Publications HAL du labo/EPI visages;empenn

2023

Journal articles

auteur
Jean-Marie Batail, Isabelle Corouge, Benoit Combès, Camille Conan, Muriel Guillery-Sollier, Marc Vérin, Paul Sauleau, Florence Le Jeune, Jean-Yves Gauvrit, Jen-Yves Gauvrit, Gabriel Robert, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré, Dominique Drapier
titre
Apathy in depression: An arterial spin labeling perfusion MRI study
article
Journal of Psychiatric Research, 2023, 157, pp.7-16. ⟨10.1016/j.jpsychires.2022.11.015⟩
identifiant
inserm-03866929
DOI
DOI : 10.1016/j.jpsychires.2022.11.015
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https://inserm.hal.science/inserm-03866929/file/1-s2.0-S0022395622006409-main.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Julien Cohen-Adad, Benoît Combès, Élise Bannier, Slimane Tounekti, Anne Kerbrat, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
titre
Effectiveness of regional diffusion MRI measures in distinguishing multiple sclerosis abnormalities within the cervical spinal cord
article
Brain and Behavior, 2023, 13 (11), pp.e3159. ⟨10.1002/brb3.3159⟩
identifiant
inserm-04313206
DOI
DOI : 10.1002/brb3.3159
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https://inserm.hal.science/inserm-04313206/file/Brain%20and%20Behavior%20-%202023%20-%20Snoussi%20-%20Effectiveness%20of%20regional%20diffusion%20MRI%20measures%20in%20distinguishing%20multiple%20sclerosis.pdf BibTex

2022

Journal articles

auteur
Pierre-Yves Jonin, Quentin Duché, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Serge Belliard, Christian Barillot, Emmanuel Barbeau
titre
Building memories on prior knowledge: behavioral and fMRI evidence of impairment in early Alzheimer's disease
article
Neurobiology of Aging, 2022, 110, pp.1-12. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2021.10.013⟩
identifiant
inserm-03473939
DOI
DOI : 10.1016/j.neurobiolaging.2021.10.013
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https://inserm.hal.science/inserm-03473939/file/1-s2.0-S0197458021003250-main.pdf BibTex
auteur
Antoine Legouhy, François Rousseau, Christian Barillot, Olivier Commowick
titre
An iterative centroid approach for diffeomorphic online atlasing
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2022, 41 (9), pp.2521-2531. ⟨10.1109/tmi.2022.3166593⟩
identifiant
hal-03672588
DOI
DOI : 10.1109/tmi.2022.3166593
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https://inria.hal.science/hal-03672588/file/TMI2020_revised_2.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Haykel Snoussi, Benoit Combès, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Julien Cohen-Adad, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
titre
Reproducibility and evolution of diffusion MRI measurements within the cervical spinal cord in multiple sclerosis
article
ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-5
identifiant
inserm-03639907
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https://inserm.hal.science/inserm-03639907/file/Article_ISBI_2022_Feb7_2022.pdf BibTex

2021

Journal articles

auteur
Roxana Ameli, Charles R.G. Guttmann, Juan Carlos Prieto, Fabien Rollot, Miklos Palotai, Sandra Vukusic, Romain Marignier, François Cotton, René Anxionnat, Jean-Paul Armspach, Bertrand Audoin, Christian Barillot, Isabelle Berry, Fabrice Bonneville, Claire Boutet, Giovanni Castelnovo, Frédéric Cervenanski, Mikael Cohen, Olivier Commowick, Jerome de Seze, Vincent Dousset, Francoise Durand-Dubief, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferré, Damien Galanaud, Tristan Glattard, Sylvie Grand, Justine Guillaumont, Rémy Guillevin, Salem Hannoun, Fabrice Heitz, Alexandre Krainik, Stéphane Kremer, Pierre Labauge, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Dominique Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Bruno Stankoff, Ayman Tourbah, Thomas Tourdias, Bruno Brochet, Michel Clanet, Nathalie Dufay, David Laplaud, Marie-Claire Maze, Thibault Moreau, Cédric Trolliet, Bernard Frangoulis, Javier Olaiz, Jean Pelletier, Bertrand Bourre, David Brassat, Philippe Cabre, Jean-Philippe Camdessanche, William Camu, Olivier Casez, Pierre Clavelou, Nicolas Collongues, Alain Creange, Gilles Defer, Marc Debouverie, Olivier Gout, Christine Lebrun-Frenay, Catherine Lubetzki, Caroline Papeix, Patrick Vermersch, Hélène Zephir
titre
Aquaporin 4 distribution in the brain and its relevance for the radiological appearance of neuromyelitis optica spectrum disease
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2021, 48 (3), pp.170-175. ⟨10.1016/j.neurad.2019.03.015⟩
identifiant
hal-03538467
DOI
DOI : 10.1016/j.neurad.2019.03.015
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BibTex
auteur
Olivier Commowick, Michaël Kain, Romain Casey, Roxana Ameli, Jean-Christophe Ferré, Anne Kerbrat, Thomas Tourdias, Frédéric Cervenansky, Sorina Camarasu-Pop, Tristan Glatard, Sandra Vukusic, Gilles Edan, Christian Barillot, Michel Dojat, Francois Cotton
titre
Multiple sclerosis lesions segmentation from multiple experts: The MICCAI 2016 challenge dataset
article
NeuroImage, 2021, 244, pp.1-8. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118589⟩
identifiant
hal-03358961
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2021.118589
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https://inria.hal.science/hal-03358961/file/1-s2.0-S1053811921008624-main.pdf BibTex
auteur
Marine Dubois, Antoine Legouhy, Isabelle Corouge, Olivier Commowick, Baptiste Morel, Patrick Pladys, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Maïa Proisy
titre
Multiparametric Analysis of Cerebral Development in Preterm Infants Using Magnetic Resonance Imaging
article
Frontiers in Neuroscience, 2021, 15, pp.1-19. ⟨10.3389/fnins.2021.658002⟩
identifiant
hal-03202821
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2021.658002
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https://inria.hal.science/hal-03202821/file/fnins-15-658002.pdf BibTex
auteur
Renaud Hédouin, Christian Barillot, Olivier Commowick
titre
Interpolation and averaging of diffusion MRI multi-compartment models
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2021, 40 (3), pp.916-927. ⟨10.1109/tmi.2020.3042765⟩
identifiant
hal-03110559
DOI
DOI : 10.1109/tmi.2020.3042765
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https://hal.science/hal-03110559/file/09284575%281%29.pdf BibTex
auteur
Salomé Le Franc, Isabelle Bonan, Mathis Fleury, Simon Butet, Christian Barillot, Anatole Lécuyer, Mélanie Cogné
titre
Visual feedback improves movement illusions induced by tendon vibration after chronic stroke
article
Journal of NeuroEngineering and Rehabilitation, 2021, 18 (1), pp.1-9. ⟨10.1186/s12984-021-00948-7⟩
identifiant
hal-03517401
DOI
DOI : 10.1186/s12984-021-00948-7
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https://inria.hal.science/hal-03517401/file/s12984-021-00948-7 BibTex
auteur
Salomé Le Franc, Mathis Fleury, Camille Jeunet, Simon Butet, Christian Barillot, Isabelle Bonan, Mé Lanie Cogné, Anatole Lé Cuyer
titre
Influence of the visuo-proprioceptive illusion of movement and motor imagery of the wrist on EEG cortical excitability among healthy participants
article
PLoS ONE, 2021, 16 (9), pp.1-19. ⟨10.1371/journal.pone.0256723⟩
identifiant
hal-03417149
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0256723
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https://hal.science/hal-03417149/file/journal.pone.0256723.pdf BibTex
auteur
Giulia Lioi, Adolfo Veliz, Julie Coloigner, Quentin Duché, Simon Butet, Mathis Fleury, Emilie Leveque-Le Bars, Elise Bannier, Anatole Lécuyer, Christian Barillot, Isabelle Bonan
titre
The impact of Neurofeedback on effective connectivity networks in chronic stroke patients: an exploratory study
article
Journal of Neural Engineering, 2021, 18 (5), pp.056052. ⟨10.1088/1741-2552/ac291e⟩
identifiant
hal-03354296
DOI
DOI : 10.1088/1741-2552/ac291e
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https://imt-atlantique.hal.science/hal-03354296/file/paper_DCM_stroke_review.pdf BibTex

2020

Journal articles

auteur
Antoine Ackaouy, Nicolas Courty, Emmanuel Vallée, Olivier Commowick, Christian Barillot, Francesca Galassi
titre
Unsupervised Domain Adaptation With Optimal Transport in Multi-Site Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions From MRI Data
article
Frontiers in Computational Neuroscience, 2020, 14, pp.1-13. ⟨10.3389/fncom.2020.00019⟩
identifiant
hal-02317028
DOI
DOI : 10.3389/fncom.2020.00019
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https://hal.science/hal-02317028/file/fncom-14-00019.pdf BibTex
auteur
Jean-Marie Batail, Julie Coloigner, Marine Soulas, Gabriel Robert, Christian Barillot, Dominique Drapier
titre
Structural abnormalities associated with poor outcome of a major depressive episode: the role of thalamus.
article
Psychiatry Research: Neuroimaging, 2020, 305, pp.1-10. ⟨10.1016/j.pscychresns.2020.111158⟩
identifiant
hal-02920551
DOI
DOI : 10.1016/j.pscychresns.2020.111158
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https://hal.science/hal-02920551/file/JMBatail_Psychresni_accepted%20version.pdf BibTex
auteur
Anne-Claire Binter, Elise Bannier, Dave Saint-Amour, Grégory Simon, Christian Barillot, Christine Monfort, Sylvaine Cordier, Fabienne Pelé, Cécile Chevrier
titre
Exposure of pregnant women to organophosphate insecticides and child motor inhibition at the age of 10–12 years evaluated by fMRI
article
Environmental Research, 2020, 188, pp.109859. ⟨10.1016/j.envres.2020.109859⟩
identifiant
inserm-02932111
DOI
DOI : 10.1016/j.envres.2020.109859
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https://inserm.hal.science/inserm-02932111/file/Binter%20et%20al-2020-Exposure%20of%20pregnant%20women%20to%20organophosphate%20insecticides%20and%20child%20motor.pdf BibTex
auteur
Claire Cury, Pierre Maurel, Rémi Gribonval, Christian Barillot
titre
A sparse EEG-informed fMRI model for hybrid EEG-fMRI neurofeedback prediction
article
Frontiers in Neuroscience, 2020, 13, ⟨10.3389/fnins.2019.01451⟩
identifiant
inserm-02090676
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2019.01451
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https://inserm.hal.science/inserm-02090676/file/NF_EEG_fMRI_prediction_resub4BioRxiv.pdf BibTex
auteur
Mathis Fleury, Giulia Lioi, Christian Barillot, Anatole Lécuyer
titre
A Survey on the Use of Haptic Feedback for Brain-Computer Interfaces and Neurofeedback
article
Frontiers in Neuroscience, 2020, 1, ⟨10.3389/fnins.2020.00528⟩
identifiant
hal-02459828
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2020.00528
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https://hal.science/hal-02459828/file/fnins-14-00528.pdf BibTex
auteur
Michael Kain, Marjolaine Bodin, Simon Loury, Yao Chi, Julien Louis, Mathieu Simon, Julien Lamy, Christian Barillot, Michel Dojat
titre
Small Animal Shanoir (SAS) A Cloud-Based Solution for Managing Preclinical MR Brain Imaging Studies
article
Frontiers in Neuroinformatics, 2020, 14, pp.1-11. ⟨10.3389/fninf.2020.00020⟩
identifiant
hal-02888669
DOI
DOI : 10.3389/fninf.2020.00020
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https://inria.hal.science/hal-02888669/file/pdf BibTex
auteur
Stephane Kremer, Salem Hannoun, Fabrice Bonneville, Francoise Durand-Dubief, Thomas Tourdias, Christian Barillot, Charles Guttmann, Sandra Vukusic, Vincent Dousset, Francois Cotton, R. Ameli, René Anxionnat, Bertrand Audoin, Arnaud Attye, Elise Bannier, Douraied Ben Salem, Marie-Paule Boncoeur-Martel, Gildas Bonhomme, Claire Boutet, Jean-Christophe Brisset, Frédéric Cervenansky, Béatrice Claise, Olivier Commowick, Jean-Marc Constans, Pascal Dardel, Hubert Desal, Jean-Christophe Ferré, Alina Gaultier, E. Gerardin, T. Glattard, Sylvie Grand, T. Grenier, Rémy Guillevin, A. Krainik, S. Lion, Nicolas Menjot de Champfleur, Lydiane Mondot, Olivier Outteryck, Nadya Pyatigorskaya, Jean-Pierre Pruvo, Sylvain Rabaste, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Jean-Claude Sadik, Dominic Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Jean-Yves Tanguy, Ayman Tourbah, Bruno Brochet, Romain Casey, Jerome de Seze, Pascal Douek, F. Guillemin, David A. Laplaud, Christine Lebrun-Frenay, Lucilla Mansuy, Thibault Moreau, Javier Olaiz, Jean Pelletier, Claire Rigaud-Bully, Bruno Stankoff, Marc Debouverie, Gilles Edan, Jonathan Ciron, Catherine Lubetzki, Patrick Vermersch, Pierre Labauge, Gilles Defer, Eric Berger, Pierre Clavelou, O. Gout, Eric Thouvenot, Olivier Heinzlef, Abdullatif Al-Khedr, Bertrand Bourre, Olivier Casez, Philippe Cabre, Alexis Montcuquet, Alain Créange, Jean-Philippe Camdessanché, Serge Bakchine, A. Maurousset, Ivania Patry, Thomas de Broucker, Corinne Pottier, Jean-Philippe Neau, Céline Labeyrie, Chantal Nifle
titre
New OFSEP recommendations for MRI assessment of multiple sclerosis patients: Special consideration for gadolinium deposition and frequent acquisitions
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2020, 47 (4), pp.250-258. ⟨10.1016/j.neurad.2020.01.083⟩
identifiant
hal-02570313
DOI
DOI : 10.1016/j.neurad.2020.01.083
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https://hal.science/hal-02570313/file/S015098612030095X.pdf BibTex
auteur
Salomé Le Franc, Mathis Fleury, Mélanie Cogne, Simon Butet, Christian Barillot, Anatole Lécuyer, Isabelle Bonan
titre
Influence of virtual reality visual feedback on the illusion of movement induced by tendon vibration of wrist in healthy participants
article
PLoS ONE, 2020, 15 (11), pp.1-16. ⟨10.1371/journal.pone.0242416⟩
identifiant
hal-03097386
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0242416
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BibTex
auteur
Antoine Legouhy, Olivier Commowick, Maia Proisy, François Rousseau, Christian Barillot
titre
Regional brain development analysis through registration using anisotropic similarity, a constrained affine transformation
article
PLoS ONE, 2020, 15 (2), pp.e0214174. ⟨10.1371/journal.pone.0214174⟩
identifiant
inserm-02493143
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0214174
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https://inserm.hal.science/inserm-02493143/file/legouhy2020_plosOne.pdf BibTex
auteur
Giulia Lioi, Claire Cury, Lorraine Perronnet, Marsel Mano, Elise Bannier, Anatole Lécuyer, Christian Barillot
titre
Simultaneous EEG-fMRI during a neurofeedback task, a brain imaging dataset for multimodal data integration
article
Scientific Data , 2020, 7 (1), pp.1-15. ⟨10.1038/s41597-020-0498-3⟩
identifiant
hal-02865965
DOI
DOI : 10.1038/s41597-020-0498-3
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https://inria.hal.science/hal-02865965/file/s41597-020-0498-3.pdf BibTex
auteur
Giulia Lioi, Simon Butet, Mathis Fleury, Elise Bannier, Anatole Lécuyer, Isabelle Bonan, Christian Barillot
titre
A Multi-Target Motor Imagery Training Using Bimodal EEG-fMRI Neurofeedback: A Pilot Study in Chronic Stroke Patients
article
Frontiers in Human Neuroscience, 2020, 14, pp.1-13. ⟨10.3389/fnhum.2020.00037⟩
identifiant
hal-02491848
DOI
DOI : 10.3389/fnhum.2020.00037
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02491848/file/Lioi_2020_Frontiers_In_Neuroscience.pdf BibTex
auteur
Corentin Vallée, Pierre Maurel, Isabelle Corouge, Christian Barillot
titre
Acquisition duration in resting-state arterial spin labeling. How long is enough?
article
Frontiers in Neuroscience, 2020, 14, ⟨10.3389/fnins.2020.00598⟩
identifiant
inserm-02129799
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2020.00598
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https://inserm.hal.science/inserm-02129799/file/HowLongIsEnough.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Claire Cury, Giulia Lioi, Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Pierre Maurel, Christian Barillot
titre
Impact of 1D and 2D visualisation on EEG-fMRI neurofeedback training during a motor imagery task.
article
ISBI 2020 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2020, Iowa City, United States. pp.1-4
identifiant
inserm-02489459
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https://inserm.hal.science/inserm-02489459/file/ISBI2020_resub_Final_2.pdf BibTex
auteur
Raphaël Truffet, Jonathan Rafael-Patino, Gabriel Girard, Marco Pizzolato, Christian Barillot, Jean-Philippe Thiran, Emmanuel Caruyer
titre
An evolutionary framework for microstructure-sensitive generalized diffusion gradient waveforms
article
MICCAI 2020 - 23rd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2020, Lima, Peru. pp.1-11
identifiant
inserm-02910086
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https://inserm.hal.science/inserm-02910086/file/paper396.pdf BibTex

