouvelles technologies d'imagerie pour la santé, pp.146-159, 2022, 978-2-271-14330-3
- identifiant
- hal-03295913
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-
Poster communications
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Gabriel Robert, Julie Coloigner
- titre
- Imaging biomarker discovery in major depressive disorder with diffusion MRI multi-compartment models
- article
- OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization of Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom. pp.1-1
- identifiant
- inserm-03934921
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-
2021
Journal articles
- auteur
- Roxana Ameli, Charles R.G. Guttmann, Juan Carlos Prieto, Fabien Rollot, Miklos Palotai, Sandra Vukusic, Romain Marignier, François Cotton, René Anxionnat, Jean-Paul Armspach, Bertrand Audoin, Christian Barillot, Isabelle Berry, Fabrice Bonneville, Claire Boutet, Giovanni Castelnovo, Frédéric Cervenanski, Mikael Cohen, Olivier Commowick, Jerome de Seze, Vincent Dousset, Francoise Durand-Dubief, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferré, Damien Galanaud, Tristan Glattard, Sylvie Grand, Justine Guillaumont, Rémy Guillevin, Salem Hannoun, Fabrice Heitz, Alexandre Krainik, Stéphane Kremer, Pierre Labauge, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Dominique Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Bruno Stankoff, Ayman Tourbah, Thomas Tourdias, Bruno Brochet, Michel Clanet, Nathalie Dufay, David Laplaud, Marie-Claire Maze, Thibault Moreau, Cédric Trolliet, Bernard Frangoulis, Javier Olaiz, Jean Pelletier, Bertrand Bourre, David Brassat, Philippe Cabre, Jean-Philippe Camdessanche, William Camu, Olivier Casez, Pierre Clavelou, Nicolas Collongues, Alain Creange, Gilles Defer, Marc Debouverie, Olivier Gout, Christine Lebrun-Frenay, Catherine Lubetzki, Caroline Papeix, Patrick Vermersch, Hélène Zephir
- titre
- Aquaporin 4 distribution in the brain and its relevance for the radiological appearance of neuromyelitis optica spectrum disease
- article
- Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2021, 48 (3), pp.170-175. ⟨10.1016/j.neurad.2019.03.015⟩
- identifiant
- hal-03538467
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neurad.2019.03.015
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-
- auteur
- Benoît Combès, Anne Kerbrat, Guillaume Pasquier, Olivier Commowick, Brandon Le Bon, Francesca Galassi, Philippe L'Hostis, Nora El Graoui, Raphael Chouteau, Emmanuel Cordonnier, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferré
- titre
- A Clinically-Compatible Workflow for Computer-Aided Assessment of Brain Disease Activity in Multiple Sclerosis Patients
- article
- Frontiers in Medicine, 2021, 8, pp.1-14. ⟨10.3389/fmed.2021.740248⟩
- identifiant
- hal-03466664
- DOI
- DOI : 10.3389/fmed.2021.740248
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Michaël Kain, Romain Casey, Roxana Ameli, Jean-Christophe Ferré, Anne Kerbrat, Thomas Tourdias, Frédéric Cervenansky, Sorina Camarasu-Pop, Tristan Glatard, Sandra Vukusic, Gilles Edan, Christian Barillot, Michel Dojat, Francois Cotton
- titre
- Multiple sclerosis lesions segmentation from multiple experts: The MICCAI 2016 challenge dataset
- article
- NeuroImage, 2021, 244, pp.1-8. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118589⟩
- identifiant
- hal-03358961
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2021.118589
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-
- auteur
- Marine Dubois, Antoine Legouhy, Isabelle Corouge, Olivier Commowick, Baptiste Morel, Patrick Pladys, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Maïa Proisy
- titre
- Multiparametric Analysis of Cerebral Development in Preterm Infants Using Magnetic Resonance Imaging
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2021, 15, pp.1-19. ⟨10.3389/fnins.2021.658002⟩
- identifiant
- hal-03202821
- DOI
- DOI : 10.3389/fnins.2021.658002
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-
- auteur
- Renaud Hédouin, Christian Barillot, Olivier Commowick
- titre
- Interpolation and averaging of diffusion MRI multi-compartment models
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2021, 40 (3), pp.916-927. ⟨10.1109/tmi.2020.3042765⟩
- identifiant
- hal-03110559
- DOI
- DOI : 10.1109/tmi.2020.3042765
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-
Conference papers
- auteur
- Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Arthur Masson, Michael Kain, Michel Dojat, Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky
- titre
- MSSEG-2: Un challenge d'imagerie médicale sur VIP
- article
- JCAD 2021, Dec 2021, En ligne, France
- identifiant
- hal-03708108
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-
- auteur
- Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Arthur Masson, Michael Kain, Michel Dojat, Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky
- titre
- MSSEG-2: A medical imaging challenge on VIP
- article
- EGI Conference 2021, Oct 2021, En ligne, France
- identifiant
- hal-03708105
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Charlotte Laurent, Jean-Christophe Ferré
- titre
- Patient specific tracts-based analysis of diffusion compartment models: application to multiple sclerosis patients with acute optic neuritis
- article
- ISMRM 2021 - International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2021, Toronto, Canada. pp.1-6
- identifiant
- hal-03202059
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-
Proceedings
- auteur
- Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky, François Cotton, Michel Dojat
- titre
- MSSEG-2 challenge proceedings: Multiple sclerosis new lesions segmentation challenge using a data management and processing infrastructure
- article
- MICCAI 2021 - 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg, France. , pp.126, 2021
- identifiant
- hal-03358968
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-
