Publications HAL de xavier,pennec

Journal articles

2017

auteur
Jan L. Bruse, Elena Cervi, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano, Tain-Yen Hsia
titre
Looks Do Matter! Aortic Arch Shape After Hypoplastic Left Heart Syndrome Palliation Correlates With Cavopulmonary Outcomes
article
Annals of Thoracic Surgery, Elsevier, 2017, 103 (2), pp.645 - 654. 〈10.1016/j.athoracsur.2016.06.041〉
identifiant
hal-01421202
DOI
DOI : 10.1016/j.athoracsur.2016.06.041
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auteur
Jan L. Bruse, Abbas Khushnood, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Tain-Yen Hsia, Silvia Schievano
titre
How successful is successful? Aortic arch shape after successful aortic coarctation repair correlates with left ventricular function
article
Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, Elsevier, 2017, 153 (2), pp.418 - 427. 〈10.1016/j.jtcvs.2016.09.018〉
identifiant
hal-01387297
DOI
DOI : 10.1016/j.jtcvs.2016.09.018
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auteur
Jan L Bruse, Maria A. Zuluaga, Abbas Khushnood, Kristin Mcleod, Hopewell N. Ntsinjana, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
titre
Detecting Clinically Meaningful Shape Clusters in Medical Image Data: Metrics Analysis for Hierarchical Clustering applied to Healthy and Pathological Aortic Arches
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, pp.1 - 13. 〈10.1109/TBME.2017.2655364〉
identifiant
hal-01511224
DOI
DOI : 10.1109/TBME.2017.2655364
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https://hal.inria.fr/hal-01511224/file/07857751.pdf BibTex
auteur
Loïc Devilliers, Stéphanie Allassonnière, Alain Trouvé, Xavier Pennec
titre
Template estimation in computational anatomy: Fréchet means in top and quotient spaces are not consistent
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2017, 10 (3), pp.1139-1169. 〈10.1137/16M1083931〉
identifiant
hal-01352707
DOI
DOI : 10.1137/16M1083931
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01352707/file/InconsistencySIIMSDevilliers.pdf BibTex
auteur
Loïc Devilliers, Stéphanie Allassonnière, Alain Trouvé, Xavier Pennec
titre
Inconsistency of Template Estimation by Minimizing of the Variance/Pre-Variance in the Quotient Space
article
Entropy, MDPI, 2017, 19 (6), pp.28. 〈10.3390/e19060288〉
identifiant
hal-01543616
DOI
DOI : 10.3390/e19060288
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https://hal.inria.fr/hal-01543616/file/entropyHal.pdf BibTex
auteur
Bishesh Khanal, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Simulating Longitudinal Brain MRIs with known Volume Changes and Realistic Variations in Image Intensity
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2017, 11 (Article 132), pp.18. 〈10.3389/fnins.2017.00132〉
identifiant
hal-01348959
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2017.00132
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https://hal.inria.fr/hal-01348959/file/fnins-11-00132.pdf BibTex
auteur
Nina Miolane, Susan Holmes, Xavier Pennec
titre
Template Shape Estimation: Correcting an Asymptotic Bias
article
SIAM Journal on Imaging Sciences, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2017, 10 (2), pp.808 - 844. 〈10.1137/16M1084493〉
identifiant
hal-01350508
DOI
DOI : 10.1137/16M1084493
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01350508/file/siims_article_black.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Barycentric Subspace Analysis on Manifolds
article
Annals of Statistics, Institute of Mathematical Statistics, A Paraître
identifiant
hal-01343881
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01343881/file/AOS1636-WithSupplements.pdf BibTex
auteur
Naiara Rodriguez-Florez, Jan L. Bruse, Alessandro Borghi, Herman Vercruysse, Juling Ong, Greg James, Xavier Pennec, David J. Dunaway, N. U. Owase Jeelani, Silvia Schievano
titre
Statistical shape modelling to aid surgical planning: associations between surgical parameters and head shapes following spring-assisted cranioplasty
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2017, pp.1-11. 〈10.1007/s11548-017-1614-5〉
identifiant
hal-01540631
DOI
DOI : 10.1007/s11548-017-1614-5
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https://hal.inria.fr/hal-01540631/file/Rodriguez-Florez_et_al-2017-International_Journal_of_Computer_Assisted_Radiology_and_Surgery.pdf BibTex
auteur
Avan Suinesiaputra, Pierre Ablin, Xènia Albà, Martino Alessandrini, Jack Allen, Wenjia Bai, Serkan Çimen, Peter Claes, Brett Cowan, Jan D 'Hooge, Nicolas Duchateau, Jan Ehrhardt, Alejandro Frangi, Ali Gooya, Vicente Grau, Karim Lekadir, Allen Lu, Anirban Mukhopadhyay, Ilkay Oksuz, Nripesh Parajuli, Xavier Pennec, Marco Pereañez, Catarina Pinto, Paolo Piras, Marc-Michel Rohé, Daniel Rueckert, Dennis Säring, Maxime Sermesant, Kaleem Siddiqi, Mahdi Tabassian, Luciano Teresi, Sotirios Tsaftaris, Matthias Wilms, Alistair Young, Xingyu Zhang, Pau Medrano-Gracia
titre
Statistical shape modeling of the left ventricle: myocardial infarct classification challenge
article
IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, pp.13. 〈10.1109/JBHI.2017.2652449〉
identifiant
hal-01533805
DOI
DOI : 10.1109/JBHI.2017.2652449
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2016

auteur
Jan L. Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Hopewell N. Ntsinjana, Claudio Capelli, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
titre
A statistical shape modelling framework to extract 3D shape biomarkers from medical imaging data: assessing arch morphology of repaired coarctation of the aorta
article
BMC Medical Imaging, BioMed Central, 2016, 16 (1), 〈10.1186/s12880-016-0142-z〉
identifiant
hal-01335147
DOI
DOI : 10.1186/s12880-016-0142-z
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https://hal.inria.fr/hal-01335147/file/art3A10_1186_s12880-016-0142.pdf BibTex
auteur
Mehdi Hadj-Hamou, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Longitudinal Analysis of Image Time Series with Diffeomorphic Deformations: A Computational Framework Based on Stationary Velocity Fields
article
Frontiers in Neuroscience, Frontiers, 2016, 10 (236), pp.18. 〈10.3389/fnins.2016.00236〉
identifiant
hal-01329989
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2016.00236
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https://hal.inria.fr/hal-01329989/file/fnins-10-00236.pdf BibTex
auteur
Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
A biophysical model of brain deformation to simulate and analyze longitudinal MRIs of patients with Alzheimer's disease
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, 134, pp.35-52. 〈10.1016/j.neuroimage.2016.03.061〉
identifiant
hal-01305755
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.03.061
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2015

auteur
David M. Cash, Chris Frost, Leonardo O. Iheme, Devrim Ünay, Melek Kandemir, Jurgen Fripp, Olivier Salvado, Pierrick Bourgeat, Martin Reuter, Bruce Fischl, Marco Lorenzi, Giovanni B. Frisoni, Xavier Pennec, Ronald K. Pierson, Jeffrey L. Gunter, Matthew L. Senjem, Clifford R. Jack, Nicolas Guizard, Vladimir S. Fonov, D. Louis Collins, Marc Modat, M. Jorge Cardoso, Kelvin K. Leung, Hongzhi Wang, Sandhitsu R. Das, Paul A. Yushkevich, Ian B. Malone, Nick C. Fox, Jonathan M. Schott, Sebastien Ourselin
titre
Assessing atrophy measurement techniques in dementia: Results from the MIRIAD atrophy challenge
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 123, pp.149-164. 〈10.1016/j.neuroimage.2015.07.087〉
identifiant
hal-01203573
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2015.07.087
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https://hal.inria.fr/hal-01203573/file/NIMG_Challenge_Final.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni, Nicholas Ayache
titre
Disentangling normal aging from Alzheimer's disease in structural magnetic resonance images
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2015, 36, pp.S42-S52. 〈10.1016/j.neurobiolaging.2014.07.046〉
identifiant
hal-01061017
DOI
DOI : 10.1016/j.neurobiolaging.2014.07.046
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https://hal.inria.fr/hal-01061017/file/Lorenzi-LongProjection-NBOA-Third.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Regional flux analysis for discovering and quantifying anatomical changes: An application to the brain morphometry in Alzheimer's disease
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 115, pp.224-234. 〈10.1016/j.neuroimage.2015.04.051〉
identifiant
hal-01145728
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2015.04.051
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https://hal.inria.fr/hal-01145728/file/Paper_flux_2nd_version.pdf BibTex
auteur
Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Philipp Beerbaum, Xavier Pennec
titre
Spatio-Temporal Tensor Decomposition of a Polyaffine Motion Model for a Better Analysis of Pathological Left Ventricular Dynamics
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 34 (7), pp.1562--1675. 〈10.1109/TMI.2015.2405579〉
identifiant
hal-01205342
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2015.2405579
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https://hal.inria.fr/hal-01205342/file/McLeod_PolyaffineHeartMeanMotion.pdf BibTex
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
titre
Computing Bi-Invariant Pseudo-Metrics on Lie Groups for Consistent Statistics
article
Entropy, MDPI, 2015, 17 (4), pp.1850-1881. 〈10.3390/e17041850〉
identifiant
hal-01133922
DOI
DOI : 10.3390/e17041850
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https://hal.inria.fr/hal-01133922/file/entropy-17-01850.pdf BibTex

2014

auteur
Romain Guibert, Kristin Mcleod, Alfonso Caiazzo, Tommaso Mansi, Miguel Angel Fernández, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Irene Vignon-Clementel, Younes Boudjemline, Jean-Frédéric Gerbeau
titre
Group-wise Construction of Reduced Models for Understanding and Characterization of Pulmonary Blood Flows from Medical Images
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2014, 18 (1), pp.63-82. 〈10.1016/j.media.2013.09.003〉
identifiant
hal-00874545
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2013.09.003
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https://hal.inria.fr/hal-00874545/file/MEDIA_Guibert_McLeod_2013.pdf BibTex
auteur
Herve Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
titre
Spectral Log-Demons: Diffeomorphic Image Registration with Very Large Deformations
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2014, 107 (3), pp.254-271. 〈10.1007/s11263-013-0681-5〉
identifiant
hal-00979616
DOI
DOI : 10.1007/s11263-013-0681-5
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https://hal.inria.fr/hal-00979616/file/SpectralDemons-IJCV2013.pdf BibTex

2013

auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, José Braga, Guido Gerig, Nicholas Ayache
titre
Toward a Comprehensive Framework for the Spatiotemporal Statistical Analysis of Longitudinal Shape Data
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2013, 103 (1), pp.22-59. 〈10.1007/s11263-012-0592-x〉
identifiant
hal-00813825
DOI
DOI : 10.1007/s11263-012-0592-x
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https://hal.inria.fr/hal-00813825/file/Durrleman_IJCV_2012_Longitudinal.pdf BibTex
auteur
Benedetta Leonardi, Andrew Taylor, Tommaso Mansi, Ingmar Voigt, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Younes Boudjemline, Giacomo Pongiglione
titre
Computational modelling of the right ventricle in repaired tetralogy of Fallot: can it provide insight into patient treatment?
article
European Heart Journal - Cardiovascular Imaging, Oxford UP, 2013, 14 (4), pp.381-6. 〈10.1093/ehjci/jes239〉
identifiant
hal-00813831
DOI
DOI : 10.1093/ehjci/jes239
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https://hal.inria.fr/hal-00813831/file/EHJCI-2013.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre
Efficient Parallel Transport of Deformations in Time Series of Images: from Schild's to Pole Ladder
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2013, 50 (1-2), pp.5-17. 〈10.1007/s10851-013-0470-3〉
identifiant
hal-00870489
DOI
DOI : 10.1007/s10851-013-0470-3
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https://hal.inria.fr/hal-00870489/file/Lorenzi-PoleLadder2013.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre
Geodesics, Parallel Transport & One-parameter Subgroups for Diffeomorphic Image Registration
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2013, International Journal of Computer Vision, 105 (2), pp.111-127. 〈10.1007/s11263-012-0598-4〉
identifiant
hal-00813835
DOI
DOI : 10.1007/s11263-012-0598-4
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https://hal.inria.fr/hal-00813835/file/Lorenzi-IJCV2012.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Giovanni Frisoni, Xavier Pennec
titre
LCC-Demons: a robust and accurate symmetric diffeomorphic registration algorithm
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 81 (1), pp.470-483. 〈10.1016/j.neuroimage.2013.04.114〉
identifiant
hal-00819895
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2013.04.114
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https://hal.inria.fr/hal-00819895/file/Lorenzi-LCC2012.pdf BibTex
auteur
Stefan Sommer, Mads Nielsen, Sune Darkner, Xavier Pennec
titre
Higher-order momentum distributions and locally affine LDDMM registration
article
SIAM J. on Imaging Science (SIIMS), SIAM, 2013, 6 (1), pp.341-367. 〈10.1137/110859002〉
identifiant
hal-00813869
DOI
DOI : 10.1137/110859002
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https://arxiv.org/pdf/1112.3166 BibTex
auteur
Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre
Sparse Multi-Scale Diffeomorphic Registration: the Kernel Bundle Framework
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2013, 46 (3), pp.292-308. 〈10.1007/s10851-012-0409-0〉
identifiant
hal-00813868
DOI
DOI : 10.1007/s10851-012-0409-0
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https://hal.inria.fr/hal-00813868/file/Sommer_JMIV2013.pdf BibTex
auteur
Catalina Tobon-Gomez, Mathieu De Craene, Kristin Mcleod, Lennart Tautz, Wenzhe Shi, Anja Hennemuth, Adityo Prakosa, Hengui Wang, Gerald Carr-White, Sergio Kapetanakis, Albert Lutz, Vernon Rasche, Tobias Schaeffter, Constantin Butakoff, Oskar Friman, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Xiahai Zhuang, Sébastien Ourselin, Hans Otto Peitgen, Xavier Pennec, Reza Razavi, Daniel Rueckert, Alejandro F. Frangi, Kawal Rhode
titre
Benchmarking framework for myocardial tracking and deformation algorithms: an open access database
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2013, 17 (6), pp.632-648. 〈10.1016/j.media.2013.03.008〉
identifiant
hal-00855928
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2013.03.008
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https://hal.inria.fr/hal-00855928/file/tobon-gomez12a_v2.0.pdf BibTex
auteur
Irina Vidal-Migallón, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Julien Dauguet, Tom Vercauteren
titre
GPU & CPU implementation of Young - Van Vliet's Recursive Gaussian Smoothing Filter
article
Insight Journal (ITK), 2013, pp.16
identifiant
inserm-00855958
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00855958/file/IJ_896_3_InsightJournal_YVV.pdf BibTex

2012

auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
titre
Comparison of the endocranial ontogenies between chimpanzees and bonobos via temporal regression and spatiotemporal registration.
article
Journal of Human Evolution, Elsevier, 2012, 62 (1), pp.74-88. 〈10.1016/j.jhevol.2011.10.004〉
identifiant
hal-00816048
DOI
DOI : 10.1016/j.jhevol.2011.10.004
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BibTex
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes
titre
Capturing the Multiscale Anatomical Shape Variability with Polyaffine Transformation Trees
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16 (7), pp.1371-1384. 〈10.1016/j.media.2012.05.011〉
identifiant
hal-00813866
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2012.05.011
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https://hal.inria.fr/hal-00813866/file/SeilerPolyaffineTransformationTreesMedIA2012.pdf BibTex

