Publications HAL de la collection SOFA

2025

Conference papers

titre
Towards Real-Time Simulation of Soft Robots with Contacts using a Method of Hybrid Hyper-Reduction
auteur
Olivier Goury, Samuel Mohsen Youssef, Simon Le Berre, Christian Duriez
article
IEEE ROBOSOFT 2025, Cosimo della Santina; Josie Hughes, Apr 2025, Lausanne, Switzerland
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https://inria.hal.science/hal-04935584/file/Contact_Reduction_RoboSoft2025_CameraReady.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Using Haptic Feedback in Digital Rectal Examination Training
auteur
Sizhe Tian, Yinoussa Adagolodjo, Jeremie Dequidt
article
2025
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https://hal.science/hal-04886503/file/Haptic_DRE_WIP_Eurohaptic_2024.pdf BibTex

2024

Journal articles

titre
A Zero-Shot Reinforcement Learning Strategy for Autonomous Guidewire Navigation
auteur
Valentina Scarponi, Michel Duprez, Florent Nageotte, Stéphane Cotin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2024, 19, pp.1185-1192. ⟨10.1007/s11548-024-03092-4⟩
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https://inria.hal.science/hal-04488626/file/Manuscript.pdf BibTex
titre
Sim-to-Real Transfer of Soft Robotic Navigation Strategies That Learns from the Virtual Eye-in-Hand Vision
auteur
Jiewen Lai, Tian-Ao Ren, Wenchao Yue, Shijian Su, Jason Y. K. Chan, Hongliang Ren
article
IEEE Transactions on Industrial Informatics, 2024, 20 (2), pp.2365-2377. ⟨10.1109/TII.2023.3291699⟩
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https://hal.science/hal-04538063/file/tii-articles-template.pdf BibTex

Conference papers

titre
Towards realistic needle insertion training simulator using partitioned model order reduction
auteur
Félix Vanneste, Claire Martin, Olivier Goury, Hadrien Courtecuisse, Erik Pernod, Stéphane Cotin, Christian Duriez
article
MICCAI 2024 - International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2024, Marrakech, Morocco. ⟨10.1007/978-3-031-72089-5_62⟩
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https://hal.science/hal-04717755/file/Paper-2954.pdf.pdf BibTex
titre
Linear compliant control design for soft robots
auteur
Antoine Alessandrini, Alexandre Kruszewski
article
ICRA 2024 - 40th IEEE International Conference on Robotics and Automation - ICRA@40, IEEE, Sep 2024, Rotterdam, Netherlands
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https://hal.science/hal-04893286/file/ICRA40_Extented_Abstract.pdf BibTex
titre
Condensed semi-implicit dynamics for trajectory optimization in soft robotics
auteur
Etienne Ménager, Alexandre Bilger, Wilson Jallet, Justin Carpentier, Christian Duriez
article
IEEE International Conference on Soft Robotics (RoboSoft), IEEE, Apr 2024, San Diego (CA), United States. ⟨10.1109/RoboSoft60065.2024.10521997⟩
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https://hal.science/hal-04466639/file/trajectory_optimisation_arxiv.pdf BibTex
titre
Learning control strategy in soft robotics through a set of configuration spaces
auteur
Etienne Ménager, Christian Duriez
article
IEEE International Conference on Soft Robotics (RoboSoft), IEEE, Apr 2024, San Diego (CA), United States
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https://hal.science/hal-04466557/file/configuration_space_arxiv.pdf BibTex

Reports

titre
Mechanical compliance: from soft robot modeling theory to finite element method computation
auteur
Christian Duriez
article
RT-0521, INRIA - Centre Lille Nord Europe. 2024
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https://inria.hal.science/hal-04469924/file/rr_inria_5_4-4.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
VisAdapt: Catadioptric Adaptive Camera for scenes of variable density of visual information
auteur
Julien Jean Ducrocq, Guillaume Caron, Hervé Midavaine, Christian Duriez, Jérémie Dequidt, El Mustapha Mouaddib
article
Applied optics, 2023, 62 (35), pp.9207-9214. ⟨10.1364/AO.500663⟩
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https://hal.science/hal-04276452/file/visadapt.pdf BibTex
titre
Augmented reality in liver surgery
auteur
Belkacem Acidi, Mohammed Ghallab, Stéphane Cotin, Eric Vibert, Nicolas Golse
article
Journal of Visceral Surgery, 2023, 160 (2), pp.118-126. ⟨10.1016/j.jviscsurg.2023.01.008⟩
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BibTex
titre
Constraint-based Simulation of Passive Suction Cups
auteur
Antonin Bernardin, Eulalie Coevoet, Paul Kry, Sheldon Andrews, Christian Duriez, Maud Marchal
article
ACM Transactions on Graphics, 2023, 42 (1), pp.1-14. ⟨10.1145/3551889⟩
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https://inria.hal.science/hal-03869711/file/PassiveSuctionCups.pdf BibTex
titre
Modeling and Control of a 5-DOF Parallel Continuum Haptic Device
auteur
Margaret Koehler, Thor Morales Bieze, Alexandre Kruszewski, Allison Okamura, Christian Duriez
article
IEEE Transactions on Robotics, 2023, 39 (5), pp.3636-3654. ⟨10.1109/TRO.2023.3277068⟩
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https://hal.science/hal-04315434/file/Modeling_and_Control_of_a_Deformable_5_DOF_Haptic_Device%283%29.pdf BibTex
titre
Toward the use of proxies for efficient learning manipulation and locomotion strategies on soft robots.
auteur
Etienne Ménager, Quentin Peyron, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, In press, ⟨10.48550/arXiv.2310.17029⟩
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https://inria.hal.science/hal-04249925/file/proxy_RAL.pdf BibTex

Conference papers

titre
Intraoperative CT augmentation for needle-based liver interventions
auteur
Juan Verde, Nicolas Padoy, Stéphane Cotin, Sidaty El Hadramy
article
MICCAI 2023, Oct 2023, Vancouver, Canada
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https://inria.hal.science/hal-04167447/file/MICCAI2023_Intraoperative_CT_augmentation_for_needle_based_liver_interventions.pdf BibTex
titre
Shape Servoing of a Soft Object Using Fourier Series and a Physics-based Model
auteur
Fouad Makiyeh, François Chaumette, Maud Marchal, Alexandre Krupa
article
IROS 2023 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2023, Detroit (MI), United States. pp.6356-6363
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https://hal.science/hal-04215551/file/IROS23_Fouad_Makiyeh.pdf BibTex
titre
Direct and inverse modeling of soft robots by learning a condensed FEM model
auteur
Etienne Ménager, Tanguy Navez, Olivier Goury, Christian Duriez
article
ICRA 2023 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2023, London, United Kingdom. pp.530-536, ⟨10.1109/ICRA48891.2023.10161537⟩
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https://inria.hal.science/hal-04167863/file/predictingcompliance.pdf BibTex
titre
Efficient Needle Insertion Simulation using Hybrid Constraint Solver and Isolated DOFs
auteur
Claire Martin, Ziqiu Zeng, Hadrien Courtecuisse
article
Eurographics 2023 - Short Papers, May 2023, Saarbrücken, Germany. ⟨10.2312/egs.20231003⟩
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https://hal.science/hal-04181906/file/Martin_et_al_EG_short_2023.pdf BibTex

Theses

titre
Exploring state descriptions and soft robot simulations for learning and control
auteur
Etienne Ménager
article
Computer science. Université de Lille, 2023. English. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-04393826/file/PhD_MENAGER.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
An efficient implicit constraint resolution scheme for interactive FE simulations
auteur
Ziqiu Zeng, Hadrien Courtecuisse
article
2023
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https://hal.science/hal-04125042/file/ImplicitConstraintResolution.pdf BibTex
titre
Efficient parallelization strategy for real-time FE simulations
auteur
Ziqiu Zeng, Hadrien Courtecuisse
article
2023
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https://hal.science/hal-04122582/file/MatrixAssembly_Arxiv.pdf BibTex
titre
An Open Source Design Optimization Toolbox Evaluated on a Soft Finger
auteur
Stefan Escaida Navarro, Tanguy Navez, Olivier Goury, Luis Molina, Christian Duriez
article
2023
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/2304.07260 BibTex

2022

Journal articles

titre
A concise guide to modelling the physics of embodied intelligence in soft robotics
auteur
Gianmarco Mengaldo, Federico Renda, Steven L Brunton, Moritz Bächer, Marcello Calisti, Christian Duriez, Gregory S Chirikjian, Cecilia Laschi
article
Nature Reviews Physics, 2022, 4 (9), pp.595-610. ⟨10.1038/s42254-022-00481-z⟩
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https://inria.hal.science/hal-03921606/file/NRP_soft_modeling.pdf BibTex
titre
A Simulation Framework for Magnetic Continuum Robots
auteur
Roland Dreyfus, Quentin Boehler, Bradley J. Nelson
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2022, 7 (3), pp.8370 - 8376. ⟨10.1109/LRA.2022.3187249⟩
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https://hal.science/hal-03710049/file/ral_iros_2022_sofa_for_magnetic_tools%20%288%29.pdf BibTex
titre
Real‐Time FE Simulation for Large‐Scale Problems Using Precondition‐Based Contact Resolution and Isolated DOFs Constraints
auteur
Ziqiu Zeng, Stéphane Cotin, Hadrien Courtecuisse
article
Computer Graphics Forum, 2022, 41 (6), pp.418-434. ⟨10.1111/cgf.14563⟩
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https://hal.science/hal-03694167/file/CGF2022.pdf BibTex
titre
Pose Estimation and Non-rigid Registration for Augmented Reality during Neurosurgery
auteur
Nazim Haouchine, Parikshit Juvekar, Michael Nercessian, William Wells, Alexandra Golby, Sarah Frisken
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2022, 69 (4), pp.1310 - 1317. ⟨10.1109/TBME.2021.3113841⟩
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https://inria.hal.science/hal-03675005/file/main.pdf BibTex
titre
Calibration method for soft robots modeled with FEM: application to anisotropy
auteur
Félix Vanneste, Olivier Goury, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2022, ⟨10.1109/LRA.2022.3155784⟩
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https://inria.hal.science/hal-03620806/file/ROBOSOFT_2022_RAL.pdf BibTex
titre
Planning of soft-rigid Hybrid arms in Contact with Compliant Environment: application to the transrectal biopsy of the prostate
auteur
Eulalie Coevoet, Yinoussa Adagolodjo, Meichun Lin, Christian Duriez, Fanny Ficuciello
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2022, 7 (2), pp.4853-4860. ⟨10.1109/LRA.2022.3152322⟩
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https://inria.hal.science/hal-03729071/file/PlanningHybrid.pdf BibTex
titre
DeepPhysics: a physics aware deep learning framework for real-time simulation
auteur
Alban Odot, Ryadh Haferssas, Stéphane Cotin
article
International Journal for Numerical Methods in Engineering, 2022, 123 (10), pp.2381-2398. ⟨10.1002/nme.6943⟩
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https://hal.science/hal-03327818/file/Phy_pred_hal_arxiv_compatible.pdf BibTex
titre
SofaGym: An open platform for Reinforcement Learning based on Soft Robot simulations
auteur
Etienne Ménager, Pierre Schegg, Elie Khairallah, Damien Marchal, Jérémie Dequidt, Philippe Preux, Christian Duriez
article
Soft Robotics, In press
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https://inria.hal.science/hal-03778189/file/SofaGym.pdf BibTex
titre
Visual Haptic Feedback for Training of Robotic Suturing
auteur
François Jourdes, Brice Valentin, Jérémie Allard, Christian Duriez, Barbara Seeliger
article
Frontiers in Robotics and AI, 2022, ⟨10.3389/frobt.2022.800232⟩
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https://hal.science/hal-03797750/file/islandora_146013.pdf BibTex
titre
Proximity Perception in Human-Centered Robotics: A Survey on Sensing Systems and Applications
auteur
Stefan Escaida Navarro, Stephan Mühlbacher-Karrer, Hosam Alagi, Hubert Zangl, Keisuke Koyama, Björn Hein, Christian Duriez, Joshua R Smith
article
IEEE Transactions on Robotics, 2022, 38, pp.1599-1620. ⟨10.1109/TRO.2021.3111786⟩
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https://inria.hal.science/hal-03156830/file/T_RO_ProximityPerception_Accepted.pdf BibTex

Conference papers

titre
An Optimal Control Problem for Elastic Registration and Force Estimation in Augmented Surgery
auteur
Guillaume Mestdagh, Stéphane Cotin
article
MICCAI 2022 - 25th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2022, Singapore, Singapore. ⟨10.1007/978-3-031-16449-1_8⟩
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https://inria.hal.science/hal-03691913/file/mestdagh-cotin-2022-preprint.pdf BibTex
titre
Unscented Kalman Filtering for Real Time Thermometry During Laser Ablation Interventions
auteur
Mohammadamin Soltani-Sarvestani, Stéphane Cotin, Paola Saccomandi
article
EMBC 2022 - International Engineering in Medicine and Biology Conference, Jul 2022, Glasgow, United Kingdom
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https://inria.hal.science/hal-03698066/file/Soltani_EMBC_2022_final_2_PS_last.pdf BibTex
titre
Deliberation in autonomous robotic surgery: a framework for handling anatomical uncertainty
auteur
Eleonora Tagliabue, Daniele Meli, Diego Dall'Alba, Paolo Fiorini
article
2022 IEEE International Conference on Robotics and Automation (ICRA 2022), IEEE, May 2022, Philadelphie, PA, United States
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https://hal.science/hal-03671364/file/DEFRAS_ICRA22.pdf BibTex
titre
Automated planning for robotic guidewire navigation in the coronary arteries
auteur
Pierre Schegg, Jérémie Dequidt, Eulalie Coevoet, Edouard Leurent, Rémi Sabatier, Philippe Preux, Christian Duriez
article
Robosoft 2022 - International Conference on Soft Robotics, Apr 2022, Edimbourg, United Kingdom
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https://inria.hal.science/hal-03778352/file/Automated_planning_for_robotic_guidewire_navigation_in_the_coronary_arteries.pdf BibTex

