Publications HAL de xavier,pennec

Journal articles

2024

auteur: Olivier Bisson, Xavier Pennec
titre: Differential of the Stretch Tensor for Any Dimension with Applications to Quotient Geodesics
article: Comptes Rendus. Mathématique, 2024, 362 (G12), pp.1847-1856. ⟨10.5802/crmath.692⟩
identifiant: hal-04831093
DOI: DOI : 10.5802/crmath.692
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auteur: Anna Calissano, Théodore Papadopoulo, Xavier Pennec, Samuel Deslauriers-Gauthier
titre: Graph Alignment Exploiting the Spatial Organization Improves the Similarity of Brain Networks
article: Human Brain Mapping, 2024, 45 (1), pp.e26554. ⟨10.1002/hbm.26554⟩
identifiant: hal-03910761
DOI: DOI : 10.1002/hbm.26554
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2023

auteur: Philipp Harms, Peter W. Michor, Xavier Pennec, Stefan Sommer
titre: Geometry of Sample Spaces
article: Differential Geometry and its Applications, 2023, 90, pp.102029. ⟨10.1016/j.difgeo.2023.102029⟩
identifiant: hal-02972385
DOI: DOI : 10.1016/j.difgeo.2023.102029
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: O(n)-invariant Riemannian metrics on SPD matrices
article: Linear Algebra and its Applications, 2023, 661, pp.163-201. ⟨10.1016/j.laa.2022.12.009⟩
identifiant: hal-03338601
DOI: DOI : 10.1016/j.laa.2022.12.009
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: Bures-Wasserstein minimizing geodesics between covariance matrices of different ranks
article: SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, 2023, 44 (3), pp.1447-1476. ⟨10.1137/22M149168X⟩
identifiant: hal-03647321
DOI: DOI : 10.1137/22M149168X
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2022

auteur: Nicolas Guigui, Xavier Pennec
titre: Numerical Accuracy of Ladder Schemes for Parallel Transport on Manifolds
article: Foundations of Computational Mathematics, 2022, 22, pp.757-790. ⟨10.1007/s10208-021-09515-x⟩
identifiant: hal-02894783
DOI: DOI : 10.1007/s10208-021-09515-x
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: The geometry of mixed-Euclidean metrics on symmetric positive definite matrices
article: Differential Geometry and its Applications, 2022, 81 (101867), ⟨10.1016/j.difgeo.2022.101867⟩
identifiant: hal-03414887
DOI: DOI : 10.1016/j.difgeo.2022.101867
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: Theoretically and computationally convenient geometries on full-rank correlation matrices
article: SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, 2022, 43 (4), pp.1851-1872. ⟨10.1137/22M1471729⟩
identifiant: hal-03527072
DOI: DOI : 10.1137/22M1471729
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2021

auteur: Shuman Jia, Hubert Nivet, Josquin Harrison, Xavier Pennec, Claudia Camaioni, Pierre Jaïs, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
titre: Left atrial shape is independent predictor of arrhythmia recurrence after catheter ablation for atrial fibrillation: A shape statistics study
article: Heart Rhythm O2, 2021, 2 (6), pp.622-632. ⟨10.1016/j.hroo.2021.10.013⟩
identifiant: hal-03650289
DOI: DOI : 10.1016/j.hroo.2021.10.013
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auteur: Talia M Nir, Jean-Paul Fouche, Jintanat Ananworanich, Beau M Ances, Jasmina Boban, Bruce J Brew, Joga R Chaganti, Linda Chang, Christopher R K Ching, Lucette A Cysique, Thomas Ernst, Joshua Faskowitz, Vikash Gupta, Jaroslaw Harezlak, Jodi M Heaps-Woodruff, Charles H Hinkin, Jacqueline Hoare, John A Joska, Kalpana J Kallianpur, Taylor Kuhn, Hei y Lam, Meng Law, Christine Lebrun-Frénay, Andrew J Levine, Lydiane Mondot, Beau K Nakamoto, Bradford A Navia, Xavier Pennec, Eric C Porges, Lauren E Salminen, Cecilia M Shikuma, Wesley Surento, April D Thames, Victor Valcour, Matteo Vassallo, Adam J Woods, Paul M Thompson, Ronald A Cohen, Robert Paul, Dan J Stein, Neda Jahanshad
titre: Association of Immunosuppression and Viral Load With Subcortical Brain Volume in an International Sample of People Living With HIV
article: JAMA Network Open, 2021, 4 (1), pp.e2031190. ⟨10.1001/jamanetworkopen.2020.31190⟩
identifiant: hal-03241929
DOI: DOI : 10.1001/jamanetworkopen.2020.31190
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2020

auteur: Nina Miolane, Nicolas Guigui, Alice Le Brigant, Johan Mathe, Benjamin Hou, Yann Thanwerdas, Stefan Heyder, Olivier Peltre, Niklas Koep, Hadi Zaatiti, Hatem Hajri, Yann Cabanes, Thomas Gerald, Paul Chauchat, Christian Shewmake, Daniel Brooks, Bernhard Kainz, Claire Donnat, Susan Holmes, Xavier Pennec
titre: Geomstats: A Python Package for Riemannian Geometry in Machine Learning
article: Journal of Machine Learning Research, 2020, 21 (223), pp.1-9
identifiant: hal-02536154
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auteur: Raphaël Sivera, Nicolas Capet, Valeria Manera, Roxane Fabre, Marco Lorenzi, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Philippe Robert
titre: Voxel-based assessments of treatment effects on longitudinal brain changes in the Multidomain Alzheimer Preventive Trial cohort
article: Neurobiology of Aging, 2020, 94, pp.50-59. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2019.11.020⟩
identifiant: hal-02166357
DOI: DOI : 10.1016/j.neurobiolaging.2019.11.020
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2019

auteur: Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
titre: Population-based priors in cardiac model personalisation for consistent parameter estimation in heterogeneous databases
article: International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2019, 35 (2), pp.e3158. ⟨10.1002/cnm.3158⟩
identifiant: hal-01922719
DOI: DOI : 10.1002/cnm.3158
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auteur: Raphaël Sivera, Hervé Delingette, Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: A model of brain morphological changes related to aging and Alzheimer's disease from cross-sectional assessments
article: NeuroImage, 2019, 198, pp.255-270. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.05.040⟩
identifiant: hal-01948174
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2019.05.040
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2018

auteur: Olivier Bernard, Alain Lalande, Clement Zotti, Frederic Cervenansky, Xin Yang, Pheng-Ann Heng, Irem Cetin, Karim Lekadir, Oscar Camara, Miguel Angel Gonzalez Ballester, Gerard Sanroma, Sandy Napel, Steffen Petersen, Georgios Tziritas, Elias Grinias, Mahendra Khened, Varghese Alex Kollerathu, Ganapathy Krishnamurthi, Marc-Michel Rohé, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Fabian Isensee, Paul Jager, Klaus H Maier-Hein, Peter M. Full, Ivo Wolf, Sandy Engelhardt, Chrisitan Baumgartner, Lisa Koch, Jelmer Wolterink, Ivana Isgum, Yeonggul Jang, Yoonmi Hong, Jay Patravali, Shubham Jain, Olivier Humbert, Pierre-Marc Jodoin
titre: Deep Learning Techniques for Automatic MRI Cardiac Multi-structures Segmentation and Diagnosis: Is the Problem Solved?
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2018, 37 (11), pp.2514-2525. ⟨10.1109/TMI.2018.2837502⟩
identifiant: hal-01803621
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2018.2837502
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auteur: Kristin Mcleod, Kristin Tøndel, Lilian Calvet, M Sermesant, Xavier Pennec
titre: Cardiac Motion Evolution Model for Analysis of Functional Changes Using Tensor Decomposition and Cross-Sectional Data
article: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2018, 65 (12), pp.2769 - 2780. ⟨10.1109/TBME.2018.2816519⟩
identifiant: hal-01736454
DOI: DOI : 10.1109/TBME.2018.2816519
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auteur: Nina Miolane, Susan Holmes, Xavier Pennec
titre: Topologically constrained template estimation via Morse-Smale complexes controls its statistical consistency
article: SIAM Journal on Applied Algebra and Geometry, 2018, 2 (2), pp.348-375. ⟨10.1137/17M1129222⟩
identifiant: hal-01655366
DOI: DOI : 10.1137/17M1129222
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auteur: Xavier Pennec
titre: Barycentric Subspace Analysis on Manifolds
article: Annals of Statistics, 2018, 46 (6A), pp.2711-2746. ⟨10.1214/17-AOS1636⟩
identifiant: hal-01343881
DOI: DOI : 10.1214/17-AOS1636
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auteur: Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Low-Dimensional Representation of Cardiac Motion Using Barycentric Subspaces: a New Group-Wise Paradigm for Estimation, Analysis, and Reconstruction
article: Medical Image Analysis, 2018, 45, pp.1-12. ⟨10.1016/j.media.2017.12.008⟩
identifiant: hal-01677685
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2017.12.008
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auteur: Avan A Suinesiaputra, Pierre A Ablin, Xènia A Albà, Martino Alessandrini, Jack A Allen, Wenjia Bai, Serkan Çimen, Peter Claes, Brett R Cowan, Jan d'Hooge, Nicolas Duchateau, Jan Ehrhardt, Alejandro F. Frangi, Ali A Gooya, Vicente Grau, Karim Lekadir, Allen A Lu, Anirban A Mukhopadhyay, Ilkay Oksuz, Nripesh Parajuli, Xavier Pennec, Marco Pereañez, Catarina Pinto, Paolo Piras, Marc-Michel Rohé, Daniel R Rueckert, Dennis Säring, Maxime Sermesant, Kaleem Siddiqi, Mahdi Tabassian, Luciano Teresi, Sotirios A Tsaftaris, Matthias Wilms, Alistair A Young, Xingyu Zhang, Pau Medrano-Gracia
titre: Statistical shape modeling of the left ventricle: myocardial infarct classification challenge
article: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2018, 22 (3), pp.503-515. ⟨10.1109/JBHI.2017.2652449⟩
identifiant: hal-01533805
DOI: DOI : 10.1109/JBHI.2017.2652449
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2017

auteur: Jan L. Bruse, Abbas Khushnood, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Tain-Yen Hsia, Silvia Schievano
titre: How successful is successful? Aortic arch shape after successful aortic coarctation repair correlates with left ventricular function
article: Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, 2017, 153 (2), pp.418 - 427. ⟨10.1016/j.jtcvs.2016.09.018⟩
identifiant: hal-01387297
DOI: DOI : 10.1016/j.jtcvs.2016.09.018
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auteur: Jan L. Bruse, Maria A. Zuluaga, Abbas Khushnood, Kristin Mcleod, Hopewell N. Ntsinjana, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
titre: Detecting clinically meaningful shape clusters in medical image data: metrics analysis for hierarchical clustering applied to healthy and pathological aortic arches
article: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2017, pp.1 - 13. ⟨10.1109/TBME.2017.2655364⟩
identifiant: hal-01421202
DOI: DOI : 10.1109/TBME.2017.2655364
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auteur: Jan L. Bruse, Elena Cervi, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano, Tain-Yen Hsia
titre: Looks Do Matter! Aortic Arch Shape After Hypoplastic Left Heart Syndrome Palliation Correlates With Cavopulmonary Outcomes
article: Annals of Thoracic Surgery, 2017, 103 (2), pp.645 - 654. ⟨10.1016/j.athoracsur.2016.06.041⟩
identifiant: hal-01880221
DOI: DOI : 10.1016/j.athoracsur.2016.06.041
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auteur: Loïc Devilliers, Stéphanie Allassonnière, Alain Trouvé, Xavier Pennec
titre: Template estimation in computational anatomy: Fréchet means in top and quotient spaces are not consistent
article: SIAM Journal on Imaging Sciences, 2017, 10 (3), pp.1139-1169. ⟨10.1137/16M1083931⟩
identifiant: hal-01352707
DOI: DOI : 10.1137/16M1083931
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auteur: Loïc Devilliers, Stéphanie Allassonnière, Alain Trouvé, Xavier Pennec
titre: Inconsistency of template estimation by minimizing of the variance/pre-variance in the quotient space
article: Entropy, 2017, 19 (6), pp.article 288. ⟨10.3390/e19060288⟩
identifiant: hal-01543616
DOI: DOI : 10.3390/e19060288
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auteur: Bishesh Khanal, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Simulating Longitudinal Brain MRIs with known Volume Changes and Realistic Variations in Image Intensity
article: Frontiers in Neuroscience, 2017, 11 (Article 132), pp.18. ⟨10.3389/fnins.2017.00132⟩
identifiant: hal-01348959
DOI: DOI : 10.3389/fnins.2017.00132
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auteur: Nina Miolane, Susan Holmes, Xavier Pennec
titre: Template Shape Estimation: Correcting an Asymptotic Bias
article: SIAM Journal on Imaging Sciences, 2017, 10 (2), pp.808 - 844. ⟨10.1137/16M1084493⟩
identifiant: hal-01350508
DOI: DOI : 10.1137/16M1084493
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auteur: Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Alan Garny, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
titre: Multifidelity-CMA: a multifidelity approach for efficient personalisation of 3D cardiac electromechanical models
article: Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, 2017, pp.1-16. ⟨10.1007/s10237-017-0960-0⟩
identifiant: hal-01656008
DOI: DOI : 10.1007/s10237-017-0960-0
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auteur: Naiara Rodriguez-Florez, Jan L. Bruse, Alessandro Borghi, Herman Vercruysse, Juling Ong, Greg James, Xavier Pennec, David J. Dunaway, Owase Jeelani, Silvia Schievano
titre: Statistical shape modelling to aid surgical planning: associations between surgical parameters and head shapes following spring-assisted cranioplasty
article: International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2017, pp.1-11. ⟨10.1007/s11548-017-1614-5⟩
identifiant: hal-01540631
DOI: DOI : 10.1007/s11548-017-1614-5
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2016

auteur: Jan L. Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Hopewell N. Ntsinjana, Claudio Capelli, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
titre: A statistical shape modelling framework to extract 3D shape biomarkers from medical imaging data: assessing arch morphology of repaired coarctation of the aorta
article: BMC Medical Imaging, 2016, 16 (1), ⟨10.1186/s12880-016-0142-z⟩
identifiant: hal-01335147
DOI: DOI : 10.1186/s12880-016-0142-z
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auteur: Jan Bruse, Hopewell Ntsinjana, Claudio Capelli, Giovanni Biglino, Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Tain-Yen Hsia, Silvia Schievano, Andrew Taylor
titre: CMR-based 3D statistical shape modelling reveals left ventricular morphological differences between healthy controls and arterial switch operation survivors
article: Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, 2016, 18 (S1), ⟨10.1186/1532-429X-18-S1-Q2⟩
identifiant: hal-03063907
DOI: DOI : 10.1186/1532-429X-18-S1-Q2
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auteur: Mehdi Hadj-Hamou, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Longitudinal Analysis of Image Time Series with Diffeomorphic Deformations: A Computational Framework Based on Stationary Velocity Fields
article: Frontiers in Neuroscience, 2016, 10 (236), pp.18. ⟨10.3389/fnins.2016.00236⟩
identifiant: hal-01329989
DOI: DOI : 10.3389/fnins.2016.00236
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auteur: Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: A biophysical model of brain deformation to simulate and analyze longitudinal MRIs of patients with Alzheimer's disease
article: NeuroImage, 2016, 134, pp.35-52. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.061⟩
identifiant: hal-01305755
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.03.061
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2015

auteur: David M. Cash, Chris Frost, Leonardo O. Iheme, Devrim Ünay, Melek Kandemir, Jurgen Fripp, Olivier Salvado, Pierrick Bourgeat, Martin Reuter, Bruce Fischl, Marco Lorenzi, Giovanni B. Frisoni, Xavier Pennec, Ronald K. Pierson, Jeffrey L. Gunter, Matthew L. Senjem, Clifford R. Jack, Nicolas Guizard, Vladimir S. Fonov, D. Louis Collins, Marc Modat, Jorge M. Cardoso, Kelvin K. Leung, Hongzhi Wang, Sandhitsu R. Das, Paul A. Yushkevich, Ian B. Malone, Nick C. Fox, Jonathan M. Schott, Sebastien Ourselin
titre: Assessing atrophy measurement techniques in dementia: Results from the MIRIAD atrophy challenge
article: NeuroImage, 2015, 123, pp.149-164. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.07.087⟩
identifiant: hal-01203573
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2015.07.087
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni, Nicholas Ayache
titre: Disentangling normal aging from Alzheimer's disease in structural magnetic resonance images
article: Neurobiology of Aging, 2015, 36, pp.S42-S52. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2014.07.046⟩
identifiant: hal-01061017
DOI: DOI : 10.1016/j.neurobiolaging.2014.07.046
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auteur: Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Regional flux analysis for discovering and quantifying anatomical changes: An application to the brain morphometry in Alzheimer's disease
article: NeuroImage, 2015, 115, pp.224-234. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.04.051⟩
identifiant: hal-01145728
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2015.04.051
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auteur: Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Philipp Beerbaum, Xavier Pennec
titre: Spatio-Temporal Tensor Decomposition of a Polyaffine Motion Model for a Better Analysis of Pathological Left Ventricular Dynamics
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2015, 34 (7), pp.1562--1675. ⟨10.1109/TMI.2015.2405579⟩
identifiant: hal-01205342
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2015.2405579
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auteur: Nina Miolane, Xavier Pennec
titre: Computing Bi-Invariant Pseudo-Metrics on Lie Groups for Consistent Statistics
article: Entropy, 2015, 17 (4), pp.1850-1881. ⟨10.3390/e17041850⟩
identifiant: hal-01133922
DOI: DOI : 10.3390/e17041850
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2014