2020
Journal articles
- auteur
- Antoine Ackaouy, Nicolas Courty, Emmanuel Vallée, Olivier Commowick, Christian Barillot, Francesca Galassi
- titre
- Unsupervised Domain Adaptation With Optimal Transport in Multi-Site Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions From MRI Data
- article
- Frontiers in Computational Neuroscience, 2020, 14, pp.1-13. ⟨10.3389/fncom.2020.00019⟩
- identifiant
- hal-02317028
- DOI
- DOI : 10.3389/fncom.2020.00019
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-
- auteur
- Stephane Kremer, Salem Hannoun, Fabrice Bonneville, Francoise Durand-Dubief, Thomas Tourdias, Christian Barillot, Charles Guttmann, Sandra Vukusic, Vincent Dousset, Francois Cotton, R. Ameli, René Anxionnat, Bertrand Audoin, Arnaud Attye, Elise Bannier, Douraied Ben Salem, Marie-Paule Boncoeur-Martel, Gildas Bonhomme, Claire Boutet, Jean-Christophe Brisset, Frédéric Cervenansky, Béatrice Claise, Olivier Commowick, Jean-Marc Constans, Pascal Dardel, Hubert Desal, Jean-Christophe Ferré, Alina Gaultier, E. Gerardin, T. Glattard, Sylvie Grand, T. Grenier, Rémy Guillevin, A. Krainik, S. Lion, Nicolas Menjot de Champfleur, Lydiane Mondot, Olivier Outteryck, Nadya Pyatigorskaya, Jean-Pierre Pruvo, Sylvain Rabaste, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Jean-Claude Sadik, Dominic Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Jean-Yves Tanguy, Ayman Tourbah, Bruno Brochet, Romain Casey, Jerome de Seze, Pascal Douek, F. Guillemin, David A. Laplaud, Christine Lebrun-Frenay, Lucilla Mansuy, Thibault Moreau, Javier Olaiz, Jean Pelletier, Claire Rigaud-Bully, Bruno Stankoff, Marc Debouverie, Gilles Edan, Jonathan Ciron, Catherine Lubetzki, Patrick Vermersch, Pierre Labauge, Gilles Defer, Eric Berger, Pierre Clavelou, O. Gout, Eric Thouvenot, Olivier Heinzlef, Abdullatif Al-Khedr, Bertrand Bourre, Olivier Casez, Philippe Cabre, Alexis Montcuquet, Alain Créange, Jean-Philippe Camdessanché, Serge Bakchine, A. Maurousset, Ivania Patry, Thomas de Broucker, Corinne Pottier, Jean-Philippe Neau, Céline Labeyrie, Chantal Nifle
- titre
- New OFSEP recommendations for MRI assessment of multiple sclerosis patients: Special consideration for gadolinium deposition and frequent acquisitions
- article
- Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2020, 47 (4), pp.250-258. ⟨10.1016/j.neurad.2020.01.083⟩
- identifiant
- hal-02570313
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neurad.2020.01.083
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-
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, Maia Proisy, François Rousseau, Christian Barillot
- titre
- Regional brain development analysis through registration using anisotropic similarity, a constrained affine transformation
- article
- PLoS ONE, 2020, 15 (2), pp.e0214174. ⟨10.1371/journal.pone.0214174⟩
- identifiant
- inserm-02493143
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0214174
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-
2019
Journal articles
- auteur
- Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Gabriel Robert, Christian Barillot, Dominique Drapier
- titre
- White matter abnormalities in depression: a categorical and phenotypic diffusion MRI study.
- article
- Neuroimage-Clinical, 2019, 22, pp.101710. ⟨10.1016/j.nicl.2019.101710⟩
- identifiant
- inserm-01938407
- DOI
- DOI : 10.1016/j.nicl.2019.101710
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-
Conference papers
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- titre
- Tissue microstructure information from T2 relaxometry and diffusion MRI can identify multiple sclerosis (MS) lesions undergoing blood-brain barrier breakdown (BBB)
- article
- ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montreal, Canada. pp.1-4
- identifiant
- inserm-02153311
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-
- auteur
- Francesca Galassi, Solène Tarride, Emmanuel Vallée, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Deep learning for multi-site ms lesions segmentation: two-step intensity standardization and generalized loss function
- article
- ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1
- identifiant
- hal-02052250
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-
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
- titre
- Online atlasing using an iterative centroid
- article
- MICCAI 2019 - 22nd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.366-374, ⟨10.1007/978-3-030-32248-9_41⟩
- identifiant
- inserm-02317392
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-32248-9_41
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-
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
- titre
- Unbiased longitudinal brain atlas creation using robust linear registration and log-Euclidean framework for diffeomorphisms
- article
- ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. pp.1038-1041, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759508⟩
- identifiant
- inserm-02099958
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759508
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-
- auteur
- Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Julien Cohen-Adad, Olivier Commowick, Benoit Combes, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
- titre
- Geometric evaluation of distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
- article
- ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1696-1699, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759196⟩
- identifiant
- inserm-01986723
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759196
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-
Habilitation à diriger des recherches
- auteur
- Olivier Commowick
- titre
- Compartments imaging for the characterization of brain diseases from quantitative MRI
- article
- Neurons and Cognition [q-bio.NC]. Université de Rennes 1, France, 2019