Theses

titre
An optimal control formulation for organ registration in augmented surgery
auteur
Guillaume Mestdagh
article
Optimization and Control [math.OC]. Université de Strasbourg, 2022. English. ⟨NNT : 2022STRAD014⟩
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https://hal.science/tel-03865304/file/MESTDAGH_Guillaume_2022_ED269.pdf BibTex
titre
Modeling of soft robots made of anisotropic mesostructured materials
auteur
Félix Vanneste
article
Modeling and Simulation. Université de Lille 1, Sciences et Technologies; CRIStAL UMR 9189, 2022. English. ⟨NNT : ⟩
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https://hal.science/tel-03788950/file/thesis_manuscript.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Model-Based Disturbance Estimation for a Fiber-Reinforced Soft Manipulator using Orientation Sensing
auteur
Barnabas Gavin Cangan, Stefan Escaida Navarro, Bai Yang, Yu Zhang, Christian Duriez, Robert K. Katzschmann
article
2022
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https://arxiv.org/pdf/2206.11626 BibTex

2021

Journal articles

titre
Coupling numerical deformable models in global and reduced coordinates for the simulation of the direct and the inverse kinematics of Soft Robots
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Federico Renda, Christian Duriez, Yinoussa Adagolodjo
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2021, IEEE Robotics and Automation Letters, 6 (2), pp.3910-3917. ⟨10.1109/LRA.2021.3061977⟩
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https://hal.science/hal-03192168/file/COSSERAT.pdf BibTex
titre
Real-Time Simulation For Control Of Soft Robots With Self-Collisions Using Model Order Reduction For Contact Forces
auteur
Olivier Goury, Bruno Carrez, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2021, 6 (2), pp.3752 - 3759. ⟨10.1109/LRA.2021.3064247⟩
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https://inria.hal.science/hal-03192762/file/MORC.pdf BibTex
titre
Trajectory Tracking Control Design for Large-Scale Linear Dynamical Systems With Applications to Soft Robotics
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez
article
IEEE Transactions on Control Systems Technology, 2021, 29 (2), pp.556-566. ⟨10.1109/TCST.2019.2953624⟩
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https://hal.science/hal-02404003/file/08930042%20%281%29.pdf BibTex
titre
On the use of simulation in robotics: Opportunities, challenges, and suggestions for moving forward
auteur
Heesun Choi, Cindy Crump, Christian Duriez, Asher Elmquist, Gregory Hager, David Han, Frank Hearl, Jessica Hodgins, Abhinandan Jain, Frederick Leve, Chen Li, Franziska Meier, Dan Negrut, Ludovic Righetti, Alberto Rodriguez, Jie Tan, Jeff Trinkle
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (1), ⟨10.1073/pnas.1907856118⟩
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https://inria.hal.science/hal-04276447/file/revisedManuscript05242020.pdf BibTex
titre
FEM-based Gain-Scheduling Control of a Soft Trunk Robot
auteur
Ke Wu, Gang Zheng
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2021, 6 (2), pp.3081 - 3088. ⟨10.1109/LRA.2021.3061311⟩
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BibTex
titre
Data-Driven Intra-Operative Estimation of Anatomical Attachments for Autonomous Tissue Dissection
auteur
Eleonora Tagliabue, Diego Dall'Alba, Micha Pfeiffer, Marco Piccinelli, Riccardo Marin, Umberto Castellani, Stefanie Speidel, Paolo Fiorini
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2021, 6, pp.1856 - 1863. ⟨10.1109/lra.2021.3060655⟩
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https://hal.science/hal-03349173/file/DataDrivenEstimationOfAttachments.pdf BibTex
titre
A Bio-Inspired Active Prostate Phantom for Adaptive Interventions
auteur
Stefan Escaida Navarro, Singh Dhaliwal, Mario Sanz Lopez, Sarah Wilby, Antony Palmer, Wojciech Polak, Rochdi Merzouki, Christian Duriez
article
IEEE Transactions on Medical Robotics and Bionics, In press, ⟨10.1109/TMRB.2021.3123385⟩
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https://inria.hal.science/hal-03374911/file/TMRB_BIP_Accepted.pdf BibTex

Conference papers

titre
Intra-operative Update of Boundary Conditions for Patient-specific Surgical Simulation
auteur
Eleonora Tagliabue, Marco Piccinelli, Diego Dall'Alba, Juan Verde, Micha Pfeiffer, Riccardo Marin, Stefanie Speidel, Paolo Fiorini, Stéphane Cotin
article
MICCAI 2021 - 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg, France. pp.373-382
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03315008/file/IntraopUpdateOfBCForSurgicalSimulation.pdf BibTex
titre
Turning an Articulated 3-PPSR Manipulator into a Parallel Continuum Robot
auteur
Oscar Gallardo, Benjamin Mauze, Redwan Dahmouche, Christian Duriez, Guillaume Laurent
article
IROS 2021 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Sep 2021, Prague, Czech Republic. ⟨10.1109/IROS51168.2021.9636596⟩
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https://hal.science/hal-03549322/file/d5c7e09c-cd07-43a6-9c27-d6fd4d5d9e44-author.pdf BibTex
titre
Personal-by-design: a 3D Electromechanical Model of the Heart Tailored for Personalisation
auteur
Gaëtan Desrues, Delphine Feuerstein, Thierry Legay, Serge Cazeau, Maxime Sermesant
article
FIMH 2021 - 11th International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2021, Stanford, CA, United States. ⟨10.1007/978-3-030-78710-3_43⟩
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https://inria.hal.science/hal-03369345/file/fimh_2021.pdf BibTex
titre
Robotic needle steering in deformable tissues with extreme learning machines
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi, Anna Cazzaniga, Paul Baksic, Eleonora Tagliabue, Elena de Momi, Hadrien Courtecuisse
article
AUTOMED 2021 - Automation in Medical Engineering, Jun 2021, Basel, Switzerland
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03187930/file/Robotic_needle_steering_in_deformable_tissues_with_extreme_learning_machines.pdf BibTex
titre
Shared control strategy for needle insertion into deformable tissue using inverse Finite Element simulation
auteur
Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse, Bernard Bayle
article
ICRA 2021 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2021, Xi’an / Virtual, China
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03191078/file/Icra2021_HAL.pdf BibTex
titre
Learning robotic needle steering from inverse finite element simulations
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi, Anna Cazzaniga, Paul Baksic, Eleonora Tagliabue, Elena de Momi, Hadrien Courtecuisse
article
ICRA 2021 - Workshop on Representing and Manipulating Deformable Objects, May 2021, Xi’an / Virtual, China
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https://hal.science/hal-03241674/file/14-PERRUSI-paper.pdf BibTex
titre
Interactive Finite Element model of needle insertion and laceration
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi, Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse
article
Eurographics 2021 - The 42nd Annual Conference of the European Association for Computer Graphics, European Association for Computer Graphics, May 2021, Vienne / Virtual, Austria. ⟨10.2312/egs.20211020⟩
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https://inria.hal.science/hal-03187709/file/Interactive_Finite_Element_model_of_needle_insertion_and_laceration__AAM_.pdf BibTex
titre
Enabling the control of a new degree of freedom by using anisotropic material on a 6-DOF parallel soft robot
auteur
Félix Vanneste, Olivier Goury, Christian Duriez
article
Robosoft 2021, Apr 2021, Yale / Virtual, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03194087/file/ROBOSOFT_2021_2sc_submission.pdf BibTex

Poster communications

titre
CoBra robot for localized cancer treatment and diagnosis under real-time MRI guidance
auteur
Sepaldeep Singh Dhaliwal, Sarah Wilby, Martijn de Vries, Kévin Brou Boni, Sina Firouzy, Stefan Escaida Navarro, Abdelkader Belarouci, Vincent Coelen, Othman Lakhal, David Pasquier, Antony L Palmer, Wojciech Polak, Dylan Jones, Ashraf Labib, John J Dobbelsteen, Mario Sanz Lopez, Christian Duriez, Nick Reynaert, Rochdi Merzouki
article
The Hamlyn Symposium on Medical Robotics Imperial College London, Jun 2021, London, United Kingdom
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03321170/file/CoBra_Hamlyn%20symposium_2021.pdf BibTex

2020

Journal articles

Screen%20Shot%202020-12-14%20at%202.50.25%20PM.png
titre
Predicted Microscopic Cortical Brain Images for Optimal Craniotomy Positioning and Visualization
auteur
Nazim Haouchine, Pariskhit Juvekar, Alexandra Golby, Sarah Frisken
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering: Imaging & Visualization, 2020, ⟨10.1080/21681163.2020.1834874⟩
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https://inria.hal.science/hal-03065619/file/haouchine_aecai_2020.pdf BibTex
titre
Three‐dimensional physics‐based registration of pelvic system using 2D dynamic magnetic resonance imaging slices
auteur
Hadrien Courtecuisse, Zhifan Jiang, Olivier Mayeur, Jean-Francois Witz, Pauline Lecomte-Grosbras, Michel Cosson, Mathias Brieu, Stéphane Cotin
article
Strain, 2020, 56 (3), ⟨10.1111/str.12339⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02873023/file/3D_Physics_based_Registration_of_Pelvic_System_Using_2D_Dynamic_MRI_Slices%281%29.pdf BibTex
titre
Estimation of boundary conditions for patient-specific liver simulation during augmented surgery
auteur
Sergei Nikolaev, Stéphane Cotin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2020, 15 (7), pp.1107-1115. ⟨10.1007/s11548-020-02188-x⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02634875/file/Estimation_of_boundary_conditions_for_patient_specific_liver_simulation_during_augmented_surgery.pdf BibTex
titre
Robust control of a silicone soft robot using neural networks
auteur
Gang Zheng, Yuan Zhou, Mingda Ju
article
ISA Transactions, 2020, 100, pp.38-45. ⟨10.1016/j.isatra.2019.12.004⟩
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https://inria.hal.science/hal-02406765/file/paper.pdf BibTex
titre
Constrained Stochastic State Estimation of Deformable 1D Objects: Application to Single-view 3D Reconstruction of Catheters with Radio-opaque Markers
auteur
Raffaella Trivisonne, Erwan Kerrien, Stéphane Cotin
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, 2020, 81, ⟨10.1016/j.compmedimag.2020.101702⟩
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https://hal.science/hal-02469093/file/CMIG.pdf BibTex
titre
Anisotropic soft robots based on 3D printed meso-structured materials: design, modeling by homogenization and simulation
auteur
Félix Vanneste, Olivier Goury, Jonas Martinez, Sylvain Lefebvre, Hervé Delingette, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2020, 5 (2), pp.2380-2386. ⟨10.1109/LRA.2020.2969926⟩
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https://inria.hal.science/hal-02475589/file/ICRA_2020_HAL.pdf BibTex
titre
Augmented Reality during Open Liver Surgery Using a Markerless Non-rigid Registration System
auteur
Nicolas Golse, Antoine Petit, Maïté Lewin, Eric Vibert, Stéphane Cotin
article
Journal of Gastrointestinal Surgery, 2020, ⟨10.1007/s11605-020-04519-4⟩
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BibTex
titre
Elastic registration based on compliance analysis and biomechanical graph matching
auteur
Jaime Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
Annals of Biomedical Engineering, 2020, 48, pp.447-462. ⟨10.1007/s10439-019-02364-4⟩
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https://hal.science/hal-02401280/file/abmeFormatMain.pdf BibTex
titre
Automatic Shape Control of Deformable Wires based on Model-Free Visual Servoing
auteur
Romain Lagneau, Alexandre Krupa, Maud Marchal
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2020, 5 (4), pp.5252 - 5259. ⟨10.1109/LRA.2020.3007114⟩
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https://inria.hal.science/hal-02890830/file/2020_ral-lagneau.pdf BibTex
titre
A Model-based Sensor Fusion Approach for Force and Shape Estimation in Soft Robotics
auteur
Stefan Escaida Navarro, Björn Hein, Stefan Escaida Navarro, Steven Nagels, Hosam Alagi, Lisa-Marie Faller, Olivier Goury, Thor Morales Bieze, Hubert Zangl, Bjorn Hein, Raf Ramakers, Wim Deferme, Gang Zheng, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2020, 5 (4), pp.5621-5628. ⟨10.1109/LRA.2020.3008120⟩
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https://inria.hal.science/hal-02882039/file/PrePrint_ModelBasedSensorFusion.pdf BibTex

Conference papers

titre
Deformation Aware Augmented Reality for Craniotomy using 3D/2D Non-rigid Registration of Cortical Vessels
auteur
Nazim Haouchine, Parikshit Juvekar, William M Wells Iii, Stéphane Cotin, Alexandra Golby, Sarah Frisken
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru. pp.735--744
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https://inria.hal.science/hal-02876726/file/MICCAI_2020_Cortical.pdf BibTex
titre
Use of stereo-laparoscopic liver surface reconstruction to compensate for pneumoperitoneum deformation through biomechanical modeling.
auteur
Andrea Teatini, Jean-Nicolas Brunet, Sergei Nikolaev, Bjørn Edwin, Stéphane Cotin, Ole Jakob Elle
article
VPH2020 - Virtual Physiological Human, Aug 2020, Paris, France
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https://inria.hal.science/hal-03130613/file/VPH2020_conference.pdf BibTex
titre
LPV Framework for Non-Linear Dynamic Control of Soft Robots using Finite Element Model
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez
article
IFAC 2020 - 21rst IFAC World Congress, Jul 2020, Berlin, Germany
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https://hal.science/hal-02567575/file/LPV_SoRo.pdf BibTex
titre
Estimation of boundary conditions for patient-specific liver simulation during augmented surgery
auteur
Sergei Nikolaev, Stéphane Cotin
article
IPCAI 2020 - The 11th International Conference on Information Processing in Computer-Assisted Interventions, Jun 2020, Munich, Germany. pp.1107-1115, ⟨10.1007/s11548-020-02188-x⟩
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https://hal.science/hal-03697401/file/Estimation_of_boundary_conditions_for_patient_specific_liver_simulation_during_augmented_surgery.pdf BibTex
titre
Robotic needle insertion in moving soft tissues using constraint-based inverse Finite Element simulation
auteur
Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse, Christian Duriez, Bernard Bayle
article
ICRA 2020 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2020, Paris / Virtual, France. pp.2407-2413, ⟨10.1109/ICRA40945.2020.9197515⟩
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https://hal.science/hal-02503574/file/ICRA_HAL.pdf BibTex
titre
Active Deformation through Visual Servoing of Soft Objects
auteur
Romain Lagneau, Alexandre Krupa, Maud Marchal
article
ICRA 2020 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2020, Paris, France. pp.1-7
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https://inria.hal.science/hal-02499488/file/Lagneau_icra_2020.pdf BibTex
titre
Simultaneous Tracking and Elasticity Parameter Estimation of Deformable Objects
auteur
Agniva Sengupta, Romain Lagneau, Alexandre Krupa, Eric Marchand, Maud Marchal
article
ICRA 2020 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2020, Paris, France. pp.1-7
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https://inria.hal.science/hal-02495831/file/ICRA2020_DefTrack_Estimation.pdf BibTex
Screen%20Shot%202020-12-14%20at%203.03.15%20PM.png
titre
Alignment of Cortical Vessels viewed through the Surgical Microscope with Preoperative Imaging to Compensate for Brain Shift
auteur
Nazim Haouchine, Parikshit Juvekar, Alexandra Golby, William M Wells, Stéphane Cotin, Sarah Frisken
article
Medical Imaging 2020: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling, Feb 2020, Houston, United States
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https://inria.hal.science/hal-03065632/file/haouchine_SPIE_2020.pdf BibTex

