Publications HAL de Annabelle, Collin; Christele, Etchegaray; Christèle, Etchegaray; Olivier, Saut; Clair, Poignard; Baudouin, Senneville du labo/EPI MONC

2024

Journal articles

titre
Population-based estimation for PDE system - Applications in electroporation of tumor spheroids.
auteur
Annabelle Collin
article
ESAIM: Control, Optimisation and Calculus of Variations, 2024, ⟨10.1051/cocv/2024019⟩
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https://inria.hal.science/hal-04508314/file/rev_article_cocv_Collin.pdf BibTex
titre
Effective interface conditions for a porous medium type problem
auteur
Giorgia Ciavolella, Noemi David, Alexandre Poulain
article
Interfaces and Free Boundaries : Mathematical Analysis, Computation and Applications, 2024, ⟨10.4171/ifb/505⟩
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https://hal.science/hal-03231456/file/Submission_final.pdf BibTex

Conference papers

titre
Efficient Posterior Sampling For Diverse Super-Resolution with Hierarchical VAE Prior
auteur
Jean Prost, Antoine Houdard, Andrés Almansa, Nicolas Papadakis
article
VISAPP 2024 - 19th International Conference on Computer Vision Theory and Applications, Feb 2024, Rome, Italy. ⟨10.5220/0012352800003660⟩
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https://hal.science/hal-03675314/file/2205.10347.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
A model for membrane degradation using a gelatin invadopodia assay
auteur
Giorgia Ciavolella, Nathalie Ferrand, Michèle Sabbah, Benoît Perthame, Roberto Natalini
article
2024
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04446414/file/Manuscript.pdf BibTex
titre
Plug-and-Play image restoration with Stochastic deNOising REgularization
auteur
Marien Renaud, Jean Prost, Arthur Leclaire, Nicolas Papadakis
article
2024
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https://arxiv.org/pdf/2402.01779 BibTex
titre
Non-local matching of superpixel-based deep features for color transfer and colorization
auteur
Roxane Leduc, Hernan Carrillo, Nicolas Papadakis
article
2024
Accès au texte intégral et bibtex
https://cnrs.hal.science/hal-04394848/file/ipol.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
Deciphering Immediate Post-Pulse Membrane Resealing from 4-Electrode Impedance Measurements by Numerical Modeling
auteur
Annabelle Collin, Tomás García-Sánchez, Sergio Corridore, Lluis Mir, Clair Poignard
article
Bioelectricity, 2023, 5 (4), pp.266-278. ⟨10.1089/bioe.2023.0012⟩
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https://inria.hal.science/hal-04361087/file/Hal_BioImpedance.pdf BibTex
titre
Integration of operator-validated contours in deformable image registration for dose accumulation in radiotherapy
auteur
Lando Bosma, Mario Ries, Baudouin Denis de Senneville, Bas Raaymakers, Cornel Zachiu
article
Physics and Imaging in Radiation Oncology, 2023, 27, pp.100483. ⟨10.1016/j.phro.2023.100483⟩
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https://hal.science/hal-04268748/file/Bosma_phiRO_Contour_guidance.pdf BibTex
titre
Development and external validation of a prediction model for the transition from mild to moderate or severe form of COVID-19
auteur
Maéva Zysman, Julien Asselineau, Olivier Saut, Eric Frison, Mathilde Oranger, Arnaud Maurac, Jérémy Charriot, Rkia Achkir, Sophie Regueme, Emilie Klein, Sébastien Bommart, Arnaud Bourdin, Gael Dournes, Julien Casteigt, Alain Blum, Gilbert Ferretti, Bruno Degano, Rodolphe Thiébaut, Francois Chabot, Patrick Berger, Francois Laurent, Ilyes Benlala
article
European Radiology, 2023, 33, pp.9262-9274. ⟨10.1007/s00330-023-09759-x⟩
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https://hal.science/hal-04153209/file/2023%20%20Zysman%20et%20al.%2C%20Development.pdf BibTex
titre
Evaluation of four tumour growth models to describe the natural history of meningiomas
auteur
Julien Engelhardt, Virginie Montalibet, Olivier Saut, Hugues Loiseau, Annabelle Collin
article
EBioMedicine, 2023, 94, pp.104697. ⟨10.1016/j.ebiom.2023.104697⟩
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https://hal.science/hal-04346355/file/article_mening.pdf BibTex
titre
Generating high-resolution synthetic CT from lung MRI with ultrashort echo-times: initial evaluation in cystic fibrosis
auteur
Arthur Longuefosse, Julien Raoult, Ilyes Benlala, Baudouin Denis de Senneville, Thomas Benkert, Julie Macey, Stéphanie Bui, Patrick Berger, Gilbert Ferretti, Jean-Yves Gaubert, Renan Liberge, Antoine Hutt, Baptiste Morel, François Laurent, Fabien Baldacci, Gaël Dournes
article
Radiology, 2023, 308 (1), ⟨10.1148/radiol.230052⟩
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https://hal.science/hal-04268631/file/2023_Radiology_MR_to_CT_GAN.pdf BibTex
titre
Phase-field model of bilipid membrane electroporation
auteur
Pedro Jaramillo-Aguayo, Annabelle Collin, Clair Poignard
article
Journal of Mathematical Biology, 2023, 87 (18), ⟨10.1007/s00285-023-01956-y⟩
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https://inria.hal.science/hal-04145549/file/EPModel_Revised_Bk.pdf BibTex
titre
Non-Contrast-Enhanced Functional Lung MRI to Evaluate Treatment Response of Allergic Bronchopulmonary Aspergillosis in Patients With Cystic Fibrosis: A Pilot Study
auteur
Ilyes Benlala, Rabea Klaar, Thomas Gaass, Julie Macey, Stéphanie Bui, Baudouin Denis de Senneville, Patrick Berger, François Laurent, Gael Dournes, Julien Dinkel
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, In press, ⟨10.1002/jmri.28844⟩
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https://hal.science/hal-04268654/file/JMRI_2023_Benlala.pdf BibTex
titre
Risk Factors Associated with Traumatic Brain Injury and Implementation of Guidelines for Requesting Computed Tomography After Head Trauma Among Children in France
auteur
Stanislas Roche, Amandine Crombé, Axel Benhamed, Jean-François Hak, Alexia Dabadie, Clémence Fauconnier-Fatus, Adelaïde Rega, Grégoire Pech-Gourg, Karim Tazarourte, Mylène Seux, Adrien Acquier, Guillaume Gorincour
article
JAMA Network Open, 2023, 6 (5), pp.e2311092. ⟨10.1001/jamanetworkopen.2023.11092⟩
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https://hal.science/hal-04452602/file/2023%20Risk%20Factors%20Associated%20with%20Traumatic%20Brain%20Injury%20and%20Implementation%20of%20Guidelines%20for%20Requesting%20Computed%20Tomography%20After%20Head%20Trauma%20Among%20Children%20in%20France%201682344049.38568.pdf BibTex
titre
3D motion strategy for online volumetric thermometry using simultaneous multi-slice EPI at 1.5T: an evaluation study
auteur
Valéry Ozenne, Pierre Bour, Baudouin Denis de Senneville, Bruno Quesson
article
International Journal of Hyperthermia, 2023, 40 (1), ⟨10.1080/02656736.2023.2194595⟩
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https://hal.science/hal-04107830/file/3D%20motion%20strategy%20for%20online%20volumetric%20thermometry%20using%20simultaneous%20multi%20slice%20EPI%20at%201%205T%20an%20evaluation%20study.pdf BibTex
titre
Technical Note: Intensity-based quality assurance criteria for deformable image registration in image-guided radiotherapy
auteur
Lando Bosma, Cornel Zachiu, Baudouin Denis de Senneville, Bas Raaymakers, Mario Ries
article
Medical Physics, 2023, 50 (9), pp.5715-5722. ⟨10.1002/mp.16367⟩
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https://hal.science/hal-04268726/file/Bosma_QA.pdf BibTex
titre
Life cycle assessment of ICT in higher education: a comparison between desktop and single-board computers
auteur
Philippe Loubet, Adrien Vincent, Annabelle Collin, Corinne Dejous, Anthony Ghiotto, Christophe Jego
article
International Journal of Life Cycle Assessment, 2023, ⟨10.1007/s11367-022-02131-z⟩
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https://inria.hal.science/hal-03938948/file/LCA_of_ICT_in_higher_education_Loubet_2023.pdf BibTex
titre
How impedance measurements and imaging can be used to characterize the conductivity of tissues during the workflow of an electroporation-based therapy
auteur
O. Sutter, D. Voyer, J.-P. Tasu, C. Poignard
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2023, pp.1-9. ⟨10.1109/TBME.2023.3336193⟩
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BibTex
titre
Using Population Based Kalman Estimator to Model COVID-19 Epidemic in France: Estimating the Effects of Non-Pharmaceutical Interventions on the Dynamics of Epidemic
auteur
Annabelle Collin, Boris P. Hejblum, Carole Vignals, Laurent Lehot, Rodolphe Thiébaut, Philippe Moireau, Mélanie Prague
article
The international journal of biostatistics, In press, ⟨10.1515/ijb-2022-0087⟩
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https://hal.science/hal-04151651/file/2021.07.09.21260259v4.full.pdf BibTex

Conference papers

titre
Convergent Bregman Plug-and-Play Image Restoration for Poisson Inverse Problems
auteur
Samuel Hurault, Ulugbek Kamilov, Arthur Leclaire, Nicolas Papadakis
article
Neural Information Processing Systems (NeurIPS'23), Dec 2023, New Orleans, United States
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https://arxiv.org/pdf/2306.03466 BibTex
titre
A Deep Attention-Multiple Instance Learning Framework to Predict Survival of Soft-Tissue Sarcoma from Whole Slide Images
auteur
Van-Linh Le, Audrey Michot, Amandine Crombé, Carine Ngo, Charles Honoré, Jean-Michel Coindre, Olivier Saut, Francois Le-Loarer
article
MICCAI 2023 - CaPTion Workshop on Cancer Prevention through early detecTion, MICCAI, Oct 2023, Vancouver, Canada. pp.3-16, ⟨10.1007/978-3-031-45350-2_1⟩
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https://inria.hal.science/hal-04235077/file/978-3-031-45350-2_1.pdf BibTex
titre
RRc-UNet 3D for Lung Tumor Segmentation from CT Scans of Non-Small Cell Lung Cancer Patients
auteur
Van-Linh Le, Olivier Saut
article
ICCV CVAMD 2023 - Workshop of International Conference on Computer Vision, Oct 2023, Paris, France. pp.2316-2325
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https://inria.hal.science/hal-04236510/file/Le_RRc-UNet_3D_for_Lung_Tumor_Segmentation_from_CT_Scans_of_ICCVW_2023_paper.pdf BibTex
titre
Inverse problem regularization with hierarchical variational autoencoders
auteur
Jean Prost, Antoine Houdard, Andres Almansa, Nicolas Papadakis
article
IEEE International Conference on Computer Vision (ICCV'23), Oct 2023, Paris, France
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https://arxiv.org/pdf/2303.11217 BibTex
titre
Electrocardiology Modeling After Catheter Ablations for Atrial Fibrillation
auteur
Simone Nati Poltri, Guido Caluori, Pierre Jaïs, Annabelle Collin, Clair Poignard
article
FIMH 2023 - 12th International Conference Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2023, Lyon, France. pp.184-193, ⟨10.1007/978-3-031-35302-4_19⟩
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https://hal.science/hal-04155159/file/article_HAL.pdf BibTex
titre
Coordinate-Unet 3D for segmentation of lung parenchyma
auteur
Van-Linh Le, Olivier Saut
article
WSCG 2023 – 31th International Conference in Central Europe on Computer Graphics, Visualization and Computer Vision, May 2023, Pilsen, Czech Republic. pp.36-42, ⟨10.24132/CSRN.3301.6⟩
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https://inria.hal.science/hal-04222468/file/wscg_main_final_08052023.pdf BibTex
titre
Lung CT Synthesis Using GANs with Conditional Normalization on Registered Ultrashort Echo-Time MRI
auteur
Arthur Longuefosse, Gaël Dournes, Ilyes Benlala, Baudouin Denis de Senneville, François Laurent, Pascal Desbarats, Fabien Baldacci
article
ISBI 2023 - 20th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2023, Cartagena de Indias, Colombia. pp.1-5, ⟨10.1109/ISBI53787.2023.10230331⟩
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https://hal.science/hal-04268682/file/Longuefosse_ISBI23_CR.pdf BibTex
titre
MR to CT synthesis using GANs : a practical guide applied to thoracic imaging
auteur
Arthur Longuefosse, Baudouin Denis de Senneville, Gaël Dournes, Ilyes Benlala, François Laurent, Pascal Desbarats, Fabien Baldacci
article
VISIGRAPP 2023 - International Joint Conference on Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications, Feb 2023, Lisbon, Portugal. pp.268-274, ⟨10.5220/0011895700003417⟩
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https://hal.science/hal-04268701/file/IVAPP_2023_MR_to_CT_synthesis.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Mathematical modeling and data assimilation for biomedical problems.
auteur
Annabelle Collin
article
Mathematics [math]. Université de Bordeaux, 2023
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https://inria.hal.science/tel-04399487/file/HDRThesis.pdf BibTex

Other publications

titre
Percutaneous irreversible electroporation for the treatment of pancreatic insulinoma
auteur
Jean-Pierre Tasu, Mathilde Vionnet, Stéphane Velasco, Luc Lafitte, Clair Poignard
article
2023, ⟨10.1016/j.diii.2023.03.006⟩
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BibTex

Poster communications

titre
Mathematical Modeling of Pulsed Electric Field Cardiac Ablation
auteur
Simon Bihoreau, Guido Caluori, Annabelle Collin, Pierre Jaïs, Michael Leguèbe, Clair Poignard
article
RICAM - Workshop 4 "Modeling and simulation of ablation treatments", Nov 2023, Linz, Austria
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https://hal.science/hal-04389083/file/poster_RICAM_Final3.pdf BibTex

Theses

titre
Mathematical and numerical modeling of bilipid membrane electroporation : A phase ordering kinetics approach
auteur
Pedro Jaramillo
article
General Mathematics [math.GM]. Université de Bordeaux, 2023. English. ⟨NNT : 2023BORD0398⟩
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https://theses.hal.science/tel-04400477/file/JARAMILLO_PEDRO_2023.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Deciphering circulating tumor cells binding in a microfluidic system thanks to a parameterized mathematical model
auteur
Giorgia Ciavolella, Julien Granet, Jacky Goetz, Nael Osmani, Christèle Etchegaray, Annabelle Collin
article
2023
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https://inria.hal.science/hal-04253803/file/article.pdf BibTex
titre
An individual-based model to explore the impact of psychological stress on immune infiltration into tumour spheroids
auteur
Emma Leschiera, Gheed Al-Hity, Melanie S. Flint, Chandrasekhar Venkataraman, Tommaso Lorenzi, Luis Almeida, Chloe Audebert
article
2023
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https://arxiv.org/pdf/2307.12627 BibTex