- identifiant
- tel-02173963
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-
2018
Journal articles
- auteur
- Aline Carsin-Vu, Isabelle Corouge, Olivier Commowick, Guillaume Bouzillé, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré, Maia Proisy
- titre
- Measurement of pediatric regional cerebral blood flow from 6 months to 15 years of age in a clinical population
- article
- European Journal of Radiology, 2018, 101, pp.38-44. ⟨10.1016/j.ejrad.2018.02.003⟩
- identifiant
- inserm-01708945
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ejrad.2018.02.003
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Audrey Istace, Michael Kain, Baptiste Laurent, Florent Leray, Mathieu Simon, Sorina Camarasu Pop, Pascal Girard, Roxana Ameli, Jean-Christophe Ferré, Anne Kerbrat, Thomas Tourdias, Frédéric Cervenansky, Tristan Glatard, Jeremy Beaumont, Senan Doyle, Florence Forbes, Jesse Knight, April Khademi, Amirreza Mahbod, Chunliang Wang, Richard Mckinley, Franca Wagner, John Muschelli, Elizabeth Sweeney, Eloy Roura, Xavier Llado, Michel Santos, Wellington P Santos, Abel G Silva-Filho, Xavier Tomas-Fernandez, Hélène Urien, Isabelle Bloch, Sergi Valverde, Mariano Cabezas, Francisco Javier Vera-Olmos, Norberto Malpica, Charles R G Guttmann, Sandra Vukusic, Gilles Edan, Michel Dojat, Martin Styner, Simon K. Warfield, François Cotton, Christian Barillot
- titre
- Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure
- article
- Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.13650. ⟨10.1038/s41598-018-31911-7⟩
- identifiant
- inserm-01847873
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-018-31911-7
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Anne Kerbrat, Benoît Combès, Olivier Commowick, Adil Maarouf, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Ayman Tourbah, Jean-Philippe Ranjeva, Christian Barillot, Gilles Edan
- titre
- USPIO-positive MS lesions are associated with greater tissue damage than gadolinium-positive-only lesions during 3-year follow-up
- article
- Multiple Sclerosis Journal, 2018, 24 (14), pp.1852-1861. ⟨10.1177/1352458517736148⟩
- identifiant
- inserm-02457629
- DOI
- DOI : 10.1177/1352458517736148
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-
Conference papers
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
- titre
- Identification of Gadolinium contrast enhanced regions in MS lesions using brain tissue microstructure information obtained from diffusion and T2 relaxometry MRI
- article
- 21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2018), Sep 2018, Grenade, Spain. pp.63-71, ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_8⟩
- identifiant
- hal-01830532
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-00931-1_8
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-
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Benoît Combès, Anne Kerbrat, Simon K Warfield, Christian Barillot
- titre
- A 3-year follow-up study of enhancing and non-enhancing multiple sclerosis (MS) lesions in MS patients demonstrating clinically isolated syndrome (CIS) using a multi-compartment T2 relaxometry (MCT2) model
- article
- ISMRM Annual Meeting 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1-5
- identifiant
- hal-01821694
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
- titre
- Multi-Compartment Model of Brain Tissues from T2 Relaxometry MRI Using Gamma Distribution
- article
- ISBI 2018 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington DC, United States. pp.141-144, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363541⟩
- identifiant
- hal-01744852
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2018.8363541
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure
- article
- JFR 2018 - Journées Françaises de Radiologie, Oct 2018, Paris, France. pp.1-19
- identifiant
- inserm-01895603
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-
- auteur
- Francesca Galassi, Olivier Commowick, Emmanuel Vallee, Christian Barillot
- titre
- Voxel-wise Comparison with a-contrario Analysis for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions from Multimodal MRI
- article
- MICCAI BrainLes 2018 workshop, Alessandro Crimi; Spyridon Bakas, Sep 2018, Granada, Spain. pp.180-188, ⟨10.1007/978-3-030-11723-8_18⟩
- identifiant
- inserm-01888928
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-11723-8_18
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Francesca Galassi, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Integration of Probabilistic Atlas and Graph Cuts for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis lesions
- article
- International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM 2018), Jun 2018, Paris, France. pp.1-6
- identifiant
- hal-01823801
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
- titre
- Anisotropic similarity, a constrained affine transformation: Application to brain development analysis
- article
- ISMRM 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1
- identifiant
- inserm-01871274
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-
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Alessandra Menafoglio, Simon K Warfield
- titre
- A Bayes Hilbert Space for Compartment Model Computing in Diffusion MRI
- article
- MICCAI 2018 - International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2018, Grenade, Spain. pp.72-80, ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_9⟩
- identifiant
- inserm-01937992
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-00931-1_9
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-
Preprints, Working Papers, ...
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Benoît Combès, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- titre
- A three year follow-up study of gadolinium enhanced and non-enhanced regions in multiple sclerosis lesions using a multi-compartment T2 relaxometry model.
