Conference papers

auteur

Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot

titre

Gaining Insights Into Multiple Sclerosis Lesion Characteristics from Brain Tissue Microstructure Information: A Multi-Compartment T2 Relaxometry Approach

article

ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States

identifiant

inserm-01543061

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auteur

Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot

titre

Multi-Compartment T2 Relaxometry Model Using Gamma Distribution Representations: A Framework for Quantitative Estimation of Brain Tissue Microstructures

article

ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States

identifiant

inserm-01543073

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auteur

Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot

titre

L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration

article

20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩

identifiant

inserm-01556476

DOI

DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30

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auteur

Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot

titre

Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord

article

ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain

identifiant

inserm-01579134

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Conference papers

auteur

Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot

titre

Automatic Multiple Sclerosis lesion segmentation from Intensity-Normalized multi-channel MRI

article

Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure - MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece

identifiant

inserm-01424802

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auteur

Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot

titre

Multiple Sclerosis lesion segmentation using an automated multimodal Graph Cut

article

Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure – MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece. pp.1-8

identifiant

inserm-01417378

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auteur

Benoit Combès, Anne Kerbrat, Olivier Commowick, Christian Barillot

titre

A Bayesian Model to Assess T2 Values and Their Changes Over Time in Quantitative MRI

article

19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.570 - 578, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_66⟩

identifiant

inserm-01349557

DOI

DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_66

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auteur

Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Simone Vantini, Simon K. Warfield

titre

Maximum Likelihood Estimators of Brain White Matter Microstructure

article

48th Scientific Meeting of the Italian Statistical Society, Jun 2016, Salerno, Italy

identifiant

inserm-01347200

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auteur

Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Simon K Warfield, Simone Vantini

titre

Comprehensive Maximum Likelihood Estimation of Diffusion Compartment Models Towards Reliable Mapping of Brain Microstructure

article

19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.622 - 630, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_72⟩

identifiant

inserm-01349556

DOI

DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_72

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Conference papers

auteur

Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain

titre

Shanoir: Software as a Service Environment to Manage Population Imaging Research Repositories

article

MICCAI Workshop on MAnagement and Processing of images for Population ImagiNG, Oct 2015, Munich, Germany. pp.23-30

identifiant

inserm-01244551

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auteur

Laurence Catanese, Olivier Commowick, Christian Barillot

titre

Automatic graph cut segmentation of multiple sclerosis lesions

article

ISBI Longitudinal Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge, Apr 2015, New York, United States

identifiant

inserm-01304109

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auteur

Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Christian Barillot

titre

Interpolation and Averaging of Multi-Compartment Model Images

article

18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2015, Munich, Germany. pp.354-362, ⟨10.1007/978-3-319-24571-3_43⟩

identifiant

inserm-01185733

DOI

DOI : 10.1007/978-3-319-24571-3_43

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auteur

Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Maxime Taquet, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Simon K. Warfield, Christian Barillot

titre

Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images

article

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New York, United States. pp.717-720

identifiant

inserm-01118766

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auteur

Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot

titre

Probabilistic One Class Learning for Automatic Detection of Multiple Sclerosis Lesions

article

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.486-489

identifiant

inserm-01127690

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auteur

Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot

titre

Robust Detection of Multiple Sclerosis Lesions from Intensity-Normalized Multi-Channel MRI

article

SPIE Medical Imaging, Feb 2015, Orlando, United States

identifiant

inserm-01127692

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auteur

Jean Pelletier, Jean-Philippe Ranjeva, Ayman Tourbah, Gilles Edan, Christian Barillot, Sophie Le Lamer, Bertrand Audoin, Audrey Rico, Lydie Crespy, Ben Ridley, W Zaaraoui, Sylviane Confort-Gouny, Maxime Guye, Adil Maarouf, Nathalie Caucheteux, Marie-Pierre Chaunu, Christophe Portefaix, Laurent Pierot, Olivier Commowick, Anne Kerbrat, Laurence Catanese, Valerie Cuvier, Julien Veys, Rebecca Pruss, Wilfried Hauke

titre

Results of a Phase 1b study to confirm safety and tolerability of olesoxime in multiple sclerosis patients

article

American Academy of Neurology, Apr 2015, Washington, DC, United States

identifiant

inserm-01244547

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auteur

Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot

titre

Quantification of Myelin Degeneration in Multiple Sclerosis within Clinical Scan Times

article

ISMRM, May 2015, Toronto, Canada

identifiant

inserm-01113277

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auteur

Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot

titre

Quantification de la fraction d’eau piégée dans la myéline – Faisabilité et évaluation clinique en SEP

article

SFRMBM, Mar 2015, Grenoble, France

identifiant

inserm-01121578

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Conference papers

auteur

Christian Barillot, Yogesh Karpate, Alessandro Crimi, Olivier Commowick

titre

Analyse d'images spatio-temporelles dans la Sclérose en Plaques

article

Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France

identifiant

hal-00988875

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auteur

Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot

titre

Simultaneous Estimation of T1, T2 and B1 Maps From Relaxometry MR Sequences

article

MICCAI Workshop on Intelligent Imaging Linking MR Acquisition and Processing, Sep 2014, United States. pp.16-23

