Publications HAL de la collection SOFA

2021

Journal articles

titre
Coupling numerical deformable models in global and reduced coordinates for the simulation of the direct and the inverse kinematics of Soft Robots
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Federico Renda, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2021, IEEE Robotics and Automation Letters, 6 (2), pp.3910-3917. ⟨10.1109/LRA.2021.3061977⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03192168/file/COSSERAT.pdf BibTex
titre
Real-Time Simulation For Control Of Soft Robots With Self-Collisions Using Model Order Reduction For Contact Forces
auteur
Olivier Goury, Bruno Carrez, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2021, 6 (2), pp.3752 - 3759. ⟨10.1109/LRA.2021.3064247⟩
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https://hal.inria.fr/hal-03192762/file/MORC.pdf BibTex
titre
A Bio-Inspired Active Prostate Phantom for Adaptive Interventions
auteur
Stefan Escaida Navarro, Singh Dhaliwal, Mario Sanz Lopez, Sarah Wilby, Antony Palmer, Wojciech Polak, Rochdi Merzouki, Christian Duriez
article
IEEE Transactions on Medical Robotics and Bionics, IEEE, In press
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https://hal.inria.fr/hal-03374911/file/TMRB_BIP_Accepted.pdf BibTex
titre
FEM-based Gain-Scheduling Control of a Soft Trunk Robot
auteur
Ke Wu, Gang Zheng
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE In press, ⟨10.1109/LRA.2021.3061311⟩
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BibTex
titre
Proximity Perception in Human-Centered Robotics: A Survey on Sensing Systems and Applications
auteur
Stefan Escaida Navarro, Stephan Mühlbacher-Karrer, Hosam Alagi, Hubert Zangl, Keisuke Koyama, Björn Hein, Christian Duriez, Joshua Smith
article
IEEE Transactions on Robotics, IEEE, In press
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https://hal.inria.fr/hal-03156830/file/T_RO_ProximityPerception_Accepted.pdf BibTex
titre
Data-Driven Intra-Operative Estimation of Anatomical Attachments for Autonomous Tissue Dissection
auteur
Eleonora Tagliabue, Diego Dall'Alba, Micha Pfeiffer, Marco Piccinelli, Riccardo Marin, Umberto Castellani, Stefanie Speidel, Paolo Fiorini
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2021, 6, pp.1856 - 1863. ⟨10.1109/lra.2021.3060655⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03349173/file/DataDrivenEstimationOfAttachments.pdf BibTex

Conference papers

titre
Intra-operative Update of Boundary Conditions for Patient-specific Surgical Simulation
auteur
Eleonora Tagliabue, Marco Piccinelli, Diego Dall'Alba, Juan Verde, Micha Pfeiffer, Riccardo Marin, Stefanie Speidel, Paolo Fiorini, Stéphane Cotin
article
MICCAI - 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03315008/file/IntraopUpdateOfBCForSurgicalSimulation.pdf BibTex
titre
Personal-by-design: a 3D Electromechanical Model of the Heart Tailored for Personalisation
auteur
Gaëtan Desrues, Delphine Feuerstein, Thierry Legay, Serge Cazeau, Maxime Sermesant
article
Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2021, Stanford, CA, United States
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https://hal.inria.fr/hal-03369345/file/fimh_2021.pdf BibTex
titre
Robotic needle steering in deformable tissues with extreme learning machines
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi, Anna Cazzaniga, Paul Baksic, Eleonora Tagliabue, Elena de Momi, Hadrien Courtecuisse
article
AUTOMED 2021, Jun 2021, Basel, Switzerland
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03187930/file/Robotic_needle_steering_in_deformable_tissues_with_extreme_learning_machines.pdf BibTex
titre
Learning robotic needle steering from inverse finite element simulations
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi, Anna Cazzaniga, Paul Baksic, Eleonora Tagliabue, Elena de Momi, Hadrien Courtecuisse
article
ICRA 2021 Workshop on Representing and Manipulating Deformable Objects, May 2021, Xi’an, China
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03241674/file/14-PERRUSI-paper.pdf BibTex
titre
Shared control strategy for needle insertion into deformable tissue using inverse Finite Element simulation
auteur
Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse, Bernard Bayle
article
ICRA 2021 - International Conference on Robotics and Automation, May 2021, Xi’an, China
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03191078/file/Icra2021_HAL.pdf BibTex
titre
Interactive Finite Element model of needle insertion and laceration
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi, Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse
article
Eurographics 2021 - The 42nd Annual Conference of the European Association for Computer Graphics, European Association for Computer Graphics, May 2021, Vienne / Virtual, Austria. ⟨10.2312/egs.20211020⟩
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https://hal.inria.fr/hal-03187709/file/Interactive_Finite_Element_model_of_needle_insertion_and_laceration__AAM_.pdf BibTex
titre
Enabling the control of a new degree of freedom by using anisotropic material on a 6-DOF parallel soft robot
auteur
Félix Vanneste, Olivier Goury, Christian Duriez
article
Robosoft 2021, Apr 2021, Yale / Virtual, United States
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https://hal.inria.fr/hal-03194087/file/ROBOSOFT_2021_2sc_submission.pdf BibTex

Poster communications

titre
CoBra robot for localized cancer treatment and diagnosis under real-time MRI guidance
auteur
Sepaldeep Singh Dhaliwal, Sarah Wilby, Martijn de Vries, Kévin Brou Boni, Sina Firouzy, Stefan Escaida Navarro, Abdelkader Belarouci, Vincent Coelen, Othman Lakhal, David Pasquier, Antony Palmer, Wojciech Polak, Dylan Jones, Ashraf Labib, John Dobbelsteen, Mario Sanz-Lopez, Christian Duriez, Nick Reynaert, Rochdi Merzouki
article
The Hamlyn Symposium on Medical Robotics Imperial College London, Jun 2021, London, United Kingdom
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03321170/file/CoBra_Hamlyn%20symposium_2021.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
DeepPhysics: a physics aware deep learning framework for real-time simulation
auteur
Alban Odot, Ryadh Haferssas, Stéphane Cotin
article
2021
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03327818/file/main.pdf BibTex