2011

auteur
Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
titre
Vers un patient numérique personnalisé pour le diagnostic et la thérapie guidés par l'image [Towards a personalized digital patient for diagnosis and therapy guided by image].
article
médecine/sciences, EDP Sciences, 2011, 27 (2), pp.208-13. 〈10.1051/medsci/2011272208〉
identifiant
inria-00616192
DOI
DOI : 10.1051/medsci/2011272208
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https://hal.inria.fr/inria-00616192/file/Asclepios-Medecine-sciences2011.pdf BibTex
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Greig De Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, James C. Gee, Paul Thompson
titre
A nonconservative Lagrangian framework for statistical fluid registration-SAFIRA.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (2), pp.184-202. 〈10.1109/TMI.2010.2067451〉
identifiant
inria-00616099
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2010.2067451
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BibTex
auteur
Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
Registration, atlas estimation and variability analysis of white matter fiber bundles modeled as currents.
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 55 (3), pp.1073-90. 〈10.1016/j.neuroimage.2010.11.056〉
identifiant
hal-00816044
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2010.11.056
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auteur
Tommaso Mansi, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre
iLogDemons: A Demons-Based Registration Algorithm for Tracking Incompressible Elastic Biological Tissues
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2011, 92 (1), pp.92-111. 〈10.1007/s11263-010-0405-z〉
identifiant
inria-00616187
DOI
DOI : 10.1007/s11263-010-0405-z
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BibTex
auteur
Tommaso Mansi, Ingmar Voigt, Benedetta Leonardi, Xavier Pennec, Stanley Durrleman, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Andrew Taylor, Younes Boudjemline, Giacomo Pongiglione, Nicholas Ayache
titre
A Statistical Model for Quantification and Prediction of Cardiac Remodelling: Application to Tetralogy of Fallot
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (9), pp.1605 - 1616. 〈10.1109/TMI.2011.2135375〉
identifiant
inria-00616185
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2011.2135375
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2009

auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Linear Registration
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2009, 33 (2), pp.222-238. 〈10.1007/s10851-008-0135-9〉
identifiant
inria-00616084
DOI
DOI : 10.1007/s10851-008-0135-9
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https://hal.inria.fr/inria-00616084/file/Arsigny_JMIV_polyaffine_1_.pdf BibTex
auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Agatha Lee, Marina Barysheva, Sarah Madsen, Christina Avedissian, Yi-Yu Chou, Greig De Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
Mapping the regional influence of genetics on brain structure variability--a tensor-based morphometry study.
article
NeuroImage, Elsevier, 2009, 48 (1), pp.37-49. 〈10.1016/j.neuroimage.2009.05.022〉
identifiant
inria-00616089
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2009.05.022
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BibTex
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
Statistical models of sets of curves and surfaces based on currents.
article
Med Image Anal, Elsevier, 2009, 13 (5), pp.793-808. 〈10.1016/j.media.2009.07.007〉
identifiant
hal-00816051
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2009.07.007
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BibTex
auteur
Heike Hufnagel, Jan Ehrhardt, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre
Computation of a probabilistic statistical shape model in a maximum-a-posteriori framework.
article
IMIA Yearbook of Medical Informatics, Schattauer, 2009, 48 (4), pp.314-9. 〈10.3414/ME9228〉
identifiant
inria-00616088
DOI
DOI : 10.3414/ME9228
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BibTex
auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, X. Buy, A. Gangi, Nicholas Ayache, Jacques Marescaux
titre
An augmented reality system for liver thermal ablation: design and evaluation on clinical cases.
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2009, 13 (3), pp.494-506. 〈10.1016/j.media.2009.02.003〉
identifiant
inria-00616105
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2009.02.003
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auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre
Diffeomorphic demons: Efficient non-parametric image registration.
article
NeuroImage, Elsevier, 2009, 45 (1), Supplement 1, Pages S61-S72. 〈10.1016/j.neuroimage.2008.10.040〉
identifiant
inserm-00349600
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2008.10.040
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00349600/file/DiffeoDemons-NeuroImage08-Vercauteren.pdf BibTex
auteur
B T Thomas Yeo, Tom Vercauteren, Pierre Fillard, Jean-Marc Peyrat, Xavier Pennec, Polina Golland, Nicholas Ayache, Olivier Clatz
titre
DT-REFinD: diffusion tensor registration with exact finite-strain differential.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, 28 (12), pp.1914-28. 〈10.1109/TMI.2009.2025654〉
identifiant
inria-00502720
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2009.2025654
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2008

auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
titre
Principal Deformations Modes of Articulated Models for the Analysis of 3D Spine Deformities
article
Electronic Letters on Computer Vision and Image Analysis, ELCVIA, 2008, 7 (4), pp.13--31. 〈10.5565/rev/elcvia.165〉
identifiant
inria-00616067
DOI
DOI : 10.5565/rev/elcvia.165
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https://hal.inria.fr/inria-00616067/file/Boisvert_ELCVIA08.pdf BibTex
auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
titre
Articulated Spine Models for 3D Reconstruction from Partial Radiographic Data
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 55 (11), pp.2565--2574. 〈10.1109/TBME.2008.2001125〉
identifiant
inria-00616069
DOI
DOI : 10.1109/TBME.2008.2001125
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auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
titre
Geometric Variability of the Scoliotic Spine using Statistics on Articulated Shape Models
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 27 (4), pp.557--568. 〈10.1109/TMI.2007.911474〉
identifiant
inria-00616070
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2007.911474
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auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Paul Thompson, Nicholas Ayache
titre
Inferring brain variability from diffeomorphic deformations of currents: an integrative approach.
article
Med Image Anal, Elsevier, 2008, 12 (5), pp.626-37. 〈10.1016/j.media.2008.06.010〉
identifiant
hal-00816052
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2008.06.010
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auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Diane Lingrand, Xavier Pennec
titre
Flexible and efficient workflow deployement of data-intensive applications on grids with MOTEUR
article
International Journal of High Performance Computing Applications, SAGE Publications, 2008, 22 (3), pp.347-360. 〈10.1177/1094342008096067〉
identifiant
hal-00459130
DOI
DOI : 10.1177/1094342008096067
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00459130/file/glatard-montagnat-etal_2008.pdf BibTex
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre
Generation of a Statistical Shape Model with Probabilistic Point Correspondences and EM-ICP
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2008, 2 (5), pp.265--273. 〈10.1007/s11548-007-0138-9〉
identifiant
inria-00616073
DOI
DOI : 10.1007/s11548-007-0138-9
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auteur
Johan Montagnat, Tristan Glatard, Isabel Campos Plasencia, Francisco Castejon, Xavier Pennec, Giuliano Taffoni, Vladimir Voznesensky, Claudio Vuerli
titre
Workflow-based data parallel applications on the EGEE production grid infrastructure
article
Journal of Grid Computing, Springer Verlag, 2008, 6 (8), pp.369-383. 〈10.1007/s10723-008-9108-x〉
identifiant
hal-00683983
DOI
DOI : 10.1007/s10723-008-9108-x
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683983/file/montagnat-glatard-etal-2008.pdf BibTex

2007

auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Geometric Means in a Novel Vector Space Structure on Symmetric Positive-Definite Matrices
article
SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, Society for Industrial and Applied Mathematics, 2007, 29 (1), pp.328--347. 〈10.1137/050637996〉
identifiant
inria-00616031
DOI
DOI : 10.1137/050637996
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auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Kiralee M Hayashi, Paul M Thompson, Nicholas Ayache
titre
Measuring brain variability by extrapolating sparse tensor fields measured on sulcal lines.
article
NeuroImage, Elsevier, 2007, 34 (2), pp.639-50. 〈10.1016/j.neuroimage.2006.09.027〉
identifiant
inria-00502521
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2006.09.027
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https://hal.inria.fr/inria-00502521/file/Fillard.Neuroimage.2006.pdf BibTex
auteur
Pierre Fillard, Xavier Pennec, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache
titre
Clinical DT-MRI estimation, smoothing, and fiber tracking with log-Euclidean metrics.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2007, 26 (11), pp.1472-82. 〈10.1109/TMI.2007.899173〉
identifiant
inria-00502645
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2007.899173
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auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
titre
A Computational Framework for the Statistical Analysis of Cardiac Diffusion Tensors: Application to a Small Database of Canine Hearts
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2007, 26 (11), pp.1500-1514. 〈10.1109/TMI.2007.907286〉
identifiant
inria-00616023
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2007.907286
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2006

auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Log-Euclidean metrics for fast and simple calculus on diffusion tensors.
article
Magnetic Resonance in Medicine, Wiley, 2006, 56 (2), pp.411-21. 〈10.1002/mrm.20965〉
identifiant
inria-00502678
DOI
DOI : 10.1002/mrm.20965
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BibTex
auteur
Hervé Delingette, Xavier Pennec, Luc Soler, Jacques Marescaux, Nicholas Ayache
titre
Computational Models for Image Guided, Robot-Assisted and Simulated Medical Interventions
article
Proceedings of the IEEE, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2006, 94 (9), pp.1678- 1688. 〈10.1109/JPROC.2006.880718〉
identifiant
inria-00615001
DOI
DOI : 10.1109/JPROC.2006.880718
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https://hal.inria.fr/inria-00615001/file/IEEE-proceedings-Robotics.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Intrinsic Statistics on Riemannian Manifolds: Basic Tools for Geometric Measurements
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2006, 25 (1), pp.127-154. 〈10.1007/s10851-006-6228-4〉
identifiant
inria-00614994
DOI
DOI : 10.1007/s10851-006-6228-4
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https://hal.inria.fr/inria-00614994/file/Pennec.JMIV06.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre
A Riemannian Framework for Tensor Computing
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2006, 66 (1), pp.41--66. 〈10.1007/s11263-005-3222-z〉
identifiant
inria-00614990
DOI
DOI : 10.1007/s11263-005-3222-z
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https://hal.inria.fr/inria-00614990/file/Pennec.IJCV05.pdf BibTex
auteur
Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Robust Mosaicing with Correction of Motion Distortions and Tissue Deformation for In Vivo Fibered Microscopy
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2006, 10 (5), pp.673--692. 〈10.1016/j.media.2006.06.006〉
identifiant
inria-00163961
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2006.06.006
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https://hal.inria.fr/inria-00163961/file/Mosaicing-Vercauteren-MedIA-elsart.pdf BibTex

2005

auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Polyrigid and Polyaffine Transformations: a Novel Geometrical Tool to Deal with Non-Rigid Deformations - Application to the registration of histological slices
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2005, 9 (6), pp.507-523. 〈10.1016/j.media.2005.04.001〉
identifiant
inria-00615665
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2005.04.001
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BibTex
auteur
Cécile Germain-Renaud, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Charles Loomis, Isabelle Magnin, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Romain Texier
titre
Grid-enabling medical image analysis
article
International Journal of Clinical Monitoring and Computing, Springer Verlag, 2005, 19 (4-5), pp.339-349. 〈10.1007/s10877-005-0679-9〉
identifiant
inria-00174284
DOI
DOI : 10.1007/s10877-005-0679-9
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https://hal.inria.fr/inria-00174284/file/AGIRJCMCALL.PDF BibTex
auteur
Stéphane Nicolau, Alain Garcia, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
An augmented reality system to guide radio-frequency tumor ablation
article
Computer Animation and Virtual Worlds, Wiley, 2005, 16 (1), pp.1--10. 〈10.1002/cav.52〉
identifiant
inria-00615660
DOI
DOI : 10.1002/cav.52
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auteur
Xavier Pennec
titre
Recaler pour mieux soigner
article
Pour la science, Paris : E. Belin, 2005, pp.126--131
identifiant
inria-00615670
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2004

auteur
Miguel Ángel González Ballester, Xavier Pennec, Marius George Linguraru, Nicholas Ayache
titre
Generalized Image Models and Their Application as Statistical Models of Images
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2004, 8 (3), pp.361--369. 〈10.1016/j.media.2004.06.012〉
identifiant
inria-00615648
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2004.06.012
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auteur
Luc Soler, Nicholas Ayache, Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Clément Forest, Hervé Delingette, Jacques Marescaux
titre
Traitement d'images médicales pour la planification, la simulation et l'aide intra-opératoire des actes chirurgicaux
article
La Revue de l'Electricité et de l'Electronique, Société de l'Électricité, de l'Électronique et des Technologies de l'Information et de la Communication, 2004, pp.64--71
identifiant
inria-00615647
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BibTex
auteur
Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Grid Powered Nonlinear Image Registration with Locally Adaptive Regularization
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2004, 8 (3), pp.325--342. 〈10.1016/j.media.2004.06.010〉
identifiant
inria-00615649
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2004.06.010
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BibTex
auteur
Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Grid-Enabled Non-Rigid Registration of Medical Images
article
Parallel Processing Letters, World Scientific Publishing, 2004, 14 (2), pp.197--216. 〈10.1142/S0129626404001830〉
identifiant
inria-00615653
DOI
DOI : 10.1142/S0129626404001830
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2003

auteur
Pascal Cachier, Eric Bardinet, Didier Dormont, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Iconic Feature Based Nonrigid Registration: The PASHA Algorithm
article
Comp. Vision and Image Understanding, undefined or unknown publisher, 2003, 89 (2-3), pp.272--298. 〈10.1016/S1077-3142(03)00002-X〉
identifiant
inria-00615633
DOI
DOI : 10.1016/S1077-3142(03)00002-X
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auteur
Xavier Pennec, Pascal Cachier, Nicholas Ayache
titre
Tracking Brain Deformations in Time-Sequences of 3D US Images
article
Pattern Recognition Letters, Elsevier, 2003, 24 (4-5), pp.801--813. 〈10.1016/S0167-8655(02)00183-6〉
identifiant
inria-00615022
DOI
DOI : 10.1016/S0167-8655(02)00183-6
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https://hal.inria.fr/inria-00615022/file/Pennec.Cachier.Ayache.PattRecLetters02.pdf BibTex
auteur
Maxime Sermesant, Clément Forest, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre
Deformable biomechanical models: Application to 4D cardiac image analysis
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2003, 7 (4), pp.475--488. 〈10.1016/S1361-8415(03)00068-9〉
identifiant
inria-00615637
DOI
DOI : 10.1016/S1361-8415(03)00068-9
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2002

auteur
Pierre Jannin, J Michael Fitzpatrick, David Hawkes, Xavier Pennec, Ramin Shahidi, Michael Vannier
titre
Validation of medical image processing in image-guided therapy.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2002, 21 (12), pp.1445-9. 〈10.1109/TMI.2002.806568〉
identifiant
inserm-00331766
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2002.806568
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00331766/file/TMIVMIP2002.pdf BibTex

2001

auteur
Sébastien Ourselin, Alexis Roche, Gérard Subsol, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Reconstructing a 3D structure from serial histological sections
article
Image and Vision Computing, Elsevier, 2001, 19, pp.25-31. 〈10.1016/S0262-8856(00)00052-4〉
identifiant
cea-00333669
DOI
DOI : 10.1016/S0262-8856(00)00052-4
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BibTex
auteur
Alexis Roche, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache
titre
Rigid registration of 3-D ultrasound with MR images: a new approach combining intensity and gradient information.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2001, 20 (10), pp.1038-49. 〈10.1109/42.959301〉
identifiant
cea-00333699
DOI
DOI : 10.1109/42.959301
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1998

auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A geometric algorithm to find small but highly similar 3D substructures in proteins
article
Bioinformatics -Oxford-, undefined or unknown publisher, 1998, 14 (6), pp.516--522. 〈10.1093/bioinformatics/14.6.516〉
identifiant
inria-00615080
DOI
DOI : 10.1093/bioinformatics/14.6.516
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BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Toward a generic framework for recognition based on uncertain geometric features
article
Videre: Journal of Computer Vision Research, Massachusetts Institute of Technology Press (MIT Press), 1998, 1 (2), pp.58--87
identifiant
inria-00615090
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00615090/file/v1n2003.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Uniform distribution, distance and expectation problems for geometric features processing
article
Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 1998, 9 (1), pp.49--67. 〈10.1023/A:1008270110193〉
identifiant
inria-00615085
DOI
DOI : 10.1023/A:1008270110193
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https://hal.inria.fr/inria-00615085/file/Pennec.JMIV98.pdf BibTex

1997

auteur
André Guéziec, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Medical Image Registration using Geometric Hashing
article
IEEE Computational Science and Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 1997, 4 (4), pp.29-41. 〈10.1109/99.641607〉
identifiant
inria-00615068
DOI
DOI : 10.1109/99.641607
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00615068/file/Gueziec.Pennec.Ayache.CSE.GH.pdf https://hal.inria.fr/inria-00615068/file/Gueziec.Pennec.Ayache.CSE.GH.a4.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec, Jean-Philippe Thirion
titre
A Framework for Uncertainty and Validation of 3D Registration Methods based on Points and Frames
article
International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 1997, 25 (3), pp.203-229. 〈10.1023/A:1007976002485〉
identifiant
inria-00615070
DOI
DOI : 10.1023/A:1007976002485
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https://hal.inria.fr/inria-00615070/file/Pennec.IJCV97.pdf BibTex