Poster communications

auteur
Simon Butet, Quentin Duché, Giulia Lioi, Mathis Fleury, Emilie Leveque-Le Bars, Elise Bannier, Anatole Lécuyer, Christian Barillot, Isabelle Bonan
titre
Feasibility of a multi-session EEG-fMRI Neurofeedback training – preliminary results from a randomized controlled study in chronic stroke patients
article
WFNR 2020 - World Federation for NeuroRehabilitation, Oct 2020, Lyon, France
identifiant
hal-03354325
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BibTex
auteur
Giulia Lioi, Adolfo Veliz, Julie Coloigner, Quentin Duché, Simon Butet, Mathis Fleury, Emilie Leveque-Le Bars, Elise Bannier, Anatole Lecuyer, Christian Barillot, Isabelle Bonan
titre
The effect of neurofeedback training on effective connectivity assessed with dynamic causal modeling in stroke patients – a pilot study
article
WFNR 2020 - World Federation For NeuroRehabilitation, Oct 2020, Lyon, France
identifiant
hal-03354319
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BibTex

Reports

auteur
Aurélien Cornet, Christian Barillot, Olivier Dameron, Alban Gaignard, Camille Maumet, Richard Redon, Anne Siegel
titre
État des lieux MoDaL (Multi-Scale Data Links)
article
[Rapport de recherche] IRISA, Inria Rennes. 2020
identifiant
hal-02557351
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https://hal.science/hal-02557351/file/MoDaL_2019_synthese_Ver1.pdf BibTex
auteur
Aurélien Cornet, Christian Barillot, Olivier Dameron, Alban Gaignard, Camille Maumet, Richard Redon, Anne Siegel
titre
Atelier MoDaL (Multi-Scale Data Links)
article
[Rapport de recherche] IRISA, Inria Rennes. 2020
identifiant
inserm-02507799
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https://inserm.hal.science/inserm-02507799/file/MoDaL_2019_workshop_report_V4.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Mathis Fleury, Giulia Lioi, Claire Cury, Maureen Clerc, Fabien Lotte, Christian Barillot
titre
Learning 2-in-1: Towards Integrated EEG-fMRI-Neurofeedback
article
2020
identifiant
hal-02522245
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https://inria.hal.science/hal-02522245/file/Learning_2_in_1__towards_integrated_EEG_fMRI_neurofeedback_subBioRxiv.pdf BibTex

2019

Journal articles

auteur
Anne-Claire Binter, Elise Bannier, Grégory Simon, Dave Saint-Amour, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Christine Monfort, Sylvaine Cordier, Cécile Chevrier, Fabienne Pelé
titre
Prenatal exposure to glycol ethers and motor inhibition function evaluated by functional MRI at the age of 10 to 12 years in the PELAGIE mother-child cohort
article
Environment International, 2019, 133 (A), pp.105163. ⟨10.1016/j.envint.2019.105163⟩
identifiant
inserm-02284944
DOI
DOI : 10.1016/j.envint.2019.105163
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-02284944/file/1-s2.0-S0160412019301825-main.pdf BibTex
auteur
Raphaël Chouteau, Benoît Combès, Elise Bannier, Haykel Snoussi, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Gilles Edan, Paul Sauleau, Anne Kerbrat
titre
Joint assessment of brain and spinal cord motor tract damage in patients with early RRMS: predominant impact of spinal cord lesions on motor function
article
Journal of Neurology, 2019, 266 (9), pp.2294-2303. ⟨10.1007/s00415-019-09419-5⟩
identifiant
inserm-02160321
DOI
DOI : 10.1007/s00415-019-09419-5
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BibTex
auteur
Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Gabriel Robert, Christian Barillot, Dominique Drapier
titre
White matter abnormalities in depression: a categorical and phenotypic diffusion MRI study.
article
Neuroimage-Clinical, 2019, 22, pp.101710. ⟨10.1016/j.nicl.2019.101710⟩
identifiant
inserm-01938407
DOI
DOI : 10.1016/j.nicl.2019.101710
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https://inserm.hal.science/inserm-01938407/file/1-s2.0-S2213158219300609-main.pdf https://inserm.hal.science/inserm-01938407/file/Coloigner_hal.pdf BibTex
auteur
Benoît Combès, Laureline Monteau, Elise Bannier, Virginie Callot, Pierre Labauge, Xavier Ayrignac, Clarisse Carra Dallière, Jean Pelletier, Adil Maarouf, Jérôme de Sèze, Nicolas Collongues, Christian Barillot, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferré, Anne Kerbrat
titre
Measurement of magnetization transfer ratio (MTR) from cervical spinal cord: Multicenter reproducibility and variability
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, 2019, 49 (6), pp.1777-1785. ⟨10.1002/jmri.26537⟩
identifiant
inserm-02457509
DOI
DOI : 10.1002/jmri.26537
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Benoît Combès, Anne Kerbrat, Jean-Christophe Ferré, Virginie Callot, Josefina Maranzano, Atef Badji, Emmanuelle Le Page, Pierre Labauge, Xavier Ayrignac, Clarisse Carra Dallière, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean Pelletier, Adil Maarouf, Jérôme de Sèze, Nicolas Collongues, David Brassat, Françoise Durand-Dubief, Christian Barillot, Elise Bannier, Gilles Edan
titre
Focal and diffuse cervical spinal cord damage in patients with early relapsing–remitting MS: A multicentre magnetisation transfer ratio study
article
Multiple Sclerosis Journal, 2019, 25 (8), pp.1113-1123. ⟨10.1177/1352458518781999⟩
identifiant
inserm-02457569
DOI
DOI : 10.1177/1352458518781999
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BibTex
auteur
Cédric Meurée, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Patch-Based Super-Resolution of Arterial Spin Labeling Magnetic Resonance Images
article
NeuroImage, 2019, 189, pp.85-94. ⟨10.1016/j.neuroimage.2019.01.004⟩
identifiant
inserm-01880726
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2019.01.004
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https://inserm.hal.science/inserm-01880726/file/articleCedricMeuree.pdf BibTex
auteur
Maia Proisy, Isabelle Corouge, Antoine Legouhy, Amélie Nicolas, Valérie Charon, Nadia Mazille, Stéphanie Leroux, Bertrand Bruneau, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré
titre
Changes in brain perfusion in successive arterial spin labeling MRI scans in neonates with hypoxic-ischemic encephalopathy
article
Neuroimage-Clinical, 2019, 101939, pp.1-31. ⟨10.1016/j.nicl.2019.101939⟩
identifiant
inserm-02189386
DOI
DOI : 10.1016/j.nicl.2019.101939
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https://inserm.hal.science/inserm-02189386/file/1-s2.0-S221315821930289X-main.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Simon Butet, Giulia Lioi, Mathis Fleury, Anatole Lécuyer, Christian Barillot, Isabelle Bonan
titre
A multi-target motor imagery training using EEG-fMRI Neurofeedback: an exploratory study on stroke
article
OHBM 2019- Orgaization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-4
identifiant
hal-02265496
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https://inria.hal.science/hal-02265496/file/OHBM%20abstract%202.pdf BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Tissue microstructure information from T2 relaxometry and diffusion MRI can identify multiple sclerosis (MS) lesions undergoing blood-brain barrier breakdown (BBB)
article
ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montreal, Canada. pp.1-4
identifiant
inserm-02153311
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https://inserm.hal.science/inserm-02153311/file/ISMRM_Chatterjee_2019.pdf BibTex
auteur
Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Dominique Drapier, Christian Barillot
titre
Structural connectivity analysis in treatment-resistant depression
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-2
identifiant
hal-02176403
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BibTex
auteur
Julie Coloigner, Anne-Claire Binter, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Cécile Chevrier, Christian Barillot, Fabienne Pelé
titre
Effect of prenatal organic solvent exposure on structural connectivity at childhood
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. pp.151-154, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759473⟩
identifiant
inserm-02176376
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759473
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https://inserm.hal.science/inserm-02176376/file/ISBI_2018_Coloigner.pdf BibTex
auteur
Claire Cury, Pierre Maurel, Giulia Lioi, Rémi Gribonval, Christian Barillot
titre
Learning bi-modal EEG-fMRI neurofeedback to improve neurofeedback in EEG only
article
Real-Time Functional Imaging and Neurofeedback, Dec 2019, Maastricht, Netherlands. pp.1-2, ⟨10.1101/599589⟩
identifiant
inserm-02368720
DOI
DOI : 10.1101/599589
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https://inserm.hal.science/inserm-02368720/file/Abstract_rtFIN2019_2.pdf BibTex
auteur
Claire Cury, Pierre Maurel, Rémi Gribonval, Christian Barillot
titre
Can we learn from coupling EEG-fMRI to enhance neuro-feedback in EEG only?
article
OHBM 2019 - Annual Meeting Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1
identifiant
inserm-02074623
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https://inserm.hal.science/inserm-02074623/file/cury-claire-empenn.pdf BibTex
auteur
Quentin Duché, Florian Chapelain, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Philippe Allain, Philippe Gallien, Virginie Dardier, Christian Barillot
titre
Neural basis of irony in patients with Multiple Sclerosis : an exploratory fMRI study
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-3
identifiant
inserm-02148314
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https://inserm.hal.science/inserm-02148314/file/OHBM_2019_COGNISEP.pdf BibTex
auteur
Mathis Fleury, Giulia Lioi, Christian Barillot, Anatole Lécuyer
titre
The use of haptic feedback in Brain-Computer Interfaces and Neurofeedback
article
rtFIN 2019 - Real Time Functional Imaging and Neurofeedback, Dec 2019, Maastricht, Netherlands
identifiant
hal-02387400
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BibTex
auteur
Mathis Fleury, Giulia Lioi, Christian Barillot, Anatole Lécuyer
titre
The use of haptic feedback in Brain-Computer Interfaces and Neurofeedback
article
CORTICO 2019 - Journée Jeunes Chercheurs en Interfaces Cerveau-Ordinateur et Neurofeedback, Mar 2019, Lille, France
identifiant
hal-02387408
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https://hal.science/hal-02387408/file/AbstractTemplate_rtFIN2019.pdf BibTex
auteur
Francesca Galassi, Solène Tarride, Emmanuel Vallée, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Deep learning for multi-site ms lesions segmentation: two-step intensity standardization and generalized loss function
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1
identifiant
hal-02052250
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https://hal.science/hal-02052250/file/Template_ISBI2019.pdf BibTex
auteur
Pierre-Yves Jonin, Quentin Duché, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Serge Belliard, Christian Barillot, Emmanuel J. Barbeau
titre
Learning What You Know: How Prior Knowledge Impairs New Associative Learning in Early AD
article
2019 Conference on Cognitive Neurosciences of Memory: Recollection, Familiarity and Novelty detection, Oct 2019, Liège, Belgium. pp.1
identifiant
inserm-02383947
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https://inserm.hal.science/inserm-02383947/file/Abstract_Lie%CC%80ge_2019Final.pdf BibTex
auteur
Pierre-Yves Jonin, Quentin Duché, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Serge Belliard, Christian Barillot, Emmanuel J. Barbeau
titre
Learning What You Know: How Prior Knowledge Impairs New Associative Learning in Early AD
article
AAIC 2019 - Alzheimer's Association International Conference, Jul 2019, Los Angeles, United States. pp.1-2
identifiant
inserm-02383941
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https://inserm.hal.science/inserm-02383941/file/Soumission%20AAIC%202019EB.pdf BibTex
auteur
Pierre-Yves Jonin, Quentin Duché, Elise Bannier, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Serge Belliard, Emmanuel Barbeau, Christian Barillot
titre
Abnormal fMRI response in sub-hippocampal structures: how prior knowledge impairs memory in AD
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-5
identifiant
inserm-02148289
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https://inserm.hal.science/inserm-02148289/file/OHBM_2019_EPMR.pdf BibTex
auteur
Salomé Le Franc, Mathis Fleury, Mélanie Cogné, Simon Butet, Christian Barillot, Anatole Lécuyer, Isabelle Bonan
titre
Influence of visual feedback on the illusion of movement induced by tendon vibration of wrist in healthy subjects
article
SOFMER 2019 - 34ème congrès de la Société Français de Médecine Physique et de Réadaptation, Oct 2019, Bordeaux, France
identifiant
hal-02415992
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auteur
Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
titre
Online atlasing using an iterative centroid
article
MICCAI 2019 - 22nd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.366-374, ⟨10.1007/978-3-030-32248-9_41⟩
identifiant
inserm-02317392
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-32248-9_41
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https://inserm.hal.science/inserm-02317392/file/paper2061.pdf BibTex
auteur
Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
titre
Unbiased longitudinal brain atlas creation using robust linear registration and log-Euclidean framework for diffeomorphisms
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. pp.1038-1041, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759508⟩
identifiant
inserm-02099958
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759508
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https://inserm.hal.science/inserm-02099958/file/atlas.pdf BibTex
auteur
Giulia Lioi, Simon Butet, Mathis Fleury, Claire Cury, Elise Bannier, Anatole Lécuyer, Isabelle Bonan, Christian Barillot
titre
Bimodal EEG-fMRI Neurofeedback for upper motor limb rehabilitation: a pilot study on chronic patients
article
rtFIN 2019 - Real Time Functional Imaging and Neurofeedback, Dec 2019, Maastricht, Netherlands. pp.1-2
identifiant
hal-02383532
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https://inria.hal.science/hal-02383532/file/GiuliaLioi_rtFIN2019_v3%20%281%29.pdf BibTex
auteur
Giulia Lioi, Simon Butet, Mathis Fleury, Anatole Lécuyer, Isabelle Bonan, Christian Barillot
titre
Efficacy of EEG-fMRI Neurofeedback in stroke in relation to the DTI structural damage: a pilot study
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-4
identifiant
hal-02265495
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https://inria.hal.science/hal-02265495/file/OHBM%20abstract%201.pdf BibTex
auteur
Camille Maumet, Xavier Rolland, Axel Bonnet, Sorina Camarasu-Pop, Argiro Kokogiannaki, Christian Barillot
titre
Open research: linking the bits and pieces with OpenAIRE-connect
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-6
identifiant
inserm-02151177
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https://inserm.hal.science/inserm-02151177/file/OHBM%202019_%20OpenAIRE-Connect%281%29.pdf BibTex
auteur
Maïa Proisy, Isabelle Corouge, Antoine Legouhy, Valérie Charon, Nadia Mazille, Amélie Nicolas, Stéphanie Leroux, Bertrand Bruneau, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré
titre
Changes in brain perfusion in successive arterial spin labelling MRI scans in neonates with hypoxic-ischemic encephalopathy
article
SPR 2019 - Annual Meeting & Postgraduate Course, Apr 2019, San Francisco, California, United States
identifiant
inserm-01944507
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BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Julien Cohen-Adad, Olivier Commowick, Benoit Combes, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
titre
Geometric evaluation of distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
article
ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1696-1699, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759196⟩
identifiant
inserm-01986723
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759196
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https://inserm.hal.science/inserm-01986723/file/snoussi-caruyer-etal-isbi2019.pdf BibTex
auteur
Raphaël Truffet, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
titre
Optimal selection of diffusion-weighting gradient waveforms using compressed sensing and dictionary learning
article
ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montréal, Canada. pp.1-3
identifiant
inserm-02015394
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https://inserm.hal.science/inserm-02015394/file/3487.pdf BibTex
auteur
Corentin Vallée, Pierre Maurel, Isabelle Corouge, Christian Barillot
titre
Investigating an optimal duration of acquisition in resting-state ASL
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-3
identifiant
inserm-02150255
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https://inserm.hal.science/inserm-02150255/file/asbtractOHBM2019.pdf BibTex