2020

Journal articles

Screen%20Shot%202020-12-14%20at%202.50.25%20PM.png
titre
Predicted Microscopic Cortical Brain Images for Optimal Craniotomy Positioning and Visualization
auteur
Nazim Haouchine, Pariskhit Juvekar, Alexandra Golby, Sarah Frisken
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering: Imaging & Visualization, Taylor & Francis, 2020, ⟨10.1080/21681163.2020.1834874⟩
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https://hal.inria.fr/hal-03065619/file/haouchine_aecai_2020.pdf BibTex
titre
Three‐dimensional physics‐based registration of pelvic system using 2D dynamic magnetic resonance imaging slices
auteur
Hadrien Courtecuisse, Zhifan Jiang, Olivier Mayeur, Jean-Francois Witz, Pauline Lecomte-Grosbras, Michel Cosson, Mathias Brieu, Stéphane Cotin
article
Strain, Wiley-Blackwell, 2020, 56 (3), ⟨10.1111/str.12339⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02873023/file/3D_Physics_based_Registration_of_Pelvic_System_Using_2D_Dynamic_MRI_Slices%281%29.pdf BibTex
titre
Estimation of boundary conditions for patient-specific liver simulation during augmented surgery
auteur
Sergei Nikolaev, Stéphane Cotin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2020, 15 (7), pp.1107-1115. ⟨10.1007/s11548-020-02188-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02634875/file/Estimation_of_boundary_conditions_for_patient_specific_liver_simulation_during_augmented_surgery.pdf BibTex
titre
Robust control of a silicone soft robot using neural networks
auteur
Gang Zheng, Yuan Zhou, Mingda Ju
article
ISA Transactions, Elsevier, 2020, 100, pp.38-45. ⟨10.1016/j.isatra.2019.12.004⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02406765/file/paper.pdf BibTex
titre
Constrained Stochastic State Estimation of Deformable 1D Objects: Application to Single-view 3D Reconstruction of Catheters with Radio-opaque Markers
auteur
Raffaella Trivisonne, Erwan Kerrien, Stéphane Cotin
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, Elsevier, 2020, 81, ⟨10.1016/j.compmedimag.2020.101702⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02469093/file/CMIG.pdf BibTex
titre
Anisotropic soft robots based on 3D printed meso-structured materials: design, modeling by homogenization and simulation
auteur
Félix Vanneste, Olivier Goury, Jonas Martinez, Sylvain Lefebvre, Hervé Delingette, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2020, 5 (2), pp.2380-2386. ⟨10.1109/LRA.2020.2969926⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02475589/file/ICRA_2020_HAL.pdf BibTex
titre
Augmented Reality during Open Liver Surgery Using a Markerless Non-rigid Registration System
auteur
Nicolas Golse, Antoine Petit, Maïté Lewin, Eric Vibert, Stéphane Cotin
article
Journal of Gastrointestinal Surgery, Springer Verlag, 2020, ⟨10.1007/s11605-020-04519-4⟩
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BibTex
titre
A Model-based Sensor Fusion Approach for Force and Shape Estimation in Soft Robotics
auteur
Stefan Escaida Navarro, Björn Hein, Stefan Escaida Navarro, Steven Nagels, Hosam Alagi, Lisa-Marie Faller, Olivier Goury, Thor Morales-Bieze, Hubert Zangl, Bjorn Hein, Raf Ramakers, Wim Deferme, Gang Zheng, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2020, 5 (4), pp.5621-5628. ⟨10.1109/LRA.2020.3008120⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02882039/file/PrePrint_ModelBasedSensorFusion.pdf BibTex
titre
Elastic registration based on compliance analysis and biomechanical graph matching
auteur
Jaime Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
Annals of Biomedical Engineering, Springer Verlag, 2020, 48, pp.447-462. ⟨10.1007/s10439-019-02364-4⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02401280/file/abmeFormatMain.pdf BibTex
titre
Automatic Shape Control of Deformable Wires based on Model-Free Visual Servoing
auteur
Romain Lagneau, Alexandre Krupa, Maud Marchal
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2020, 5 (4), pp.5252 - 5259. ⟨10.1109/LRA.2020.3007114⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02890830/file/2020_ral-lagneau.pdf BibTex

Conference papers

titre
Deformation Aware Augmented Reality for Craniotomy using 3D/2D Non-rigid Registration of Cortical Vessels
auteur
Nazim Haouchine, Parikshit Juvekar, William Wells Iii, Stéphane Cotin, Alexandra Golby, Sarah Frisken
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru
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https://hal.inria.fr/hal-02876726/file/MICCAI_2020_Cortical.pdf BibTex
titre
Use of stereo-laparoscopic liver surface reconstruction to compensate for pneumoperitoneum deformation through biomechanical modeling.
auteur
Andrea Teatini, Jean-Nicolas Brunet, Sergei Nikolaev, Bjørn Edwin, Stéphane Cotin, Ole Jakob Elle
article
VPH2020 - Virtual Physiological Human, Aug 2020, Paris, France
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https://hal.inria.fr/hal-03130613/file/VPH2020_conference.pdf BibTex
titre
LPV Framework for Non-Linear Dynamic Control of Soft Robots using Finite Element Model
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez
article
IFAC 2020 - 21rst IFAC World Congress, Jul 2020, Berlin, Germany
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02567575/file/LPV_SoRo.pdf BibTex
titre
Robotic needle insertion in moving soft tissues using constraint-based inverse Finite Element simulation
auteur
Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse, Christian Duriez, Bernard Bayle
article
ICRA 2020 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2020, Paris / Virtual, France. pp.2407-2413, ⟨10.1109/ICRA40945.2020.9197515⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02503574/file/ICRA_HAL.pdf BibTex
titre
Active Deformation through Visual Servoing of Soft Objects
auteur
Romain Lagneau, Alexandre Krupa, Maud Marchal
article
ICRA 2020 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2020, Paris, France. pp.1-7
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https://hal.inria.fr/hal-02499488/file/Lagneau_icra_2020.pdf BibTex
titre
Simultaneous Tracking and Elasticity Parameter Estimation of Deformable Objects
auteur
Agniva Sengupta, Romain Lagneau, Alexandre Krupa, Eric Marchand, Maud Marchal
article
ICRA 2020 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2020, Paris, France. pp.1-7
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https://hal.inria.fr/hal-02495831/file/ICRA2020_DefTrack_Estimation.pdf BibTex
Screen%20Shot%202020-12-14%20at%203.03.15%20PM.png
titre
Alignment of Cortical Vessels viewed through the Surgical Microscope with Preoperative Imaging to Compensate for Brain Shift
auteur
Nazim Haouchine, Parikshit Juvekar, Alexandra Golby, William Wells, Stéphane Cotin, Sarah Frisken
article
Medical Imaging 2020: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling, Feb 2020, Houston, United States
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https://hal.inria.fr/hal-03065632/file/haouchine_SPIE_2020.pdf BibTex