auteur: Romain Guibert, Kristin Mcleod, Alfonso Caiazzo, Tommaso Mansi, Miguel Angel Fernández, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Irene Vignon-Clementel, Younes Boudjemline, Jean-Frédéric Gerbeau
titre: Group-wise Construction of Reduced Models for Understanding and Characterization of Pulmonary Blood Flows from Medical Images
article: Medical Image Analysis, 2014, 18 (1), pp.63-82. ⟨10.1016/j.media.2013.09.003⟩
identifiant: hal-00874545
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2013.09.003
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auteur: Herve Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
titre: Spectral Log-Demons: Diffeomorphic Image Registration with Very Large Deformations
article: International Journal of Computer Vision, 2014, 107 (3), pp.254-271. ⟨10.1007/s11263-013-0681-5⟩
identifiant: hal-00979616
DOI: DOI : 10.1007/s11263-013-0681-5
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2013

auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, José Braga, Guido Gerig, Nicholas Ayache
titre: Toward a Comprehensive Framework for the Spatiotemporal Statistical Analysis of Longitudinal Shape Data
article: International Journal of Computer Vision, 2013, 103 (1), pp.22-59. ⟨10.1007/s11263-012-0592-x⟩
identifiant: hal-00813825
DOI: DOI : 10.1007/s11263-012-0592-x
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auteur: Benedetta Leonardi, Andrew Taylor, Tommaso Mansi, Ingmar Voigt, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Younes Boudjemline, Giacomo Pongiglione
titre: Computational modelling of the right ventricle in repaired tetralogy of Fallot: can it provide insight into patient treatment?
article: European Heart Journal - Cardiovascular Imaging, 2013, 14 (4), pp.381-6. ⟨10.1093/ehjci/jes239⟩
identifiant: hal-00813831
DOI: DOI : 10.1093/ehjci/jes239
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre: Efficient Parallel Transport of Deformations in Time Series of Images: from Schild's to Pole Ladder
article: Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2013, 50 (1-2), pp.5-17. ⟨10.1007/s10851-013-0470-3⟩
identifiant: hal-00870489
DOI: DOI : 10.1007/s10851-013-0470-3
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre: Geodesics, Parallel Transport & One-parameter Subgroups for Diffeomorphic Image Registration
article: International Journal of Computer Vision, 2013, 105 (2), pp.111-127. ⟨10.1007/s11263-012-0598-4⟩
identifiant: hal-00813835
DOI: DOI : 10.1007/s11263-012-0598-4
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auteur: Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni, Xavier Pennec
titre: LCC-Demons: a robust and accurate symmetric diffeomorphic registration algorithm
article: NeuroImage, 2013, 81 (1), pp.470-483. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.04.114⟩
identifiant: hal-00819895
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2013.04.114
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auteur: Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen
titre: Mathematical Methods for Medical Imaging
article: International Journal of Computer Vision, 2013, 105 (2), pp.109-110. ⟨10.1007/s11263-013-0650-z⟩
identifiant: hal-00858908
DOI: DOI : 10.1007/s11263-013-0650-z
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auteur: Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre: Sparse Multi-Scale Diffeomorphic Registration: the Kernel Bundle Framework
article: Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2013, 46 (3), pp.292-308. ⟨10.1007/s10851-012-0409-0⟩
identifiant: hal-00813868
DOI: DOI : 10.1007/s10851-012-0409-0
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auteur: Stefan Sommer, Mads Nielsen, Sune Darkner, Xavier Pennec
titre: Higher-order momentum distributions and locally affine LDDMM registration
article: SIAM Journal on Imaging Sciences, 2013, 6 (1), pp.341-367. ⟨10.1137/110859002⟩
identifiant: hal-00813869
DOI: DOI : 10.1137/110859002
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auteur: Catalina Tobon-Gomez, Mathieu de Craene, Kristin Mcleod, Lennart Tautz, Wenzhe Shi, Anja Hennemuth, Adityo Prakosa, Hengui Wang, Gerald Carr-White, Sergio Kapetanakis, Albert Lutz, Vernon Rasche, Tobias Schaeffter, Constantin Butakoff, Oskar Friman, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Xiahai Zhuang, Sébastien Ourselin, Hans Otto Peitgen, Xavier Pennec, Reza Razavi, Daniel Rueckert, Alejandro F. Frangi, Kawal Rhode
titre: Benchmarking framework for myocardial tracking and deformation algorithms: an open access database
article: Medical Image Analysis, 2013, 17 (6), pp.632-648. ⟨10.1016/j.media.2013.03.008⟩
identifiant: hal-00855928
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2013.03.008
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auteur: Irina Vidal-Migallón, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Julien Dauguet, Tom Vercauteren
titre: GPU & CPU implementation of Young - Van Vliet's Recursive Gaussian Smoothing Filter
article: Insight Journal, 2013, pp.16
identifiant: inserm-00855958
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2012

auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
titre: Comparison of the endocranial ontogenies between chimpanzees and bonobos via temporal regression and spatiotemporal registration.
article: Journal of Human Evolution, 2012, 62 (1), pp.74-88. ⟨10.1016/j.jhevol.2011.10.004⟩
identifiant: hal-00816048
DOI: DOI : 10.1016/j.jhevol.2011.10.004
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auteur: Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes
titre: Capturing the Multiscale Anatomical Shape Variability with Polyaffine Transformation Trees
article: Medical Image Analysis, 2012, 16 (7), pp.1371-1384. ⟨10.1016/j.media.2012.05.011⟩
identifiant: hal-00813866
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2012.05.011
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2011

auteur: Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
titre: Vers un patient numérique personnalisé pour le diagnostic et la thérapie guidés par l'image [Towards a personalized digital patient for diagnosis and therapy guided by image].
article: Médecine/Sciences, 2011, 27 (2), pp.208-13. ⟨10.1051/medsci/2011272208⟩
identifiant: inria-00616192
DOI: DOI : 10.1051/medsci/2011272208
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auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, James C. Gee, Paul Thompson
titre: A nonconservative Lagrangian framework for statistical fluid registration-SAFIRA.
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (2), pp.184-202. ⟨10.1109/TMI.2010.2067451⟩
identifiant: inria-00616099
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2010.2067451
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auteur: Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: Registration, atlas estimation and variability analysis of white matter fiber bundles modeled as currents.
article: NeuroImage, 2011, 55 (3), pp.1073-90. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.11.056⟩
identifiant: hal-00816044
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2010.11.056
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auteur: Tommaso Mansi, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre: iLogDemons: A Demons-Based Registration Algorithm for Tracking Incompressible Elastic Biological Tissues
article: International Journal of Computer Vision, 2011, 92 (1), pp.92-111. ⟨10.1007/s11263-010-0405-z⟩
identifiant: inria-00616187
DOI: DOI : 10.1007/s11263-010-0405-z
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auteur: Tommaso Mansi, Ingmar Voigt, Benedetta Leonardi, Xavier Pennec, Stanley Durrleman, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Andrew Taylor, Younes Boudjemline, Giacomo Pongiglione, Nicholas Ayache
titre: A Statistical Model for Quantification and Prediction of Cardiac Remodelling: Application to Tetralogy of Fallot
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (9), pp.1605 - 1616. ⟨10.1109/TMI.2011.2135375⟩
identifiant: inria-00616185
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2011.2135375
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2009

auteur: Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Linear Registration
article: Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2009, 33 (2), pp.222-238. ⟨10.1007/s10851-008-0135-9⟩
identifiant: inria-00616084
DOI: DOI : 10.1007/s10851-008-0135-9
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auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Agatha Lee, Marina Barysheva, Sarah Madsen, Christina Avedissian, Yi-Yu Chou, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur W. Toga, Paul Thompson
titre: Mapping the regional influence of genetics on brain structure variability--a tensor-based morphometry study.
article: NeuroImage, 2009, 48 (1), pp.37-49. ⟨10.1016/j.neuroimage.2009.05.022⟩
identifiant: inria-00616089
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2009.05.022
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: Statistical models of sets of curves and surfaces based on currents.
article: Medical Image Analysis, 2009, 13 (5), pp.793-808. ⟨10.1016/j.media.2009.07.007⟩
identifiant: hal-00816051
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2009.07.007
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auteur: Heike Hufnagel, Jan Ehrhardt, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre: Computation of a probabilistic statistical shape model in a maximum-a-posteriori framework.
article: IMIA Yearbook of Medical Informatics, 2009, 48 (4), pp.314-9. ⟨10.3414/ME9228⟩
identifiant: inria-00616088
DOI: DOI : 10.3414/ME9228
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auteur: Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, X. Buy, A. Gangi, Nicholas Ayache, Jacques Marescaux
titre: An augmented reality system for liver thermal ablation: design and evaluation on clinical cases.
article: Medical Image Analysis, 2009, 13 (3), pp.494-506. ⟨10.1016/j.media.2009.02.003⟩
identifiant: inria-00616105
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2009.02.003
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auteur: Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre: Diffeomorphic demons: Efficient non-parametric image registration.
article: NeuroImage, 2009, 45 (1), Supplement 1, Pages S61-S72. ⟨10.1016/j.neuroimage.2008.10.040⟩
identifiant: inserm-00349600
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2008.10.040
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auteur: B T Thomas Yeo, Tom Vercauteren, Pierre Fillard, Jean-Marc Peyrat, Xavier Pennec, Polina Golland, Nicholas Ayache, Olivier Clatz
titre: DT-REFinD: diffusion tensor registration with exact finite-strain differential.
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2009, 28 (12), pp.1914-28. ⟨10.1109/TMI.2009.2025654⟩
identifiant: inria-00502720
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2009.2025654
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2008

auteur: Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
titre: Geometric Variability of the Scoliotic Spine using Statistics on Articulated Shape Models
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2008, 27 (4), pp.557--568. ⟨10.1109/TMI.2007.911474⟩
identifiant: inria-00616070
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2007.911474
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auteur: Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
titre: Principal Deformations Modes of Articulated Models for the Analysis of 3D Spine Deformities
article: Electronic Letters on Computer Vision and Image Analysis, 2008, 7 (4), pp.13--31. ⟨10.5565/rev/elcvia.165⟩
identifiant: inria-00616067
DOI: DOI : 10.5565/rev/elcvia.165
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auteur: Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Nicholas Ayache
titre: Articulated Spine Models for 3D Reconstruction from Partial Radiographic Data
article: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2008, 55 (11), pp.2565--2574. ⟨10.1109/TBME.2008.2001125⟩
identifiant: inria-00616069
DOI: DOI : 10.1109/TBME.2008.2001125
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Paul Thompson, Nicholas Ayache
titre: Inferring brain variability from diffeomorphic deformations of currents: an integrative approach.
article: Medical Image Analysis, 2008, 12 (5), pp.626-37. ⟨10.1016/j.media.2008.06.010⟩
identifiant: hal-00816052
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2008.06.010
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Diane Lingrand, Xavier Pennec
titre: Flexible and efficient workflow deployement of data-intensive applications on grids with MOTEUR
article: International Journal of High Performance Computing Applications, 2008, 22 (3), pp.347-360. ⟨10.1177/1094342008096067⟩
identifiant: hal-00459130
DOI: DOI : 10.1177/1094342008096067
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auteur: Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre: Generation of a Statistical Shape Model with Probabilistic Point Correspondences and EM-ICP
article: International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2008, 2 (5), pp.265--273. ⟨10.1007/s11548-007-0138-9⟩
identifiant: inria-00616073
DOI: DOI : 10.1007/s11548-007-0138-9
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auteur: Johan Montagnat, Tristan Glatard, Isabel Campos Plasencia, Francisco Castejon, Xavier Pennec, Giuliano Taffoni, Vladimir Voznesensky, Claudio Vuerli
titre: Workflow-based data parallel applications on the EGEE production grid infrastructure
article: Journal of Grid Computing, 2008, 6 (8), pp.369-383. ⟨10.1007/s10723-008-9108-x⟩
identifiant: hal-00683983
DOI: DOI : 10.1007/s10723-008-9108-x
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2007

auteur: Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Geometric Means in a Novel Vector Space Structure on Symmetric Positive-Definite Matrices
article: SIAM Journal on Matrix Analysis and Applications, 2007, 29 (1), pp.328--347. ⟨10.1137/050637996⟩
identifiant: inria-00616031
DOI: DOI : 10.1137/050637996
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auteur: Pierre Fillard, Xavier Pennec, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache
titre: Clinical DT-MRI estimation, smoothing, and fiber tracking with log-Euclidean metrics.
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2007, 26 (11), pp.1472-82. ⟨10.1109/TMI.2007.899173⟩
identifiant: inria-00502645
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2007.899173
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auteur: Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Kiralee M Hayashi, Paul M Thompson, Nicholas Ayache
titre: Measuring brain variability by extrapolating sparse tensor fields measured on sulcal lines.
article: NeuroImage, 2007, 34 (2), pp.639-50. ⟨10.1016/j.neuroimage.2006.09.027⟩
identifiant: inria-00502521
DOI: DOI : 10.1016/j.neuroimage.2006.09.027
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auteur: Xavier Pennec
titre: From Riemannian Geometry to Computational Anatomy of the Brain
article: ERCIM News, 2007, 69, Special issue on the Digital Patient, p.15-16
identifiant: hal-03991386
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auteur: Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Chenyang Xu, Elliot R. Mcveigh, Nicholas Ayache
titre: A Computational Framework for the Statistical Analysis of Cardiac Diffusion Tensors: Application to a Small Database of Canine Hearts
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2007, 26 (11), pp.1500-1514. ⟨10.1109/TMI.2007.907286⟩
identifiant: inria-00616023
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2007.907286
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2006

auteur: Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Log-Euclidean metrics for fast and simple calculus on diffusion tensors.
article: Magnetic Resonance in Medicine, 2006, 56 (2), pp.411-21. ⟨10.1002/mrm.20965⟩
identifiant: inria-00502678
DOI: DOI : 10.1002/mrm.20965
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auteur: Hervé Delingette, Xavier Pennec, Luc Soler, Jacques Marescaux, Nicholas Ayache
titre: Computational Models for Image Guided, Robot-Assisted and Simulated Medical Interventions
article: Proceedings of the IEEE, 2006, 94 (9), pp.1678- 1688. ⟨10.1109/JPROC.2006.880718⟩
identifiant: inria-00615001
DOI: DOI : 10.1109/JPROC.2006.880718
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auteur: Xavier Pennec
titre: Intrinsic Statistics on Riemannian Manifolds: Basic Tools for Geometric Measurements
article: Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2006, 25 (1), pp.127-154. ⟨10.1007/s10851-006-6228-4⟩
identifiant: inria-00614994
DOI: DOI : 10.1007/s10851-006-6228-4
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auteur: Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre: A Riemannian Framework for Tensor Computing
article: International Journal of Computer Vision, 2006, 66 (1), pp.41--66. ⟨10.1007/s11263-005-3222-z⟩
identifiant: inria-00614990
DOI: DOI : 10.1007/s11263-005-3222-z
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auteur: Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Robust Mosaicing with Correction of Motion Distortions and Tissue Deformation for In Vivo Fibered Microscopy
article: Medical Image Analysis, 2006, 10 (5), pp.673--692. ⟨10.1016/j.media.2006.06.006⟩
identifiant: inria-00163961
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2006.06.006
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2005

auteur: Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Polyrigid and Polyaffine Transformations: a Novel Geometrical Tool to Deal with Non-Rigid Deformations - Application to the registration of histological slices
article: Medical Image Analysis, 2005, 9 (6), pp.507-523. ⟨10.1016/j.media.2005.04.001⟩
identifiant: inria-00615665
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2005.04.001
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auteur: Vincent Breton, Kevin Dean, Tony Solomonides, Ignacio Blanquer, V. Hernandez, Enzo Medico, N. Maglaveras, Siegfried Benkner, Guy Lonsdale, Sharon Lloyd, K Hassan, Richard Mcclatchey, S. Miguet, Johan Montagnat, Xavier Pennec, W. de Neve, C. de Wagter, Germaine Heeren, Lydia Maigne, K Nozaki, M Taillet, H Bilofsky, R Ziegler, M Hoffman, C Jones, Mario Cannataro, P. Veltri, G. Aloisio, S Fiore, M. Mirto, I Chouvarda, V Koutkias, Andigoni Malousi, V Lopez, I Oliveira, Jean-Philippe Sanchez, F. Martin-Sanchez, G de Moor, Brecht Claerhout, Jean Herveg
titre: The Healthgrid White Paper.
article: Studies in Health Technology and Informatics, 2005, 112, pp.249-321
identifiant: hal-03010736
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auteur: Cécile Germain-Renaud, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Charles Loomis, Isabelle Magnin, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Romain Texier
titre: Grid-enabling medical image analysis
article: International Journal of Clinical Monitoring and Computing, 2005, 19 (4-5), pp.339-349. ⟨10.1007/s10877-005-0679-9⟩
identifiant: inria-00174284
DOI: DOI : 10.1007/s10877-005-0679-9
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auteur: Stéphane Nicolau, Alain Garcia, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: An augmented reality system to guide radio-frequency tumor ablation
article: Computer Animation and Virtual Worlds, 2005, 16 (1), pp.1--10. ⟨10.1002/cav.52⟩
identifiant: inria-00615660
DOI: DOI : 10.1002/cav.52
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auteur: Xavier Pennec
titre: Recaler pour mieux soigner
article: Pour la science, 2005, 338, pp.126--131
identifiant: inria-00615670
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auteur: Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: A Grid Service for the Interactive Use of a Parallel Non-Rigid Registration Algorithm
article: Methods of Information in Medicine, 2005, 44 (2), pp.239-43. ⟨10.1055/s-0038-1633954⟩
identifiant: inria-00615978
DOI: DOI : 10.1055/s-0038-1633954
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2004