1977

auteur
J. West, J.M. Fitzpatrick, M.Y. Wang, B.M. Dawant, C.R. Maurer, R.M. Kessler, R.J. Maciunas, Christian Barillot, D. Lemoine, A. Collignon, F. Maes, P. Suetens, D. Vandermeulen, P.A. Van den Elsen, S. Napel, T.S. Sumanaweera, B. Harkness, P.F. Hemler, Derek Hill, David Hawkes, C. Studholme, J.B.A. Maintz, M.A. Viergever, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, M.E. Noz, G.Q. Maguire, M. Pollack, C.A. Pelizzari, R.A. Robb, D. Hanson, R.P. Woods
titre
Comparison and evaluation of retrospective intermodality brain image registration techniques.
article
Journal of Computer Assisted Tomography, Lippincott, Williams & Wilkins, 1977, 21 (4), pp.554-66
identifiant
inria-00615072
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Conference papers

2017

auteur
Loïc Devilliers, Xavier Pennec, Stéphanie Allassonnière
titre
Inconsistency of Template Estimation with the Fréchet mean in Quotient Space
article
Information Processing in Medical Imaging 2017, Jun 2017, Boone, United States. pp.12, 2017, Information Processing in Medical Imaging: 25th International Conference, IPMI 2017, Boone, NC, USA, June 25-30, 2017, Proceedings. 〈http://www.ipmi2017.org〉. 〈10.1007/978-3-319-59050-9_2〉
identifiant
hal-01481074
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-59050-9_2
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01481074/file/IPMIversionHAL.pdf BibTex
auteur
Shuman Jia, Claudia Camaioni, Marc-Michel Rohé, Pierre Jaïs, Xavier Pennec, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
titre
Prediction of Post-Ablation Outcome in Atrial Fibrillation Using Shape Parameterization and Partial Least Squares Regression
article
FIMH 2017 - International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. 10263, pp.314 - 321, 2017, Lecture Notes in Computer Science. 〈https://fimh2017.joomla.com/〉. 〈10.1007/978-3-319-59448-4_30〉
identifiant
hal-01574831
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-59448-4_30
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01574831/file/FIMH_ShapePLS-1.pdf BibTex
auteur
Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Improving Understanding of Long-Term Cardiac Functional Remodelling via Cross-Sectional Analysis of Polyaffine Motion Parameters
article
FIMH 2017 - 9th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. Springer, 10263, pp.51 - 59, 2017, Lecture Notes in Computer Science. 〈https://fimh2017.joomla.com/〉. 〈10.1007/978-3-319-59448-4_6〉
identifiant
hal-01574837
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-59448-4_6
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01574837/file/MeanMotionEvolutionFIMH-1.pdf BibTex
auteur
Roch Molléro, Hervé Delingette, Manasi Datar, Tobias Heimann, Jakob Hauser, Dilveer Panesar, Alexander Jones, Andrew Taylor, Marcus Kelm, Titus Kuehne, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
titre
Longitudinal Analysis using Personalised 3D Cardiac Models with Population-Based Priors: Application to Paediatric Cardiomyopathies
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2017, Québec City, Canada. 2015, MICCAI 2017, Lecture Notes in Computer Science. 〈http://www.miccai2017.org/〉
identifiant
hal-01569735
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01569735/file/paper729.pdf BibTex
auteur
Roch Molléro, Jakob Hauser, Xavier Pennec, Manasi Datar, Hervé Delingette, Alexander Jones, Nicholas Ayache, Tobias Heimann, Maxime Sermesant
titre
Longitudinal Parameter Estimation in 3D Electromechanical Models: Application to Cardiovascular Changes in Digestion
article
FIMH 2017 - 9th international conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. Springer
identifiant
hal-01522598
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01522598/file/FIMH_2017_Camera_Ready.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Sample-limited L p Barycentric Subspace Analysis on Constant Curvature Spaces
article
Geometric Sciences of Information (GSI 2017), Nov 2017, Paris, France. Lecture Notes in Computer Science (LNCS), 2017
identifiant
hal-01574895
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https://hal.inria.fr/hal-01574895/file/62-Pennec.pdf BibTex
auteur
Marc-Michel Rohé, Manasi Datar, Tobias Heimann, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
SVF-Net: Learning Deformable Image Registration Using Shape Matching
article
MICCAI 2017 - the 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada
identifiant
hal-01557417
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https://hal.inria.fr/hal-01557417/file/paper_324.pdf BibTex
auteur
Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Automatic Multi-Atlas Segmentation of Myocardium with SVF-Net
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM) workshop, Sep 2017, Québec, Canada
identifiant
hal-01575297
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https://hal.inria.fr/hal-01575297/file/stacom_seg_v2.pdf BibTex

2016

auteur
Jan Bruse, Kristin Mcleod, Elena Cervi, Giovanni Biglino, T.-Y Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano
titre
Discovering clusters in pathologic cardiac morphology: MR-based hierarchical 3D shape clustering of surgically repaired aortic arches
article
Computer Assisted Radiology, 30th International Congress and Exhibition, Jun 2016, Heidelberg, Germany
identifiant
hal-01519862
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auteur
Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
titre
A Multiscale Cardiac Model for Fast Personalisation and Exploitation
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. 9902, pp.174-182, 2015, MICCAI 2016, Lecture Notes in Computer Science. 〈http://www.miccai2016.org/〉. 〈10.1007/978-3-319-46726-9_21〉
identifiant
hal-01360908
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_21
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https://hal.inria.fr/hal-01360908/file/paper_725.pdf BibTex
auteur
Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Barycentric Subspace Analysis: a new Symmetric Group-wise Paradigm for Cardiac Motion Tracking
article
MICCAI 2016 - the 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2016, Athens, Greece. 9902 (448-456), pp.300-307, 2016, MICCAI 2016, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-319-46726-9_35〉
identifiant
hal-01373706
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_35
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https://hal.inria.fr/hal-01373706/file/paper929.pdf BibTex
auteur
Marc-Michel Rohé, Roch Molléro, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Highly Reduced Model of the Cardiac Function for Fast Simulation
article
IEEE - IVMSP Workshop 2016, Jul 2016, Bordeaux, France. IEEE, pp.5, 2016, Image, Video, and Multidimensional Signal Processing Workshop (IVMSP), 2016 IEEE 12th. 〈10.1109/IVMSPW.2016.7528214〉
identifiant
hal-01373715
DOI
DOI : 10.1109/IVMSPW.2016.7528214
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https://hal.inria.fr/hal-01373715/file/IVMSP.pdf BibTex

2015

auteur
Stéphanie Allassonnière, Loïc Devilliers, Xavier Pennec
titre
Estimating the Template in the Total Space with the Fréchet Mean on Quotient Spaces may have a Bias: a Case Study on Vector Spaces Quotiented by the Group of Translations
article
Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.131-142, 2015, Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundation sof Computational Anatomy (MFCA'15). 〈http://www-sop.inria.fr/asclepios/events/MFCA15/〉
identifiant
hal-01203816
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01203816/file/MFCA15_4_1.pdf BibTex
auteur
Jan Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Hopewell Ntsinjana, Claudio Capelli, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano
titre
A Non-parametric Statistical Shape Model for Assessment of the Surgically Repaired Aortic Arch in Coarctation of the Aorta: How Normal is Abnormal?
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM 2015), Oct 2015, Munich, Germany. Springer, Lecture Notes in Computer Science 9534, Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. Imaging and Modelling Challenges: 6th International Workshop, STACOM 2015, Held in Conjunction with MICCAI 2015, Munich, Germany, October 9, 2015, Revised Selected Papers. 〈http://www.cardiacatlas.org/web/stacom2015/〉. 〈10.1007/978-3-319-28712-6_3〉
identifiant
hal-01205515
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-28712-6_3
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https://hal.inria.fr/hal-01205515/file/Bruse_STACOM2015_04.pdf BibTex
auteur
Vikash Gupta, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
A framework for creating population specific multimodal brain atlas using clinical T1 and diffusion tensor images
article
MICCAI 2015 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.99-108, 2016, Computational Diffusion MRI. 〈http://cmic.cs.ucl.ac.uk/cdmri15/〉. 〈10.1007/978-3-319-28588-7_9〉
identifiant
hal-01261115
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-28588-7_9
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https://hal.inria.fr/hal-01261115/file/Gupta_CDMRI_2015.pdf BibTex
auteur
Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Simulating Patient Specific Multiple Time-point MRIs From a Biophysical Model of Brain Deformation in Alzheimer's Disease
article
Workshop on Computational Biomechanics for Medicine - X, Oct 2015, Munich, France. Springer International Publishing, pp.167--176, 2015, Computational Biomechanics for Medicine: Imaging, Modeling and Computing. 〈10.1007/978-3-319-28329-6_15〉
identifiant
hal-01217080
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-28329-6_15
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https://hal.inria.fr/hal-01217080/file/khanal2015_CBM.pdf BibTex
auteur
Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Philipp Beerbaum, Xavier Pennec
titre
Descriptive and Intuitive Population-Based Cardiac Motion Analysis via Sparsity Constrained Tensor Decomposition
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2015), Oct 2015, Munich, Germany. 9351, pp.419-426, Lecture notes in computer science (LNCS). 〈http://www.miccai2015.org/〉. 〈10.1007/978-3-319-24574-4_50〉
identifiant
hal-01205535
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-24574-4_50
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https://hal.inria.fr/hal-01205535/file/McLeod_CardiacMotionAnalysis_MICCAI2015.pdf BibTex
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
titre
Biased estimators on Quotient spaces
article
Geometric Science of Information. Second International Conference, GSI 2015., Oct 2015, Palaiseau, France. Springer, 9389, pp.130-139, Lecture notes in computer science (LNCS). 〈10.1007/978-3-319-25040-3_15〉
identifiant
hal-01203805
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-25040-3_15
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https://hal.inria.fr/hal-01203805/file/Miolane_Pennec_GSI2015.pdf BibTex
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
titre
A survey of mathematical structures for extending 2D neurogeometry to 3D image processing
article
MICCAI Workshop on Medical Computer Vision: Algorithms for Big Data (MICCAI-MCV 2015), Oct 2015, Munich, Germany. 〈https://sites.google.com/site/miccaimcv2015/home〉
identifiant
hal-01203518
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https://hal.inria.fr/hal-01203518/file/Miolane_Pennec_MCV2015.pdf BibTex
auteur
Roch Molléro, Dominik Neumann, Marc-Michel Rohé, Manasi Datar, Herve Lombaert, Nicholas Ayache, Dorin Comaniciu, Olivier Ecabert, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Tommaso Mansi
titre
Propagation of Myocardial Fibre Architecture Uncertainty on Electromechanical Model Parameter Estimation: A Case Study
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart, LNCS., Jun 2015, Maastricht, Netherlands. pp. 448-456, 2015, 8th International Conference, FIMH 2015, Maastricht, The Netherlands, June 25-27, 2015. Proceedings. 〈http://www.fimh2015.org/〉. 〈10.1007/978-3-319-20309-6_51〉
identifiant
hal-01241896
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-20309-6_51
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https://hal.inria.fr/hal-01241896/file/FIMH2015_UncertaintyPropagation_camera_ready.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Barycentric Subspaces and Affine Spans in Manifolds
article
Geometric Science of Information GSI'2015, Second International Conference, Oct 2015, Palaiseau, France. 9389, pp.12-21, Lecture Notes in Compuer Science. 〈http://www.gsi2015.org/〉. 〈10.1007/978-3-319-25040-3_2〉
identifiant
hal-01164463
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-25040-3_2
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https://hal.inria.fr/hal-01164463/file/Pennec_AffineSpan_GSI2015.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Barycentric Subspaces Analysis on Spheres
article
Mathematical Foundation sof Computational Anatomy (MFCA'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.71-82, 2015, Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundation sof Computational Anatomy (MFCA'15)
identifiant
hal-01203815
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https://hal.inria.fr/hal-01203815/file/MFCA15_2_3.pdf BibTex
auteur
Marc-Michel Rohé, Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Combination of Polyaffine Transformations and Supervised Learning for the Automatic Diagnosis of LV Infarct
article
Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM 2015), 2015, Munich, Germany
identifiant
hal-01206710
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https://hal.inria.fr/hal-01206710/file/STACOM_2015_final.pdf BibTex

2014

auteur
Hugo Darmanté, Benoit Bugnas, Regis Bernard De Dompsure, Laurent Barresi, Nina Miolane, Xavier Pennec, Fernand De Peretti, Nicolas Bronsard
titre
Analyse biométrique de l'anneau pelvien en 3 dimensions - à propos de 100 scanners
article
89e Réunion annuelle de la SOFCOT, Nov 2014, Paris, France. 100 (7), 2014, Revue de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique. 〈10.1016/j.rcot.2014.09.076〉
identifiant
hal-01094711
DOI
DOI : 10.1016/j.rcot.2014.09.076
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BibTex
auteur
Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
A Biophysical Model of Shape Changes due to Atrophy in the Brain with Alzheimer's Disease
article
P. GOLLAND; N. HATA; C. BARILLOT; J. HORNEGGER; R. HOWE. MICCAI 2014 - 17th International Conference Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. Springer, 8674, pp.41-48, 2014, LNCS - Lecture Notes in Computer Science, Springer. 〈http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-10470-6_6〉. 〈10.1007/978-3-319-10470-6_6〉
identifiant
hal-01006478
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-10470-6_6
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https://hal.inria.fr/hal-01006478/file/Khanal2014_MiccaiFinalSubmitted.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, (adni) For The Alzheimer'S Disease Neuroimaging Initiative
titre
Regional flux analysis of longitudinal atrophy in Alzheimer's disease
article
Alzheimer's Association International Conference, Jul 2014, Copenhagen, Denmark. 2014
identifiant
hal-01015978
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BibTex
auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec
titre
Statistics on Lie groups : a need to go beyond the pseudo-Riemannian framework
article
MaxEnt 2014, Sep 2014, Amboise, France. AIP Proceedings, 1641, pp.59--66, Bayesian inference and Maximum Entropy Methods in Science and Engineering (MaxEnt 2014)
identifiant
hal-01091515
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https://hal.inria.fr/hal-01091515/file/69_paper.pdf BibTex

2013

auteur
Vikash Gupta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Improving DTI Resolution from a Single Clinical Acquisition: A Statistical Approach using Spatial Prior
article
Kensaku Mori and Ichiro Sakuma and Yoshinobu Sato and Christian Barillot and Nassir Navab. Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2013 (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, 8151, pp.477-484, 2013, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-40760-4_60〉
identifiant
hal-00845927
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40760-4_60
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https://hal.inria.fr/hal-00845927/file/paper504.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre
Parallel Transport with Pole Ladder: Application to Deformations of time Series of Images
article
Nielsen, Frank and Barbaresco, F. GSI2013 - Geometric Science of Information, Aug 2013, Paris, France. Springer, 8085, pp.68-75, 2013, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-40020-9_6〉
identifiant
hal-00819898
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40020-9_6
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00819898/file/0069_MarcoLorenzi.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Martina Bochetta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni Frisoni
titre
Conversion to MCI in healthy individuals with abnormal CSF Ab42 levels is associated with specific longitudinal morphological changes
article
Alzheimer's Association International Conference 2013, Jul 2013, Boston, United States. 9, issue 4 (supplement), pp.P596, 2013, Alzheimer's & Dementia: The Journal of the Alzheimer's Association. 〈10.1016/j.jalz.2013.05.1189〉
identifiant
hal-00874722
DOI
DOI : 10.1016/j.jalz.2013.05.1189
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BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Bjoern Menze, Marc Niethammer, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Sparse Scale-Space Decomposition of Volume Changes in Deformations Fields
article
Kensaku Mori and Ichiro Sakuma and Yoshinobu Sato and Christian Barillot and Nassir Navab. Medical Image Computing and Computer Aided Intervention (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. Springer, 8150, pp.328-335, 2013, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-40763-5_41〉
identifiant
hal-00845758
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40763-5_41
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00845758/file/Submission562.pdf BibTex
auteur
Kristin Mcleod, Christof Seiler, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Spatio-Temporal Dimension Reduction of Cardiac Motion for Group-Wise Analysis and Statistical Testing
article
Kensaku Mori and Ichiro Sakuma and Yoshinobu Sato and Christian Barillot and Nassir Navab. MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2013, 2013, Nagoya, Japan. Springer, Heidelberg, 8150, pp.501-508, 2013, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-40763-5_62〉
identifiant
hal-00840041
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40763-5_62
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00840041/file/MICCAI_mcleod_2013.pdf BibTex
auteur
Kristin Mcleod, Christof Seiler, Nicolas Toussaint, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Regional Analysis of Left Ventricle Function using a Cardiac-Specific Polyaffine Motion Model
article
Sébastien Ourselin and Daniel Rueckert and Nicolas Smith. Functional Imaging and Modeling of the Heart 2013 (FIMH), Jun 2013, London, United Kingdom. Springer, 7945, pp.483-490, 2013, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-38899-6_57〉
identifiant
hal-00840042
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-38899-6_57
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00840042/file/PolyAffineHeartRegionalAnalysis.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Bi-invariant means on Lie groups with Cartan-Schouten connections
article
Nielsen, Frank and Barbaresco, F. Geometric Science of Information (GSI 2013), Aug 2013, Paris, France. Springer, 8085, pp.59-67, 2013, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-40020-9_5〉
identifiant
hal-00846373
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40020-9_5
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00846373/file/GSI13_CartanConnections.pdf BibTex
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Susan Holmes
titre
Random Spatial Structure of Geometric Deformations and Bayesian Nonparametrics
article
GSI - Geometric Science of Information - 2013, Aug 2013, Paris, France. Springer, 8085, pp.120-127, 2013, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-40020-9_12〉
identifiant
hal-00847185
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40020-9_12
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00847185/file/BayesianNonparametricsGeometricDeformationsSeiler2013.pdf BibTex
auteur
Birkan Tunç, Alex Smith,, Demian Wasserman, Xavier Pennec, William M. Wells, Ragini Verma, Kilian M. Pohl
titre
Multinomial Probabilistic Fiber Representation for Connectivity Driven Clustering
article
Gee, J. C. and Joshi, Sarang and Pohl, Kilian M. and Wells, William M. and Zollei, L. IPMI 2013 - Information Processing in Medical Imaging, Jun 2013, Asilomar, United States. Springer, 7917, pp.730-741, 2013, LNCS. 〈10.1007/978-3-642-38868-2_61〉
identifiant
hal-00846431
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-38868-2_61
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00846431/file/tunc-ipmi-2013.pdf BibTex