2022

Journal articles

titre
Endoscopic in-situ recognition of urinary stones during LASER-induced stone fragmentation: a modern, effective and essential approach in the diagnostic process in urolithiasis
auteur
Vincent Estrade, Baudouin Denis de Senneville, Laurent Facq, Michel Daudon
article
Comptes Rendus. Chimie, 2022, 25 (S1), pp.407-416. ⟨10.5802/crchim.162⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03772492/file/ArticleCRC_EstradeSennevilleDaudon_final_version.pdf BibTex
titre
Tumor growth monitoring in breast cancer xenografts: A good technique for a strong ethic
auteur
Anne Rodallec, Cristina Vaghi, Joseph Ciccolini, Raphaëlle Fanciullino, Sebastien Benzekry
article
PLoS ONE, 2022, 17 (9), pp.e0274886. ⟨10.1371/journal.pone.0274886⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03924541/file/journal.pone.0274886.pdf BibTex
titre
Practical identifiability analysis of a mechanistic model for the time to distant metastatic relapse and its application to renal cell carcinoma
auteur
Arturo Álvarez-Arenas, Wilfried Souleyreau, Andrea Emanuelli, Lindsay S Cooley, Jean-Christophe Bernhard, Andreas Bikfalvi, Sébastien Benzekry
article
PLoS Computational Biology, 2022, 18, ⟨10.1371/journal.pcbi.1010444⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03921339/file/lvarez-Arenas_Benzekry_2022_PLOS%20Computational%20Biology_Practical%20identifiability%20analysis%20of%20a%20mechanistic%20model%20for%20the%20time%20to%20distant%20metastatic%20relapse%20and%20its%20application%20to%20renal%20cell%20carcinoma.pdf BibTex
titre
Deep morphological recognition of kidney stones using intra-operative endoscopic digital videos
auteur
Vincent Estrade, Michel Daudon, Emmanuel Richard, Jean-Christophe Bernhard, Franck Bladou, Gregoire Robert, Laurent Facq, Baudouin Denis de Senneville
article
Physics in Medicine and Biology, 2022, 67 (16), pp.165006. ⟨10.1088/1361-6560/ac8592⟩
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https://hal.science/hal-03772477/file/2022_Estrade_deep_Video_recognition.pdf BibTex
titre
Comparison of MRI-based response criteria and radiomics for the prediction of early response to transarterial radioembolization in patients with hepatocellular carcinoma
auteur
Godefroy Aujay, Christèle Etchegaray, Jean-Frederic Blanc, Bruno Lapuyade, Panteleimon Papadopoulos, Marie-Anaïg Pey, Laurence Bordenave, Hervé Trillaud, Olivier Saut, Jean-Baptiste Pinaquy
article
Diagnostic and Interventional Imaging, 2022, 103 (7-8), pp.360-366. ⟨10.1016/j.diii.2022.01.009⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03930592/file/Aujay_Manuscript_withoutFigures%20%281%29.pdf BibTex
titre
Estimation for dynamical systems using a population-based Kalman filter – Applications in computational biology
auteur
Annabelle Collin, Mélanie Prague, Philippe Moireau
article
MathematicS In Action, 2022, ⟨10.5802/msia.25⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02869347/file/hal-version-kalma-pop-math-in-action.pdf BibTex
titre
Macro-scale models for fluid flow in tumour tissues: impact of microstructure properties
auteur
Cristina Vaghi, Raphaëlle Fanciullino, Sébastien Benzekry, Clair Poignard
article
Journal of Mathematical Biology, 2022, 84, pp.27. ⟨10.1007/s00285-022-01719-1⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02891573/file/Revised_manuscript_line_numbers.pdf BibTex
titre
Asymptotic analysis of a biphase tumor fluid flow: the weak coupling case.
auteur
Cristina Vaghi, Sébastien Benzekry, Clair Poignard
article
Applied Mathematics and Computation, 2022, 413, pp.126635. ⟨10.1016/j.amc.2021.126635⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03354766/file/2101.03400.pdf BibTex
titre
Deep Learning for the Automatic Quantification of Pleural Plaques in Asbestos-Exposed Subjects
auteur
Ilyes Benlala, Baudouin Denis de Senneville, Gael Dournes, Morgane Menant, Celine Gramond, Isabelle Thaon, Benedicte Clin, Patrick Brochard, Antoine Gislard, Pascal Andujar, Soizick Chammings, Justine Gallet, Aude Lacourt, Fleur Delva, Christophe Paris, Gilbert Ferretti, Jean-Claude Pairon, Francois Laurent
article
International Journal of Environmental Research and Public Health, 2022, 19 (3), pp.1417. ⟨10.3390/ijerph19031417⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03610113/file/BPh_IJERPH_2022_Benlala.pdf BibTex
titre
Towards automatic recognition of pure and mixed stones using intra‐operative endoscopic digital images
auteur
Vincent Estrade, Michel Daudon, Emmanuel Richard, Jean‐christophe Bernhard, Franck Bladou, Grégoire Robert, Baudouin Denis de Senneville
article
BJU International, 2022, 129 (2), pp.234-242. ⟨10.1111/bju.15515⟩
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https://hal.science/hal-03453435/file/2021_Estrade_revision1_text_and_figures.pdf BibTex
titre
An Hybrid Model for Rectal Tumour Response Prediction during Radiotherapy
auteur
Sena Apeke, Laurent Gaubert, Nicolas Boussion, Dimitris Visvikis, Olivier Saut, Thierry Colin, Philippe Lambin, Vincent Rodin, Pascal Redou
article
Open Journal of Biophysics, 2022, 12 (04), pp.245-264. ⟨10.4236/ojbiphy.2022.124012⟩
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BibTex
titre
Artificial intelligence in CT for quantifying lung changes in the era of CFTR modulators
auteur
Gael Dournes, Chase S Hall, Matthew M Willmering, Alan S Brody, Julie Macey, Stephanie Bui, Baudouin Denis de Senneville, Patrick Berger, François Laurent, Ilyes Benlala, Jason Woods
article
European Respiratory Journal, 2022, 59, pp.2100844. ⟨10.1183/13993003.00844-2021⟩
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https://hal.science/hal-03453536/file/AIinCF-ERJ-HAL.pdf BibTex
titre
Spatial mechanistic modeling for prediction of 3D multicellular spheroids behavior upon exposure to high intensity pulsed electric fields
auteur
Annabelle Collin, Hadrien Bruhier, Jelena Kolosnjaj, Muriel Golzio, Marie-Pierre Rols, Clair Poignard
article
AIMS bioengineering, 2022, 9 (2), pp.102-122. ⟨10.3934/bioeng.2022009⟩
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https://inria.hal.science/hal-03700689/file/sphero-hal.pdf BibTex

Conference papers

titre
Automated needle localisation for electric field computation during an electroporation ablation
auteur
Eloïse Inacio, Luc Lafitte, Olivier Sutter, Olivier Seror, Baudouin Denis de Senneville, Clair Poignard
article
IEEE - MELECON 2022 - 21st Mediterranean Electrotechnical Conference, Jun 2022, Palerme, Italy. ⟨10.1109/MELECON53508.2022.9842866⟩
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https://hal.science/hal-03862360/file/IEEE_MELECON_2022_Inacio.pdf BibTex
titre
Analytic solutions of two problems of Biology and Physics using the Jacobi elliptic functions
auteur
François Dubois, Olivier Lafitte, Clair Poignard
article
16th International Symposium on Orthogonal Polynomials, Special Functions and Applications, Centre de recherches Mathématiques, Jun 2022, Montréal, Canada
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https://hal.science/hal-04004709/file/exposeOPSFA170622.pdf BibTex
titre
Reconstruction de la forme d’une pièce par super-résolution à l’aide de réponses impulsionnelles
auteur
Tom Sprunck, Khaoula Chahdi, Cédric Foy, Emmanuel Franck, Antoine Deleforge
article
16ème Congrès Français d'Acoustique, CFA2022, Société Française d'Acoustique; Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique, Apr 2022, Marseille, France
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BibTex

Book sections

titre
Pulsed Field Ablation for the Interventional Treatment of Cardiac Arrhythmias
auteur
Guido Caluori, Annabelle Collin, Clair Poignard, Pierre Jais
article
Innovative Treatment Strategies for Clinical Electrophysiology, Springer Nature Singapore, pp.29-47, 2022, Lecture Notes in Bioengineering, 978-981-19-6648-4. ⟨10.1007/978-981-19-6649-1_2⟩
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https://inria.hal.science/hal-04059570/file/PFA_Chapter.pdf BibTex

Special issue

titre
Microtissues in cancer modeling
auteur
Clair Poignard
article
AIMS bioengineering, 9, 2022, ⟨10.3934/bioeng.2022021⟩
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BibTex

2021

Journal articles

titre
Deciphering Tumour Tissue Organization by 3D Electron Microscopy and machine learning
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Fatma Zohra Khoubai, Marc Bevilacqua, Alexandre Labedade, Kathleen Flosseau, Christophe Chardot, Sophie Branchereau, Jean Ripoche, Stefano Cairo, Etienne Gontier, Christophe Grosset
article
Communications Biology, 2021, 4 (1), pp.1390. ⟨10.1038/s42003-021-02919-z⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03263488/file/s42003-021-02919-z.pdf BibTex
titre
Experimental and computational modeling for signature and biomarker discovery of renal cell carcinoma progression
auteur
Lindsay Cooley, Justine Rudewicz, Wilfried Souleyreau, Andrea Emanuelli, Arturo Alvarez-Arenas, Kim Clarke, Francesco Falciani, Maeva Dufies, Diether Lambrechts, Elodie Modave, Domitille Chalopin-Fillot, Raphael Pineau, Damien Ambrosetti, Jean-Christophe Bernhard, Alain Ravaud, Sylvie Négrier, Jean-Marc Ferrero, Gilles Pagès, Sebastien Benzekry, Macha Nikolski, Andreas Bikfalvi
article
Molecular Cancer, 2021, 20 (1), ⟨10.1186/s12943-021-01416-5⟩
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BibTex
titre
Voluntary Wheel Running Does Not Enhance Radiotherapy Efficiency in a Preclinical Model of Prostate Cancer: The Importance of Physical Activity Modalities?
auteur
Suzanne Dufresne, Cindy Richard, Arthur Dieumegard, Luz Orfila, Gregory Delpon, Sophie Chiavassa, Brice Martin, Laurent Rouvière, Jean-Michel Escoffre, Edward Oujagir, Baudouin Denis de Senneville, Ayache Bouakaz, Nathalie Rioux-Leclercq, Vincent Potiron, Amélie Rébillard
article
Cancers, 2021, 13 (21), pp.5402. ⟨10.3390/cancers13215402⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-03409985/file/cancers-13-05402%281%29.pdf BibTex
titre
Improved 18-FDG PET/CT diagnosis of multiple myeloma diffuse disease by radiomics analysis
auteur
Charles Mesguich, Elif Hindie, Baudouin Denis de Senneville, Ghoufrane Tlili, Jean-Baptiste Pinaquy, Gerald Marit, Olivier Saut
article
Nuclear Medicine Communications, 2021, 42 (10), pp.1135-1143. ⟨10.1097/MNM.0000000000001437⟩
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https://inria.hal.science/hal-03428536/file/Manuscript%20070420.pdf BibTex
titre
Quantitative investigation of dose accumulation errors from intra-fraction motion in MRgRT for prostate cancer
auteur
Lando Bosma, Cornel Zachiu, Mario Ries, Baudouin Denis de Senneville, Bas Raaymakers
article
Physics in Medicine and Biology, 2021, 66 (6), pp.065002. ⟨10.1088/1361-6560/abe02a⟩
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https://hal.science/hal-03453543/file/DoseAccumulationErrors__revised_.pdf BibTex
titre
Image based species identification of Globodera quarantine nematodes using computer vision and deep learning
auteur
Romain Thevenoux, Van-Linh Le, Heloïse Villessèche, Alain Buisson, Marie Beurton-Aimar, Eric Grenier, Laurent Folcher, Nicolas Parisey
article
Computers and Electronics in Agriculture, 2021, 186, ⟨10.1016/j.compag.2021.106058⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03319310/file/S0168169921000764.pdf BibTex
titre
A model-strengthened imaging biomarker for survival prediction in EGFR-mutated non-small-cell lung carcinoma patients treated with tyrosine kinase inhibitors
auteur
Annabelle Collin, Vladimir Groza, Louise Missenard, François Chomy, Thierry Colin, Jean Palussière, Olivier Saut
article
Bulletin of Mathematical Biology, 2021, 83 (6), ⟨10.1007/s11538-021-00902-7⟩
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https://inria.hal.science/hal-03428532/file/EGFR-BMB.pdf BibTex
titre
Joint state-parameter estimation for tumor growth model
auteur
Annabelle Collin, Thibaut Kritter, Clair Poignard, Olivier Saut
article
SIAM Journal on Applied Mathematics, 2021, 81 (2), ⟨10.1137/20M131775X⟩
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https://inria.hal.science/hal-02960283/file/Data_assimilation-review-nocolor.pdf BibTex
titre
Cerebral blood flow and cerebrovascular reactivity are preserved in a mouse model of cerebral microvascular amyloidosis
auteur
Leon P Munting, Marc Pp Derieppe, Ernst Suidgeest, Lydiane Hirschler, Matthias Jp van Osch, Baudouin Denis de Senneville, Louise van Der Weerd
article
eLife, 2021, 10, ⟨10.7554/eLife.61279⟩
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https://hal.science/hal-03453535/file/Tg_SwDI_HAL_v2.pdf BibTex
titre
MRI-Based Radiomics Input for Prediction of 2-Year Disease Recurrence in Anal Squamous Cell Carcinoma
auteur
Nicolas Giraud, Olivier Saut, Thomas Aparicio, Philippe Ronchin, Louis-Arnaud Bazire, Emilie Barbier, Claire Lemanski, Xavier Mirabel, Pierre-Luc Etienne, Astrid Lièvre, Wulfran Cacheux, Ariane Darut-Jouve, Christelle de La Fouchardière, Arnaud Hocquelet, Hervé Trillaud, Thomas Charleux, Gilles Breysacher, Delphine Argo-Leignel, Alexandre Tessier, Nicolas Magné, Meher Ben Abdelghani, Côme Lepage, Véronique Vendrely
article
Cancers, 2021, 13 (2), pp.193. ⟨10.3390/cancers13020193⟩
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https://inria.hal.science/hal-03428535/file/cancers-13-00193%282%29.pdf BibTex
titre
Deep correction of breathing-related artifacts in real-time MR-thermometry
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Pierrick Coupé, Mario Ries, Laurent Facq, Chrit Moonen
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, 2021, pp.101834. ⟨10.1016/j.compmedimag.2020.101834⟩
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https://hal.science/hal-03066089/file/2020_Deep_Thermometry_clean_copy.pdf BibTex
titre
Toward improved endoscopic examination of urinary stones: a concordance study between endoscopic digital pictures vs. Microscopy
auteur
Vincent Estrade, Baudouin Denis de Senneville, Paul Meria, Christophe Almeras, Franck Bladou, Jean-Christophe Bernhard, Gregoire Robert, Olivier Traxer, Michel Daudon
article
BJU International, 2021, 128 (3), pp.319-330. ⟨10.1111/bju.15312⟩
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https://hal.science/hal-03066139/file/BJU_clean.pdf BibTex
titre
On a magnetic skin effect in eddy current problems: the magnetic potential in magnetically soft materials
auteur
Victor Péron, Clair Poignard
article
Zeitschrift für Angewandte Mathematik und Physik, 2021, ⟨10.1007/s00033-021-01596-6⟩
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https://inria.hal.science/hal-02968889/file/VPCP_sept20.pdf BibTex

Book sections

titre
Mathematical Modeling of Gastro-Intestinal Metastasis Resistance to Tyrosine Kinase Inhibitors
auteur
Thierry Colin, Thomas Michel, Clair Poignard
article
Methods of Mathematical Oncology, 370, Springer Singapore, pp.15-49, 2021, Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, ⟨10.1007/978-981-16-4866-3_2⟩
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Books

titre
Methods of Mathematical Oncology
auteur
Takashi Suzuki, Clair Poignard, Mark Chaplain, Vito Quaranta
article
Springer Singapore, 370, 2021, Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, ⟨10.1007/978-981-16-4866-3⟩
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Reports

titre
Reconstruction of trajectories-Challenge AMIES
auteur
Kyriaki Dariva, Pedro Jaramillo
article
[Research Report] Univ Lyon, Université Claude-Bernard Lyon 1; Université de bordeaux. 2021, pp.1-15
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https://hal.science/hal-03364121/file/aHAL.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Asymptotic analysis of a biphase tumor fluid flow. The weak coupling case
auteur
Cristina Vaghi, Sébastien Benzekry, Clair Poignard
article
2021
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https://arxiv.org/pdf/2101.03400 BibTex