auteur: Miguel Ángel González Ballester, Xavier Pennec, Marius George Linguraru, Nicholas Ayache
titre: Generalized Image Models and Their Application as Statistical Models of Images
article: Medical Image Analysis, 2004, 8 (3), pp.361--369. ⟨10.1016/j.media.2004.06.012⟩
identifiant: inria-00615648
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2004.06.012
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auteur: Luc Soler, Nicholas Ayache, Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Clément Forest, Hervé Delingette, Jacques Marescaux
titre: Traitement d'images médicales pour la planification, la simulation et l'aide intra-opératoire des actes chirurgicaux
article: La Revue de l'électricité et de l'électronique, 2004, pp.64--71
identifiant: inria-00615647
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auteur: Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Grid Powered Nonlinear Image Registration with Locally Adaptive Regularization
article: Medical Image Analysis, 2004, 8 (3), pp.325--342. ⟨10.1016/j.media.2004.06.010⟩
identifiant: inria-00615649
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2004.06.010
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auteur: Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Grid-Enabled Non-Rigid Registration of Medical Images
article: Parallel Processing Letters, 2004, 14 (2), pp.197--216. ⟨10.1142/S0129626404001830⟩
identifiant: inria-00615653
DOI: DOI : 10.1142/S0129626404001830
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2003

auteur: Pascal Cachier, Eric Bardinet, Didier Dormont, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Iconic Feature Based Nonrigid Registration: The PASHA Algorithm
article: Computer Vision and Image Understanding, 2003, 89 (2-3), pp.272--298. ⟨10.1016/S1077-3142(03)00002-X⟩
identifiant: inria-00615633
DOI: DOI : 10.1016/S1077-3142(03)00002-X
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auteur: Xavier Pennec, Pascal Cachier, Nicholas Ayache
titre: Tracking Brain Deformations in Time-Sequences of 3D US Images
article: Pattern Recognition Letters, 2003, 24 (4-5), pp.801--813. ⟨10.1016/S0167-8655(02)00183-6⟩
identifiant: inria-00615022
DOI: DOI : 10.1016/S0167-8655(02)00183-6
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auteur: Maxime Sermesant, Clément Forest, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre: Deformable biomechanical models: Application to 4D cardiac image analysis
article: Medical Image Analysis, 2003, 7 (4), pp.475--488. ⟨10.1016/S1361-8415(03)00068-9⟩
identifiant: inria-00615637
DOI: DOI : 10.1016/S1361-8415(03)00068-9
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2002

auteur: Pierre Jannin, J Michael Fitzpatrick, David J. Hawkes, Xavier Pennec, Ramin Shahidi, Michael W. Vannier
titre: Validation of medical image processing in image-guided therapy.
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2002, 21 (12), pp.1445-9. ⟨10.1109/TMI.2002.806568⟩
identifiant: inserm-00331766
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2002.806568
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2001

auteur: Sébastien Ourselin, Alexis Roche, Gérard Subsol, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Reconstructing a 3D structure from serial histological sections
article: Image and Vision Computing, 2001, 19, pp.25-31. ⟨10.1016/S0262-8856(00)00052-4⟩
identifiant: cea-00333669
DOI: DOI : 10.1016/S0262-8856(00)00052-4
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auteur: Alexis Roche, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache
titre: Rigid registration of 3-D ultrasound with MR images: a new approach combining intensity and gradient information.
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2001, 20 (10), pp.1038-49. ⟨10.1109/42.959301⟩
identifiant: cea-00333699
DOI: DOI : 10.1109/42.959301
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1998

auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: A geometric algorithm to find small but highly similar 3D substructures in proteins
article: Bioinformatics, 1998, 14 (6), pp.516--522. ⟨10.1093/bioinformatics/14.6.516⟩
identifiant: inria-00615080
DOI: DOI : 10.1093/bioinformatics/14.6.516
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auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Uniform distribution, distance and expectation problems for geometric features processing
article: Journal of Mathematical Imaging and Vision, 1998, 9 (1), pp.49--67. ⟨10.1023/A:1008270110193⟩
identifiant: inria-00615085
DOI: DOI : 10.1023/A:1008270110193
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auteur: Xavier Pennec
titre: Toward a generic framework for recognition based on uncertain geometric features
article: Videre: Journal of Computer Vision Research, 1998, 1 (2), pp.58--87
identifiant: inria-00615090
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1997

auteur: André Guéziec, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Medical Image Registration using Geometric Hashing
article: IEEE Computational Science and Engineering, 1997, 4 (4), pp.29-41. ⟨10.1109/99.641607⟩
identifiant: inria-00615068
DOI: DOI : 10.1109/99.641607
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auteur: Xavier Pennec, Jean-Philippe Thirion
titre: A Framework for Uncertainty and Validation of 3D Registration Methods based on Points and Frames
article: International Journal of Computer Vision, 1997, 25 (3), pp.203-229. ⟨10.1023/A:1007976002485⟩
identifiant: inria-00615070
DOI: DOI : 10.1023/A:1007976002485
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auteur: J. West, J.M. Fitzpatrick, M.Y. Wang, B.M. Dawant, C.R. Maurer, R.M. Kessler, R.J. Maciunas, Christian Barillot, Didier Lemoine, A. Collignon, F. Maes, P. Suetens, D. Vandermeulen, P.A. van den Elsen, S. Napel, T.S. Sumanaweera, B. Harkness, P.F. Hemler, Derek Hill, David J. Hawkes, C. Studholme, J.B.A. Maintz, M.A. Viergever, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, M.E. Noz, G.Q. Maguire, M. Pollack, C.A. Pelizzari, R.A. Robb, D. Hanson, R.P. Woods
titre: Comparison and evaluation of retrospective intermodality brain image registration techniques
article: Journal of Computer Assisted Tomography, 1997, 21 (4), pp.554-566
identifiant: inria-00615072
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Conference papers

2023

auteur: Morten Akhøj, Xavier Pennec, Stefan Sommer
titre: Tangent phylogenetic PCA
article: Scandinavian Conference on Image Analysis 2023, Apr 2023, Levi Ski Resort (Lapland), Finland. pp.77-90, ⟨10.1007/978-3-031-31438-4_6⟩
identifiant: hal-03842847
DOI: DOI : 10.1007/978-3-031-31438-4_6
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auteur: Anna Calissano, Elodie Maignant, Xavier Pennec
titre: Towards Quotient Barycentric Subspaces
article: GSI 2023: Geometric Science of Information, Aug 2023, Saint-Malo (France), France. pp.366-374, ⟨10.1007/978-3-031-38271-0_36⟩
identifiant: hal-04162647
DOI: DOI : 10.1007/978-3-031-38271-0_36
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auteur: Elodie Maignant, Alain Trouvé, Xavier Pennec
titre: Riemannian Locally Linear Embedding with Application to Kendall Shape Spaces
article: GSI 2023: Geometric Science of Information, Aug 2023, Saint-Malo, (France), France. pp.12-20, ⟨10.1007/978-3-031-38271-0_2⟩
identifiant: hal-04122754
DOI: DOI : 10.1007/978-3-031-38271-0_2
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auteur: Tom Szwagier, Xavier Pennec
titre: Rethinking the Riemannian Logarithm on Flag Manifolds as an Orthogonal Alignment Problem
article: GSI 2023: Geometric Science of Information, Aug 2023, Saint-Malo, (France), France. pp.375-383, ⟨10.1007/978-3-031-38271-0_37⟩
identifiant: hal-04100534
DOI: DOI : 10.1007/978-3-031-38271-0_37
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: Characterization of Invariant Inner Products
article: GSI 2023 - International Conference on Geometric Science of Information, Aug 2023, Saint Malo, France, France. pp.384-391, ⟨10.1007/978-3-031-38271-0_38⟩
identifiant: hal-04229093
DOI: DOI : 10.1007/978-3-031-38271-0_38
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2021

auteur: Nicolas Guigui, Elodie Maignant, Alain Trouvé, Xavier Pennec
titre: Parallel Transport on Kendall Shape Spaces
article: GSI 2021 - 5th conference on Geometric Science of Information, Jul 2021, Paris, France. pp.103-110, ⟨10.1007/978-3-030-80209-7_12⟩
identifiant: hal-03160677
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-80209-7_12
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auteur: Nicolas Guigui, Pamela Moceri, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Cardiac Motion Modeling with Parallel Transport and Shape Splines
article: ISBI 2021 - 18th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice, France. pp. 1394-1397, ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9433887⟩
identifiant: hal-03142196
DOI: DOI : 10.1109/ISBI48211.2021.9433887
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auteur: Nicolas Guigui, Xavier Pennec
titre: A reduced parallel transport equation on Lie Groups with a left-invariant metric
article: GSI 2021 - 5th conference on Geometric Science of Information, Jul 2021, Paris, France. pp.119-126, ⟨10.1007/978-3-030-80209-7_14⟩
identifiant: hal-03154318
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-80209-7_14
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auteur: Florent Jousse, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Matilde Gonzalez
titre: Geodesic squared exponential kernel for non-rigid shape registration
article: FG 2021 - IEEE International Conference on Automatic Face and Gesture Recognition, Dec 2021, JODHPUR, India. ⟨10.1109/FG52635.2021.9666997⟩
identifiant: hal-03500440
DOI: DOI : 10.1109/FG52635.2021.9666997
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: Geodesics and Curvature of the Quotient-Affine Metrics on Full-Rank Correlation Matrices
article: GSI 2021 - 5th conference on Geometric Science of Information, Jul 2021, Paris, France. pp.93-102, ⟨10.1007/978-3-030-80209-7_11⟩
identifiant: hal-03157992
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-80209-7_11
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2020

auteur: Nina Miolane, Nicolas Guigui, Hadi Zaatiti, Christian Shewmake, Hatem Hajri, Daniel Brooks, Alice Le Brigant, Johan Mathe, Benjamin Hou, Yann Thanwerdas, Stefan Heyder, Olivier Peltre, Niklas Koep, Yann Cabanes, Thomas Gerald, Paul Chauchat, Bernhard Kainz, Claire Donnat, Susan Holmes, Xavier Pennec
titre: Introduction to Geometric Learning in Python with Geomstats
article: SciPy 2020 - 19th Python in Science Conference, Jul 2020, Austin, Texas, United States. pp.48-57, ⟨10.25080/Majora-342d178e-007⟩
identifiant: hal-02908006
DOI: DOI : 10.25080/Majora-342d178e-007
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2019

auteur: Nicolas Guigui, Shuman Jia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Symmetric Algorithmic Components for Shape Analysis with Diffeomorphisms
article: GSI 2019 - 4th conference on Geometric Science of Information, F. Nielsen and F. Barbaresco, Aug 2019, Toulouse, France. pp.759--768, ⟨10.1007/978-3-030-26980-7_79⟩
identifiant: hal-02148832
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-26980-7_79
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: Is affine invariance well defined on SPD matrices? A principled continuum of metrics
article: GSI 2019 - 4th conference on Geometric Science of Information, Aug 2019, Toulouse, France. pp.502-510, ⟨10.1007/978-3-030-26980-7_52⟩
identifiant: hal-02147020
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-26980-7_52
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auteur: Yann Thanwerdas, Xavier Pennec
titre: Exploration of Balanced Metrics on Symmetric Positive Definite Matrices
article: GSI 2019 - 4th conference on Geometric Science of Information, Aug 2019, Toulouse, France. pp.484--493, ⟨10.1007/978-3-030-26980-7_50⟩
identifiant: hal-02158525
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-26980-7_50
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2018

auteur: Shuman Jia, Antoine Despinasse, Zihao Wang, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Pierre Jaïs, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
titre: Automatically Segmenting the Left Atrium from Cardiac Images Using Successive 3D U-Nets and a Contour Loss
article: STACOM: Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. Atrial Segmentation and LV Quantification Challenges, Sep 2018, Granada, Spain. pp.221-229, ⟨10.1007/978-3-030-12029-0_24⟩
identifiant: hal-01860285
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-12029-0_24
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auteur: Shuman Jia, Nicolas Duchateau, Pamela Moceri, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Parallel Transport of Surface Deformations from Pole Ladder to Symmetrical Extension
article: Shape in Medical Imaging. ShapeMI 2018., Sep 2018, Granada, Spain. pp.116-124, ⟨10.1007/978-3-030-04747-4_11⟩
identifiant: hal-01860274
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-04747-4_11
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2017

auteur: Loïc Devilliers, Xavier Pennec, Stéphanie Allassonnière
titre: Inconsistency of Template Estimation with the Fréchet mean in Quotient Space
article: Information Processing in Medical Imaging. IPMI 2017., Martin Styner; Marc Niethammer; Dinggang Shen; Stephen Aylward; Ipek Oguz; Hongtu Zhu, Jun 2017, Boone, United States. pp.16-27, ⟨10.1007/978-3-319-59050-9_2⟩
identifiant: hal-01481074
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-59050-9_2
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auteur: Shuman Jia, Claudia Camaioni, Marc-Michel Rohé, Pierre Jaïs, Xavier Pennec, Hubert Cochet, Maxime Sermesant
titre: Prediction of Post-Ablation Outcome in Atrial Fibrillation Using Shape Parameterization and Partial Least Squares Regression
article: FIMH 2017 - International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.314 - 321, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_30⟩
identifiant: hal-01574831
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-59448-4_30
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auteur: Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Improving Understanding of Long-Term Cardiac Functional Remodelling via Cross-Sectional Analysis of Polyaffine Motion Parameters
article: FIMH 2017 - 9th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.51 - 59, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_6⟩
identifiant: hal-01574837
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-59448-4_6
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auteur: Roch Molléro, Hervé Delingette, Manasi Datar, Tobias Heimann, Jakob Hauser, Dilveer Panesar, Alexander Jones, Andrew Taylor, Marcus Kelm, Titus Kuehne, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
titre: Longitudinal Analysis using Personalised 3D Cardiac Models with Population-Based Priors: Application to Paediatric Cardiomyopathies
article: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2017, Québec City, Canada. pp.350-358, ⟨10.1007/978-3-319-66185-8_40⟩
identifiant: hal-01569735
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-66185-8_40
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auteur: Roch Molléro, Jakob Hauser, Xavier Pennec, Manasi Datar, Hervé Delingette, Alexander Jones, Nicholas Ayache, Tobias Heimann, Maxime Sermesant
titre: Longitudinal Parameter Estimation in 3D Electromechanical Models: Application to Cardiovascular Changes in Digestion
article: FIMH 2017 - 9th international conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.432-440, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_41⟩
identifiant: hal-01522598
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-59448-4_41
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auteur: Xavier Pennec
titre: Sample-limited L p Barycentric Subspace Analysis on Constant Curvature Spaces
article: Geometric Sciences of Information (GSI 2017), Nov 2017, Paris, France. pp.20-28, ⟨10.1007/978-3-319-68445-1_3⟩
identifiant: hal-01574895
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-68445-1_3
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auteur: Marc-Michel Rohé, Manasi Datar, Tobias Heimann, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: SVF-Net: Learning Deformable Image Registration Using Shape Matching
article: MICCAI 2017 - the 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada. pp.266-274, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_31⟩
identifiant: hal-01557417
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_31
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auteur: Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Automatic Multi-Atlas Segmentation of Myocardium with SVF-Net
article: STACOM: Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. ACDC and MMWHS Challenges, Sep 2017, Québec, Canada. pp.170-177, ⟨10.1007/978-3-319-75541-0_18⟩
identifiant: hal-01575297
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-75541-0_18
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2016

auteur: Jan L. Bruse, Kristin Mcleod, Elena Cervi, Giovanni Biglino, T.-y Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano
titre: Discovering clusters in pathologic cardiac morphology: MR-based hierarchical 3D shape clustering of surgically repaired aortic arches
article: Computer Assisted Radiology, 30th International Congress and Exhibition, Jun 2016, Heidelberg, Germany
identifiant: hal-01519862
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auteur: Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
titre: A Multiscale Cardiac Model for Fast Personalisation and Exploitation
article: MICCAI 2016 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2016, Athens, Greece. pp.174-182, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_21⟩
identifiant: hal-01360908
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_21
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auteur: Marc-Michel Rohé, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Barycentric Subspace Analysis: a new Symmetric Group-wise Paradigm for Cardiac Motion Tracking
article: MICCAI 2016 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2016, Athens, Greece. pp.300-307, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_35⟩
identifiant: hal-01373706
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_35
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auteur: Marc-Michel Rohé, Roch Molléro, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Highly Reduced Model of the Cardiac Function for Fast Simulation
article: IEEE - IVMSP Workshop 2016, Jul 2016, Bordeaux, France. pp.5, ⟨10.1109/IVMSPW.2016.7528214⟩
identifiant: hal-01373715
DOI: DOI : 10.1109/IVMSPW.2016.7528214
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2015