2012

auteur
Nicolas Duchateau, Mathieu De Craene, Xavier Pennec, Beatriz Merino, Marta Sitges, Bart Bijnens
titre
Which Reorientation Framework for the Atlas-Based Comparison of Motion from Cardiac Image Sequences?
article
Durrleman, Stanley and Fletcher, Tom and Gerig, Guido and Niethammer, Marc. STIA 2012 (Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Sep 2012, Nice, France. Springer, Heidelberg, 7570, pp.25-37, 2012, LNCS. 〈10.1007/978-3-642-33555-6_3〉
identifiant
hal-00813822
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-33555-6_3
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BibTex
auteur
Vikash Gupta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Towards higher resolution analysis of Clinical Brain Diffusion Images
article
1st International Symposium on Deep Brain Connectomics, Sep 2012, Clermon-Ferrand, France. 2012
identifiant
hal-00813829
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BibTex
auteur
Hervé Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
titre
Spectral Demons - Image Registration via Global Spectral Correspondence
article
Computer Vision - ECCV 2012, 2012, Florence, Italy. Springer, 7573, pp.30-44, 2012, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-33709-3_3〉
identifiant
hal-00813833
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-33709-3_3
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BibTex
auteur
Hervé Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Jean-Marc Peyrat, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
titre
Groupwise Spectral Log-Demons Framework for Atlas Construction
article
Medical Computer Vision (MCV'12) MICCAI workshop, 2012, Nice, France. Springer, 7766, pp.11-19, 2012, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-36620-8_2〉
identifiant
hal-00813834
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-36620-8_2
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BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni Frisoni
titre
Disentangling the normal aging from the pathological Alzheimer's disease progression on cross-sectional structural MR images
article
MICCAI workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders (NIBAD'12), 2012, Nice, France. pp.145-154, 2012
identifiant
hal-00813836
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https://hal.inria.fr/hal-00813836/file/Lorenzi-LongProjection-NIBAD12.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni, (adni) For The Alzheimer'S Disease Neuroimaging Initiative
titre
Disentangling the normal aging from the pathological Alzheimer's disease progression on structural MR images
article
5th Clinical Trials in Alzheimer's Disease (CTAD'12), Oct 2012, Monte Carlo, Monaco. 2012
identifiant
hal-00813844
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BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Giovanni B. Frisoni, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Probabilistic Flux Analysis of Cerebral Longitudinal Atrophy
article
MICCAI workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders (NIBAD'12), 2012, Nice, France. pp.256-265, 2012
identifiant
hal-00813846
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00813846/file/Asclepios-Lorenzi-FluxAnalysis-atrophy-Challenge.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Regional flux analysis of longitudinal atrophy in Alzheimer's disease
article
Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2012 (MICCAI), 2012, Nice, France. Springer, Heidelberg, 7510, pp.739--746, 2012, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-33415-3_91〉
identifiant
hal-00813837
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-33415-3_91
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00813837/file/Lorenzi-MICCAI2012.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni, (adni) For The Alzheimer'S Disease Neuroimaging Initiative
titre
Differentiating pathological brain atrophy from normal aging: a promising diagnostic tool for Alzheimer's disease
article
2nd Virtual Physiological Human European Conference (VPH2012), Sep 2012, London, United Kingdom. 2012
identifiant
hal-00813842
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auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni
titre
Modeling the longitudinal atrophy in healthy subject at risk for Alzheimer's disease
article
Alzheimer's Association International Conference 2012, Jul 2012, Vancouver, Canada. 8, Issue 4, Supplement, pp.P340, 2012, Alzheimer's & Dementia: The Journal of the Alzheimer's Association. 〈http://www.alzheimersanddementia.com/article/S1552-5260%2812%2901069-2/fulltext〉. 〈10.1016/j.jalz.2012.05.937〉
identifiant
hal-00876516
DOI
DOI : 10.1016/j.jalz.2012.05.937
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auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni
titre
Spatio-temporal model of atrophy progression in healthy subjects at risk for Alzheimer's disease
article
Alzheimer's Association International Conference 2012, Jul 2012, Vancouver, Canada. 8, Issue 4, Supplement, pp.P340-P341, 2012, Alzheimer's & Dementia: The Journal of the Alzheimer's Association. 〈http://www.alzheimersanddementia.com/article/S1552-5260%2812%2901070-9/fulltext〉. 〈10.1016/j.jalz.2012.05.938〉
identifiant
hal-00876518
DOI
DOI : 10.1016/j.jalz.2012.05.938
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auteur
Kristin Mcleod, Christof Seiler, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
A Near-Incompressible Poly-Affine Motion Model for Cardiac Function Analysis
article
Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function + a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (STACOM+CESC'12), 2012, Nice, France. Springer, 7746, pp.288-297, 2013, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-36961-2_33〉
identifiant
hal-00813852
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-36961-2_33
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auteur
Adityo Prakosa, Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Evaluation of iLogDemons Algorithm for Cardiac Motion Tracking in Synthetic Ultrasound Sequence
article
Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Imaging and Modelling Challenge (STACOM12), 2012, Nice, France. Springer, 7746, pp.178-187, 2012, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-36961-2_21〉
identifiant
hal-00813860
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-36961-2_21
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https://hal.inria.fr/hal-00813860/file/PrakosaSTACOM12_1_.pdf BibTex
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes
titre
Simultaneous Multiscale Polyaffine Registration by Incorporating Deformation Statistics
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2012, Nice, France. Springer, Heidelberg, 7511, pp.130--137, 2012, LNCS. 〈10.1007/978-3-642-33418-4_17〉
identifiant
hal-00813867
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-33418-4_17
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https://hal.inria.fr/hal-00813867/file/SeilerMultiscaleGroupwisePolyaffineRegistrationMICCAI2012.pdf BibTex
auteur
Stefan Sommer, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre
Sparsity and Scale: Compact Representations of Deformation for Diffeomorphic Registration
article
IEEE Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis (MMBIA 2012), Jan 2012, Breckenridge, Colorado, United States. 2012, 〈10.1109/MMBIA.2012.6164753〉
identifiant
hal-00641357
DOI
DOI : 10.1109/MMBIA.2012.6164753
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https://hal.inria.fr/hal-00641357/file/Sommer.mmbia12.pdf BibTex

2011

auteur
Michel Dojat, Mélanie Pélégrini-Issac, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Alban Gaignard, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Franck Michel, Johan Montagnat, Xavier Pennec, Javier Balderrama, Bacem Wali
titre
NeuroLOG: A framework for the sharing and reuse of distributed tools and data in neuroimaging
article
Organization for Human Brain Mapping (HBM'11), Jun 2011, Quebec, Canada. 2011
identifiant
hal-00813796
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auteur
Bernard Gibaud, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Franck Michel, Bacem Wali, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Pascal Girard, Alban Gaignard, Diane Lingrand, Johan Montagnat, Javier Rojas Balderrama, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, David Godard, Gilles Kassel, Mélanie Pélégrini-Issac
titre
A federated system for sharing and reuse of images and image processing tools in neuroimaging
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'11), Jun 2011, Berlin, Germany. 2011
identifiant
hal-00690921
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auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre
Geodesics, Parallel Transport & One-parameter Subgroups for Diffeomorphic Image Registration
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads. Proceedings of the Third International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.64-74, 2011
identifiant
inria-00623919
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https://hal.inria.fr/inria-00623919/file/MFCA11_2_3.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Giovanni Frisoni
titre
Monitoring the brain's longitudinal changes in clinical trials for Alzheimers disease: a robust and reliable non-rigid registration framework
article
Alzheimer's Association 2011 International Conference on Alzheimer's Disease (AAICAD), Jul 2011, Paris, France. 7, Issue 4, Supplement, pp.S376, 2011, Alzheimer's & Dementia: The Journal of the Alzheimer's Association. 〈10.1016/j.jalz.2011.05.1082〉
identifiant
inria-00616203
DOI
DOI : 10.1016/j.jalz.2011.05.1082
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auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Giovanni Frisoni, Xavier Pennec
titre
Mapping the effects of Ab142 levels on the longitudinal changes in healthy aging: hierarchical modeling based on stationary velocity filds.
article
Fichtinger, Gabor and Martel, Anne and Peters, Terry. Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2011, Toronto, Canada. Springer, 6892, pp.663-670, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-23629-7_81〉
identifiant
inria-00616213
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-23629-7_81
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auteur
Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Schilds Ladder for the parallel transport of deformations in time series of images
article
Szekely, G. and Hahn, H. IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. Springer, 6801, pp.463--474, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-22092-0_38〉
identifiant
inria-00616210
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-22092-0_38
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auteur
Kristin Mcleod, Adityo Prakosa, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
An Incompressible Log-Domain Demons Algorithm for Tracking Heart Tissue
article
Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function (STACOM11), Sep 2011, Toronto, Canada. Springer, 7085, pp.55-67, 2012, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-28326-0_6〉
identifiant
hal-00813851
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-28326-0_6
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auteur
Xavier Pennec, Marco Lorenzi
titre
Which parallel transport for the statistical analysis of longitudinal deformations?
article
Colloque GRETSI '11, 2011, Bordeaux, France. 2011
identifiant
inria-00616204
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auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes Aguirre
titre
Geometry-Aware Multiscale Image Registration Via OBBTree-Based Polyaffine Log-Demons
article
MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2011, 2011, Toronto, Canada. Springer, Heidelberg, 6892, pp.631-638, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-23629-7_77〉
identifiant
inria-00616215
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-23629-7_77
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https://hal.inria.fr/inria-00616215/file/SeilerOBBTreeMultiscalePolyLogDemonsMICCAI2011.pdf BibTex
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Lucas Ritacco, Mauricio Reyes Aguirre
titre
Femur Specific Polyaffine Model to Regularize the Log-Domain Demons Registration
article
Dawant, Benoit M. and Haynor, David R. Proceedings of SPIE Medical Imaging '11, 2011, Lake Buena Vista, Floride, United States. SPIE Publishing, 7962, Paper 7962-15, 2011, Medical Imaging 2011: Image Processing. 〈10.1117/12.878316〉
identifiant
inria-00616216
DOI
DOI : 10.1117/12.878316
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https://hal.inria.fr/inria-00616216/file/SeilerFemurPolyaffineLogDemonsSPIE2011.pdf BibTex
auteur
Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Pierre Fillard
titre
Joint T1 and Brain Fiber Diffeomorphic Registration Using the Demons
article
Liu, Tianming and Shen, Dinggang and Ibanez, Luis and Tao, Xiaodong. Multimodal Brain Image Analysis First International Workshop, MBIA 2011, Held in Conjunction with MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. Springer Berlin / Heidelberg, 7012, pp.10-18, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-24446-9_2〉
identifiant
inria-00627971
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-24446-9_2
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https://hal.inria.fr/inria-00627971/file/Joint_T1_and_Brain_Fiber_Diffeomorphic_Registration_Using_the_Demons_.pdf BibTex
auteur
Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre
A Multi-scale Kernel Bundle for LDDMM: Towards Sparse Deformation Description Across Space and Scales
article
Szekely, Gabor and Hahn, Horst. IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. Springer, 6801, pp.624--635, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-22092-0_51〉
identifiant
inria-00616209
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-22092-0_51
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auteur
Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre
Kernel Bundle EPDiff: Evolution Equations for Multi-Scale Diffeomorphic Image Registration
article
Bruckstein, A.M. and ter Haar Romeny, B. and Bronstein, A.M. and Bronstein, M.M. Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2011, Ein-Gedi, Israel. Springer, 6667, pp.677-688, 2011, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-24785-9_57〉
identifiant
hal-00644965
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-24785-9_57
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https://hal.inria.fr/hal-00644965/file/Sommer.SSVM11.pdf BibTex