Book sections

titre
Data-driven simulation for augmented surgery
auteur
Andrea Mendizabal, Eleonora Tagliabue, Tristan Hoellinger, Jean-Nicolas Brunet, Sergei Nikolaev, Stéphane Cotin
article
Bilen Emek Abali; Ivan Giorgio. Developments and Novel Approaches in Biomechanics and Metamaterials, 132, Springer, pp.71-96, 2020, Advanced Structured Materials, 978-3-030-50464-9. ⟨10.1007/978-3-030-50464-9_5⟩
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https://inria.hal.science/hal-02538101/file/Iconsom_manuscript_2019.pdf BibTex

Master thesis

titre
Advances in the inverse biomechanical simulation framework for autonomous robotic needle steering.
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi
article
Automatic Control Engineering. 2020
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https://inria.hal.science/hal-02986039/file/PERRUSI_master_thesis.pdf BibTex

Theses

titre
Machine Learning meets real-time Numerical Simulation - Application to surgical training, preoperative planning and surgical assistance
auteur
Andrea Mendizabal
article
Biomechanics [physics.med-ph]. Université de Strasbourg, 2020. English. ⟨NNT : 2020STRAD034⟩
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https://hal.science/tel-03116502/file/PhD_thesis.pdf BibTex
titre
Exploring new numerical methods for the simulation of soft tissue deformations in surgery assistance
auteur
Jean-Nicolas Brunet
article
Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Strasbourg, 2020. English. ⟨NNT : 2020STRAD029⟩
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https://inria.hal.science/tel-03130643/file/brunet_jean-nicolas_2020_ED269.pdf BibTex
titre
Image-guided Interactive Simulation for Endovascular Surgery
auteur
Raffaella Trivisonne
article
Modeling and Simulation. Université de Strasbourg, 2020. English. ⟨NNT : ⟩
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2019

Journal articles

titre
Force classification during robotic interventions through simulation-trained neural networks
auteur
Andrea Mendizabal, Raphael Sznitman, Stéphane Cotin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2019, 14, pp.1601-1610. ⟨10.1007/s11548-019-02048-3⟩
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https://inria.hal.science/hal-02268782/file/IJCARS_rebuttal_bis%282%29.pdf BibTex
titre
Soft Haptic Device to Render the Sensation of Flying Like a Drone
auteur
Carine Rognon, Margaret Koehler, Christian Duriez, Dario Floreano, Allison M Okamura
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2019, 4 (3), pp.2524-2531. ⟨10.1109/LRA.2019.2907432⟩
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BibTex
titre
Stiffness Control of Deformable Robots Using Finite Element Modeling
auteur
Margaret Koehler, Allison M Okamura, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2019, 4 (2), pp.469-476. ⟨10.1109/LRA.2019.2890897⟩
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https://inria.hal.science/hal-02079146/file/RALStiffnessControl.pdf BibTex
titre
Robotic Insertion of Flexible Needle in Deformable Structures Using Inverse Finite-Element Simulation
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Laurent Goffin, Michel de Mathelin, Hadrien Courtecuisse, Yinoussa Adagolodjo
article
IEEE Transactions on Robotics, 2019, 35 (3), pp.697-708. ⟨10.1109/TRO.2019.2897858⟩
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https://inria.hal.science/hal-02144487/file/main.pdf BibTex
titre
Calibration and External Force Sensing for Soft Robots using an RGB-D Camera
auteur
Zhongkai Zhang, Antoine Petit, Jeremie Dequidt, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2019, 4 (3), pp.2356 - 2363. ⟨10.1109/LRA.2019.2903356⟩
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https://hal.science/hal-02060976/file/Calibration%20and%20External%20Force%20Sensing%20for%20Soft%20Robots%20using%20an%20RGB-D%20Camera.pdf BibTex
titre
Population-based priors in cardiac model personalisation for consistent parameter estimation in heterogeneous databases
auteur
Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2019, 35 (2), pp.e3158. ⟨10.1002/cnm.3158⟩
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https://inria.hal.science/hal-01922719/file/Special_Issue___Longitudinal_with_Priors_Refactoring-3.pdf BibTex
titre
Motion Control of Cable-Driven Continuum Catheter Robot through Contacts
auteur
Zhongkai Zhang, Jeremie Dequidt, Junghwan Back, Hongbin Liu, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2019, 4 (2), pp.1852-1859. ⟨10.1109/LRA.2019.2898047⟩
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https://hal.science/hal-02052637/file/RA-L-ICRA-Zhongkai%20Zhang.pdf BibTex
titre
Virtual image correlation of magnetic resonance images for 3D geometric modelling of pelvic organs
auteur
Zhifan Jiang, Olivier Mayeur, Jean-Francois Witz, Pauline Lecomte‐grosbras, Jérémie Dequidt, Michel Cosson, Christian Duriez, Mathias Brieu
article
Strain, 2019, 55 (3), pp.e12305. ⟨10.1111/str.12305⟩
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https://hal.science/hal-02403391/file/Paper_ZJiang_2017_Revision2.pdf BibTex
titre
Control Design for Soft Robots based on Reduced Order Model
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Christian Duriez, Thierry-Marie Guerra
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2019, 4 (1), pp.25-32. ⟨10.1109/LRA.2018.2876734⟩
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https://hal.science/hal-01901031/file/ControlSoftRobots.pdf BibTex
titre
Simulation of hyperelastic materials in real-time using deep learning
auteur
Andrea Mendizabal, Pablo Márquez-Neila, Stéphane Cotin
article
Medical Image Analysis, 2019, 59, pp.101569. ⟨10.1016/j.media.2019.101569⟩
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https://inria.hal.science/hal-02097119/file/hal_version_media_paper.pdf BibTex
titre
Modeling Novel Soft Mechanosensors based on Air-Flow Measurements
auteur
Stefan Escaida Navarro, Olivier Goury, Gang Zheng, Thor Morales Bieze, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2019, 4 (4), pp.4338 - 4345. ⟨10.1109/LRA.2019.2932604⟩
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https://inria.hal.science/hal-02239080/file/19-0372_04_MS.pdf BibTex
titre
Position-based modeling of lesion displacement in Ultrasound-guided breast biopsy
auteur
Eleonora Tagliabue, Diego Dall’alba, Enrico Magnabosco, Chiara Tenga, Igor Peterlík, Paolo Fiorini
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2019, 14 (8), pp.1329-1339. ⟨10.1007/s11548-019-01997-z⟩
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https://hal.science/hal-02276090/file/IJCARS2019_PBD_FEM_HAL.pdf BibTex
titre
Finite-time estimation for linear time-delay systems via homogeneous method
auteur
Gang Zheng, Haoping Wang
article
International Journal of Control, 2019, 92 (6), pp.1252-1263. ⟨10.1080/00207179.2017.1390255⟩
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https://inria.hal.science/hal-01649434/file/Hal.pdf BibTex

Conference papers

titre
Time stepping scheme for interactive medical simulations
auteur
François Jourdes
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
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https://inria.hal.science/hal-02419406/file/SWS19_paper_1-InSimo.pdf BibTex
titre
An Interactive Physically-based Model for Active Suction Phenomenon Simulation
auteur
Antonin Bernardin, Christian Duriez, Maud Marchal
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02419381/file/SWS19_paper_3.pdf BibTex
titre
OpenVolumeMesh -A Versatile Index-Based Data Structure for 3D Polytopal Complexes
auteur
Waseem Palliyali, Georges Younes, Julien Abinahed, Nikhil Navkar, Shidin Balakrishnan, Abdulrahman Alfayyad, Abdulla Al-Ansari, Zherong Pan, Gorune Ohannessian, Samer Itani, Dinesh Manocha, George Turkiyyah
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
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https://inria.hal.science/hal-02419401/file/SWS19_paper_2-Dynamic_Textures_for_Topologically_Changing_Volumes.pdf BibTex
titre
Towards using SOFA to train a controller for neurovascular catheter interventions
auteur
Tim P Pusch, Lennart Karstensen, Tobias Behr
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
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https://inria.hal.science/hal-02419367/file/SWS19_paper_5.pdf BibTex
titre
Biomechanical modeling of probe to tissue interaction in robotic ultrasound scanning
auteur
Eleonora Tagliabue, Diego Dall'Alba, Paolo Fiorini
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
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https://inria.hal.science/hal-02419373/file/SWS19_paper_4.pdf BibTex
titre
Physics-based Deep Neural Network for Augmented Reality during Liver Surgery
auteur
Jean-Nicolas Brunet, Andrea Mendizabal, Antoine Petit, Nicolas Golse, Eric Vibert, Stéphane Cotin
article
MICCAI 2019 - 22nd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.8, ⟨10.1007/978-3-030-32254-0_16⟩
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https://inria.hal.science/hal-02158862/file/MICCAI2019%284%29.pdf BibTex
titre
Towards Hyper-Reduction of Cardiac Models using Poly-Affine Deformation
auteur
Gaëtan Desrues, Hervé Delingette, Maxime Sermesant
article
STACOM 2019: Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, Oct 2019, Shenzhen, China
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https://inria.hal.science/hal-02429678/file/STACOM_FinalVersion.pdf BibTex
titre
Physics-based Deep Neural Network for Real-Time Lesion Tracking in Ultrasound-guided Breast Biopsy
auteur
Andrea Mendizabal, Eleonora Tagliabue, Jean-Nicolas Brunet, Diego Dall'Alba, Paolo Fiorini, Stéphane Cotin
article
Computational Biomechanics for Medicine XIV, Oct 2019, Shenzhen, China
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https://inria.hal.science/hal-02311277/file/camera_ready_manuscript.pdf BibTex
Screenshot%20from%202019-10-18%2011-03-16.png
titre
Deformed Reality
auteur
Antoine Petit, Nazim Haouchine, Frédérick Roy, Dan B Goldman, Stéphane Cotin
article
Computer Graphics & Visual Computing (Eurographics), Sep 2019, Bangor, United Kingdom
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https://inria.hal.science/hal-02320444/file/paper1011_CRC.pdf BibTex
titre
The effect of discretization on parameter identification. Application to patient-specific simulations
auteur
Nava Weingort Schulmann, Stéphane Cotin, Igor Peterlík
article
CMBBE 2019 - 16th International Symposium on Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, Aug 2019, New York (NY), United States
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https://hal.science/hal-02276130/file/The%20effect%20of%20discretization%20on%20parameter%20identification%20%281%29.pdf BibTex
titre
Corotated meshless implicit dynamics for deformable bodies
auteur
Jean-Nicolas Brunet, Vincent Magnoux, Benoît Ozell, Stéphane Cotin
article
WSCG 2019 - 27th International Conference on Computer Graphics, Visualization and Computer Vision, May 2019, Pilsen, Czech Republic. ⟨10.24132/CSRN.2019.2901.1.11⟩
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https://inria.hal.science/hal-02119414/file/%21%21_CSRN-2801-11.pdf BibTex
titre
Controllability pre-verification of silicone soft robots based on finite-element method
auteur
Gang Zheng, Olivier Goury, Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Christian Duriez
article
ICRA 2019 - International Conference on Robotics and Automation, May 2019, Montreal, Canada. pp.7395-7400, ⟨10.1109/ICRA.2019.8794370⟩
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https://hal.science/hal-02403899/file/final.pdf BibTex
titre
Soft robots locomotion and manipulation control using FEM simulation and quadratic programming
auteur
Eulalie Coevoet, Adrien Escande, Christian Duriez
article
RoboSoft 2019 - IEEE International Conference on Soft Robotics, Apr 2019, Seoul, South Korea. ⟨10.1109/ROBOSOFT.2019.8722815⟩
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https://inria.hal.science/hal-02079151/file/Friction.pdf BibTex
titre
Dynamically Closed-Loop Controlled Soft Robotic Arm using a Reduced Order Finite Element Model with State Observer
auteur
Robert K Katzschmann, Maxime Thieffry, Olivier Goury, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez, Daniela Rus
article
IEEE 2019 International Conference on Soft Robotics, Apr 2019, Séoul, South Korea. pp.717-724
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02078809/file/Dynamically%20Closed%20Loop%20Controlled%20Soft%20Robotic%20Arm%20using%20a%20Reduced%20Order%20Finite%20Element%20Model%20with%20State%20Observer%20-%20Katzschmann%20Thieffry%20et%20al.pdf BibTex
titre
Toward Shape Optimization of Soft Robots
auteur
Thomas Morzadec, Damien Marchal, Christian Duriez
article
RoboSoft 2019 - IEEE International Conference on Soft Robotics, Apr 2019, Séoul, South Korea
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02078776/file/RoboSoft.pdf BibTex
titre
FEM-based confidence assessment of non-rigid registration
auteur
Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse, Matthieu Chabanas, Bernard Bayle
article
Surgetica 2019, 2019, Rennes, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02238974/file/Surgetica2019.pdf BibTex

Book sections

titre
Computational Biomechanics of the Brain in the Operating Theatre
auteur
Hadrien Courtecuisse, Fanny Morin, Ingerid Reinertsen, Yohan Payan, Matthieu Chabanas
article
Biomechanics of the Brain, Springer, pp.321-344, 2019, 978-3-030-04995-9. ⟨10.1007/978-3-030-04996-6_13⟩
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https://hal.science/hal-02385041/file/chapter_operating_theater_R2.pdf BibTex

Poster communications

titre
Robust Fabrication of a Soft Mechanosensor based on Pneumatic Measurements
auteur
Stefan Escaida Navarro, Olivier Goury, Gang Zheng, Thor Morales Bieze, Christian Duriez
article
New Advances in Tactile Sensation, Perception, and Learning in Robotics: Emerging Materials and Technologies for Manipulation (RoboTac 2019), Nov 2019, Macao, China
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https://inria.hal.science/hal-02876688/file/Paper_RoboTac2019.pdf BibTex