Book sections

titre
Data-driven simulation for augmented surgery
auteur
Andrea Mendizabal, Eleonora Tagliabue, Tristan Hoellinger, Jean-Nicolas Brunet, Sergei Nikolaev, Stéphane Cotin
article
Bilen Emek Abali; Ivan Giorgio. Developments and Novel Approaches in Biomechanics and Metamaterials, 132, pp.71-96, 2020, 978-3-030-50464-9. ⟨10.1007/978-3-030-50464-9⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02538101/file/Iconsom_manuscript_2019.pdf BibTex

Master thesis

titre
Advances in the inverse biomechanical simulation framework for autonomous robotic needle steering.
auteur
Pedro Henrique Suruagy Perrusi
article
Automatic Control Engineering. 2020
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https://hal.inria.fr/hal-02986039/file/PERRUSI_master_thesis.pdf BibTex

Theses

titre
Shape control of deformable objects by adaptive visual servoing
auteur
Romain Lagneau
article
Computer Science [cs]. INSA Rennes, 2020. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03087518/file/TEL_ThesisRLagneau.pdf BibTex
titre
Machine Learning meets real-time Numerical Simulation - Application to surgical training, preoperative planning and surgical assistance
auteur
Andrea Mendizabal
article
Biomechanics [physics.med-ph]. Université de Strasbourg, 2020. English
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-03116502/file/PhD_thesis.pdf BibTex
titre
Exploring new numerical methods for the simulation of soft tissue deformations in surgery assistance
auteur
Jean-Nicolas Brunet
article
Computer Science [cs]. Université de Strasbourg, 2020. English
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https://hal.inria.fr/tel-03130643/file/thesis_jean-nicolas_brunet_final.pdf BibTex
titre
Image-guided Interactive Simulation for Endovascular Surgery
auteur
Raffaella Trivisonne
article
Modeling and Simulation. Université de Strasbourg, 2020. English
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https://hal.inria.fr/tel-03021043/file/Trivisonne_Raffaella_2020_ED269.pdf.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Force classification during robotic interventions through simulation-trained neural networks
auteur
Andrea Mendizabal, Raphael Sznitman, Stéphane Cotin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2019, 14, pp.1601-1610. ⟨10.1007/s11548-019-02048-3⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02268782/file/IJCARS_rebuttal_bis%282%29.pdf BibTex
titre
Soft Haptic Device to Render the Sensation of Flying Like a Drone
auteur
Carine Rognon, Margaret Koehler, Christian Duriez, Dario Floreano, Allison Okamura
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2019, 4 (3), pp.2524-2531. ⟨10.1109/LRA.2019.2907432⟩
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BibTex
titre
Stiffness Control of Deformable Robots Using Finite Element Modeling
auteur
Margaret Koehler, Allison Okamura, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2019, 4 (2), pp.469-476. ⟨10.1109/LRA.2019.2890897⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02079146/file/RALStiffnessControl.pdf BibTex
titre
Robotic Insertion of Flexible Needle in Deformable Structures Using Inverse Finite-Element Simulation
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Laurent Goffin, Michel de Mathelin, Hadrien Courtecuisse
article
IEEE Transactions on Robotics, IEEE, 2019, 35 (3), pp.697-708. ⟨10.1109/TRO.2019.2897858⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02144487/file/main.pdf BibTex
titre
Calibration and External Force Sensing for Soft Robots using an RGB-D Camera
auteur
Zhongkai Zhang, Antoine Petit, Jeremie Dequidt, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2019, 4 (3), pp.2356 - 2363. ⟨10.1109/LRA.2019.2903356⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02060976/file/Calibration%20and%20External%20Force%20Sensing%20for%20Soft%20Robots%20using%20an%20RGB-D%20Camera.pdf BibTex
titre
Population-based priors in cardiac model personalisation for consistent parameter estimation in heterogeneous databases
auteur
Roch Molléro, Xavier Pennec, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, John Wiley and Sons, 2019, 35 (2), pp.e3158. ⟨10.1002/cnm.3158⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01922719/file/Special_Issue___Longitudinal_with_Priors_Refactoring-3.pdf BibTex
titre
Motion Control of Cable-Driven Continuum Catheter Robot through Contacts
auteur
Zhongkai Zhang, Jeremie Dequidt, Junghwan Back, Hongbin Liu, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2019, 4 (2), pp.1852-1859. ⟨10.1109/LRA.2019.2898047⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02052637/file/RA-L-ICRA-Zhongkai%20Zhang.pdf BibTex
titre
Virtual image correlation of magnetic resonance images for 3D geometric modelling of pelvic organs
auteur
Zhifan Jiang, Olivier Mayeur, Jean-Francois Witz, Pauline Lecomte‐grosbras, Jérémie Dequidt, Michel Cosson, Christian Duriez, Mathias Brieu
article
Strain, Wiley-Blackwell, 2019, 55 (3), pp.e12305. ⟨10.1111/str.12305⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02403391/file/Paper_ZJiang_2017_Revision2.pdf BibTex
titre
Control Design for Soft Robots based on Reduced Order Model
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Christian Duriez, Thierry-Marie Guerra
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2019, 4 (1), pp.25-32. ⟨10.1109/LRA.2018.2876734⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01901031/file/ControlSoftRobots.pdf BibTex
titre
Position-based modeling of lesion displacement in Ultrasound-guided breast biopsy
auteur
Eleonora Tagliabue, Diego Dall’alba, Enrico Magnabosco, Chiara Tenga, Igor Peterlík, Paolo Fiorini
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2019, 14 (8), pp.1329-1339. ⟨10.1007/s11548-019-01997-z⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02276090/file/IJCARS2019_PBD_FEM_HAL.pdf BibTex
titre
Modeling Novel Soft Mechanosensors based on Air-Flow Measurements
auteur
Stefan Escaida Navarro, Olivier Goury, Gang Zheng, Thor Morales Bieze, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2019, 4 (4), pp.4338 - 4345. ⟨10.1109/LRA.2019.2932604⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02239080/file/19-0372_04_MS.pdf BibTex
titre
Finite-time estimation for linear time-delay systems via homogeneous method
auteur
Gang Zheng, Haoping Wang
article
International Journal of Control, Taylor & Francis, 2019, 92 (6), pp.1252-1263. ⟨10.1080/00207179.2017.1390255⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01649434/file/Hal.pdf BibTex
titre
Simulation of hyperelastic materials in real-time using deep learning
auteur
Andrea Mendizabal, Pablo Márquez-Neila, Stéphane Cotin
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2019, 59, pp.101569. ⟨10.1016/j.media.2019.101569⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02097119/file/hal_version_media_paper.pdf BibTex
titre
Trajectory Tracking Control Design for Large-Scale Linear Dynamical Systems With Applications to Soft Robotics
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez
article
IEEE Transactions on Control Systems Technology, Institute of Electrical and Electronics Engineers, In press, pp.1-11. ⟨10.1109/TCST.2019.2953624⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02404003/file/08930042%20%281%29.pdf BibTex