2010

auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig De Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Paul Thompson
titre
Statistically assisted fluid image registration algorithm - SAFIRA
article
Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. IEEE, pp.364--367, 2010, 〈10.1109/ISBI.2010.5490335〉
identifiant
inria-00616165
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490335
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auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Yi-Yu Chou, Xavier Pennec, Greig De Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, James C. Gee, Paul Thompson
titre
A 3D Statistical Fluid Registration Algorithm
article
Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI'2010), 2010, Beijing, China. 2010
identifiant
inria-00616169
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auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
titre
Measuring the inter-subject variability of endocast growth using shape regression and spatiotemporal registration
article
79th Annual Meeting of the American Association of Physical Anthropologists, Apr 2010, Albuquerque, United States. 2010
identifiant
hal-00935056
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BibTex
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
titre
Comparison of the endocast growth of chimpanzees and bonobos via temporal regression and spatiotemporal registration
article
Miccai Workshop on Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, 2010, Beijing, China, China. 2010
identifiant
inria-00616154
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https://hal.inria.fr/inria-00616154/file/Durrleman_Workshop4D.pdf BibTex
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
titre
Measuring the inter-species variability of endocast growth using shape regression and spatiotemporal registration
article
Abstracts of the 79-th annual meeting of the American Assoc. of Physical Anthropologists (AAPA), April 2010, Albuquerque, Jul 2010, Albuquerque, United States. pp.78-79, 2010, 〈http://physanth.org/annual-meeting/2010/79th-annual-meeting-2010/2010%20AAPA%20Abstracts.pdf〉
identifiant
hal-00875361
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auteur
V. Gorbunova, Stanley Durrleman, Pechin Lo, Xavier Pennec, M. De Bruijne
titre
Lung CT registration combining intensity, curves and surfaces
article
Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. IEEE, pp.340--343, 2010, 〈10.1109/ISBI.2010.5490341〉
identifiant
inria-00616166
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490341
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BibTex
auteur
Hans Lamecker, Xavier Pennec
titre
Atlas to Image-with-Tumor Registration based on Demons and Deformation Inpainting
article
MICCAI Workshop on Computational Imaging Biomarkers for Tumors - From Qualitative to Quantitative (CIBT'2010), 2010, Beijing, China. 2010, The MIDAS Journal - Computational Imaging Biomarkers for Tumors (CIBT). 〈http://hdl.handle.net/10380/3208〉
identifiant
inria-00616156
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https://hal.inria.fr/inria-00616156/file/IJ_759_1_demons.pdf BibTex
auteur
Natasha Lepore, Anand Joshi, Richard Leahy, Caroline Brun, Yi-Yu Chou, Xavier Pennec, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greg De Zubicaray, Margaret Wright, Kathie Mcmahon, Aw Toga, Paul Thompson
titre
A New Combined Surface and Volume Registration
article
Dawant, Benoit M. and Haynor, David R. Medical Imaging 2010, Feb 2010, San Diego, United States. SPIE, 7623, pp.76231E-76231E-9, 2010, SPIE Proceedings. 〈10.1117/12.844434〉
identifiant
hal-00813772
DOI
DOI : 10.1117/12.844434
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https://hal.inria.fr/hal-00813772/file/LeporeSPIE2010.pdf BibTex
auteur
Marco Lorenzi, G. Frisoni, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Mapping longitudinal changes in the brain affected by Alzheimer's disease
article
VPH European Conference, Sep 2010, Brussels, Belgium. 2010
identifiant
hal-00813774
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BibTex
auteur
Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Younes Boudjemline
titre
[In-silico models for the simulation and prediction of the cardiac function].
article
Congrès de la Société Francaise de Pédiatrie et de l'Association des Pédiatres de Langue Française (APLF), 2010, Paris, France. Elsevier, 17(6) (6), pp.611-2, 2010, Archives de Pédiatrie. 〈10.1016/S0929-693X(10)70022-1〉
identifiant
inria-00616147
DOI
DOI : 10.1016/S0929-693X(10)70022-1
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BibTex
auteur
Tommaso Mansi, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre
LogDemons Revisited: Consistent Regularisation and Incompressibility Constraint for Soft Tissue Tracking in Medical Images
article
Proc. of Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'10), part II, 2010, Beijing, China, China. 6362, pp.652-659, 2010, LNCS. 〈10.1007/978-3-642-15745-5_80〉
identifiant
inria-00616162
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-15745-5_80
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BibTex
auteur
Kristin Mcleod, Tommaso Mansi, Stanley Durrleman, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre
Statistical Analysis of the Anatomy: From Digital Patient to Digital Population
article
First VPH Conference (VPH2010), Jul 2010, Brussels, Belgium. 2010
identifiant
hal-00813775
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BibTex
auteur
Kristin Mcleod, Alfonso Caiazzo, Miguel Angel Fernández, Tommaso Mansi, Irene Vignon-Clementel, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Younes Boudjemline, Jean-Frédéric Gerbeau
titre
Atlas-Based Reduced Models of Blood Flows for Fast Patient-Specific Simulations
article
STACOM, Sep 2010, Beijin, China. Springer, 6364, pp.95-104, 2010, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-15835-3_10〉
identifiant
inria-00517994
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-15835-3_10
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https://hal.inria.fr/inria-00517994/file/2010_miccai_lncs.pdf BibTex
auteur
Franck Michel, Alban Gaignard, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Mélanie Pélégrini-Issac, Xavier Pennec, Javier Rojas Balderrama, Bacem Wali
titre
Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.
article
Tony Solomonides ; Ignacio Blanquer ; Vincent Breton ; Tristan Glatard ; Yannick Legré. HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. IOS press, 159, pp.112-123, 2010, Studies in Health Technology and Informatics. 〈10.3233/978-1-60750-583-9-112〉
identifiant
inserm-00512799
DOI
DOI : 10.3233/978-1-60750-583-9-112
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00512799/file/neurolog_healthgrid_2010.pdf http://www.hal.inserm.fr/inserm-00512799/file/inserm-00512799_edited.pdf BibTex
auteur
Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes Aguirre
titre
Parametric regression of 3D medical images through the exploration of non-parametric regression models
article
Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. IEEE, pp.452--455, 2010, Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2010 IEEE International Symposium on. 〈10.1109/ISBI.2010.5490313〉
identifiant
inria-00616168
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490313
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https://hal.inria.fr/inria-00616168/file/Seiler.ISBI2010.pdf BibTex
auteur
Andrew Sweet, Xavier Pennec
titre
Log-Domain Diffeomorphic Registration of Diffusion Tensor Images
article
WBIR 2010 - International Workshop on Biomedical Image Registration , Jul 2010, Lübeck, Germany. Springer, 6204, pp.198-209, 2010, LNCS. 〈10.1007/978-3-642-14366-3_18〉
identifiant
inria-00616163
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-14366-3_18
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https://hal.inria.fr/inria-00616163/file/wbir2010.pdf BibTex
auteur
Andrew Sweet, Xavier Pennec
titre
A Log-Euclidean Statistical Analysis of DTI Brain Deformations
article
MICCAI 2010 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2010, Beijing, China. 〈http://cmic.cs.ucl.ac.uk/cdmri10/〉
identifiant
hal-01525407
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https://hal.inria.fr/hal-01525407/file/cdmri2010.pdf BibTex

2009

auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig De Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
A Lagrangian formulation for statistical fluid registration
article
Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, no address, United States. IEEE, pp.975--978, 2009, 〈10.1109/ISBI.2009.5193217〉
identifiant
inria-00616141
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2009.5193217
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BibTex
auteur
Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
A statistical model of white matter fiber bundles based on currents.
article
Jerry L. Prince and Dzung L. Pham and Kyle J. Meyers. International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2009, Williamsburg, Va, United States. Springer-Verlag, 5636, pp.114-25, 2009, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-02498-6_10〉
identifiant
inria-00502721
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-02498-6_10
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BibTex
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Guido Gerig, Nicholas Ayache
titre
Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
article
Yang, Guang-Zhong and Hawkes, David and Rueckert, Daniel and Noble, Alison and Taylor, Chris. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part I, 2009, London, UK, United States. Springer, 5761, pp.297--304, 2009, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-642-04268-3_37〉
identifiant
inria-00616113
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-04268-3_37
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https://hal.inria.fr/inria-00616113/file/MICCAI-1207.pdf BibTex
auteur
V. Gorbunova, Stanley Durrleman, Pechin Lo, Xavier Pennec, M. De Bruijne
titre
Curve- and surface-based registration of lung CT images via currents
article
Brown, M. and de Bruijne, M. and van Ginneken, B. and Kiraly, A. and Kuhnigk, J.M. and Lorenz, C. and McClelland, J.R. and Mori, K. and Reeves, A.P. and Reinhardt, J. Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis, 2009, London United Kingdom, United Kingdom. pp.15--25, 2009, Proc. of Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis. 〈http://www.lungworkshop.org/2009/proc2009/15.pdf〉
identifiant
inria-00616136
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00616136/file/Gorbunova_LungWorkshop.pdf BibTex
auteur
Heike Hufnagel, Jan Ehrhardt, Xavier Pennec, Heinz Handels
titre
Application of a Probabilistic Statistical Shape Model to Automatic Segmentation
article
World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, WC 2009, München, 2009, no address, Germany. Springer, 25/4, pp.2181--2184, 2009, IFMBE Proceedings. 〈10.1007/978-3-642-03882-2_579〉
identifiant
inria-00616144
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-03882-2_579
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auteur
Tommaso Mansi, Stanley Durrleman, Boris Bernhardt, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Ingmar Voigt, Philipp Lurz, Andrew Taylor, Julie Blanc, Younes Boudjemline, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A Statistical Model of Right Ventricle in Tetralogy of Fallot for Prediction of Remodelling and Therapy Planning
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'09), 2009, London, UK, United Kingdom. Springer, 5761, pp.214-221, 2009, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-642-04268-3_27〉
identifiant
inria-00616175
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-04268-3_27
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2008

auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig De Zubicaray, Matthew Meredith, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
A tensor-based morphometry study of genetic influences on brain structure using a new fluid registration method
article
Metaxas, Dimitris and Axel, Leon. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, New York, USA, United States. Springer, 5242, pp.914--921, 2008, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-540-85990-1_110〉
identifiant
inria-00616170
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_110
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auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Greig De Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Marina Barysheva, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
A new registration method based on Log-Euclidean Tensor metrics and its application to genetic studies
article
Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp.1115-1118, 2008, 〈10.1109/ISBI.2008.4541196〉
identifiant
inria-00616171
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541196
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auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Katie L. Mcmahon, Greig I. De Zubicaray, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
Volumetric Differences in Brain Structure in Identical and Fraternal Twins Computed using Riemannian Tensor-Based Morphometry
article
13th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2008, Melbourne, Australia. 2008
identifiant
hal-00875380
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auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
A Forward Model to Build Unbiased Atlases from Curves and Surfaces
article
Xavier Pennec. 2nd MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp.68-79, 2008
identifiant
inria-00632875
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https://hal.inria.fr/inria-00632875/file/mfca08_3_1.pdf BibTex
auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
Sparse approximation of currents for statistics on curves and surfaces.
article
Metaxas, D and Axel, L and Fichtinger, G and Szekely, G. MICCAI - 11th International Conference on Medical Image Computing And Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. Springer, 5242 (Pt 2), pp.390-398, 2008, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-540-85990-1_47〉
identifiant
hal-00818375
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_47
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auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
A framework for evaluating the impact of compression on registration algorithms without gold standard
article
International Conference on Image Processing, Oct 2008, San Diego, California, United States. IEEE, pp.2912-2915, 2008, 〈10.1109/ICIP.2008.4712404〉
identifiant
hal-00683112
DOI
DOI : 10.1109/ICIP.2008.4712404
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683112/file/icip_final.pdf BibTex
auteur
Monica Hernandez, Salvador Olmos, Xavier Pennec
titre
Comparing algorithms for diffeomorphic registration: Stationary LDDMM and Diffeomorphic Demons
article
Xavier Pennec. 2nd MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp.24-35, 2008
identifiant
inria-00629883
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https://hal.inria.fr/inria-00629883/file/mfca08_1_3.pdf BibTex
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre
Comparison of Statistical Shape Models Built on Correspondence Probabilities and One-to-One Correspondences
article
Proc. SPIE Symposium on Medical Imaging '08, 2008, San Diego, USA, Germany. 6914, 2008, SPIE Conference Series. 〈10.1117/12.771136〉
identifiant
inria-00616124
DOI
DOI : 10.1117/12.771136
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auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre
A Global Criterion for the Computation of Statistical Shape Model Parameters Based on Correspondence Probabilities
article
Springer,. Bildverarbeitung für die Medizin 2008, 2008, no address, Germany. 14, pp.277-282, 2008, Informatik aktuell. 〈10.1007/978-3-540-78640-5_56〉
identifiant
inria-00616114
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-78640-5_56
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auteur
Natasha Leporé, Caroline Brun, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Xavier Pennec, Katie Mcmahon, Matthew Meredith, Greig De Zubicaray, Margaret Wright, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
Best individual template selection from deformation tensor minimization
article
Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp.460-463, 2008, 〈10.1109/ISBI.2008.4541032〉
identifiant
inria-00616172
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541032
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auteur
Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Martin Huber, Andrew Taylor, Giacomo Pongiglione, Xavier Pennec, Younes Boudjemline
titre
Modélisation électromécanique du coeur et analyse d'images
article
Congrés des Sociétés Françaises Médico-chirurgicales Pédiatriques, 2008, Paris, France. 15(5), pp.1032, 2008, Archives de Pédiatrie. 〈10.1016/S0929-693X(08)72422-9〉
identifiant
hal-00875383
DOI
DOI : 10.1016/S0929-693X(08)72422-9
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auteur
Erik Pernod, Jean-Christophe Souplet, Javier Rojas Balderrama, Diane Lingrand, Xavier Pennec
titre
Multiple Sclerosis Brain MRI Segmentation Workflow deployment on the EGEE Grid
article
MICCAI-Grid Workshop, Sep 2008, New York, United States. pp.55--64, 2008
identifiant
hal-00459138
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00459138/file/pernod-souplet-etal_2008.pdf BibTex
auteur
Jean-Marc Peyrat, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Nicholas Ayache
titre
Registration of 4D Time-Series of Cardiac Images with Multichannel Diffeomorphic Demons
article
Metaxas, Dimitris and Axel, Leon and Fichtinger, Gabor and Székely, Gábor. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, New York, USA, United States. Springer, 5242, pp.972--979, 2008, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-540-85990-1_117〉
identifiant
inria-00616122
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_117
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auteur
Javier Rojas Balderrama, Diane Lingrand, Erik Pernod, Jean-Christophe Souplet, Xavier Pennec, Johan Montagnat
titre
NeuroLOG: Neuroscience Application Workflows Execution on the EGEE Grid
article
EGEE conference, Sep 2008, Istanbul, Turkey
identifiant
hal-00461625
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00461625/file/egee08.pdf BibTex
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre
Symmetric Log-Domain Diffeomorphic Registration: A Demons-based Approach
article
Dimitris Metaxas and Leon Axel and Gabor Fichtinger and Gábor Székely. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. Springer, 5241, pp.754--761, 2008, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-540-85988-8_90〉
identifiant
inria-00280602
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-85988-8_90
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https://hal.inria.fr/inria-00280602/file/SymLogDemons-MICCAI08-Vercauteren.pdf BibTex
auteur
B.T. Thomas Yeo, Tom Vercauteren, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Polina Golland, Nicholas Ayache, Olivier Clatz
titre
DTI Registration with Exact Finite-Strain Differential
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), May 2008, Paris, France. IEEE, pp.700-703, 2008, 〈10.1109/ISBI.2008.4541092〉
identifiant
inria-00272326
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541092
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https://hal.inria.fr/inria-00272326/file/DTIDiffeomorphicDemons-ISBI08-Yeo.pdf BibTex

2007

auteur
Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Oscar Lopez, Howard Aizenstein, James Becker, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
Comparison of Standard and Riemannian Fluid Registration for Tensor-Based Morphometry in HIV/AIDS
article
Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, United States. 2007
identifiant
inria-00616057
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auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
Measuring brain variability via sulcal lines registration: a diffeomorphic approach.
article
Nicholas Ayache and Sébastien Ourselin and Anthony Maeder. International Conference on Medical Imaging and Computer Assisted Intervention, Oct 2007, Brisbane, Australia. Springer-Verlag, 4791 (Pt 1), pp.675-82, 2007, Lecture notes in computer science. 〈10.1007/978-3-540-75757-3_82〉
identifiant
inria-00502704
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-75757-3_82
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auteur
Pierre Fillard, Xavier Pennec, Paul Thompson, Nicholas Ayache
titre
Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
article
Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, Australia. 2007
identifiant
inria-00616033
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auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
article
Cluster Computing and the Grid, May 2007, Rio de Janeiro, Brazil. pp.100-107, 2007, 〈10.1109/CCGRID.2007.78〉
identifiant
hal-00683172
DOI
DOI : 10.1109/CCGRID.2007.78
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683172/file/CCGRID07.pdf BibTex
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Heinz Handels, Nicholas Ayache
titre
Point-Based Statistical Shape Models with Probabilistic Correspondences and Affine EM-ICP
article
Springer,. Bildverarbeitung fuer die Medizin 2007, 2007, no address, Germany. Springer, pp.434-438, 2007, Informatik aktuell. 〈10.1007/978-3-540-71091-2_87〉
identifiant
inria-00616034
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-71091-2_87
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auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Heinz Handels, Nicholas Ayache
titre
Shape Analysis Using a Point-Based Statistical Shape Model Built on Correspondence Probabilities
article
Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4791, pp.959-967, 2007, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-540-75757-3_116〉
identifiant
inria-00616042
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-75757-3_116
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auteur
Natasha Leporé, Caroline Brun, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Oscar Lopez, Howard Aizenstein, James Becker, Arthur Toga, Paul Thompson
titre
Mean Template for Tensor-Based Morphometry using Deformation Tensors
article
Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4792, pp.826-833, 2007, LNCS. 〈10.1007/978-3-540-75759-7_100〉
identifiant
inria-00616043
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-75759-7_100
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auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
Clinical Evaluation of a Respiratory Gated Guidance System for Liver Punctures
article
Ayache, Nicholas and Ourselin, Sébastien and Maeder, Anthony J. Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. Springer, 4792, pp.77--85, 2007, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-540-75759-7_10〉
identifiant
inria-00616044
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-75759-7_10
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BibTex
auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
titre
Statistical Comparison of Cardiac Fibre Architectures
article
Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. 4466, pp.413-423, 2007, LNCS. 〈10.1007/978-3-540-72907-5_42〉
identifiant
inria-00616049
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-72907-5_42
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BibTex
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre
Diffeomorphic Demons Using ITK's Finite Difference Solver Hierarchy
article
Insight Journal -- ISC/NA-MIC Workshop on Open Science at MICCAI 2007, 2007, no address, Australia. 2007
identifiant
inria-00616035
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BibTex
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre
Non-parametric Diffeomorphic Image Registration with the Demons Algorithm
article
Nicholas Ayache and Sébastien Ourselin and Anthony Maeder. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Oct 2007, Brisbane, Australia. 4792/2007, pp.319-326, 2007, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-540-75759-7_39〉
identifiant
inria-00166123
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-75759-7_39
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https://hal.inria.fr/inria-00166123/file/DiffeoDemons-MICCAI07-Vercauteren.pdf BibTex
auteur
Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Ezio Malis, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre
Insight Into Efficient Image Registration Techniques and the Demons Algorithm
article
Nico Karssemeijer and Boudewijn Lelieveldt. Information Processing in Medical Imaging, Jul 2007, Kerkrade, Netherlands. 4584/2007, pp.495-506, 2007, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/978-3-540-73273-0_41〉
identifiant
inria-00165534
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-73273-0_41
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https://hal.inria.fr/inria-00165534/file/InsightEffRegDemons-IPMI07-Vercauteren.pdf BibTex