Proceedings

titre
Simulation of soft tissue deformation in real-time using domain decomposition
auteur
Ryadh Haferssas, Pierre-Henri Tournier, Frédéric Nataf, Stéphane Cotin
article
MICCAI (Workshop on Computational Biomechanics for Medicine), 2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02400982/file/paper.pdf BibTex

Theses

titre
Biomechanical graph matching for hepatic intra-operative image registration
auteur
Jaime Garcia Guevara
article
Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Universite de Lorraine, 2019. English. ⟨NNT : 2019LORR0238⟩
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https://hal.science/tel-02408339/file/thesisGarciaGuevara.pdf BibTex
titre
Model-Based Dynamic Control of Soft Robots
auteur
Maxime Thieffry
article
Automatic. Université Polytechnique des Hauts-de-France, 2019. English. ⟨NNT : ⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/tel-02363267/file/these_MT.pdf BibTex
titre
Vision-based calibration, position control and force sensing for soft robots
auteur
Zhongkai Zhang
article
Robotics [cs.RO]. Université de Lille, 2019. English. ⟨NNT : ⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/tel-01990867/file/Zhongkai%20Zhang-PhD%20thesis.pdf BibTex
titre
Optimization-based inverse model of soft robots, with contact handling
auteur
Eulalie Coevoet
article
Automatic. Université de Lille 1, Sciences et Technologies, 2019. English. ⟨NNT : ⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/tel-02446416/file/TheseCoevoet%20%281%29.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Constrained Stochastic State Estimation for 3D Shape Reconstruction of Catheters and Guidewires in Fluoroscopic Images
auteur
Raffaella Trivisonne, Erwan Kerrien, Stéphane Cotin
article
2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02072386/file/PreprintTKC.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Corotational cut finite element method for real-time surgical simulation: Application to needle insertion simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Stéphane Pierre Alain Bordas
article
Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, 2018, ⟨10.1016/j.cma.2018.10.023⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01921631/file/CutFEM_needle_Bui_et_al.pdf BibTex
titre
Calipso: Physics-based Image and Video Editing through CAD Model Proxies
auteur
Nazim Haouchine, Frédérick Roy, Hadrien Courtecuisse, Matthias Niessner, Stéphane Cotin
article
The Visual Computer, 2018, 36, pp.211-226. ⟨10.1007/s00371-018-1600-0⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01890684/file/calipso_haouchine.pdf BibTex
titre
Nonprehensile Manipulation of Deformable Objects: Achievements and Perspectives from the RobDyMan Project
auteur
Fabio Ruggiero, Antoine Petit, Diana Serra, Aykut C Satici, Jonathan Cacace, Alejandro Donaire, Fanny Ficuciello, Luca R Buonocore, Giuseppe Andrea Fontanelli, Vincenzo Lippiello, Luigi Villani, Bruno Siciliano
article
IEEE Robotics and Automation Magazine, 2018, 25 (3), pp.83 - 92. ⟨10.1109/mra.2017.2781306⟩
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https://inria.hal.science/hal-01889779/file/paper_ram_1617.pdf BibTex
titre
FiloGen: A Model-Based Generator of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Single Motile Cells with Growing and Branching Filopodia
auteur
Dmitry V Sorokin, Igor Peterlik, Vladimír V Ulman, David Svoboda, Tereza Nečasová, Katsiarina Morgaenko, Lívia Eisellová, Lenka Tesařová, Martin Maška
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2018, pp.1-12. ⟨10.1109/TMI.2018.2845884⟩
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https://inria.hal.science/hal-01821338/file/tmi_filogen.pdf BibTex
titre
Biomechanics-based graph matching for augmented CT-CBCT
auteur
Jaime Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stephane Cotin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2018, 13 (6), pp.805-813. ⟨10.1007/s11548-018-1755-1⟩
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https://inria.hal.science/hal-01761521/file/template.pdf BibTex
titre
Fast Elastic Registration of Soft Tissues under Large Deformations
auteur
Igor Peterlik, Hadrien Courtecuisse, Robert Rohling, Purang Abolmaesumi, Christopher Nguan, Stéphane Cotin, Septimiu E Salcudean
article
Medical Image Analysis, 2018, 45, pp.24-40. ⟨10.1016/j.media.2017.12.006⟩
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https://inria.hal.science/hal-01613757/file/supineFlankPaper.pdf BibTex
titre
Model-based Feature Augmentation for Cardiac Ablation Target Learning from Images
auteur
Rocio Cabrera Lozoya, Benjamin Berte, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2018, pp.1. ⟨10.1109/TBME.2018.2818300⟩
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https://inria.hal.science/hal-01744142/file/TBME2818300.pdf BibTex
Screen%20Shot%202018-03-01%20at%201.07.58%20AM.png
titre
Vision-based Force Feedback Estimation for Robot-assisted Surgery using Instrument-constrained Biomechanical 3D Maps
auteur
Nazim Haouchine, Winnie Kuang, Stéphane Cotin, Michael Yip
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2018, ⟨10.1109/LRA.2018.2810948⟩
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https://inria.hal.science/hal-01720259/file/17-0884_06_MS.pdf BibTex
titre
Vision-Based Sensing of External Forces Acting on Soft Robots Using Finite Element Method
auteur
Zhongkai Zhang, Jérémie Dequidt, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2018, 3 (3), pp.1529 - 1536. ⟨10.1109/LRA.2018.2800781⟩
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https://inria.hal.science/hal-01720645/file/Vision-Based%20Sensing%20of%20External%20Forces%20Acting%20on_Soft%20Robots%20Using%20Finite%20Element%20Method.pdf BibTex
titre
Intraoperative Biomechanical Registration of the Liver: Does the Heterogeneity of the Liver Matter?
auteur
Rosalie Plantefève, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
Innovation and Research in BioMedical engineering, 2018, 39 (1), pp.18-25. ⟨10.1016/j.irbm.2017.10.005⟩
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https://inria.hal.science/hal-01625573/file/article_IRBM.pdf BibTex
titre
Fast, generic and reliable control and simulation of soft robots using model order reduction
auteur
Olivier Goury, Christian Duriez
article
IEEE Transactions on Robotics, 2018, 34 (6), pp.1565 - 1576. ⟨10.1109/TRO.2018.2861900⟩
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https://hal.science/hal-01834483/file/reducedSoftRobotIEEETorPrePrint.pdf BibTex
titre
Finite element method-based kinematics and closed-loop control of soft, continuum manipulators
auteur
Thor Morales Bieze, Frederick Largilliere, Alexandre Kruszewski, Zhongkai Zhang, Rochdi Merzouki, Christian Duriez
article
Soft Robotics, 2018, 5 (3), pp.348-364. ⟨10.1089/soro.2017.0079⟩
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https://hal.science/hal-01745625/file/Finite%20element%20method-based%20kinematics%20and%20closed-loop%20control%20of%20soft%2Ccontinuum%20manipulators.pdf BibTex
titre
Transfer Learning from Simulations on a Reference Anatomy for ECGI in Personalised Cardiac Resynchronization Therapy
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Hervé Delingette, Thomas Jackson, Jessica Webb, Lauren Fovargue, Jack Lee, Christopher A Rinaldi, Reza Razavi, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, In press, 20, ⟨10.1109/TBME.2018.2839713⟩
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https://hal.science/hal-01796483/file/FINAL_VERSION_CORR.pdf BibTex
titre
A Framework for the Generation of Realistic Synthetic Cardiac Ultrasound and Magnetic Resonance Imaging Sequences from the same Virtual Patients
auteur
Yitian Zhou, Sophie Giffard-Roisin, Mathieu de Craene, Sorina Camarasu-Pop, Jan d'Hooge, Martino Alessandrini, Denis Friboulet, Maxime Sermesant, Olivier Bernard
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2018, 37 (3), pp.741-754. ⟨10.1109/TMI.2017.2708159⟩
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https://inria.hal.science/hal-01533366/file/TMI2708159.pdf BibTex
titre
Model-based generation of large databases of cardiac images: synthesis of pathological cine MR sequences from real healthy cases
auteur
Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2018, 37, pp.755-766. ⟨10.1109/TMI.2017.2714343⟩
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https://inria.hal.science/hal-01533788/file/jDuchateau_TMI_2017_FINAL.pdf BibTex

Conference papers

titre
Environment-aware non-rigid registration in surgery using physics-based simulation
auteur
Antoine Petit, Stéphane Cotin
article
ACCV 2018 - 14th Asian Conference on Computer Vision, Dec 2018, Perth, Australia
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https://hal.science/hal-01930366/file/accv2018submission_apetit_vf1.pdf BibTex
titre
Capturing Deformations of Interacting Non-rigid Objects Using RGB-D Data
auteur
Antoine Petit, Stéphane Cotin, Vincenzo Lippiello, Bruno Siciliano
article
IROS 2018 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2018, Madrid, Spain
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https://inria.hal.science/hal-01889771/file/iros2018_apetit_2.pdf BibTex
titre
FEM-based Deformation Control for Dexterous Manipulation of 3D Soft Objects
auteur
Fanny Ficuciello, Alessandro Migliozzi, Eulalie Coevoet, Antoine Petit, Christian Duriez
article
IROS 2018 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2018, Madrid, Spain. ⟨10.1109/IROS.2018.8593512⟩
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https://inria.hal.science/hal-01889783/file/manipulation_of_def_objects_1.pdf BibTex
titre
Stochastic Correction of Boundary Conditions during Liver Surgery
auteur
Sergei Nikolaev, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
CVCS 2018 - 9th Colour and Visual Computing Symposium 2018, NTNU: Norwegian University of Science and Technology, Sep 2018, Gjovik, Norway. pp.1 - 4, ⟨10.1109/CVCS.2018.8496720⟩
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https://inria.hal.science/hal-01823810/file/Online_the_9th_Colour_and_Visual_Computing_Simposium_2018.pdf BibTex
titre
Real-time Patient Specific Surgical Simulation using Corotational Cut Finite Element Method: Application to Needle Insertion Simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Franz Chouly, Alexei Lozinski, Stéphane Bordas
article
13th World Congress in Computational Mechanics, Jul 2018, New York, United States
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BibTex
titre
Biomechanics-based graph matching for augmented CT-CBCT
auteur
Jaime Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stephane Cotin
article
IPCAI 2018 - 9th International Conference on Information Processing in Computer-Assisted Interventions, Jun 2018, Berlin, Germany
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https://inria.hal.science/hal-01761538/file/template.pdf BibTex
titre
Reduced Order Control of Soft Robots with Guaranteed Stability
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez
article
European Control Conference ECC18, Jun 2018, Limassol, Cyprus
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https://hal.science/hal-01747433/file/ECC18_0293_FI.pdf BibTex
titre
Marker-based Registration for Large Deformations -Application to Open Liver Surgery
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Nicolas Golse, Eric Vibert, Michel de Mathelin, Stéphane Cotin, Hadrien Courtecuisse, Yinoussa Adagolodjo
article
ICRA 2018 - International Conference on Robotics and Automation, May 2018, Brisbane, Australia
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https://inria.hal.science/hal-01792837/file/Icra.pdf BibTex

Poster communications

titre
How To Design Your Polymer Artificial Muscle Actuator/ Sensor?
auteur
Marwa A Eldiwiny, Eric Cattan, Christian Duriez
article
ICRA 2018 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2018, Brisbane, Australia. pp.1-2
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https://hal.science/hal-01798709/file/ElDiwiny.pdf BibTex

Theses

titre
Coupling rObotics aNd mEdical simulations for automatiC percuTaneous procedures (CONECT)
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Yinoussa Adagolodjo
article
Optimisation et contrôle [math.OC]. Université de Strasbourg, 2018. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-01939268/file/Adagolodjo%20%281%29.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Controlling the error on target motion through real-time mesh adaptation: applications to Deep Brain Stimulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Hadrien Courtecuisse, Michel Audette, Stéphane Cotin, Stéphane P A Bordas
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2017, pp.1-26. ⟨10.1002/cnm.2958⟩
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https://hal.science/hal-01672962/file/ijnmbe_2017_adaptivity_brain_Bui_et_al.pdf BibTex
titre
Non-Invasive Personalisation of a Cardiac Electrophysiology Model from Body Surface Potential Mapping
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Thomas Jackson, Lauren Fovargue, Jack Lee, Hervé Delingette, Reza Razavi, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2017, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 64 (9), pp.2206 - 2218. ⟨10.1109/TBME.2016.2629849⟩
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https://inria.hal.science/hal-01397393/file/TBME_acceptedversion.pdf BibTex
titre
Non-rigid Contour-Based Registration of Cell Nuclei in 2D Live Cell Microscopy Images Using a Dynamic Elasticity Model
auteur
Dmitry V Sorokin, Igor Peterlik, Marco Tektonidis, Karl Rohr, Pavel Matula
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2017, 37 (1), pp.173-184. ⟨10.1109/TMI.2017.2734169⟩
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https://inria.hal.science/hal-01613732/file/Sorokin_Registration.2016.pdf BibTex
titre
Real-time Error Control for Surgical Simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Hadrien Courtecuisse, Stéphane Cotin, Stéphane Bordas
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2017, 95 (3), pp.596-607. ⟨10.1109/TBME.2017.2695587⟩
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https://inria.hal.science/hal-01514621/file/TBME_2017_error_controlled_refinement_final.pdf BibTex
TrunkSimuRealShort.png
titre
Optimization-Based Inverse Model of Soft Robots With Contact Handling
auteur
Eulalie Coevoet, Adrien Escande, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, 2017, ⟨10.1109/LRA.2017.2669367⟩
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https://inria.hal.science/hal-01500912/file/RAL2017.pdf BibTex
titre
Multiorgan Motion Tracking in Dynamic Magnetic Resonance Imaging for Evaluation of Pelvic System Mobility and Shear Strain
auteur
Zhifan Jiang, Jean-François Witz, Pauline Lecomte-Grosbras, Jeremie Dequidt, Stéphane Cotin, Christelle Rubod, Christian Duriez, Mathias Brieu
article
Strain, 2017, 53 (2), ⟨10.1111/str.12224⟩
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https://inria.hal.science/hal-01496177/file/Multiorgan%20Motion%20Tracking%20in%20Dynamic%20MRI%20%282017%29.pdf BibTex
titre
Blood vessel modeling for interactive simulation of interventional neuroradiology procedures
auteur
Erwan Kerrien, Ahmed Yureidini, Jeremie Dequidt, Christian Duriez, René Anxionnat, Stéphane Cotin
article
Medical Image Analysis, 2017, 35, pp.685 - 698. ⟨10.1016/j.media.2016.10.003⟩
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https://inria.hal.science/hal-01390923/file/medima_20161008.pdf BibTex
titre
Brain-shift compensation using intraoperative ultrasound and constraint-based biomechanical simulation
auteur
Fanny Morin, Hadrien Courtecuisse, Ingerid Reinertsen, Florian Le Lann, Olivier Palombi, Yohan Payan, Matthieu Chabanas
article
Medical Image Analysis, 2017, 40, pp.133 - 153. ⟨10.1016/j.media.2017.06.003⟩
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https://hal.science/hal-01560157/file/MEDIMA_1264.pdf BibTex