- article
- 2018
- identifiant
- hal-01837974
- DOI
- DOI : 10.1101/365379
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- auteur
- Aaron Carass, Snehashis Roy, Amod Jog, Jennifer L. Cuzzocreo, Elizabeth Magrath, Adrian Gherman, Julia Button, James Nguyen, Ferran Prados, Carole H. Sudre, Manuel Jorge Cardoso, Niamh Cawley, Olga Ciccarelli, Claudia A.M. Wheeler-Kingshott, Sébastien Ourselin, Laurence Catanese, Hrishikesh Deshpande, Pierre Maurel, Olivier Commowick, Christian Barillot, Xavier Tomas-Fernandez, Simon K. Warfield, Suthirth Vaidya, Abhijith Chunduru, Ramanathan Muthuganapathy, Ganapathy Krishnamurthi, Andrew Jesson, Tal Arbel, Oskar Maier, Heinz Handels, Leonardo O. Iheme, Devrim Unay, Saurabh Jain, Diana M. Sima, Dirk Smeets, Mohsen Ghafoorian, Bram Platel, Ariel Birenbaum, Hayit Greenspan, Pierre-Louis Bazin, Peter A. Calabresi, Ciprian M. Crainiceanu, Lotta M. Ellingsen, Daniel S. Reich, Jerry L. Prince, Dzung L. Pham
- titre
- Longitudinal multiple sclerosis lesion segmentation: Resource and challenge
- article
- NeuroImage, 2017, 148, pp.77 - 102. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.12.064⟩
- identifiant
- inserm-01480156
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.12.064
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Renaud Hédouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Maxime Taquet, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- titre
- Block-Matching Distortion Correction of Echo-Planar Images With Opposite Phase Encoding Directions
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2017, 36 (5), pp.1106 - 1115. ⟨10.1109/TMI.2016.2646920⟩
- identifiant
- hal-01436561
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2016.2646920
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- titre
- Multi-Compartment T2 Relaxometry Model Using Gamma Distribution Representations: A Framework for Quantitative Estimation of Brain Tissue Microstructures
- article
- ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
- identifiant
- inserm-01543073
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- titre
- Gaining Insights Into Multiple Sclerosis Lesion Characteristics from Brain Tissue Microstructure Information: A Multi-Compartment T2 Relaxometry Approach
- article
- ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
- identifiant
- inserm-01543061
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot
- titre
- L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration
- article
- 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩
- identifiant
- inserm-01556476
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30
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-
- auteur
- Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
- titre
- Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
- article
- ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain
- identifiant
- inserm-01579134
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-
2016
Journal articles
- auteur
- Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Anthony Baire, Ines Fackfack, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain
- titre
- Shanoir: Applying the Software as a Service Distribution Model to Manage Brain Imaging Research Repositories
- article
- Frontiers in information and communication technologies, 2016, MAPPING: MAnagement and Processing of Images for Population ImagiNG, ⟨10.3389/fict.2016.00025⟩
- identifiant
- inserm-01404864
- DOI
- DOI : 10.3389/fict.2016.00025
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-
- auteur
- Christian Barillot, Gilles Edan, Olivier Commowick
- titre
- Imaging biomarkers in Multiple Sclerosis: from image analysis to population imaging
- article
- Medical Image Analysis, 2016, 33, pp.134-139. ⟨10.1016/j.media.2016.06.017⟩
- identifiant
- hal-01333583
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2016.06.017
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-
Conference papers
- auteur
- Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Automatic Multiple Sclerosis lesion segmentation from Intensity-Normalized multi-channel MRI
- article
- Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure - MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece
- identifiant
- inserm-01424802
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-
- auteur
- Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Multiple Sclerosis lesion segmentation using an automated multimodal Graph Cut
- article
- Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure – MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece. pp.1-8
- identifiant
- inserm-01417378
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-
- auteur
- Benoit Combès, Anne Kerbrat, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- A Bayesian Model to Assess T2 Values and Their Changes Over Time in Quantitative MRI
- article
- 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.570 - 578, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_66⟩
- identifiant
- inserm-01349557
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_66
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Simone Vantini, Simon K. Warfield
- titre
- Maximum Likelihood Estimators of Brain White Matter Microstructure
- article
- 48th Scientific Meeting of the Italian Statistical Society, Jun 2016, Salerno, Italy
- identifiant
- inserm-01347200
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-
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Simon K Warfield, Simone Vantini
- titre
- Comprehensive Maximum Likelihood Estimation of Diffusion Compartment Models Towards Reliable Mapping of Brain Microstructure
- article
- 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.622 - 630, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_72⟩
- identifiant
- inserm-01349556
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_72
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-
Proceedings
- auteur
- Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky, Roxana Ameli
- titre
- MSSEG Challenge Proceedings: Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure
- article
- MICCAI, Oct 2016, Athènes, Greece. 2016
- identifiant
- inserm-01397806
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-
2015
Journal articles
- auteur
- Roxana Amélie, René Anxionnat, Jean-Paul Armspach, Bertrand Audoin, Christian Barillot, Isabelle Berry, Fabrice Bonneville, Claire Boutet, Giovanni Castelnovo, Frédéric Cervenansky, Mikael Cohen, Olivier Commowick, François Cotton, Jérôme de Seze, Vincent Dousset, Françoise Durand-Dubief, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferre, Damien Galanaud, Tristan Glattard, Sylvie Grand, Justine Guillaumont, Rémy Guillevin, Charles Guttmann, Salem Hannoun, Fabrice Heitz, Alexandre Krainik, Stéphane Kremer, Pierre Labauge, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Dominique Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Bruno Stankoff, Thomas Tourdias, Ayman Tourbah, Sandra Vukusic