auteur: Stéphanie Allassonnière, Loïc Devilliers, Xavier Pennec
titre: Estimating the Template in the Total Space with the Fréchet Mean on Quotient Spaces may have a Bias: a Case Study on Vector Spaces Quotiented by the Group of Translations
article: Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.131-142
identifiant: hal-01203816
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auteur: Jan L. Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Hopewell N. Ntsinjana, Claudio Capelli, Tain-Yen Hsia, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Andrew Taylor, Silvia Schievano
titre: A Non-parametric Statistical Shape Model for Assessment of the Surgically Repaired Aortic Arch in Coarctation of the Aorta: How Normal is Abnormal?
article: Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM 2015), Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-28712-6_3⟩
identifiant: hal-01205515
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-28712-6_3
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auteur: Vikash Gupta, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: A framework for creating population specific multimodal brain atlas using clinical T1 and diffusion tensor images
article: MICCAI 2015 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.99-108, ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_9⟩
identifiant: hal-01261115
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-28588-7_9
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auteur: Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Simulating Patient Specific Multiple Time-point MRIs From a Biophysical Model of Brain Deformation in Alzheimer's Disease
article: Workshop on Computational Biomechanics for Medicine - X, Oct 2015, Munich, France. pp.167--176, ⟨10.1007/978-3-319-28329-6_15⟩
identifiant: hal-01217080
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-28329-6_15
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auteur: Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Philipp Beerbaum, Xavier Pennec
titre: Descriptive and Intuitive Population-Based Cardiac Motion Analysis via Sparsity Constrained Tensor Decomposition
article: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2015), Oct 2015, Munich, Germany. pp.419-426, ⟨10.1007/978-3-319-24574-4_50⟩
identifiant: hal-01205535
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-24574-4_50
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auteur: Nina Miolane, Xavier Pennec
titre: Biased estimators on Quotient spaces
article: Geometric Science of Information. Second International Conference, GSI 2015., Oct 2015, Palaiseau, France. pp.130-139, ⟨10.1007/978-3-319-25040-3_15⟩
identifiant: hal-01203805
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-25040-3_15
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auteur: Nina Miolane, Xavier Pennec
titre: A survey of mathematical structures for extending 2D neurogeometry to 3D image processing
article: MICCAI Workshop on Medical Computer Vision: Algorithms for Big Data. MCV 2015., Oct 2015, Munich, Germany. pp.155-167, ⟨10.1007/978-3-319-42016-5_15⟩
identifiant: hal-01203518
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-42016-5_15
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auteur: Roch Molléro, Dominik Neumann, Marc-Michel Rohé, Manasi Datar, Herve Lombaert, Nicholas Ayache, Dorin Comaniciu, Olivier Ecabert, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Tommaso Mansi
titre: Propagation of Myocardial Fibre Architecture Uncertainty on Electromechanical Model Parameter Estimation: A Case Study
article: Functional Imaging and Modeling of the Heart, LNCS., Jun 2015, Maastricht, Netherlands. pp. 448-456, ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_51⟩
identifiant: hal-01241896
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-20309-6_51
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auteur: Xavier Pennec
titre: Barycentric Subspaces Analysis on Spheres
article: Mathematical Foundation sof Computational Anatomy (MFCA'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.71-82
identifiant: hal-01203815
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auteur: Xavier Pennec
titre: Barycentric Subspaces and Affine Spans in Manifolds
article: Geometric Science of Information GSI'2015, Second International Conference, Oct 2015, Palaiseau, France. pp.12-21, ⟨10.1007/978-3-319-25040-3_2⟩
identifiant: hal-01164463
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-25040-3_2
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auteur: Marc-Michel Rohé, Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Combination of Polyaffine Transformations and Supervised Learning for the Automatic Diagnosis of LV Infarct
article: Statistical Atlases and Computational Models of the Heart. Imaging and Modelling Challenges. STACOM 2015., 2015, Munich, Germany. pp.190-198
identifiant: hal-01206710
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2014

auteur: Hugo Darmanté, Benoit Bugnas, Regis Bernard De Dompsure, Laurent Barresi, Nina Miolane, Xavier Pennec, Fernand de Peretti, Nicolas Bronsard
titre: Analyse biométrique de l'anneau pelvien en 3 dimensions - à propos de 100 scanners
article: 89e Réunion annuelle de la SOFCOT, Nov 2014, Paris, France. ⟨10.1016/j.rcot.2014.09.076⟩
identifiant: hal-01094711
DOI: DOI : 10.1016/j.rcot.2014.09.076
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auteur: Bishesh Khanal, Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: A Biophysical Model of Shape Changes due to Atrophy in the Brain with Alzheimer's Disease
article: MICCAI 2014 - 17th International Conference Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. pp.41-48, ⟨10.1007/978-3-319-10470-6_6⟩
identifiant: hal-01006478
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-10470-6_6
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, (adni) For The Alzheimer'S Disease Neuroimaging Initiative
titre: Regional flux analysis of longitudinal atrophy in Alzheimer's disease
article: Alzheimer's Association International Conference, Jul 2014, Copenhagen, Denmark
identifiant: hal-01015978
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auteur: Nina Miolane, Xavier Pennec
titre: Statistics on Lie groups : a need to go beyond the pseudo-Riemannian framework
article: Bayesian inference and Maximum Entropy Methods in Science and Engineering (MaxEnt 2014), Sep 2014, Amboise, France. pp.59--66, ⟨10.1063/1.4905963⟩
identifiant: hal-01091515
DOI: DOI : 10.1063/1.4905963
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2013

auteur: Vikash Gupta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Improving DTI Resolution from a Single Clinical Acquisition: A Statistical Approach using Spatial Prior
article: Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2013 (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.477-484, ⟨10.1007/978-3-642-40760-4_60⟩
identifiant: hal-00845927
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-40760-4_60
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre: Parallel Transport with Pole Ladder: Application to Deformations of time Series of Images
article: GSI2013 - Geometric Science of Information, Aug 2013, Paris, France. pp.68-75, ⟨10.1007/978-3-642-40020-9_6⟩
identifiant: hal-00819898
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-40020-9_6
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auteur: Marco Lorenzi, Bjoern H. Menze, Marc Niethammer, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Sparse Scale-Space Decomposition of Volume Changes in Deformations Fields
article: Medical Image Computing and Computer Aided Intervention (MICCAI), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.328-335, ⟨10.1007/978-3-642-40763-5_41⟩
identifiant: hal-00845758
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-40763-5_41
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auteur: Marco Lorenzi, Martina Bochetta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni
titre: Conversion to MCI in healthy individuals with abnormal CSF Ab42 levels is associated with specific longitudinal morphological changes
article: Alzheimer's Association International Conference 2013, Jul 2013, Boston, United States. pp.P596, ⟨10.1016/j.jalz.2013.05.1189⟩
identifiant: hal-00874722
DOI: DOI : 10.1016/j.jalz.2013.05.1189
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auteur: Kristin Mcleod, Christof Seiler, Nicolas Toussaint, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Regional Analysis of Left Ventricle Function using a Cardiac-Specific Polyaffine Motion Model
article: Functional Imaging and Modeling of the Heart 2013 (FIMH), Jun 2013, London, United Kingdom. pp.483-490, ⟨10.1007/978-3-642-38899-6_57⟩
identifiant: hal-00840042
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-38899-6_57
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auteur: Kristin Mcleod, Christof Seiler, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Spatio-Temporal Dimension Reduction of Cardiac Motion for Group-Wise Analysis and Statistical Testing
article: MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2013, 2013, Nagoya, Japan. pp.501-508, ⟨10.1007/978-3-642-40763-5_62⟩
identifiant: hal-00840041
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-40763-5_62
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auteur: Xavier Pennec
titre: Bi-invariant means on Lie groups with Cartan-Schouten connections
article: Geometric Science of Information (GSI 2013), Aug 2013, Paris, France. pp.59-67, ⟨10.1007/978-3-642-40020-9_5⟩
identifiant: hal-00846373
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-40020-9_5
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auteur: Christof Seiler, Xavier Pennec, Susan Holmes
titre: Random Spatial Structure of Geometric Deformations and Bayesian Nonparametrics
article: GSI - Geometric Science of Information - 2013, Aug 2013, Paris, France. pp.120-127, ⟨10.1007/978-3-642-40020-9_12⟩
identifiant: hal-00847185
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-40020-9_12
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auteur: Birkan Tunç, Alex Smith, Demian Wasserman, Xavier Pennec, William M. Wells, Ragini Verma, Kilian M. Pohl
titre: Multinomial Probabilistic Fiber Representation for Connectivity Driven Clustering
article: IPMI 2013 - Information Processing in Medical Imaging, Jun 2013, Asilomar, United States. pp.730-741, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_61⟩
identifiant: hal-00846431
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-38868-2_61
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2012

auteur: Nicolas Duchateau, Mathieu de Craene, Xavier Pennec, Beatriz Merino, Marta Sitges, Bart Bijnens
titre: Which Reorientation Framework for the Atlas-Based Comparison of Motion from Cardiac Image Sequences?
article: STIA 2012 (Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Sep 2012, Nice, France. pp.25-37, ⟨10.1007/978-3-642-33555-6_3⟩
identifiant: hal-00813822
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33555-6_3
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auteur: Vikash Gupta, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Towards higher resolution analysis of Clinical Brain Diffusion Images
article: 1st International Symposium on Deep Brain Connectomics, Sep 2012, Clermon-Ferrand, France
identifiant: hal-00813829
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auteur: Hervé Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Jean-Marc Peyrat, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
titre: Groupwise Spectral Log-Demons Framework for Atlas Construction
article: Medical Computer Vision (MCV'12) MICCAI workshop, 2012, Nice, France. pp.11-19, ⟨10.1007/978-3-642-36620-8_2⟩
identifiant: hal-00813834
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-36620-8_2
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auteur: Hervé Lombaert, Leo Grady, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Farida Cheriet
titre: Spectral Demons - Image Registration via Global Spectral Correspondence
article: Computer Vision - ECCV 2012, 2012, Florence, Italy. pp.30-44, ⟨10.1007/978-3-642-33709-3_3⟩
identifiant: hal-00813833
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33709-3_3
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auteur: Marco Lorenzi, Giovanni B. Frisoni, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Probabilistic Flux Analysis of Cerebral Longitudinal Atrophy
article: MICCAI workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders (NIBAD'12), 2012, Nice, France. pp.256-265
identifiant: hal-00813846
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni
titre: Spatio-temporal model of atrophy progression in healthy subjects at risk for Alzheimer's disease
article: Alzheimer's Association International Conference 2012, Jul 2012, Vancouver, Canada. pp.P340-P341, ⟨10.1016/j.jalz.2012.05.938⟩
identifiant: hal-00876518
DOI: DOI : 10.1016/j.jalz.2012.05.938
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auteur: Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni
titre: Differentiating pathological brain atrophy from normal aging: a promising diagnostic tool for Alzheimer's disease
article: 2nd Virtual Physiological Human European Conference (VPH2012), Sep 2012, London, United Kingdom
identifiant: hal-00813842
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auteur: Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni
titre: Disentangling the normal aging from the pathological Alzheimer's disease progression on structural MR images
article: 5th Clinical Trials in Alzheimer's Disease (CTAD'12), Oct 2012, Monte Carlo, Monaco
identifiant: hal-00813844
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auteur: Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Regional flux analysis of longitudinal atrophy in Alzheimer's disease
article: Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2012 (MICCAI), 2012, Nice, France. pp.739--746, ⟨10.1007/978-3-642-33415-3_91⟩
identifiant: hal-00813837
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33415-3_91
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni
titre: Modeling the longitudinal atrophy in healthy subject at risk for Alzheimer's disease
article: Alzheimer's Association International Conference 2012, Jul 2012, Vancouver, Canada. pp.P340, ⟨10.1016/j.jalz.2012.05.937⟩
identifiant: hal-00876516
DOI: DOI : 10.1016/j.jalz.2012.05.937
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Giovanni Frisoni
titre: Disentangling the normal aging from the pathological Alzheimer's disease progression on cross-sectional structural MR images
article: MICCAI workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders (NIBAD'12), 2012, Nice, France. pp.145-154
identifiant: hal-00813836
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auteur: Kristin Mcleod, Christof Seiler, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: A Near-Incompressible Poly-Affine Motion Model for Cardiac Function Analysis
article: Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function + a Cardiac Electrophysiological Simulation Challenge (STACOM+CESC'12), 2012, Nice, France. pp.288-297, ⟨10.1007/978-3-642-36961-2_33⟩
identifiant: hal-00813852
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-36961-2_33
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auteur: Adityo Prakosa, Kristin Mcleod, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Evaluation of iLogDemons Algorithm for Cardiac Motion Tracking in Synthetic Ultrasound Sequence
article: Proc. MICCAI Workshop on Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Imaging and Modelling Challenge (STACOM12), 2012, Nice, France. pp.178-187, ⟨10.1007/978-3-642-36961-2_21⟩
identifiant: hal-00813860
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-36961-2_21
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auteur: Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes
titre: Simultaneous Multiscale Polyaffine Registration by Incorporating Deformation Statistics
article: MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2012, Nice, France. pp.130--137, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_17⟩
identifiant: hal-00813867
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33418-4_17
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auteur: Stefan Sommer, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre: Sparsity and Scale: Compact Representations of Deformation for Diffeomorphic Registration
article: IEEE Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis (MMBIA 2012), Jan 2012, Breckenridge, Colorado, United States. ⟨10.1109/MMBIA.2012.6164753⟩
identifiant: hal-00641357
DOI: DOI : 10.1109/MMBIA.2012.6164753
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2011

auteur: Michel Dojat, Mélanie Pélégrini-Issac, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Alban Gaignard, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Franck Michel, Johan Montagnat, Xavier Pennec, Javier Balderrama, Bacem Wali
titre: NeuroLOG: A framework for the sharing and reuse of distributed tools and data in neuroimaging
article: Organization for Human Brain Mapping (HBM'11), Jun 2011, Quebec, Canada
identifiant: hal-00813796
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auteur: Bernard Gibaud, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Franck Michel, Bacem Wali, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Pascal Girard, Alban Gaignard, Diane Lingrand, Johan Montagnat, Javier Rojas Balderrama, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, David Godard, Gilles Kassel, Mélanie Pélégrini-Issac
titre: A federated system for sharing and reuse of images and image processing tools in neuroimaging
article: Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'11), Jun 2011, Berlin, Germany
identifiant: hal-00690921
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec, Giovanni B. Frisoni
titre: Monitoring the brain's longitudinal changes in clinical trials for Alzheimers disease: a robust and reliable non-rigid registration framework
article: Alzheimer's Association 2011 International Conference on Alzheimer's Disease (AAICAD), Jul 2011, Paris, France. pp.S376, ⟨10.1016/j.jalz.2011.05.1082⟩
identifiant: inria-00616203
DOI: DOI : 10.1016/j.jalz.2011.05.1082
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auteur: Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Schilds Ladder for the parallel transport of deformations in time series of images
article: IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. pp.463--474, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_38⟩
identifiant: inria-00616210
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-22092-0_38
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auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre: Geodesics, Parallel Transport & One-parameter Subgroups for Diffeomorphic Image Registration
article: Proceedings of the Third International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.64-74
identifiant: inria-00623919
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auteur: Marco Lorenzi, Nicholas Ayache, Giovanni B. Frisoni, Xavier Pennec
titre: Mapping the effects of Ab142 levels on the longitudinal changes in healthy aging: hierarchical modeling based on stationary velocity filds.
article: Proceedings of Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.663-670, ⟨10.1007/978-3-642-23629-7_81⟩
identifiant: inria-00616213
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-23629-7_81
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auteur: Kristin Mcleod, Adityo Prakosa, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: An Incompressible Log-Domain Demons Algorithm for Tracking Heart Tissue
article: STACOM 2011 - Statistical Atlases and Computational Models of the Heart: Mapping Structure and Function, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.55-67, ⟨10.1007/978-3-642-28326-0_6⟩
identifiant: hal-00813851
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-28326-0_6
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auteur: Xavier Pennec, Marco Lorenzi
titre: Which parallel transport for the statistical analysis of longitudinal deformations?
article: Colloque GRETSI '11, 2011, Bordeaux, France
identifiant: inria-00616204
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auteur: Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Reyes Aguirre
titre: Geometry-Aware Multiscale Image Registration Via OBBTree-Based Polyaffine Log-Demons
article: MICCAI 2011 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2011, Toronto, Canada. pp.631-638, ⟨10.1007/978-3-642-23629-7_77⟩
identifiant: inria-00616215
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-23629-7_77
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auteur: Christof Seiler, Xavier Pennec, Lucas Ritacco, Mauricio Antonio Reyes Aguirre
titre: Femur Specific Polyaffine Model to Regularize the Log-Domain Demons Registration
article: Proceedings of SPIE Medical Imaging '11, 2011, Lake Buena Vista, Floride, United States. Paper 7962-15, ⟨10.1117/12.878316⟩
identifiant: inria-00616216
DOI: DOI : 10.1117/12.878316
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auteur: Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Pierre Fillard
titre: Joint T1 and Brain Fiber Diffeomorphic Registration Using the Demons
article: Multimodal Brain Image Analysis First International Workshop, MBIA 2011, Held in Conjunction with MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.10-18, ⟨10.1007/978-3-642-24446-9_2⟩
identifiant: inria-00627971
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-24446-9_2
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auteur: Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre: Kernel Bundle EPDiff: Evolution Equations for Multi-Scale Diffeomorphic Image Registration
article: Scale Space and Variational Methods in Computer Vision, May 2011, Ein-Gedi, Israel. pp.677-688, ⟨10.1007/978-3-642-24785-9_57⟩
identifiant: hal-00644965
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-24785-9_57
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auteur: Stefan Sommer, François Lauze, Mads Nielsen, Xavier Pennec
titre: A Multi-scale Kernel Bundle for LDDMM: Towards Sparse Deformation Description Across Space and Scales
article: IPMI - 22nd International Conference on Information Processing in Medical Images- 2011, Jul 2011, Kloster Irsee, Germany. pp.624--635, ⟨10.1007/978-3-642-22092-0_51⟩
identifiant: inria-00616209
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-22092-0_51
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2010

auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, James C. Gee, Paul Thompson
titre: A 3D Statistical Fluid Registration Algorithm
article: Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI'2010), 2010, Beijing, China
identifiant: inria-00616169
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auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Paul Thompson
titre: Statistically assisted fluid image registration algorithm - SAFIRA
article: Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.364--367, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490335⟩
identifiant: inria-00616165
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490335
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
titre: Measuring the inter-species variability of endocast growth using shape regression and spatiotemporal registration
article: Abstracts of the 79-th annual meeting of the American Assoc. of Physical Anthropologists (AAPA), April 2010, Albuquerque, Jul 2010, Albuquerque, United States. pp.78-79
identifiant: hal-00875361
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache, José Braga
titre: Comparison of the endocast growth of chimpanzees and bonobos via temporal regression and spatiotemporal registration
article: Miccai Workshop on Spatio-Temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, 2010, Beijing, China, China
identifiant: inria-00616154
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auteur: V. Gorbunova, Stanley Durrleman, Pechin Lo, Xavier Pennec, M. de Bruijne
titre: Lung CT registration combining intensity, curves and surfaces
article: Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.340--343, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490341⟩
identifiant: inria-00616166
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490341
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auteur: Hans Lamecker, Xavier Pennec
titre: Atlas to Image-with-Tumor Registration based on Demons and Deformation Inpainting
article: MICCAI Workshop on Computational Imaging Biomarkers for Tumors - From Qualitative to Quantitative (CIBT'2010), 2010, Beijing, China
identifiant: inria-00616156
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auteur: Natasha Lepore, Anand A. Joshi, Richard M. Leahy, Caroline C. Brun, Yi-Yu Chou, Xavier Pennec, Agatha D. Lee, Marina Barysheva, Greg I. de Zubicaray, Margaret J. Wright, Kathie L. Mcmahon, Aw Toga, Paul M. Thompson
titre: A New Combined Surface and Volume Registration
article: Medical Imaging 2010, Feb 2010, San Diego, United States. pp.76231E-76231E-9, ⟨10.1117/12.844434⟩
identifiant: hal-00813772
DOI: DOI : 10.1117/12.844434
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auteur: Marco Lorenzi, G. Frisoni, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Mapping longitudinal changes in the brain affected by Alzheimer's disease
article: VPH European Conference, Sep 2010, Brussels, Belgium
identifiant: hal-00813774
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auteur: Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Younes Boudjemline
titre: [In-silico models for the simulation and prediction of the cardiac function].
article: Congrès de la Société Francaise de Pédiatrie et de l'Association des Pédiatres de Langue Française (APLF), 2010, Paris, France. pp.611-2, ⟨10.1016/S0929-693X(10)70022-1⟩
identifiant: inria-00616147
DOI: DOI : 10.1016/S0929-693X(10)70022-1
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auteur: Tommaso Mansi, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre: LogDemons Revisited: Consistent Regularisation and Incompressibility Constraint for Soft Tissue Tracking in Medical Images
article: Proc. of Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'10), part II, 2010, Beijing, China, China. pp.652-659, ⟨10.1007/978-3-642-15745-5_80⟩
identifiant: inria-00616162
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-15745-5_80
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auteur: Kristin Mcleod, Tommaso Mansi, Stanley Durrleman, Maxime Sermesant, Xavier Pennec
titre: Statistical Analysis of the Anatomy: From Digital Patient to Digital Population
article: First VPH Conference (VPH2010), Jul 2010, Brussels, Belgium
identifiant: hal-00813775
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auteur: Kristin Mcleod, Alfonso Caiazzo, Miguel Angel Fernández, Tommaso Mansi, Irene Vignon-Clementel, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Younes Boudjemline, Jean-Frédéric Gerbeau
titre: Atlas-Based Reduced Models of Blood Flows for Fast Patient-Specific Simulations
article: STACOM 2010 - Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart, Sep 2010, Beijing, China. pp.95-104, ⟨10.1007/978-3-642-15835-3_10⟩
identifiant: inria-00517994
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-15835-3_10
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auteur: Franck Michel, Alban Gaignard, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Mélanie Pélégrini-Issac, Xavier Pennec, Javier Rojas Balderrama, Bacem Wali
titre: Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.
article: HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. pp.112-123, ⟨10.3233/978-1-60750-583-9-112⟩
identifiant: inserm-00512799
DOI: DOI : 10.3233/978-1-60750-583-9-112
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auteur: Christof Seiler, Xavier Pennec, Mauricio Antonio Reyes Aguirre
titre: Parametric regression of 3D medical images through the exploration of non-parametric regression models
article: Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.452--455, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490313⟩
identifiant: inria-00616168
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490313
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auteur: Andrew Sweet, Xavier Pennec
titre: Log-Domain Diffeomorphic Registration of Diffusion Tensor Images
article: WBIR 2010 - International Workshop on Biomedical Image Registration , Jul 2010, Lübeck, Germany. pp.198-209, ⟨10.1007/978-3-642-14366-3_18⟩
identifiant: inria-00616163
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-14366-3_18
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auteur: Andrew Sweet, Xavier Pennec
titre: A Log-Euclidean Statistical Analysis of DTI Brain Deformations
article: MICCAI 2010 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2010, Beijing, China
identifiant: hal-01525407
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2009

auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur W. Toga, Paul Thompson
titre: A Lagrangian formulation for statistical fluid registration
article: Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, no address, United States. pp.975--978, ⟨10.1109/ISBI.2009.5193217⟩
identifiant: inria-00616141
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2009.5193217
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auteur: Stanley Durrleman, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: A statistical model of white matter fiber bundles based on currents.
article: International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2009, Williamsburg, Va, United States. pp.114-25, ⟨10.1007/978-3-642-02498-6_10⟩
identifiant: inria-00502721
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-02498-6_10
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Guido Gerig, Nicholas Ayache
titre: Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part I, 2009, London, UK, United States. pp.297--304, ⟨10.1007/978-3-642-04268-3_37⟩
identifiant: inria-00616113
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-04268-3_37
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auteur: V. Gorbunova, Stanley Durrleman, Pechin Lo, Xavier Pennec, M. de Bruijne
titre: Curve- and surface-based registration of lung CT images via currents
article: Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis, 2009, London United Kingdom, United Kingdom. pp.15--25
identifiant: inria-00616136
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auteur: Heike Hufnagel, Jan Ehrhardt, Xavier Pennec, Heinz Handels
titre: Application of a Probabilistic Statistical Shape Model to Automatic Segmentation
article: World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, WC 2009, München, 2009, no address, Germany. pp.2181--2184, ⟨10.1007/978-3-642-03882-2_579⟩
identifiant: inria-00616144
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-03882-2_579
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auteur: Heike Hufnagel, Jan Ehrhardt, Xavier Pennec, Alexander Schmidt-Richberg, Heinz Handels
titre: Level Set Segmentation Using a Point-Based Statistical Shape Model Relying on Correspondence Probabilities
article: PMMIA'09 - MICCAI Workshop Probabilistic Model for Medical Image Analysis, 2009, London, United Kingdom
identifiant: hal-03987142
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auteur: Tommaso Mansi, Stanley Durrleman, Boris Bernhardt, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Ingmar Voigt, Philipp Lurz, Andrew Taylor, Julie Blanc, Younes Boudjemline, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: A Statistical Model of Right Ventricle in Tetralogy of Fallot for Prediction of Remodelling and Therapy Planning
article: MICCAI 2009 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2009, London, UK, United Kingdom. pp.214-221, ⟨10.1007/978-3-642-04268-3_27⟩
identifiant: inria-00616175
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-04268-3_27
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2008

auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Greig de Zubicaray, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Marina Barysheva, Arthur W. Toga, Paul Thompson
titre: A new registration method based on Log-Euclidean Tensor metrics and its application to genetic studies
article: Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp.1115-1118, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541196⟩
identifiant: inria-00616171
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541196
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auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Greig de Zubicaray, Matthew Meredith, Katie Mcmahon, Margaret Wright, Arthur W. Toga, Paul Thompson
titre: A tensor-based morphometry study of genetic influences on brain structure using a new fluid registration method
article: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'08), 2008, New York, USA, United States. pp.914--921, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_110⟩
identifiant: inria-00616170
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_110
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auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Agatha D. Lee, Marina Barysheva, Katie L. Mcmahon, Greig I. de Zubicaray, Margaret Wright, Arthur W. Toga, Paul M. Thompson
titre: Volumetric Differences in Brain Structure in Identical and Fraternal Twins Computed using Riemannian Tensor-Based Morphometry
article: 13th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2008, Melbourne, Australia
identifiant: hal-00875380
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: A Forward Model to Build Unbiased Atlases from Curves and Surfaces
article: MFCA 2008 - Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp.68-79
identifiant: inria-00632875
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: Sparse approximation of currents for statistics on curves and surfaces.
article: MICCAI 2008 - Medical Image Computing And Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. pp.390-398, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_47⟩
identifiant: hal-00818375
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_47
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: A framework for evaluating the impact of compression on registration algorithms without gold standard
article: International Conference on Image Processing, Oct 2008, San Diego, California, United States. pp.2912-2915, ⟨10.1109/ICIP.2008.4712404⟩
identifiant: hal-00683112
DOI: DOI : 10.1109/ICIP.2008.4712404
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: A probabilistic model to analyse workflow performance on production grids
article: 8th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid (CCGRID'08), May 2008, Lyon, France. pp.510-517, ⟨10.1109/CCGRID.2008.123⟩
identifiant: hal-00481713
DOI: DOI : 10.1109/CCGRID.2008.123
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auteur: Monica Hernandez, Salvador Olmos, Xavier Pennec
titre: Comparing algorithms for diffeomorphic registration: Stationary LDDMM and Diffeomorphic Demons
article: 2nd MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy, Oct 2008, New-York, United States. pp.24-35
identifiant: inria-00629883
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auteur: Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre: Comparison of Statistical Shape Models Built on Correspondence Probabilities and One-to-One Correspondences
article: Proc. SPIE Symposium on Medical Imaging '08, 2008, San Diego, USA, Germany. ⟨10.1117/12.771136⟩
identifiant: inria-00616124
DOI: DOI : 10.1117/12.771136
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auteur: Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Nicholas Ayache, Heinz Handels
titre: A Global Criterion for the Computation of Statistical Shape Model Parameters Based on Correspondence Probabilities
article: Bildverarbeitung für die Medizin 2008, 2008, no address, Germany. pp.277-282, ⟨10.1007/978-3-540-78640-5_56⟩
identifiant: inria-00616114
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-78640-5_56
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auteur: Natasha Leporé, Caroline Brun, Yi-Yu Chou, Agatha Lee, Marina Barysheva, Xavier Pennec, Katie Mcmahon, Matthew Meredith, Greig de Zubicaray, Margaret Wright, Arthur W. Toga, Paul Thompson
titre: Best individual template selection from deformation tensor minimization
article: Proc. of the 2008 IEEE Int. Symp. on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), Paris, France, May 14-17, 2008, no address, France. pp.460-463, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541032⟩
identifiant: inria-00616172
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541032
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auteur: Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Martin Huber, Andrew Taylor, Giacomo Pongiglione, Xavier Pennec, Younes Boudjemline
titre: Modélisation électromécanique du coeur et analyse d'images
article: Congrés des Sociétés Françaises Médico-chirurgicales Pédiatriques, 2008, Paris, France. pp.1032, ⟨10.1016/S0929-693X(08)72422-9⟩
identifiant: hal-00875383
DOI: DOI : 10.1016/S0929-693X(08)72422-9
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auteur: Erik Pernod, Jean-Christophe Souplet, Javier Rojas Balderrama, Diane Lingrand, Xavier Pennec
titre: Multiple Sclerosis Brain MRI Segmentation Workflow deployment on the EGEE Grid
article: MICCAI-Grid Workshop, Sep 2008, New York, United States. pp.55--64
identifiant: hal-00459138
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auteur: Jean-Marc Peyrat, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Nicholas Ayache
titre: Registration of 4D Time-Series of Cardiac Images with Multichannel Diffeomorphic Demons
article: MICCAI 2008 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2008, New York, USA, United States. pp.972--979, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_117⟩
identifiant: inria-00616122
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_117
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auteur: Javier Rojas Balderrama, Diane Lingrand, Erik Pernod, Jean-Christophe Souplet, Xavier Pennec, Johan Montagnat
titre: NeuroLOG: Neuroscience Application Workflows Execution on the EGEE Grid
article: EGEE conference, Sep 2008, Istanbul, Turkey
identifiant: hal-00461625
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auteur: Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre: Symmetric Log-Domain Diffeomorphic Registration: A Demons-based Approach
article: MICCAI 2008 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. pp.754--761, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_90⟩
identifiant: inria-00280602
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-85988-8_90
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auteur: B.T. Thomas Yeo, Tom Vercauteren, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Polina Golland, Nicholas Ayache, Olivier Clatz
titre: DTI Registration with Exact Finite-Strain Differential
article: IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), May 2008, Paris, France. pp.700-703, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541092⟩
identifiant: inria-00272326
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541092
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2007

auteur: Caroline Brun, Natasha Leporé, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Oscar Lopez, Howard Aizenstein, James Becker, Arthur W. Toga, Paul Thompson
titre: Comparison of Standard and Riemannian Fluid Registration for Tensor-Based Morphometry in HIV/AIDS
article: Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, United States
identifiant: inria-00616057
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auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: Measuring brain variability via sulcal lines registration: a diffeomorphic approach.
article: International Conference on Medical Imaging and Computer Assisted Intervention, Oct 2007, Brisbane, Australia. pp.675-82, ⟨10.1007/978-3-540-75757-3_82⟩
identifiant: inria-00502704
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-75757-3_82
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auteur: Pierre Fillard, Xavier Pennec, Paul Thompson, Nicholas Ayache
titre: Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
article: Proc. of MICCAI'07 Workshop on Statistical Registration: Pair-wise and Group-wise Alignment and Atlas Formation, 2007, Brisbane, Australia, Australia
identifiant: inria-00616033
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
article: Cluster Computing and the Grid, May 2007, Rio de Janeiro, Brazil. pp.100-107, ⟨10.1109/CCGRID.2007.78⟩
identifiant: hal-00683172
DOI: DOI : 10.1109/CCGRID.2007.78
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auteur: Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Heinz Handels, Nicholas Ayache
titre: Shape Analysis Using a Point-Based Statistical Shape Model Built on Correspondence Probabilities
article: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.959-967, ⟨10.1007/978-3-540-75757-3_116⟩
identifiant: inria-00616042
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-75757-3_116
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auteur: Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Jan Ehrhardt, Heinz Handels, Nicholas Ayache
titre: Point-Based Statistical Shape Models with Probabilistic Correspondences and Affine EM-ICP
article: Bildverarbeitung fuer die Medizin 2007, 2007, no address, Germany. pp.434-438, ⟨10.1007/978-3-540-71091-2_87⟩
identifiant: inria-00616034
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-71091-2_87
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auteur: Natasha Leporé, Caroline Brun, Xavier Pennec, Yi-Yu Chou, Oscar Lopez, Howard Aizenstein, James Becker, Arthur W. Toga, Paul Thompson
titre: Mean Template for Tensor-Based Morphometry using Deformation Tensors
article: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.826-833, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7_100⟩
identifiant: inria-00616043
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-75759-7_100
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auteur: Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: Clinical Evaluation of a Respiratory Gated Guidance System for Liver Punctures
article: Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.77--85, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7_10⟩
identifiant: inria-00616044
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-75759-7_10
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auteur: Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot R. Mcveigh, Nicholas Ayache
titre: Statistical Comparison of Cardiac Fibre Architectures
article: Proceedings of Functional Imaging and Modeling of the Heart 2007 (FIMH'07), 2007, no address, United States. pp.413-423, ⟨10.1007/978-3-540-72907-5_42⟩
identifiant: inria-00616049
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-72907-5_42
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auteur: Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre: Non-parametric Diffeomorphic Image Registration with the Demons Algorithm
article: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Oct 2007, Brisbane, Australia. pp.319-326, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7_39⟩
identifiant: inria-00166123
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-75759-7_39
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auteur: Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre: Diffeomorphic Demons Using ITK's Finite Difference Solver Hierarchy
article: Insight Journal -- ISC/NA-MIC Workshop on Open Science at MICCAI 2007, 2007, no address, Australia
identifiant: inria-00616035
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auteur: Tom Vercauteren, Xavier Pennec, Ezio Malis, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache
titre: Insight Into Efficient Image Registration Techniques and the Demons Algorithm
article: Information Processing in Medical Imaging, Jul 2007, Kerkrade, Netherlands. pp.495-506, ⟨10.1007/978-3-540-73273-0_41⟩
identifiant: inria-00165534
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-73273-0_41
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2006