2006

auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Statistics on Diffeomorphisms in a Log-Euclidean Framework
article
Xavier Pennec and Sarang Joshi. 1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.14-15, 2006
identifiant
inria-00635671
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https://hal.inria.fr/inria-00635671/file/Arsigny_MFCA06.pdf BibTex
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms
article
Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, Copenhaguen, Denmark. 4190 pp.924--931, 2006, LNCS. 〈10.1007/11866565_113〉
identifiant
inria-00615594
DOI
DOI : 10.1007/11866565_113
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BibTex
auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration
article
Pluim, J.P.W. and Likar, B. and Gerritsen, F.A. Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. Springer, 4057, pp.120-127, 2006, LNCS. 〈10.1007/11784012_15〉
identifiant
inria-00615607
DOI
DOI : 10.1007/11784012_15
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auteur
Antoine Azar, Chenyang Xu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
An interactive Intensity- and Feature-Based Non-Rigid Registration Framework for 3D Medical Images
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.824--827, 2006, 〈10.1109/ISBI.2006.1625045〉
identifiant
inria-00615601
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2006.1625045
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auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle
titre
A novel framework for the 3D analysis of spine deformation modes.
article
Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. IOS Press, 123, pp.176-81, 2006, Studies in Health Technology and Informatics. 〈http://www.booksonline.iospress.nl/Content/View.aspx?piid=3635〉
identifiant
inria-00615608
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BibTex
auteur
Jonathan Boisvert, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle, Farida Cheriet
titre
3D Anatomic Variability Assesment of the Scoliotic Spine Using Statistics on Lie Groups
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. IEEE, pp.750--753, 2006, 〈10.1109/ISBI.2006.1625025〉
identifiant
inria-00615602
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2006.1625025
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BibTex
auteur
Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle
titre
Assessment of Brace Local Action on Vertebrae Relative Poses
article
Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. 123, pp.372--378, 2006, Studies in Health Technology and Informatics
identifiant
inria-00615609
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BibTex
auteur
Jonathan Boisvert, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Farida Cheriet, Nicholas Ayache
titre
Principal Spine Shape Deformation Modes Using Riemannian Geometry and Articulated Models
article
Proc of the IV Conference on Articulated Motion and Deformable Objects, Andratx, Mallorca, Spain, 11-14 July, 2006, no address, Spain. Springer, 4069, pp.346--355, 2006, LNCS. 〈10.1007/11789239_36〉
identifiant
inria-00615592
DOI
DOI : 10.1007/11789239_36
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BibTex
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Clinical DT-MRI estimation, smoothing and fiber tracking with log-Euclidean metrics
article
Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.786-789, 2006, 〈10.1109/ISBI.2006.1625034〉
identifiant
inria-00615579
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2006.1625034
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auteur
J. Freund, D. Comaniciu, Y. Ioannis, P. Liu, Richard Mcclatchey, E. Moley-Fletcher, Xavier Pennec, Giacomo Pongiglione, X.S. Zhou
titre
Health-e-Child: An Integrated Biomedical Platform for Grid-Based Pediatrics
article
Proc of Health-Grid 2006, 2006, Valancia, Spain, Spain. 120, pp.259-270, 2006, Studies in Health Technology and Informatics
identifiant
inria-00615591
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auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
An experimental comparison of Grid5000 clusters and the EGEE grid
article
Experimental Grid testbeds for the assessment of large-scale distributed applications and tools, Jun 2006, Paris, France. pp.1-10, 2006
identifiant
hal-00683199
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683199/file/EXPGRID06.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
Efficient services composition for grid-enabled data-intensive applications
article
High Performance and Distributed Computing, Jun 2006, Paris, France. pp.333-334, 2006, 〈10.1109/HPDC.2006.1652170〉
identifiant
hal-00683201
DOI
DOI : 10.1109/HPDC.2006.1652170
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683201/file/HPDC06.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
Probabilistic and dynamic optimization of job partitioning on a grid infrastructure
article
Parallel, Distributed and network-based Processing, Feb 2006, Montbéliard-Sochaux, France. pp.231-238, 2006, 〈10.1109/PDP.2006.61〉
identifiant
hal-00683203
DOI
DOI : 10.1109/PDP.2006.61
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683203/file/PDP06.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Xavier Pennec, Johan Montagnat
titre
Performance evaluation of grid-enabled registration algorithms using bronze-standards
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI 2006), Oct 2006, Copenhagen, Denmark. Springer, 4191, pp.152-160, 2006, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/11866763_19〉
identifiant
hal-00683176
DOI
DOI : 10.1007/11866763_19
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683176/file/MICCAI06.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
Medical image registration algorithms assessment: Bronze Standard application enactment on grids using the MOTEUR workflow engine
article
HealthGrid conference (HealthGrid'06), Valencia, Spain, June 7-9, Jun 2006, Valencia, Spain. pp.93-103, 2006
identifiant
hal-00683188
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683188/file/HealthGrid06b.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Left-Invariant Riemannian Elasticity: a distance on shape diffeomorphisms ?
article
Xavier Pennec and Sarang Joshi. 1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.1-13, 2006
identifiant
inria-00634098
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https://hal.inria.fr/inria-00634098/file/Pennec_MFCA06.pdf BibTex
auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
titre
Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Structure
article
Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, no address, Denmark. Springer, 4190, pp.297--304, 2006, LNCS. 〈10.1007/11866565_37〉
identifiant
inria-00615596
DOI
DOI : 10.1007/11866565_37
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2005

auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Fast and simple calculus on tensors in the log-Euclidean framework.
article
J. Duncan and G. Gerig. International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. Springer-Verlag, 3749 (Pt 1), pp.115-22, 2005, Lecture notes in computer science. 〈10.1007/11566465_15〉
identifiant
inria-00502669
DOI
DOI : 10.1007/11566465_15
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auteur
Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
titre
Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.
article
J. Duncan and G. Gerig. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. Springer-Verlag, 3750 (Pt 2), pp.927-34, 2005, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/11566489_114〉
identifiant
inria-00502673
DOI
DOI : 10.1007/11566489_114
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auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Paul M. Thompson, Nicholas Ayache
titre
Extrapolation of sparse tensor fields: application to the modeling of brain variability.
article
Gary E. Christensen and Milan Sonka. International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2005, Glenwood Springs, CO, United States. Springer-Verlag, 3565, pp.27-38, 2005, Lecture notes in computer science. 〈10.1007/11505730_3〉
identifiant
inria-00502688
DOI
DOI : 10.1007/11505730_3
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auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
A Riemannian Framework for the Processing of Tensor-Valued Images
article
Olsen, Ole Fogh and Florak, Luc and Kuijper, Arjan. Deep Structure, Singularities, and Computer Vision (DSSCV), 2005, no address, Netherlands. Springer, pp.112--123, 2005, LNCS. 〈10.1007/11577812_10〉
identifiant
inria-00615994
DOI
DOI : 10.1007/11577812_10
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auteur
Cécile Germain, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Charles Loomis, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Romain Texier
titre
Grid-enabling medical image analysis
article
Cluster Computing and Grid 2005 (CCGrid05) Bio-Medical Computations on the Grid (Bio-Grid), May 2005, Cardiff, United Kingdom. Springer Netherlands, 19 (4/5), pp.339-349, 2005, 〈10.1007/s10877-005-0679-9〉
identifiant
hal-00166971
DOI
DOI : 10.1007/s10877-005-0679-9
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00166971/file/agirBiogrid3.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
Grid-enabled workflows for data intensive medical applications
article
International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS), Jun 2005, Dublin, Ireland. IEEE, pp.537-542, 2005, 〈10.1109/CBMS.2005.61〉
identifiant
hal-00691613
DOI
DOI : 10.1109/CBMS.2005.61
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00691613/file/CBMS05.pdf BibTex
auteur
Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Hans Handels, Nicholas Ayache
titre
Non-Linear 2D and 3D Registration Using Block-Matching and B-Splines
article
Bildverarbeitung fuer die Medizin 2005, 2005, Heidelberg, Germany, Germany. Springer, pp.325-329, 2005, Informatik aktuell. 〈10.1007/3-540-26431-0_67〉
identifiant
inria-00615991
DOI
DOI : 10.1007/3-540-26431-0_67
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auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
A complete Augmented Reality Guidance System for Liver Punctures: First Clinical Evaluation
article
Duncan, Jim and Gerig, Guido. Proceedings of the 8th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Part I, 2005, Palm Springs, CA, USA, October 26-29, United States. Springer, 3749, pp.539--547, 2005, LNCS. 〈10.1007/11566465_67〉
identifiant
inria-00616011
DOI
DOI : 10.1007/11566465_67
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auteur
Xavier Pennec, R. Stefanescu, V. Arsigny, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre
Riemannian elasticity: a statistical regularization framework for non-linear registration.
article
J. Duncan and G. Gerig. International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. Springer-Verlag, 3750 (Pt 2), pp.943-50, 2005, Lecture notes in computer science. 〈10.1007/11566489_116〉
identifiant
inria-00502675
DOI
DOI : 10.1007/11566489_116
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auteur
Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Mosaicing of Confocal Microscopic In Vivo Soft Tissue Video Sequences
article
Jim Duncan and Guido Gerig. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, United States. pp.753-760, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/11566465_93〉
identifiant
inria-00166791
DOI
DOI : 10.1007/11566465_93
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https://hal.inria.fr/inria-00166791/file/miccai05_mosaicing_vercauteren.pdf BibTex

2004

auteur
Guillaume Flandin, Xavier Pennec, Alexis Roche, Will Penny, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre
Multi-subject anatomo-functional classification for activation studies
article
NeuroImage (HBM'04), 2004, Budapest, Hungary, Hungary. 2004
identifiant
inria-00615974
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auteur
Derek Hill, Xavier Pennec, Michael Burns, Michael Parkin, Jo Hajnal, Radu Stefanescu, Daniel Rueckert, Johan Montagnat
titre
Intraoperable Medical Image Registration Grid Service
article
Proc. of HealthGrid 2004, 2004, Clermont-Ferrand, France. European Commission, DG Information Society, 2004
identifiant
inria-00615977
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auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
An Accuracy Certified Augmented Reality System for Therapy Guidance
article
Proc. of the 8th European Conference on Computer Vision (ECCV 04), Part III, 2004, Prague, Czech Republic. Springer, 3023, pp.79--91, 2004, LNCS. 〈10.1007/b97871〉
identifiant
inria-00615985
DOI
DOI : 10.1007/b97871
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auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
An Augmented Reality System to Guide Liver Punctures
article
Workshop AMI-ARCS 2004 held in conjunction with MICCAI'04, 2004, no address, France. pp.77--86, 2004
identifiant
inria-00615990
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auteur
Stéphane Nicolau, Jérôme Schmid, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
An Augmented Reality and Virtuality Interface for a Puncture Guidance System: Design and Validation on an Abdominal Phantom
article
Guang-Zhong Yang and Tianzi Jiang. MIAR - Medical Imaging and Augmented Reality - 2004, Aug 2004, Beijing, China. Springer, 3150, pp.302--310, 2004, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/b99698〉
identifiant
hal-00875246
DOI
DOI : 10.1007/b99698
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auteur
Luc Soler, Nicholas Ayache, Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Clément Forest, Hervé Delingette, Didier Mutter, Jacques Marescaux
titre
Virtual Reality, Augmented Reality and Robotics in surgical procedures of the liver
article
Buzug, T.M. and Lueth, T.C. Perspectives in Image-guided Surgery. Proceedings of the Scientific Workshop on Medical Robotics, Navigation and Visualization (MRNV) 2004, 2004, RheinAhrCampus Remagen, Germany, Germany. World Scientific, pp.476--484, 2004
identifiant
inria-00615975
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auteur
Luc Soler, Stéphane Nicolau, Jérôme Schmid, Christophe Koehl, Jacques Marescaux, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Virtual Reality and Augmented Reality in Digestive Surgery
article
Proc. of IEEE International Symposium on Mixed and Augmented Reality (ISMAR'04), 2004, no address, United States. pp.278--279, 2004, 〈10.1109/ISMAR.2004.64〉
identifiant
inria-00615979
DOI
DOI : 10.1109/ISMAR.2004.64
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auteur
Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A Grid Service for the Interactive Use of a Parallel Non-Rigid Registration Algorithm
article
Proc. of HealthGrid 2004, 2004, Clermont-Ferrand, France. European Commission, DG Information Society, 2004
identifiant
inria-00615978
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2003

auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Polyrigid and Polyaffine Transformations: A New Class of Diffeomorphisms for Locally Rigid or Affine Registration
article
Randy E. Ellis and Terry M. Peters. Proc. of MICCAI'03, Part II, Oct 2003, Montreal, Canada. Springer, 2879 (2), pp.829--837, 2003, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/b93811〉
identifiant
inria-00615668
DOI
DOI : 10.1007/b93811
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https://hal.inria.fr/inria-00615668/file/MIM04.pdf BibTex
auteur
Guillaume Flandin, Will Penny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre
A multisubject anatomo-functional parcellation of the brain
article
Paus, Tomas and Bullmore, Ed and Cohen, Jonathan D. NeuroImage (HBM'03), 2003, New York, USA, United States. Academic Press, 2003
identifiant
inria-00615951
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auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
Evaluation of a New 3D/2D Registration Criterion for Liver Radio-Frequencies Guided by Augmented Reality
article
Ayache, Nicholas and Delingette, Hervé. International Symposium on Surgery Simulation and Soft Tissue Modeling (IS4TM'03), 2003, Juan-les-Pins, France, France. Springer, 2673, pp.270--283, 2003, Lecture Notes in Computer Science. 〈10.1007/3-540-45015-7_26〉
identifiant
inria-00615945
DOI
DOI : 10.1007/3-540-45015-7_26
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auteur
Stéphane Nicolau, Alain Garcia, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
Guidage de ponctions percutanées à l'aide d'un système de vision basé sur une méthode de recalage 3D/2D
article
Actes du colloque Imagerie pour les sciences du vivant et de l'ingénieur (IMVIE03), 2003, Strasbourg, France. 2003
identifiant
inria-00615933
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auteur
Stéphane Nicolau, Alain Garcia, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
Augmented Reality guided radio-frequency tumor ablation
article
Proceedings of Augmented and Virtual Reality Workshop (AVIR03), 2003, Genève, Switzerland. pp.34-35, 2003
identifiant
inria-00615957
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auteur
Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
Vision augmentée de structures anatomiques abdominales recalées par stéréoscopie
article
Actes du quatrième colloque francophone. Méthodes et Techniques Optiques pour l'Industrie, 2003, Belfort, France. 1, pp.413--418, 2003
identifiant
inria-00615934
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BibTex
auteur
Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Parallel non-rigid registration on a cluster of workstations
article
Norager, Sofie. Proc. of HealthGrid'03, 2003, Lyon, France. European Commission, DG Information Society, 2003
identifiant
inria-00615956
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BibTex
auteur
Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Grid Enabled Non-Rigid Registration with a Dense Transformation and A Priori Information
article
Randy E. Ellis and Terry M. Peters. MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions 2003, Oct 2003, Montreal, Canada. Springer, 2879, pp.804--811, 2003, Lecture Notes in Computer Science - LNCS. 〈10.1007/978-3-540-39903-2_98〉
identifiant
hal-00875275
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-39903-2_98
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2002