Conference papers

titre
Time stepping scheme for interactive medical simulations
auteur
François Jourdes
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02419406/file/SWS19_paper_1-InSimo.pdf BibTex
titre
Biomechanical modeling of probe to tissue interaction in robotic ultrasound scanning
auteur
Eleonora Tagliabue, Diego Dall'Alba, Paolo Fiorini
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02419373/file/SWS19_paper_4.pdf BibTex
titre
OpenVolumeMesh -A Versatile Index-Based Data Structure for 3D Polytopal Complexes
auteur
Waseem Palliyali, Georges Younes, Julien Abinahed, Nikhil Navkar, Shidin Balakrishnan, Abdulrahman Alfayyad, Abdulla Al-Ansari, Zherong Pan, Gorune Ohannessian, Samer Itani, Dinesh Manocha, George Turkiyyah
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02419401/file/SWS19_paper_2-Dynamic_Textures_for_Topologically_Changing_Volumes.pdf BibTex
titre
An Interactive Physically-based Model for Active Suction Phenomenon Simulation
auteur
Antonin Bernardin, Christian Duriez, Maud Marchal
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02419381/file/SWS19_paper_3.pdf BibTex
titre
Towards using SOFA to train a controller for neurovascular catheter interventions
auteur
Tim Pusch, Lennart Karstensen, Tobias Behr
article
SWS19 - SOFA Week Symposium, Nov 2019, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02419367/file/SWS19_paper_5.pdf BibTex
titre
Physics-based Deep Neural Network for Real-Time Lesion Tracking in Ultrasound-guided Breast Biopsy
auteur
Andrea Mendizabal, Eleonora Tagliabue, Jean-Nicolas Brunet, Diego Dall'Alba, Paolo Fiorini, Stéphane Cotin
article
Computational Biomechanics for Medicine XIV, Oct 2019, Shenzhen, China
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-02311277/file/camera_ready_manuscript.pdf BibTex
titre
Physics-based Deep Neural Network for Augmented Reality during Liver Surgery
auteur
Jean-Nicolas Brunet, Andrea Mendizabal, Antoine Petit, Nicolas Golse, Eric Vibert, Stéphane Cotin
article
MICCAI 2019 - 22nd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.8, ⟨10.1007/978-3-030-32254-0_16⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02158862/file/MICCAI2019%284%29.pdf BibTex
titre
Towards Hyper-Reduction of Cardiac Models using Poly-Affine Deformation
auteur
Gaëtan Desrues, Hervé Delingette, Maxime Sermesant
article
STACOM 2019: Statistical Atlases and Computational Models of the Heart, Oct 2019, Shenzhen, China
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https://hal.inria.fr/hal-02429678/file/STACOM_FinalVersion.pdf BibTex
Screenshot%20from%202019-10-18%2011-03-16.png
titre
Deformed Reality
auteur
Antoine Petit, Nazim Haouchine, Frédérick Roy, Dan Goldman, Stéphane Cotin
article
Computer Graphics & Visual Computing (Eurographics), Sep 2019, Bangor, United Kingdom
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https://hal.inria.fr/hal-02320444/file/paper1011_CRC.pdf BibTex
titre
The effect of discretization on parameter identification. Application to patient-specific simulations
auteur
Nava Schulmann, Stéphane Cotin, Igor Peterlík
article
CMBBE 2019 - 16th International Symposium on Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, Aug 2019, New York (NY), United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02276130/file/The%20effect%20of%20discretization%20on%20parameter%20identification%20%281%29.pdf BibTex
titre
Corotated meshless implicit dynamics for deformable bodies
auteur
Jean-Nicolas Brunet, Vincent Magnoux, Benoît Ozell, Stéphane Cotin
article
WSCG 2019 - 27th International Conference on Computer Graphics, Visualization and Computer Vision, May 2019, Pilsen, Czech Republic. ⟨10.24132/CSRN.2019.2901.1.11⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02119414/file/%21%21_CSRN-2801-11.pdf BibTex
titre
Controllability pre-verification of silicone soft robots based on finite-element method
auteur
Gang Zheng, Olivier Goury, Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Christian Duriez
article
ICRA 2019 - International Conference on Robotics and Automation, May 2019, Montreal, Canada. pp.7395-7400, ⟨10.1109/ICRA.2019.8794370⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02403899/file/final.pdf BibTex
titre
Soft robots locomotion and manipulation control using FEM simulation and quadratic programming
auteur
Eulalie Coevoet, Adrien Escande, Christian Duriez
article
RoboSoft 2019 - IEEE International Conference on Soft Robotics, Apr 2019, Seoul, South Korea
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https://hal.inria.fr/hal-02079151/file/Friction.pdf BibTex
titre
Toward Shape Optimization of Soft Robots
auteur
Thomas Morzadec, Damien Marchal, Christian Duriez
article
RoboSoft 2019 - IEEE International Conference on Soft Robotics, Apr 2019, Séoul, South Korea
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02078776/file/RoboSoft.pdf BibTex
titre
Dynamically Closed-Loop Controlled Soft Robotic Arm using a Reduced Order Finite Element Model with State Observer
auteur
Robert Katzschmann, Maxime Thieffry, Olivier Goury, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez, Daniela Rus
article
IEEE 2019 International Conference on Soft Robotics, Apr 2019, Séoul, South Korea
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02078809/file/Dynamically%20Closed%20Loop%20Controlled%20Soft%20Robotic%20Arm%20using%20a%20Reduced%20Order%20Finite%20Element%20Model%20with%20State%20Observer%20-%20Katzschmann%20Thieffry%20et%20al.pdf BibTex
titre
FEM-based confidence assessment of non-rigid registration
auteur
Paul Baksic, Hadrien Courtecuisse, Matthieu Chabanas, Bernard Bayle
article
Surgetica 2019, 2019, Rennes, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02238974/file/Surgetica2019.pdf BibTex