auteur: Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms
article: MICCAI 2006 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Part I, 2006, Copenhaguen, Denmark. pp.924--931, ⟨10.1007/11866565_113⟩
identifiant: inria-00615594
DOI: DOI : 10.1007/11866565_113
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auteur: Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Statistics on Diffeomorphisms in a Log-Euclidean Framework
article: 1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.14-15
identifiant: inria-00635671
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auteur: Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration
article: Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.120-127, ⟨10.1007/11784012_15⟩
identifiant: inria-00615607
DOI: DOI : 10.1007/11784012_15
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auteur: Antoine Azar, Chenyang Xu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: An interactive Intensity- and Feature-Based Non-Rigid Registration Framework for 3D Medical Images
article: Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.824--827, ⟨10.1109/ISBI.2006.1625045⟩
identifiant: inria-00615601
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2006.1625045
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auteur: Jonathan Boisvert, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle, Farida Cheriet
titre: 3D Anatomic Variability Assesment of the Scoliotic Spine Using Statistics on Lie Groups
article: Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.750--753, ⟨10.1109/ISBI.2006.1625025⟩
identifiant: inria-00615602
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2006.1625025
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auteur: Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle
titre: Assessment of Brace Local Action on Vertebrae Relative Poses
article: Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. pp.372--378
identifiant: inria-00615609
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auteur: Jonathan Boisvert, Farida Cheriet, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Hubert Labelle
titre: A novel framework for the 3D analysis of spine deformation modes.
article: Research into Spinal Deformities, 2006, no address, United States. pp.176-81
identifiant: inria-00615608
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auteur: Jonathan Boisvert, Xavier Pennec, Hubert Labelle, Farida Cheriet, Nicholas Ayache
titre: Principal Spine Shape Deformation Modes Using Riemannian Geometry and Articulated Models
article: Proc of the IV Conference on Articulated Motion and Deformable Objects, Andratx, Mallorca, Spain, 11-14 July, 2006, no address, Spain. pp.346--355, ⟨10.1007/11789239_36⟩
identifiant: inria-00615592
DOI: DOI : 10.1007/11789239_36
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auteur: Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Clinical DT-MRI estimation, smoothing and fiber tracking with log-Euclidean metrics
article: Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.786-789, ⟨10.1109/ISBI.2006.1625034⟩
identifiant: inria-00615579
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2006.1625034
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auteur: J. Freund, D. Comaniciu, Y. Ioannis, P. Liu, Richard Mcclatchey, E. Moley-Fletcher, Xavier Pennec, Giacomo Pongiglione, X.S. Zhou
titre: Health-e-Child: An Integrated Biomedical Platform for Grid-Based Pediatrics
article: Proc of Health-Grid 2006, 2006, Valancia, Spain, Spain. pp.259-270
identifiant: inria-00615591
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: Probabilistic and dynamic optimization of job partitioning on a grid infrastructure
article: Parallel, Distributed and network-based Processing, Feb 2006, Montbéliard-Sochaux, France. pp.231-238, ⟨10.1109/PDP.2006.61⟩
identifiant: hal-00683203
DOI: DOI : 10.1109/PDP.2006.61
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auteur: Tristan Glatard, Xavier Pennec, Johan Montagnat
titre: Performance evaluation of grid-enabled registration algorithms using bronze-standards
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI 2006), Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.152-160, ⟨10.1007/11866763_19⟩
identifiant: hal-00683176
DOI: DOI : 10.1007/11866763_19
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: Medical image registration algorithms assessment: Bronze Standard application enactment on grids using the MOTEUR workflow engine
article: HealthGrid conference (HealthGrid'06), Valencia, Spain, June 7-9, Jun 2006, Valencia, Spain. pp.93-103
identifiant: hal-00683188
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: Efficient services composition for grid-enabled data-intensive applications
article: High Performance and Distributed Computing, Jun 2006, Paris, France. pp.333-334, ⟨10.1109/HPDC.2006.1652170⟩
identifiant: hal-00683201
DOI: DOI : 10.1109/HPDC.2006.1652170
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: An experimental comparison of Grid5000 clusters and the EGEE grid
article: Experimental Grid testbeds for the assessment of large-scale distributed applications and tools, Jun 2006, Paris, France. pp.1-10
identifiant: hal-00683199
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auteur: Xavier Pennec
titre: Left-Invariant Riemannian Elasticity: a distance on shape diffeomorphisms ?
article: 1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.1-13
identifiant: inria-00634098
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auteur: Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot R. Mcveigh, Nicholas Ayache
titre: Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Structure
article: Proc. of the 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'06), Part I, 2006, no address, Denmark. pp.297--304, ⟨10.1007/11866565_37⟩
identifiant: inria-00615596
DOI: DOI : 10.1007/11866565_37
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2005

auteur: Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Fast and simple calculus on tensors in the log-Euclidean framework.
article: International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.115-22, ⟨10.1007/11566465_15⟩
identifiant: inria-00502669
DOI: DOI : 10.1007/11566465_15
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auteur: Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
titre: Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.927-34, ⟨10.1007/11566489_114⟩
identifiant: inria-00502673
DOI: DOI : 10.1007/11566489_114
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auteur: Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Paul M. Thompson, Nicholas Ayache
titre: Extrapolation of sparse tensor fields: application to the modeling of brain variability.
article: International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2005, Glenwood Springs, CO, United States. pp.27-38, ⟨10.1007/11505730_3⟩
identifiant: inria-00502688
DOI: DOI : 10.1007/11505730_3
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auteur: Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: A Riemannian Framework for the Processing of Tensor-Valued Images
article: Deep Structure, Singularities, and Computer Vision (DSSCV), 2005, no address, Netherlands. pp.112--123, ⟨10.1007/11577812_10⟩
identifiant: inria-00615994
DOI: DOI : 10.1007/11577812_10
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auteur: Cécile Germain, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Charles Loomis, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Romain Texier
titre: Grid-enabling medical image analysis
article: Cluster Computing and Grid 2005 (CCGrid05) Bio-Medical Computations on the Grid (Bio-Grid), May 2005, Cardiff, United Kingdom. pp.339-349, ⟨10.1007/s10877-005-0679-9⟩
identifiant: hal-00166971
DOI: DOI : 10.1007/s10877-005-0679-9
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: Grid-enabled workflows for data intensive medical applications
article: International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS), Jun 2005, Dublin, Ireland. pp.537-542, ⟨10.1109/CBMS.2005.61⟩
identifiant: hal-00691613
DOI: DOI : 10.1109/CBMS.2005.61
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auteur: Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Hans Handels, Nicholas Ayache
titre: Non-Linear 2D and 3D Registration Using Block-Matching and B-Splines
article: Bildverarbeitung fuer die Medizin 2005, Deutsches Krebsforschungszentrum, 2005, Heidelberg, Germany, Germany. pp.325-329, ⟨10.1007/3-540-26431-0_67⟩
identifiant: inria-00615991
DOI: DOI : 10.1007/3-540-26431-0_67
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auteur: Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: A complete Augmented Reality Guidance System for Liver Punctures: First Clinical Evaluation
article: MICCAI 2005 - Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Part I, 2005, Palm Springs, CA, USA, October 26-29, United States. pp.539--547, ⟨10.1007/11566465_67⟩
identifiant: inria-00616011
DOI: DOI : 10.1007/11566465_67
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auteur: Xavier Pennec, R. Stefanescu, V. Arsigny, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre: Riemannian elasticity: a statistical regularization framework for non-linear registration.
article: International Conference on Medical Image computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.943-50, ⟨10.1007/11566489_116⟩
identifiant: inria-00502675
DOI: DOI : 10.1007/11566489_116
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auteur: Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Mosaicing of Confocal Microscopic In Vivo Soft Tissue Video Sequences
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2005, Palm Springs, United States. pp.753-760, ⟨10.1007/11566465_93⟩
identifiant: inria-00166791
DOI: DOI : 10.1007/11566465_93
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2004

auteur: Guillaume Flandin, Xavier Pennec, Alexis Roche, Will D. Penny, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre: Multi-subject anatomo-functional classification for activation studies
article: NeuroImage (HBM'04), 2004, Budapest, Hungary
identifiant: inria-00615974
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auteur: Derek Hill, Xavier Pennec, Michael Burns, Michael Parkin, Jo Hajnal, Radu Stefanescu, Daniel Rueckert, Johan Montagnat
titre: Intraoperable Medical Image Registration Grid Service
article: Proc. of HealthGrid 2004, 2004, Clermont-Ferrand, France
identifiant: inria-00615977
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auteur: Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: An Accuracy Certified Augmented Reality System for Therapy Guidance
article: Proc. of the 8th European Conference on Computer Vision (ECCV 04), Part III, 2004, Prague, Czech Republic. pp.79--91, ⟨10.1007/b97871⟩
identifiant: inria-00615985
DOI: DOI : 10.1007/b97871
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auteur: Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: An Augmented Reality System to Guide Liver Punctures
article: Workshop AMI-ARCS 2004 held in conjunction with MICCAI'04, IRISA Rennes, 2004, no address, France. pp.77--86
identifiant: inria-00615990
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auteur: Stéphane Nicolau, Jérôme Schmid, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: An Augmented Reality and Virtuality Interface for a Puncture Guidance System: Design and Validation on an Abdominal Phantom
article: MIAR - Medical Imaging and Augmented Reality - 2004, Aug 2004, Beijing, China. pp.302--310, ⟨10.1007/b99698⟩
identifiant: hal-00875246
DOI: DOI : 10.1007/b99698
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auteur: Luc Soler, Stéphane Nicolau, Jérôme Schmid, Christophe Koehl, Jacques Marescaux, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Virtual Reality and Augmented Reality in Digestive Surgery
article: Proc. of IEEE International Symposium on Mixed and Augmented Reality (ISMAR'04), 2004, no address, United States. pp.278--279, ⟨10.1109/ISMAR.2004.64⟩
identifiant: inria-00615979
DOI: DOI : 10.1109/ISMAR.2004.64
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auteur: Luc Soler, Nicholas Ayache, Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Clément Forest, Hervé Delingette, Didier Mutter, Jacques Marescaux
titre: Virtual Reality, Augmented Reality and Robotics in surgical procedures of the liver
article: Perspectives in Image-guided Surgery. Proceedings of the Scientific Workshop on Medical Robotics, Navigation and Visualization (MRNV) 2004, 2004, RheinAhrCampus Remagen, Germany, Germany. pp.476--484
identifiant: inria-00615975
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auteur: Radu Stefanescu, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Non-Rigid Atlas to Subject Registration with Pathologies for Conformal Brain Radiotherapy
article: MICCAI 2004 - 7th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2004, Saint-Malo, France. pp.704-711, ⟨10.1007/978-3-540-30135-6_86⟩
identifiant: hal-03989487
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-30135-6_86
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2003

auteur: Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Polyrigid and Polyaffine Transformations: A New Class of Diffeomorphisms for Locally Rigid or Affine Registration
article: Proc. of MICCAI'03, Part II, Oct 2003, Montreal, Canada. pp.829--837, ⟨10.1007/b93811⟩
identifiant: inria-00615668
DOI: DOI : 10.1007/b93811
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auteur: Guillaume Flandin, Will D. Penny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre: A multisubject anatomo-functional parcellation of the brain
article: NeuroImage (HBM'03), 2003, New York, USA, United States
identifiant: inria-00615951
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auteur: Miguel Ángel González Ballester, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Generalized Image Models and Their Application as Statistical Models of Images
article: MICCAI 2003 - Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Nov 2003, Montréal Québec, Canada. pp.150-157, ⟨10.1007/978-3-540-39903-2_19⟩
identifiant: hal-03989511
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-39903-2_19
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auteur: Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: Vision augmentée de structures anatomiques abdominales recalées par stéréoscopie
article: Actes du quatrième colloque francophone. Méthodes et Techniques Optiques pour l'Industrie, 2003, Belfort, France. pp.413--418
identifiant: inria-00615934
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auteur: Stéphane Nicolau, Alain Garcia, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: Guidage de ponctions percutanées à l'aide d'un système de vision basé sur une méthode de recalage 3D/2D
article: Actes du colloque Imagerie pour les sciences du vivant et de l'ingénieur (IMVIE03), 2003, Strasbourg, France
identifiant: inria-00615933
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auteur: Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: Evaluation of a New 3D/2D Registration Criterion for Liver Radio-Frequencies Guided by Augmented Reality
article: International Symposium on Surgery Simulation and Soft Tissue Modeling (IS4TM'03), INRIA Sophia Antipolis, 2003, Juan-les-Pins, France, France. pp.270--283, ⟨10.1007/3-540-45015-7_26⟩
identifiant: inria-00615945
DOI: DOI : 10.1007/3-540-45015-7_26
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auteur: Stéphane Nicolau, Alain Garcia, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: Augmented Reality guided radio-frequency tumor ablation
article: Proceedings of Augmented and Virtual Reality Workshop (AVIR03), 2003, Genève, Switzerland. pp.34-35
identifiant: inria-00615957
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auteur: Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Parallel non-rigid registration on a cluster of workstations
article: Proc. of HealthGrid'03, 2003, Lyon, France
identifiant: inria-00615956
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auteur: Radu Stefanescu, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Grid Enabled Non-Rigid Registration with a Dense Transformation and A Priori Information
article: MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions 2003, Oct 2003, Montreal, Canada. pp.804--811, ⟨10.1007/978-3-540-39903-2_98⟩
identifiant: hal-00875275
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-39903-2_98
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2002

auteur: Guillaume Flandin, Ferath Kherif, Xavier Pennec, Denis Rivière, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre: A new representation of fMRI data using anatomo-functional constraints
article: NeuroImage (HBM'02), 2002, Sendai, Japan, Japan
identifiant: inria-00615928
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auteur: Guillaume Flandin, Ferath Kherif, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre: Improved Detection Sensitivity in Functional MRI Data using a Brain Parcelling Technique
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'02), 2002, Tokyo, Japan. pp.467--474, ⟨10.1007/3-540-45786-0_58⟩
identifiant: inria-00615921
DOI: DOI : 10.1007/3-540-45786-0_58
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auteur: Guillaume Flandin, Ferath Kherif, Xavier Pennec, Denis Rivière, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline
titre: Parcellation of brain images with anatomical and functional constraints for fMRI data analysis
article: IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2002, Washington, USA, United States. pp.907--910, ⟨10.1109/ISBI.2002.1029408⟩
identifiant: inria-00615916
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2002.1029408
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auteur: Sébastien Granger, Xavier Pennec
titre: Multi-scale EM-ICP: A Fast and Robust Approach for Surface Registration
article: European Conference on Computer Vision (ECCV 2002), 2002, Copenhagen, Denmark, Denmark. pp.418--432, ⟨10.1007/3-540-47979-1_28⟩
identifiant: inria-00615911
DOI: DOI : 10.1007/3-540-47979-1_28
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auteur: Pierre Jannin, J.M. Fitzpatrick, David J. Hawkes, Xavier Pennec, R. Sahidi, M.W. Vannier
titre: White paper: validation of medical image processing in image-guided therapy
article: Proc. of Int. Conf. on Computer Assisted Radiology (CARS 2002), 2002, no address, Germany. pp.299--305, ⟨10.1007/978-3-642-56168-9_49⟩
identifiant: inria-00615930
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-56168-9_49
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auteur: Sébastien Ourselin, Radu Stefanescu, Xavier Pennec
titre: Robust registration of multi-modal images: towards real-time clinical applications
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'02), 2002, Tokyo, Japan. pp.140--147, ⟨10.1007/3-540-45787-9_18⟩
identifiant: inria-00615675
DOI: DOI : 10.1007/3-540-45787-9_18
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auteur: Maxime Sermesant, Clément Forest, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
titre: Biomechanical Model Construction from Different Modalities: Application to Cardiac Images
article: MICCAI 2002 - Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, 2002, Tokyo, Japan. pp.714--721, ⟨10.1007/3-540-45786-0_88⟩
identifiant: inria-00615925
DOI: DOI : 10.1007/3-540-45786-0_88
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2001

auteur: Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Pascal Cachier
titre: Fusing 3-D ultrasound and MRI for real-time image-guided neurosurgery
article: Medical Physics and Clinical Engineering Conference, 2001, no address, United States
identifiant: inria-00615896
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auteur: Pascal Cachier, Jean-François Mangin, Xavier Pennec, Denis Rivière, Dimitri Papadopoulos-Orfanos, Jean Régis, Nicholas Ayache
titre: Multisubject Non-Rigid Registration of Brain MRI using Intensity and Geometric Features
article: 4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.734--742, ⟨10.1007/3-540-45468-3_88⟩
identifiant: inria-00615871
DOI: DOI : 10.1007/3-540-45468-3_88
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auteur: Sébastien Granger, Xavier Pennec, Alexis Roche
titre: Rigid Point-Surface Registration Using an EM variant of ICP for Computer Guided Oral Implantology
article: 4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.752--761, ⟨10.1007/3-540-45468-3_90⟩
identifiant: inria-00615679
DOI: DOI : 10.1007/3-540-45468-3_90
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auteur: Xavier Pennec, Pascal Cachier, Nicholas Ayache
titre: Tracking brain deformations in time sequences of 3D US images
article: IPMI 2001 - Information Processing in Medical Images, 2001, Davis, CA, USA, United States. pp.169--175, ⟨10.1007/3-540-45729-1_16⟩
identifiant: inria-00615677
DOI: DOI : 10.1007/3-540-45729-1_16
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auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Alexis Roche, Pascal Cachier
titre: Non-rigid MR/US registration for tracking brain deformations
article: Proc of Int. Workshop on Medical Imaging and Augmented Reality (MIAR 2001), 10-12 June 2001, Shatin, Hong Kong, 2001, Shatin, Hong Kong, Hong Kong SAR China. pp.79--86, ⟨10.1109/MIAR.2001.930268⟩
identifiant: inria-00615898
DOI: DOI : 10.1109/MIAR.2001.930268
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2000

auteur: Pascal Cachier, Xavier Pennec
titre: 3D Non-Rigid Registration by Gradient Descent on a Gaussian-Windowed Similarity Measure using Convolutions
article: MMBIA'00 - IEEE Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis, 2000, Hilton Head Island, South Carolina, USA, United States. pp.182--189, ⟨10.1109/MMBIA.2000.852376⟩
identifiant: inria-00615855
DOI: DOI : 10.1109/MMBIA.2000.852376
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auteur: D. Etienne, A. Stankoff, Xavier Pennec, Sébastien Granger, A. Lacan, R. Derycke
titre: A new approach for dental implant aided surgery.
article: 4th Congresson Panamerica de Periodontologia, Aug 2000, Santiago, Chile
identifiant: hal-00875388
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auteur: D. Etienne, A. Stankoff, Xavier Pennec, Sébastien Granger, A. Lacan, R. Derycke
titre: A new approach for dental implant aided surgery. A pilot evaluation
article: Proc. of CARS'2000, 2000, no address, Germany. pp.927--931
identifiant: inria-00615854
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auteur: Alexis Roche, Xavier Pennec, M. Rudolph, D.P. Auer, Grégoire Malandain, Sébastien Ourselin, L.M. Auer, Nicholas Ayache
titre: Generalized Correlation Ratio for Rigid Registration of 3D Ultrasound with MR Images
article: Proc. of the 3rd Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'00), 2000, Pittsburgh, Pennsylvanie, USA, United States. pp.567--577, ⟨10.1007/978-3-540-40899-4_58⟩
identifiant: inria-00615680
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-40899-4_58
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1999