Book sections

auteur
Christian Barillot, Valentina Emiliani, Mickaël Tanter
titre
Imagerie et analyses fonctionnelles
article
Bernard Poulain; Etienne Hirsch. Le Cerveau en lumières, Odile Jacob, 2019, 978-2-7381-4845-2
identifiant
inserm-02414949
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BibTex

Poster communications

auteur
Gabriel Besson, Pierre-Yves Jonin, Christian Barillot
titre
Wakeful rest promotes the viewpoint invariance, but not the fine discriminability, of entities mnemonic representations for subsequently familiarity-based recognition
article
2019 - Cognitive Neuroscience of Memory: Recollection Familiarity Novelty detection, Oct 2019, Liège, Belgium
identifiant
inserm-02384508
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https://inserm.hal.science/inserm-02384508/file/Wakeful%20rest%20promotes%20the%20viewpoint%20invariance.pdf BibTex

Documents associated with scientific events

auteur
Camille Maumet, Christian Barillot
titre
Le futur de l'imagerie façonné par les chercheurs
article
Enseignements Post-Universitaires CHU Rennes: les Mardis soirs d'imagerie: "Application de l'IA en Neurologie", May 2019, Rennes, France
identifiant
inserm-02931842
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https://inria.hal.science/inserm-02931842/file/EPU%20CHU%2028%20mai%202019%20IA%20et%20imagerie%20-%20Camille%20Maumet%20et%20Christian%20Barillot.pdf BibTex

2018

Journal articles

auteur
Aline Carsin-Vu, Isabelle Corouge, Olivier Commowick, Guillaume Bouzillé, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré, Maia Proisy
titre
Measurement of pediatric regional cerebral blood flow from 6 months to 15 years of age in a clinical population
article
European Journal of Radiology, 2018, 101, pp.38-44. ⟨10.1016/j.ejrad.2018.02.003⟩
identifiant
inserm-01708945
DOI
DOI : 10.1016/j.ejrad.2018.02.003
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https://inserm.hal.science/inserm-01708945/file/Carsin17_EJR_HAL.pdf https://inserm.hal.science/inserm-01708945/file/document BibTex
auteur
Olivier Commowick, Audrey Istace, Michael Kain, Baptiste Laurent, Florent Leray, Mathieu Simon, Sorina Camarasu Pop, Pascal Girard, Roxana Ameli, Jean-Christophe Ferré, Anne Kerbrat, Thomas Tourdias, Frédéric Cervenansky, Tristan Glatard, Jeremy Beaumont, Senan Doyle, Florence Forbes, Jesse Knight, April Khademi, Amirreza Mahbod, Chunliang Wang, Richard Mckinley, Franca Wagner, John Muschelli, Elizabeth Sweeney, Eloy Roura, Xavier Llado, Michel Santos, Wellington P Santos, Abel G Silva-Filho, Xavier Tomas-Fernandez, Hélène Urien, Isabelle Bloch, Sergi Valverde, Mariano Cabezas, Francisco Javier Vera-Olmos, Norberto Malpica, Charles R G Guttmann, Sandra Vukusic, Gilles Edan, Michel Dojat, Martin Styner, Simon K. Warfield, François Cotton, Christian Barillot
titre
Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.13650. ⟨10.1038/s41598-018-31911-7⟩
identifiant
inserm-01847873
DOI
DOI : 10.1038/s41598-018-31911-7
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https://inserm.hal.science/inserm-01847873/file/s41598-018-31911-7.pdf BibTex
auteur
Mathis Fleury, Christian Barillot, Elise Bannier, Marsel Mano, Pierre Maurel
titre
Automated Electrodes Detection during simultaneous EEG/fMRI
article
Frontiers in information and communication technologies, In press, 5, pp.31. ⟨10.3389/fict.2018.00031⟩
identifiant
hal-01939735
DOI
DOI : 10.3389/fict.2018.00031
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https://inria.hal.science/hal-01939735/file/Draft_Article_TED%287%29.pdf BibTex
auteur
Mathieu Hatt, Baptiste Laurent, Anouar Ouahabi, Hadi Fayad, Shan Tan, Laquan Li, Wei Lu, Vincent Jaouen, Clovis Tauber, Jakub Czakon, Filip Drapejkowski, Witold Dyrka, Sorina Camarasu-Pop, Frédéric Cervenansky, Pascal Girard, Tristan Glatard, Michael Kain, Yao Yao, Christian Barillot, Assen Kirov, Dimitris Visvikis
titre
The first MICCAI challenge on PET tumor segmentation
article
Medical Image Analysis, 2018, 44, pp.177-195. ⟨10.1016/j.media.2017.12.007⟩
identifiant
hal-01659162
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2017.12.007
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https://hal.science/hal-01659162/file/manuscript_final.pdf BibTex
auteur
Pierre-Yves Jonin, Gabriel Besson, Renaud La Joie, Jérémie Pariente, Serge Belliard, Christian Barillot, Emmanuel J. Barbeau
titre
Superior explicit memory despite severe developmental amnesia: In-depth case study and neural correlates
article
Hippocampus, 2018, 28 (12), pp.867-885. ⟨10.1002/hipo.23010⟩
identifiant
inserm-01916086
DOI
DOI : 10.1002/hipo.23010
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https://inserm.hal.science/inserm-01916086/file/_system_appendPDF_proof_hi%20%281%29.pdf BibTex
auteur
Anne Kerbrat, Benoît Combès, Olivier Commowick, Adil Maarouf, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Ayman Tourbah, Jean-Philippe Ranjeva, Christian Barillot, Gilles Edan
titre
USPIO-positive MS lesions are associated with greater tissue damage than gadolinium-positive-only lesions during 3-year follow-up
article
Multiple Sclerosis Journal, 2018, 24 (14), pp.1852-1861. ⟨10.1177/1352458517736148⟩
identifiant
inserm-02457629
DOI
DOI : 10.1177/1352458517736148
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Conference papers

auteur
Christian Barillot, Michel Dojat, Michael Kain
titre
France Life Imaging and the transversal node for Information Analysis and Management (IAM)
article
JFR 2018 - Journées Françaises de Radiologie, Oct 2018, Paris, France. pp.1-15
identifiant
inserm-01895605
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https://inserm.hal.science/inserm-01895605/file/FLI-IAM_JFR18-CB.pdf BibTex
auteur
Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Camille Maumet, Michael Kain, Christian Barillot, Tristan Glatard
titre
Open Science for the Neuroinformatics community
article
DI4R 2018 - Digital Infrastructures for Research, Oct 2018, Lisbon, Portugal. pp.1
identifiant
inserm-01846994
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https://inserm.hal.science/inserm-01846994/file/DI4R%202018%20-%20Open%20Science%20for%20the%20Neuroinformatics%20community.pdf BibTex
auteur
Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Camille Maumet, Michael Kain, Christian Barillot, Tristan Glatard
titre
Interoperability with Boutiques and CARMIN
article
DI4R 2018 - Digital Infrastructures for Research, Oct 2018, Lisbon, Portugal. pp.1
identifiant
inserm-01846997
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https://inserm.hal.science/inserm-01846997/file/DI4R%202018%20-%20Interoperability%20with%20Boutiques%20and%20CARMIN.pdf BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
titre
Identification of Gadolinium contrast enhanced regions in MS lesions using brain tissue microstructure information obtained from diffusion and T2 relaxometry MRI
article
21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2018), Sep 2018, Grenade, Spain. pp.63-71, ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_8⟩
identifiant
hal-01830532
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-00931-1_8
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https://hal.science/hal-01830532/file/MICAAI_2018_Camera_Ready.pdf BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Benoît Combès, Anne Kerbrat, Simon K Warfield, Christian Barillot
titre
A 3-year follow-up study of enhancing and non-enhancing multiple sclerosis (MS) lesions in MS patients demonstrating clinically isolated syndrome (CIS) using a multi-compartment T2 relaxometry (MCT2) model
article
ISMRM Annual Meeting 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1-5
identifiant
hal-01821694
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https://hal.science/hal-01821694/file/HAL_copy_ISMRM_2018-MS-CIS-3yr-followup-study-MCT2.pdf BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
titre
Multi-Compartment Model of Brain Tissues from T2 Relaxometry MRI Using Gamma Distribution
article
ISBI 2018 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington DC, United States. pp.141-144, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363541⟩
identifiant
hal-01744852
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2018.8363541
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https://hal.science/hal-01744852/file/Template_ISBI2018-copy.pdf BibTex
auteur
Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Dominique Drapier, Christian Barillot
titre
Diffusion MRI as an imaging marker of depression from a large and homogenous population study
article
ISMRM 2018 - International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France. pp.1-2
identifiant
hal-01812093
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01812093/file/Abstract_MDD_CTL.pdf BibTex
auteur
Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Isabelle Corouge, Jean-Christophe Ferré, Dominique Drapier, Christian Barillot
titre
Diffusion MRI as a descriptive imaging marker of the pathogenesis of treatment-resistant depression
article
ISMRM 2018 - International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France. pp.1-2
identifiant
hal-01812087
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01812087/file/Abstract_MDD_CGI_2.pdf BibTex
auteur
Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure
article
JFR 2018 - Journées Françaises de Radiologie, Oct 2018, Paris, France. pp.1-19
identifiant
inserm-01895603
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01895603/file/Challenge_MS_SegmentationChallenge_JFR-OC.pdf BibTex
auteur
Mathis Fleury, Pierre Maurel, Marsel Mano, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Automatic Electrodes Detection during simultaneous EEG/fMRI acquisition
article
ISMRM 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1-3, ⟨10.1101/395806⟩
identifiant
hal-01874815
DOI
DOI : 10.1101/395806
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01874815/file/Article_ISMRM.pdf BibTex
auteur
Francesca Galassi, Olivier Commowick, Emmanuel Vallee, Christian Barillot
titre
Voxel-wise Comparison with a-contrario Analysis for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions from Multimodal MRI
article
MICCAI BrainLes 2018 workshop, Alessandro Crimi; Spyridon Bakas, Sep 2018, Granada, Spain. pp.180-188, ⟨10.1007/978-3-030-11723-8_18⟩
identifiant
inserm-01888928
DOI
DOI : 10.1007/978-3-030-11723-8_18
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01888928/file/miccai2018.pdf BibTex
auteur
Francesca Galassi, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Integration of Probabilistic Atlas and Graph Cuts for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis lesions
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM 2018), Jun 2018, Paris, France. pp.1-6
identifiant
hal-01823801
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01823801/file/FG_ISMRM_rev1.pdf BibTex
auteur
Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
titre
Anisotropic similarity, a constrained affine transformation: Application to brain development analysis
article
ISMRM 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1
identifiant
inserm-01871274
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https://inserm.hal.science/inserm-01871274/file/1781.pdf BibTex
auteur
Corentin Vallée, Pierre Maurel, Isabelle Corouge, Christian Barillot
titre
Resting-state ASL : Toward an optimal sequence duration
article
ISMRM 2018 - International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Jun 2018, Paris, France. pp.1-2
identifiant
inserm-01935089
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https://inserm.hal.science/inserm-01935089/file/ISMRM_2018_Abstract.pdf BibTex

Poster communications

auteur
Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Isabelle Corouge, Dominique Drapier, Christian Barillot
titre
White matter connectivity analysis in patients suffering from depression.
article
2018 - 7ème Forum de l’Institut de Psychiatrie, Sep 2018, Amiens, France. pp.1
identifiant
hal-01890087
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https://hal.science/hal-01890087/file/Poster_journee_Psychiatrie_vf.pdf BibTex
auteur
Pierre-Yves Jonin, Audrey Noël, Gabriel Besson, Sophie Muratot, Serge Belliard, Christian Barillot, Emmanuel Barbeau
titre
Retrieval practice based on recognition memory: testing the retrieval effort hypothesis
article
UC Irvine International Conference on Learning and Memory, Apr 2018, Irvine, United States. 2018
identifiant
inserm-01939069
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https://inserm.hal.science/inserm-01939069/file/Irvine_JoninFinal.pdf BibTex
auteur
Giulia Lioi, Mathis Fleury, Simon Butet, Anatole Lécuyer, Christian Barillot, Isabelle Bonan
titre
Bimodal EEG-fMRI Neurofeedback for stroke rehabilitation
article
ISPRM 2018 -International Society of Physical and Rehabilitation Medicine, Jul 2018, Paris, France
identifiant
inserm-01932954
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https://inserm.hal.science/inserm-01932954/file/Poster_GiuliaLioi_ISPRM.pdf BibTex