2020

Journal articles

titre
Impact of CT-based body composition parameters at baseline, their early changes and response in metastatic cancer patients treated with immune checkpoint inhibitors
auteur
Amandine Crombé, Michèle Kind, Maud Toulmonde, Antoine Italiano, Sophie Cousin
article
European Journal of Radiology, 2020, 133, pp.109340 -. ⟨10.1016/j.ejrad.2020.109340⟩
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https://hal.science/hal-03492983/file/S0720048X20305295.pdf BibTex
titre
Intensity Harmonization Techniques Influence Radiomics Features and Radiomics-based Predictions in Sarcoma Patients
auteur
Amandine Crombé, Michèle Kind, David Fadli, François Le Loarer, Antoine Italiano, Xavier Buy, Olivier Saut
article
Scientific Reports, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-72535-0⟩
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https://inria.hal.science/hal-03050686/file/NORMRI_R1_manuscript_SRcor_Clean2.pdf BibTex
titre
Anatomically-adaptive multi-modal image registration for image-guided external-beam radiotherapy
auteur
C Zachiu, Baudouin Denis de Senneville, T Willigenburg, J Voort van Zyp, J C J de Boer, B W Raaymakers, M Ries
article
Physics in Medicine and Biology, 2020, 65 (21), pp.215028. ⟨10.1088/1361-6560/abad7d⟩
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https://hal.science/hal-03453538/file/2020_SpatiallyAdaptiveRegistration.pdf BibTex
titre
Systematic review of sarcomas radiomics studies: Bridging the gap between concepts and clinical applications?
auteur
Amandine Crombé, David Fadli, Antoine Italiano, Olivier Saut, Xavier Buy, Michèle Kind
article
European Journal of Radiology, 2020, 132, pp.109283. ⟨10.1016/j.ejrad.2020.109283⟩
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BibTex
titre
Automated landmarking for insects morphometric analysis using deep neural networks
auteur
Van-Linh Le, Marie Beurton-Aimar, Akka Zemmari, Alexia Marie, Nicolas Parisey
article
Ecological Informatics, 2020, 60, ⟨10.1016/j.ecoinf.2020.101175⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03319822/file/main_ecolInf.pdf BibTex
titre
AssemblyNet: A large ensemble of CNNs for 3D whole brain MRI segmentation
auteur
Pierrick Coupé, Boris Mansencal, Michaël Clément, Rémi Giraud, Baudouin Denis de Senneville, Vinh-Thong Ta, Vincent Lepetit, José V. Manjón
article
NeuroImage, 2020, 219, pp.117026. ⟨10.1016/j.neuroimage.2020.117026⟩
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https://hal.science/hal-02930959/file/AssemblyNet_NI_HAL.pdf BibTex
titre
Machine Learning and Mechanistic Modeling for Prediction of Metastatic Relapse in Early-Stage Breast Cancer
auteur
Chiara Nicolò, Cynthia Périer, Mélanie Prague, Carine Bellera, Gaëtan Macgrogan, Olivier Saut, Sébastien Benzekry
article
JCO Clinical Cancer Informatics, 2020, 4, pp.259-274. ⟨10.1200/CCI.19.00133⟩
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https://hal.science/hal-02942177/file/manuscript_final_all.pdf BibTex
titre
Mechanistic Learning for Combinatorial Strategies With Immuno-oncology Drugs: Can Model-Informed Designs Help Investigators?
auteur
Joseph Ciccolini, Dominique Barbolosi, Nicolas André, Fabrice Barlesi, Sébastien Benzekry
article
JCO precision oncology, 2020, 108 (4), pp.486-491. ⟨10.1200/PO.19.00381⟩
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https://inria.hal.science/hal-03147084/file/final.pdf BibTex
titre
Physiological changes may dominate the electrical properties of liver during reversible electroporation: Measurements and modelling
auteur
Tomas Garcia-Sanchez, Damien Voyer, Clair Poignard, Lluis M. Mir
article
Bioelectrochemistry, 2020, 136, pp.107627. ⟨10.1016/j.bioelechem.2020.107627⟩
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https://inria.hal.science/hal-02914095/file/202008_Biochem_GVPM.pdf BibTex
titre
Deciphering the response and resistance to immunecheckpoint inhibitors in lung cancer with artificial intelligence-based analysis: the pioneer and quantic joint-projects
auteur
Joseph Ciccolini, Sébastien Benzekry, Fabrice Barlesi
article
British Journal of Cancer, 2020, 123 (3), pp.337-338. ⟨10.1038/s41416-020-0918-3⟩
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https://inria.hal.science/hal-03147110/file/Main%20text%20BJC%20comment%20ciccolini%20final.pdf BibTex
titre
Artificial Intelligence and Mechanistic Modeling for Clinical Decision Making in Oncology
auteur
Sébastien Benzekry
article
Clinical Pharmacology and Therapeutics, 2020, ⟨10.1002/cpt.1951⟩
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https://inria.hal.science/hal-02916941/file/manuscript_all.pdf BibTex
titre
Comparison and calibration of different electroporation models - Application to rabbit livers experiments
auteur
Gaspard Jankowiak, Cécile Taing, Clair Poignard, Annabelle Collin
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, 2020, CEMRACS 2018 - Numerical and mathematical modeling for biological and medical applications: deterministic, probabilistic and statistical descriptions, 67, ⟨10.1051/proc/202067014⟩
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https://hal.science/hal-02076894/file/ProcIRE.pdf BibTex
titre
Numerical modelling challenges for clinical electroporation ablation technique of liver tumors
auteur
Olivier Gallinato, Baudouin Denis de Senneville, Olivier Seror, Clair Poignard
article
Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2020, 15, ⟨10.1051/mmnp/2019037⟩
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https://inria.hal.science/hal-02493795/file/202002MNMP-GDSP.pdf BibTex
titre
Population modeling of tumor growth curves and the reduced Gompertz model improve prediction of the age of experimental tumors
auteur
Cristina Vaghi, Anne Rodallec, Raphaëlle Fanciullino, Joseph Ciccolini, Jonathan P Mochel, Michalis Mastri, Clair Poignard, John M.L. Ebos, Sébastien Benzekry
article
PLoS Computational Biology, 2020, 16 (2), pp.e1007178. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007178⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-02515955/file/journal.pcbi.1007178.pdf BibTex
titre
Biomechanical quality assurance criteria for deformable image registration algorithms used in radiotherapy guidance
auteur
Cornel Zachiu, Baudouin Denis de Senneville, Bas W. Raaymakers, Mario Ries
article
Physics in Medicine and Biology, 2020, ⟨10.1088/1361-6560/ab501d⟩
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BibTex
titre
Numerical modeling of floating potentials in electrokinetic problems using an asymptotic method
auteur
Damien Voyer, Sergio Corridore, Annabelle Collin, Riccardo Scorretti, Clair Poignard
article
IEEE Transactions on Magnetics, 2020, ⟨10.1109/TMAG.2019.2951942⟩
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https://hal.science/hal-02467851/file/202002IEEETM-VCCSP.pdf BibTex
titre
In Silico Electrical Modeling of Cell Aggregates
auteur
Floriane Gidel, Damien Voyer, Clair Poignard
article
IEEE Transactions on Magnetics, 2020, 56 (3), ⟨10.1109/TMAG.2019.2952156⟩
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https://inria.hal.science/hal-02467979/file/202002IEEETM-GVP.pdf BibTex
titre
Prédiction de l'efficacité de l'immunothérapie dans le cancer bronchique à partir de données cliniques et biologiques simples : apport de l'intelligence artificielle
auteur
Mathieu Grangeon, Sebastien Benzekry, Solène Chaleat, Pascale Tomasini, Dominique Barbolosi, Fabrice Barlesi, Laurent Greillier
article
Revue des Maladies Respiratoires Actualites, 2020, 12 (1), pp.217. ⟨10.1016/j.rmra.2019.11.477⟩
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https://inria.hal.science/hal-03147118/file/2020-Grangeon-Revue%20des%20Maladies%20Respiratoires%20Actualite%CC%81s-Pre%CC%81diction%20de%20l%E2%80%99efficacite%CC%81%20de%20l%E2%80%99immunothe%CC%81rapie%20dans%20le%20cancer%20bronchique%20a%CC%80%20partir%20de%20donne%CC%81es%20cliniques%20et%20biologiques%20simples%C2%A0-%20apport%20de%20l%E2%80%99intelligence%20artificielle.pdf BibTex
titre
Spatial mechanistic modeling for prediction of the growth of asymptomatic meningioma
auteur
Annabelle Collin, Cédrick Copol, Vivien Pianet, Thierry Colin, Julien Engelhardt, Guy Kantor, Hugues Loiseau, Olivier Saut, Benjamin Taton
article
Computer Methods and Programs in Biomedicine, In press
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https://inria.hal.science/hal-02397720/file/CMPB-newversion.pdf BibTex
titre
Patch-based field-of-view matching in multi-modal images for electroporation-based ablations
auteur
Luc Lafitte, Rémi Giraud, Cornel Zachiu, Mario Ries, Olivier Sutter, Antoine Petit, Olivier Seror, Clair Poignard, Baudouin Denis de Senneville
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, 2020, 84, ⟨10.1016/j.compmedimag.2020.101750⟩
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https://hal.science/hal-02868718/file/2020_Patch_Match_registration_final.pdf BibTex
titre
Survival criterion for a population subject to selection and mutations ; Application to temporally piecewise constant environments
auteur
Manon Costa, Christèle Etchegaray, Sepideh Mirrahimi
article
Nonlinear Analysis: Real World Applications, In press, 59, ⟨10.1016/j.nonrwa.2020.103239⟩
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https://hal.science/hal-02126707/file/CEM_submitted.pdf BibTex
titre
RegQCNET: Deep quality control for image-to-template brain MRI affine registration
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Jose V. Manjon, Pierrick Coupé
article
Physics in Medicine and Biology, 2020, ⟨10.1088/1361-6560/abb6be⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02941116/file/2020_RegQCNET.pdf BibTex
titre
Cell migration in complex environments: chemotaxis and topographical obstacles
auteur
Alessandro Cucchi, Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier, Laurent Navoret, Lamis Sabbagh
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, 2020, 67, pp.191-209. ⟨10.1051/proc/202067012⟩
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https://hal.science/hal-02126709/file/Cucchi_et_al_last.pdf BibTex
titre
Liver contrast-enhanced sonography: Computer-assisted differentiation between focal nodular hyperplasia and inflammatory hepatocellular adenoma by reference to microbubble transport patterns
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Nora Frulio, Hervé Laumonier, Cécile Salut, Luc Lafitte, Hervé Trillaud
article
European Radiology, 2020, ⟨10.1007/s00330-019-06566-1⟩
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https://hal.science/hal-02377657/file/2020_DCEUS_Adenome_HAL.pdf BibTex

Conference papers

titre
Floating Potential Boundary Condition in Smooth Domains in an Electroporation Context
auteur
Annabelle Collin, Sergio Corridore, Clair Poignard
article
MMDS 2020 - International Conference by Center for Mathematical Modeling and Data Science, Oct 2020, Osaka (JP), Japan. pp.91-106, ⟨10.1007/978-981-16-4866-3_6⟩
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https://inria.hal.science/hal-03004806/file/FloatingPotential-revised.pdf BibTex

Special issue

titre
CEMRACS 2018: Numerical and mathematical modeling for biologicaland medical applications: deterministic, probabilisticand statistical description
auteur
Vincent Calvez, Céline Grandmont, Eva Lochërbach, Clair Poignard, Magali Ribot, Nicolas Vauchelet
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, 67, pp.336, 2020, ⟨10.1051/proc/202067000⟩
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Theses

titre
Mathematical modeling of antibody nanoconjugates transport in tumors
auteur
Cristina Vaghi
article
Numerical Analysis [math.NA]. Université de Bordeaux, 2020. English. ⟨NNT : 2020BORD0326⟩
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https://theses.hal.science/tel-03157478/file/VAGHI_CRISTINA_2020.pdf BibTex
titre
Real data calibration and floating potential model in the context of electroporation
auteur
Sergio Corridore
article
Modeling and Simulation. Université de Bordeaux, 2020. English. ⟨NNT : 2020BORD0107⟩
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https://theses.hal.science/tel-03485172/file/CORRIDORE_SERGIO_2020.pdf BibTex
titre
Développement des approches radiomics à visées diagnostique et pronostique pour la prise en charge de patients atteints des sarcomes des tissus mous.
auteur
Amandine Crombé
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2020. Français. ⟨NNT : 2020BORD0059⟩
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https://theses.hal.science/tel-03270587/file/CROMBE_AMANDINE_2020.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Apprehending the effects of mechanical deformations in cardiac electrophysiology: A homogenization approach
auteur
Annabelle Collin, Sébastien Imperiale, Philippe Moireau, Jean-Frédéric Gerbeau, Dominique Chapelle
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2019, 29 (13), pp.2377-2417. ⟨10.1142/S0218202519500490⟩
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https://inria.hal.science/hal-02267941/file/MovingElectrophysio_final.pdf BibTex
titre
Assessment of risk factors for occurrence or worsening of acetabular fracture following percutaneous cementoplasty of acetabulum malignancies
auteur
Marie-Charlotte Hesler, Xavier Buy, Vittorio Catena, Véronique Brouste, Michèle Kind, Jean Palussière, Amandine Crombé
article
European Journal of Radiology, 2019, 120, pp.108694 -. ⟨10.1016/j.ejrad.2019.108694⟩
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https://hal.science/hal-03488784/file/S0720048X19303444.pdf BibTex
titre
Optimizing 4D abdominal MRI: image denoising using an iterative back-projection approach
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Colleen Rosalie Cardiet, Aurélien Trotier, Emeline Ribot, Luc Lafitte, Laurent Facq, Sylvain Miraux
article
Physics in Medicine and Biology, In press, ⟨10.1088/1361-6560/ab563e⟩
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https://hal.science/hal-02367839/file/2019_4D_reconstruction_revision2_final.pdf BibTex
titre
Assessment of left ventricle magnetic resonance temperature stability in patients in the presence of arrhythmias
auteur
Valéry Ozenne, Pierre Bour, Baudouin Denis de Senneville, Solenn Toupin, Alexis Vaussy, Matthieu Lepetit‐coiffé, Pierre Jaïs, Hubert Cochet, B. Quesson
article
NMR in Biomedicine, 2019, 32 (11), ⟨10.1002/nbm.4160⟩
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https://hal.science/hal-03033104/file/Ozenne-Assessment_of_left_ventricle_MR_temperature_Revised_Clean_Figures.pdf BibTex
titre
Numerical Optimization of Plasmid DNA Delivery Combined with Hyaluronidase Injection for Electroporation Protocol
auteur
Daniele Peri, Manon Deville, Clair Poignard, Emanuela Signori, Roberto Natalini
article
Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2019, pp.105204. ⟨10.1016/j.cmpb.2019.105204⟩
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BibTex
titre
Combinatorial immunotherapy strategies: most gods throw dice, but fate
auteur
Joseph Ciccolini, Dominique Barbolosi, Nicolas André, Sebastien Benzekry, Fabrice Barlesi
article
Annals of Oncology, 2019, 30 (11), pp.1690-1691. ⟨10.1093/annonc/mdz297/5559268⟩
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https://inria.hal.science/hal-03147132/file/published_online_first.pdf BibTex
titre
Modified bidomain model with passive periodic heterogeneities
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series S, 2019, ⟨10.3934/dcdss.2020126⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02363470/file/201909DCDSS-CDP.pdf BibTex
titre
Interval between planning and frameless stereotactic radiotherapy for brain metastases: are our margins still accurate?
auteur
Charlotte Bronnimann, Aymeri Huchet, Julie Benech-Faure, Caroline Dutriaux, Olivier Saut, Eivind Blais, Olivier Mollier, Renaud Trouette, Véronique Vendrely
article
Neuro-Oncology Practice, 2019, ⟨10.1093/nop/npz048⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02406540/file/manuscript.bronnimann26.4.19doc.pdf BibTex
titre
Combinatorial immunotherapy strategies : most gods throw dice, but fate plays chess
auteur
Joseph Ciccolini, Dominique Barbolosi, Nicolas Andre, Sébastien Benzekry, Fabrice Barlesi
article
Annals of Oncology, 2019, ⟨10.1093/annonc/mdz297⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02383826/file/2019_edito_annals_post_print.pdf BibTex
titre
Evaluating the benefit of PBS vs. VMAT dose distributions in terms of dosimetric sparing and robustness against inter-fraction anatomical changes for pediatric abdominal tumors
auteur
Filipa Guerreiro, Cornel Zachiu, Enrica Seravalli, Ribeiro Cassia Oraboni, Geert Janssens, Mario Ries, Baudouin Denis de Senneville, John H Maduro, Charlotte L Brouwer, Erik W Korevaar, Antje C Knopf, Bas W. Raaymakers
article
Radiotherapy & Oncology, 2019, ⟨10.1016/j.radonc.2019.06.025⟩
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titre
Quantitative mathematical modeling of clinical brain metastasis dynamics in non-small cell lung cancer
auteur
Maria Bilous, Cindy Serdjebi, Arnaud Boyer, Claudia Pouypoudat, Pascale Tomasini, Dominique Barbolosi, Fabrice Barlesi, François Chomy, Sébastien Benzekry
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-49407-3⟩
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https://inria.hal.science/hal-01928442/file/Bilous_et_al_2019_Scientific_Reports.pdf BibTex
titre
A stochastic model for cell adhesion to the vascular wall
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier
article
Journal of Mathematical Biology, 2019, ⟨10.1007/s00285-019-01407-7⟩
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https://hal.science/hal-01442975/file/Etchegaray_Meunier.pdf BibTex
titre
T2-based MRI Delta-Radiomics Improve Response Prediction in Soft-Tissue Sarcomas Treated by Neoadjuvant Chemotherapy
auteur
Amandine Crombé, Cynthia Perier, Michèle Kind, Baudouin Denis de Senneville, Francois Le Loarer, Antoine Italiano, Xavier Buy, Olivier Saut
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, 2019, 50 (2), pp.497-510. ⟨10.1002/jmri.26589⟩
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https://inria.hal.science/hal-01929807/file/JMRI_T2R_VersionSoumiseInitialement.pdf BibTex
titre
A prospective comparison of dynamic contrast-enhanced MRI and 51Cr-EDTA clearance for glomerular filtration rate measurement in 42 kidney transplant recipients
auteur
Benjamin Taton, Renaud de La Faille, Julien Asselineau, Paul Perez, Pierre Merville, Thierry Colin, Christian Combe, Steven Sourbron, Nicolas Grenier
article
European Journal of Radiology, 2019, 117, pp.209-215. ⟨10.1016/j.ejrad.2019.02.002⟩
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https://inria.hal.science/hal-02416091/file/EJR-D-18-01522R1%20%28glisse%CC%81%28e%29s%29.pdf BibTex
titre
Is There Any Room for Pharmacometrics With Immuno-Oncology Drugs? Input from the EORTC-PAMM Course on Preclinical and Early-phase Clinical Pharmacology
auteur
Anne Rodallec, Raphaelle Fanciullino, Sébastien Benzekry, Joseph Ciccolini
article
Anticancer Research, 2019, 39 (7), pp.3419-3422. ⟨10.21873/anticanres.13486⟩
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https://inria.hal.science/hal-02383831/file/2019_Rodallec_AnticancerResearch_Is%20There%20Any%20Room%20for%20Pharmacometrics%20With%20Immuno-Oncology%20Drugs%3F%20Input%20from%20the%20EORTC-PAMM%20Course%20on%20Preclinical%20and%20Early-phase%20Clinical%20Pharmacology.pdf BibTex
titre
Assessment of Intratumoral Doxorubicin Penetration after Mild Hyperthermia-mediated Release from Thermosensitive Liposomes
auteur
Marc Derieppe, Jean-Michel Escoffre, Baudouin Denis de Senneville, Quincy van Houtum, Angelique Barten-van Rijbroek, Kim van Der Wurff-Jacobs, Ludwig Dubois, Clemens Bos, Chrit T. W. Moonen
article
Contrast Media and Molecular Imaging, 2019, ⟨10.1155/2019/2645928⟩
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https://hal.science/hal-02377672/file/2645928.pdf BibTex
titre
Influence of Different Isoflurane Anesthesia Protocols on Murine Cerebral Hemodynamics measured with pseudo-Continuous Arterial Spin Labeling
auteur
Leon P Munting, Marc Derieppe, Ernst Suidgeest, Baudouin Denis de Senneville, Jack A Wells, Louise van Der Weerd
article
NMR in Biomedicine, 2019, ⟨10.1002/nbm.4105⟩
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BibTex
titre
A planning strategy for combined self-scanned/gated MR- HIFU treatment in the pancreas
auteur
Cyril Jacques J Ferrer, Clemens Bos, Baudouin Denis de Senneville, Pim T S Borman, Bjorn Stemkens, Rob H N Tijssen, Chrit T. W. Moonen, Lambertus W Bartels
article
International Journal of Hyperthermia, 2019
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BibTex
titre
Influence of Temporal Parameters of DCE-MRI on the Quantification of Heterogeneity in Tumor Vascularization
auteur
Amandine Crombé, Olivier Saut, Jerome Guigui, Antoine Italiano, Xavier Buy, Michèle Kind
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, 2019, 50 (6), pp.1773-1788. ⟨10.1002/jmri.26753⟩
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https://inria.hal.science/hal-02406497/file/JMRI_R1_TWIST-manuscript_CleanF.pdf BibTex
titre
CAR T-Cell Immunotherapy in Human and Veterinary Oncology: Changing the Odds Against Hematological Malignancies
auteur
Jonathan Paul M. Mochel, Stephen C Ekker, Chad Johannes, Albert E Jergens, Karin Allenspach, Agnes Bourgois-Mochel, Michael Knouse, Sébastien Benzekry, Wesley Wierson, Amy K Leblanc, Saad S Kenderian
article
AAPS Journal, 2019, 21 (3), ⟨10.1208/s12248-019-0322-1⟩
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https://inria.hal.science/hal-02099159/file/hal.pdf BibTex
titre
State-parameter estimation approach for data-driven wildland fire spread modeling: Application to the 2012 RxCADRE S5 field-scale experiment
auteur
Cong Zhang, Annabelle Collin, Philippe Moireau, Arnaud Trouvé, Mélanie C. Rochoux
article
Fire Safety Journal, 2019, 105, pp.286 - 299. ⟨10.1016/j.firesaf.2019.03.009⟩
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https://hal.science/hal-03484997/file/S0379711218305502.pdf BibTex
titre
Optimal Scheduling of Bevacizumab and Pemetrexed/cisplatin Dosing in Non‐Small Cell Lung Cancer
auteur
Benjamin K Schneider, Arnaud Boyer, Joseph Ciccolini, Fabrice Barlesi, Kenneth Wang, Sébastien Benzekry, Jonathan Paul M. Mochel
article
CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, 2019, ⟨10.1002/psp4.12415⟩
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https://inria.hal.science/hal-02109335/file/19_schneider.pdf BibTex
titre
Numerical Workflow of Irreversible Electroporation for Deep-Seated Tumor
auteur
Olivier Gallinato, Baudouin Denis de Senneville, Olivier Seror, Clair Poignard
article
Physics in Medicine and Biology, 2019, 64 (5), pp.055016. ⟨10.1088/1361-6560/ab00c4⟩
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https://inria.hal.science/hal-02063020/file/paperIRE_workflow_R3.pdf BibTex
titre
A Parallel Voronoi-Based Approach for Mesoscale Simulations of Cell Aggregate Electropermeabilization
auteur
Pouria Mistani, Arthur Guittet, Clair Poignard, Frederic Gibou
article
Journal of Computational Physics, 2019, ⟨10.1016/j.jcp.2018.12.009⟩
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https://arxiv.org/pdf/1802.01781 BibTex
titre
Asymptotic expansions for the conductivity problem with nearly touching inclusions with corner
auteur
Virginie Bonnaillie-Noël, Clair Poignard, Grégory Vial
article
Annales Henri Lebesgue, 2019, 3, pp.381-406. ⟨10.5802/ahl.36⟩
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https://hal.science/hal-01766052/file/BPV18_280619.pdf BibTex
titre
Modeling and analysis of adipocytes dynamic with a differentiation process
auteur
Jérôme Gilleron, Thierry Goudon, Frédéric Lagoutière, Hugo Martin, Benjamin Mauroy, Pascal Millet, Magali Ribot, Cristina Vaghi
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, In press, 2019, pp.1 - 10. ⟨10.1051/proc/202067013⟩
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https://inria.hal.science/hal-02073788/file/2019_modeling_and_analysis_of_adipocytes_dynamic_with_a_differentiation_process.pdf BibTex
titre
Front shape similarity measure for data-driven simulations of wildland fire spread based on state estimation: Application to the RxCADRE field-scale experiment
auteur
Cong Zhang, Annabelle Collin, Philippe Moireau, Arnaud Trouvé, Mélanie Rochoux
article
Proceedings of the Combustion Institute, 2019, 37 (3), pp.4201-4209. ⟨10.1016/j.proci.2018.07.112⟩
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https://inria.hal.science/hal-01969130/file/MANUSCRIPT_PROCI-D-17-00980R2.pdf BibTex