Conference papers

AugmentedIntraOpA2.jpg
titre
Automatic biomechanical graph matching CT-CBCT fusion
auteur
Jaime Garcia Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
Surgetica 2017, Nov 2017, Strasbourg, France
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https://hal.science/hal-01587952/file/GarciaGuevaraSurgetica2017.pdf BibTex
Screen%20Shot%202017-06-19%20at%203.30.12%20PM.png
titre
DejaVu: Intra-operative Simulation for Surgical Gesture Rehearsal
auteur
Nazim Haouchine, Danail Stoyanov, Frederick Roy, Stéphane Cotin
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions Conference MICCAI 2017, Oct 2017, Quebec City, Canada
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https://hal.science/hal-01542395/file/dejavu-249.pdf BibTex
titre
Silhouette-based Pose Estimation for Deformable Organs Application to Surgical Augmented Reality
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Raffaella Trivisonne, Nazim Haouchine, Stéphane Cotin, Hadrien Courtecuisse, Yinoussa Adagolodjo
article
IROS 2017 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Sep 2017, Vancouver, Canada
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https://hal.science/hal-01578815/file/Iros2017%281%29.pdf BibTex
titre
Visual Servoing Control of Soft Robots based on Finite Element Model
auteur
Zhongkai Zhang, Thor Morales Bieze, Jérémie Dequidt, Alexandre Kruszewski, Christian Duriez
article
IROS 2017 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Sep 2017, Vancouver, Canada
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https://hal.science/hal-01618330/file/IROS17_2033_FI-1.pdf BibTex
Overview_1stLine.png
titre
An Immersed Boundary Method for Detail-Preserving Soft Tissue Simulation from Medical Images
auteur
Christoph J Paulus, Roland Maier, Daniel Peterseim, Stéphane Cotin
article
Computational Biomechanics for Medicine, Sep 2017, Quebec, Canada. pp.55-67, ⟨10.1007/978-3-319-75589-2_6⟩
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https://inria.hal.science/hal-01578447/file/2017_MICCAI_workshop.pdf BibTex
titre
Robust Automatic Graph-based Skeletonization of Hepatic Vascular Trees
auteur
Rosalie Plantefève, Samuel Kadoury, An Tang, Igor Peterlik
article
CIIV STENT 2017, Sep 2017, Québec, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01576771/file/cvii-stent-6.pdf BibTex
titre
Image-driven Stochastic Identification of Boundary Conditions for Predictive Simulation
auteur
Igor Peterlik, Nazim Haouchine, Lukáš Ručka, Stéphane Cotin
article
20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01570811/file/miccai2017BCDA.pdf BibTex
titre
Longitudinal Analysis using Personalised 3D Cardiac Models with Population-Based Priors: Application to Paediatric Cardiomyopathies
auteur
Roch Molléro, Hervé Delingette, Manasi Datar, Tobias Heimann, Jakob Hauser, Dilveer Panesar, Alexander Jones, Andrew Taylor, Marcus Kelm, Titus Kuehne, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2017, Québec City, Canada. pp.350-358, ⟨10.1007/978-3-319-66185-8_40⟩
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https://inria.hal.science/hal-01569735/file/paper729.pdf BibTex
titre
Real-time Error Control for Surgical Simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Hadrien Courtecuisse, Stéphane Cotin, Stéphane P A Bordas
article
BIOMECHANICS AND COMPUTER ASSISTED SURGERY MEETS MEDICAL REALITY, Aug 2017, Lille, France
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https://hal.science/hal-01571194/file/euromech595_2017_Bui_et_al.pdf BibTex
titre
Using Physical Modeling and RGB-D Registration for Contact Force Sensing on Deformable Objects
auteur
Antoine Petit, Fanny Ficuciello, Giuseppe Andrea Fontanelli, Luigi Villani, Bruno Siciliano
article
ICINCO 2017 - 14th International Conference on Informatics in Control, Automation and Robotics, IEEE, Jul 2017, Madrid, Spain. pp.24-33, ⟨10.5220/0006415900240033⟩
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BibTex
titre
Template-based Monocular 3D Recovery of Elastic Shapes using Lagrangian Multipliers
auteur
Nazim Haouchine, Stéphane Cotin
article
Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), Jul 2017, Honolulu, Hawai, United States. ⟨10.1109/CVPR.2017.381⟩
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https://inria.hal.science/hal-01524609/file/CVPR%202017%20-%20Template-based%20Monocular%203D%20Recovery%20of%20Elastic%20Shapes%20using%20Lagrangian%20Multipliers.pdf BibTex
titre
Augmented 3D Catheter Navigation using Constrained Shape from Template
auteur
Raffaella Trivisonne, Erwan Kerrien, Stéphane Cotin
article
Hamlyn Symposium, Jun 2017, London, United Kingdom
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https://inria.hal.science/hal-01545693/file/HSMR17_paper_58.pdf BibTex
titre
Smoothed Particle Hydrodynamics for Electrophysiological Modeling: An Alternative to Finite Element Methods
auteur
Eric Lluch, Rubén Doste, Sophie Giffard-Roisin, Alexandre This, Maxime Sermesant, Oscar Camara, Mathieu de Craene, Hernán G Morales
article
FIMH 2017 - 9th International Conference on Functional Imaging and Modelling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.333-343, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_32⟩
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https://inria.hal.science/hal-01533371/file/paperFIMH.pdf BibTex
titre
Sparse Bayesian Non-linear Regression for Multiple Onsets Estimation in Non-invasive Cardiac Electrophysiology
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Hervé Delingette, Thomas Jackson, Lauren Fovargue, Jack Lee, Aldo Rinaldi, Nicholas Ayache, Reza Razavi, Maxime Sermesant
article
Functional imaging and modelling of the heart 2017, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.230-238, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_22⟩
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https://inria.hal.science/hal-01498602/file/FIMH_2017_cameraready.pdf BibTex
titre
A Rule-Based Method to Model Myocardial Fiber Orientation for Simulating Ventricular Outflow Tract Arrhythmias
auteur
Rubén Doste, David Soto-Iglesias, Gabriel Bernardino, Rafael Sebastian, Sophie Giffard-Roisin, Rocío Cabrera-Lozoya, Maxime Sermesant, Antonio Berruezo, Damián Sánchez-Quintana, Oscar Camara
article
Functional imaging and modelling of the heart 2017, Jun 2017, Toronto, Canada. ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_33⟩
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BibTex
titre
Haptic Rendering of FEM-based Tearing Simulation using Clusterized Collision Detection
auteur
Benoît Le Gouis, François Lehericey, Maud Marchal, Bruno Arnaldi, Valérie Gouranton, Anatole Lécuyer
article
WHC 2017 - IEEE World Haptics Conference, Jun 2017, Munich, Germany. pp.406-411
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https://inria.hal.science/hal-01675134/file/WHC_2017.pdf BibTex
titre
Real-time simulation of hydraulic components for interactive control of soft robots
auteur
Alejandro Rodríguez, Eulalie Coevoet, Christian Duriez
article
The 2017 IEEE International Conference on Robotics and Automation (ICRA), May 2017, Singapour, Singapore
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https://inria.hal.science/hal-01535810/file/Hydraulic_components.pdf BibTex
titre
Elasticity-based Clustering for Haptic Interaction with Heterogeneous Deformable Objects
auteur
Benoît Le Gouis, Maud Marchal, Anatole Lécuyer, Bruno Arnaldi
article
VRIPHYS2017 - 13th Eurographics Workshop on Virtual Reality Interaction and Physical Simulation, Apr 2017, Lyon, France. pp.75-83
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01675148/file/VRIPHYS_2017.pdf BibTex
titre
Model-Based Generation of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Motile Cells with Growing Filopodia
auteur
Dmitry V Sorokin, Igor Peterlik, Vladimír V Ulman, David Svoboda, Martin Maška
article
International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01445488/file/2017.ISBI.filapodiaSimu.pdf BibTex
titre
Fast reconstruction of image deformation field using radial basis function
auteur
Lukáš Ručka, Igor Peterlík
article
ISBI2017 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01445483/file/isbi-rbf.pdf BibTex
titre
Face-based Smoothed Finite Element Method for Real-time Simulation of soft tissue
auteur
Andrea Mendizabal, Rémi Bessard Duparc, Huu Phuoc Bui, Christoph J Paulus, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
SPIE Medical Imaging, Feb 2017, Orlando, United States
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https://inria.hal.science/hal-01444595/file/SPIE2017.pdf BibTex

Book sections

titre
Biomechanical modeling of brain soft tissues for medical applications
auteur
Fanny Morin, Matthieu Chabanas, Hadrien Courtecuisse, Yohan Payan
article
Payan, Yohan; Ohayon, Jacques. Biomechanics of Living Organs, Academic Press, pp.127-146, 2017, ⟨10.1016/B978-0-12-804009-6.00006-7⟩
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https://hal.science/hal-01560109/file/chapter6_Biomechanical_modeling_of_brain_soft_tissues.pdf BibTex
titre
Nonlinear Biomechanical Model of the Liver
auteur
Stéphanie Marchesseau, Simon Chatelin, Hervé Delingette
article
Yohan Payan; Jacques Ohayon. Biomechanics of Living Organs. Hyperelastic Constitutive Laws for Finite Element Modeling, Elsevier, pp.243 - 265, 2017, 978-0-12-804009-6. ⟨10.1016/b978-0-12-804009-6.00011-0⟩
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https://hal.science/hal-03040194/file/LiverHyperElasticity%20Submitted.pdf BibTex

Poster communications

titre
Deformed Reality: Proof of concept and preliminary results
auteur
Nazim Haouchine, Antoine Petit, Frederick Roy, Stéphane Cotin
article
ISMAR 2017 - 16th IEEE International Symposium on Mixed and Augmented Reality, Oct 2017, Nantes, France. 2017
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01636772/file/poster-deformed-reality.pdf BibTex

Theses

titre
Robust personalisation of 3D electromechanical cardiac models. Application to heterogeneous and longitudinal clinical databases
auteur
Roch Molléro
article
Signal and Image processing. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4106⟩
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https://theses.hal.science/tel-01737200/file/2017AZUR4106.pdf BibTex
titre
Topological Changes in Simulations of Deformable Objects
auteur
Christoph Joachim Paulus
article
Modeling and Simulation. University of Strasbourg, 2017. English. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-01516170/file/PhD%20Thesis%20Christoph%20Joachim%20PAULUS%202017.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Comprehensive Pre-Clinical Evaluation of a Multi-physics Model of Liver Tumor Radiofrequency Ablation
auteur
Chloé Audigier, Tommaso Mansi, Hervé Delingette, Saikiran Rapaka, Tiziano Passerini, Viorel Mihalef, Marie-Pierre Jolly, Raoul Pop, Michele Diana, Luc Soler, Ali Kamen, Dorin Comaniciu, Nicholas Ayache
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2016, ⟨10.1007/s11548-016-1517-x⟩
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https://inria.hal.science/hal-01423321/file/IJCARS_Audigier_2016.pdf BibTex
titre
A Mechanical Model to Interpret Cell-Scale Indentation Experiments on Plant Tissues in Terms of Cell Wall Elasticity and Turgor Pressure
auteur
Richard Malgat, François Faure, Arezki Boudaoud
article
Frontiers in Plant Science, 2016, 7, pp.1351. ⟨10.3389/fpls.2016.01351⟩
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https://hal.science/hal-01367360/file/articleFrontiers.pdf BibTex
GraphicalAbstract.jpg
titre
Interactive Training System for Interventional Electrocardiology Procedures
auteur
Hugo Talbot, Federico Spadoni, Christian Duriez, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
Medical Image Analysis, 2016, 8789, pp.11-19. ⟨10.1007/978-3-319-12057-7_2⟩
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https://inria.hal.science/hal-01338346/file/Talbot_H.pdf BibTex
titre
SmartSIM - a virtual reality simulator for laparoscopy training using a generic physics engine
auteur
Zohaib Amjad Khan, Nabeel Kamal, Asad Hameed, Amama Mahmood, Rida Zainab, Bushra Sadia, Shamyl Bin Mansoor, Osman Hasan
article
The International Journal of Medical Robotics and Computer Assisted Surgery, 2016, 16, pp.437 - 437. ⟨10.1002/rcs.1771⟩
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https://hal.science/hal-01509822/file/SmartSIM.pdf BibTex
im.png
titre
Robust Augmented Reality registration method for Localization of Solid Organs’ Tumors Using CT-derived Virtual Biomechanical Model and Fluorescent Fiducials
auteur
Seong-Ho Kong, Nazim Haouchine, Renato Soares, Andrey S Klymchenko, Bohdan Andreiuk, Bruno Marques, Galyna Shabat, Thierry Piéchaud, Michele Diana, Stéphane Cotin, Jacques Marescaux
article
Surgical Endoscopy, 2016, ⟨10.1007/s00464-016-5297-8⟩
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https://hal.science/hal-01314963/file/surg-endosc.pdf BibTex
titre
Image-based Biophysical Simulation of Intracardiac Abnormal Ventricular Electrograms
auteur
Rocío Cabrera-Lozoya, Benjamin Berte, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2016, PP (99), ⟨10.1109/TBME.2016.2562918⟩
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https://hal.science/hal-01313615/file/HALfile.pdf BibTex