Reports

auteur
Christian Barillot, Inbar Fijalkow, Isabelle Queinnec, Fabrice Theoleyre, Hélène Touzet, Michel Beaudouin-Lafon, Marie-Paule Cani, François Chaumette, Gérald Conreur, Véronique Cortier, Cyril Gavoille, Guy Gogniat, Julien Gossa, Andreas Herzig, Jean Krivine, Philippe Lamarre, Françoise Lamnabhi-Lagarrigue, Anne-Catherine Letournel, Lionel Seinturier, Isabelle Tellier, Serge Torres, Charlotte Truchet, Alexandros Tsoukias, Michel Verleysen
titre
Rapport de Prospective du Conseil Scientifique de l’Institut des Sciences de l’Information et leurs Interactions (INS2I)
article
[0] CNRS. 2018, pp.1-87
identifiant
hal-01956087
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https://hal.science/hal-01956087/file/Rapport%20de%20Prospective%20CSI%20INS2I%202018%20%2B%20%20Annexes.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Benoît Combès, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
A three year follow-up study of gadolinium enhanced and non-enhanced regions in multiple sclerosis lesions using a multi-compartment T2 relaxometry model.
article
2018
identifiant
hal-01837974
DOI
DOI : 10.1101/365379
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https://hal.science/hal-01837974/file/bioArxiv_preprint_three_year_follow_up_study.pdf BibTex

2017

Journal articles

auteur
Aaron Carass, Snehashis Roy, Amod Jog, Jennifer L. Cuzzocreo, Elizabeth Magrath, Adrian Gherman, Julia Button, James Nguyen, Ferran Prados, Carole H. Sudre, Manuel Jorge Cardoso, Niamh Cawley, Olga Ciccarelli, Claudia A.M. Wheeler-Kingshott, Sébastien Ourselin, Laurence Catanese, Hrishikesh Deshpande, Pierre Maurel, Olivier Commowick, Christian Barillot, Xavier Tomas-Fernandez, Simon K. Warfield, Suthirth Vaidya, Abhijith Chunduru, Ramanathan Muthuganapathy, Ganapathy Krishnamurthi, Andrew Jesson, Tal Arbel, Oskar Maier, Heinz Handels, Leonardo O. Iheme, Devrim Unay, Saurabh Jain, Diana M. Sima, Dirk Smeets, Mohsen Ghafoorian, Bram Platel, Ariel Birenbaum, Hayit Greenspan, Pierre-Louis Bazin, Peter A. Calabresi, Ciprian M. Crainiceanu, Lotta M. Ellingsen, Daniel S. Reich, Jerry L. Prince, Dzung L. Pham
titre
Longitudinal multiple sclerosis lesion segmentation: Resource and challenge
article
NeuroImage, 2017, 148, pp.77 - 102. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.12.064⟩
identifiant
inserm-01480156
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.12.064
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https://inserm.hal.science/inserm-01480156/file/2017-NI-Carass-Challenge-2016_Dec_22.pdf BibTex
auteur
Renaud Hédouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Maxime Taquet, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Block-Matching Distortion Correction of Echo-Planar Images With Opposite Phase Encoding Directions
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2017, 36 (5), pp.1106 - 1115. ⟨10.1109/TMI.2016.2646920⟩
identifiant
hal-01436561
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2016.2646920
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https://inria.hal.science/hal-01436561/file/TMI_FinalVersion_WithoutCopyright.pdf BibTex
auteur
Marsel Mano, Anatole Lécuyer, Elise Bannier, Lorraine Perronnet, Saman Noorzadeh, Christian Barillot
titre
How to Build a Hybrid Neurofeedback Platform Combining EEG and fMRI.
article
Frontiers in Neuroscience, 2017, 11, pp.140. ⟨10.3389/fnins.2017.00140⟩
identifiant
inserm-01576500
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2017.00140
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https://inserm.hal.science/inserm-01576500/file/Mano-Front%20Neurosci-2017.pdf BibTex
auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
titre
Unimodal Versus Bimodal EEG-fMRI Neurofeedback of a Motor Imagery Task
article
Frontiers in Human Neuroscience, 2017, 11, ⟨10.3389/fnhum.2017.00193⟩
identifiant
hal-01519755
DOI
DOI : 10.3389/fnhum.2017.00193
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https://inria.hal.science/hal-01519755/file/fnhum-11-00193%20%281%29.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Elise Bannier, Benoît Combès, Laureline Monteau, Christian Barillot, Gilles Edan, Anne Kerbrat, Jean-Christophe Ferre
titre
Evaluating the reliability of cervical spine magnetization transfer imaging in the context of multicenter longitudinal studies
article
ESMRMB, Oct 2017, Barcelona, Spain
identifiant
hal-01578473
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BibTex
auteur
Anne-Claire Binter, Elise Bannier, Dave Saint-Amour, Grégory Simon, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Jean-François Viel, Sylvaine Cordier, Cécile Chevrier, Fabienne Pelé
titre
Prenatal solvent exposure association with motor inhibition functional MRI at the age of 10-12 in the PELAGIE mother-child cohort
article
International Society of Environmental Epidemiology, Sep 2017, Sydney, Australia
identifiant
inserm-01578506
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auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Multi-Compartment T2 Relaxometry Model Using Gamma Distribution Representations: A Framework for Quantitative Estimation of Brain Tissue Microstructures
article
ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
identifiant
inserm-01543073
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BibTex
auteur
Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Gaining Insights Into Multiple Sclerosis Lesion Characteristics from Brain Tissue Microstructure Information: A Multi-Compartment T2 Relaxometry Approach
article
ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
identifiant
inserm-01543061
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https://inserm.hal.science/inserm-01543061/file/Gauss-MCM-poster.pdf BibTex
auteur
Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot
titre
L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration
article
20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩
identifiant
inserm-01556476
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30
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https://inserm.hal.science/inserm-01556476/file/MICCAI17-317.pdf BibTex
auteur
Anne Kerbrat, Benoit Combès, Laureline Monteau, Jean-Christophe Ferré, J Maranzano, Virgine Callot, Pierre Labauge, Xavier Ayrignac, Clarisse Carra Dallière, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Pierre Pelletier, Adil Maarouf, David Brassat, Jérôme de Seze, Nicolas Collongues, F Durand Dubief, Christian Barillot, Gilles Edan, Elise Bannier
titre
Presence of focal and diffuse cervical cord tissue damage in early relapsing-remitting MS: A magnetization transfer study
article
ECTRIMS, Oct 2017, Paris, France
identifiant
hal-01579486
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auteur
Marsel Mano, Elise Bannier, Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Christian Barillot
titre
Hybrid EEG and fMRI platform for multi-modal neurofeedback
article
International Society of Magnetic Resonance in Medicine, ISMRM, Apr 2017, Honolulu, United States. pp.4550
identifiant
inserm-01577442
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https://inserm.hal.science/inserm-01577442/file/Poster%20Hemisfer%20ISMRM%204550.2017.pdf BibTex
auteur
Cédric Meurée, Pierre Maurel, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Patch-based super-resolution for arterial spin labeling MRI
article
ISMRM 25th Annual Meeting & Exhibition, Apr 2017, Honolulu, United States
identifiant
inserm-01558183
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https://inserm.hal.science/inserm-01558183/file/ISMRMposterCedricMeuree.pdf BibTex
auteur
Saman Noorzadeh, Pierre Maurel, Thomas Oberlin, Rémi Gribonval, Christian Barillot
titre
Multi-modal EEG and fMRI Source Estimation Using Sparse Constraints
article
MICCAI 2017 - 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2017, Quebec, Canada. ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_51⟩
identifiant
hal-01586495
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_51
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https://inria.hal.science/hal-01586495/file/MICCAI17-583_final.pdf BibTex
auteur
Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
titre
Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
article
ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain
identifiant
inserm-01579134
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https://inserm.hal.science/inserm-01579134/file/snoussi_et_al_esmrmb2017.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

auteur
Adil Maarouf, Jean Ferré, W Zaaraoui, Arnaud Le Troter, Elise Bannier, Isabelle Berry, Maxime Guye, Laurent Pierot, Christian Barillot, Jean Pelletier, Ayman Tourbah, Gilles Edan, Bertrand Audoin, Jean-Philippe Ranjeva
titre
Ultra-small Super Paramagnetic Iron Oxide predicts higher disease activity in clinically isolated syndrome
article
2017
identifiant
hal-01576913
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https://hal.science/hal-01576913/file/Maarouf%20MSJ%202016%20USPIO.pdf BibTex

2016

Journal articles

auteur
Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Anthony Baire, Ines Fackfack, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain
titre
Shanoir: Applying the Software as a Service Distribution Model to Manage Brain Imaging Research Repositories
article
Frontiers in information and communication technologies, 2016, MAPPING: MAnagement and Processing of Images for Population ImagiNG, ⟨10.3389/fict.2016.00025⟩
identifiant
inserm-01404864
DOI
DOI : 10.3389/fict.2016.00025
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https://inserm.hal.science/inserm-01404864/file/Shanoir_Frontiers_final.pdf BibTex
auteur
Christian Barillot, Gilles Edan, Olivier Commowick
titre
Imaging biomarkers in Multiple Sclerosis: from image analysis to population imaging
article
Medical Image Analysis, 2016, 33, pp.134-139. ⟨10.1016/j.media.2016.06.017⟩
identifiant
hal-01333583
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2016.06.017
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https://inria.hal.science/hal-01333583/file/Media-20years_Barillot_revised.pdf BibTex
auteur
Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, W Zaaraoui, Arnaud Le Troter, Elise Bannier, Isabelle Berry, Maxime Guye, Laurent Pierot, Christian Barillot, Jean Pelletier, Ayman Tourbah, Gilles Edan, Bertrand Audoin, Jean-Philippe Ranjeva
titre
Ultra-small superparamagnetic iron oxide enhancement is associated with higher loss of brain tissue structure in clinically isolated syndrome
article
Multiple Sclerosis Journal, 2016, 22 (8), pp.1032-1039. ⟨10.1177/1352458515607649⟩
identifiant
inserm-02457660
DOI
DOI : 10.1177/1352458515607649
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BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
An a contrario approach for the detection of patient-specific brain perfusion abnormalities with arterial spin labelling
article
NeuroImage, 2016, 134, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.054⟩
identifiant
inserm-01291748
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.03.054
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https://inserm.hal.science/inserm-01291748/file/Maumet_NeuroImage_A_Contrario.pdf BibTex
auteur
Caroline Nadeau, Alexandre Krupa, Jan Petr, Christian Barillot
titre
Moments-Based Ultrasound Visual Servoing: From Mono to Multi-plane Approach
article
IEEE Transactions on Robotics, 2016, 32 (6), pp.1558-1564. ⟨10.1109/TRO.2016.2604482⟩
identifiant
hal-01385661
DOI
DOI : 10.1109/TRO.2016.2604482
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https://inria.hal.science/hal-01385661/file/article.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Automatic Multiple Sclerosis lesion segmentation from Intensity-Normalized multi-channel MRI
article
Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure - MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece
identifiant
inserm-01424802
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https://inserm.hal.science/inserm-01424802/file/MSSEG_Beaumont_2.pdf BibTex
auteur
Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Multiple Sclerosis lesion segmentation using an automated multimodal Graph Cut
article
Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure – MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece. pp.1-8
identifiant
inserm-01417378
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https://inserm.hal.science/inserm-01417378/file/Beaumont%20et%20al%2C%20MSSEG_Challenge_Proceedings.pdf BibTex
auteur
Benoit Combès, Anne Kerbrat, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
A Bayesian Model to Assess T2 Values and Their Changes Over Time in Quantitative MRI
article
19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.570 - 578, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_66⟩
identifiant
inserm-01349557
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_66
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https://inserm.hal.science/inserm-01349557/file/paper518.pdf BibTex
auteur
Michel Dojat, Bénédicte Batrancourt, Yann Cointepas, Olivier Coulon, Tristan Glatard, Fabrice Heitz, Michael Kain, Christian Barillot
titre
Sharing Data and Image Processing Pipelines: The Information Analysis & Management initiative
article
OHBM 2016 - 22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2016, Geneve, Suisse
identifiant
hal-01488230
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https://amu.hal.science/hal-01488230/file/OHBM-1849-2016.pdf BibTex
auteur
Pierre-Yves Jonin, Audrey Noël, Serge Belliard, Christian Barillot, Emmanuel J Barbeau
titre
L'apprentissage en mémoire de reconnaissance: La répétition de la récupération, pas de l'encodage, optimise la rétention
article
Journée d'hiver de la Société de Neuropsychologie de Langue Française, Dec 2016, Paris, France
identifiant
hal-01874696
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BibTex

Book sections

auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
titre
Brain training with neurofeedback
article
Brain-Computer Interfaces 1, Wiley-ISTE, 2016
identifiant
hal-01413424
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BibTex
auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
titre
Entraîner son cerveau avec le neurofeedback
article
Maureen Clerc; Laurent Bougrain; Fabien Lotte. Les interfaces cerveau-ordinateur 1, ISTE editions, pp.277-292, 2016, 978-1-78406-147-0
identifiant
hal-01413408
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Patents

auteur
Marsel Mano, Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Christian Barillot
titre
Hybrid Eeg-MrI and Simultaneous neuro-feedback for brain Rehabilitation
article
France, Patent n° : PCT/EP2016/1652279. 2016
identifiant
hal-01576711
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Poster communications

auteur
Marsel Mano, Elise Bannier, Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Christian Barillot
titre
Design of an Experimental Platform for Hybrid EEG-fMRI Neurofeedback Studies
article
22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2016), Jun 2016, Genève, Switzerland.
identifiant
hal-01426072
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https://hal.science/hal-01426072/file/Hybrid%20EEG%C2%AD-fMRI%20neurofeedback%20of%20a%20motor%C2%ADimagery%20task.pdf BibTex
auteur
Lorraine Perronnet, Anatole Lécuyer, Marsel Mano, Elise Bannier, Fabien Lotte, Maureen Clerc, Christian Barillot
titre
EEG-fMRI neurofeedback of a motor imagery task
article
Organization for Human Brain Mapping, Jun 2016, Genève, Switzerland
identifiant
hal-01426182
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https://inria.hal.science/hal-01426182/file/OHBM_poster_4133_lp.pdf BibTex