auteur
Guillaume Flandin, Ferath Kherif, Xavier Pennec, Denis Rivière, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre
A new representation of fMRI data using anatomo-functional constraints
article
NeuroImage (HBM'02), 2002, Sendai, Japan, Japan. 2002
identifiant
inria-00615928
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auteur
Guillaume Flandin, Ferath Kherif, Xavier Pennec, Denis Rivière, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre
Parcellation of brain images with anatomical and functional constraints for fMRI data analysis
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2002, Washington, USA, United States. pp.907--910, 2002, 〈10.1109/ISBI.2002.1029408〉
identifiant
inria-00615916
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2002.1029408
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auteur
Guillaume Flandin, Ferath Kherif, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre
Improved Detection Sensitivity in Functional MRI Data using a Brain Parcelling Technique
article
Dohi, Takeyoshi and Kikinis, Ron. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'02), 2002, Tokyo, Japan. Springer, 2488, pp.467--474, 2002, LNCS. 〈10.1007/3-540-45786-0_58〉
identifiant
inria-00615921
DOI
DOI : 10.1007/3-540-45786-0_58
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BibTex
auteur
Sébastien Granger, Xavier Pennec
titre
Multi-scale EM-ICP: A Fast and Robust Approach for Surface Registration
article
Heyden, A. and Sparr, G. and Nielsen, M. and Johansen, P. European Conference on Computer Vision (ECCV 2002), 2002, Copenhagen, Denmark, Denmark. Springer, 2353, pp.418--432, 2002, LNCS. 〈10.1007/3-540-47979-1_28〉
identifiant
inria-00615911
DOI
DOI : 10.1007/3-540-47979-1_28
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BibTex
auteur
Pierre Jannin, J.M. Fitzpatrick, David Hawkes, Xavier Pennec, R. Sahidi, M.W. Vannier
titre
White paper: validation of medical image processing in image-guided therapy
article
Lemke, H.U. and Vannier, M.W. and Inamura, K. and Farman, A.G. and Doi, K. and Reiber, J.H.C. Proc. of Int. Conf. on Computer Assisted Radiology (CARS 2002), 2002, no address, Germany. Springer, pp.299--305, 2002, 〈10.1007/978-3-642-56168-9_49〉
identifiant
inria-00615930
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-56168-9_49
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BibTex
auteur
Sébastien Ourselin, Radu Stefanescu, Xavier Pennec
titre
Robust registration of multi-modal images: towards real-time clinical applications
article
Dohi, Takeyoshi and Kikinis, Ron. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'02), 2002, Tokyo, Japan. Springer, 2489, pp.140--147, 2002, LNCS. 〈10.1007/3-540-45787-9_18〉
identifiant
inria-00615675
DOI
DOI : 10.1007/3-540-45787-9_18
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BibTex
auteur
Maxime Sermesant, Clément Forest, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre
Biomechanical Model Construction from Different Modalities: Application to Cardiac Images
article
Dohi, Takeyoshi and Kikinis, Ron. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'02), 2002, Tokyo, Japan. Springer, 2488, pp.714--721, 2002, LNCS. 〈10.1007/3-540-45786-0_88〉
identifiant
inria-00615925
DOI
DOI : 10.1007/3-540-45786-0_88
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BibTex

2001

auteur
Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Pascal Cachier
titre
Fusing 3-D ultrasound and MRI for real-time image-guided neurosurgery
article
Medical Physics and Clinical Engineering Conference, 2001, no address, United States. 17(3), 2001, Physica Medica (European journal of Medical Physics)
identifiant
inria-00615896
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auteur
Pascal Cachier, Jean-François Mangin, Xavier Pennec, Denis Rivière, Dimitri Papadopoulos-Orfanos, Jean Régis, Nicholas Ayache
titre
Multisubject Non-Rigid Registration of Brain MRI using Intensity and Geometric Features
article
Niessen, W.J. and Viergever, M.A. 4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. 2208, pp.734--742, 2001, LNCS. 〈10.1007/3-540-45468-3_88〉
identifiant
inria-00615871
DOI
DOI : 10.1007/3-540-45468-3_88
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BibTex
auteur
Sébastien Granger, Xavier Pennec, Alexis Roche
titre
Rigid Point-Surface Registration Using an EM variant of ICP for Computer Guided Oral Implantology
article
Niessen, W.J. and Viergever, M.A. 4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. 2208, pp.752--761, 2001, LNCS. 〈10.1007/3-540-45468-3_90〉
identifiant
inria-00615679
DOI
DOI : 10.1007/3-540-45468-3_90
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BibTex
auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Alexis Roche, Pascal Cachier
titre
Non-rigid MR/US registration for tracking brain deformations
article
Press, IEEE Computer Society. Proc of Int. Workshop on Medical Imaging and Augmented Reality (MIAR 2001), 10-12 June 2001, Shatin, Hong Kong, 2001, Shatin, Hong Kong, Hong Kong SAR China. pp.79--86, 2001, 〈10.1109/MIAR.2001.930268〉
identifiant
inria-00615898
DOI
DOI : 10.1109/MIAR.2001.930268
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BibTex
auteur
Xavier Pennec, Pascal Cachier, Nicholas Ayache
titre
Tracking brain deformations in time sequences of 3D US images
article
Insana, M.I. and Leahy, R.M. Proc. of IPMI'01, 2001, Davis, CA, USA, United States. Springer, 2082, pp.169--175, 2001, LNCS. 〈10.1007/3-540-45729-1_16〉
identifiant
inria-00615677
DOI
DOI : 10.1007/3-540-45729-1_16
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BibTex

2000

auteur
Pascal Cachier, Xavier Pennec
titre
3D Non-Rigid Registration by Gradient Descent on a Gaussian-Windowed Similarity Measure using Convolutions
article
Proc. of IEEE Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis (MMBIA'00), 2000, Hilton Head Island, South Carolina, USA, United States. IEEE Computer society, pp.182--189, 2000, 〈10.1109/MMBIA.2000.852376〉
identifiant
inria-00615855
DOI
DOI : 10.1109/MMBIA.2000.852376
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BibTex
auteur
D. Etienne, A. Stankoff, Xavier Pennec, Sébastien Granger, A. Lacan, R. Derycke
titre
A new approach for dental implant aided surgery. A pilot evaluation
article
Lemke, H.U. and Vannier, M.W. and Inamura, K. and Farman, A.G. and Doi, K. Proc. of CARS'2000, 2000, no address, Germany. Elsevier, pp.927--931, 2000
identifiant
inria-00615854
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BibTex
auteur
D. Etienne, A. Stankoff, Xavier Pennec, Sébastien Granger, A. Lacan, R. Derycke
titre
A new approach for dental implant aided surgery.
article
4th Congresson Panamerica de Periodontologia, Aug 2000, Santiago, Chile. 2000
identifiant
hal-00875388
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BibTex
auteur
Alexis Roche, Xavier Pennec, M. Rudolph, D.P. Auer, Grégoire Malandain, Sébastien Ourselin, L.M. Auer, Nicholas Ayache
titre
Generalized Correlation Ratio for Rigid Registration of 3D Ultrasound with MR Images
article
DiGioia, A.M. and Delp, S. Proc. of the 3rd Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'00), 2000, Pittsburgh, Pennsylvanie, USA, United States. 1935, pp.567--577, 2000, LNCS. 〈10.1007/978-3-540-40899-4_58〉
identifiant
inria-00615680
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-40899-4_58
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BibTex

1999

auteur
Sébastien Ourselin, Alexis Roche, Gérard Subsol, Xavier Pennec
titre
Automatic Alignment of Histological Sections
article
Pernus, F. and Kovacic, S. and Stiehl, H.S. and Viergever, M.A. International Workshop on Biomedical Image Registration, WBIR'99, 1999, Bled (Slovénie), Slovenia. pp.1--13, 1999
identifiant
inria-00615684
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Xavier Pennec, Pascal Cachier, Nicholas Ayache
titre
Understanding the ''Demon's Algorithm'': 3D Non-Rigid registration by Gradient Descent
article
Taylor, Chris and Colchester, Alan. Proc. of 2nd Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'99), 1999, Cambridge, UK, United Kingdom. Springer, 1679, pp.597--605, 1999, LNCS. 〈10.1007/10704282_64〉
identifiant
inria-00615831
DOI
DOI : 10.1007/10704282_64
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auteur
Xavier Pennec
titre
Probabilities and Statistics on Riemannian Manifolds: Basic Tools for Geometric Measurements
article
Cetin, A.E. and Akarun, L. and Ertuzun, A. and Gurcan, M.N. and Yardimci, Y. Proc. of Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP'99), 1999, June 20-23, Antalya, Turkey, Turkey. 1, pp.194--198, 1999
identifiant
inria-00615833
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1998

auteur
Xavier Pennec, Charles R.G. Guttmann, Jean-Philippe Thirion
titre
Feature-based Registration of Medical Images: Estimation and Validation of the Pose Accuracy
article
Proc. of First Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'98), 1998, Cambridge, USA, United States. Springer, 1496, pp.1107--1114, 1998, LNCS. 〈10.1007/BFb0056300〉
identifiant
inria-00615809
DOI
DOI : 10.1007/BFb0056300
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auteur
Alexis Roche, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
The Correlation Ratio as a New Similarity Measure for Multimodal Image Registration
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Interventation, 1998, France. pp.1115-1124, 1998, 〈10.1007/BFb0056181〉
identifiant
cea-00333675
DOI
DOI : 10.1007/BFb0056181
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1997

auteur
Xavier Pennec
titre
Registration of Uncertain Geometric Features: Estimating the Pose and its Accuracy
article
Moigne, J. Le. Proc of the First Image Registration Workshop, November 20-21 1997, Greenbelt, Maryland, USA, 1997, Greenbelt, Maryland, USA, United States. pp.263--272, 1997
identifiant
inria-00615789
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1996

auteur
Xavier Pennec
titre
Multiple Registration and Mean Rigid Shape - Application to the 3D case
article
Mardia, K.V. and Gill, C.A. and I.L., Dryden. Image Fusion and Shape Variability Techniques (16th Leeds Annual Statistical Workshop), 1996, no address, United Kingdom. pp.178-185, 1996
identifiant
inria-00615762
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auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Quelques problèmes posés par la gestion des primitives géométriques en vision par ordinateur
article
Journées ORASIS, 1996, no address, France. pp.111-116, 1996
identifiant
inria-00615764
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auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Randomness and Geometric Features in Computer Vision
article
IEEE Conf. on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR'96), 1996, San Francisco, Cal, USA, United States. pp.484--491, 1996, 〈10.1109/CVPR.1996.517116〉
identifiant
inria-00615694
DOI
DOI : 10.1109/CVPR.1996.517116
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auteur
Jay West, Michael Fitzpatrick, Matthew Wang, Benoit Dawant, Calvin Maurer, Robert Kessler, Robert Maciunas, Christian Barillot, Didier Lemoine, Andre Collignon, Frederik Maes, Paul Suetens, Dirk Vandermeulen, Petra Van den Elsen, Paul Hemler, Sandy Napel, Thilaka Sumanaweera, Beth Harkness, Derek Hill, Colin Studholme, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Marylin Noz, Derald Maguire, Michael Pollack, Charles Pelizzari, Richard Robb, Dennis Hanson, Roger Woods
titre
Comparison and evaluation of retrospective intermodality image registration techniques
article
Medical Imaging 1996: Image Processing, Apr 1996, Newport Beach, California, USA, United States. 2710, 1996, SPIE proceedings series. 〈10.1117/12.237936〉
identifiant
inria-00615767
DOI
DOI : 10.1117/12.237936
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1995

auteur
Xavier Pennec, Jean-Philippe Thirion
titre
Validation of 3D Registration Methods based on Points and Frames
article
Proc. of the 5th Int. Conf on Comp. Vision (ICCV'95), 1995, Cambridge, Ma, United States. pp.557--562, 1995, 〈10.1109/ICCV.1995.466890〉
identifiant
inria-00615699
DOI
DOI : 10.1109/ICCV.1995.466890
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1994

auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
An ¸al O(n2) Algorithm for 3D Substructure Matching of Proteins
article
Califano, A. and Rigoutsos, I. and Wolson, H.J. Shape and Pattern Matching in Computational Biology -- Proc. First Int. Workshop, Seattle, Wash, June 20, 1994, 1994, Seattle, Wash, United States. Plenum Publishing, pp.25--40, 1994
identifiant
inria-00615736
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Book sections

2015

auteur
Xavier Pennec, Pierre Fillard
titre
Statistical Computing on Non-Linear Spaces for Computational Anatomy
article
Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research, Springer, pp.147-168, 2015, 978-0-387-09748-0. 〈10.1007/978-0-387-09749-7_8〉
identifiant
inria-00616201
DOI
DOI : 10.1007/978-0-387-09749-7_8
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https://hal.inria.fr/inria-00616201/file/ComputationalAnatomy.pdf BibTex

2014

auteur
Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre
Discrete Ladders for Parallel Transport in Transformation Groups with an Affine Connection Structure
article
Frank Nielsen. Geometric Theory of Information, Springer, pp.243-271, 2014, Signals and Communication Technology, 〈10.1007/978-3-319-05317-2_9〉
identifiant
hal-00933229
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-05317-2_9
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https://hal.inria.fr/hal-00933229/file/GSI-BookChapter.pdf BibTex

2013

auteur
Kristin Mcleod, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Giacomo Pongiglione, Xavier Pennec
titre
Statistical Shape Analysis of Surfaces in Medical Images Applied to the Tetralogy of Fallot Heart
article
Frederic Cazals and Pierre Kornprobst. Modeling in Computational Biology and Biomedicine, Springer, pp.165-191, 2013, Lectures Notes in Mathematical and Computational Biology, 978-3-642-31207-6. 〈10.1007/978-3-642-31208-3_5〉
identifiant
hal-00813850
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-31208-3_5
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https://hal.inria.fr/hal-00813850/file/McLeod_Pennec_CBB.pdf BibTex

2012

auteur
Xavier Pennec, Vincent Arsigny
titre
Exponential Barycenters of the Canonical Cartan Connection and Invariant Means on Lie Groups
article
Frederic Barbaresco and Amit Mishra and Frank Nielsen. Matrix Information Geometry, Springer, pp.123-168, 2012, 978-3-642-30231-2 (Print) / 978-3-642-30232-9 (Online). 〈10.1007/978-3-642-30232-9_7〉
identifiant
hal-00699361
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-30232-9_7
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https://hal.inria.fr/hal-00699361/file/Bi-Invar-Means.pdf BibTex

2009

auteur
Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
titre
Asclepios: a Research Project-Team at INRIA for the Analysis and Simulation of Biomedical Images
article
Bertot, Y. and Huet, G. and Lévy, J.-J. and Plotkin, G. From semantics to computer science: essays in honor of Gilles Kahn, Cambridge University Press, pp.415-436, 2009, 〈10.1017/CBO9780511770524.019〉
identifiant
inria-00616094
DOI
DOI : 10.1017/CBO9780511770524.019
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https://hal.inria.fr/inria-00616094/file/Colloquium-Gilles-Kahn-NA-2007-v5.pdf BibTex
auteur
Cecile Germain-Renaud, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Bertrand Delhay, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Joel Schaerer, Romain Texier
titre
Grid Analysis of Radiological Data
article
Mario Cannataro (Ed.). Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healthcare, IGI, pp.363-391, 2009, chapter 19, 〈10.4018/978-1-60566-374-6.ch019〉
identifiant
hal-00683992
DOI
DOI : 10.4018/978-1-60566-374-6.ch019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683992/file/germain-breton-etal-2009.pdf BibTex

2008

auteur
Ender Konukoglu, Xavier Pennec, Olivier Clatz, Nicholas Ayache
titre
Tumor Growth Modeling in Oncological Image Analysis
article
Bankman, I. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp.297--307, 2008, 13: 978-0-12-373904-9. 〈10.1016/B978-012373904-9.50027-1〉
identifiant
inria-00616081
DOI
DOI : 10.1016/B978-012373904-9.50027-1
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auteur
Xavier Pennec
titre
Statistical computing on manifolds: from Riemannian geometry to computational anatomy
article
Nielsen, Frank. Emerging Trends in Visual Computing, 5416, Springer, pp.347--386, 2008, LNCS, 978-3-642-00825-2. 〈10.1007/978-3-642-00826-9_16〉
identifiant
inria-00616104
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-00826-9_16
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https://hal.inria.fr/inria-00616104/file/Pennec_ETVC08.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Jean-Philippe Thirion
titre
Landmark-based registration using features identified through differential geometry
article
Bankman, I. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp.565--578, 2008, 13: 978-0-12-373904-9. 〈10.1016/B978-012373904-9.50044-1〉
identifiant
inria-00616082
DOI
DOI : 10.1016/B978-012373904-9.50044-1
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2005

auteur
Xavier Pennec, Alexis Roche, Pascal Cathier, Nicholas Ayache
titre
Non-Rigid MR/US Registration for Tracking Brain Deformations
article
Blum, R.S. and Liu, Zh. Multi-Sensor Image Fusion and Its Applications, 26, CRC Press - Taylor and Francis, pp.107--143, 2005, Signal Processing and Communications
identifiant
inria-00615672
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2004

auteur
Luc Soler, Nicholas Ayache, Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Clément Forest, Hervé Delingette, Didier Mutter, Jacques Marescaux
titre
Traitements d'images médicales pour la planification, la simulation et l'aide intra-opératoire des actes chirurgicaux
article
Faupel, M. and Smigielski, P. and Grzymala, R. Imagerie et Photonique pour les sciences du vivant et la médecine, Edition Fontis Media, pp.19-31, 2004, 2-88476-005-9
identifiant
inria-00615657
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2000

auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Jean-Philippe Thirion
titre
Landmark-based registration using features identified through differential geometry
article
Bankman, I. Handbook of Medical Imaging - Processing and Analysis. I., Academic Press, pp.499--513, 2000
identifiant
inria-00615106
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https://hal.inria.fr/inria-00615106/file/Pennec.HMIP.pdf BibTex