Book sections

titre
Computational Biomechanics of the Brain in the Operating Theatre
auteur
Hadrien Courtecuisse, Fanny Morin, Ingerid Reinertsen, Yohan Payan, Matthieu Chabanas
article
Biomechanics of the Brain, Springer, pp.321-344, 2019, 978-3-030-04995-9. ⟨10.1007/978-3-030-04996-6_13⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02385041/file/chapter_operating_theater_R2.pdf BibTex

Poster communications

titre
Robust Fabrication of a Soft Mechanosensor based on Pneumatic Measurements
auteur
Stefan Escaida Navarro, Olivier Goury, Gang Zheng, Thor Morales Bieze, Christian Duriez
article
New Advances in Tactile Sensation, Perception, and Learning in Robotics: Emerging Materials and Technologies for Manipulation (RoboTac 2019), Nov 2019, Macao, China
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https://hal.inria.fr/hal-02876688/file/Paper_RoboTac2019.pdf BibTex

Theses

titre
Biomechanical graph matching for hepatic intra-operative image registration
auteur
Jaime Garcia Guevara
article
Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Universite de Lorraine, 2019. English. ⟨NNT : 2019LORR0238⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-02408339/file/thesisGarciaGuevara.pdf BibTex
titre
Model-Based Dynamic Control of Soft Robots
auteur
Maxime Thieffry
article
Automatic. Université Polytechnique des Hauts-de-France, 2019. English
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-02363267/file/these_MT.pdf BibTex
titre
Vision-based calibration, position control and force sensing for soft robots
auteur
Zhongkai Zhang
article
Robotics [cs.RO]. Université de Lille, 2019. English
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01990867/file/Zhongkai%20Zhang-PhD%20thesis.pdf BibTex
titre
Optimization-based inverse model of soft robots, with contact handling
auteur
Eulalie Coevoet
article
Automatic. Université de Lille 1, Sciences et Technologies, 2019. English
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-02446416/file/TheseCoevoet%20%281%29.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Simulation of soft tissue deformation in real-time using domain decomposition
auteur
Ryadh Haferssas, Pierre-Henri Tournier, Frédéric Nataf, Stéphane Cotin
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02400982/file/paper.pdf BibTex
titre
Constrained Stochastic State Estimation for 3D Shape Reconstruction of Catheters and Guidewires in Fluoroscopic Images
auteur
Raffaella Trivisonne, Erwan Kerrien, Stéphane Cotin
article
2019
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02072386/file/PreprintTKC.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Corotational cut finite element method for real-time surgical simulation: Application to needle insertion simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Stéphane Bordas
article
Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, Elsevier, 2018, ⟨10.1016/j.cma.2018.10.023⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01921631/file/CutFEM_needle_Bui_et_al.pdf BibTex
titre
Calipso: Physics-based Image and Video Editing through CAD Model Proxies
auteur
Nazim Haouchine, Frédérick Roy, Hadrien Courtecuisse, Matthias Nießner, Stéphane Cotin
article
The Visual Computer, Springer Verlag, 2018, 36, pp.211-226. ⟨10.1007/s00371-018-1600-0⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01890684/file/calipso_haouchine.pdf BibTex
titre
Nonprehensile Manipulation of Deformable Objects: Achievements and Perspectives from the RobDyMan Project
auteur
Fabio Ruggiero, Antoine Petit, Diana Serra, Aykut Satici, Jonathan Cacace, Alejandro Donaire, Fanny Ficuciello, Luca Buonocore, Giuseppe Fontanelli, Vincenzo Lippiello, Luigi Villani, Bruno Siciliano
article
IEEE Robotics and Automation Magazine, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 25 (3), pp.83 - 92. ⟨10.1109/mra.2017.2781306⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01889779/file/paper_ram_1617.pdf BibTex
titre
FiloGen: A Model-Based Generator of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Single Motile Cells with Growing and Branching Filopodia
auteur
Dmitry Sorokin, Igor Peterlik, Vladimír Ulman, David Svoboda, Tereza Nečasová, Katsiarina Morgaenko, Lívia Eisellová, Lenka Tesařová, Martin Maška
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, pp.1-12. ⟨10.1109/TMI.2018.2845884⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01821338/file/tmi_filogen.pdf BibTex
titre
Biomechanics-based graph matching for augmented CT-CBCT
auteur
Jaime Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stephane Cotin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2018, 13 (6), pp.805-813. ⟨10.1007/s11548-018-1755-1⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01761521/file/template.pdf BibTex
titre
Fast Elastic Registration of Soft Tissues under Large Deformations
auteur
Igor Peterlik, Hadrien Courtecuisse, Robert Rohling, Purang Abolmaesumi, Christopher Nguan, Stéphane Cotin, Septimiu E Salcudean
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2018, 45, pp.24-40. ⟨10.1016/j.media.2017.12.006⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01613757/file/supineFlankPaper.pdf BibTex
titre
Model-based Feature Augmentation for Cardiac Ablation Target Learning from Images
auteur
Rocio Cabrera Lozoya, Benjamin Berte, Hubert Cochet, Pierre Jaïs, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, pp.1. ⟨10.1109/TBME.2018.2818300⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01744142/file/TBME2818300.pdf BibTex
Screen%20Shot%202018-03-01%20at%201.07.58%20AM.png
titre
Vision-based Force Feedback Estimation for Robot-assisted Surgery using Instrument-constrained Biomechanical 3D Maps
auteur
Nazim Haouchine, Winnie Kuang, Stéphane Cotin, Michael Yip
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2018, ⟨10.1109/LRA.2018.2810948⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01720259/file/17-0884_06_MS.pdf BibTex
titre
Vision-Based Sensing of External Forces Acting on Soft Robots Using Finite Element Method
auteur
Zhongkai Zhang, Jérémie Dequidt, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2018, 3 (3), pp.1529 - 1536. ⟨10.1109/LRA.2018.2800781⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01720645/file/Vision-Based%20Sensing%20of%20External%20Forces%20Acting%20on_Soft%20Robots%20Using%20Finite%20Element%20Method.pdf BibTex
titre
A Framework for the Generation of Realistic Synthetic Cardiac Ultrasound and Magnetic Resonance Imaging Sequences from the same Virtual Patients
auteur
Yitian Zhou, Sophie Giffard-Roisin, Mathieu de Craene, Sorina Camarasu-Pop, Jan d'Hooge, Martino Alessandrini, Denis Friboulet, Maxime Sermesant, Olivier Bernard
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 37 (3), pp.741-754. ⟨10.1109/TMI.2017.2708159⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533366/file/TMI2708159.pdf BibTex
titre
Transfer Learning from Simulations on a Reference Anatomy for ECGI in Personalised Cardiac Resynchronization Therapy
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Hervé Delingette, Thomas Jackson, Jessica Webb, Lauren Fovargue, Jack Lee, Christopher Rinaldi, Reza Razavi, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, In press, 20, ⟨10.1109/TBME.2018.2839713⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01796483/file/FINAL_VERSION_CORR.pdf BibTex
titre
Finite element method-based kinematics and closed-loop control of soft, continuum manipulators
auteur
Thor Morales Bieze, Frederick Largilliere, Alexandre Kruszewski, Zhongkai Zhang, Rochdi Merzouki, Christian Duriez
article
Soft Robotics, Mary Ann Liebert, Inc., 2018, 5 (3), pp.348-364. ⟨10.1089/soro.2017.0079⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01745625/file/Finite%20element%20method-based%20kinematics%20and%20closed-loop%20control%20of%20soft%2Ccontinuum%20manipulators.pdf BibTex
titre
Fast, generic and reliable control and simulation of soft robots using model order reduction
auteur
Olivier Goury, Christian Duriez
article
IEEE Transactions on Robotics, IEEE, 2018, 34 (6), pp.1565 - 1576. ⟨10.1109/TRO.2018.2861900⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01834483/file/reducedSoftRobotIEEETorPrePrint.pdf BibTex
titre
Model-based generation of large databases of cardiac images: synthesis of pathological cine MR sequences from real healthy cases
auteur
Nicolas Duchateau, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Nicholas Ayache
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 37, pp.755-766. ⟨10.1109/TMI.2017.2714343⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533788/file/jDuchateau_TMI_2017_FINAL.pdf BibTex