2015

Journal articles

auteur
Roxana Amélie, René Anxionnat, Jean-Paul Armspach, Bertrand Audoin, Christian Barillot, Isabelle Berry, Fabrice Bonneville, Claire Boutet, Giovanni Castelnovo, Frédéric Cervenansky, Mikael Cohen, Olivier Commowick, François Cotton, Jérôme de Seze, Vincent Dousset, Françoise Durand-Dubief, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferre, Damien Galanaud, Tristan Glattard, Sylvie Grand, Justine Guillaumont, Rémy Guillevin, Charles Guttmann, Salem Hannoun, Fabrice Heitz, Alexandre Krainik, Stéphane Kremer, Pierre Labauge, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Dominique Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Bruno Stankoff, Thomas Tourdias, Ayman Tourbah, Sandra Vukusic
titre
OFSEP, a nationwide cohort of people with multiple sclerosis: Consensus minimal MRI protocol
article
Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2015, 42 (3), pp.133 - 140. ⟨10.1016/j.neurad.2014.12.001⟩
identifiant
hal-01378309
DOI
DOI : 10.1016/j.neurad.2014.12.001
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BibTex
auteur
Christian Barillot, Gilles Edan, Anne Kerbrat, Benoit Combes, Adil Maarouf, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferre, Ayman Tourbah, Isabelle Berry, Jean-Philippe Ranjeva
titre
T2 and T2*relaxometry as a detector of USPIO enhancement in CIS patients
article
Multiple Sclerosis Journal, 2015, 31st Congress of the European-Committee-for-Treatment-and-Research-in-Multiple-Sclerosis (ECTRIMS), Barcelona, SPAIN, OCT 07-10, 2015, 21 (11), pp.178--179
identifiant
hal-01259390
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BibTex
auteur
Christian Barillot, Polina Golland, Nobuhiko Hata, Joachim Hornegger, Robert Howe
titre
Special issue on MICCAI 2014
article
Medical Image Analysis, 2015, 25 (1), ⟨10.1016/j.media.2015.04.017⟩
identifiant
inserm-01576148
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2015.04.017
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BibTex
auteur
Olivier Commowick, Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, Jean-Philippe Ranjeva, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
Diffusion MRI abnormalities detection with orientation distribution functions: A multiple sclerosis longitudinal study
article
Medical Image Analysis, 2015, 22 (1), pp.114-123. ⟨10.1016/j.media.2015.02.005⟩
identifiant
inserm-01134107
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2015.02.005
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https://inserm.hal.science/inserm-01134107/file/Article_MS_ODF.pdf BibTex
auteur
Hrishikesh Deshpande, Pierre Maurel, Christian Barillot
titre
Classification of Multiple Sclerosis Lesions using Adaptive Dictionary Learning
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, 2015, pp.1-15. ⟨10.1016/j.compmedimag.2015.05.003⟩
identifiant
hal-01151695
DOI
DOI : 10.1016/j.compmedimag.2015.05.003
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https://inria.hal.science/hal-01151695/file/Hrishikesh_CMIG_Final.pdf BibTex
auteur
Tristan Glatard, Yann Cointepas, Olivier Commowick, Michael Kain, Baptiste Laurent, Florent Leray, Christian Barillot
titre
CARMIN: a common web API for remote pipeline execution
article
Frontiers in Neuroscience, 2015, 9, ⟨10.3389/conf.fnins.2015.91.00053⟩
identifiant
hal-01576182
DOI
DOI : 10.3389/conf.fnins.2015.91.00053
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BibTex

Conference papers

auteur
Elise Bannier, Marsel Mano, Stoermer Robert, Isabelle Corouge, Lorraine Perronnet, Jussi Lindgren, Anatole Lécuyer, Christian Barillot
titre
On the feasibility and specificity of simultaneous EEG and ASL MRI at 3T
article
Proceedings of ISMRM, May 2015, Toronto, Canada
identifiant
inserm-01113276
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BibTex
auteur
Elise Bannier, Marsel Mano, Stoermer Robert, Isabelle Corouge, Lorraine Perronnet, Jussi Lindgren, Anatole Lécuyer, Christian Barillot
titre
Faisabilité et spécificités de l'ASL-EEG simultané à 3T
article
SFRMBM, Mar 2015, Grenoble, France
identifiant
inserm-01113279
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain
titre
Shanoir: Software as a Service Environment to Manage Population Imaging Research Repositories
article
MICCAI Workshop on MAnagement and Processing of images for Population ImagiNG, Oct 2015, Munich, Germany. pp.23-30
identifiant
inserm-01244551
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01244551/file/MICCAI-MAPPING-Workshop-Shanoir.pdf BibTex
auteur
Laurence Catanese, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Automatic graph cut segmentation of multiple sclerosis lesions
article
ISBI Longitudinal Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge, Apr 2015, New York, United States
identifiant
inserm-01304109
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01304109/file/ISBI_Challenge_Catanese.pdf BibTex
auteur
Hrishikesh Deshpande, Pierre Maurel, Christian Barillot
titre
Adaptive Dictionary Learning For Competitive Classification Of Multiple Sclerosis Lesions
article
International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, New-York, United States
identifiant
hal-01121110
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-01121110/file/ISBI15_0473_MS_ISBI3.pdf BibTex
auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Christian Barillot
titre
Interpolation and Averaging of Multi-Compartment Model Images
article
18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2015, Munich, Germany. pp.354-362, ⟨10.1007/978-3-319-24571-3_43⟩
identifiant
inserm-01185733
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-24571-3_43
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https://inserm.hal.science/inserm-01185733/file/Miccai_2015_interpolation.pdf BibTex
auteur
Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Maxime Taquet, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Simon K. Warfield, Christian Barillot
titre
Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New York, United States. pp.717-720
identifiant
inserm-01118766
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https://inserm.hal.science/inserm-01118766/file/215_0204.pdf BibTex
auteur
Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Probabilistic One Class Learning for Automatic Detection of Multiple Sclerosis Lesions
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.486-489
identifiant
inserm-01127690
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https://inserm.hal.science/inserm-01127690/file/Yogesh_ISBI_Camera_Ready.pdf BibTex
auteur
Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
titre
Robust Detection of Multiple Sclerosis Lesions from Intensity-Normalized Multi-Channel MRI
article
SPIE Medical Imaging, Feb 2015, Orlando, United States
identifiant
inserm-01127692
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https://inserm.hal.science/inserm-01127692/file/Yogesh_camera_ready_SPIE.pdf BibTex
auteur
Thomas Oberlin, Christian Barillot, Rémi Gribonval, Pierre Maurel
titre
Symmetrical EEG-FMRI Imaging by Sparse Regularization
article
23rd European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2015), Aug 2015, Nice, France. pp.1-5, ⟨10.1109/EUSIPCO.2015.7362708⟩
identifiant
hal-01170889
DOI
DOI : 10.1109/EUSIPCO.2015.7362708
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https://hal.science/hal-01170889/file/oberlin_14011.pdf BibTex
auteur
Jean Pelletier, Jean-Philippe Ranjeva, Ayman Tourbah, Gilles Edan, Christian Barillot, Sophie Le Lamer, Bertrand Audoin, Audrey Rico, Lydie Crespy, Ben Ridley, W Zaaraoui, Sylviane Confort-Gouny, Maxime Guye, Adil Maarouf, Nathalie Caucheteux, Marie-Pierre Chaunu, Christophe Portefaix, Laurent Pierot, Olivier Commowick, Anne Kerbrat, Laurence Catanese, Valerie Cuvier, Julien Veys, Rebecca Pruss, Wilfried Hauke
titre
Results of a Phase 1b study to confirm safety and tolerability of olesoxime in multiple sclerosis patients
article
American Academy of Neurology, Apr 2015, Washington, DC, United States
identifiant
inserm-01244547
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auteur
Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Quantification of Myelin Degeneration in Multiple Sclerosis within Clinical Scan Times
article
ISMRM, May 2015, Toronto, Canada
identifiant
inserm-01113277
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auteur
Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Quantification de la fraction d’eau piégée dans la myéline – Faisabilité et évaluation clinique en SEP
article
SFRMBM, Mar 2015, Grenoble, France
identifiant
inserm-01121578
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Patents

auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Method of characterizing molecular diffusion within a body from a set of diffusionweighted magnetic resonance signals and apparatus for carrying out such a method
article
France, Patent n° : 069127 WO. 2015
identifiant
hal-01576709
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Poster communications

auteur
Renaud Hédouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
article
ESMRMB, Oct 2015, Edimbourg, United Kingdom. 2015
identifiant
inserm-01251208
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auteur
Pierre-Yves Jonin, Gabriel Besson, Jérémie Pariente, Renaud La Joie, Serge Belliard, Christian Barillot, Isabelle Corouge, Emmanuel J Barbeau
titre
When the extended hippocampal system is of no need for context-free memory: a case of developmental amnesia
article
Memory Mechanisms in Machine and Man, Sep 2015, Albi, France. 2015
identifiant
inserm-01246564
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2014

Journal articles

auteur
Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Ayman Tourbah, Isabelle Berry, Jean-Philippe Ranjeva, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
Predictive Value of Imaging Markers at Multiple Sclerosis Disease Onset Based on Gadolinium- and USPIO-Enhanced MRI and Machine Learning
article
PLoS ONE, 2014, 9 (4), pp.e93024. ⟨10.1371/journal.pone.0093024⟩
identifiant
hal-00971524
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0093024
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https://inria.hal.science/hal-00971524/file/journal.pone.0093024.PDF BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Robust estimation of the cerebral blood flow in arterial spin labelling
article
Magnetic Resonance Imaging, 2014, 32 (5), pp.497 - 504. ⟨10.1016/j.mri.2014.01.016⟩
identifiant
inserm-00942814
DOI
DOI : 10.1016/j.mri.2014.01.016
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https://inserm.hal.science/inserm-00942814/file/Maumet_MRI_2014_ASL-M-estimators.pdf BibTex
auteur
Kensaku Mori, Yoshinobu Sato, Christian Barillot, Nassir Navab
titre
Editorial for the MEDIA special issue on MICCAI 2013
article
Medical Image Analysis, 2014, 18 (8), ⟨10.1016/j.media.2014.08.001⟩
identifiant
hal-01576169
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2014.08.001
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auteur
Jan Petr, Jean-Christophe Ferré, Hélène Raoult, Elise Bannier, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Template-based approach for detecting motor task activation-related hyperperfusion in pulsed ASL data.
article
Human Brain Mapping, 2014, pp.1179-89. ⟨10.1002/hbm.22243⟩
identifiant
inserm-00800899
DOI
DOI : 10.1002/hbm.22243
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auteur
Hélène Raoult, Elise Bannier, Pierre Maurel, Clément Neyton, Jean-Christophe Ferré, Peter Schmitt, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
Hemodynamic Quantification in Brain Arteriovenous Malformations With Time-Resolved Spin-Labeled Magnetic Resonance Angiography
article
Stroke, 2014, 45 (8), pp.2461-4. ⟨10.1161/STROKEAHA.114.006080⟩
identifiant
inserm-01080106
DOI
DOI : 10.1161/STROKEAHA.114.006080
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Conference papers

auteur
Christian Barillot, Yogesh Karpate, Alessandro Crimi, Olivier Commowick
titre
Analyse d'images spatio-temporelles dans la Sclérose en Plaques
article
Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France
identifiant
hal-00988875
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https://hal.science/hal-00988875/file/Barillot_RFIA_2014_final.pdf BibTex
auteur
Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Simultaneous Estimation of T1, T2 and B1 Maps From Relaxometry MR Sequences
article
MICCAI Workshop on Intelligent Imaging Linking MR Acquisition and Processing, Sep 2014, United States. pp.16-23
identifiant
inserm-01052853
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https://inserm.hal.science/inserm-01052853/file/cao_intellmr2014.pdf BibTex
auteur
Fang Cao, Olivier Commowick, Camille Maumet, Christian Barillot
titre
Quantitative Relaxation Templates for the Human Brain at 3T
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.57-60
identifiant
inserm-00950843
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https://inserm.hal.science/inserm-00950843/file/paper.pdf BibTex
auteur
Hrishikesh Deshpande, Pierre Maurel, Christian Barillot
titre
Detection of Multiple Sclerosis Lesions using Sparse Representations and Dictionary Learning
article
2nd International Workshop on Sparsity Techniques in Medical Imaging (STMI), MICCAI 2014, Sep 2014, Boston, MA, United States
identifiant
hal-01087339
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https://inria.hal.science/hal-01087339/file/STMI-P-4.pdf BibTex
auteur
Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot, Gilles Edan
titre
Longitudinal Intensity Normalization in Multiple Sclerosis Patients
article
MICCAI Workshop on Clinical Image-based Procedures, Sep 2014, Boston, United States. pp.1-8
identifiant
inserm-01074699
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https://inserm.hal.science/inserm-01074699/file/Yogesh_Camera_Ready_CLIP_2014.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Christian Barillot, Simon K. Warfield
titre
Fast and robust detection of the optimal number of fascicles in diffusion images using model averaging theory
article
ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2629
identifiant
inserm-00993965
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https://inserm.hal.science/inserm-00993965/file/2629.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Fast Identification of Optimal Fascicle Configurations from Standard Clinical Diffusion MRI Using Akaike Information Criterion
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.238-241
identifiant
inserm-00987802
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https://inserm.hal.science/inserm-00987802/file/astamm_isbi2014.pdf BibTex

Proceedings

auteur
Polina Golland, Nobuhiko Hata, Christian Barillot, Joachim Hornegger, Robert Howe
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2014, Part I
article
Golland, Polina; Hata, Nobuhiko; Barillot, Christian; Hornegger, Joachim; Howe, Robert. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Bosoton, United States. 8673, Springer International Publishing , 2014, Lecture Notes in Computer Sciences, 978-3-319-10403-4. ⟨10.1007/978-3-319-10404-1⟩
identifiant
hal-01576310
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-10404-1
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auteur
Polina Golland, Nobuhiko Hata, Christian Barillot, Joachim Hornegger, Robert Howe
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2014, Part III
article
Golland, Polina; Hata, Nobuhiko; Barillot, Christian; Hornegger, Joachim; Howe, Robert. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. 8675, Springer International Publishing , 2014, Lecture Notes in Computer Sciences, 978-3-319-10442-3. ⟨10.1007/978-3-319-10443-0⟩
identifiant
hal-01576313
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-10443-0
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auteur
Polina Golland, Nobuhiko Hata, Christian Barillot, Joachim Hornegger, Robert Howe
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2014, Part II
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2014, Boston, United States. 8674, Springer International Publishing , 2014, Lecture Notes in Computer Sciences, 978-3-319-10469-0. ⟨10.1007/978-3-319-10470-6⟩
identifiant
hal-01576311
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-10470-6
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2013