Conference papers

titre
A Multiscale Cardiac Model for Fast Personalisation and Exploitation
auteur
Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
MICCAI 2016 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2016, Athens, Greece. pp.174-182, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_21⟩
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https://inria.hal.science/hal-01360908/file/paper_725.pdf BibTex
titre
Numerical Simulation of Cochlear-Implant Surgery: Towards Patient-Specific Planning
auteur
Olivier Goury, Yann Nguyen, Renato Torres, Jeremie Dequidt, Christian Duriez
article
19th International Conference on Medical Image Computing & Computer Assisted Intervention (MICCAI 2016), Oct 2016, Athènes, Greece. pp 500-507
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https://hal.science/hal-01370185/file/patientSpecific.pdf BibTex
titre
Estimation of Purkinje Activation from ECG: an Intermittent Left Bundle Branch Block Study
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Lauren Fovargue, Jessica Webb, Roch Molléro, Jack Lee, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Reza Razavi, Maxime Sermesant
article
7th International Statistical Atlases and Computational Modeling of the Heart (STACOM) Workshop, Held in Conjunction with MICCAI 2016, Oct 2016, Athens, Greece
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https://inria.hal.science/hal-01372924/file/Stacom_sophie_ECG.pdf BibTex
titre
Anatomical Mirroring: Real-time User-specific Anatomy in Motion Using a Commodity Depth Camera
auteur
Armelle Bauer, Ali-Hamadi Dicko, François Faure, Olivier Palombi, Jocelyne Troccaz
article
ACM SIGGRAPH Conference on Motion in Games, Oct 2016, San Francisco, United States. pp.113-122, ⟨10.1145/2994258.2994259⟩
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https://hal.science/hal-01366704/file/mig_2016.pdf BibTex
titre
Stiffness rendering on soft tangible devices controlled through inverse FEM simulation
auteur
Frédérick Largillière, Eulalie Coevoet, Mario Sanz Lopez, Laurent Grisoni, Christian Duriez
article
International Conference on Intelligent Robots and Systems - IROS 2016, Oct 2016, Daejeon, South Korea
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https://inria.hal.science/hal-01386787/file/IROS_stiffness_interface.pdf BibTex
simuLoop%20%282%29.jpg
titre
Inverse real-time Finite Element simulation for robotic control of flexible needle insertion in deformable tissues
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Laurent Goffin, Michel de Mathelin, Hadrien Courtecuisse
article
IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems (IROS 2016) , Oct 2016, Daejeon, South Korea
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https://hal.science/hal-01353925/file/iros2016.pdf BibTex
im.jpg
titre
Using Contours as Boundary Conditions for Elastic Registration during Minimally Invasive Hepatic Surgery
auteur
Nazim Haouchine, Frederick Roy, Lionel Untereiner, Stéphane Cotin
article
International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2016, Daejeon, South Korea
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https://inria.hal.science/hal-01353185/file/haouchine_iros2016.pdf BibTex
titre
Kinematic Modeling and Observer Based Control of Soft Robot using Real-Time Finite Element Method
auteur
Zhongkai Zhang, Jeremie Dequidt, Alexandre Kruszewski, Frederick Largilliere, Christian Duriez
article
IROS2016 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2016, Daejeon, South Korea
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https://inria.hal.science/hal-01370347/file/IROS16_0629_FI.pdf BibTex
im.jpg
titre
Simultaneous Pose Estimation and Augmentation of Elastic Surfaces from a Moving Monocular Camera
auteur
Nazim Haouchine, Marie-Odile Berger, Stephane Cotin
article
International Symposium on Mixed and Augmented Reality, Sep 2016, Merida, Mexico. ⟨10.1109/ISMAR-Adjunct.2016.0076⟩
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https://inria.hal.science/hal-01353189/file/haouchine_ISMAR2016.pdf BibTex
none.png
titre
Vessel-based brain-shift compensation using elastic registration driven by a patient-specific finite element model
auteur
Fanny Morin, Ingerid Reinertsen, Hadrien Courtecuisse, Olivier Palombi, Bodil Munkvold, Hans Kristian Bø, Yohan Payan, Matthieu Chabanas
article
International Conference on Information Processing in Computer-Assisted Interventions (IPCAI), Jun 2016, Heidelberg, Germany
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https://hal.science/hal-01331713/file/revised_paper_bis.pdf BibTex
ImagePigletMMVR1.png
titre
3D Physics-Based Registration of 2D Dynamic MRI Data
auteur
Raffaella Trivisonne, Igor Peterlik, Stéphane Cotin, Hadrien Courtecuisse
article
MMVR - Medicine Meets Virtual Reality, Apr 2016, Los Angeles, United States
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https://inria.hal.science/hal-01254388/file/Trivisonne_R.pdf BibTex

Book sections

titre
Soft robot modeling, simulation and control in real-time
auteur
Christian Duriez
article
Soft Robotics: Trends, Applications and Challenges, 2016, ⟨10.1007/978-3-319-46460-2_13⟩
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BibTex

Theses

titre
Augmented Reality and Numerical Simulations for Hepatic Tumors Resection
auteur
Rosalie Plantefève
article
Modeling and Simulation. Université Lille 1 Sciences et Technologies, 2016. English. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-01338385/file/Thesis_final.pdf BibTex

2015

Journal articles

vonMises.png
titre
Rest shape computation for highly deformable model of brain.
auteur
Fanny Morin, Hadrien Courtecuisse, Matthieu Chabanas, Yohan Payan
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2015, 18 Suppl 1, pp.2006-2007. ⟨10.1080/10255842.2015.1070591⟩
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https://hal.science/hal-01217673/file/CMBBE%202015%20Morin.pdf BibTex
3D_model_reconstruction%20%281%29.png
titre
Patient-specific Biomechanical Modeling for Guidance during Minimally-invasive Hepatic Surgery
auteur
Rosalie Plantefève, Igor Peterlik, Nazim Haouchine, Stéphane Cotin
article
Annals of Biomedical Engineering, 2015
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https://inria.hal.science/hal-01205194/file/ABME.pdf BibTex
knee.jpg
titre
Stable Constrained Dynamics
auteur
Maxime Tournier, Matthieu Nesme, Benjamin Gilles, François Faure
article
ACM Transactions on Graphics, 2015, Proceedings of SIGGRAPH, 34 (4), pp.132:1--132:10. ⟨10.1145/2766969⟩
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https://inria.hal.science/hal-01157835/file/StableConstraints_siggraph15.pdf BibTex
titre
50 nuances de robots mous !
auteur
Christian Duriez
article
Interstices, 2015
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BibTex
titre
Registration by interactive inverse simulation: application for adaptive radiotherapy
auteur
Eulalie Coevoet, Nick Reynaert, Eric Lartigau, Luis Schiappacasse, Jérémie Dequidt, Christian Duriez
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2015, 10 (8), pp.1193-1200. ⟨10.1007/s11548-015-1175-4⟩
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https://hal.science/hal-01261302/file/paperIJCARS.pdf BibTex
scanned-3.jpg
titre
Impact of Soft Tissue Heterogeneity on Augmented Reality for Liver Surgery
auteur
Nazim Haouchine, Stephane Cotin, Igor Peterlik, Jeremie Dequidt, Mario Sanz Lopez, Erwan Kerrien, Marie-Odile Berger
article
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, 2015, 21 (5), pp.584 - 597. ⟨10.1109/TVCG.2014.2377772⟩
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https://inria.hal.science/hal-01136728/file/haouchineTVCG2014-low.pdf BibTex
Screen%20Shot%202015-08-23%20at%2011.56.21%20AM.png
titre
Monocular 3D Reconstruction and Augmentation of Elastic Surfaces with Self-occlusion Handling
auteur
Nazim Haouchine, Jeremie Dequidt, Marie-Odile Berger, Stephane Cotin
article
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, 2015, pp.14. ⟨10.1109/TVCG.2015.2452905⟩
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https://inria.hal.science/hal-01186011/file/haouchine_tvcg_2015.pdf BibTex

Conference papers

titre
Tracking Fractures of Deformable Objects in Real-Time with an RGB-D Sensor
auteur
Antoine Petit, Vincenzo Lippiello, Bruno Siciliano
article
3D Vision (3DV), 2015 International Conference on, IEEE, Oct 2015, Lyon, France. pp.632 - 639, ⟨10.1109/3DV.2015.78⟩
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https://hal.science/hal-01617263/file/3dv-2015_apetit_review_vf1.pdf BibTex
titre
Framework for augmented reality in Minimally Invasive laparoscopic surgery
auteur
Bruno Marques, Rosalie Plantefeve, Frédérick Roy, Nazim Haouchine, Emmanuel Jeanvoine, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
HealthCom 2015, Oct 2015, Boston, United States. ⟨10.1109/HealthCom.2015.7454467⟩
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https://inria.hal.science/hal-01315574/file/article.pdf BibTex
thumbnail.jpg
titre
Surgical Augmented Reality with Topological Changes
auteur
Christoph J. Paulus, Nazim Haouchine, David Cazier, Stéphane Cotin
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions, Oct 2015, München, Germany
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https://inria.hal.science/hal-01184498/file/2015MICCAI.pdf BibTex
thumbnail.jpg
titre
Augmented Reality during Cutting and Tearing of Deformable Objects
auteur
Christoph J. Paulus, Nazim Haouchine, David Cazier, Stephane Cotin
article
The 14th IEEE International Symposium on Mixed and Augmented Reality, Sep 2015, Fukuoka, Japan. pp.6
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https://inria.hal.science/hal-01184495/file/2015ISMAR.pdf BibTex
sensable_friction_00000003%20%281%29.png
titre
Haptic Rendering of Hyperelastic Models with Friction
auteur
Hadrien Courtecuisse, Yinoussa Adagolodjo, Hervé Delingette, Christian Duriez, Yinoussa Adagolodjo
article
2015 IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems (IROS), Sep 2015, Hamburg, Germany. pp.591-596, ⟨10.1109/IROS.2015.7353432⟩
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https://hal.science/hal-01184113/file/IROS15_1122_FI.pdf BibTex
titre
Real-time tracking of 3D elastic objects with an RGB-D sensor
auteur
Antoine Petit, Vincenzo Lippiello, Bruno Siciliano
article
IROS 2015 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, IEEE, Sep 2015, Hamburg, Germany. pp.3914-3921, ⟨10.1109/IROS.2015.7353928⟩
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https://hal.science/hal-01617309/file/deformable_object_tracking_vf.pdf BibTex
IceballRender-shorter2.jpg
titre
Augmented Reality for Cryoablation Procedures
auteur
Hugo Talbot, Frederick Roy, Stéphane Cotin
article
SIGGRAPH 2015, Aug 2015, Los Angeles, United States
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https://inria.hal.science/hal-01180848/file/SIGGRAPH-0488.pdf BibTex
teaser-hal.jpg
titre
Fracture in Augmented Reality
auteur
Nazim Haouchine, Alexandre Bilger, Jeremie Dequidt, Stephane Cotin
article
SIGGRAPH [Poster], Aug 2015, Los Angeles, United States
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https://inria.hal.science/hal-01191090/file/template.pdf BibTex
titre
Propagation of Myocardial Fibre Architecture Uncertainty on Electromechanical Model Parameter Estimation: A Case Study
auteur
Roch Molléro, Dominik Neumann, Marc-Michel Rohé, Manasi Datar, Herve Lombaert, Nicholas Ayache, Dorin Comaniciu, Olivier Ecabert, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Xavier Pennec, Maxime Sermesant, Tommaso Mansi
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart, LNCS., Jun 2015, Maastricht, Netherlands. pp. 448-456, ⟨10.1007/978-3-319-20309-6_51⟩
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https://inria.hal.science/hal-01241896/file/FIMH2015_UncertaintyPropagation_camera_ready.pdf BibTex
patient_2-MeasuredDT.png
titre
Personalization of Cardiac Electrophysiology Model using the Unscented Kalman Filtering
auteur
Hugo Talbot, Stephane Cotin, Reza Razavi, Christopher Rinaldi, Hervé Delingette
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS 2015), Jun 2015, Barcelona, Spain
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https://inria.hal.science/hal-01195719/file/CARS2015-HTalbot.pdf BibTex
grasping2.png
titre
6D Frictional Contact for Rigid Bodies
auteur
Charles Bouchard, Matthieu Nesme, Maxime Tournier, Bin Wang, François Faure, Paul Kry
article
Graphics Interface, Jun 2015, Halifax, Canada
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https://inria.hal.science/hal-01138834/file/gi6dcontact.pdf BibTex
thumb.png
titre
Surgery Training, Planning and Guidance Using the SOFA Framework
auteur
Hugo Talbot, Nazim Haouchine, Igor Peterlik, Jeremie Dequidt, Christian Duriez, Hervé Delingette, Stephane Cotin
article
Eurographics, May 2015, Zurich, Switzerland
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https://inria.hal.science/hal-01160297/file/Sofa-EG2015.pdf BibTex

Poster communications

titre
Domain Decomposition for real time Simulation of needle insertion
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Hadrien Courtecuisse, Raffaella Trivisonne, Laurent Goffin, Stephane Pierre-Alain Bordas, Michel de Mathelin
article
DD23, Jul 2015, Jeju, South Korea
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https://inria.hal.science/hal-01229514/file/Poster.pdf https://inria.hal.science/hal-01229514/file/talk_main.pdf BibTex

Theses

titre
Image-guided Simulation for Augmented Reality during Hepatic Surgery
auteur
Nazim Haouchine
article
Computer Science [cs]. Université de Lille1, 2015. English. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-01254439/file/Thesis.pdf BibTex

2014

Journal articles

recalage.jpg
titre
Velocity-based Adaptivity of Deformable Models
auteur
Maxime Tournier, Matthieu Nesme, François Faure, Benjamin Gilles
article
Computers and Graphics, 2014, 45, pp.75-85. ⟨10.1016/j.cag.2014.08.004⟩
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https://inria.hal.science/hal-01076338/file/si-gi-2014.pdf BibTex
media2013.png
titre
Real-time simulation of contact and cutting of heterogeneous soft-tissues
auteur
Hadrien Courtecuisse, Jeremie Allard, Pierre Kerfriden, Stephane Pierre-Alain Bordas, Stephane Cotin, Christian Duriez
article
Medical Image Analysis, 2014, 18 (2), pp.394-410. ⟨10.1016/j.media.2013.11.001⟩
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https://inria.hal.science/hal-01097108/file/courtecuisse2014b.pdf BibTex