identifiant

inserm-01052853

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auteur

Fang Cao, Olivier Commowick, Camille Maumet, Christian Barillot

titre

Quantitative Relaxation Templates for the Human Brain at 3T

article

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.57-60

identifiant

inserm-00950843

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auteur

Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot, Gilles Edan

titre

Longitudinal Intensity Normalization in Multiple Sclerosis Patients

article

MICCAI Workshop on Clinical Image-based Procedures, Sep 2014, Boston, United States. pp.1-8

identifiant

inserm-01074699

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auteur

Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Jolene Singh, Simon K. Warfield

titre

Tracking the Cortico-Spinal Tract as a Multi-Modal Distribution of Streamlines from Local White Matter Microstructure Models

article

MICCAI Challenge on DTI Tractography Proceedings, Sep 2014, Boston, United States. pp.21-32

identifiant

inserm-01066812

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auteur

Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Stefano Baraldo, Olivier Commowick, Simon K. Warfield

titre

Non-central chi estimation of multi-compartment models improves model selection by reducing overfitting

article

ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2623

identifiant

inserm-00993964

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auteur

Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Christian Barillot, Simon K. Warfield

titre

Fast and robust detection of the optimal number of fascicles in diffusion images using model averaging theory

article

ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2629

identifiant

inserm-00993965

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auteur

Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot

titre

Fast Identification of Optimal Fascicle Configurations from Standard Clinical Diffusion MRI Using Akaike Information Criterion

article

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.238-241

identifiant

inserm-00987802

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Conference papers

auteur

Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot

titre

Semi-Automatic Classification of Lesion Patterns in Patients with Clinically Isolated Syndrome

article

International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1102-1105, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556671⟩

identifiant

inserm-00800723

DOI

DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556671

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auteur

Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot

titre

Multiple Sclerosis Lesions Evolution in Patients with Clinically Isolated Syndrome

article

SPIE Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, United States. pp.86690I-86690I-8

identifiant

inserm-00781478

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auteur

Sylvain Prima, Olivier Commowick

titre

Using bilateral symmetry to improve non-local means denoising of MR brain images

article

10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'2013), Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1-8, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556703⟩

identifiant

inserm-00804377

DOI

DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556703

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auteur

Sylvain Prima, Olivier Commowick

titre

Multimodal rigid-body registration of 3D brain images using bilateral symmetry

article

Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, Lake Buena Vista (Orlando Area), United States. pp.866911, ⟨10.1117/12.2007075⟩

identifiant

inserm-00766642

DOI

DOI : 10.1117/12.2007075

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auteur

Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot

titre

Tracking the Cortico-Spinal Tract from Low Spatial and Angular Resolution Diffusion MRI

article

MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge on Peritumoral White Matter Anatomy for Neurosurgical Decision-Making, Sep 2013, Japan. pp.43-53

identifiant

inserm-00849274

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auteur

Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Christian Barillot, Patrick Pérez

titre

Adaptive Multi-modal Particle Filtering for Probabilistic White Matter Tractography

article

Information Processing in Medical Imaging, Jul 2013, Monterey, United States. pp.594-606, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_50⟩

identifiant

inserm-00849053

DOI

DOI : 10.1007/978-3-642-38868-2_50

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auteur

Emmanuel Vallee, Olivier Commowick, Camille Maumet, Aymeric Stamm, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Jean-Christophe Ferré, Clément de Guibert, Christian Barillot

titre

Statistical Analysis of White Matter Integrity for the Clinical Study of Specific Language Impairment in Children

article

MICCAI 2013 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2013, Japan. pp.187-195, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_17⟩

identifiant

inserm-00849267

DOI

DOI : 10.1007/978-3-319-02475-2_17

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Conference papers

auteur

Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Gilles Edan, Christian Barillot

titre

MRI Estimation of T1 Relaxation Time Using a Constrained Optimization Algorithm

article

MBIA 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.203-214

identifiant

inserm-00723849

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auteur

Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima

titre

Automated diffeomorphic registration of anatomical structures with rigid parts: application to dynamic cervical MRI.

article

MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.163-70, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_21⟩

identifiant

inserm-00716106

DOI

DOI : 10.1007/978-3-642-33418-4_21

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auteur

Olivier Commowick, Aymeric Stamm

titre

Non-local robust detection of DTI white matter differences with small databases.