Conference papers

titre
Environment-aware non-rigid registration in surgery using physics-based simulation
auteur
Antoine Petit, Stéphane Cotin
article
ACCV 2018 - 14th Asian Conference on Computer Vision, Dec 2018, Perth, Australia
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01930366/file/accv2018submission_apetit_vf1.pdf BibTex
titre
FEM-based Deformation Control for Dexterous Manipulation of 3D Soft Objects
auteur
Fanny Ficuciello, Alessandro Migliozzi, Eulalie Coevoet, Antoine Petit, Christian Duriez
article
IROS 2018 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2018, Madrid, Spain
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https://hal.inria.fr/hal-01889783/file/manipulation_of_def_objects_1.pdf BibTex
titre
Capturing Deformations of Interacting Non-rigid Objects Using RGB-D Data
auteur
Antoine Petit, Stéphane Cotin, Vincenzo Lippiello, Bruno Siciliano
article
IROS 2018 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Oct 2018, Madrid, Spain
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https://hal.inria.fr/hal-01889771/file/iros2018_apetit_2.pdf BibTex
titre
Stochastic Correction of Boundary Conditions during Liver Surgery
auteur
Sergei Nikolaev, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
CVCS 2018 - 9th Colour and Visual Computing Symposium 2018, NTNU: Norwegian University of Science and Technology, Sep 2018, Gjovik, Norway. pp.1 - 4, ⟨10.1109/CVCS.2018.8496720⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01823810/file/Online_the_9th_Colour_and_Visual_Computing_Simposium_2018.pdf BibTex
titre
Real-time Patient Specific Surgical Simulation using Corotational Cut Finite Element Method: Application to Needle Insertion Simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Franz Chouly, Alexei Lozinski, Stéphane Bordas
article
13th World Congress in Computational Mechanics, Jul 2018, New York, United States
Accès au bibtex
BibTex
titre
Biomechanics-based graph matching for augmented CT-CBCT
auteur
Jaime Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stephane Cotin
article
IPCAI 2018 - 9th International Conference on Information Processing in Computer-Assisted Interventions, Jun 2018, Berlin, Germany
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https://hal.inria.fr/hal-01761538/file/template.pdf BibTex
titre
Reduced Order Control of Soft Robots with Guaranteed Stability
auteur
Maxime Thieffry, Alexandre Kruszewski, Thierry-Marie Guerra, Christian Duriez
article
European Control Conference ECC18, Jun 2018, Limassol, Cyprus
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01747433/file/ECC18_0293_FI.pdf BibTex
titre
Marker-based Registration for Large Deformations -Application to Open Liver Surgery
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Nicolas Golse, Eric Vibert, Michel de Mathelin, Stéphane Cotin, Hadrien Courtecuisse
article
ICRA 2018 - International Conference on Robotics and Automation, May 2018, Brisbane, Australia
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https://hal.inria.fr/hal-01792837/file/Icra.pdf BibTex

Poster communications

titre
How To Design Your Polymer Artificial Muscle Actuator/ Sensor?
auteur
Marwa Eldiwiny, Eric Cattan, Christian Duriez
article
ICRA 2018 - IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2018, Brisbane, Australia. pp.1-2
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01798709/file/ElDiwiny.pdf BibTex