Conference papers

titre
A novel approach for parallel electroporation of spheroids entrapped in hydrogels
auteur
Julien Marchalot, Maxime Hanni, Marie Frénéa-Robin, Laure Franqueville, Damien Voyer, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, Charlotte Rivière
article
3rd World Congress on Electroporation, Sep 2019, Toulouse, France
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BibTex
titre
Combining Population Modeling and Bayesian Inference for Tumor Growth Prediction
auteur
Cristina Vaghi
article
SMB 2019 annual meeting, Jul 2019, Montreal, Canada
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https://hal.science/hal-02424592/file/presentation_SMB.pdf BibTex
titre
Numerical modeling of floating potentials in electrokinetic problems
auteur
Damien Voyer, Sergio Corridore, Annabelle Collin, Riccardo Scorretti, Clair Poignard
article
Compumag 2019, Jul 2019, Paris, France
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https://hal.science/hal-02189453/file/PB-A1-10.pdf BibTex
titre
Homogenization of lamination stacks based on the vector potential formulation
auteur
Mohammad Issa, Laurent Krähenbühl, Clair Poignard, Jean-René Poirier, Ronan Perrussel
article
Compumag 2019, Jul 2019, Paris, France
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BibTex
titre
Mechanistic modeling of metastasis: cancer at the organism scale
auteur
Sébastien Benzekry
article
International Society of Pharmacometrics (ISoP) workshop, Jul 2019, Paris, France
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https://inria.hal.science/hal-02424424/file/07_metastasis_isop.pdf BibTex
titre
Development of microfluidic tools to fabricate multicellular constructs and analyze their electromagnetic properties
auteur
Marie Frénéa-Robin, Jonathan Cottet, Julien Marchalot, Charlotte Rivière, Laure Franqueville, Damien Voyer, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, Philippe Renaud
article
BioEM 2019, Jun 2019, Montpellier, France
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BibTex
titre
Model assessment through data assimilation of realistic data in cardiac electrophysiology
auteur
Antoine Gérard, Annabelle Collin, Gautier Bureau, Philippe Moireau, Yves Coudière
article
FIMH 2019 - 10th Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-02172102/file/sequentialDA_FIMH2019.pdf BibTex
titre
Data-driven mechanistic modeling of metastasis: cancer at the organism scale
auteur
Sébastien Benzekry
article
RITS conference (Recherche en Imagerie et Technologies pour la Sante) of the French Society of Biomedical Engineering (SFGBM), May 2019, Tours, France
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https://inria.hal.science/hal-02424452/file/05_tours_mets_pkpd_c.pdf BibTex
titre
Machine learning versus mechanistic modeling for prediction of metastatic relapse in breast cancer
auteur
Sebastien Benzekry
article
2019 CSBC-PSON Mathematical Oncology Meeting, May 2019, Portland, United States
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https://inria.hal.science/hal-02424419/file/05_prediction_mets_portland.pdf BibTex
titre
Hepatic tumor diagnosis by analysing dense transport fields in contrast-enhanced ultrasound
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Nora Frulio, Hervé Laumonier, Cécile Salut, Luc Lafitte, Hervé Trillaud
article
ISBI19 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy
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https://hal.science/hal-02377660/file/2019_DCEUS_Adenome.pdf BibTex
titre
Front Data Assimilation and Sensitivity Analysis for Data-Driven Wildland Fire Spread Simulations
auteur
Mélanie Rochoux, Cong Zhang, Nicolas Frebourg, Annabelle Collin, Philippe Moireau, Didier Lucor, Arnaud Trouvé
article
International Fire Behavior and Fuels Conference, Apr 2019, Marseille, France
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BibTex

Book sections

titre
Population Modeling of Tumor Growth Curves, the Reduced Gompertz Model and Prediction of the Age of a Tumor
auteur
Cristina Vaghi, Anne Rodallec, Raphaelle Fanciullino, Joseph Ciccolini, Jonathan Paul M. Mochel, Michalis Mastri, John M.L. Ebos, Clair Poignard, Sébastien Benzekry
article
Mathematical and Computational Oncology, pp.87-97, 2019, ⟨10.1007/978-3-030-35210-3_7⟩
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https://hal.science/hal-02383995/file/ismco_paper.pdf BibTex
titre
Evaluating growth and risk of relapse of intracranial tumors
auteur
Olivier Saut, Thierry Colin, Annabelle Collin, Thibaut Kritter, Vivien Pianet, Clair Poignard, Benjamin Taton
article
Computational Systems Biology Approaches in Cancer Research, CRC Press, 2019, 9780367344214
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https://inria.hal.science/hal-02406709/file/chapitre%20curie.pdf BibTex

Poster communications

titre
Population modeling of tumor growth curves, the reduced Gompertz model and prediction of the age of a tumor
auteur
Cristina Vaghi, Anne Rodallec, Raphaelle Fanciullino, Joseph Ciccolini, Jonathan Paul M. Mochel, Michalis Mastri, John M.L. Ebos, Clair Poignard, Sébastien Benzekry
article
PAGE 2019 Twenty-eighth meeting, Jun 2019, Stockholm, Sweden
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https://hal.science/hal-02424578/file/poster_page.pdf BibTex

Theses

titre
Analyse quantitative des données de routine clinique pour le pronostic précoce en oncologie
auteur
Cynthia Perier
article
Traitement des images [eess.IV]. Université de Bordeaux, 2019. Français. ⟨NNT : 2019BORD0219⟩
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https://theses.hal.science/tel-02457768/file/PERIER_CYNTHIA_2019.pdf BibTex
titre
Mathematical modelling of neoadjuvant antiangiogenic therapy and prediction of post-surgical metastatic relapse in breast cancer patients
auteur
Chiara Nicolò
article
Numerical Analysis [math.NA]. Université de Bordeaux, 2019. English. ⟨NNT : 2019BORD0183⟩
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https://theses.hal.science/tel-02560543/file/NICOLO_CHIARA_2019.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
A reduced Gompertz model for predicting tumor age using a population approach
auteur
Cristina Vaghi, Anne Rodallec, Raphaelle Fanciullino, Joseph Ciccolini, Jonathan Paul M. Mochel, Michalis Mastri, Clair Poignard, John M.L. Ebos, Sébastien Benzekry
article
2019
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https://hal.science/hal-02165901/file/preprint.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Mathematical Modeling of the Proliferation Gradient in MultiCellular Tumor Spheroids
auteur
Thomas Michel, Jérôme Fehrenbach, Valérie Lobjois, Jennifer Laurent, Aurelie Gomes, Thierry Colin, Clair Poignard
article
Journal of Theoretical Biology, 2018, 458, pp.133 - 147. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.08.031⟩
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https://inria.hal.science/hal-01883189/file/spheroids.pdf BibTex
titre
Turning cold tumors into hot tumors: harnessing the potential of tumor immunity using nanoparticles
auteur
Anne Rodallec, Guillaume Sicard, Raphaelle Fanciullino, Sébastien Benzekry, Bruno Lacarelle, Gérard Milano, Joseph Ciccolini
article
Expert Opinion on Drug Metabolism and Toxicology, 2018, 14 (11), pp.1-9. ⟨10.1080/17425255.2018.1540588⟩
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https://inria.hal.science/hal-01958583/file/rodallec_nano_immuno.pdf BibTex
titre
Viscoelastic modeling of the fusion of multicellular tumor spheroids in growth phase
auteur
Guillaume Dechristé, Jérôme Fehrenbach, Elena Griseti, Valérie Lobjois, Clair Poignard
article
Journal of Theoretical Biology, 2018, 454, pp.102-109. ⟨10.1016/j.jtbi.2018.05.005⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01786027/file/articleV3Hidden.pdf BibTex
titre
A stochastic model for protrusion activity
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, 2018
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1808.00217 BibTex
titre
Pharmacokinetics variability: why nanoparticles are not magic bullets in oncology
auteur
Anne Rodallec, Sébastien Benzekry, Bruno Lacarelle, Joseph Ciccolini, Raphaelle Fanciullino
article
Critical Reviews in Oncology/Hematology, 2018, 129, pp.1 - 12. ⟨10.1016/j.critrevonc.2018.06.008⟩
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https://inria.hal.science/hal-01821678/file/rodallec_pk_nano_hal.pdf BibTex
titre
Crawling migration under chemical signalling: A stochastic model
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2018, 41 (18), pp.8799-8815. ⟨10.1002/mma.5145⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1808.00210 BibTex
titre
Pre-treatment magnetic resonance-based texture features as potential imaging biomarkers for predicting event free survival in anal cancer treated by chemoradiotherapy
auteur
Arnaud Hocquelet, Thibaut Auriac, Cynthia Perier, Clarisse Dromain, Marie Meyer, Jean-Baptiste Pinaquy, Alban Denys, Hervé Trillaud, Baudouin Denis de Senneville, Véronique Vendrely
article
European Radiology, 2018, 28 (7), pp.2801-2811. ⟨10.1007/s00330-017-5284-z⟩
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BibTex
titre
Real-time 3D ultrasound based motion tracking for the treatment of mobile organs with MR-guided high-intensity focused ultrasound
auteur
Pierre Bour, Valéry Ozenne, Fabrice Marquet, Baudouin Denis de Senneville, Erik Dumont, Bruno Quesson
article
International Journal of Hyperthermia, 2018, 34 (8), pp.1225-1235
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BibTex
titre
Numerical solutions of a 2D fluid problem coupled to a nonlinear non-local reaction-advection-diffusion problem for cell crawling migration in a discoidal domain
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier
article
International Journal of Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2018
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1804.04904 BibTex
titre
Dynamical modeling of tissue electroporation
auteur
Damien Voyer, Aude Silve, Lluis M. Mir, Riccardo Scorretti, Clair Poignard
article
Bioelectrochemistry, 2018, 119, pp.98 - 110. ⟨10.1016/j.bioelechem.2017.08.007⟩
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https://inria.hal.science/hal-01598846/file/201708SourceBIOJEC7041.pdf BibTex
titre
Fluid filling of the digestive tract for improved proton resonance frequency shift-based MR thermometry in the pancreas
auteur
Cyril Jacques Ferrer, Lambertus Bartels, Marijn van Stralen, Baudouin Denis de Senneville, Chrit T.W. Moonen, Clemens Bos
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, 2018, 47 (3), pp.692-701
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BibTex
titre
Respiratory motion model based on the noise covariance matrix of a receive array
auteur
Anna Andreychenko, Baudouin Denis de Senneville, Robin Navest, Rob H.N. Tijssen, Jan J.W. Lagendijk, Cornelis van den Berg
article
Magnetic Resonance in Medicine, 2018, 79 (3), pp.1730-1735
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BibTex
titre
A stochastic model for protrusion activity
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, In press, pp.1 - 10
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https://hal.science/hal-01760549/file/Proceedings_traj.pdf BibTex
titre
Front shape similarity measure for shape-oriented sensitivity analysis and data assimilation for Eikonal equation
auteur
Mélanie Rochoux, Annabelle Collin, Cong Zhang, Arnaud Trouvé, Didier Lucor, Philippe Moireau
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, 2018, pp.258 - 279. ⟨10.1051/proc/201863258⟩
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https://inria.hal.science/hal-01625575/file/ESAIM17_review.pdf BibTex
titre
Mathematical analysis and 2-scale convergence of a heterogeneous microscopic bidomain model
auteur
Annabelle Collin, Sébastien Imperiale
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2018, ⟨10.1142/S0218202518500264⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01759914/file/AnalysisAndHomOfBidModel.pdf BibTex
titre
A continuum mechanics model of enzyme-based tissue degradation in cancer therapies
auteur
Manon Deville, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
Bulletin of Mathematical Biology, In press, ⟨10.1007/s11538-018-0515-2⟩
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https://inria.hal.science/hal-01889575/file/main-springer-R2.pdf BibTex
titre
Revisiting bevacizumab + cytotoxics scheduling using mathematical modeling: proof of concept study in experimental non-small cell lung carcinoma
auteur
Diane-Charlotte Imbs, Raouf El Cheikh, Arnaud Boyer, Joseph Ciccolini, Celine Mascaux, Bruno Lacarelle, Fabrice Barlesi, Dominique Barbolosi, Sébastien Benzekry
article
CPT: Pharmacometrics and Systems Pharmacology, 2018, pp.1-9. ⟨10.1002/psp4.12265⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01624423/file/Imbs_17_CPT_PSP_Revisiting%20Bevacizumab%E2%80%89%2B%E2%80%89Cytotoxics%20Scheduling%20Using%20Mathematical%20Modeling%20Proof%20of%20Concept%20Study%20in%20Experimental%20Non-Small%20Cell%20Lung%20Carcinoma.pdf BibTex
titre
Experimental estimation of stored stress within spherical microtissues
auteur
Thierry Colin, Guillaume Dechristé, Jérôme Fehrenbach, Ludivine Guillaume, Valérie Lobjois, Clair Poignard
article
Journal of Mathematical Biology, 2018, 77 (4)
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01782340/file/manuscrit.pdf BibTex