Directions of work or proceedings

2017

auteur
Jorge Cardoso, Tal Arbel, Enzo Ferrante, Xavier Pennec, Dalca Adrian V., Sarah Parisot, Sarang Joshi, Nematollah Batmanghelich, Aristeidis Sotiras, Mads Nielsen, Mert Sabuncu, Fletcher Tom, Li Shen, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
titre
Graphs in Biomedical Image Analysis, Computational Anatomy and Imaging Genetics First International Workshop, GRAIL 2017, 6th International Workshop, MFCA 2017, and Third International Workshop, MICGen 2017, Held in Conjunction with MICCAI 2017, Québec City, QC, Canada, September 10–14, 2017, Proceedings
article
France. 10551, 2017, Lecture Notes in Computer Science, 〈10.1007/978-3-319-67675-3〉
identifiant
hal-01597839
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-67675-3
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2015

auteur
Stanley Durrleman, Thomas P. Fletcher, Guido Gerig, Marc Niethammer, Xavier Pennec
titre
Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data
article
Durrleman, Stanley; Fletcher, Thomas P.; Gerig, Guido; Niethammer, Marc ; Pennec, Xavier STIA 2014 - Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Sep 2014, Cambridge, United States. 8682, Springer International Publishing, pp.89, 2015, Lecture notes in computer science, 978-3-319-14904-2. 〈10.1007/978-3-319-14905-9〉. 〈http://www.sci.utah.edu/stia2014-home.html〉
identifiant
hal-01114150
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-14905-9
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auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas P. Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
titre
Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015)
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Thomas P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015), Oct 2015, Munich, Germany. pp.173, 2015, 〈http://www-sop.inria.fr/asclepios/events/MFCA15/〉
identifiant
hal-01203812
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https://hal.inria.fr/hal-01203812/file/MFCA15_Proceedings.pdf BibTex

2013

auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
titre
Proceedings of the Fourth International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Biological Shape Variability Modeling (MFCA 2013), Nagoya, Japan
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Tom P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan. Inria, pp.132, 2013
identifiant
hal-00873631
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https://hal.inria.fr/hal-00873631/file/MFCA2013_Proceedings.pdf BibTex

2011

auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen
titre
Proceedings of the Third International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads. HAL, pp.200, 2011
identifiant
hal-00813806
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https://hal.inria.fr/hal-00813806/file/MFCA11_Proceedings.pdf BibTex

2008

auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi
titre
Proceedings of the Second International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'08) - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. MICCAI, Inria, Hal, pp.188, 2008
identifiant
hal-00846316
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https://hal.inria.fr/hal-00846316/file/MFCA08_Proceedings.pdf BibTex

2006

auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi
titre
Proceedings of the First International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'06) - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
article
Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. MICCAI - Inria, pp.187, 2006
identifiant
inria-00614989
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https://hal.inria.fr/inria-00614989/file/MFCA06.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

2006

auteur
Xavier Pennec
titre
Statistical Computing on Manifolds for Computational Anatomy
article
Computer Science [cs]. Université Nice Sophia Antipolis, 2006
identifiant
tel-00633163
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00633163/file/Pennec_HDR.pdf BibTex

Master thesis

1993

auteur
Xavier Pennec
titre
Traitement de l'erreur dans les méthodes de hachage géométrique et d'Alignement, une étude théorique
article
Imagerie médicale. 1993
identifiant
hal-00875950
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https://hal.inria.fr/hal-00875950/file/Pennec-DEA-report.pdf BibTex

Other publications

2013

auteur
Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen
titre
Mathematical Methods for Medical Imaging
article
Editorial of the special issue following the Mathematical Foundations of Computational Anatomy (M.. 2013, 〈10.1007/s11263-013-0650-z〉
identifiant
hal-00858908
DOI
DOI : 10.1007/s11263-013-0650-z
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2012

auteur
Xavier Pennec
titre
Proceedings of the MICCAI 2012 Workshops, Challenges and Tutorials
article
4080 pages. 2012
identifiant
hal-00813857
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BibTex

2010

auteur
I. L. Dryden, Xavier Pennec, Jean-Marc Peyrat
titre
Power Euclidean metrics for covariance matrices with application to diffusion tensor imaging
article
ArXiv e-prints. 2010
identifiant
hal-00813769
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https://arxiv.org/pdf/1009.3045 BibTex

2005

auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
An optimized workflow enactor for data-intensive grid applications
article
I3S laboratory Research Report (I3S/RR-2005-32-FR), Sophia Antipolis, France. 2005, pp.17
identifiant
hal-00691833
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00691833/file/RR-05.32-T.GLATARD.pdf BibTex

Patents

2015

auteur
Natasha Lepore, Fernando Ypes-Calderon, Yalin Wang, Paul Thompson, Xavier Pennec, Marvin D. Nelson, Caroline Brun, Wayne Tang
titre
Magnetic resonance imaging tool to detect clinical difference in brain anatomy
article
United States, Patent n° : WO/2015/017582, International Application PCT/US2014/048973. 2015
identifiant
hal-01203798
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2007

auteur
Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
titre
Robust Mosaicing Method with Correction of Motion Distorsions and Tissue Deformations for In Vivo Fibered Microscopy
article
United States, Patent n° : US Patent US20090041314. 2007
identifiant
hal-00875647
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2006

auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre
Dispositif perfectionné de traitement ou de production d'images de tenseurs
article
France, Patent n° : International application number PCT/FR2006/000774. 2006
identifiant
hal-00875686
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auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre
Device for processing raw images or tensor images
article
United States, Patent n° : US patent US 2008/0170802. 2006
identifiant
hal-00875690
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2003

auteur
Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Electronic device for automatic registration of images
article
United States, Patent n° : US patent No US 6,539,127 B1, Mars 25, 2003. 2003
identifiant
hal-00875677
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1999

auteur
Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Dispositif électronique de recalage automatique d'images
article
France, Patent n° : Brevet numéro No FR 98 09649. European extension EP0977148. 1999
identifiant
hal-00875674
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Poster communications

2016

auteur
Nina Miolane, Xavier Pennec, Susan Holmes
titre
Towards a unified bayesian geometric framework for template estimation in Computational Anatomy
article
International Society of Bayesian Analysis: World Meeting, Jun 2016, Cagliari, Italy. 〈https://bayesian.org/content/isba-2016-world-meeting〉
identifiant
hal-01396716
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01396716/file/MiolanePosterISBAv2.pdf BibTex

2014

auteur
Jan Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Tain-Yen Hsia, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
titre
A Statistical Shape Atlas of the Surgically Reconstructed Aortic Arch in Patients With Hypoplastic Left Heart Syndrome
article
7th World Congress of Biomechanics, Boston 2014, Jul 2014, Boston, United States. 2014, 〈https://esbiomech.org/newsletter/esbiomech-newsletter-autumn-2013/7th-world-congress-of-biomechanics-from-july-6-11-2014-boston-usa/〉
identifiant
hal-01205176
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2012

auteur
Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Bertrand Thirion, Pierre Fillard
titre
Joint T1 and brain fiber diffeomorphic registration using the demons
article
Organization for the Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
identifiant
hal-00828387
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00828387/file/ohbm2012.pdf BibTex

Reports

2014

auteur
Martin Bauer, Martins Bruveris, Philipp Harms, Boris Khesin, Stephen Marsland, Peter Michor, Klas Modin, Olaf Müller, Xavier Pennec, Stefan Sommer, François-Xavier Vialard
titre
Math in the Cabin - Shape Analysis Workshop in Bad Gastein
article
[Research Report] Brunel University London; University of Vienna. 2014
identifiant
hal-01076953
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01076953/file/report.pdf BibTex

2010

auteur
Xavier Pennec, Curzio Basso, Younes Boudjemline, Stanley Durrleman, Ender Konukoglu, Tommaso Mansi, Kristin Mcleod, Giacomo Pongiglione, Matteo Santoro, Maxime Sermesant, Bertrand Stos, Nicolas Toussaint, Gianluca Trocchio
titre
Third generation disease models: Image analysis tools, pediatric heart diseases, inflammatory diseases and brain tumors
article
[Technical Report] 2010
identifiant
hal-00813777
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2009

auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Guido Gerig, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
article
[Research Report] RR-6952, INRIA. 2009, 17 p
identifiant
inria-00408293
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https://hal.inria.fr/inria-00408293/file/RR-6952.pdf BibTex

2008

auteur
Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre
Sparse Approximation of Currents for Statistics on Curves and Surfaces
article
[Research Report] RR-6571, INRIA. 2008, pp.15
identifiant
inria-00286014
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https://hal.inria.fr/inria-00286014/file/RR-6571.pdf BibTex

2007

auteur
Pierre Fillard, Xavier Pennec, Paul Thompson, Nicholas Ayache
titre
Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
article
[Research Report] RR-6241, INRIA. 2007, pp.12
identifiant
inria-00159699
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00159699/file/RR-6241.pdf BibTex

2006

auteur
Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Affine Registration
article
[Research Report] RR-5865, INRIA. 2006, pp.46
identifiant
inria-00070161
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070161/file/RR-5865.pdf BibTex
auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Bi-invariant Means in Lie Groups. Application to Left-invariant Polyaffine Transformations
article
[Research Report] RR-5885, INRIA. 2006
identifiant
inria-00071383
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071383/file/RR-5885.pdf BibTex
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Kiralee M. Hayashi, Paul M. Thompson, Nicholas Ayache
titre
Measuring Brain Variability by Extrapolating Sparse Tensor Fields Measured on Sulcal Lines
article
[Research Report] RR-5887, INRIA. 2006
identifiant
inria-00071381
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071381/file/RR-5887.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
article
2006, pp.23
identifiant
hal-00691828
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00691828/file/RR-06.35-T.GLATARD.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec, David Emsellem, Diane Lingrand
titre
MOTEUR: a data-intensive service-based workflow manager
article
2006, pp.37
identifiant
hal-00691832
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00691832/file/RR-06.07-T.GLATARD.pdf BibTex
auteur
Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot Mcveigh, Nicholas Ayache
titre
Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Architecture
article
[Research Report] RR-5906, INRIA. 2006
identifiant
inria-00071359
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071359/file/RR-5906.pdf BibTex

2005

auteur
Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Fast and Simple Computations on Tensors with Log-Euclidean Metrics.
article
[Research Report] RR-5584, INRIA. 2005, pp.42
identifiant
inria-00070423
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070423/file/RR-5584.pdf BibTex
auteur
Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Joint Estimation and Smoothing of Clinical DT-MRI with a Log-Euclidean Metric
article
[Research Report] RR-5607, INRIA. 2005, pp.18
identifiant
inria-00070400
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070400/file/RR-5607.pdf BibTex

2004

auteur
Xavier Pennec
titre
Probabilities and Statistics on Riemannian Manifolds : A Geometric approach
article
RR-5093, INRIA. 2004
identifiant
inria-00071490
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071490/file/RR-5093.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre
A Riemannian Framework for Tensor Computing
article
RR-5255, INRIA. 2004, pp.34
identifiant
inria-00070743
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00070743/file/RR-5255.pdf BibTex

2003

auteur
Vincent Arsigny, Xavier Pennec
titre
A novel family of geometrical transformations: Polyrigid transformations. Application to the registration of histological slices
article
RR-4837, INRIA. 2003
identifiant
inria-00071748
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071748/file/RR-4837.pdf BibTex
auteur
Stephane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre
Validation of a New 3D/2D Registration Criterion including Error Prediction. Application to Image Guided Radio-Frequency Ablation of the Liver Tumors
article
[Research Report] RR-4993, INRIA. 2003
identifiant
inria-00071585
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00071585/file/RR-4993.pdf BibTex

2002

auteur
Sébastien Granger, Xavier Pennec
titre
Statistiques exactes et approchées sur les normales aléatoires
article
RR-4533, INRIA. 2002
identifiant
inria-00072055
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072055/file/RR-4533.pdf BibTex

2001

auteur
Sébastien Granger, Xavier Pennec, Alexis Roche
titre
Rigid Point-Surface Registration using Oriented Points and an EM Variant of ICP for Computer Guided Oral Implantology
article
RR-4169, INRIA. 2001
identifiant
inria-00072453
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072453/file/RR-4169.pdf BibTex
auteur
Sébastien Ourselin, Xavier Pennec, Radu Stefanescu, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache
titre
Robust Registration of Multi-Modal Medical Images: Towards Real-Time Clinical Applications
article
RR-4333, INRIA. 2001
identifiant
inria-00072254
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072254/file/RR-4333.pdf BibTex

2000

auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Pascal Cachier
titre
Tracking Brain Deformations in Time-Sequences of 3D US Images
article
[Research Report] RR-4091, INRIA. 2000
identifiant
inria-00072541
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072541/file/RR-4091.pdf BibTex
auteur
Alexis Roche, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Sébastien Ourselin
titre
Generalized Correlation Ratio for Rigid Registration of 3D Ultrasound with MR Images
article
[Research Report] RR-3980, INRIA. 2000, pp.24
identifiant
inria-00072667
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072667/file/RR-3980.pdf BibTex

1999

auteur
Pascal Cachier, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Fast Non Rigid Matching by Gradient Descent: Study and Improvements of the "Demons" Algorithm
article
RR-3706, INRIA. 1999
identifiant
inria-00072962
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00072962/file/RR-3706.pdf BibTex

1998

auteur
Sébastien Ourselin, Alexis Roche, Gérard Subsol, Xavier Pennec, Christophe Sattonnet
titre
Automatic Alignment of Histological Sections for 3D Reconstruction and Analysis
article
RR-3595, INRIA. 1998
identifiant
inria-00073084
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00073084/file/RR-3595.pdf BibTex
auteur
Xavier Pennec
titre
Computing the Mean of Geometric Features Application to the Mean Rotation
article
RR-3371, INRIA. 1998
identifiant
inria-00073318
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00073318/file/RR-3371.pdf BibTex
auteur
Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre
Multimodal Image Registration by Maximization of the Correlation Ratio
article
RR-3378, INRIA. 1998
identifiant
inria-00073311
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00073311/file/RR-3378.pdf BibTex

1996

auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
Randomness and Geometric Features in Computer Vision
article
RR-2820, INRIA. 1996
identifiant
inria-00073871
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00073871/file/RR-2820.pdf BibTex

1995

auteur
Xavier Pennec, Jean-Philippe Thirion
titre
Validation of 3-D Registration Methods based on Points and Frames
article
RR-2470, INRIA. 1995
identifiant
inria-00074205
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00074205/file/RR-2470.pdf BibTex

1994

auteur
Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre
An 0(n2) algorithm for 3D substructure matching of proteins
article
[Research Report] RR-2274, INRIA. 1994
identifiant
inria-00074397
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00074397/file/RR-2274.pdf BibTex

1993

auteur
Xavier Pennec
titre
Correctness and robustness of 3D rigid matching with bounded sensor error
article
RR-2111, INRIA. 1993
identifiant
inria-00074561
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00074561/file/RR-2111.pdf BibTex

Theses

1996

auteur
Xavier Pennec
titre
L'incertitude dans les problèmes de reconnaissance et de recalage -- Applications en imagerie médicale et biologie moléculaire
article
Informatique [cs]. Ecole Polytechnique X, 1996. Français
identifiant
tel-00633175
Accès au texte intégral et bibtex
https://pastel.archives-ouvertes.fr/tel-00633175/file/Pennec_PhD.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

2010

auteur
Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre
A probabilistic model to analyse workflow performance on production grids
article
2010
identifiant
hal-00481713
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00481713/file/glatard-montagnat-etal_2008b.pdf BibTex