Theses

titre
Couplage de La rObotique et de la simulatioN médicalE pour des proCédures automaTisées (CONECT)
auteur
Yinoussa Adagolodjo
article
Optimisation et contrôle [math.OC]. Université de Strasbourg, 2018. Français
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https://hal.inria.fr/tel-01939268/file/Adagolodjo%20%281%29.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Controlling the error on target motion through real-time mesh adaptation: applications to Deep Brain Stimulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Hadrien Courtecuisse, Michel Audette, Stéphane Cotin, Stéphane Bordas
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, John Wiley and Sons, 2017, pp.1-26. ⟨10.1002/cnm.2958⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01672962/file/ijnmbe_2017_adaptivity_brain_Bui_et_al.pdf BibTex
titre
Non-Invasive Personalisation of a Cardiac Electrophysiology Model from Body Surface Potential Mapping
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Thomas Jackson, Lauren Fovargue, Jack Lee, Hervé Delingette, Reza Razavi, Nicholas Ayache, Maxime Sermesant
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 64 (9), pp.2206 - 2218. ⟨10.1109/TBME.2016.2629849⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01397393/file/TBME_acceptedversion.pdf BibTex
titre
Non-rigid Contour-Based Registration of Cell Nuclei in 2D Live Cell Microscopy Images Using a Dynamic Elasticity Model
auteur
Dmitry Sorokin, Igor Peterlik, Marco Tektonidis, Karl Rohr, Pavel Matula
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, 37 (1), pp.173-184. ⟨10.1109/TMI.2017.2734169⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01613732/file/Sorokin_Registration.2016.pdf BibTex
titre
Real-time Error Control for Surgical Simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Hadrien Courtecuisse, Stéphane Cotin, Stéphane Bordas
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, pp.12
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01514621/file/TBME_2017_error_controlled_refinement_final.pdf BibTex
TrunkSimuRealShort.png
titre
Optimization-Based Inverse Model of Soft Robots With Contact Handling
auteur
Eulalie Coevoet, Adrien Escande, Christian Duriez
article
IEEE Robotics and Automation Letters, IEEE 2017, ⟨10.1109/LRA.2017.2669367⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01500912/file/RAL2017.pdf BibTex
titre
Multiorgan Motion Tracking in Dynamic Magnetic Resonance Imaging for Evaluation of Pelvic System Mobility and Shear Strain
auteur
Zhifan Jiang, Jean-François Witz, Pauline Lecomte-Grosbras, Jeremie Dequidt, Stéphane Cotin, Christelle Rubod, Christian Duriez, Mathias Brieu
article
Strain, Wiley-Blackwell, 2017, 53 (2), ⟨10.1111/str.12224⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01496177/file/Multiorgan%20Motion%20Tracking%20in%20Dynamic%20MRI%20%282017%29.pdf BibTex
titre
Blood vessel modeling for interactive simulation of interventional neuroradiology procedures
auteur
Erwan Kerrien, Ahmed Yureidini, Jeremie Dequidt, Christian Duriez, René Anxionnat, Stéphane Cotin
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 35, pp.685 - 698. ⟨10.1016/j.media.2016.10.003⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01390923/file/medima_20161008.pdf BibTex
titre
Brain-shift compensation using intraoperative ultrasound and constraint-based biomechanical simulation
auteur
Fanny Morin, Hadrien Courtecuisse, Ingerid Reinertsen, Florian Le Lann, Olivier Palombi, Yohan Payan, Matthieu Chabanas
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 40, pp.133 - 153. ⟨10.1016/j.media.2017.06.003⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01560157/file/MEDIMA_1264.pdf BibTex
titre
Intraoperative Biomechanical Registration of the Liver: Does the Heterogeneity of the Liver Matter?
auteur
Rosalie Plantefève, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
Innovation and Research in BioMedical engineering, Elsevier Masson, In press
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01625573/file/article_IRBM.pdf BibTex