- titre
- OFSEP, a nationwide cohort of people with multiple sclerosis: Consensus minimal MRI protocol
- article
- Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2015, 42 (3), pp.133 - 140. ⟨10.1016/j.neurad.2014.12.001⟩
- identifiant
- hal-01378309
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neurad.2014.12.001
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, Jean-Philippe Ranjeva, Gilles Edan, Christian Barillot
- titre
- Diffusion MRI abnormalities detection with orientation distribution functions: A multiple sclerosis longitudinal study
- article
- Medical Image Analysis, 2015, 22 (1), pp.114-123. ⟨10.1016/j.media.2015.02.005⟩
- identifiant
- inserm-01134107
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2015.02.005
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-
- auteur
- Tristan Glatard, Yann Cointepas, Olivier Commowick, Michael Kain, Baptiste Laurent, Florent Leray, Christian Barillot
- titre
- CARMIN: a common web API for remote pipeline execution
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2015, 9, ⟨10.3389/conf.fnins.2015.91.00053⟩
- identifiant
- hal-01576182
- DOI
- DOI : 10.3389/conf.fnins.2015.91.00053
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Sonia Pujol, William Wells, Carlo Pierpaoli, Caroline Brun, James Gee, Guang Cheng, Baba Vemuri, Olivier Commowick, Sylvain Prima, Aymeric Stamm, Maged Goubran, Ali Khan, Terry Peters, Peter Neher, Klaus H Maier-Hein, Yundi Shi, Antonio Tristan-Vega, Gopalkrishna Veni, Ross Whitaker, Martin Styner, Carl-Fredrik Westin, Sylvain Gouttard, Isaiah Norton, Laurent Chauvin, Hatsuho Mamata, Guido Gerig, Arya Nabavi, Alexandra Golby, Ron Kikinis
- titre
- The DTI Challenge: Toward Standardized Evaluation of Diffusion Tensor Imaging Tractography for Neurosurgery
- article
- Journal of Neuroimaging, 2015, pp.8. ⟨10.1111/jon.12283⟩
- identifiant
- inserm-01185878
- DOI
- DOI : 10.1111/jon.12283
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-
Conference papers
- auteur
- Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain
- titre
- Shanoir: Software as a Service Environment to Manage Population Imaging Research Repositories
- article
- MICCAI Workshop on MAnagement and Processing of images for Population ImagiNG, Oct 2015, Munich, Germany. pp.23-30
- identifiant
- inserm-01244551
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-
- auteur
- Laurence Catanese, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Automatic graph cut segmentation of multiple sclerosis lesions
- article
- ISBI Longitudinal Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge, Apr 2015, New York, United States
- identifiant
- inserm-01304109
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-
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Christian Barillot
- titre
- Interpolation and Averaging of Multi-Compartment Model Images
- article
- 18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2015, Munich, Germany. pp.354-362, ⟨10.1007/978-3-319-24571-3_43⟩
- identifiant
- inserm-01185733
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-24571-3_43
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-
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Maxime Taquet, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- titre
- Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New York, United States. pp.717-720
- identifiant
- inserm-01118766
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-
- auteur
- Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Probabilistic One Class Learning for Automatic Detection of Multiple Sclerosis Lesions
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.486-489
- identifiant
- inserm-01127690
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
- titre
- Robust Detection of Multiple Sclerosis Lesions from Intensity-Normalized Multi-Channel MRI
- article
- SPIE Medical Imaging, Feb 2015, Orlando, United States
- identifiant
- inserm-01127692
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Jean Pelletier, Jean-Philippe Ranjeva, Ayman Tourbah, Gilles Edan, Christian Barillot, Sophie Le Lamer, Bertrand Audoin, Audrey Rico, Lydie Crespy, Ben Ridley, W Zaaraoui, Sylviane Confort-Gouny, Maxime Guye, Adil Maarouf, Nathalie Caucheteux, Marie-Pierre Chaunu, Christophe Portefaix, Laurent Pierot, Olivier Commowick, Anne Kerbrat, Laurence Catanese, Valerie Cuvier, Julien Veys, Rebecca Pruss, Wilfried Hauke
- titre
- Results of a Phase 1b study to confirm safety and tolerability of olesoxime in multiple sclerosis patients
- article
- American Academy of Neurology, Apr 2015, Washington, DC, United States
- identifiant
- inserm-01244547
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- titre
- Quantification of Myelin Degeneration in Multiple Sclerosis within Clinical Scan Times
- article
- ISMRM, May 2015, Toronto, Canada
- identifiant
- inserm-01113277
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- titre
- Quantification de la fraction d’eau piégée dans la myéline – Faisabilité et évaluation clinique en SEP
- article
- SFRMBM, Mar 2015, Grenoble, France
- identifiant
- inserm-01121578
- Accès au bibtex
-
Patents
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- titre
- Method of characterizing molecular diffusion within a body from a set of diffusionweighted magnetic resonance signals and apparatus for carrying out such a method
- article
- France, Patent n° : 069127 WO. 2015
- identifiant
- hal-01576709
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- auteur
- Renaud Hédouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- titre
- Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
- article
- ESMRMB, Oct 2015, Edimbourg, United Kingdom. 2015
- identifiant
- inserm-01251208
- Accès au bibtex
-
2014
Journal articles
- auteur
- Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Ayman Tourbah, Isabelle Berry, Jean-Philippe Ranjeva, Gilles Edan, Christian Barillot
- titre
- Predictive Value of Imaging Markers at Multiple Sclerosis Disease Onset Based on Gadolinium- and USPIO-Enhanced MRI and Machine Learning
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (4), pp.e93024. ⟨10.1371/journal.pone.0093024⟩
- identifiant
- hal-00971524
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0093024
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield
- titre
- A Mathematical Framework for the Registration and Analysis of Multi-Fascicle Models for Population Studies of the Brain Microstructure
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2014, 33 (2), pp.504-517. ⟨10.1109/TMI.2013.2289381⟩
- identifiant
- inserm-00903679
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2013.2289381
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- auteur
- Christian Barillot, Yogesh Karpate, Alessandro Crimi, Olivier Commowick
- titre