Conference papers

titre
Mathematical Modeling and Prediction of Clinical Metastasis
auteur
Sébastien Benzekry
article
Mathematical Challenges in the Analysis of Continuum Models for Cancer Growth, Evolution and Therapy, Nov 2018, Oaxaca, Mexico
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https://inria.hal.science/hal-01969108/file/11_metastasis_oaxaca.pdf BibTex
titre
A fluid dynamic model for quantitative contrast-enhanced ultrasound imaging: validation for the assessment of uteroplacental perfusion
auteur
Baudouin Denis de Senneville, Anthony Novell, Chloé J. Arthuis, Vanda Mendes, Paul-Armand Dujardin, Frédéric Patat, Ayache Bouakaz, Jean-Michel Escoffre, Franck Perrotin
article
IEEE International Ultrasonics Symposium, Oct 2018, Kobe, Japan
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BibTex
titre
Validation of a sequential data assimilation method applied to cardiac electrophysiology
auteur
Antoine Gérard, Annabelle Collin, Yves Coudière
article
Virtual Physiological Human conference, Sep 2018, Saragosse, Spain
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https://inria.hal.science/hal-01955627/file/VPHProceedingsAG.pdf BibTex
titre
Optimization of sequential administration of bevacizumab plus cytotoxics in non-small cell lung cancer by combining in vivo experiments and mathematical modeling
auteur
Sébastien Benzekry
article
Mathematical perspectives in the biology and therapeutics of cancer, Jul 2018, Marseille, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01969142/file/07_marseille_bevalung.pdf BibTex
titre
Non-rigid CT to MR registration for online external beam radiotherapy guidance
auteur
Cornel Zachiu, Baudouin Denis de Senneville, Mario Ries, Fieke Prins, Bas W. Raaymakers
article
6th MR in RT symposium, Jun 2018, Utrecht, Netherlands
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BibTex
titre
Mathematical Modeling of Tumor-Tumor Distant Interactions Supports a Systemic Control of Tumor Growth
auteur
Sébastien Benzekry
article
3rd Mathematical Biology Modeling days of Besançon, Jun 2018, Besançon, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01969102/file/06_two_tumors.pdf BibTex
titre
Evaluation of 2D simultaneous multi-slice EPI at 1.5T for MR-thermometry in presence of motion
auteur
Pierre Bour, Valéry Ozenne, Fabrice Marquet, Baudouin Denis de Senneville, Erik Dumont, Bruno Quesson
article
International Society of Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France
Accès au bibtex
BibTex
titre
3D ultrasound based motion tracking combined with rapid multislice MR-thermometry for MR guided HIFU on mobile organs
auteur
Valéry Ozenne, Pierre Bour, Baudouin Denis de Senneville, Marylène Delcey, Wadie Ben Hassen, Alexis Vaussy, S Rainer, Bruno Quesson
article
International Society of Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France
Accès au bibtex
BibTex

Poster communications

titre
A biologically-based mathematical model for prediction of metastatic relapse
auteur
Michalis Mastri, Cynthia Perier, Gaetan Macgrogan, John M.L. Ebos, Sébastien Benzekry
article
17th Biennial Congress of the Metastasis Research Society, Aug 2018, Princeton, United States
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https://inria.hal.science/hal-01968980/file/2018_ds3_metastasis.pdf BibTex
titre
Improving the efficacy of anti-cancer nanoparticles with data-driven mathematical modeling
auteur
Cristina Vaghi, Anne Rodallec, Raphaelle Fanciullino, Joseph Ciccolini, Clair Poignard, Sébastien Benzekry
article
Data Science Summer School, Jun 2018, Palaiseau, France
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https://inria.hal.science/hal-01968959/file/2018_ds3_vaghi_nanoparticles.pdf BibTex
titre
Modeling Primary Tumor Dynamics of Human-to-Mouse Xenografted Non-Small Cell Lung Cancer in Response to Administration of Bevacizumab and Pemetrexed-Cisplatin
auteur
Benjamin Schneider, Arnaud Boyer, Joseph Ciccolini, Kenneth Wang, Martin E Fernandez-Zapico, Jonathan Paul M. Mochel, Sébastien Benzekry
article
Population Approach Group in Europe (PAGE) Meeting 2018, May 2018, Montreux, Switzerland. 2018
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titre
Mathematical modeling of differential effects of neo-adjuvant Sunitinib on primary tumor and metastatic growth
auteur
Chiara Nicolò, Michalis Mastri, Amanda Tracz, John M.L. Ebos, Sébastien Benzekry
article
AACR Annual Meeting 2018, Apr 2018, Chicago, United States. 78 (13 Supplement), pp.4264, 2018, ⟨10.1158/1538-7445.AM2018-4264⟩
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https://inria.hal.science/hal-01968917/file/2018_aacr_Nicolo_neoadjuvant_metastasis.pdf BibTex

Reports

titre
SEME 2017 : identification de véhicules en utilisant le numéro VIN
auteur
Rémi Besson, Christèle Etchegaray, Luca Ferrari, Samuel Nordmann
article
[Rapport de recherche] Paris Descartes. 2018
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https://hal.science/hal-01886989/file/rapport-seme-identification.pdf BibTex

Theses

titre
Utilisation de données cliniques pour la construction de modèles en oncologie
auteur
Thibaut Kritter
article
Mathématiques générales [math.GM]. Université de Bordeaux, 2018. Français. ⟨NNT : 2018BORD0166⟩
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Crawling migration under chemical signalling: a stochastic particle model
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier
article
2018
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2017

Journal articles

titre
Precision of manual two-dimensional segmentations of lung and liver metastases and its impact on tumour response assessment using RECIST 1.1
auteur
François Cornelis, Marie Martin, Olivier Saut, Xavier Buy, Michèle Kind, Jean Palussiere, Thierry Colin
article
European Radiology Experimental, 2017, 1 (1), ⟨10.1186/s41747-017-0015-4⟩
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https://inria.hal.science/hal-01634849/file/s41747-017-0015-4.pdf BibTex
titre
Dose- and time-dependence of the host-mediated response to paclitaxel therapy: a mathematical modeling approach
auteur
Madeleine Benguigui, Dror Alishekevitz, Michael Timaner, Dvir Shechter, Ziv Raviv, Sebastien Benzekry, Yuval Shaked
article
Oncotarget, 2017, 9 (2), pp.2574-2590. ⟨10.18632/oncotarget.23514⟩
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titre
Real-time non-rigid target tracking for ultrasound-guided clinical interventions
auteur
Cornel Zachiu, Mario Ries, Pascal Ramaekers, Jean-Luc Guey, Chrit T. W. Moonen, Baudouin Denis de Senneville
article
Physics in Medicine and Biology, 2017, 62 (20), pp.8154 - 8177. ⟨10.1088/1361-6560/aa8c66⟩
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https://hal.science/hal-01617624/file/2017_MR_US_Tracking.pdf BibTex
titre
Tumor growth model of ductal carcinoma: from in situ phase to stroma invasion
auteur
Olivier Gallinato, Thierry Colin, Olivier Saut, Clair Poignard
article
Journal of Theoretical Biology, 2017, 429, pp.253 - 266. ⟨10.1016/j.jtbi.2017.06.022⟩
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https://inria.hal.science/hal-01598837/file/paperBreastHidden.pdf BibTex
titre
Safety and Efficacy of Irreversible Electroporation for the Treatment of Hepatocellular Carcinoma Not Amenable to Thermal Ablation Techniques: A Retrospective Single-Center Case Series
auteur
Olivier Sutter, Joyce Calvo, Gisèle N’kontchou, Jean-Charles Nault, Raffik Ourabia, Pierre Nahon, Nathalie Ganne-Carrié, Valérie Bourcier, Nora Zentar, Fatna Bouhafs, Nicolas Sellier, Abou Diallo, Olivier Seror
article
Radiology, 2017, 284 (3), pp.877-886. ⟨10.1148/radiol.2017161413⟩
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BibTex
titre
Superconvergent second order Cartesian method for solving free boundary problem for invadopodia formation
auteur
Olivier Gallinato, Clair Poignard
article
Journal of Computational Physics, 2017, 339, pp.412 - 431. ⟨10.1016/j.jcp.2017.03.010⟩
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https://inria.hal.science/hal-01483484/file/subm_paperJCP.pdf BibTex
titre
A novel adaptive needle insertion sequencing for robotic, single needle MR-guided high-dose-rate prostate brachytherapy
auteur
Maxence Borot de Battisti, Baudouin Denis de Senneville, Gilion Hautvast, D Binnekamp, Jan Lagendijk, M Maenhout, M Moerland
article
Physics in Medicine and Biology, 2017
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BibTex
titre
Partial nephrectomy versus ablative therapy for the treatment of renal tumors in an imperative setting
auteur
Jean-Alexandre Long, Jean-Christophe Bernhard, Pierre Bigot, Cécilia Lanchon, Philippe Paparel, Nathalie Rioux-Leclercq, Laurence Albiges, Thomas Bodin, François-Xavier Nouhaud, Romain Boissier, Pierre Gimel, Arnaud Mejean, Alexandra Masson-Lecomte, Nicolas Grenier, François Cornelis, Yohann Grassano, Vincent Comat, Quentin Come Le Clerc, Jérôme Rigaud, Laurent J. Salomon, Jean-Luc Descotes, Christian Sengel, Morgan Rouprêt, Gregory Verhoest, Idir Ouzaid, Valentin Arnoux, Karim Bensalah
article
World Journal of Urology, 2017, 35 (4), pp.649 - 656. ⟨10.1007/s00345-016-1913-4⟩
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titre
Mathematical model for transport of DNA plasmids from the external medium up to the nucleus by electroporation
auteur
Michael S Leguèbe, Maria Grazia Notarangelo, Monika Twarogowska, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
Mathematical Biosciences, 2017, 285, pp.1-13. ⟨10.1016/j.mbs.2016.11.015⟩
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titre
A Voronoi Interface approach to cell aggregate electropermeabilization
auteur
Arthur Guittet, Clair Poignard, Frederic Gibou
article
Journal of Computational Physics, 2017, 332, pp.143 - 159. ⟨10.1016/j.jcp.2016.11.048⟩
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https://inria.hal.science/hal-01483521/file/Revision_JCP_11_21_2016.pdf BibTex
titre
Feasibility of real-time MR thermal dose mapping for predicting radiofrequency ablation outcome in the myocardium in vivo
auteur
Solenne Toupin, Pierre Bour, Matthieu Lepetit-Coiffe, Valery Ozenne, Baudouin Denis de Senneville, Rainer Schneider, Alexis Vaussy, Arnaud Chaumeil, Hubert Cochet, Frédéric Sacher, Pierre Jais, Bruno Quesson
article
Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, 2017, 19 (1), pp.14
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BibTex
titre
Combination of principal component analysis and optical-flow motion compensation for improved cardiac MR thermometry
auteur
Solenne Toupin, Baudouin Denis de Senneville, Valery Ozenne, Pierre Bour, Matthieu Lepetit-Coiffe, M Boissenin, Pierre Jais, Bruno Quesson
article
Physics in Medicine and Biology, 2017, 62 (4), pp.1208-1224
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BibTex
titre
Irreversible Electroporation: Disappearance of Observable Changes at Imaging Does Not Always Imply Complete Reversibility of the Underlying Causal Tissue Changes
auteur
Olivier Seror, Clair Poignard, Olivier Gallinato, Rafik Belkacem-Ourabia, Olivier Sutter
article
Radiology, 2017, 282, pp.301 - 302. ⟨10.1148/radiol.2017161809⟩
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https://inria.hal.science/hal-01421863/file/Preprint.pdf BibTex
titre
Etude de l'effet séquence bevacizumab/pemetrexed/cisplatine chez la souris porteuse de cancer du poumon non à petites cellules
auteur
Arnaud Boyer, Joseph Ciccolini, Céline Mascaux, Diane-Charlotte Imbs, Raouf El Cheikh, Fabrice Barlesi, Sébastien Benzekry
article
Revue des Maladies Respiratoires, 2017, 34, ⟨10.1016/j.rmr.2016.10.110⟩
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titre
Mathematical modeling of tumor-tumor distant interactions supports a systemic control of tumor growth
auteur
Sébastien Benzekry, Clare Lamont, Dominique Barbolosi, Lynn Hlatky, Philip Hahnfeldt
article
Cancer Research, 2017, ⟨10.1158/0008-5472.CAN-17-0564⟩
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https://inria.hal.science/hal-01566947/file/benzekry_concomitant_resistance_all.pdf https://inria.hal.science/hal-01566947/file/supplementary_figures_tables.pdf BibTex
titre
Non-standard radiotherapy fractionations delay the time to malignant transformation of low-grade gliomas
auteur
Araceli M Henares-Molina, Sébastien Benzekry, Pedro C Lara, Marcial M García-Rojo, Víctor M Pérez-García, Alicia M Martínez-González
article
PLoS ONE, 2017, ⟨10.1371/journal.pone.0178552.t001⟩
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https://inria.hal.science/hal-01532505/file/Henares-Molina_2017_PloSOne_Non-standard%20radiotherapy%20fractionations%20delay%20the%20time%20to%20malignant%20transformation%20of%20low-grade%20gliomas.pdf BibTex
titre
An Adaptive Non-Local-Means Filter for Real-Time MR-Thermometry
auteur
Cornel Zachiu, Mario Ries, Chrit Moonen, Baudouin Denis de Senneville
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2017, 36 (4), pp.904-916. ⟨10.1109/TMI.2016.2627221⟩
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https://hal.science/hal-01461332/file/2017_ANLM_Thermometry.pdf BibTex
titre
A framework for continuous target tracking during MR-guided high intensity focused ultrasound thermal ablations in the abdomen
auteur
Cornel Zachiu, Baudouin Denis de Senneville, Ivan D. Dmitriev, Chrit T. W. Moonen, Mario Ries
article
Journal of Therapeutic Ultrasound, 2017, 5, pp.27. ⟨10.1186/s40349-017-0106-y⟩
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https://hal.science/hal-01617622/file/2017_TherapyMotionCorrection2D3D.pdf BibTex
titre
Model-driven optimization of antiangiogenics + cytotoxics combination: application to breast cancer mice treated with bevacizumab + paclitaxel doublet leads to reduced tumor growth and fewer metastasis
auteur
Severine Mollard, Joseph Ciccolini, Diane-Charlotte Imbs, Raouf El Cheikh, Dominique Barbolosi, Sébastien Benzekry
article
Oncotarget, 2017, ⟨10.18632/oncotarget.15484⟩
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https://inria.hal.science/hal-01474679/file/Mollard_17_Oncotarget_Model%20driven%20optimization%20of%20antiangiogenics%20%2B%20cytotoxics%20combination%20application%20to%20breast%20cancer%20mice%20treated%20with%20bevacizumab%20%2B%20paclitaxel%20doublet%20leads%20to%20reduced%20tumor%20growth%20and%20fewer%20metastasis.pdf BibTex
titre
Effect of intra-fraction motion on the accumulated dose for free-breathing MR-guided stereotactic body radiation therapy of renal-cell carcinoma
auteur
Bjorn Stemkens, Markus Glitzner, Charis Kontaxis, Baudouin Denis de Senneville, Fieke Prins, Sjoerd Crijns, Linda Kerkmeijer, Jan Lagendijk, C. van den Berg, Rob Tijssen
article
Physics in Medicine and Biology, 2017
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Conference papers

titre
Joint-state and parameters estimation using nudging and SEIK filters for HIV mechanistic models
auteur
Mélanie Prague, Rodolphe Thiébaut, Philippe Moireau, Annabelle Collin
article
Journée de la statistique francaise, Jun 2017, Avignon, France
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https://inria.hal.science/hal-01579068/file/Abstract_PRAGUE_JDS2017_v2.pdf BibTex
titre
Optimized radiotherapy protocols delay the malignant transformation of low-grade gliomas in-silico
auteur
Araceli Henares-Molina, Sébastien Benzekry, Pedro Lara, Marcial García-Rojo, Victor Pérez-García, Alicia Martínez-González
article
5th Quadrennial Meeting of the World Federation of Neuro-Oncology Societies, May 2017, Zurich, Switzerland. pp.iii12 - iii12, ⟨10.1093/neuonc/nox036.040⟩
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Book sections

titre
Different Approaches Used in Modeling of Cell Membrane Electroporation
auteur
Clair Poignard, Aude Silve, Lars Wegner
article
Handbook of Electroporation, Springer, pp.24, 2017, Handbook of Electroporation, 978-3-319-26779-1. ⟨10.1007/978-3-319-26779-1_3-1⟩
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https://inria.hal.science/hal-01483487/file/ChapterCellMod.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Contributions in Mathematical Oncology: When Theory Meets Reality
auteur
Sébastien Benzekry
article
Mathematics [math]. Université de Bordeaux, 2017
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https://theses.hal.science/tel-01658070/file/HDR_benzekry.pdf BibTex

Reports

titre
A continuum mechanics model of enzyme-based tissue degradation in cancer therapies
auteur
Manon Deville, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-9030, Inria Bordeaux Sud-Ouest; IMB - Institut de Mathématiques de Bordeaux; Université de Bordeaux; IAC - Istituto per le Applicazioni del Calcolo "M. Picone", Consiglio Nazionale delle Ricerche. 2017
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https://inria.hal.science/hal-01469180/file/RR-9030.pdf BibTex