Journal articles

auteur
Aurore Esquevin, Hélène Raoult, Serge Belliard, Isabelle Corouge, Elise Bannier, Florence Le Jeune, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré, Jean-Yves Gauvrit
titre
Étude de la perfusion cérébrale par Arterial Spin Labeling : principes et applications en neurosciences cliniques
article
Revue de neuropsychologie, 2013, 5 (2), pp.135-141. ⟨10.3917/rne.052.0135⟩
identifiant
inserm-00856795
DOI
DOI : 10.3917/rne.052.0135
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auteur
Jean-Christophe Ferré, Jan Petr, Christian Barillot, Hélène Raoult, Jean-Yves Gauvrit
titre
Optimal individual inversion time in brain arterial spin labeling perfusion magnetic resonance imaging: correlation with carotid hemodynamics measured with cine phase-contrast magnetic resonance imaging
article
Journal of Computer Assisted Tomography, 2013, 37 (2), pp.247-51. ⟨10.1097/RCT.0b013e31827cd548⟩
identifiant
inserm-00845274
DOI
DOI : 10.1097/RCT.0b013e31827cd548
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auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Béatrice Carsin, Christian Barillot
titre
Patient-specific detection of perfusion abnormalities combining within-subject and between-subject variances in Arterial Spin Labeling
article
NeuroImage, 2013, 81C, pp.121-130. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.04.079⟩
identifiant
inserm-00816852
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2013.04.079
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https://inserm.hal.science/inserm-00816852/file/Maumet_NeuroImage_2013.pdf BibTex
auteur
Hélène Raoult, Elise Bannier, Benjamin Robert, Christian Barillot, Peter Schmitt, Jean-Yves Gauvrit
titre
Time-resolved Spin-labeled MR Angiography for the Depiction of Cerebral Arteriovenous Malformations: A Comparison of Techniques
article
Radiology, 2013, pp.131252. ⟨10.1148/radiol.13131252⟩
identifiant
inserm-00945211
DOI
DOI : 10.1148/radiol.13131252
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Conference papers

auteur
Isabelle Corouge, Elise Bannier, David Travers, Camille Maumet, Jean-Christophe Ferré, Alain Patat, Dominique Drapier, Christian Barillot
titre
Functional Arterial Spin Labeling during a working memory task MRI at 3T. Comparison with BOLD fMRI
article
ESMRMB, Oct 2013, Toulouse, France. pp.242
identifiant
inserm-00936671
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auteur
Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
Semi-Automatic Classification of Lesion Patterns in Patients with Clinically Isolated Syndrome
article
International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1102-1105, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556671⟩
identifiant
inserm-00800723
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556671
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https://inserm.hal.science/inserm-00800723/file/Crimi_Isbi_2013.pdf BibTex
auteur
Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
Multiple Sclerosis Lesions Evolution in Patients with Clinically Isolated Syndrome
article
SPIE Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, United States. pp.86690I-86690I-8
identifiant
inserm-00781478
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https://inserm.hal.science/inserm-00781478/file/8669_17.PDF BibTex
auteur
Aurore Esquevin, Jean-Christophe Ferré, Florence Le Jeune, Aymeric Stamm, Catherine Merck, Elise Bannier, Serge Belliard, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
Arterial Spin Labeling in Semantic Dementia: Hypoperfusion's Detection and Diagnostic Accuracy. Could It Make as Well as FDG-PET?
article
RSNA, Nov 2013, Paris, France. pp.NA
identifiant
inserm-00936680
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auteur
Aurore Esquevin, Isabelle Corouge, Florence Le Jeune, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Catherine Merck, Serge Belliard, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
Arterial spin labeling magnetic resonance and fluorodeoxyglucose-positron emission tomography imaging in semantic dementia: group voxel-wise analysis
article
European Congress of Radiology (ECR), Mar 2013, Austria
identifiant
inserm-00772597
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auteur
Guillaume Koch, Elise Bannier, Agathe Baumann, Stéphanie Ferragut, Mathieu Lamard, Christian Barillot, Eric Stindel, Romuald Seizeur
titre
3D visual fMRI using binocular stimulation
article
ESMRMB, Oct 2013, Toulouse, France. pp.NA
identifiant
inserm-00858344
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auteur
Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, W Zaaraoui, Elise Bannier, Christian Barillot, Isabelle Berry, Gilles Edan, Damien Galanaud, Jean Pelletier, Christophe Portefaix, Ayman Tourbah, Jean Philippe Ranjeva, Bertrand Audoin
titre
Impact of Macrophagic Activity on Tissue Structure in Patients Suffering from Clinically Isolated Syndrome Suggestive of Multiple Sclerosis: A Multicentric USPIO Enhancement Study at 3T
article
ISMRM, Apr 2013, Salt Lake City, France. pp.50
identifiant
inserm-00858282
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BibTex
auteur
Meenakshi Mani, Anuj Srivastava, Christian Barillot
titre
Morphological changes in the corpus callosum: A study using a joint Riemannian feature spaces
article
SPIE Medical Imaging: Image Processing, Feb 2013, Orlando, FL, United States. pp.866908, ⟨10.1117/12.2007226⟩
identifiant
inserm-00851511
DOI
DOI : 10.1117/12.2007226
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https://inserm.hal.science/inserm-00851511/file/spie_2013.pdf BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
An a contrario approach for the detection of activated brain areas in fMRI
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine 21st Annual Meeting & Exhibition (ISMRM), Apr 2013, Salt Lake City, United States. pp.3260
identifiant
inserm-00784860
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https://inserm.hal.science/inserm-00784860/file/Maumet_ISMRM2013_fmri_a_contrario.pdf BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Robust perfusion maps in Arterial Spin Labeling by means of M-estimators
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine 21st Annual Meeting & Exhibition (ISMRM), Apr 2013, Salt Lake City, United States. pp.3037
identifiant
inserm-00784862
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https://inserm.hal.science/inserm-00784862/file/Maumet_ISMRM2013_outliers.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Tracking the Cortico-Spinal Tract from Low Spatial and Angular Resolution Diffusion MRI
article
MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge on Peritumoral White Matter Anatomy for Neurosurgical Decision-Making, Sep 2013, Japan. pp.43-53
identifiant
inserm-00849274
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https://inserm.hal.science/inserm-00849274/file/DTIChallenge_Article_2013.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Christian Barillot, Patrick Pérez
titre
Adaptive Multi-modal Particle Filtering for Probabilistic White Matter Tractography
article
Information Processing in Medical Imaging, Jul 2013, Monterey, United States. pp.594-606, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_50⟩
identifiant
inserm-00849053
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-38868-2_50
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https://inserm.hal.science/inserm-00849053/file/astamm_ipmi2013.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Vallee, Olivier Commowick, Camille Maumet, Aymeric Stamm, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Jean-Christophe Ferré, Clément de Guibert, Christian Barillot
titre
Statistical Analysis of White Matter Integrity for the Clinical Study of Specific Language Impairment in Children
article
MICCAI 2013 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2013, Japan. pp.187-195, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_17⟩
identifiant
inserm-00849267
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-02475-2_17
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https://inserm.hal.science/inserm-00849267/file/CDMRI13_Vallee.pdf BibTex

Proceedings

auteur
Mori Kensaku, Sakuma Ichiro, Sato Yoshinobu, Christian Barillot, Navab Nassir
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2013 Part III
article
Kensaku Mori; Ichiro Sakuma; Yoshinobu Sato; Christian Barillot; Nassir Navab. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. 8151, Springer-Verlag, 2013, Lecture Notes in Computer Sciences, 978-3-642-40759-8. ⟨10.1007/978-3-642-40760-4⟩
identifiant
inserm-01576303
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40760-4
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BibTex
auteur
Mori Kensaku, Sakuma Ichiro, Sato Yoshinobu, Christian Barillot, Navab Nassir
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2013 - Part 2
article
Kensaku Mori; Ichiro Sakuma; Yoshinobu Sato; Christian Barillot; Nassir Navab. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. 8150, Springer-Verlag, 2013, Lecture Notes in Computer Sciences, 978-3-642-40762-8. ⟨10.1007/978-3-642-40763-5⟩
identifiant
inserm-01576301
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40763-5
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BibTex
auteur
Kensaku Mori, Ichiro Sakuma, Yoshinobu Sato, Christian Barillot, Nassir Navab
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2013 - Part 1
article
Kensaku Mori; Ichiro Sakuma; Yoshinobu Sato; Christian Barillot; Nassir Navab. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. 8149, Springer-Verlag, 2013, Lecture Notes in Computer Sciences, 978-3-642-40810-6. ⟨10.1007/978-3-642-40811-3⟩
identifiant
hal-01577000
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-40811-3
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BibTex

Reports

auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Béatrice Carsin, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Patient-Specific Detection of Perfusion Abnormalities Combining Within- and Between-Subject Variances in ASL
article
[Research Report] RR-8216, INRIA. 2013
identifiant
hal-00781247
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https://inria.hal.science/hal-00781247/file/RR-8216.pdf BibTex
auteur
Lei Yu, Pierre Maurel, Christian Barillot, Rémi Gribonval
titre
Quantifying CBF from Arterial Spin Labeling via Diverse-TI: sampling diversity or repetitions ?
article
[Research Report] RR-8258, INRIA Rennes - Bretagne Atlantique; INRIA. 2013
identifiant
hal-00799718
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https://inria.hal.science/hal-00799718/file/RR_8258.pdf BibTex

2012

Journal articles

auteur
Jean-Christophe Ferré, Jan Petr, Elise Bannier, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
Improving quality of arterial spin labeling MR imaging at 3 Tesla with a 32-channel coil and parallel imaging.
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, 2012, 35 (5), pp.1233-9. ⟨10.1002/jmri.23586⟩
identifiant
inserm-00723540
DOI
DOI : 10.1002/jmri.23586
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00723540/file/ASL_32cx_jmri2012.pdf BibTex
auteur
Hélène Raoult, Jean-Christophe Ferré, Jan Petr, Elise Bannier, Aymeric Stamm, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
Functional arterial spin labeling: Optimal sequence duration for motor activation mapping in clinical practice.
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, 2012, 36 (6), pp.1435-44. ⟨10.1002/jmri.23782⟩
identifiant
inserm-00727889
DOI
DOI : 10.1002/jmri.23782
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Conference papers

auteur
Elise Bannier, Camille Maumet, Anca Pasnicu, Jean-Christophe Ferré, Eduardo Pasqualini, Arnaud Biraben, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Voxel Based Analysis of 3D Double Inversion Recovery for the detection of cortical abnormalities in drug resistant epilepsy
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine 20th Annual Meeting & Exhibition (ISMRM), May 2012, Melbourne, Australia. pp.3244
identifiant
inserm-00686834
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auteur
Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
MRI Estimation of T1 Relaxation Time Using a Constrained Optimization Algorithm
article
MBIA 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.203-214
identifiant
inserm-00723849
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https://inserm.hal.science/inserm-00723849/file/workshop.pdf BibTex
auteur
Isabelle Corouge, Aurore Esquevin, Florence Le Jeune, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Catherine Merck, Serge Belliard, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
Arterial Spin Labeling at 3T in semantic dementia: perfusion abnormalities detection and comparison with FDG-PET
article
MICCAI 2012 Workshop on Novel Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders, Oct 2012, Nice, France. pp.32-40
identifiant
inserm-00730431
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https://inserm.hal.science/inserm-00730431/file/corouge.pdf BibTex
auteur
Aurore Esquevin, Florence Le Jeune, Serge Belliard, Jean-Christophe Ferré, Isabelle Corouge, Elise Bannier, Christian Barillot, Catherine Merck, Jean-Yves Gauvrit
titre
Arterial Spin Labeling et TEP-FDG dans la démence sémantique
article
Journées Françaises de Radiologie, Oct 2012, France
identifiant
inserm-00772588
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auteur
Aurore Esquevin, Jean-Christophe Ferré, Serge Belliard, Isabelle Corouge, Elise Bannier, Christian Barillot, Catherine Merck, Jean-Yves Gauvrit, Florence Le Jeune
titre
Fluorodeoxyglucose-Positron Emission Tomography in Semantic Dementia and Correlation with Arterial Spin Labeling Magnetic Resonance Imaging
article
Annual Congress of the European Association of Nuclear Medicine (EANM), Oct 2012, Italy
identifiant
inserm-00772593
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auteur
Aurore Esquevin, Isabelle Corouge, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Catherine Merck, Florence Le Jeune, Serge Belliard, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
Arterial spin labeling at 3T in semantic dementia: Perfusion abnormalities detection
article
ISMRM scientific workshop. Perfusion MRI: Standardization, Beyond CBF & Everyday Clinical Applications,, Oct 2012, Netherlands. pp.39
identifiant
inserm-00772291
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auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Christian Barillot
titre
Using negative signal in mono-TI pulsed arterial spin labeling to outline pathological increases in arterial transit times
article
ISMRM Scientific Workshop. Perfusion MRI: Standardization, Beyond CBF & Everyday Clinical Applications, Oct 2012, Amsterdam, Netherlands. pp.42
identifiant
inserm-00767119
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https://inserm.hal.science/inserm-00767119/file/Maumet_ISMRM_Perfusion2012_Negative_signal.pdf BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Automatic detection of perfusion abnormalities based on an Arterial Spin Labeling template
article
ISMRM scientific workshop. Perfusion MRI: Standardization, Beyond CBF & Everyday Clinical Applications, Oct 2012, Netherlands. pp.8
identifiant
inserm-00767115
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https://inserm.hal.science/inserm-00767115/file/Maumet_ISMRM_Perfusion2012_Hypo_hyper_perfusions.pdf BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
A comprehensive framework for the detection of individual brain perfusion abnormalities using Arterial Spin Labeling
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. pp.542-549
identifiant
inserm-00720593
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https://inserm.hal.science/inserm-00720593/file/Maumet_MICCAI2012.pdf BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Robust Cerebral Blood Flow Map Estimation in Arterial Spin Labeling
article
International Workshop on Multimodal Brain Image Analysis (MBIA), held in conjunction with MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.215-224
identifiant
inserm-00724974
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https://inserm.hal.science/inserm-00724974/file/Maumet_MBIA2012.pdf BibTex
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
A contrario detection of focal brain perfusion abnormalities based on an Arterial Spin Labeling template
article
9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), May 2012, Barcelona, Spain. pp.1176-1179
identifiant
inserm-00677106
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https://inserm.hal.science/inserm-00677106/file/Maumet_ISBI2012.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model: Part II
article
MICCAI 2012 DTI Tractography Challenge, Oct 2012, Nice, France. pp.12-20
identifiant
inserm-00725366
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https://inserm.hal.science/inserm-00725366/file/Workshop_DDITracto.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
A new multi-directional fiber model for low angular resolution diffusion imaging
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2012, Australia. pp.908
identifiant
inserm-00858206
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https://inserm.hal.science/inserm-00858206/file/Stamm_A._PA_rez_P._Barillot_C._-_ISMRM_2012_-_A_new_multi-directional_fiber_model_for_LARDI.pdf BibTex
auteur
Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
A new multi-fiber model for low angular resolution diffusion MRI
article
International Symposium on Biomedical Imaging, May 2012, Spain. pp.936-9
identifiant
inserm-00858205
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https://inserm.hal.science/inserm-00858205/file/ISBI_Stamm_vf.pdf BibTex
auteur
Lei Yu, Pierre Maurel, Christian Barillot, Rémi Gribonval
titre
Compressive Matched Filter for Cerebral Blood Flow Quantification with ASL: sampling diversity or repetition?
article
Miccai Workshop on Sparsity Techniques in Medical Imaging (STMI'12), Oct 2012, Nice, France. pp.0-0
identifiant
hal-00762774
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https://hal.science/hal-00762774/file/Compressive_Matched_Filter_for_Cerebral_Blood_Flow_Quantification_with_ASL.pdf BibTex

Book sections

auteur
Jean-Marie Scarabin, Philippe Mercier, Matthieu Delion, Christian Barillot, Pierre Jannin, Bernard Gibaud, Eric Berton
titre
From Bourgery's anatomy to multiparameter, 3D, digital imaging, individual for each patient.
article
Jean-Marie Scarabin. Stereotaxy and Epilepsy Surgery, John Libbey Eurotext, 41-90 chap.2, 2012, 978-2-7420-0767-7
identifiant
hal-00905721
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Patents

auteur
Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Diffusion MRI for detecting a direction of at least one fibre in a body
article
Patent n° : 2458397. 2012
identifiant
inserm-00858209
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Documents associated with scientific events

auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Automatic detection of perfusion abnormalities based on an Arterial Spin Labeling template
article
ISMRM Scientific Workshop: Perfusion MRI 2012, Oct 2012, Amsterdam, Netherlands. , 2012
identifiant
hal-04091251
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https://inria.hal.science/hal-04091251/file/Camille_Maumet_2012-10_Oral_ISMRM_Perfusion_Workshop.pdf BibTex