Conference papers

AugmentedIntraOpA2.jpg
titre
Automatic biomechanical graph matching CT-CBCT fusion
auteur
Jaime Garcia Guevara, Igor Peterlik, Marie-Odile Berger, Stéphane Cotin
article
Surgetica 2017, Nov 2017, Strasbourg, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01587952/file/GarciaGuevaraSurgetica2017.pdf BibTex
Screen%20Shot%202017-06-19%20at%203.30.12%20PM.png
titre
DejaVu: Intra-operative Simulation for Surgical Gesture Rehearsal
auteur
Nazim Haouchine, Danail Stoyanov, Frederick Roy, Stéphane Cotin
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions Conference MICCAI 2017, Oct 2017, Quebec City, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01542395/file/dejavu-249.pdf BibTex
titre
Visual Servoing Control of Soft Robots based on Finite Element Model
auteur
Zhongkai Zhang, Thor Morales Bieze, Jérémie Dequidt, Alexandre Kruszewski, Christian Duriez
article
IROS 2017 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Sep 2017, Vancouver, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01618330/file/IROS17_2033_FI-1.pdf BibTex
titre
Silhouette-based Pose Estimation for Deformable Organs Application to Surgical Augmented Reality
auteur
Yinoussa Adagolodjo, Raffaella Trivisonne, Nazim Haouchine, Stéphane Cotin, Hadrien Courtecuisse
article
IROS 2017 - IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems, Sep 2017, Vancouver, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01578815/file/Iros2017%281%29.pdf BibTex
Overview_1stLine.png
titre
An Immersed Boundary Method for Detail-Preserving Soft Tissue Simulation from Medical Images
auteur
Christoph Paulus, Roland Maier, Daniel Peterseim, Stéphane Cotin
article
Computational Biomechanics for Medicine, Sep 2017, Quebec, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01578447/file/2017_MICCAI_workshop.pdf BibTex
titre
Robust Automatic Graph-based Skeletonization of Hepatic Vascular Trees
auteur
Rosalie Plantefève, Samuel Kadoury, An Tang, Igor Peterlik
article
CIIV STENT 2017, Sep 2017, Québec, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-01576771/file/cvii-stent-6.pdf BibTex
titre
Longitudinal Analysis using Personalised 3D Cardiac Models with Population-Based Priors: Application to Paediatric Cardiomyopathies
auteur
Roch Molléro, Hervé Delingette, Manasi Datar, Tobias Heimann, Jakob Hauser, Dilveer Panesar, Alexander Jones, Andrew Taylor, Marcus Kelm, Titus Kuehne, Marcello Chinali, Gabriele Rinelli, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Maxime Sermesant
article
Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2017, Québec City, Canada. pp.350-358, ⟨10.1007/978-3-319-66185-8_40⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01569735/file/paper729.pdf BibTex
titre
Image-driven Stochastic Identification of Boundary Conditions for Predictive Simulation
auteur
Igor Peterlik, Nazim Haouchine, Lukáš Ručka, Stéphane Cotin
article
20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Québec, Canada
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https://hal.inria.fr/hal-01570811/file/miccai2017BCDA.pdf BibTex
titre
Real-time Error Control for Surgical Simulation
auteur
Huu Phuoc Bui, Satyendra Tomar, Hadrien Courtecuisse, Stéphane Cotin, Stéphane Bordas
article
BIOMECHANICS AND COMPUTER ASSISTED SURGERY MEETS MEDICAL REALITY, Aug 2017, Lille, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01571194/file/euromech595_2017_Bui_et_al.pdf BibTex
titre
Using Physical Modeling and RGB-D Registration for Contact Force Sensing on Deformable Objects
auteur
Antoine Petit, Fanny Ficuciello, Giuseppe Andrea Fontanelli, Luigi Villani, Bruno Siciliano
article
ICINCO 2017 - 14th International Conference on Informatics in Control, Automation and Robotics, IEEE, Jul 2017, Madrid, Spain. pp.24-33, ⟨10.5220/0006415900240033⟩
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titre
Template-based Monocular 3D Recovery of Elastic Shapes using Lagrangian Multipliers
auteur
Nazim Haouchine, Stéphane Cotin
article
Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), Jul 2017, Honolulu, Hawai, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01524609/file/CVPR%202017%20-%20Template-based%20Monocular%203D%20Recovery%20of%20Elastic%20Shapes%20using%20Lagrangian%20Multipliers.pdf BibTex
titre
Augmented 3D Catheter Navigation using Constrained Shape from Template
auteur
Raffaella Trivisonne, Erwan Kerrien, Stéphane Cotin
article
Hamlyn Symposium, Jun 2017, London, United Kingdom
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https://hal.inria.fr/hal-01545693/file/HSMR17_paper_58.pdf BibTex
titre
Sparse Bayesian Non-linear Regression for Multiple Onsets Estimation in Non-invasive Cardiac Electrophysiology
auteur
Sophie Giffard-Roisin, Hervé Delingette, Thomas Jackson, Lauren Fovargue, Jack Lee, Aldo Rinaldi, Nicholas Ayache, Reza Razavi, Maxime Sermesant
article
Functional imaging and modelling of the heart 2017, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.230-238, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_22⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01498602/file/FIMH_2017_cameraready.pdf BibTex
titre
A Rule-Based Method to Model Myocardial Fiber Orientation for Simulating Ventricular Outflow Tract Arrhythmias
auteur
Rubén Doste, David Soto-Iglesias, Gabriel Bernardino, Rafael Sebastian, Sophie Giffard-Roisin, Rocío Cabrera-Lozoya, Maxime Sermesant, Antonio Berruezo, Damián Sánchez-Quintana, Oscar Camara
article
Functional imaging and modelling of the heart 2017, Jun 2017, Toronto, Canada. ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_33⟩
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titre
Smoothed Particle Hydrodynamics for Electrophysiological Modeling: An Alternative to Finite Element Methods
auteur
Eric Lluch, Rubén Doste, Sophie Giffard-Roisin, Alexandre This, Maxime Sermesant, Oscar Camara, Mathieu de Craene, Hernán Morales
article
FIMH 2017 - 9th International Conference on Functional Imaging and Modelling of the Heart, Jun 2017, Toronto, Canada. pp.333-343, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_32⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01533371/file/paperFIMH.pdf BibTex
titre
Haptic Rendering of FEM-based Tearing Simulation using Clusterized Collision Detection
auteur
Benoît Le Gouis, François Lehericey, Maud Marchal, Bruno Arnaldi, Valérie Gouranton, Anatole Lécuyer
article
WHC 2017 - IEEE World Haptics Conference, Jun 2017, Munich, Germany. pp.406-411
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https://hal.inria.fr/hal-01675134/file/WHC_2017.pdf BibTex
titre
Real-time simulation of hydraulic components for interactive control of soft robots
auteur
Alejandro Rodríguez, Eulalie Coevoet, Christian Duriez
article
The 2017 IEEE International Conference on Robotics and Automation (ICRA), May 2017, Singapour, Singapore
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https://hal.inria.fr/hal-01535810/file/Hydraulic_components.pdf BibTex
titre
Elasticity-based Clustering for Haptic Interaction with Heterogeneous Deformable Objects
auteur
Benoît Le Gouis, Maud Marchal, Anatole Lécuyer, Bruno Arnaldi
article
VRIPHYS2017 - 13th Eurographics Workshop on Virtual Reality Interaction and Physical Simulation, Apr 2017, Lyon, France. pp.75-83
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https://hal.inria.fr/hal-01675148/file/VRIPHYS_2017.pdf BibTex
titre
Fast reconstruction of image deformation field using radial basis function
auteur
Lukáš Ručka, Igor Peterlík
article
ISBI2017 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia
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https://hal.inria.fr/hal-01445483/file/isbi-rbf.pdf BibTex
titre
Model-Based Generation of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Motile Cells with Growing Filopodia
auteur
Dmitry Sorokin, Igor Peterlik, Vladimír Ulman, David Svoboda, Martin Maška
article
International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia
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https://hal.inria.fr/hal-01445488/file/2017.ISBI.filapodiaSimu.pdf BibTex
titre
Face-based Smoothed Finite Element Method for Real-time Simulation of soft tissue
auteur
Andrea Mendizabal, Rémi Duparc, Huu Phuoc Bui, Christoph Paulus, Igor Peterlik, Stéphane Cotin
article
SPIE Medical Imaging, Feb 2017, Orlando, United States
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https://hal.inria.fr/hal-01444595/file/SPIE2017.pdf BibTex

Book sections

titre
Non linear Biomechanical Model of the Liver
auteur
Stéphanie Marchesseau, Simon Chatelin, Hervé Delingette
article
Yohan Payan; Jacques Ohayon. Biomechanics of Living Organs, Elsevier, pp.602, 2017, 9780128040096
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https://hal.inria.fr/hal-01536406/file/LiverHyperElasticity.pdf BibTex
titre
Biomechanical modeling of brain soft tissues for medical applications
auteur
Fanny Morin, Matthieu Chabanas, Hadrien Courtecuisse, Yohan Payan
article
Payan, Yohan; Ohayon, Jacques. Biomechanics of Living Organs, Academic Press, pp.127-146, 2017, ⟨10.1016/B978-0-12-804009-6.00006-7⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01560109/file/chapter6_Biomechanical_modeling_of_brain_soft_tissues.pdf BibTex

Poster communications

titre
Deformed Reality: Proof of concept and preliminary results
auteur
Nazim Haouchine, Antoine Petit, Frederick Roy, Stéphane Cotin
article
ISMAR 2017 - 16th IEEE International Symposium on Mixed and Augmented Reality, Oct 2017, Nantes, France. 2017
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https://hal.inria.fr/hal-01636772/file/poster-deformed-reality.pdf BibTex

Theses

titre
Robust personalisation of 3D electromechanical cardiac models. Application to heterogeneous and longitudinal clinical databases
auteur
Roch Molléro
article
Signal and Image processing. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2017. English. ⟨NNT : 2017AZUR4106⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01737200/file/2017AZUR4106.pdf BibTex
titre
Topological Changes in Simulations of Deformable Objects
auteur
Christoph Paulus
article
Modeling and Simulation. University of Strasbourg, 2017. English
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https://hal.inria.fr/tel-01516170/file/PhD%20Thesis%20Christoph%20Joachim%20PAULUS%202017.pdf BibTex