Theses

titre
Mathematical Modeling of enhanced drug delivery by mean of Electroporation or Enzymatic treatment
auteur
Manon Deville
article
General Mathematics [math.GM]. Université de Bordeaux; Università degli studi di Roma "Tor Vergata" (1972-..), 2017. English. ⟨NNT : 2017BORD0755⟩
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https://theses.hal.science/tel-01699066/file/DEVILLE_MANON_2017.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Numerical solutions of a 2D fluid problem coupled to a nonlinear non-local reaction-advection-diffusion problem for cell crawling migration in a discoidal domain
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier
article
2017
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https://hal.science/hal-01760518/file/Proc_ASud.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Free boundary problem for cell protrusion formations: theoretical and numerical aspects
auteur
Olivier Gallinato, Masahito Ohta, Clair Poignard, Takashi Suzuki
article
Journal of Mathematical Biology, 2016, ⟨10.1007/s00285-016-1080-7⟩
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https://inria.hal.science/hal-01412264/file/subm_paperJMB-v2-R1.pdf BibTex
titre
Analysis-suitable G1 multi-patch parametrizations for C1 isogeometric spaces
auteur
Annabelle Collin, Giancarlo Sangalli, Thomas Takacs
article
Computer Aided Geometric Design, 2016
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https://arxiv.org/pdf/1509.07619 BibTex
titre
Multi-scale Modeling in Clinical Oncology: Opportunities and Barriers to Success
auteur
Thomas E. Yankeelov, Gary An, Oliver Saut, Guy M. Genin, E. Georg Luebeck, Aleksander S. Popel, Benjamin Ribba, Paolo Vicini, Xiaobo Zhou, Jared A. Weis, Kaiming Ye
article
Annals of Biomedical Engineering, 2016, 44 (9)
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https://inria.hal.science/hal-01396241/file/MSM_oncology_manuscript_revised_v4.pdf BibTex
titre
Mathematical modeling of cancer immunotherapy and its synergy with radiotherapy
auteur
R. Serre, Sébastien Benzekry, Laetitia Padovani, C. Meille, N. Andre, J. Ciccolini, F. Barlesi, X. Muracciole, Dominique Barbolosi
article
Cancer Research, 2016, ⟨10.1158/0008-5472.CAN-15-3567⟩
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BibTex
titre
Numerical simulation of electrocardiograms for full cardiac cycles in healthy and pathological conditions
auteur
Elisa Schenone, Annabelle Collin, Jean-Frédéric Gerbeau
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2016, 32 (5), ⟨10.1002/cnm.2744⟩
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https://inria.hal.science/hal-01184744/file/ECG_final_version.pdf BibTex
titre
Modeling Spontaneous Metastasis following Surgery: An In Vivo-In Silico Approach
auteur
Sébastien Benzekry, Amanda Tracz, Michalis Mastri, R. Corbelli, Dominique Barbolosi, John M.L. Ebos
article
Cancer Research, 2016, 76 (3), pp.535 - 547. ⟨10.1158/0008-5472.CAN-15-1389⟩
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https://inria.hal.science/hal-01222046/file/benzekryEbos_surgery_all_HAL.pdf BibTex
titre
Impact of external medium conductivity on cell membrane electropermeabilization by microsecond and nanosecond electric pulses
auteur
Aude Silve, Isabelle Leray, Clair Poignard, Lluis M. Mir
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep19957⟩
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BibTex
titre
Computational Trials: Unraveling Motility Phenotypes, Progression Patterns, and Treatment Options for Glioblastoma Multiforme
auteur
Fabio Raman, Elizabeth Scribner, Olivier Saut, Cornelia Wenger, Thierry Colin, Hassan M Fathallah-Shaykh
article
PLoS ONE, 2016, 11 (1), ⟨10.1371/journal.pone.0146617⟩
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https://inria.hal.science/hal-01396271/file/journal.pone.0146617.PDF BibTex
titre
In Vivo Bioluminescence Tomography for Monitoring Breast Tumor Growth and Metastatic Spreading: Comparative Study and Mathematical Modeling
auteur
Séverine Mollard, Raphaelle Fanciullino, Sarah Giacometti, Cindy Serdjebi, Sebastien Benzekry, Joseph Ciccolini
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.10. ⟨10.1038/srep36173⟩
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https://inria.hal.science/hal-01392861/file/Mollard_16_In%20vivo%20bioluminescence%20tomography%20for%20monitoring%20breast%20tumor%20growth%20and%20metastatic%20spreading-%20comparative%20study%20and%20mathematical%20modeling.pdf BibTex
titre
Next generation metronomic chemotherapy - report from the Fifth Biennial International Metronomic and Anti-angiogenic Therapy Meeting, 6 - 8 May 2016, Mumbai
auteur
Pan G Pantziarka, Lisa Hutchinson, Nicolas G André, Sébastien Benzekry, Francesco Bertolini, Atanu Bhattacharjee, Shubhada Chiplunkar, Dan G Duda, Vikram G Gota, Sudeep G Gupta, Amit J Joshi, Sadhana Kannan, Robert Kerbel, Mark Kieran, Antonella Palazzo, Aparna Parikh, Eddy G Pasquier, Vijay Patil, Kumar Prabhash, Yuval Shaked, Giselle Saulnier Sholler, Jaroslav J Sterba, David J Waxman, Shripad G Banavali
article
Ecancermedicalscience, 2016, 10, ⟨10.3332/ecancer.2016.689⟩
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https://inria.hal.science/hal-01392473/file/Pantziarka_16_Next%20generation%20metronomic%20chemotherapy%E2%80%94report%20from%20the%20Fifth%20Biennial%20International%20Metronomic%20and%20Anti-angiogenic%20Therapy%20Meeting%206%E2%80%938%20May%202016%20Mumbai.pdf BibTex
titre
Les lois de la croissance tumorale
auteur
Sébastien Benzekry
article
Bibliothèque Tangente, 2016
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https://inria.hal.science/hal-01418295/file/les_lois_de_la_croissance_tumorale_all.pdf BibTex
titre
Spatial modelling of tumour drug resistance: the case of GIST liver metastases Mathematical Medicine and Biology Advance
auteur
Guillaume Lefebvre, François Cornelis, Patricio Cumsille, Thierry Colin, Clair Poignard, Olivier Saut
article
Mathematical Medicine and Biology, 2016, 00, pp.1 - 26. ⟨10.1093/imammb/dqw002⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01380292/file/2016MMB-LCCCPS.pdf BibTex

Conference papers

titre
Computation of the electric field at the tissue scale when pulse voltages are applied to induce electroporation
auteur
Damien Voyer, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Laurent Krähenbühl, Riccardo Scorretti
article
10th EMF, Apr 2016, Lyon, France
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BibTex
titre
Asymptotic expansion for the magnetic potential in the eddy-current problem
auteur
Ronan Perrussel, Clair Poignard, Victor Péron, Ruth Sabariego, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl
article
10th EMF, Apr 2016, Lyon, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01393362/file/153.pdf BibTex
titre
Dynamic modeling of electroporation
auteur
L. Mir, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, A. Silve, Damien Voyer
article
ADVANCES IN MAGNETICS CONFERENCE (AIM) 2016, Mar 2016, Bormio, Italy
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BibTex
titre
Abstract 2099: Model-driven optimization of anti-angiogenics combined with chemotherapy: application to bevacizumab + pemetrexed/cisplatin doublet in NSCLC-bearing mice
auteur
Joseph Ciccolini, Sebastien Benzekry, Sarah Giacometti, Fabrice Barlesi, Dominique Barbolosi
article
107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research, 2016, New Orleans, France. pp.20, ⟨10.1158/1538-7445.AM2016-2099⟩
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BibTex

Poster communications

titre
The effects of the diffusive inclusions in the bidomain model: theoretical and numerical study. Application to the rat heart.
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard
article
2nd Scientific Workshop IHU-Liryc, Nov 2016, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-01418706/file/main.pdf BibTex
titre
Front observer for data assimilation of electroanatomical mapping data for a numerical atrial model
auteur
A Gérard, Annabelle Collin, J Bayer, A Frontera, Philippe Moireau, Yves Coudière
article
Liryc Workshop, Sep 2016, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-01400776/file/poster.pdf BibTex

Reports

titre
Mathematical model for transport of DNA plasmids from the external medium up to the nucleus by electroporation
auteur
Michael Leguèbe, Maria G. Notarangelo, Monika Twarogowska, Roberto Natalini, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8939, Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2016
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https://inria.hal.science/hal-01349522/file/RR-8939.pdf BibTex
titre
Free boundary problem for cell protrusion formations: theoretical and numerical aspects
auteur
Olivier Gallinato, Masahito Ohta, Clair Poignard, Takashi Suzuki
article
[Research Report] RR-8810, INRIA; Institut de Mathématiques de Bordeaux; Université de Bordeaux; Tokyo University of Science; Osaka University. 2016
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https://inria.hal.science/hal-01228013/file/RR-8810-rr.pdf BibTex
titre
Different Approaches used in Modeling of Cell Membrane Electroporation
auteur
Clair Poignard, A Silve, L Wegner
article
[Research Report] RR-8940, Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2016
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https://inria.hal.science/hal-01349523/file/RR-8940.pdf BibTex
titre
Mathematical modeling of tumor and metastatic growth when treated with sunitinib
auteur
Simon Evain, Sebastien Benzekry
article
[Research Report] Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2016
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01377994/file/Mathematical%20modeling%20of%20tumor%20and%20metastatic%20growth%20when%20treated%20with%20sunitinib%20EVAIN%20BENZEKRY.pdf BibTex
titre
Around a mathematical model of the concomitant tumor resistance phenomenon
auteur
Laura Lumale, Sébastien Benzekry
article
[Research Report] INRIA Bordeaux; Equipe MONC; INSA Toulouse. 2016
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https://hal.science/hal-01420449/file/rapport_stage.pdf BibTex

Theses

titre
Mathematical and numerical modelling of cell migration
auteur
Christèle Etchegaray
article
Analysis of PDEs [math.AP]. Université Paris Saclay (COmUE), 2016. English. ⟨NNT : 2016SACLS428⟩
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https://theses.hal.science/tel-01533458/file/ETCHEGARAY_2016_diffusion.pdf BibTex
titre
Modélisation de processus cancéreux et méthodes superconvergentes de résolution de problèmes d'interface sur grille cartésienne
auteur
Olivier Gallinato
article
Modélisation et simulation. Université de Bordeaux, 2016. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-01419334/file/manthesis.pdf BibTex
titre
Analyse mathématique et calibration de modèles de croissance tumorale
auteur
Thomas Michel
article
Mathématiques générales [math.GM]. Université de Bordeaux, 2016. Français. ⟨NNT : 2016BORD0222⟩
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https://theses.hal.science/tel-01419843/file/MICHEL_THOMAS_2016.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
The Modified Bidomain Model with Periodic Diffusive Inclusions
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard
article
2016
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BibTex
titre
Analysis of a non-local and non-linear Fokker-Planck model for cell crawling migration
auteur
Christèle Etchegaray, Nicolas Meunier, Raphael Voituriez
article
2016
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https://hal.science/hal-01437108/file/Etchegaray_Meunier_Voituriez_New.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Cell membrane permeabilization by 12-ns electric pulses: Not a purely dielectric, but a charge-dependent phenomenon
auteur
Aude Silve, Isabelle Leray, Michael Leguèbe, Clair Poignard, Lluis M. Mir
article
Bioelectrochemistry, 2015, Volume 106, Part B, December 2015, Pages 369–378, ⟨10.1016/j.bioelechem.2015.06.002⟩
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BibTex
titre
TMOD−03 * Motility controls growth and progression patterns of glioblastoma multiforme
auteur
Olivier Saut, Thierry Colin, Hassan Fathallah, Elizabeth Scribner
article
Neuro-Oncology, 2015, ⟨10.1093/neuonc/nov237.03⟩
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BibTex
titre
Computational Modelling of Metastasis Development in Renal Cell Carcinoma
auteur
Etienne Baratchart, Sébastien Benzekry, Andreas Bikfalvi, Thierry Colin, Lindsay S. Cooley, Raphäel Pineau, Emeline J Ribot, Olivier Saut, Wilfried Souleyreau
article
PLoS Computational Biology, 2015, 11 (11), ⟨10.1371/journal.pcbi.1004626⟩
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https://inria.hal.science/hal-01164834/file/journal.pcbi.1004626.pdf BibTex
titre
Capturing the Driving Role of Tumor-Host Crosstalk in a Dynamical Model of Tumor Growth
auteur
Sebastien Benzekry, Afshin Beheshti, Philip Hahnfeldt, Lynn Hlatky
article
Bio-protocol , 2015, 5 (21)
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https://inria.hal.science/hal-01222068/file/Capturing%20the%20Driving%20Role%20of%20Tumor-Host%20Crosstalk_Final.pdf BibTex
titre
Adaptive radiotherapy in routine: The radiation oncologist's point of view
auteur
Olivier Saut, Bénédicte Henriques de Figueiredo, Adeline Petit, Paul Sargos, Guy Kantor, Claudia Pouypoudat, Christina Zacharatou, Mikael Antoine
article
Cancer/Radiothérapie, 2015, 19 (6), ⟨10.1016/j.canrad.2015.06.016⟩
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BibTex
titre
A Luenberger observer for reaction-diffusion models with front position data
auteur
Annabelle Collin, Dominique Chapelle, Philippe Moireau
article
Journal of Computational Physics, 2015, 300, pp.20. ⟨10.1016/j.jcp.2015.07.044⟩
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https://inria.hal.science/hal-01111675/file/RDEstimPaper-resubmission.pdf BibTex
titre
A second-order Cartesian method for the simulation of electropermeabilization cell models
auteur
Michaël Leguèbe, Clair Poignard, Lisl Weynans
article
Journal of Computational Physics, 2015, 292, pp.26. ⟨10.1016/j.jcp.2015.03.028⟩
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BibTex
titre
Migration and orientation of endothelial cells on micropatterned polymers: A simple model based on classical mechanics
auteur
Julie Joie, Yifeng Lei, Marie-Christine Durrieu, Thierry Colin, Clair Poignard, Olivier Saut
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series B, 2015, 20 (4), ⟨10.3934/dcdsb.2015.20.1059⟩
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BibTex
titre
Host Age Is a Systemic Regulator of Gene Expression Impacting Cancer Progression
auteur
Afshin Beheshti, Sebastien Benzekry, J. Tyson Mcdonald, Lili Ma, Michael Peluso, Philip Hahnfeldt, Lynn Hlatky
article
Cancer Research, 2015, 75 (6), pp.10. ⟨10.1158/0008-5472.CAN-14-1053⟩
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BibTex
titre
Non-Linear Steady-State Electrical Current Modeling for the Electropermeabilization of Biological Tissue
auteur
Marie Breton, François Buret, Laurent Krähenbühl, Michael Leguèbe, Lluis M. Mir, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, Damien Voyer
article
IEEE Transactions on Magnetics, 2015, 51 (3), pp.7402104. ⟨10.1109/TMAG.2014.2351836⟩
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BibTex
titre
Metronomic Reloaded: Theoretical Models Bringing Chemotherapy into the Era of Precision Medicine
auteur
Sébastien Benzekry, Eddy Pasquier, Dominique Barbolosi, Bruno Lacarelle, Fabrice Barlési, Nicolas André, Joseph Ciccolini
article
Seminars in Cancer Biology, 2015, pp.23. ⟨10.1016/j.semcancer.2015.09.002⟩
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https://inria.hal.science/hal-01195547/file/BenzekryPasquierAndreCiccolini_SCB_15_Metronomic%20reloaded%20theoretical%20models%20bringing%20chemotherapy%20into%20the%20era%20of%20precision%20medicine_hal.pdf BibTex
titre
Improving efficacy of the combination between antiangiogenic and chemotherapy: Time for mathematical modeling support
auteur
Joseph Ciccolini, Sébastien Benzekry, Bruno Lacarelle, Dominique Barbolosi, Fabrice Barlesi
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, pp.1. ⟨10.1073/pnas.1506689112⟩
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BibTex
titre
Design principles for cancer therapy guided by changes in complexity of protein-protein interaction networks
auteur
Sebastien Benzekry, Jack A Tuszynski, Edward A Rietman, Giannoula Lakka Klement
article
Biology Direct, 2015, pp.14. ⟨10.1186/s13062-015-0058-5⟩
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https://inria.hal.science/hal-01158313/file/s13062-015-0058-5.pdf BibTex
titre
Patient specific simulation of tumor growth, response to the treatment and relapse of a lung metastasis: a clinical case
auteur
Thierry Colin, François Cornelis, Julien Jouganous, Jean Palussière, Olivier Saut
article
Journal of Computational Surgery, 2015, pp.18. ⟨10.1186/s40244-014-0014-1⟩
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https://inria.hal.science/hal-01102586/file/article.pdf BibTex

Conference papers

titre
Dynamic Modeling of Electroporation for the Computation of the Electric Field Distribution Inside Biological Tissues during the Application of the Pulse Voltage
auteur
Lluis Mir, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, A. Silve, Damien Voyer
article
1rst World Congress of Electroporation, WC2015, Sep 2015, Portorož, Slovenia. pp.211-214, ⟨10.1007/978-981-287-817-5_47⟩
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BibTex
titre
Microscopic Modelling of the Non-Linear Gap Junction Channels
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
2015 Computing in Cardiology Conference (CinC), Sep 2015, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-01418702/file/paper.pdf BibTex
titre
Efficient delta-parametrization of 2D Surface-Impedance solutions
auteur
Laurent Krähenbühl, Patrick Dular, Victor Péron, Ronan Perrussel, Ruth Sabariego, Clair Poignard
article
Compumag 2015, Jun 2015, Montréal, Canada. pp.442
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https://hal.science/hal-01174983/file/PC4%20Kr%C3%A4henb%C3%BChl-Efficient%20delta-parametrization%20of%202D%20Surface-Impedance%20solutions.pdf BibTex
titre
Sequential State Estimation for Electrophysiology Models with Front Level-Set Data Using Topological Gradient Derivations
auteur
Annabelle Collin, Dominique Chapelle, Philippe Moireau
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart 2015, Jun 2015, Maastricht, Netherlands. pp.402-411, ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_46⟩
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https://inria.hal.science/hal-01174916/file/ElectrophysioObserver-v1.pdf BibTex
titre
Impédances de surface en 2D : comparaison de méthodes de paramétrisation en δ
auteur
Laurent Krähenbühl, Patrick Dular, Victor Péron, Ronan Perrussel, Ruth Sabariego, Clair Poignard
article
Numélec 2015, Université de Nantes - IREENA, Jun 2015, Nantes, France
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https://hal.science/hal-01199546/file/Numelec2015_66.pdf BibTex
titre
On the growth and dissemination laws in a mathematical model of metastatic growth
auteur
Sébastien Benzekry, John M.L. Ebos
article
Workshop on Multiscale and Hybrid Modelling in Cell and Cell Population Biology, Mar 2015, Paris, France. ⟨10.1051/itmconf/20150500007⟩
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https://inria.hal.science/hal-01222088/file/benzekry_ebos.pdf BibTex