Conference papers

AblationScar2.jpg
titre
Interactive Training System for Interventional Electrocardiology Procedures
auteur
H Talbot, F Spadoni, Christian Duriez, M Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
6th International Symposium on Biomedical Simulation - ISBMS 2014, Oct 2014, Strabsourg, France. pp.11 - 19, ⟨10.1007/978-3-319-12057-7_2⟩
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https://inria.hal.science/hal-01078209/file/HugoTalbot-ISBMS2014.pdf BibTex
liver-fem.png
titre
The Role of Ligaments: Patient-Specific or Scenario-Specific ?
auteur
Julien Bosman, Nazim Haouchine, Jérémie Dequidt, Igor Peterlik, Stéphane Cotin, Christian Duriez
article
International Symposium on Biomedical Simulation ISBMS, Oct 2014, Strasbourg, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01068077/file/main.pdf BibTex
prob-statement2.png
titre
Automatic Alignment of pre and intraoperative Data using Anatomical Landmarks for Augmented Laparoscopic Liver Surgery
auteur
Rosalie Plantefeve, Nazim Haouchine, Jean Pierre Radoux, Stéphane Cotin
article
International Symposium on Biomedical Simulation ISBMS, Oct 2014, Strasbourg, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01068246/file/article.pdf BibTex
titre
Testbed for assessing the accuracy of interventional radiology simulations
auteur
Mario Sanz Lopez, Jérémie Dequidt, Erwan Kerrien, Christian Duriez, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
ISBMS - 6th International Symposium on Biomedical Simulation, Oct 2014, Strasbourg, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01059892/file/final_paper_6p.pdf BibTex
intraopSimu2_4.png
titre
Intra-operative Registration for Stereotactic Procedures driven by a combined Biomechanical Brain and CSF Model
auteur
Alexandre Bilger, Éric Bardinet, Sara Fernández-Vidal, Christian Duriez, Pierre Jannin, Stéphane Cotin
article
ISBMS - International Symposium on Biomedical Simulation, Oct 2014, Strasbourg, France. pp.76-85, ⟨10.1007/978-3-319-12057-7_9⟩
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https://inria.hal.science/hal-01058435/file/Bilger_ISBMS.pdf BibTex
pre-op-projection.png
titre
Intra-operative Registration for Deep Brain Stimulation Procedures based on a Full Physics Head Model
auteur
Alexandre Bilger, Eric Bardinet, Sara Fernández-Vidal, Christian Duriez, Pierre Jannin, Stéphane Cotin
article
MICCAI 2014 Workshop on Deep Brain Stimulation Methodological Challenges - 2nd edition, Sep 2014, Boston, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01060304/file/dbsmc14_Bilger.pdf BibTex
lapin2.png
titre
Introducing interactive inverse FEM simulation and its application for adaptive radiotherapy
auteur
Eulalie Coevoet, Nick Reynaert, Eric Lartigau, Luis Schiappacasse, Jérémie Dequidt, Christian Duriez
article
MICCAI - 17th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01059667/file/paper706.pdf BibTex
teaser3.png
titre
Single View Augmentation of 3D Elastic Objects
auteur
Nazim Haouchine, Jérémie Dequidt, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
International Symposium on Mixed and Augmented Reality - ISMAR, Sep 2014, Munich, Germany
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01056323/file/template.pdf BibTex
paper1026_results.png
titre
Interactive Visualization of Muscle Activity During Limb Movements: Towards Enhanced Anatomy Learning
auteur
Armelle Bauer, Florent Paclet, Violaine Cahouet, Ali Hamadi Dicko, Olivier Palombi, François Faure, Jocelyne Troccaz
article
VCBM 2014 - Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine (VCBM 2014), Sep 2014, Vienne, Austria. pp.191-198, ⟨10.2312/vcbm.20141191⟩
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https://inria.hal.science/hal-01057027/file/EG_VCBM.pdf BibTex
Image_representatif_MYCF.jpg
titre
My Corporis Fabrica: Making Anatomy Easy
auteur
Armelle Bauer, Federico Ulliana, Ali Hamadi Dicko, Benjamin Gilles, Olivier Palombi, François Faure
article
SIGGRAPH: Special Interest Group on GRAPHics and Interactive Techniques, Aug 2014, Vancouver, Canada. pp.#16, ⟨10.1145/2619195.2656302⟩
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https://inria.hal.science/hal-00987439/file/MyCF_sg14.pdf BibTex
titre
Réalité augmentée pour la chirurgie minimalement invasive du foie utilisant un modèle biomécanique guidé par l'image
auteur
Nazim Haouchine, Stéphane Cotin, Jérémie Dequidt, Erwan Kerrien, Marie-Odile Berger
article
Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00988767/file/rfia2014_submission_89.pdf BibTex
ipcai-peterlik.jpg
titre
Model-Based Identification of Anatomical Boundary Conditions in Living Tissues
auteur
Igor Peterlik, Hadrien Courtecuisse, Christian Duriez, Stéphane Cotin
article
IPCAI 2014 - 5th International Conference on Information Processing in Computer Assisted Interventions, Jun 2014, Fukuoka, Japan. ⟨10.1007/978-3-319-07521-1_21⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01264434/file/Peterlik_PDFProof.pdf BibTex
titre
Haptic Rendering on Deformable Anatomical Tissues with Strong Heterogeneities
auteur
Guillaume Kazmitcheff, Hadrien Courtecuisse, Yann Nguyen, Mathieu Miroir, Alexis Bozorg-Grayeli, Stéphane Cotin, Olivier Sterkers, Christian Duriez
article
Eurohaptics 2014, Jun 2014, Versailles, France
Accès au bibtex
BibTex
titre
Towards an Accurate Tracking of Liver Tumors for Augmented Reality in Robotic Assisted Surgery
auteur
Nazim Haouchine, Jérémie Dequidt, Igor Peterlik, Erwan Kerrien, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
International Conference on Robotics and Automation (ICRA), Jun 2014, Hong Kong, China
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01003262/file/output.pdf BibTex
tree.png
titre
Seamless Adaptivity of Elastic Models
auteur
Maxime Tournier, Matthieu Nesme, François Faure, Benjamin Gilles
article
Graphics Interface, May 2014, Montréal, Canada. pp.17-24
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https://inria.hal.science/hal-00975220/file/SeamlessAdaptivity_GI2014.pdf BibTex
miniature-article.png
titre
Interactive Planning of Cryotherapy Using Physically-Based Simulation
auteur
Hugo Talbot, Myriam Lekkal, Rémi Béssard-Duparc, Stéphane Cotin
article
MMVR 21 - Medicine Meets Virtual Reality - 2014, Feb 2014, Manhattan Beach, California, United States
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https://inria.hal.science/hal-00918200/file/Talbot_H.pdf BibTex

Theses

titre
Interactive Patient-Specific Simulation of Cardiac Electrophysiology
auteur
Hugo Talbot
article
Computer Science [cs]. Université des Sciences et Technologies de Lille, 2014. English. ⟨NNT : ⟩
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https://inria.hal.science/tel-01097201/file/Thesis.pdf BibTex
visu100_03.png
titre
Robust blood vessel surface reconstruction for interactive simulations from patient data
auteur
Ahmed Yureidini
article
Medical Imaging. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2014. English. ⟨NNT : ⟩
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2013

Journal articles

thumbnail.png
titre
Anatomy Transfer
auteur
Ali Hamadi Dicko, Tiantian Liu, Benjamin Gilles, Ladislav Kavan, François Faure, Olivier Palombi, Marie-Paule Cani
article
ACM Transactions on Graphics, 2013, ACM SIGGRAPH ASIA, 32 (6), pp.Article No. 188. ⟨10.1145/2508363.2508415⟩
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https://inria.hal.science/hal-00862502/file/main.pdf BibTex
titre
A Combined Force and Thermal Feedback Interface for Minimally Invasive Procedures Simulation
auteur
Mohamed Guiatni, Vincent Riboulet, Christian Duriez, Abderrahmane Kheddar, Stéphane Cotin
article
IEEE/ASME Transactions on Mechatronics, 2013, 18 (3), pp.1170-1181. ⟨10.1109/TMECH.2012.2197862⟩
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BibTex
titre
Personalization of a Cardiac Electromechanical Model using Reduced Order Unscented Kalman Filtering from Regional Volumes
auteur
Stéphanie Marchesseau, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Rocio Cabrera Lozoya, Catalina Tobon-Gomez, Philippe Moireau, Rosa Maria Figueras I Ventura, Karim Lekadir, Alfredo Hernandez, Mireille Garreau, Erwan Donal, Christophe Leclercq, Simon G. Duckett, Kawal Rhode, Christopher Aldo Rinaldi, Alejandro F. Frangi, Reza Razavi, Dominique Chapelle, Nicholas Ayache
article
Medical Image Analysis, 2013, 17 (7), pp.816-829. ⟨10.1016/j.media.2013.04.012⟩
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https://inria.hal.science/hal-00819806/file/Finalmanuscript.pdf BibTex
Couv.png
titre
Towards an Interactive Electromechanical Model of the Heart
auteur
Hugo Talbot, Stéphanie Marchesseau, Christian Duriez, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
Interface Focus, 2013, The Virtual Physiological Human: Integrative Approaches to Computational Biomedicine, 3 (2), pp.4. ⟨10.1098/rsfs.2012.0091⟩
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https://inria.hal.science/hal-00797354/file/Interface_Focus-2013-Talbot.pdf BibTex
titre
Computer-based training system for cataract surgery
auteur
Jérémie Dequidt, Hadrien Courtecuisse, Olivier Comas, Jérémie Allard, Christian Duriez, Stéphane Cotin, Elodie Dumortier, Olivier Wavreille, Jean-Francois Rouland
article
SIMULATION: Transactions of The Society for Modeling and Simulation International, 2013, ⟨10.1177/0037549713495753⟩
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https://inria.hal.science/hal-00855821/file/cataractChapter.pdf BibTex
titre
3D strain assessment in ultrasound (straus): A synthetic comparison of five tracking methodologies
auteur
Mathieu de Craene, Stéphanie Marchesseau, Brecht Heyde, Hang Gao, M. Alessandrini, Olivier Bernard, Gemma Piella, Antonio Porras, Lennart Tautz, Anja Hennemuth, Adityo Prakosa, Hervé Liebgott, Oudom Somphone, Pascal Allain, S. Makram Ebeid, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Jan d'Hooge, Eric Saloux
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2013, 32 (9), pp.1632 - 1646. ⟨10.1109/TMI.2013.2261823⟩
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https://inria.hal.science/hal-00840039/file/TMI-2013-0246.pdf BibTex

Conference papers

titre
Haptic Rendering of Interacting Dynamic Deformable Objects Simulated in Real-Time at Different Frequencies
auteur
François Dervaux, Igor Peterlik, Jérémie Dequidt, Stéphane Cotin, Christian Duriez
article
IROS 2013 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Nov 2013, Tokyo, Japan
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https://inria.hal.science/hal-00842866/file/main.pdf BibTex
MontageFrancois.png
titre
Control of Elastic Soft Robots based on Real-Time Finite Element Method
auteur
Christian Duriez
article
ICRA 2013 IEEE International Conference on Robotics and Automation, 2013, Karlsruhe, France
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https://hal.science/hal-00823766/file/icra2013.pdf BibTex

Book sections

genou.jpg
titre
Frame-based interactive simulation of complex deformable objects
auteur
Benjamin Gilles, François Faure, Guillaume Bousquet, Dinesh K. Pai
article
Hidalgo González, Manuel and Mir Torres, Arnau and Varona Gómez, Javier. Deformation Models, 7, Springer, pp.145-166, 2013, Lecture Notes in Computational Vision and Biomechanics, 978-94-007-5446-1. ⟨10.1007/978-94-007-5446-1_6⟩
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https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00806088/file/main.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

NewLiver.png
titre
Real-time haptic simulation of medical procedures involving deformations and device-tissue interactions
auteur
Christian Duriez
article
Modeling and Simulation. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2013
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https://theses.hal.science/tel-00785118/file/HDR_duriez.pdf BibTex

Books

titre
Information Processing in Computer-Assisted Interventions - Proceedings of the 4th International IPCAI conference, Heidelberg, June 26, 2013.
auteur
Stéphane Cotin, Pierre Jannin, Dean Barratt, Nassir Navab, Gabor Fichtinger
article
Barratt, D. and Cotin, S. and Fichtinger, G. and Jannin, P. and Navab, N. Springer, 7915, pp.111, 2013, 978-3-642-38568-1
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BibTex

2012

Journal articles

representative.png
titre
Adaptive Image-based Intersection Volume
auteur
Bin Wang, François Faure, Dinesh K. Pai
article
ACM Transactions on Graphics, 2012, Proceedings of SIGGRAPH 2012, 31 (4), pp.Article No. 97. ⟨10.1145/2185520.2185593⟩
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https://inria.hal.science/hal-00699908/file/optixdetection-siggraph2012.pdf BibTex

Conference papers

titre
Physics-based Augmented Reality for 3D Deformable Object
auteur
Nazim Haouchine, Jérémie Dequidt, Erwan Kerrien, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
Eurographics Workshop on Virtual Reality Interaction and Physical Simulation, Dec 2012, Darmstadt, Germany
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https://inria.hal.science/hal-00768362/file/paper1028_final.pdf BibTex
Sofa-StimulationSide.png
titre
Towards Real-Time Computation of Cardiac Electrophysiology for Training Simulator
auteur
Hugo Talbot, Christian Duriez, Hadrien Courtecuisse, Jatin Relan, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
Statistical Atlases and Computational Models of the Heart - STACOM 2012 in the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France
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https://inria.hal.science/hal-00750835/file/SimulationOfCardiacAblation-STACOM2012.pdf BibTex
liver1.png
titre
Modeling and Real-Time Simulation of a Vascularized Liver Tissue
auteur
Igor Peterlík, Christian Duriez, Stéphane Cotin
article
MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.50--57
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https://hal.science/hal-00800546/file/vascularizedModel.pdf BibTex
Navigation.png
titre
Interactive Electromechanical Model of the Heart for Patient-Specific Therapy Planning and Training using SOFA
auteur
Hugo Talbot, Stéphanie Marchesseau, Christian Duriez, Hadrien Courtecuisse, Jatin Relan, Maxime Sermesant, Stéphane Cotin, Hervé Delingette
article
VPH 2012, Sep 2012, Londres, United Kingdom
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https://inria.hal.science/hal-00751537/file/VPH2012.pdf BibTex

Book sections

NewLiverMap.png
titre
SOFA: A Multi-Model Framework for Interactive Physical Simulation
auteur
François Faure, Christian Duriez, Hervé Delingette, Jérémie Allard, Benjamin Gilles, Stéphanie Marchesseau, Hugo Talbot, Hadrien Courtecuisse, Guillaume Bousquet, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
Yohan Payan. Soft Tissue Biomechanical Modeling for Computer Assisted Surgery, 11, Springer, pp.283-321, 2012, Studies in Mechanobiology, Tissue Engineering and Biomaterials, 978-3-642-29013-8. ⟨10.1007/8415_2012_125⟩
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https://inria.hal.science/hal-00681539/file/main.pdf BibTex
PipelineMyCF.png
titre
From Generic to Specic Musculoskeletal Simulations using an Ontology-based Modeling Pipeline
auteur
Ali Hamadi Dicko, Benjamin Gilles, François Faure, Olivier Palombi
article
Dimitri Plemenos and Georges Miaoulis. Intelligent Computer Graphics 2012, 441, Springer, pp.227-242, 2012, Studies in Computational Intelligence, ⟨10.1007/978-3-642-31745-3_12⟩
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https://inria.hal.science/hal-00701190/file/main-body.pdf BibTex