article

MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.476-84, ⟨10.1007/978-3-642-33454-2_59⟩

identifiant

inserm-00716094

DOI

DOI : 10.1007/978-3-642-33454-2_59

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auteur

Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima

titre

Block-Matching Strategies for Rigid Registration of Multimodal Medical Images

article

9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI'2012), May 2012, Barcelona, Spain. pp.700-703, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235644⟩

identifiant

inserm-00681610

DOI

DOI : 10.1109/ISBI.2012.6235644

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auteur

Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot

titre

Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model: Part II

article

MICCAI 2012 DTI Tractography Challenge, Oct 2012, Nice, France. pp.12-20

identifiant

inserm-00725366

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auteur

Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield

titre

Registration and Analysis of White Matter Group Differences with a Multi-Fiber Model

article

15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.313-320

identifiant

inserm-00716110

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Conference papers

auteur

Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Romuald Seizeur, Patrick Pérez, Christian Barillot, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé

titre

Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model

article

MICCAI 2011 DTI Tractography Challenge Workshop, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.18-24

identifiant

inserm-00627893

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auteur

Ralph Suarez, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Sanjay Prabhu, Simon K. Warfield

titre

Automated detection of white matter fiber bundles

article

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2011, Apr 2011, Chicago, IL, United States. pp.845-848, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872536⟩

identifiant

inserm-00607800

DOI

DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872536

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auteur

Nicolas Wiest-Daesslé, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot, Romuald Seizeur, Sylvain Prima

titre

Comparison of 3 Diffusion Models to Track the Hand Motor Fibers within the Corticospinal Tract Using Functional, Anatomical and Diffusion MRI

article

MICCAI 2011 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'11), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.150-157

identifiant

inserm-00628264

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Conference papers

auteur

Olivier Commowick, Simon K Warfield

titre

Incorporating priors on expert performance parameters for segmentation validation and label fusion: a maximum a posteriori STAPLE.

article

Med Image Comput Comput Assist Interv, Sep 2010, China. pp.25-32

identifiant

inserm-00550016

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auteur

Vincent Garcia, Olivier Commowick, Grégoire Malandain

titre

A Robust and Efficient Block Matching Framework for Non Linear Registration of Thoracic CT Images

article

Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China. pp.1-10

identifiant

inria-00616148

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auteur

Liliane Ramus, Olivier Commowick, Grégoire Malandain

titre

Construction of patient specific atlases from locally most similar anatomical pieces.

article

Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI), Sep 2010, China. pp.155-162

identifiant

inserm-00550024

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Conference papers

auteur

Olivier Commowick, Simon K. K. Warfield, Grégoire Malandain

titre

Using Frankenstein's Creature Paradigm to Build a Patient Specific Atlas

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United States. pp.993--1000, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3_120⟩

identifiant

inria-00616133

DOI

DOI : 10.1007/978-3-642-04271-3_120

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Conference papers

auteur

Olivier Commowick, Pierre Fillard, Olivier Clatz, Simon K Warfield

titre

Detection of DTI white matter abnormalities in multiple sclerosis patients.

article

International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York City, United States. pp.975-82, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_116⟩

identifiant

inria-00502709

DOI

DOI : 10.1007/978-3-540-85988-8_116

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Conference papers

auteur

Olivier Commowick, Grégoire Malandain

titre

Efficient Selection of the Most Similar Image in a Database for Critical Structures Segmentation

article

Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Part II, 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.203--210

identifiant

inria-00616045

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Conference papers

auteur

Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache

titre

Statistics on Diffeomorphisms in a Log-Euclidean Framework

article

1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.14-15

identifiant

inria-00635671

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auteur

Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache

titre

A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration

article

Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.120-127, ⟨10.1007/11784012_15⟩

identifiant

inria-00615607

DOI

DOI : 10.1007/11784012_15

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auteur

Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache

titre

A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms

article

MICCAI 2006 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Part I, 2006, Copenhaguen, Denmark. pp.924--931, ⟨10.1007/11866565_113⟩

identifiant

inria-00615594

DOI

DOI : 10.1007/11866565_113

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auteur

Olivier Commowick, Grégoire Malandain

titre

Evaluation of Atlas Construction Strategies in the Context of Radiotherapy Planning

article

Proceedings of the SA2PM Workshop (From Statistical Atlases to Personalized Models), 2006, Copenhagen, Denmark

identifiant

inria-00615605

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auteur

Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Jimena Costa, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain

titre

An Efficient Locally Affine Framework for the Registration of Anatomical Structures

article

Proceedings of the Third IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.478-481

identifiant

inria-00615606

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Conference papers

auteur

Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain

titre

Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.927-34, ⟨10.1007/11566489_114⟩

identifiant

inria-00502673

DOI

DOI : 10.1007/11566489_114

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Conference papers

auteur

Radu Stefanescu, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Xavier Pennec

titre

Non-Rigid Atlas to Subject Registration with Pathologies for Conformal Brain Radiotherapy

article

MICCAI 2004 - 7th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2004, Saint-Malo, France. pp.704-711, ⟨10.1007/978-3-540-30135-6_86⟩

identifiant

hal-03989487

DOI

DOI : 10.1007/978-3-540-30135-6_86

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