Master thesis

titre
Etude de sensibilité de modèles de croissance tumorale sous contrôle angiogénique
auteur
Maxime Prod'Homme
article
Mathématiques [math]. 2015
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https://inria.hal.science/hal-01215779/file/rapport.pdf BibTex

Poster communications

titre
Microscopic Modelling of the Non-Linear Gap Junction Channels
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
2015 Computing in Cardiology Conference, Sep 2015, Nice, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01418665/file/main.pdf BibTex
titre
Effects of non-linear GJ channels on the AP propagation : a modelling insight
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Thomas Desplantez, Clair Poignard
article
33RD ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN SECTION OF THE ISHR , Jul 2015, Bordeaux, France
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https://inria.hal.science/hal-01418687/file/ISHR2015-AD.pdf BibTex
titre
Modelling cardiac electrophysiology with structural heterogeneities and dynamical gap junctions
auteur
Anđela Davidović, Yves Coudière, Clair Poignard, Thomas Desplantez
article
2015 SIAM Conference on Computational Science and Engineering, Mar 2015, Salt Lake City, United States
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https://inria.hal.science/hal-01418697/file/main.pdf BibTex

Reports

titre
Superconvergent Cartesian Methods for Poisson type Equations in 2D–domains
auteur
Olivier Gallinato, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8809, INRIA; Institut de Mathématiques de Bordeaux; Université de Bordeaux. 2015, pp.33
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https://inria.hal.science/hal-01228046/file/RR-8809-rr.pdf BibTex
titre
Mathematical study and asymptotic analysis of a model for tumor drug resistance
auteur
Thierry Colin, Thomas Michel, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8784, Inria Bordeaux Sud-Ouest. 2015, 32 p
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https://inria.hal.science/hal-01211770/file/ColinMichelPoignard-HAL.pdf BibTex
titre
On the asymptotic expansion of the magnetic potential in eddy current problem: a practical use of asymptotics for numerical purposes
auteur
Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8749, INRIA Bordeaux; INRIA. 2015
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https://inria.hal.science/hal-01174009/file/RR-8749.pdf BibTex

Theses

titre
Modélisation et analyse de l'hétérogénéité tumorale lors de résistance aux traitements : cas des métastases hépatiques de GIST
auteur
Guillaume Lefebvre
article
Cancer. Université de Bordeaux, 2015. Français. ⟨NNT : 2015BORD0438⟩
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https://theses.hal.science/tel-01266727/file/LEFEBVRE_GUILLAUME_2015.pdf BibTex
titre
Modélisation et simulation de la croissance de métastases pulmonaires
auteur
Julien Jouganous
article
Equations aux dérivées partielles [math.AP]. Université de Bordeaux, 2015. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-01245553/file/These.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Effects of Anti-Angiogenesis on Glioblastoma Growth and Migration: Model to Clinical Predictions
auteur
Elizabeth Scribner, Olivier Saut, Province Paula, Bag Asim, Thierry Colin, Hassan Fathallah
article
PLoS ONE, 2014, pp.21. ⟨10.1371/journal.pone.0115018⟩
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BibTex
titre
Spatial Modeling of Tumor Drug Resistance: the case of GIST Liver Metastases
auteur
Guillaume Lefebvre, François Cornelis, Patricio Cumsille, Thierry Colin, Clair Poignard, Olivier Saut
article
Mathematical Medicine and Biology, 2014, pp.26. ⟨10.1093/imammb/dqw002⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01089452/file/RR-8642.pdf BibTex
titre
Conducting and permeable states of cell membrane submitted to high voltage pulses: Mathematical and numerical studies validated by the experiments
auteur
Michael Leguebe, Aude Silve, Lluis M Mir, Clair Poignard
article
Journal of Theoretical Biology, 2014, 360, pp.83-94. ⟨10.1016/j.jtbi.2014.06.027⟩
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BibTex
titre
Classical'' Electropermeabilization Modeling at the Cell Scale
auteur
Otared Kavian, Michael Leguèbe, Clair Poignard, Lisl Weynans
article
Journal of Mathematical Biology, 2014, 68 (1-2), pp.30. ⟨10.1007/s00285-012-0629-3⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00712683/file/RR-8005.pdf BibTex
titre
Différence de Potentiel Induite par un Champ Electrique sur la Membrane d'une Cellule Biologique
auteur
Clair Poignard, Aude Silve
article
La Revue 3E.I, 2014, 3EI, 75, pp.11-20
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00977590/file/Article2_Electromag.pdf BibTex
titre
A Multilayer Grow-or-Go Model for GBM: Effects of Invasive Cells and Anti-Angiogenesis on Growth.
auteur
Thierry Colin, Hassan Fathallah, Jean-Baptiste Lagaert, Olivier Saut
article
Bulletin of Mathematical Biology, 2014
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BibTex
titre
Thin Layer Models For Electromagnetism
auteur
Marc Duruflé, Victor Péron, Clair Poignard
article
Communications in Computational Physics, 2014, 16, pp.213-238. ⟨10.4208/cicp.120813.100114a⟩
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https://hal.science/hal-00918634/file/RevisedDPP13_CiCP.pdf BibTex
titre
Strong convergence results for the asymptotic behavior of the 3D-shell model
auteur
Dominique Chapelle, Annabelle Collin
article
Journal of Elasticity, 2014, 115 (2), pp.173-192. ⟨10.1007/s10659-013-9452-3⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00843766/file/3DshellPaper.pdf BibTex
titre
An inverse problem for the recovery of the vascularization of a tumor
auteur
Thierry Colin, Angelo Iollo, Jean-Baptiste Lagaert, Olivier Saut
article
Journal of Inverse and Ill-posed Problems, 2014, 0.1515/jip-2013-0009. ⟨10.1515/jip-2013-0009⟩
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BibTex
titre
Corner asymptotics of the magnetic potential in the eddy-current model
auteur
Monique Dauge, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2014, 37 (13), pp.1924-1955. ⟨10.1002/mma.2947⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00779067/file/RR-8204.pdf BibTex

Conference papers

titre
Patient Specific Image Driven Evaluation of the Aggressiveness of Metastases to the Lung
auteur
Thierry Colin, Francois Cornelis, Julien Jouganous, Marie Martin, Olivier Saut
article
MICCAI 2014, Sep 2014, United States. pp.1
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BibTex
titre
The Modified Bidomain Model with Periodic Diffusive Inclusions
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
Computing in Cardiology — 41st Annual Conference, Sep 2014, Cambridge, Massachusetts, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01117248/file/paper.pdf BibTex
titre
Asymptotic delta-Parametrization of Surface-Impedance Solutions
auteur
Laurent Krähenbühl, Patrick Dular, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Ruth Sabariego
article
IEEE CEFC, May 2014, Annecy, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00959750/file/CEFC2014_AsymptoticDeltaParametrization.pdf BibTex
titre
Nonlinear steady-state electrical current modeling for the electropermeabilization of biological tissue
auteur
Marie Breton, François Buret, Laurent Krähenbühl, Michael Leguèbe, Lluis M. Mir, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Riccardo Scorretti, Damien Voyer
article
IEEE CEFC, May 2014, Annecy, France. pp.CD
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BibTex
titre
An integro-differential equation for 1D cell migration
auteur
Christèle Etchegaray, Bérénice Grec, Bertrand Maury, Nicolas Meunier, Laurent Navoret
article
Integral Methods in Science and Engineering (IMSE), 2014, Karlsruhe, Germany. pp.195-207, ⟨10.1007/978-3-319-16727-5⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01083510/file/EtchegarayGrecMauryMeunierNavoret.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
A few advances in biological modeling and asymptotic analysis
auteur
Clair Poignard
article
Analysis of PDEs [math.AP]. Universite de Bordeaux, 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://theses.hal.science/tel-01113037/file/ThesisHDR.pdf BibTex

Master thesis

titre
An experimentally-based modeling study of the effect of anti-angiogenic therapies on primary tumor kinetics for data analysis of clinically relevant animal models of metastasis
auteur
Aristoteles Camillo
article
Cancer. 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01087741/file/Rapport_stage_M2.pdf BibTex

Poster communications

titre
The Modified Bidomain Model with Diffusive Inclusions
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
Computing in Cardiology — 41st Annual Conference, Sep 2014, Cambridge, Massachusetts, United States. 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01117258/file/main.pdf BibTex
titre
Influence of periodic diffusive inclusions on the bidomain model
auteur
Yves Coudière, Anđela Davidović, Clair Poignard
article
From the Clinic to Partial Differential Equations and Back: Emerging challenges for Cardiovascular Mathematics, Jan 2014, Providence, Rhode Island, United States. 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01117272/file/main.pdf BibTex

Reports

titre
Tumor growth model for ductal carcinoma: from in situ phase to stroma invasion
auteur
Thierry Colin, Olivier Gallinato, Clair Poignard, Olivier Saut
article
[Research Report] RR-8502, INRIA. 2014, pp.31
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00962163/file/RR-8502.pdf BibTex
titre
Conducting and Permeable States of Cell Membrane Submitted to High Voltage Pulses. Mathematical and Numerical Studies Validated by the Experiments.
auteur
Michael Leguebe, Aude Silve, Lluis M. Mir, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-8496, Inria Bordeaux Sud-Ouest; INRIA. 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00956017/file/RR-8496.pdf BibTex

Theses

titre
Asymptotic analysis in cardiac electrophysiology : applications in modeling and in data assimilation
auteur
Annabelle Collin
article
General Mathematics [math.GM]. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2014. English. ⟨NNT : 2014PA066198⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://theses.hal.science/tel-01075052/file/PhDThesisAnnabelleCollin.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Asymptotic Expansion of Steady-State Potential in a High Contrast Medium with a Thin Resistive Layer
auteur
Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
Applied Mathematics and Computation, 2013, 221, pp.48-65. ⟨10.1016/j.amc.2013.06.047⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00442659/file/RR-7163.pdf BibTex
titre
Modelling of the migration of endothelial cells on bioactive micropatterned polymers
auteur
Thierry Colin, Marie-Christine Durrieu, Julie Joie, Yifeng Lei, Youcef Mammeri, Clair Poignard, Olivier Saut
article
Mathematical Biosciences and Engineering, 2013, 10 (4), pp.997-1015. ⟨10.3934/mbe.2013.10.997⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00709993/file/RR-7998.pdf BibTex
titre
Theoretical investigation of the efficacy of antiangiogenic drugs combined to chemotherapy in xenografted mice.
auteur
Floriane Lignet, Sébastien Benzekry, Shelby Wilson, Frédérique Billy, Olivier Saut, Michel Tod, Benoit You, A. Adda Berkane, S. Kassour, M. X. Wei, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba
article
Journal of Theoretical Biology, 2013, 320, pp.86-99. ⟨10.1016/j.jtbi.2012.12.013⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
A surface-based electrophysiology model relying on asymptotic analysis and motivated by cardiac atria modeling
auteur
Dominique Chapelle, Annabelle Collin, Jean-Frédéric Gerbeau
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2013, 23 (14), pp.2749-2776. ⟨10.1142/S0218202513500450⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00723691/file/asymptoticAnalysis_m3as.pdf BibTex
titre
In vivo mathematical modeling of tumor growth from imaging data : soon to come in the future ?
auteur
Thierry Colin, Francois Cornelis, Olivier Saut, Patricio Cumsille, Damiano Lombardi, Angelo Iollo, J. Palussiere
article
Diagnostic and Interventional Imaging, 2013, pp.571-574
Accès au bibtex
BibTex

Conference papers

titre
Corner Asymptotics of the Magnetic Potential in the Eddy-Current Model
auteur
Monique Dauge, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
JSA 2013 - Journées Singulières Augmentées, Aug 2013, Rennes, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00931735/file/JS7_peron.pdf BibTex
titre
Surface-based electrophysiology modeling and assessment of physiological simulations in atria
auteur
Annabelle Collin, Jean-Frédéric Gerbeau, Mélèze Hocini, Michel Haïssaguerre, Dominique Chapelle
article
FIMH - 7th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2013, Londres, United Kingdom. pp.352-359, ⟨10.1007/978-3-642-38899-6_42⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00815974/file/FIMH2013.pdf BibTex

Book sections

titre
Reduced Order Models at work
auteur
Michel Bergmann, Thierry Colin, Angelo Iollo, Damiano Lombardi, Olivier Saut, Haysam Telib
article
Quarteroni, Alfio. Modeling, Simulation and Applications, 9, Springer, 2013
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00906908/file/manuscript.pdf BibTex

Poster communications

titre
Influence of periodic diffusive inclusions on the bidomain model
auteur
Andjela Davidovic, Yves Coudière, Clair Poignard
article
Workshop Liryc, 2013, Bordeaux, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00937884/file/poster-ad.pdf BibTex

Reports

titre
A second-order Cartesian method for the simulation of electropermeabilization cell models
auteur
Michael Leguèbe, Clair Poignard, Lisl Weynans
article
[Research Report] RR-8302, INRIA Bordeaux; INRIA. 2013, pp.35
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00821758/file/RR-8302.pdf BibTex
titre
Modelling of migration and orientation of endothelial cells on micropatterned polymers
auteur
Julie Joie, Y. Lei, Thierry Colin, Marie-Christine Durrieu, Clair Poignard, Olivier Saut
article
[Research Report] RR-8252, INRIA. 2013
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https://inria.hal.science/hal-00795238/file/RR-discret2.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Boundary Layer Correctors and Generalized Polarization Tensor for Periodic Rough Thin Layers. A Review for the Conductivity Problem
auteur
Clair Poignard
article
ESAIM: Proceedings, 2012, Mathematical and numerical approaches for multiscale problem, 37, pp.136-165. ⟨10.1051/proc/201237004⟩
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https://inria.hal.science/inria-00586103/file/RR-7603.pdf BibTex
titre
Eddy currents and corner singularities
auteur
François Buret, Monique Dauge, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Damien Voyer
article
IEEE Transactions on Magnetics, 2012, 48 (2), pp.679-682. ⟨10.1109/TMAG.2011.2175378⟩
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https://inria.hal.science/inria-00614033/file/ExtEddyCurrentCorner.pdf BibTex
titre
SYSTEM IDENTIFICATION IN TUMOR GROWTH MODELING USING SEMI-EMPIRICAL EIGENFUNCTIONS
auteur
Thierry Colin, Angelo Iollo, Damiano Lombardi, Olivier Saut
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2012, 22 (6), ⟨10.1142/s0218202512500030⟩
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https://hal.science/hal-04485448/file/Math.%20Mod.%20Meth.%20Appl.%20Sci.%202012%20COLIN.pdf BibTex
titre
Inverse Problems in tumor growth modeling by means of semiempirical eigenfunctions
auteur
Damiano Lombardi, Angelo Iollo, Thierry Colin, Olivier Saut
article
Mathematical Models and Methods in Applied Sciences, 2012, pp.1
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BibTex
titre
Prediction of the Evolution of Thyroidal Lung Nodules Using a Mathematical Model
auteur
Thierry Colin, Angelo Iollo, Damiano Lombardi, Olivier Saut
article
ERCIM News, 2012, 82, pp.37-38
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Conference papers

titre
Asymptotic Description of the Magnetic Potential near a Corner Singularity in the Bidimensional Eddy-Current Problem
auteur
Monique Dauge, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
WCCM 2012, Jul 2012, São Paulo, Brazil
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https://inria.hal.science/hal-00768026/file/WCCM12_slides.pdf BibTex

Book sections

titre
Some models for the prediction of tumor growth: general framework and applications to metastases in the lung
auteur
Damiano Lombardi, Thierry Colin, Angelo Iollo, Olivier Saut, Françoise Bonichon, J. Palussière
article
Computational Surgery, Springer, pp.1, 2012
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BibTex