2011

Journal articles

steak-deformed2.png
titre
Sparse Meshless Models of Complex Deformable Solids
auteur
François Faure, Benjamin Gilles, Guillaume Bousquet, Dinesh K. Pai
article
ACM Transactions on Graphics, 2011, Proceedings of SIGGRAPH'2011, 30 (4), pp.Article No. 73. ⟨10.1145/2010324.1964968⟩
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https://inria.hal.science/inria-00589204/file/main.pdf BibTex
titre
Constraint-based haptic rendering of multirate compliant mechanisms
auteur
Igor Peterlik, Mourad Nouicer, Christian Duriez, Stéphane Cotin, Abderrahmane Kheddar
article
IEEE Transactions on Haptics (ToH), 2011, 4 (3), pp.175-187. ⟨10.1109/TOH.2011.41⟩
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BibTex
Teaser.png
titre
Frame-based Elastic Models
auteur
Benjamin Gilles, Guillaume Bousquet, François Faure, Dinesh Pai
article
ACM Transactions on Graphics, 2011, 30 (2), pp.Article No. 15. ⟨10.1145/1944846.1944855⟩
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https://inria.hal.science/inria-00589199/file/main.pdf BibTex
cag-vcbm-aneurysm.png
titre
Interactive Blood-Coil Simulation in Real-time during Aneurysm Embolization
auteur
Yiyi Wei, Stéphane Cotin, Jérémie Allard, Le Fang, Chunhong Pan, Songde Ma
article
Computers and Graphics, 2011, Visual Computing in Biology and Medicine, 35 (2), pp.422-430. ⟨10.1016/j.cag.2011.01.010⟩
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https://inria.hal.science/hal-00688443/file/VCBM2010.pdf BibTex
titre
A Multi-Front Eikonal Model of Cardiac Electrophysiology for Interactive Simulation of Radio-Frequency Ablation
auteur
Erik Pernod, Maxime Sermesant, Ender Konukoglu, Jatin Relan, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
Computers and Graphics, 2011, 35, pp.431--440
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https://inria.hal.science/inria-00616180/file/CG-VCBM-2011.pdf BibTex

Conference papers

demoHMS-deformLensV7.jpg
titre
Preconditioner-Based Contact Response and Application to Cataract Surgery
auteur
Hadrien Courtecuisse, Jérémie Allard, Christian Duriez, Stéphane Cotin
article
MICCAI - 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.315-322, ⟨10.1007/978-3-642-23623-5_40⟩
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https://inria.hal.science/hal-00685593/file/miccai2011-preconditioner.pdf BibTex
titre
Biomechanical Simulation of Electrode Migration for Deep Brain Stimulation
auteur
Alexandre Bilger, Jérémie Dequidt, Christian Duriez, Stéphane Cotin
article
14th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.339-346, ⟨10.1007/978-3-642-23623-5_43⟩
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https://inria.hal.science/hal-00685737/file/fulltext_2_.pdf BibTex
sig11talk-gpu.jpg
titre
Implicit FEM and Fluid Coupling on GPU for Interactive Multiphysics Simulation
auteur
Jérémie Allard, Hadrien Courtecuisse, François Faure
article
SIGGRAPH Talks, Aug 2011, Vancouver, Canada. pp.Article No. 52, ⟨10.1145/2037826.2037895⟩
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https://inria.hal.science/inria-00589203/file/sig11talk-gpu.pdf BibTex
Iros.png
titre
Asynchronous haptic simulation of contacting deformable objects with variable stiffness
auteur
Igor Peterlik, Christian Duriez, Stéphane Cotin
article
Intelligent Robots and Systems (IROS), 2011 IEEE/RSJ International Conference on, 2011, san francisco, United States. pp.2608--2613
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https://hal.science/hal-00823762/file/IROS2011.pdf BibTex

Book sections

titre
Implicit FEM Solver on GPU for Interactive Deformation Simulation
auteur
Jérémie Allard, Hadrien Courtecuisse, François Faure
article
Wen-mei W. Hwu. GPU Computing Gems Jade Edition, Elsevier, pp.281-294, 2011, Applications of GPU Computing Series, 9780123859631. ⟨10.1016/B978-0-12-385963-1.00021-6⟩
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BibTex

Reports

miniature-report.jpg
titre
Deliverable D10.4.1
auteur
Hugo Talbot, Federico Spadoni, Maxime Sermesant, Nicholas Ayache, Hervé Delingette
article
[Research Report] 2011, pp.25
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https://inria.hal.science/hal-00918216/file/euHeart_Deliverable_10-4-1.pdf BibTex

2010

Journal articles

breast1.jpeg
titre
Volumetric modeling and interactive cutting of deformable bodies
auteur
Lenka Jerabkova, Guillaume Bousquet, Sébastien Barbier, François Faure, Jérémie Allard
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2010, Special Issue on Biomechanical Modelling of Soft Tissue Motion, 103 (2-3), pp.217-224. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2010.09.012⟩
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https://inria.hal.science/inria-00550267/file/pbmb10.pdf BibTex
anatomical_structures.jpg
titre
GPU-based Real-Time Soft Tissue Deformation with Cutting and Haptic Feedback
auteur
Hadrien Courtecuisse, Hoeryong Jung, Jérémie Allard, Christian Duriez, Doo Yong Lee, Stéphane Cotin
article
Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2010, Special Issue on Biomechanical Modelling of Soft Tissue Motion, 103 (2-3), pp.159-168. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2010.09.016⟩
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https://inria.hal.science/hal-00686056/file/pbmb10-fem-cutting.pdf BibTex
sig10ldi-img.png
titre
Volume Contact Constraints at Arbitrary Resolution
auteur
Jérémie Allard, François Faure, Hadrien Courtecuisse, Florent Falipou, Christian Duriez, Paul Kry
article
ACM Transactions on Graphics, 2010, Proceedings of SIGGRAPH 2010, 29 (3), pp.Article No. 82. ⟨10.1145/1778765.1778819⟩
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https://inria.hal.science/inria-00502446/file/sig10ldi-preprint.pdf BibTex
presence10-0.jpg
titre
Modularity for Large Virtual Reality Applications
auteur
Jérémie Allard, Jean-Denis Lesage, Bruno Raffin
article
Presence: Teleoperators and Virtual Environments, 2010, 19 (2), pp.142-161. ⟨10.1162/pres.19.2.142⟩
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https://inria.hal.science/hal-00688474/file/presence10-flowvr.pdf BibTex
nesme2.png
titre
Accurate interactive animation of deformable models at arbitrary resolution
auteur
Matthieu Nesme, François Faure, Yohan Payan
article
International Journal of Image and Graphics, 2010, 10 (2), pp.175-202. ⟨10.1142/S021946781000372X⟩
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https://inria.hal.science/inria-00443064/file/Nesme_Int_Journ_Image_Graph_09.pdf BibTex

Conference papers

asynchronous-preconditioners.png
titre
Asynchronous Preconditioners for Efficient Solving of Non-linear Deformations
auteur
Hadrien Courtecuisse, Jérémie Allard, Christian Duriez, Stéphane Cotin
article
VRIPHYS - Virtual Reality Interaction and Physical Simulation, Nov 2010, Copenhagen, Denmark. pp.59-68, ⟨10.2312/PE/vriphys/vriphys10/059-068⟩
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https://inria.hal.science/hal-00688865/file/vriphys2010.pdf BibTex
europar10.png
titre
Multi-GPU and Multi-CPU Parallelization for Interactive Physics Simulations
auteur
Everton Hermann, Bruno Raffin, François Faure, Thierry Gautier, Jérémie Allard
article
Europar 2010 - 16th International Euro-Par Conference on Parallel Processing, Aug 2010, Ischia-Naples, Italy. pp.235-246, ⟨10.1007/978-3-642-15291-7_23⟩
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https://inria.hal.science/inria-00502448/file/europar10.pdf BibTex
eye-mesh.png
titre
High Fidelity Haptic Rendering for Deformable Objects Undergoing Topology Changes
auteur
Hoeryong Jung, Stéphane Cotin, Christian Duriez, Jérémie Allard, Doo Yong Lee
article
EuroHaptics - Haptics: Generating and Perceiving Tangible Sensations International Conference, Jul 2010, Amsterdam, Netherlands. pp.262-268, ⟨10.1007/978-3-642-14064-8_38⟩
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https://inria.hal.science/hal-00688913/file/eurohaptics10-topology-changes-preprint.pdf BibTex
titre
Interactive real time simulation of cardiac radio-frequency ablation
auteur
Erik Pernod, Maxime Sermesant, Jatin Relan, Hervé Delingette
article
Proc. of Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine (2010) (VCBM'2010), 2010, Leipzig, Germany
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https://inria.hal.science/inria-00616160/file/ErikPernodVCBM2010.pdf BibTex

Theses

titre
Suture in virtual surgery : interactive simulation and heterogeneous models
auteur
Christophe Guébert
article
Modélisation et simulation. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00561061/file/theseGuebert.pdf BibTex
titre
Interactive Physical Simulation on Multi-core and Multi-GPU Architectures
auteur
Everton Hermann
article
Networking and Internet Architecture [cs.NI]. Institut National Polytechnique de Grenoble - INPG, 2010. English. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00537947/file/these.pdf BibTex

2009

Journal articles

liver.png
titre
Preserving Topology and Elasticity for Embedded Deformable Models
auteur
Matthieu Nesme, Paul Kry, Lenka Jerabkova, François Faure
article
ACM Transactions on Graphics, 2009, Proceedings of ACM SIGGRAPH 2009, 28 (3), pp.Article No. 52. ⟨10.1145/1531326.1531358⟩
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https://inria.hal.science/inria-00394451/file/composite.pdf BibTex

Conference papers

med.png
titre
Interactive Physical Simulation on Multicore Architectures
auteur
Everton Hermann, Bruno Raffin, François Faure
article
EGPGV - Eurographics Workhop on Parallel Graphics and Visualization, Mar 2009, Munich, Germany. pp.1-8, ⟨10.2312/EGPGV/EGPGV09/001-008⟩
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https://inria.hal.science/inria-00360131/file/egpgv09.pdf BibTex

2008

Conference papers

vriphys08-fin.png
titre
Unified processing of constraints for interactive simulation
auteur
Christophe Guébert, Christian Duriez, Laurent Grisoni
article
Workshop in Virtual Reality Interactions and Physical Simulation VRIPHYS' 2008, Nov 2008, Grenoble, France
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https://hal.science/hal-00823764/file/vriphys08-fin.pdf BibTex
ldi08-1.png
titre
Image-based Collision Detection and Response between Arbitrary Volumetric Objects
auteur
François Faure, Jérémie Allard, Florent Falipou, Sébastien Barbier
article
ACM SIGGRAPH/Eurographics Symposium on Computer Animation, Jul 2008, Dublin, Ireland. pp.155-162, ⟨10.2312/SCA/SCA08/155-162⟩
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https://inria.hal.science/inria-00319399/file/sofa-ldi-sca2008.pdf BibTex
torus_separation.png
titre
Ray-traced collision detection for deformable bodies
auteur
Everton Hermann, François Faure, Bruno Raffin
article
GRAPP 2008 - 3rd International Conference on Computer Graphics Theory and Applications, Jan 2008, Madeira, Portugal. pp.293-299
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https://inria.hal.science/inria-00319404/file/grapp08.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Computer Based Interactive Medical Simulation 
auteur
Stéphane Cotin
article
Modeling and Simulation. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2008
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https://theses.hal.science/tel-00839511/file/HDR_-_Final.pdf BibTex

Theses

operation.png
titre
Multiresolution mechanical model for interactive animation of soft bodies
auteur
Matthieu Nesme
article
Modélisation et simulation. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2008. Français. ⟨NNT : ⟩
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https://theses.hal.science/tel-00293531/file/nesme_these.pdf BibTex

2006

Journal articles

liver.jpg
titre
Hierarchical Multi-Resolution Finite Element Model for Soft Body Simulation
auteur
Matthieu Nesme, François Faure, Yohan Payan
article
Lecture Notes in Computer Science, 2006, 4072, pp.40-47
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https://hal.science/hal-00082208/file/LNCS_2006_Nesme.pdf BibTex

Conference papers

0_dragon.jpg
titre
Animating Shapes at Arbitrary Resolution with Non-Uniform Stiffness
auteur
Matthieu Nesme, Yohan Payan, François Faure
article
VRIPHYS, 2006, Madrid, Spain
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https://inria.hal.science/inria-00394475/file/NPF06.pdf BibTex

Software

titre
SOFA
auteur
François Faure, Christian Duriez, Jérémie Allard, Stéphane Cotin, Hervé Delingette, Bilger Alexandre, Hugo Talbot, Benjamin Gilles, Adagolodgo Yinoussa, Bensoussan Pierre-Jean, Stéphanie Marchesseau, Baksic Paul, Nesme Matthieu, Pernod Erik, Roy Frederick, Jourdes Francois, Paran Guillaume, Marchal Damien, Igor Peterlik, Brunet Jean-Nicolas, Hadrien Courtecuisse, Scheikl Paul Maria, Bousquet Guillaume, Coevoet Eulalie, Dequidt Jeremie, Falipou Florent, Hermann Everton, Alcalde Juan Pablo de la Plata, Testylier Romain, Tournier Maxime, Vanneste Felix
article
2006, ⟨swh:1:cnt:3de90b67ca1dd6e12c9fc326bb7037cb9b4bdf7c;origin=https://github.com/sofa-framework/sofa;visit=swh:1:snp:3fe570d6f99f87bb576ba7b86134990305f7aee1;anchor=swh:1:rev:aedc7ffea53e1a1b406b5e1c32b344cf53d9dbd1;path=/Authors.txt⟩
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BibTex

2005

Journal articles

cube.jpeg
titre
Physically realistic interactive simulation for biological soft tissues
auteur
Matthieu Nesme, Maud Marchal, Emmanuel Promayon, Matthieu Chabanas, Yohan Payan, François Faure
article
Recent Research Developments in Biomechanics, 2005, 2, pp.1-22
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-00080378/file/RecRechBiomech_Payan_2005.pdf BibTex

Conference papers

bunny.jpg
titre
Efficient, Physically Plausible Finite Elements
auteur
Matthieu Nesme, Yohan Payan, François Faure
article
Eurographics, Aug 2005, Dublin, Ireland
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