2011

Journal articles

auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
titre
3D Rigid Registration of Intraoperative Ultrasound and Preoperative MR Brain Images based on Hyperechogenic Structures
article
International Journal of Biomedical Imaging, 2011, pp.53131
identifiant
hal-00645546
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https://hal.science/hal-00645546/file/Coupe_JIBI2011.pdf BibTex
auteur
Clément de Guibert, Camille Maumet, Pierre Jannin, Jean-Christophe Ferré, Catherine Tréguier, Christian Barillot, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Arnaud Biraben
titre
Abnormal functional lateralization and activity of language brain areas in typical specific language impairment (developmental dysphasia)
article
Brain - A Journal of Neurology , 2011, 134 (Pt 10), pp.3044-58. ⟨10.1093/brain/awr141⟩
identifiant
inserm-00607180
DOI
DOI : 10.1093/brain/awr141
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https://inserm.hal.science/inserm-00607180/file/2011%20Abnormal%20functional%20lateral%20and%20activity%20dysphasia%2C%20Authors%20version.pdf BibTex
auteur
Daniel García-Lorenzo, Sylvain Prima, Douglas L. Arnold, Louis D. Collins, Christian Barillot
titre
Trimmed-likelihood estimation for focal lesions and tissue segmentation in multisequence MRI for multiple sclerosis.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (8), pp.1455-67. ⟨10.1109/TMI.2011.2114671⟩
identifiant
inserm-00590724
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2011.2114671
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https://inserm.hal.science/inserm-00590724/file/TMI2011.pdf https://inserm.hal.science/inserm-00590724/file/inserm-00590724_edited.pdf BibTex
auteur
Lei Lin, Daniel Garcia-Lorenzo, Chong Li, Jiang Tianzi, Christian Barillot
titre
Adaptive pixon represented segmentation (APRS) for 3D MR brain images based on mean shift and Markov random fields
article
Pattern Recognition Letters, 2011, 32 (7), pp.1036-1043. ⟨10.1016/j.patrec.2011.02.016⟩
identifiant
inserm-00723811
DOI
DOI : 10.1016/j.patrec.2011.02.016
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https://inserm.hal.science/inserm-00723811/file/LeiLin_Patrec11.pdf BibTex
auteur
Jan Petr, Elise Bannier, Hélène Raoult, Jean-Christophe Ferré, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Evaluation of functional arterial spin labeling data using a perfusion template
article
BMC Neuroscience, 2011, 12 (Suppl 1), pp.P9
identifiant
inserm-00610654
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https://inserm.hal.science/inserm-00610654/file/1471-2202-12-S1-P9.pdf BibTex
auteur
Jan Petr, Elise Bannier, Hélène Raoult, Jean-Christophe Ferré, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Evaluation of functional arterial spin labeling data using a perfusion template
article
BMC Neuroscience, 2011, 12 (Suppl 1), pp.P9
identifiant
hal-01070256
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https://inria.hal.science/hal-01070256/file/1471-2202-12-S1-P9.pdf BibTex
auteur
Hélène Raoult, Jan Petr, Jean-Yves Gauvrit, Aymeric Stamm, Elise Bannier, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré
titre
Innovations in functional MR imaging of the brain: arterial spin labeling and diffusion
article
Journal de Radiologie, 2011, 92 (10), pp.878-88. ⟨10.1016/j.jradio.2011.04.016⟩
identifiant
inserm-00601140
DOI
DOI : 10.1016/j.jradio.2011.04.016
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auteur
Hélène Raoult, Jan Petr, Elise Bannier, Aymeric Stamm, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré
titre
Arterial spin labeling for motor activation mapping at 3T with a 32-channel coil: Reproducibility and spatial accuracy in comparison with BOLD fMRI.
article
NeuroImage, 2011, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.neuroimage.2011.06.011⟩
identifiant
inserm-00604941
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2011.06.011
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Conference papers

auteur
Catherine Allaire, Clément de Guibert, Camille Maumet, Pierre Jannin, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Catherine Tréguier, Elisabeth Le Rumeur, Arnaud Biraben
titre
Mécanismes physiopathologiques des dysphasies développementales de l'enfant : Apport de l'IRM fonctionnelle à 3 Teslas
article
Société française de neuropédiatrie, Jan 2011, Lyon, France
identifiant
inserm-00609088
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auteur
Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Romuald Seizeur, Patrick Pérez, Christian Barillot, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé
titre
Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model
article
MICCAI 2011 DTI Tractography Challenge Workshop, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.18-24
identifiant
inserm-00627893
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https://inserm.hal.science/inserm-00627893/file/Workshop_DDITracto.pdf BibTex
auteur
Michel Dojat, Mélanie Pélégrini-Issac, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Alban Gaignard, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Franck Michel, Johan Montagnat, Xavier Pennec, Javier Balderrama, Bacem Wali
titre
NeuroLOG: A framework for the sharing and reuse of distributed tools and data in neuroimaging
article
Organization for Human Brain Mapping (HBM'11), Jun 2011, Quebec, Canada
identifiant
hal-00813796
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auteur
Bernard Gibaud, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Franck Michel, Bacem Wali, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Pascal Girard, Alban Gaignard, Diane Lingrand, Johan Montagnat, Javier Rojas Balderrama, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, David Godard, Gilles Kassel, Mélanie Pélégrini-Issac
titre
A federated system for sharing and reuse of images and image processing tools in neuroimaging
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'11), Jun 2011, Berlin, Germany
identifiant
hal-00690921
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auteur
Jan Petr, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Hélène Raoult, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Construction and evaluation of a quantitative arterial spin labeling brain perfusion template at 3T
article
8th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'2011), Mar 2011, Chicago, United States. pp.1035, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872578⟩
identifiant
inserm-00601149
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872578
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https://inserm.hal.science/inserm-00601149/file/Petr11a.pdf BibTex
auteur
Hélène Raoult, Jan Petr, Jean-Yves Gauvrit, Aymeric Stamm, Elise Bannier, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré
titre
Reproducibility of Arterial Spin Labeling for Motor Activation Mapping: Evaluation of a short 3 min duration sequence
article
European Congress of Radiology (ECR 2011), Mar 2011, Vienna, Austria
identifiant
inserm-00601145
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auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot, Romuald Seizeur, Sylvain Prima
titre
Comparison of 3 Diffusion Models to Track the Hand Motor Fibers within the Corticospinal Tract Using Functional, Anatomical and Diffusion MRI
article
MICCAI 2011 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'11), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.150-157
identifiant
inserm-00628264
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https://inserm.hal.science/inserm-00628264/file/Tractography_CDMRI_2011.pdf BibTex

Reports

auteur
Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot
titre
Diffusion Directions Imaging (DDI)
article
[Research Report] RR-7683, INRIA. 2011, pp.28
identifiant
inria-00608706
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https://inria.hal.science/inria-00608706/file/RR-7683.pdf BibTex

2010

Journal articles

auteur
Clément de Guibert, Camille Maumet, Jean-Christophe Ferré, Pierre Jannin, Arnaud Biraben, Catherine Allaire, Christian Barillot, Elisabeth Le Rumeur
titre
FMRI language mapping in children: a panel of language tasks using visual and auditory stimulation without reading or metalinguistic requirements.
article
NeuroImage, 2010, 51 (2), pp.897-909. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.02.054⟩
identifiant
inserm-00461666
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2010.02.054
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https://inserm.hal.science/inserm-00461666/file/2010_de_Guibert_fMRI_language_mapping_children.pdf BibTex
auteur
Claire Haegelen, Daniel García-Lorenzo, Florence Le Jeune, Julie Péron, Bernard Gibaud, Laurent Riffaud, Gilles Brassier, Christian Barillot, Marc Vérin, Xavier Morandi
titre
SPECT and PET analysis of subthalamic stimulation in Parkinson's disease: analysis using a manual segmentation.
article
Journal of Neurology, 2010, 257 (3), pp.375-82. ⟨10.1007/s00415-009-5327-8⟩
identifiant
inserm-00627211
DOI
DOI : 10.1007/s00415-009-5327-8
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BibTex
auteur
Cecilia Nauczyciel, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Sophie Blestel, Dominique Drapier, Jean-Christophe Ferre, Christian Barillot, Bruno Millet
titre
Assessment of standard coil positioning in transcranial magnetic stimulation in depression
article
Psychiatry Research, 2010, 186 (2-3), pp.232-238. ⟨10.1016/j.psychres.2010.06.012⟩
identifiant
inria-00535787
DOI
DOI : 10.1016/j.psychres.2010.06.012
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Conference papers

auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
titre
Intraoperative ultrasonography for the correction of brainshift based on the matching of hyperechogenic structures
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.1405 - 1408, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490261⟩
identifiant
inserm-00515405
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490261
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https://inserm.hal.science/inserm-00515405/file/ISBI2009final.pdf BibTex
auteur
Ryan Datteri, Christian Barillot, Benoit M. Dawant, Jérémy Lecoeur
titre
Segmentation of the Thalamus in Multi-Spectral MR Images Using a Combination of Atlas-Based and Gradient Graph Cut Methods
article
SPIE: medical imaging, Feb 2010, San Diego, United States. pp.76233N
identifiant
inria-00456242
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https://inria.hal.science/inria-00456242/file/SPIE_Final_paper.pdf BibTex
auteur
Jean-Christophe Ferré, Jan Petr, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Perfusion cérébrale par ASL Pulsé à 3T : quel est le TI optimal?
article
Journées Françaises de Radiologie, Oct 2010, Paris, France
identifiant
inserm-00601134
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https://inserm.hal.science/inserm-00601134/file/Ferre10a.pdf BibTex
auteur
Jean-Christophe Ferré, Jan Petr, Christian Barillot, Jean-Yves Gauvrit
titre
La qualité des cartographies perfusionnelles d'ASL pulsé à 3T est-elle corrélée au débit artériel?
article
Journées Françaises de Radiologie, Oct 2010, Paris, France
identifiant
inserm-00601137
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https://inserm.hal.science/inserm-00601137/file/Ferre10b.pdf BibTex
auteur
Florence Forbes, Senan Doyle, Daniel Garcia-Lorenzo, Christian Barillot, Michel Dojat
titre
A Weighted Multi-Sequence Markov Model For Brain Lesion Segmentation
article
13th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics - AISTATS 2010, May 2010, Sardinia, Italy. pp.225-232
identifiant
inserm-00723808
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https://inserm.hal.science/inserm-00723808/file/Forbes_aistats_2010_paper.pdf BibTex
auteur
Florence Forbes, Senan Doyle, Daniel Garcia-Lorenzo, Christian Barillot, Michel Dojat
titre
Adaptive weighted fusion of multiple MR sequences for brain lesion segmentation
article
2010 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.69-72, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490413⟩
identifiant
inserm-00723807
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490413
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https://inserm.hal.science/inserm-00723807/file/isbi2010_FF.pdf BibTex
auteur
Arnaud Le Guen, Jean-Yves Gauvrit, Jan Petr, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré
titre
Optimisation et reproductibilité d'une séquence d'arterial spin labeling cérébrale à 3 Tesla
article
37ème Congrès annuel de la Société Française de Neuroradiologie, Mar 2010, Paris, France
identifiant
inserm-00601142
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https://inserm.hal.science/inserm-00601142/file/LeGuen10b.pdf BibTex
auteur
Arnaud Le Guen, Jean-Yves Gauvrit, Jan Petr, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré
titre
Optimization and reproducibility of brain arterial spin labeling sequence at 3 Tesla
article
European Congress of Radiology (ECR 2010), Mar 2010, Vienna, Austria
identifiant
inserm-00601144
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BibTex
auteur
Jérémy Lecoeur, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Segmentation multimodale optimale par coupe de graphe multispectral : applications aux lésions de sclérose en plaques en IRM
article
17ème conférence en Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle, Jan 2010, Caen, France. pp.5B-2
identifiant
inria-00449510
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https://inria.hal.science/inria-00449510/file/RFIA_optim.pdf BibTex
auteur
Meena Mani, Sebastian Kurtek, Christian Barillot, Anuj Srivastava
titre
A Comprehensive Riemannian Framework for the Analysis of White Matter Fiber Tracts
article
IEEE-ISBI, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.1101- 1104, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490185⟩
identifiant
inserm-00723805
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490185
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https://inserm.hal.science/inserm-00723805/file/ISBI_Mani_3.pdf BibTex
auteur
Franck Michel, Alban Gaignard, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Mélanie Pélégrini-Issac, Xavier Pennec, Javier Rojas Balderrama, Bacem Wali
titre
Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.
article
HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. pp.112-123, ⟨10.3233/978-1-60750-583-9-112⟩
identifiant
inserm-00512799
DOI
DOI : 10.3233/978-1-60750-583-9-112
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https://inserm.hal.science/inserm-00512799/file/neurolog_healthgrid_2010.pdf https://inserm.hal.science/inserm-00512799/file/inserm-00512799_edited.pdf BibTex
auteur
Jan Petr, Jean-Christophe Ferré, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Denoising arterial spin labeling MRI using tissue partial volume
article
SPIE Medical Imaging 2010: Image Processing, Feb 2010, San Diego, United States. pp.n.a, ⟨10.1117/12.844443⟩
identifiant
inserm-00601147
DOI
DOI : 10.1117/12.844443
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00601147/file/Petr10b.pdf BibTex
auteur
Jan Petr, Jean-Christophe Ferré, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
titre
Improving arterial spin labeling by temporal filtering
article
SPIE Medical Imaging 2010: Image Processing, Feb 2010, San Diego, United States. pp.n.a, ⟨10.1117/12.843960⟩
identifiant
inserm-00601146
DOI
DOI : 10.1117/12.843960
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https://inserm.hal.science/inserm-00601146/file/Petr10a.pdf BibTex

2009

Journal articles

auteur
Cybèle Ciofolo, Christian Barillot
titre
Atlas-based segmentation of 3D cerebral structures with competitive level sets and fuzzy control.
article
Medical Image Analysis, 2009, 13 (3), pp.456-70. ⟨10.1016/j.media.2009.02.008⟩
identifiant
inserm-00443873
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2009.02.008
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auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Charles Kervrann, Christian Barillot
titre
Nonlocal means-based speckle filtering for ultrasound images.
article
IEEE Transactions on Image Processing, 2009, 18 (10), pp.2221-9. ⟨10.1109/TIP.2009.2024064⟩
identifiant
inserm-00428524
DOI
DOI : 10.1109/TIP.2009.2024064
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https://inserm.hal.science/inserm-00428524/file/TIP-04410-onecolumn.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Maxime Descoteaux, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Christian Barillot, Rachid Deriche, Cyril Poupon
titre
NEX or no NEX? A high angular resolution diffusion imaging study
article
ISMRM 2009 : Annual Meeting of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine, Apr 2009, Honolulu, United States. pp.1398
identifiant
hal-00788717
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auteur
Daniel García-Lorenzo, Jérémy Lecoeur, Douglas L. Arnold, D. Louis Collins, Christian Barillot
titre
Multiple Sclerosis lesion segmentation using an automatic multimodal Graph Cuts
article
12th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2009, Londres, United Kingdom. pp.584-591, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3⟩
identifiant
inria-00423040
DOI
DOI : 10.1007/978-3-642-04271-3
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https://inria.hal.science/inria-00423040/file/09-MICCAI-Graphcuts.pdf BibTex
auteur
Jérémy Lecoeur, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
titre
Optimized supervised segmentation of MS lesions from multispectral MRIs
article
MICCAI workshop on Medical Image Analysis on Multiple Sclerosis (validation and methodological issues), Sep 2009, Londres, United Kingdom
identifiant
inria-00410442
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https://inria.hal.science/inria-00410442/file/MIAMS_09.pdf BibTex
auteur
Jérémy Lecoeur, Jean-Christophe Ferré, D. Louis Collins, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
titre
Multi Channel MRI Segmentation With Graph Cuts Using Spectral Gradient And Multidimensional Gaussian Mixture Model
article
SPIE - Medical Imaging, Feb 2009, Orlando, United States. pp.72593X1-72593X11, ⟨10.1117/12.811108⟩
identifiant
inria-00354050
DOI
DOI : 10.1117/12.811108
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https://inria.hal.science/inria-00354050/file/spie.pdf BibTex