- Analyse d'images spatio-temporelles dans la Sclérose en Plaques
- article
- Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France
- identifiant
- hal-00988875
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- titre
- Simultaneous Estimation of T1, T2 and B1 Maps From Relaxometry MR Sequences
- article
- MICCAI Workshop on Intelligent Imaging Linking MR Acquisition and Processing, Sep 2014, United States. pp.16-23
- identifiant
- inserm-01052853
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Fang Cao, Olivier Commowick, Camille Maumet, Christian Barillot
- titre
- Quantitative Relaxation Templates for the Human Brain at 3T
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.57-60
- identifiant
- inserm-00950843
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot, Gilles Edan
- titre
- Longitudinal Intensity Normalization in Multiple Sclerosis Patients
- article
- MICCAI Workshop on Clinical Image-based Procedures, Sep 2014, Boston, United States. pp.1-8
- identifiant
- inserm-01074699
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Jolene Singh, Simon K. Warfield
- titre
- Tracking the Cortico-Spinal Tract as a Multi-Modal Distribution of Streamlines from Local White Matter Microstructure Models
- article
- MICCAI Challenge on DTI Tractography Proceedings, Sep 2014, Boston, United States. pp.21-32
- identifiant
- inserm-01066812
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Stefano Baraldo, Olivier Commowick, Simon K. Warfield
- titre
- Non-central chi estimation of multi-compartment models improves model selection by reducing overfitting
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2623
- identifiant
- inserm-00993964
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Christian Barillot, Simon K. Warfield
- titre
- Fast and robust detection of the optimal number of fascicles in diffusion images using model averaging theory
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2629
- identifiant
- inserm-00993965
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- titre
- Fast Identification of Optimal Fascicle Configurations from Standard Clinical Diffusion MRI Using Akaike Information Criterion
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.238-241
- identifiant
- inserm-00987802
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2013
Journal articles
- auteur
- Irina Vidal-Migallón, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Julien Dauguet, Tom Vercauteren
- titre
- GPU & CPU implementation of Young - Van Vliet's Recursive Gaussian Smoothing Filter
- article
- Insight Journal, 2013, pp.16
- identifiant
- inserm-00855958
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- auteur
- Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
- titre
- Semi-Automatic Classification of Lesion Patterns in Patients with Clinically Isolated Syndrome
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1102-1105, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556671⟩
- identifiant
- inserm-00800723
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556671
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
- titre
- Multiple Sclerosis Lesions Evolution in Patients with Clinically Isolated Syndrome
- article
- SPIE Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, United States. pp.86690I-86690I-8
- identifiant
- inserm-00781478
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Sylvain Prima, Olivier Commowick
- titre
- Using bilateral symmetry to improve non-local means denoising of MR brain images
- article
- 10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'2013), Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1-8, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556703⟩
- identifiant
- inserm-00804377
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556703
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Sylvain Prima, Olivier Commowick
- titre
- Multimodal rigid-body registration of 3D brain images using bilateral symmetry
- article
- Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, Lake Buena Vista (Orlando Area), United States. pp.866911, ⟨10.1117/12.2007075⟩
- identifiant
- inserm-00766642
- DOI
- DOI : 10.1117/12.2007075
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- titre
- Tracking the Cortico-Spinal Tract from Low Spatial and Angular Resolution Diffusion MRI
- article
- MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge on Peritumoral White Matter Anatomy for Neurosurgical Decision-Making, Sep 2013, Japan. pp.43-53
- identifiant
- inserm-00849274
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Christian Barillot, Patrick Pérez
- titre
- Adaptive Multi-modal Particle Filtering for Probabilistic White Matter Tractography
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Jul 2013, Monterey, United States. pp.594-606, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_50⟩
- identifiant
- inserm-00849053
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-38868-2_50
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Emmanuel Vallee, Olivier Commowick, Camille Maumet, Aymeric Stamm, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Jean-Christophe Ferré, Clément de Guibert, Christian Barillot
- titre
- Statistical Analysis of White Matter Integrity for the Clinical Study of Specific Language Impairment in Children
- article
- MICCAI 2013 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2013, Japan. pp.187-195, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_17⟩
- identifiant
- inserm-00849267
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-02475-2_17
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Journal articles
- auteur
- Olivier Commowick, Alireza Akhondi-Asl, Simon K. Warfield
- titre
- Estimating A Reference Standard Segmentation with Spatially Varying Performance Parameters: Local MAP STAPLE
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2012, 31 (8), pp.1593-1606. ⟨10.1109/TMI.2012.2197406⟩
- identifiant
- inserm-00697775
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2012.2197406
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Christophe Person, Valérie Louis-Dorr, Sylvain Poussier, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Louis Maillard, Didier Wolf, Nicolas Gilet, Véronique Roch, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie
- titre
- Voxel-based quantitative analysis of brain images from F-18 Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography with a Block-Matching algorithm for spatial normalization
- article
- Clinical Nuclear Medicine, 2012, 37 (3), pp.268-273. ⟨10.1097/RLU.0b013e3182443b2d⟩
- identifiant
- hal-00651731
- DOI
- DOI : 10.1097/RLU.0b013e3182443b2d
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Ralph O. Suarez, Olivier Commowick, Sanjay P. Prabhu, Simon K. K. Warfield
- titre
- Automated delineation of white matter fiber tracts with a multiple region-of-interest approach.