Reports

titre
A Dynamical Model for the Transmembrane Potential Regulation by pH
auteur
Araks Martirosyan, Loïc Paulevé, Clair Poignard, Mireille Régnier, Jean-Marc Steyaert, Laurent Schwartz
article
[Research Report] LIX, Ecole polytechnique. 2012
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https://hal.science/hal-00769446/file/main.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Numerical treatment of rounded and sharp corners in the modeling of 2D electrostatic fields
auteur
Laurent Krähenbühl, François Buret, Ronan Perrussel, Damien Voyer, Patrick Dular, Victor Péron, Clair Poignard
article
Journal of Microwaves, Optoelectronics and Electromagnetic Applications, 2011, 10 (1), pp.66-81. ⟨10.1590/S2179-10742011000100008⟩
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https://hal.science/hal-00515107/file/Krahenbuhl_JMOe2011_rounded_corner_v3.pdf BibTex
titre
Dry Coating of Talc Particles: Effect of Material and Process Modifications on Their Wettability and Dispersibility
auteur
Guillaume Lefebvre, Laurence Galet, Alain Chamayou
article
AIChE Journal, 2011, 57 (1), pp.79-86. ⟨10.1002/aic.12239⟩
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https://hal.science/hal-01593330/file/dry-coating-of-talc-particles-effect-of-material.pdf BibTex
titre
Ion flux, transmembrane potential, and osmotic stabilization: A new electrophysiological dynamic model for Eukaryotic cells
auteur
Clair Poignard, Aude Silve, Frederic Campion, Lluis M. Mir, Olivier Saut, Laurent Schwartz
article
European Biophysics Journal, 2011, 40 (3), pp.235-246. ⟨10.1007/s00249-010-0641-8⟩
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https://inria.hal.science/inria-00477372/file/RR-7269.pdf BibTex
titre
Time-harmonic Maxwell equations in biological cells. The differential form formalism to treat the thin layer
auteur
Marc Duruflé, Victor Péron, Clair Poignard
article
Confluentes Mathematici, 2011, 3 (2), pp.325-357. ⟨10.1142/S1793744211000345⟩
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https://hal.science/hal-00651510/file/CM-Michelle.pdf BibTex
titre
Explicit characterization of the polarization tensor for rough thin layers
auteur
Clair Poignard
article
European Journal of Applied Mathematics, 2011, 22, pp.1-6. ⟨10.1017/S0956792510000252⟩
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BibTex
titre
Two-scale analysis for very rough thin layers. An explicit characterization of the polarization tensor
auteur
Ionel Sorin Ciuperca, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
Journal de Mathématiques Pures et Appliquées, 2011, 95 (3), pp.227-295. ⟨10.1016/j.matpur.2010.12.001⟩
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https://inria.hal.science/inria-00401835/file/RR-6975.pdf BibTex

Conference papers

titre
Impedance condition close to a corner in eddy-current problems
auteur
Monique Dauge, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
ACOMEN, Nov 2011, Liège, Belgium. pp.CD
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BibTex
titre
Eddy currents and corner singularities
auteur
François Buret, Monique Dauge, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Damien Voyer
article
Compumag 2011, Jul 2011, Sydney, Australia. pp.électronique
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https://hal.science/hal-00549380/file/EddyCurrentCorner.pdf BibTex
titre
2D electrostatic problems with rounded corners
auteur
François Buret, Monique Dauge, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Victor Péron, Ronan Perrussel, Clair Poignard, Damien Voyer
article
Compumag 2011, Jul 2011, Sydney, Australia. pp.électronique
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https://hal.science/hal-00549384/file/ElectroHighorder_20101209.pdf BibTex
titre
Thin Layer Models for Electromagnetism
auteur
Marc Duruflé, Victor Péron, Clair Poignard
article
Waves 2011: The 10th International Conference on Mathematical and Numerical Aspects of Waves, Jul 2011, Vancouver, Canada
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https://inria.hal.science/hal-00847009/file/WAVES2011-Peron.pdf BibTex

Theses

titre
Modeling, mathematical and numerical analysis of anti-cancerous therapies for metastatic cancers
auteur
Sébastien Benzekry
article
Analysis of PDEs [math.AP]. Université Aix-Marseille 1 – Université de Provence, 2011. English. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-01658210/file/these_benzekry_11.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
Influence of a Rough Thin Layer on the Potential
auteur
Ionel Sorin Ciuperca, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
IEEE Transactions on Magnetics, 2010, 46 (8), pp.2823 - 2826. ⟨10.1109/TMAG.2010.2044027⟩
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https://hal.science/hal-00506120/file/IEEE-T-Mag_46-8_07-2010_2823_Perrussel.pdf BibTex
titre
Modeling the early ionization of dielectrics by ultrashort laser pulses
auteur
Antoine Bourgeade, Candice Mézel, Olivier Saut
article
Journal of Scientific Computing, 2010, 44, pp.170-190. ⟨10.1007/s10915-010-9375-0⟩
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https://hal.science/hal-00489482/file/ion.pdf BibTex
titre
Toward a New Laser Induced Hydrodynamic Forward Transfer Process with Femtosecond Lasers
auteur
Ludovic Hallo, Candice Mézel, Antoine Bourgeade, Olivier Saut
article
Contributions to Plasma Physics, 2010, ⟨10.1002/ctpp.201010012⟩
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https://arxiv.org/pdf/0909.1964 BibTex
titre
Computational modeling of solid tumor growth: the avascular stage
auteur
Didier Bresch, Thierry Colin, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba, Olivier Saut
article
SIAM Journal on Scientific Computing, 2010, 32 (4), pp.2321-2344
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https://hal.science/inria-00148610/file/modcan.pdf BibTex
titre
OPTIMAL PLACEMENT OF ELECTRODES IN AN ELECTROPORATION PROCESS
auteur
Nicolae Cindea, Benoît Fabrèges, Frédéric de Gournay, Clair Poignard
article
ESAIM: Proceedings, 2010, 30, pp.34-43. ⟨10.1051/proc/2010004⟩
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BibTex
titre
Approximate Transmission Conditions through a rough thin layer. The case of the periodic roughness
auteur
Ionel Ciuperca, Mohammed Jai, Clair Poignard
article
European Journal of Applied Mathematics, 2010, 21 (1), pp.51-75. ⟨10.1017/S095679250999012X⟩
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https://inria.hal.science/inria-00356124/file/RR-6812.pdf BibTex

Conference papers

titre
Treatment of rounded and sharp corners in the numerical modeling of 2D electrostatic fields
auteur
Laurent Krähenbühl, François Buret, Ronan Perrussel, Damien Voyer, Patrick Dular, Victor Péron, Clair Poignard
article
MOMAG, Aug 2010, Vitória, Brazil. pp.CD
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https://hal.science/hal-00502238/file/MOMAG2010_rounded_corner_HALv04.pdf BibTex
titre
Conditions de transmission approchées en électromagnétisme pour des milieux cellulaires
auteur
Victor Péron, Marc Duruflé, Clair Poignard
article
40 ème CANUM Congrès National d'Analyse Numérique, May 2010, Carcans-Maubuisson, France
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BibTex
titre
A Transmission Problem in Electromagnetism with a Singular Interface
auteur
Gabriel Caloz, Monique Dauge, Erwan Faou, Victor Péron, Clair Poignard
article
6th Singular Days on Asymptotic Methods for PDEs, Apr 2010, Berlin, Germany
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https://inria.hal.science/inria-00528523/file/TalkJS6.pdf BibTex
titre
Surface modification of talc particles by dry coating : influence on the wettability and the dispersibility in aqueous solutions
auteur
Guillaume Lefebvre, Laurence Galet, Alain Chamayou
article
WCPT6 2010 -World Congress on Particle Technology, Apr 2010, Nuremberg, Germany. 4 p
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BibTex
titre
Modelamiento matemático de crecimiento de tumores, acoplado con angiogénesis tumoral y su uso en la investigación de nuevas estrategias de tratamiento del cáncer
auteur
Patricio Cumsille, Cristóbal Quiñinao, Carlos Conca, Thierry Colin, Olivier Saut
article
III WORKSHOP IBEROAMERICANO DE MATEMÁTICAS APLICADAS, CHILLÁN (CHILE), Jan 2010, Chile. pp.1
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BibTex

Reports

titre
Numerical studies on the effect of electric pulses on an egg-shaped cell with a spherical nucleus
auteur
François Buret, Nicolas Faure, Laurent Nicolas, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-7270, Inria Bordeaux Sud-Ouest; INRIA. 2010, pp.21
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https://inria.hal.science/inria-00477495/file/RR-7270.pdf BibTex

2009

Journal articles

titre
A pharmacologically based multiscale mathematical model of angiogenesis and its use in investigating the efficacy of a new cancer treatment strategy.
auteur
Frédérique Billy, Benjamin Ribba, Olivier Saut, Hélène Morre-Trouilhet, Thierry Colin, Didier Bresch, Jean-Pierre Boissel, Emmanuel Grenier, Jean-Pierre Flandrois
article
Journal of Theoretical Biology, 2009, 260 (4), pp.545-62. ⟨10.1016/j.jtbi.2009.06.026⟩
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BibTex
titre
Approximate transmission conditions through a weakly oscillating thin layer
auteur
Clair Poignard
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2009, 32 (4), pp.435-453. ⟨10.1002/mma.1045⟩
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https://inria.hal.science/inria-00334772/file/membWosci-18pp.pdf BibTex
titre
A viscoelastic model for avascular tumor growth.
auteur
Didier Bresch, Thierry Colin, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba, Olivier Saut
article
Discrete and Continuous Dynamical Systems - Series A, 2009, pp.101-108
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BibTex
titre
About the transmembrane voltage potential of a biological cell in time-harmonic regime
auteur
Clair Poignard
article
ESAIM: Proceedings, 2009, 26, pp.162-179
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https://inria.hal.science/inria-00352510/file/ESAIM-Proc-TMP.pdf BibTex

Conference papers

titre
Influence of a rough thin layer on the potential
auteur
Ionel Sorin Ciuperca, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
Compumag 2009, Nov 2009, Florianópolis, Brazil. à paraître
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https://hal.science/hal-00412388/file/Compumag2008_Perrussel4.pdf BibTex
titre
Approximate Transmission Conditions for the Laplacian in a High Contrast Medium with a Thin Layer. The Influence of the Curvature.
auteur
Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
WAVES2009, the 9th International Conference on Mathematical and Numerical Aspects of Wave Propagation, Jun 2009, Pau, France
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https://inria.hal.science/inria-00442381/file/procWavesCor.pdf BibTex

Reports

titre
A viscoelastic model for avascular tumor growth
auteur
Didier Bresch, Thierry Colin, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba, Olivier Saut
article
[Research Report] 2009
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https://inria.hal.science/inria-00267292/file/paper.pdf BibTex
titre
Influence of a rough thin layer on the steady-state potential
auteur
Ionel Sorin Ciuperca, Ronan Perrussel, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-6935, INRIA. 2009, pp.11
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https://inria.hal.science/inria-00384198/file/RR-6935.pdf BibTex

2008

Journal articles

titre
Approximate conditions replacing thin layers
auteur
Clair Poignard, Patrick Dular, Ronan Perrussel, Laurent Krähenbühl, Laurent Nicolas, Michelle Schatzman
article
IEEE Transactions on Magnetics, 2008, 44 (6), pp.1154 -- 1157. ⟨10.1109/TMAG.2007.916154⟩
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https://hal.science/hal-00165049/file/ieee_tmag_44_poignard.pdf BibTex
titre
Modèle mathématique multi-échelle de l'angiogenèse tumorale et application à l'analyse de l'efficacité de traitements anti-angiogéniques.
auteur
Thierry Colin, Frédérique Billy, Olivier Saut, Hélène Morre-Trouilhet, Didier Bresch, Benjamin Ribba, Emmanuel Grenier
article
Bulletin du Cancer, 2008, 95 (65), pp.1
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BibTex
titre
Asymptotics for Steady State Voltage Potentials in a Bidimensional Highly Contrasted Medium
auteur
Clair Poignard
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2008, 31 (4), pp.443-479. ⟨10.1002/mma.923⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00083670/file/completasympt.pdf BibTex
titre
Asymptotics for steady state voltage potentials in a bidimensional highly contrasted medium with thin layer
auteur
Clair Poignard
article
Mathematical Methods in the Applied Sciences, 2008, 31 (4), pp.443-479. ⟨10.1002/mma.923⟩
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https://inria.hal.science/inria-00334770/file/MMAS-31pp.pdf BibTex

Reports

titre
Approximate transmission conditions for time-harmonic Maxwell equations in a domain with thin layer
auteur
Victor Péron, Clair Poignard
article
[Research Report] RR-6775, INRIA. 2008, pp.37
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00347971/file/RR-6775.pdf BibTex

2007

Journal articles

titre
Generalized Impedance Boundary Condition At High Frequency For A Domain With Thin Layer: The Circular Case
auteur
Clair Poignard
article
Applicable Analysis, 2007, 86 (12), pp.1549-1568. ⟨10.1080/00036810701714172⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00334771/file/GIBC-18pp.pdf BibTex
titre
Quelques méthodes de paramètre d'ordre avec applications à la modélisation de processus cancéreux
auteur
Didier Bresch, Thierry Colin, Emmanuel Grenier, Benjamin Ribba, Olivier Saut, Pushpendra Singh, Claude Verdier
article
ESAIM: Proceedings, 2007, 18, pp.163-180. ⟨10.1051/proc:071814⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00196827/file/ESAIM.pdf BibTex
titre
Asymptotically precise norm estimates of scattering from a small circular inhomogeneity
auteur
Derek J. Hansen, Clair Poignard, Michael S. Vogelius
article
Applicable Analysis, 2007, 86 (4), pp.433-458. ⟨10.1080/00036810701243073⟩
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https://inria.hal.science/inria-00334779/file/AA-26pp.pdf BibTex

Conference papers

titre
Asymptotics Methods to Compute Electromagnetic Fields
auteur
Clair Poignard, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Laurent Nicolas, Michelle Schatzman
article
Compumag 2007, Jun 2007, Aachen, Germany. pp.979
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00360339/file/Compumag2007_Poignard.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Rigorous Asymptotics For The Elecric Field In TM Mode At Mid-Frequency In A Bidimensional Medium With Thin Layer
auteur
Clair Poignard
article
2007
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00085930/file/helmscal11_03.pdf BibTex
titre
Bidimensional study of the Maxwell-Bloch model in a nonlinear crystal
auteur
Olivier Saut
article
2007
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00131950/file/bidim.pdf BibTex
titre
Propagation d'impulsion laser ultracourtes dans un cristal non linéaire
auteur
Olivier Saut, Antoine Bourgeade
article
2007
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00128697/file/esaim.pdf BibTex

2006

Journal articles

titre
Numerical methods for the bidimensional Maxwell–Bloch equations in nonlinear crystals
auteur
Olivier Saut, Antoine Bourgeade
article
Journal of Computational Physics, 2006, 213, pp.Issue 2, Pages 823-843. ⟨10.1016/j.jcp.2005.09.003⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00131958/file/jcp.pdf BibTex
titre
Algebraic Multilevel Methods for Edge Elements
auteur
Ronan Perrussel, Laurent Nicolas, François Musy, Laurent Krähenbühl, Michelle Schatzman, Clair Poignard
article
IEEE Transactions on Magnetics, 2006, 42 (4), pp.619-622. ⟨10.1109/TMAG.2006.871604⟩
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https://hal.science/hal-00111256/file/IEEE_T-Mag_42-4_04-2006_0619_Algebraic_Multilevel.pdf BibTex
titre
A multiscale mathematical model of avascular tumor growth to investigate the therapeutic benefit of anti-invasive agents
auteur
Benjamin Ribba, Olivier Saut, T. Colin, D. Bresch, Emmanuel Grenier, J.-P. Boissel
article
Journal of Theoretical Biology, 2006, 243, pp.532-541
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BibTex
titre
A multiscale mathematical model of avascular tumor growth to investigate the therapeutic benefit of anti-invasive agents
auteur
Benjamin Ribba, Olivier Saut, Thierry Colin, Didier Bresch, Emmanuel Grenier, Jean-Pierre Boissel
article
Journal of Theoretical Biology, 2006, 243 (4), pp.532-541. ⟨10.1016/j.jtbi.2006.07.013⟩
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BibTex
titre
A multiscale mathematical model of avascular tumor growth to investigate the therapeutic benefit of anti-invasive agent
auteur
Benjamin Ribba, Olivier Saut, Didier Bresch, Emmanuel Grenier, Jean-Pierre Boissel
article
Journal of Theoretical Biology, 2006, 243 (4), pp.532-541. ⟨10.1016/j.jtbi.2006.07.013⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00385848/file/ribba2.pdf BibTex

Conference papers

titre
Méthodes asymptotiques pour le calcul de champs
auteur
Clair Poignard, Patrick Dular, Laurent Krähenbühl, Laurent Nicolas, Michelle Schatzman
article
Numélec 2006, Nov 2006, Lille, France. pcn-104
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00398408/file/pcn-104.pdf BibTex

Theses

titre
Méthodes asymptotiques pour le calcul des champs électromagnétiques dans des milieux à couches minces. Application aux cellules biologiques.
auteur
Clair Poignard
article
Mathématiques [math]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2006. Français. ⟨NNT : ⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://theses.hal.science/tel-00124110/file/these.pdf BibTex

2005

Journal articles

titre
Une méthode spectrale pour les équations de Maxwell–Bloch bidimensionnelles dans les cristaux non-linéaires
auteur
Olivier Saut
article
Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série I, Mathématique, 2005, 340 (12), pp.927-932. ⟨10.1016/j.crma.2005.04.004⟩
Accès au bibtex
BibTex

2004

Journal articles

titre
A Maxwell-Bloch model with discrete symmetries for wave propagation in nonlinear crystals: an application to KDP
auteur
Christophe Besse, Brigitte Bidégaray-Fesquet, Antoine Bourgeade, Pierre Degond, Olivier Saut
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2004, 38 (2), pp.321-344. ⟨10.1051/m2an:2004015⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00018460/file/m2an0371.pdf BibTex
titre
Computational modeling of ultrashort powerful laser pulses in a nonlinear crystal
auteur
Olivier Saut
article
Journal of Computational Physics, 2004, 197 (2), pp.624-646. ⟨10.1016/j.jcp.2003.12.016⟩
Accès au bibtex
BibTex