auteur: Sébastien Ourselin, Alexis Roche, Gérard Subsol, Xavier Pennec
titre: Automatic Alignment of Histological Sections
article: International Workshop on Biomedical Image Registration, WBIR'99, 1999, Bled (Slovénie), Slovenia. pp.1--13
identifiant: inria-00615684
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auteur: Xavier Pennec, Pascal Cachier, Nicholas Ayache
titre: Understanding the ''Demon's Algorithm'': 3D Non-Rigid registration by Gradient Descent
article: 2nd Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'99), 1999, Cambridge, UK, United Kingdom. pp.597--605, ⟨10.1007/10704282_64⟩
identifiant: inria-00615831
DOI: DOI : 10.1007/10704282_64
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auteur: Xavier Pennec
titre: Probabilities and Statistics on Riemannian Manifolds: Basic Tools for Geometric Measurements
article: Proc. of Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP'99), IEEE-EURASIP, 1999, June 20-23, Antalya, Turkey, Turkey. pp.194--198
identifiant: inria-00615833
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1998

auteur: Xavier Pennec, Charles R.G. Guttmann, Jean-Philippe Thirion
titre: Feature-based Registration of Medical Images: Estimation and Validation of the Pose Accuracy
article: MICCAI 1998 - Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, 1998, Cambridge, USA, United States. pp.1107--1114, ⟨10.1007/BFb0056300⟩
identifiant: inria-00615809
DOI: DOI : 10.1007/BFb0056300
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auteur: Alexis Roche, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: The Correlation Ratio as a New Similarity Measure for Multimodal Image Registration
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Interventation, 1998, France. pp.1115-1124, ⟨10.1007/BFb0056181⟩
identifiant: cea-00333675
DOI: DOI : 10.1007/BFb0056181
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1997

auteur: Xavier Pennec
titre: Registration of Uncertain Geometric Features: Estimating the Pose and its Accuracy
article: Proc of the First Image Registration Workshop, November 20-21 1997, Greenbelt, Maryland, USA, CESDIS, 1997, Greenbelt, Maryland, USA, United States. pp.263--272
identifiant: inria-00615789
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1996

auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Randomness and Geometric Features in Computer Vision
article: IEEE Conf. on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR'96), 1996, San Francisco, Cal, USA, United States. pp.484--491, ⟨10.1109/CVPR.1996.517116⟩
identifiant: inria-00615694
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.1996.517116
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auteur: Xavier Pennec
titre: Multiple Registration and Mean Rigid Shape - Application to the 3D case
article: Image Fusion and Shape Variability Techniques (16th Leeds Annual Statistical Workshop), University of Leeds, UK, 1996, no address, United Kingdom. pp.178-185
identifiant: inria-00615762
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auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Quelques problèmes posés par la gestion des primitives géométriques en vision par ordinateur
article: Journées ORASIS, 1996, no address, France. pp.111-116
identifiant: inria-00615764
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auteur: Jay B. West, Michael J. Fitzpatrick, Matthew Y. Wang, Benoit M. Dawant, Calvin R. Maurer, Robert M. Kessler, Robert J. Maciunas, Christian Barillot, Didier Lemoine, Andre M.F. Collignon, Frederik Maes, Paul Suetens, Dirk Vandermeulen, Petra A. van den Elsen, Paul F. Hemler, Sandy Napel, Thilaka S. Sumanaweera, Beth A. Harkness, Derek L. Hill, Colin Studholme, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Marylin E. Noz, Derald Q. Maguire, Michael Pollack, Charles A. Pelizzari, Richard A. Robb, Dennis P. Hanson, Roger P. Woods
titre: Comparison and evaluation of retrospective intermodality image registration techniques
article: Medical Imaging 1996: Image Processing, Apr 1996, Newport Beach, California, USA, United States. ⟨10.1117/12.237936⟩
identifiant: inria-00615767
DOI: DOI : 10.1117/12.237936
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1995

auteur: Xavier Pennec, Jean-Philippe Thirion
titre: Validation of 3D Registration Methods based on Points and Frames
article: Proc. of the 5th Int. Conf on Comp. Vision (ICCV'95), 1995, Cambridge, Ma, United States. pp.557--562, ⟨10.1109/ICCV.1995.466890⟩
identifiant: inria-00615699
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.1995.466890
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1994

auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: An ¸al O(n²) Algorithm for 3D Substructure Matching of Proteins
article: Shape and Pattern Matching in Computational Biology -- Proc. First Int. Workshop, Seattle, Wash, June 20, 1994, 1994, Seattle, Wash, United States. pp.25--40
identifiant: inria-00615736
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Book sections

2022

auteur: Nicolas Guigui, Xavier Pennec
titre: Parallel transport, a central tool in geometric statistics for computational anatomy: Application to cardiac motion modeling
article: Frank Nielsen; Arni S.R. Srinivasa Rao; C.R. Rao. Geometry and Statistics, 46, Elsevier, pp.285-326, 2022, Handbook of Statistics, 978-0-323-91345-4. ⟨10.1016/bs.host.2022.03.006⟩
identifiant: hal-03684811
DOI: DOI : 10.1016/bs.host.2022.03.006
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2021

auteur: Xavier Pennec
titre: Statistical analysis of organs' shapes and deformations: the Riemannian and the affine settings in computational anatomy
article: Jean-François Uhl; Joaquim Jorge; Daniel Simoes Lopes; Pedro F Campos. Digital Anatomy - Applications of Virtual, Mixed and Augmented Reality, Springer Nature, In press, Human–Computer Interaction Series, ⟨10.1007/978-3-030-61905-3_9⟩
identifiant: hal-02925156
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-61905-3_9
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2020

auteur: Nina Miolane, Loïc Devilliers, Xavier Pennec
titre: Bias on estimation in quotient space and correction methods: Applications to statistics on organ shapes
article: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis, Chap. 9, Elsevier, pp.343-376, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-814725-2.00017-0⟩
identifiant: hal-02342155
DOI: DOI : 10.1016/B978-0-12-814725-2.00017-0
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auteur: Xavier Pennec
titre: Manifold-valued image processing with SPD matrices
article: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis, Chap. 3, Elsevier; Elsevier, pp.75-134, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-814725-2.00010-8⟩
identifiant: hal-02341958
DOI: DOI : 10.1016/B978-0-12-814725-2.00010-8
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auteur: Xavier Pennec
titre: Advances in Geometric Statistics for Manifold Dimension Reduction
article: Handbook of Variational Methods for Nonlinear Geometric Data, Springer International Publishing, pp.339-359, 2020, ⟨10.1007/978-3-030-31351-7_11⟩
identifiant: hal-02560938
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-31351-7_11
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auteur: Xavier Pennec, Marco Lorenzi
titre: Beyond Riemannian geometry: The affine connection setting for transformation groups
article: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis, Chap. 5, Elsevier, pp.169-229, 2020, 978-0-12-814725-2. ⟨10.1016/B978-0-12-814725-2.00012-1⟩
identifiant: hal-02342137
DOI: DOI : 10.1016/B978-0-12-814725-2.00012-1
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auteur: Stefan Sommer, Tom Fletcher, Xavier Pennec
titre: Introduction to differential and Riemannian geometry
article: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis, Chap. 1, Elsevier, pp.3-37, 2020, ⟨10.1016/b978-0-12-814725-2.00008-x⟩
identifiant: hal-02341901
DOI: DOI : 10.1016/b978-0-12-814725-2.00008-x
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2019

auteur: Marie-Christine Bailly-Maître, Chapon Philippe, Etienne Deloule, Jean-Paul Deroin, Marion Garçon, Thierry Gonon, Christian Marignac, Thierry Moindrot, Fernand Peloux, Flavien Perazza, Xavier Pennec, Elise Seron, Eric Vuillez
titre: Chapitre 3. La Mine
article: Bailly-Maître, Marie-Christine. L'entreprise minière de Brandes XIe-XIVe siècles Huez, Oisans (Isère) : extraction et transformation de minerais argentifères, 47, ALPARA; MOM Éditions, pp.67-140, 2019, Documents d'Archéologie en Rhône-Alpes et en Auvergne, 978-2-916125-13-8. ⟨10.4000/books.alpara.4822⟩
identifiant: hal-03046107
DOI: DOI : 10.4000/books.alpara.4822
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2015

auteur: Xavier Pennec, Pierre Fillard
titre: Statistical Computing on Non-Linear Spaces for Computational Anatomy
article: Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research, Springer, pp.147-168, 2015, 978-0-387-09748-0. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7_8⟩
identifiant: inria-00616201
DOI: DOI : 10.1007/978-0-387-09749-7_8
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2014

auteur: Marco Lorenzi, Xavier Pennec
titre: Discrete Ladders for Parallel Transport in Transformation Groups with an Affine Connection Structure
article: Frank Nielsen. Geometric Theory of Information, Springer, pp.243-271, 2014, Signals and Communication Technology, ⟨10.1007/978-3-319-05317-2_9⟩
identifiant: hal-00933229
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-05317-2_9
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2013

auteur: Kristin Mcleod, Tommaso Mansi, Maxime Sermesant, Giacomo Pongiglione, Xavier Pennec
titre: Statistical Shape Analysis of Surfaces in Medical Images Applied to the Tetralogy of Fallot Heart
article: Frederic Cazals and Pierre Kornprobst. Modeling in Computational Biology and Biomedicine, Springer, pp.165-191, 2013, Lectures Notes in Mathematical and Computational Biology, 978-3-642-31207-6. ⟨10.1007/978-3-642-31208-3_5⟩
identifiant: hal-00813850
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-31208-3_5
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2012

auteur: Xavier Pennec, Vincent Arsigny
titre: Exponential Barycenters of the Canonical Cartan Connection and Invariant Means on Lie Groups
article: Frederic Barbaresco and Amit Mishra and Frank Nielsen. Matrix Information Geometry, Springer, pp.123-168, 2012, 978-3-642-30231-2 (Print) / 978-3-642-30232-9 (Online). ⟨10.1007/978-3-642-30232-9_7⟩
identifiant: hal-00699361
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-30232-9_7
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2009

auteur: Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
titre: Asclepios: a Research Project-Team at INRIA for the Analysis and Simulation of Biomedical Images
article: Bertot, Y. and Huet, G. and Lévy, J.-J. and Plotkin, G. From semantics to computer science: essays in honor of Gilles Kahn, Cambridge University Press, pp.415-436, 2009, ⟨10.1017/CBO9780511770524.019⟩
identifiant: inria-00616094
DOI: DOI : 10.1017/CBO9780511770524.019
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auteur: Cecile Germain-Renaud, Vincent Breton, Patrick Clarysse, Bertrand Delhay, Yann Gaudeau, Tristan Glatard, Emmanuel Jeannot, Yannick Legre, Johan Montagnat, Jean-Marie Moureaux, Angel Osorio, Xavier Pennec, Joel Schaerer, Romain Texier
titre: Grid Analysis of Radiological Data
article: Mario Cannataro (Ed.). Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healthcare, IGI, pp.363-391, 2009, chapter 19, ⟨10.4018/978-1-60566-374-6.ch019⟩
identifiant: hal-00683992
DOI: DOI : 10.4018/978-1-60566-374-6.ch019
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2008

auteur: Ender Konukoglu, Xavier Pennec, Olivier Clatz, Nicholas Ayache
titre: Tumor Growth Modeling in Oncological Image Analysis
article: Bankman, I. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp.297--307, 2008, 13: 978-0-12-373904-9. ⟨10.1016/B978-012373904-9.50027-1⟩
identifiant: inria-00616081
DOI: DOI : 10.1016/B978-012373904-9.50027-1
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auteur: Xavier Pennec
titre: Statistical computing on manifolds: from Riemannian geometry to computational anatomy
article: Nielsen, Frank. Emerging Trends in Visual Computing, 5416, Springer, pp.347--386, 2008, LNCS, 978-3-642-00825-2. ⟨10.1007/978-3-642-00826-9_16⟩
identifiant: inria-00616104
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-00826-9_16
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auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Jean-Philippe Thirion
titre: Landmark-based registration using features identified through differential geometry
article: Bankman, I. Handbook of Medical Image Processing and Analysis - New edition, Academic Press, pp.565--578, 2008, 13: 978-0-12-373904-9. ⟨10.1016/B978-012373904-9.50044-1⟩
identifiant: inria-00616082
DOI: DOI : 10.1016/B978-012373904-9.50044-1
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2007

auteur: Xavier Pennec, Pierre Fillard
titre: Les autoroutes de l'information neuronale
article: Voir l'invisible, Omniscience, p.116-117, 2007, ISBN 978-2-916097-13-8
identifiant: hal-03991401
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auteur: Xavier Pennec, Pierre Fillard
titre: Avons-nous tous le même cerveau ?
article: Voir l'invisible, Omniscience, p.112-113, 2007, 978-2-916097-13-8
identifiant: hal-03991400
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2005

auteur: Xavier Pennec, Alexis Roche, Pascal Cathier, Nicholas Ayache
titre: Non-Rigid MR/US Registration for Tracking Brain Deformations
article: Blum, R.S. and Liu, Zh. Multi-Sensor Image Fusion and Its Applications, 26, CRC Press - Taylor and Francis, pp.107--143, 2005, Signal Processing and Communications
identifiant: inria-00615672
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2004

auteur: Luc Soler, Nicholas Ayache, Stéphane Nicolau, Xavier Pennec, Clément Forest, Hervé Delingette, Didier Mutter, Jacques Marescaux
titre: Traitements d'images médicales pour la planification, la simulation et l'aide intra-opératoire des actes chirurgicaux
article: Faupel, M. and Smigielski, P. and Grzymala, R. Imagerie et Photonique pour les sciences du vivant et la médecine, Edition Fontis Media, pp.19-31, 2004, 2-88476-005-9
identifiant: inria-00615657
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2000

auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Jean-Philippe Thirion
titre: Landmark-based registration using features identified through differential geometry
article: Bankman, I. Handbook of Medical Imaging - Processing and Analysis. I., Academic Press, pp.499--513, 2000
identifiant: inria-00615106
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Habilitation à diriger des recherches

2006

auteur: Xavier Pennec
titre: Statistical Computing on Manifolds for Computational Anatomy
article: Computer Science [cs]. Université Nice Sophia Antipolis, 2006
identifiant: tel-00633163
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Master thesis

1993

auteur: Xavier Pennec
titre: Traitement de l'erreur dans les méthodes de hachage géométrique et d'Alignement, une étude théorique
article: Imagerie médicale. 1993
identifiant: hal-00875950
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Other publications

2010

auteur: I. L. Dryden, Xavier Pennec, Jean-Marc Peyrat
titre: Power Euclidean metrics for covariance matrices with application to diffusion tensor imaging
article: 2010
identifiant: hal-00813769
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2005

auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: An optimized workflow enactor for data-intensive grid applications
article: 2005, pp.17
identifiant: hal-00691833
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Books

2023

auteur: Nicolas Guigui, Nina Miolane, Xavier Pennec
titre: Introduction to Riemannian Geometry and Geometric Statistics: from basic theory to implementation with Geomstats
article: Know Publishers, 16 (3), pp.182, 2023, Foundations and Trends® in Machine Learning, 978-1-63828-155-9. ⟨10.1561/2200000098⟩
identifiant: hal-03766900
DOI: DOI : 10.1561/2200000098
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2020

auteur: Xavier Pennec, Stephan Sommer, Tom Fletcher
titre: Riemannian Geometric Statistics in Medical Image Analysis
article: Pennec, Xavier; Sommer, Stefan; Fletcher, Tom. Academic Press; Elsevier, 2020, ⟨10.1016/C2017-0-01561-6⟩
identifiant: hal-02341896
DOI: DOI : 10.1016/C2017-0-01561-6
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2019

auteur: Dajiang Zhu, Jingwen Yan, Heng Huang, Li Shen, Paul M. Thompson, Carl-Fredrik Westin, Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Tom Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
titre: Multimodal Brain Image Analysis and Mathematical Foundations of Computational Anatomy
article: Zhu, Dajiang; Yan, Jingwen; Nielsen, Mads; Fletcher, Tom; Durrleman, Stanley; Sommer, Stefan; Huang, Heng; Shen, Li; Thompson, Paul M.; Westin, Carl-Fredrik; Pennec, Xavier; Joshi, Sarang. Springer, 11846, 2019, Lecture Notes in Computer Science (LNCS), ⟨10.1007/978-3-030-33226-6⟩
identifiant: hal-02341877
DOI: DOI : 10.1007/978-3-030-33226-6
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2017

auteur: Jorge M. Cardoso, Tal Arbel, Enzo Ferrante, Xavier Pennec, Dalca Adrian V., Sarah Parisot, Sarang Joshi, Nematollah K. Batmanghelich, Aristeidis Sotiras, Mads Nielsen, Mert Sabuncu, Fletcher Tom, Li Shen, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
titre: Graphs in Biomedical Image Analysis, Computational Anatomy and Imaging Genetics
article: Jorge Cardoso; Tal Arbel; Mert Sabuncu; Fletcher Tom; Li Shen; Stanley Durrleman; Stefan Sommer; Enzo Ferrante; Xavier Pennec; Dalca Adrian V.; Sarah Parisot; Sarang Joshi; Nematollah Batmanghelich; Aristeidis Sotiras; Mads Nielsen. 10551, 2017, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-319-67675-3⟩
identifiant: hal-01597839
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-67675-3
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2013

auteur: Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas P. Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
titre: Proceedings of the Fourth International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy - Geometrical and Statistical Methods for Biological Shape Variability Modeling (MFCA 2013), Nagoya, Japan
article: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Tom P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan. Inria, pp.132, 2013
identifiant: hal-00873631
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2011

auteur: Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen
titre: Proceedings of the Third International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'11)- Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
article: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads. HAL, pp.200, 2011
identifiant: hal-00813806
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2008

auteur: Xavier Pennec, Sarang Joshi
titre: Proceedings of the Second International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'08) - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
article: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. MICCAI, Inria, Hal, pp.188, 2008
identifiant: hal-00846316
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2006

auteur: Xavier Pennec, Sarang Joshi
titre: Proceedings of the First International Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA'06) - Geometrical and Statistical Methods for Modelling Biological Shape Variability
article: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang. MICCAI - Inria, pp.187, 2006
identifiant: inria-00614989
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Patents