- article
- NeuroImage, 2012, 59 (4), pp.3690-3700. ⟨10.1016/j.neuroimage.2011.11.043⟩
- identifiant
- inserm-00657707
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2011.11.043
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- auteur
- Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Gilles Edan, Christian Barillot
- titre
- MRI Estimation of T1 Relaxation Time Using a Constrained Optimization Algorithm
- article
- MBIA 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.203-214
- identifiant
- inserm-00723849
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima
- titre
- Automated diffeomorphic registration of anatomical structures with rigid parts: application to dynamic cervical MRI.
- article
- MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.163-70, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_21⟩
- identifiant
- inserm-00716106
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-33418-4_21
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Olivier Commowick, Aymeric Stamm
- titre
- Non-local robust detection of DTI white matter differences with small databases.
- article
- MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.476-84, ⟨10.1007/978-3-642-33454-2_59⟩
- identifiant
- inserm-00716094
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-33454-2_59
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima
- titre
- Block-Matching Strategies for Rigid Registration of Multimodal Medical Images
- article
- 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI'2012), May 2012, Barcelona, Spain. pp.700-703, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235644⟩
- identifiant
- inserm-00681610
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2012.6235644
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- titre
- Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model: Part II
- article
- MICCAI 2012 DTI Tractography Challenge, Oct 2012, Nice, France. pp.12-20
- identifiant
- inserm-00725366
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- auteur
- Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield
- titre
- Registration and Analysis of White Matter Group Differences with a Multi-Fiber Model
- article
- 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.313-320
- identifiant
- inserm-00716110
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2011
Journal articles
- auteur
- Keelin Murphy, Bram van Ginneken, Joseph M. Reinhardt, Sven Kabus, Kai Ding, Xiang Deng, Kunlin Cao, Kaifang Du, Gary E. Christensen, Vincent Garcia, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Ben Glocker, Nikolaos Paragios, Nassir Navab, Vladlena Gorbunova, Jon Sporring, Marleen de Bruijne, Xiao Han, Mattias P. Heinrich, Julia A. Schnabel, Mark Jenkinson, Cristian Lorenz, Marc Modat, Jamie R. Mcclelland, Sébastien Ourselin, Sacha Ea Muenzing, Max A. Viergever, Dante de Nigris, Louis D. Collins, Tal Arbel, Marta Peroni, Rui Li, Gregory C. Sharp, Alexander Schmidt-Richberg, Jan Ehrhardt, René Werner, Dirk Smeets, Dirk Loeckx, Gang Song, Nicholas Tustison, Brian Avants, James C. Gee, Marius Staring, Stefan Klein, Berend C. Stoel, Martin Urschler, Manuel Werlberger, Jef Vandemeulebroucke, Simon Rit, David Sarrut, Josien Pw Pluim
- titre
- Evaluation of registration methods on thoracic CT: the EMPIRE10 challenge.
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (11), pp.1901-20. ⟨10.1109/TMI.2011.2158349⟩
- identifiant
- inserm-00607794
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2011.2158349
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-
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Romuald Seizeur, Patrick Pérez, Christian Barillot, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé
- titre
- Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model
- article
- MICCAI 2011 DTI Tractography Challenge Workshop, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.18-24
- identifiant
- inserm-00627893
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-
- auteur
- Ralph Suarez, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Sanjay Prabhu, Simon K. Warfield
- titre
- Automated detection of white matter fiber bundles
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2011, Apr 2011, Chicago, IL, United States. pp.845-848, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872536⟩
- identifiant
- inserm-00607800
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872536
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-
- auteur
- Nicolas Wiest-Daesslé, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot, Romuald Seizeur, Sylvain Prima
- titre
- Comparison of 3 Diffusion Models to Track the Hand Motor Fibers within the Corticospinal Tract Using Functional, Anatomical and Diffusion MRI
- article
- MICCAI 2011 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'11), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.150-157
- identifiant
- inserm-00628264
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-
2010
Journal articles
- auteur
- Liliane Ramus, Juliette Thariat, Pierre-Yves Marcy, Yoann Pointreau, Guillaume Bera, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- titre
- Outils de contourage, utilisation et construction d'atlas anatomiques : exemples des cancers de la tete et du cou
- article
- Cancer/Radiothérapie, 2010, 14 (3), pp.206-12
- identifiant
- inria-00616098
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-
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Simon K Warfield
- titre
- Incorporating priors on expert performance parameters for segmentation validation and label fusion: a maximum a posteriori STAPLE.
- article
- Med Image Comput Comput Assist Interv, Sep 2010, China. pp.25-32
- identifiant
- inserm-00550016
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-
- auteur
- Vincent Garcia, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- titre
- A Robust and Efficient Block Matching Framework for Non Linear Registration of Thoracic CT Images
- article
- Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China. pp.1-10
- identifiant
- inria-00616148
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-
- auteur
- Liliane Ramus, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- titre
- Construction of patient specific atlases from locally most similar anatomical pieces.
- article
- Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI), Sep 2010, China. pp.155-162
- identifiant
- inserm-00550024
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-
2009
Journal articles
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
- titre
- A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Linear Registration
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2009, 33 (2), pp.222-238. ⟨10.1007/s10851-008-0135-9⟩
- identifiant
- inria-00616084
- DOI
- DOI : 10.1007/s10851-008-0135-9
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-
- auteur
- Richard Sims, Aurélie Isambert, Vincent Grégoire, François Bidault, Lydia Fresco, John Sage, John Mills, Jean Bourhis, Dimitri Lefkopoulos, Olivier Commowick, Mehdi Benkebil, Grégoire Malandain
- titre
- A pre-clinical assessment of an atlas-based automatic segmentation tool for the head and neck
- article
- Radiotherapy & Oncology, 2009, 93 (3), pp.474-8
- identifiant
- inria-00616090
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-
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Simon K. K. Warfield, Grégoire Malandain
- titre
- Using Frankenstein's Creature Paradigm to Build a Patient Specific Atlas
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United States. pp.993--1000, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3_120⟩
- identifiant
- inria-00616133
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-04271-3_120
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-
2008
Journal articles
- auteur
- Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Aurélie Isambert, Jimena Costa, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
- titre
- An efficient locally affine framework for the smooth registration of anatomical structures
- article
- Medical Image Analysis, 2008, 12 (4), pp.427-41. ⟨10.1016/j.media.2008.01.002⟩
- identifiant
- inria-00616074
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2008.01.002
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Vincent Grégoire, Grégoire Malandain
- titre
- Atlas-Based Delineation of Lymph Node Levels in Head and Neck Computed Tomography Images
- article
- Radiotherapy & Oncology, 2008, 87 (2), pp.281-289
- identifiant
- inria-00616080
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-
- auteur
- Aurélie Isambert, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Olivier Commowick, Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Dimitri Lefkopoulos
- titre
- Evaluation of an atlas-based automatic segmentation software for the delineation of brain organs at risk in a radiation therapy clinical context
- article
- Radiotherapy & Oncology, 2008, 87 (1), pp.93-9. ⟨10.1016/j.radonc.2007.11.030⟩
- identifiant
- inria-00616079
- DOI
- DOI : 10.1016/j.radonc.2007.11.030
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-
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Pierre Fillard, Olivier Clatz, Simon K Warfield
- titre
- Detection of DTI white matter abnormalities in multiple sclerosis patients.
- article
- International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York City, United States. pp.975-82, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_116⟩
- identifiant
- inria-00502709
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-540-85988-8_116
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-
2007
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- titre
- Efficient Selection of the Most Similar Image in a Database for Critical Structures Segmentation
- article
- Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Part II, 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.203--210
- identifiant
- inria-00616045
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-
Theses
- auteur
- Olivier Commowick
- titre
- Création et utilisation d'atlas anatomiques numériques pour la radiothérapie
- article
- Interface homme-machine [cs.HC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩
- identifiant
- tel-00133432
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-
2006
Conference papers
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- titre
- Statistics on Diffeomorphisms in a Log-Euclidean Framework
- article
- 1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.14-15
- identifiant
- inria-00635671
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-
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- titre
- A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration
- article
- Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.120-127, ⟨10.1007/11784012_15⟩
- identifiant
- inria-00615607
- DOI
- DOI : 10.1007/11784012_15
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-
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- titre
- A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms
- article
- MICCAI 2006 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Part I, 2006, Copenhaguen, Denmark. pp.924--931, ⟨10.1007/11866565_113⟩
- identifiant
- inria-00615594
- DOI
- DOI : 10.1007/11866565_113
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-
- auteur
- Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- titre
- Evaluation of Atlas Construction Strategies in the Context of Radiotherapy Planning
- article
- Proceedings of the SA2PM Workshop (From Statistical Atlases to Personalized Models), 2006, Copenhagen, Denmark
- identifiant
- inria-00615605
- Accès au bibtex
-
- auteur
- Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Jimena Costa, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
- titre
- An Efficient Locally Affine Framework for the Registration of Anatomical Structures
- article
- Proceedings of the Third IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.478-481
- identifiant
- inria-00615606
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-
Reports
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- titre
- A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Affine Registration
- article
- [Research Report] RR-5865, INRIA. 2006, pp.46
- identifiant
- inria-00070161
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-
2005
Journal articles
- auteur
- Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Stéphane Chanalet, Pierre-Yves Marcy, Jean-Louis Habrand, François Fauchon, Philippe Paquis, Adel Courdi, Olivier Commowick, Isabelle Rutten, Nicholas Ayache
- titre
- Atlas-based automatic segmentation of MR images: validation study on the brainstem in radiotherapy context
- article
- International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics, 2005, 61 (1), pp.289-98. ⟨10.1016/j.ijrobp.2004.08.055⟩
- identifiant
- inria-00615664
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijrobp.2004.08.055
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-
Conference papers
- auteur
- Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
- titre
- Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.927-34, ⟨10.1007/11566489_114⟩
- identifiant
- inria-00502673
- DOI
- DOI : 10.1007/11566489_114
- Accès au bibtex
-
2004
Conference papers
- auteur
- Radu Stefanescu, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
- titre
- Non-Rigid Atlas to Subject Registration with Pathologies for Conformal Brain Radiotherapy
- article
- MICCAI 2004 - 7th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2004, Saint-Malo, France. pp.704-711, ⟨10.1007/978-3-540-30135-6_86⟩
- identifiant
- hal-03989487
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-540-30135-6_86
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