2015

auteur: Natasha Lepore, Fernando Ypes-Calderon, Yalin Wang, Paul M. Thompson, Xavier Pennec, Marvin D. Nelson, Caroline Brun, Wayne L. Tang
titre: Magnetic resonance imaging tool to detect clinical difference in brain anatomy
article: United States, Patent n° : WO/2015/017582, International Application PCT/US2014/048973. 2015
identifiant: hal-01203798
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2007

auteur: Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
titre: Robust Mosaicing Method with Correction of Motion Distorsions and Tissue Deformations for In Vivo Fibered Microscopy
article: United States, Patent n° : US Patent US20090041314. 2007
identifiant: hal-00875647
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2006

auteur: Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre: Device for processing raw images or tensor images
article: United States, Patent n° : US patent US 2008/0170802. 2006
identifiant: hal-00875690
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auteur: Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre: Dispositif perfectionné de traitement ou de production d'images de tenseurs
article: France, Patent n° : International application number PCT/FR2006/000774. 2006
identifiant: hal-00875686
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2003

auteur: Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Electronic device for automatic registration of images
article: United States, Patent n° : US patent No US 6,539,127 B1, Mars 25, 2003. 2003
identifiant: hal-00875677
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1999

auteur: Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Dispositif électronique de recalage automatique d'images
article: France, Patent n° : Brevet numéro No FR 98 09649. European extension EP0977148. 1999
identifiant: hal-00875674
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Poster communications

2023

auteur: Anna Calissano, Théodore Papadopoulo, Xavier Pennec, Samuel Deslauriers-Gauthier
titre: Graph Matching improves the Similarity of Structural Brain Networks
article: OHBM 2023 - Organization for Human Brain Mapping, Jul 2023, Montreal (Canada), Canada
identifiant: hal-04390489
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2022

auteur: Elodie Maignant, Xavier Pennec, Alain Trouvé
titre: Looking for invariance in Locally Linear Embedding
article: Curves and Surfaces 2022, Jun 2022, Arcachon, France
identifiant: hal-03909427
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2016

auteur: Nina Miolane, Xavier Pennec, Susan Holmes
titre: Towards a unified bayesian geometric framework for template estimation in Computational Anatomy
article: International Society of Bayesian Analysis: World Meeting, Jun 2016, Cagliari, Italy.
identifiant: hal-01396716
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2014

auteur: Jan L. Bruse, Kristin Mcleod, Giovanni Biglino, Tain-Yen Hsia, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Andrew M. Taylor, Silvia Schievano
titre: A Statistical Shape Atlas of the Surgically Reconstructed Aortic Arch in Patients With Hypoplastic Left Heart Syndrome
article: 7th World Congress of Biomechanics, Boston 2014, Jul 2014, Boston, United States. , 2014
identifiant: hal-01205176
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2012

auteur: Viviana Siless, Pamela Guevara, Xavier Pennec, Bertrand Thirion, Pierre Fillard
titre: Joint T1 and brain fiber diffeomorphic registration using the demons
article: Organization for the Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
identifiant: hal-00828387
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Proceedings

2018

auteur: Martin Bauer, Nicolas Charon, Philipp Harms, Boris Khesin, Alice Le Brigant, Elodie Maignant, Stephen Marsland, Peter Michor, Xavier Pennec, Stephen C. Preston, Stefan Sommer, François-Xavier Vialard
titre: Math in the Black Forest: Workshop on New Directions in Shape Analysis
article: Published by the authors, 2018
identifiant: hal-01923588
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2015

auteur: Stanley Durrleman, Thomas P. Fletcher, Guido Gerig, Marc Niethammer, Xavier Pennec
titre: Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data
article: Durrleman, Stanley; Fletcher, Thomas P.; Gerig, Guido; Niethammer, Marc ; Pennec, Xavier STIA 2014 - Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Sep 2014, Cambridge, United States. 8682, Springer International Publishing, pp.89, 2015, Lecture notes in computer science, 978-3-319-14904-2. ⟨10.1007/978-3-319-14905-9⟩
identifiant: hal-01114150
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-14905-9
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auteur: Xavier Pennec, Sarang Joshi, Mads Nielsen, Thomas P. Fletcher, Stanley Durrleman, Stefan Sommer
titre: Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015)
article: Pennec, Xavier and Joshi, Sarang and Nielsen, Mads and Fletcher, Thomas P. and Durrleman, Stanley and Sommer, Stefan Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015), Oct 2015, Munich, Germany. , pp.173, 2015
identifiant: hal-01203812
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2012

auteur: Xavier Pennec
titre: Proceedings of the MICCAI 2012 Workshops, Challenges and Tutorials
article: 2012
identifiant: hal-00813857
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Reports

2023

auteur: Frédéric Blanqui, Anne Canteaut, Hidde De Jong, Sébastien Imperiale, Nathalie Mitton, Guillaume Pallez, Xavier Pennec, Xavier Rival, Bertrand Thirion
titre: Recommendations on "Grey-Zone Publishers
article: Inria. 2023, pp.1-3
identifiant: hal-04201298
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auteur: Frédéric Blanqui, Anne Canteaut, Hidde de Jong, Sébastien Imperiale, Nathalie Mitton, Guillaume Pallez, Xavier Pennec, Xavier Rival, Bertrand Thirion
titre: Recommandations sur les « éditeurs de la zone grise »
article: Inria. 2023, pp.1-3
identifiant: hal-04001505
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2020

auteur: Romain Bussone, Xavier Pennec, Colin Quentinet, Pierre Camps, Sophie Goudemez, Gilbert Mari, Olivier Grauby, Jean-Marc Vallet, Zuzana Fekiacova, Lionel Catsoyannis, André Lachaume, Michel Radecki, Gabriel Létard, David Geoffroy
titre: Relevés des travaux protohistoriques des mines de cuivre natif de Roua
article: SRA PACA (Aix-en-Provence). 2020
identifiant: hal-04270740
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2019

auteur: Romain Bussone, Xavier Pennec, Gilbert Mari, Olivier Grauby, Jean-Marc Vallet, Zuzana Fekiacova, Marco Guerrin, Fabien Belhaoues
titre: Relevés des travaux protohistoriques des mines de Roua et prospection thématique sur l'exploitation du cuivre du Dôme de Barrot à la Protohistoire
article: SRA PACA (Aix-en-Provence). 2019
identifiant: hal-04270732
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2014

auteur: Martin Bauer, Martins Bruveris, Philipp Harms, Boris Khesin, Stephen Marsland, Peter Michor, Klas Modin, Olaf Müller, Xavier Pennec, Stefan Sommer, François-Xavier Vialard
titre: Math in the Cabin - Shape Analysis Workshop in Bad Gastein
article: [Research Report] Brunel University London; University of Vienna. 2014
identifiant: hal-01076953
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2010

auteur: Xavier Pennec, Curzio Basso, Younes Boudjemline, Stanley Durrleman, Ender Konukoglu, Tommaso Mansi, Kristin Mcleod, Giacomo Pongiglione, Matteo Santoro, Maxime Sermesant, Bertrand Stos, Nicolas Toussaint, Gianluca Trocchio
titre: Third generation disease models: Image analysis tools, pediatric heart diseases, inflammatory diseases and brain tumors
article: [Technical Report] 2010
identifiant: hal-00813777
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2009

auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Guido Gerig, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: Spatiotemporal Atlas Estimation for Developmental Delay Detection in Longitudinal Datasets
article: [Research Report] RR-6952, INRIA. 2009, 17 p
identifiant: inria-00408293
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2008

auteur: Stanley Durrleman, Xavier Pennec, Alain Trouvé, Nicholas Ayache
titre: Sparse Approximation of Currents for Statistics on Curves and Surfaces
article: [Research Report] RR-6571, INRIA. 2008, pp.15
identifiant: inria-00286014
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2007

auteur: Pierre Fillard, Xavier Pennec, Paul M. Thompson, Nicholas Ayache
titre: Evaluating Brain Anatomical Correlations via Canonical Correlation Analysis of Sulcal Lines
article: [Research Report] RR-6241, INRIA. 2007, pp.12
identifiant: inria-00159699
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2006

auteur: Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Bi-invariant Means in Lie Groups. Application to Left-invariant Polyaffine Transformations
article: [Research Report] RR-5885, INRIA. 2006
identifiant: inria-00071383
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auteur: Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Affine Registration
article: [Research Report] RR-5865, INRIA. 2006, pp.46
identifiant: inria-00070161
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auteur: Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Kiralee M. Hayashi, Paul M. Thompson, Nicholas Ayache
titre: Measuring Brain Variability by Extrapolating Sparse Tensor Fields Measured on Sulcal Lines
article: [Research Report] RR-5887, INRIA. 2006
identifiant: inria-00071381
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec, David Emsellem, Diane Lingrand
titre: MOTEUR: a data-intensive service-based workflow manager
article: 2006, pp.37
identifiant: hal-00691832
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auteur: Tristan Glatard, Johan Montagnat, Xavier Pennec
titre: Optimizing jobs timeouts on clusters and production grids
article: 2006, pp.23
identifiant: hal-00691828
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auteur: Jean-Marc Peyrat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Xavier Pennec, Chenyang Xu, Elliot R. Mcveigh, Nicholas Ayache
titre: Towards a Statistical Atlas of Cardiac Fiber Architecture
article: [Research Report] RR-5906, INRIA. 2006
identifiant: inria-00071359
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2005

auteur: Vincent Arsigny, Pierre Fillard, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Fast and Simple Computations on Tensors with Log-Euclidean Metrics.
article: [Research Report] RR-5584, INRIA. 2005, pp.42
identifiant: inria-00070423
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auteur: Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Joint Estimation and Smoothing of Clinical DT-MRI with a Log-Euclidean Metric
article: [Research Report] RR-5607, INRIA. 2005, pp.18
identifiant: inria-00070400
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2004

auteur: Xavier Pennec, Pierre Fillard, Nicholas Ayache
titre: A Riemannian Framework for Tensor Computing
article: RR-5255, INRIA. 2004, pp.34
identifiant: inria-00070743
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auteur: Xavier Pennec
titre: Probabilities and Statistics on Riemannian Manifolds : A Geometric approach
article: RR-5093, INRIA. 2004
identifiant: inria-00071490
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2003

auteur: Vincent Arsigny, Xavier Pennec
titre: A novel family of geometrical transformations: Polyrigid transformations. Application to the registration of histological slices
article: RR-4837, INRIA. 2003
identifiant: inria-00071748
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auteur: Stephane Nicolau, Xavier Pennec, Luc Soler, Nicholas Ayache
titre: Validation of a New 3D/2D Registration Criterion including Error Prediction. Application to Image Guided Radio-Frequency Ablation of the Liver Tumors
article: [Research Report] RR-4993, INRIA. 2003
identifiant: inria-00071585
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2002

auteur: Sébastien Granger, Xavier Pennec
titre: Statistiques exactes et approchées sur les normales aléatoires
article: RR-4533, INRIA. 2002
identifiant: inria-00072055
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2001

auteur: Sébastien Granger, Xavier Pennec, Alexis Roche
titre: Rigid Point-Surface Registration using Oriented Points and an EM Variant of ICP for Computer Guided Oral Implantology
article: RR-4169, INRIA. 2001
identifiant: inria-00072453
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auteur: Sébastien Ourselin, Xavier Pennec, Radu Stefanescu, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache
titre: Robust Registration of Multi-Modal Medical Images: Towards Real-Time Clinical Applications
article: RR-4333, INRIA. 2001
identifiant: inria-00072254
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2000

auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache, Pascal Cachier
titre: Tracking Brain Deformations in Time-Sequences of 3D US Images
article: [Research Report] RR-4091, INRIA. 2000
identifiant: inria-00072541
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auteur: Alexis Roche, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Sébastien Ourselin
titre: Generalized Correlation Ratio for Rigid Registration of 3D Ultrasound with MR Images
article: [Research Report] RR-3980, INRIA. 2000, pp.24
identifiant: inria-00072667
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1999

auteur: Pascal Cachier, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Fast Non Rigid Matching by Gradient Descent: Study and Improvements of the "Demons" Algorithm
article: RR-3706, INRIA. 1999
identifiant: inria-00072962
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1998

auteur: Sébastien Ourselin, Alexis Roche, Gérard Subsol, Xavier Pennec, Christophe Sattonnet
titre: Automatic Alignment of Histological Sections for 3D Reconstruction and Analysis
article: RR-3595, INRIA. 1998
identifiant: inria-00073084
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auteur: Xavier Pennec
titre: Computing the Mean of Geometric Features Application to the Mean Rotation
article: RR-3371, INRIA. 1998
identifiant: inria-00073318
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auteur: Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
titre: Multimodal Image Registration by Maximization of the Correlation Ratio
article: RR-3378, INRIA. 1998
identifiant: inria-00073311
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1996

auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: Randomness and Geometric Features in Computer Vision
article: RR-2820, INRIA. 1996
identifiant: inria-00073871
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1995

auteur: Xavier Pennec, Jean-Philippe Thirion
titre: Validation of 3-D Registration Methods based on Points and Frames
article: RR-2470, INRIA. 1995
identifiant: inria-00074205
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1994

auteur: Xavier Pennec, Nicholas Ayache
titre: An 0(n2) algorithm for 3D substructure matching of proteins
article: [Research Report] RR-2274, INRIA. 1994
identifiant: inria-00074397
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1993

auteur: Xavier Pennec
titre: Correctness and robustness of 3D rigid matching with bounded sensor error
article: RR-2111, INRIA. 1993
identifiant: inria-00074561
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Theses

1996

auteur: Xavier Pennec
titre: Uncertainty in recognition and registration problems - Applications in medical imaging and molecular biology
article: Informatique [cs]. Ecole Polytechnique X, 1996. Français. ⟨NNT : ⟩
identifiant: tel-00633175
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Preprints, Working Papers, ...

2024

auteur: Dimbihery Rabenoro, Xavier Pennec
titre: A geometric framework for asymptotic inference of principal subspaces in PCA
article: 2024
identifiant: hal-03842125
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auteur: Dimbihery Rabenoro, Xavier Pennec
titre: Effective formulas for the geometry of normal homogeneous spaces. Application to flag manifolds
article: 2024
identifiant: hal-04232479
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auteur: Tom Szwagier, Xavier Pennec
titre: The curse of isotropy: from principal components to principal subspaces
article: 2024
identifiant: hal-04171853
DOI: DOI : 10.48550/arXiv.2307.15348
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2023

auteur: Morten Akhøj, James Benn, Erlend Grong, Stefan Sommer, Xavier Pennec
titre: Principal subbundles for dimension reduction
article: 2023
identifiant: hal-04156036
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auteur: Blanche Buet, Xavier Pennec
titre: Flagfolds
article: 2023
identifiant: hal-04112465
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2022

auteur: James Benn, Anna Calissano, Stephen Marsland, Xavier Pennec
titre: The Currents Space of Graphs
article: 2022
identifiant: hal-03910825
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2021

auteur: Talia Nir, Jean-Paul Fouche, Jintanat Ananworanich, Beau Ances, Jasmina Boban, Bruce Brew, Linda Chang, Joga Chaganti, Christopher R.K. Ching, Lucette Cysique, Thomas Ernst, Joshua Faskowitz, Vikash Gupta, Jaroslaw Harezlak, Jodi Heaps-Woodruff, Charles Hinkin, Jacqueline Hoare, John Joska, Kalpana Kallianpur, Taylor Kuhn, Hei Lam, Meng Law, Christine Lebrun-Frenay, Andrew Levine, Lydiane Mondot, Beau Nakamoto, Bradford Navia, Xavier Pennec, Eric Porges, Cecilia Shikuma, April Thames, Victor Valcour, Matteo Vassallo, Adam Woods, Paul Thompson, Ronald Cohen, Robert Paul, Dan Stein, Neda Jahanshad
titre: Smaller limbic structures are associated with greater immunosuppression in over 1000 HIV-infected adults across five continents: Findings from the ENIGMA-HIV Working Group
article: 2021
identifiant: hal-03063822
DOI: DOI : 10.1101/724583
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2019

auteur: Nina Miolane, Johan Mathe, Claire Donnat, Mikael Jorda, Xavier Pennec
titre: geomstats: a Python Package for Riemannian Geometry in Machine Learning
article: 2019
identifiant: hal-01974572
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auteur: Xavier Pennec
titre: Curvature effects on the empirical mean in Riemannian and affine Manifolds: a non-asymptotic high concentration expansion in the small-sample regime
article: 2019
identifiant: hal-02157952
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2018

auteur: Xavier Pennec
titre: Parallel Transport with Pole Ladder: a Third Order Scheme in Affine Connection Spaces which is Exact in Affine Symmetric Spaces
article: 2018
identifiant: hal-01799888
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