2008

Journal articles

auteur
Pierrick Coupé, Pierre Yger, Sylvain Prima, Pierre Hellier, Charles Kervrann, Christian Barillot
titre
An optimized blockwise nonlocal means denoising filter for 3-D magnetic resonance images.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2008, 27 (4), pp.425-41. ⟨10.1109/TMI.2007.906087⟩
identifiant
inserm-00169658
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2007.906087
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https://inserm.hal.science/inserm-00169658/file/Coupe07c.pdf https://inserm.hal.science/inserm-00169658/file/inserm-00169658_edited.pdf BibTex
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Sylvain Prima, Charles Kervrann, Christian Barillot
titre
3D Wavelet Sub-Bands Mixing for Image Denoising
article
International Journal of Biomedical Imaging, 2008, 2008 (Article ID 590183), pp.590183. ⟨10.1155/2008/590183⟩
identifiant
inria-00332001
DOI
DOI : 10.1155/2008/590183
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https://inria.hal.science/inria-00332001/file/Coupe08a.pdf BibTex
auteur
Simon Duchesne, Anna Caroli, Cristina Geroldi, Christian Barillot, Giovanni B. Frisoni, Louis D. Collins
titre
MRI-based automated computer classification of probable AD versus normal controls.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2008, 27 (4), pp.509-20. ⟨10.1109/TMI.2007.908685⟩
identifiant
inserm-00333460
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2007.908685
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https://inserm.hal.science/inserm-00333460/file/Duchesne08.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Charles Kervrann, Christian Barillot
titre
Bayesian Non Local Means-Based Speckle filtering
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, May 2008, Paris, France
identifiant
inria-00283477
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https://inria.hal.science/inria-00283477/file/Coupe08c.pdf BibTex
auteur
Maxime Descoteaux, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Christian Barillot, Rachid Deriche
titre
Impact of Rician Adapted Non-Local Means Filtering on HARDI
article
Medical image computing and computer-assisted intervention - MICCAI 2008, Sep 2008, New-York, United States. ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_15⟩
identifiant
inria-00423318
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_15
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https://inria.hal.science/inria-00423318/file/WiestDaessle08c.pdf BibTex
auteur
Daniel García-Lorenzo, Sylvain Prima, D. Louis Collins, Douglas L. Arnold, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
titre
Combining Robust Expectation Maximization and Mean Shift algorithms for Multiple Sclerosis Brain Segmentation
article
MICCAI workshop on Medical Image Analysis on Multiple Sclerosis (validation and methodological issues) (MIAMS'2008), Sep 2008, New York, United States. pp.82-91
identifiant
inserm-00421706
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https://inserm.hal.science/inserm-00421706/file/miccai-ms4ms.pdf BibTex
auteur
Daniel García-Lorenzo, Sylvain Prima, Laura Parkes, Jean-Christophe Ferré, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
titre
The impact of processing workflow in performance of automatic white matter lesion segmentation in Multiple Sclerosis
article
MICCAI workshop on Medical Image Analysis on Multiple Sclerosis (validation and methodological issues) (MIAMS'2008), Sep 2008, New York, United States. pp.104-112
identifiant
inserm-00421702
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https://inserm.hal.science/inserm-00421702/file/miccai-validation.pdf BibTex
auteur
Daniel García-Lorenzo, Sylvain Prima, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
titre
A robust Expectation-Maximization algorithm for Multiple Sclerosis lesion segmentation
article
MICCAI Workshop: 3D Segmentation in the Clinic: A Grand Challenge II, MS lesion segmentation, Sep 2008, New York, United States. pp.277
identifiant
inserm-00421713
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https://inserm.hal.science/inserm-00421713/file/08-wMiccai-challenge.pdf BibTex
auteur
Jérémy Lecoeur, Sean Patrick Morrissey, Jean-Christophe Ferré, Douglas L. Arnold, D. Louis Collins, Christian Barillot
titre
Multiple Sclerosis Lesions Segmentation using Spectral Gradient and Graph Cuts
article
Medical Image Analysis on Multiple Sclerosis (validation and methodological issues), Sep 2008, New York City, United States
identifiant
inria-00323042
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https://inria.hal.science/inria-00323042/file/Lecoeur_MIAMS08.pdf BibTex
auteur
Mani Meena, Srivastava Anuj, Christian Barillot
titre
The Labeling of Cortical Sulci using Multidimensional Scaling
article
MICCAI Workshop - Manifolds in Medical Imaging: Metrics, Learning and Beyond, Sep 2008, New-York, United States
identifiant
inserm-00335194
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https://inserm.hal.science/inserm-00335194/file/1_mmi_mani.pdf BibTex
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
titre
Automated DTI analysis of MS lesions and their contralateral regions of interest using the mid-sagittal plane as a reference
article
MICCAI workshop on Medical Image Analysis on Multiple Sclerosis (validation and methodological issues) (MIAMS'2008), Sep 2008, New York, United States. pp.51-59
identifiant
inserm-00590412
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https://inserm.hal.science/inserm-00590412/file/MIAMS2008.pdf BibTex
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Pierrick Coupé, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
titre
Rician noise removal by non-Local Means filtering for low signal-to-noise ratio MRI: applications to DT-MRI.
article
11th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. pp.171-9, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_21⟩
identifiant
inserm-00332388
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_21
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https://inserm.hal.science/inserm-00332388/file/Miccai08_DenoisingRician.pdf https://inserm.hal.science/inserm-00332388/file/inserm-00332388_edited.pdf BibTex

2007

Journal articles

auteur
Christian Barillot
titre
The Increasing Influence of Medical image Processing In Clinical Neuroimaging
article
Cellular and Molecular Biology, 2007, 52 (6), pp.31-38
identifiant
inserm-00109381
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BibTex
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
titre
Probe Trajectory Interpolation for 3D Reconstruction of Freehand Ultrasound
article
Medical Image Analysis, 2007
identifiant
inria-00154571
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https://inria.hal.science/inria-00154571/file/Coupe_Media07.pdf BibTex
auteur
Duygu Tosun, Simon Duchesne, Yan Rolland, Arthur W. Toga, Marc Vérin, Christian Barillot
titre
3-D analysis of cortical morphometry in differential diagnosis of Parkinson's plus syndromes: mapping frontal lobe cortical atrophy in progressive supranuclear palsy patients.
article
Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI .. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, 2007, 10 (Pt 2), pp.891-9
identifiant
inserm-00333468
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https://inserm.hal.science/inserm-00333468/file/Miccai_Duygu.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Christian Barillot, Pierrick Coupé, Bernard Gibaud, Pierre Hellier, Pierre Jannin, Xavier Morandi, Perrine Paul, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé, Omar El Ganaoui
titre
Image Guidance in neurosurgical procedures, the "VISAGES" point of view
article
4th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2007, Arlington, United States. pp.1056-1059, ⟨10.1109/ISBI.2007.357037⟩
identifiant
inserm-00152147
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2007.357037
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https://inserm.hal.science/inserm-00152147/file/barillotISBI07.pdf BibTex
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
titre
A PROBABILISTIC OBJECTIVE FUNCTION FOR 3D RIGID REGISTRATION OF INTRAOPERATIVE US AND PREOPERATIVE MR BRAIN IMAGES
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, IEEE Signal Processing Society (SPS) and the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS), Apr 2007, Washington DC, USA, United States. pp.1320-1323, ⟨10.1109/ISBI.2007.357103⟩
identifiant
inria-00147025
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2007.357103
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https://inria.hal.science/inria-00147025/file/Coupe_ISBI2007.pdf BibTex
auteur
S. Duchesne, Yan Rolland, M. Verin, Christian Barillot
titre
Computer aided differential diagnosis of movement disorders
article
SPIE Medical Imaging: Camputer Assisted Diagnosis, 2007, San Diego, United States. pp.0
identifiant
inserm-00140496
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BibTex
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Pierrick Coupé, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
titre
Non-local means variants for denoising of diffusion-weighted and diffusion tensor MRI.
article
10th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2007, Brisbane, Australia. pp.344-51, ⟨10.1007/978-3-540-75759-7_42⟩
identifiant
inserm-00193788
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-75759-7_42
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https://inserm.hal.science/inserm-00193788/file/Miccai07.pdf BibTex
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Christian Barillot
titre
Validation of a new optimisation algorithm for registration tasks in medical imaging
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2007, Washington, United States. ⟨10.1109/ISBI.2007.356783⟩
identifiant
inria-00133377
DOI
DOI : 10.1109/ISBI.2007.356783
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https://inria.hal.science/inria-00133377/file/main.pdf BibTex
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Pierre Yger, Sylvain Prima, Christian Barillot
titre
Evaluation of a new optimisation algorithm for rigid registration of MRI data
article
Medical Imaging 2007: Image Processing, Feb 2007, San Diego, United States. ⟨10.1117/12.707931⟩
identifiant
inria-00133375
DOI
DOI : 10.1117/12.707931
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https://inria.hal.science/inria-00133375/file/RegistrationSPIE07.pdf BibTex

Reports

auteur
Jérémy Lecoeur, Christian Barillot
titre
Segmentation d'images cérébrales : État de l'art
article
[Rapport de recherche] RR-6306, INRIA. 2007, pp.46
identifiant
inria-00175188
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https://inria.hal.science/inria-00175188/file/RR-6306.pdf BibTex

2006

Journal articles

auteur
Christian Barillot, Habib Benali, Michel Dojat, Alban Gaignard, Bernard Gibaud, Serge Kinkingnéhun, Jean-Pierre Matsumoto, Mélanie Pélégrini-Issac, Eric Simon, Lynda Temal
titre
Federating distributed and heterogeneous information sources in neuroimaging: the NeuroBase Project.
article
Studies in Health Technology and Informatics, 2006, 120, pp.3-13
identifiant
inserm-00141685
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https://inserm.hal.science/inserm-00141685/file/NeurobaseHealthGrid06.pdf BibTex
auteur
François Rousseau, Pierre Hellier, Marloes Mj Letteboer, Wiro J. Niessen, Christian Barillot
titre
Quantitative evaluation of three calibration methods for 3-D freehand ultrasound.
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2006, 25 (11), pp.1492-501. ⟨10.1109/TMI.2006.882134⟩
identifiant
inserm-00140890
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2006.882134
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BibTex
auteur
François Rousseau, Pierre Hellier, Christian Barillot
titre
A Novel Temporal Calibration Method for 3D Ultrasound
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2006
identifiant
inria-00001215
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https://inria.hal.science/inria-00001215/file/TMI-3DUS-TemporalCalibration.pdf BibTex

Conference papers

auteur
Laure S. Aït-Ali, Sylvain Prima, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
Longitudinal segmentation of MS lesions in multimodal brain MRI
article
RFIA, University of Tours, Jan 2006, Tours, France, France
identifiant
inria-00001160
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https://inria.hal.science/inria-00001160/file/AitAli_RFIA06.pdf BibTex
auteur
Laure S. Aït-Ali, Sylvain Prima, Béatrice Carsin-Nicol, Sean Patrick Morissey, Michel Carsin, Christian Barillot, Gilles Edan
titre
Segmentation automatique des lésions de sclérose en plaques sur des études longitudinales d'IRM multi-séquences
article
33ème Congrès Annuel de la Société Française de Neuro-Radiologie, 2006, Paris, France
identifiant
hal-00080969
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BibTex
auteur
Laure S. Aït-Ali, Sylvain Prima, Sean Patrick Morissey, Christian Barillot, Gilles Edan
titre
Fully automated lesion segmentation in patients with Multiple Sclerosis - a multisequence approach with longitudinal MRI data
article
2006, pp.38
identifiant
hal-00080936
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BibTex
auteur
Cybèle Ciofolo, Christian Barillot
titre
Shape analysis for 3D segmentation of cerebral structures with level sets and fuzzy control
article
15e congrès francophone AFRIF-AFIA Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle, Université de Tours, Jan 2006, Tours, France
identifiant
inria-00001161
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https://inria.hal.science/inria-00001161/file/Ciofolo_RFIA06.pdf BibTex
auteur
Cybèle Ciofolo, Christian Barillot
titre
Analyse de forme pour la segmentation de structures cérébrales 3D par ensembles de niveau et commande floue
article
RFIA'2006, 15ème Congrès Francophone AFRIF/AFIA de Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle, 2006, France
identifiant
inserm-00109468
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https://inserm.hal.science/inserm-00109468/file/195.pdf BibTex
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Yger, Christian Barillot
titre
Fast Non Local Means Denoising for 3D MR Images
article
9th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2006, Copenhagen, Denmark, pp.33-40, ⟨10.1007/11866763_5⟩
identifiant
inria-00131287
DOI
DOI : 10.1007/11866763_5
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https://inria.hal.science/inria-00131287/file/MICCAI2006.pdf BibTex
auteur
S. Duchesne, M. Chakravarty, D. L. Collins, Christian Barillot
titre
Brainstem segmentation protocol
article
workshop on "Atlas and personalized models" sattelite conference of, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention- MICCAI'07, Oct 2006, Copenhaguen,, Denmark. pp.0
identifiant
inserm-00140813
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BibTex
auteur
Bernard Gibaud, Christian Barillot, Habib Benali, Michel Dojat, Alban Gaignard, Serge Kinkingnéhun, Jean-Pierre Matsumoto, Mélanie Pélégrini-Issac, Eric Simon, Lynda Temal
titre
Sharing data and image processing tools in neuroimaging.
article
CARS 2006 - Computer Assisted Radiology and Surgery, Jun 2006, Osaka, Japan. pp.41-42
identifiant
inserm-00152138
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00152138/file/365_LE_Gibaud.pdf BibTex
auteur
Arnaud Ogier, Pierre Hellier, Christian Barillot
titre
Restoration of 3D medical images with total variation scheme on wavelet domains (TVW)
article
SPIE Medical Imaging: Image Processing, Feb 2006, San Diego, CA, pp.465-473
identifiant
inria-00001159
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00001159/file/Spie06.pdf BibTex

2005

Journal articles

auteur
Christian Barillot, David R. Haynor, Pierre Hellier
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention: Editorial
article
Medical Image Analysis, 2005, 9 (5), pp.411-412
identifiant
inserm-00136525
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Cybèle Ciofolo, Christian Barillot
titre
Brain segmentation with competitive level sets and fuzzy control.
article
Information processing in medical imaging : proceedings of the .. conference., 2005, 19, pp.333-44
identifiant
inserm-00137473
Accès au bibtex
BibTex
auteur
David R. Haynor, Christian Barillot, Pierre Hellier
titre
A selection of papers from MICCAI 2004: the marriage of data and prior information.
article
Academic Radiology, 2005, 12 (10), pp.1229-31. ⟨10.1016/j.acra.2005.06.016⟩
identifiant
inserm-00136461
DOI
DOI : 10.1016/j.acra.2005.06.016
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BibTex
auteur
François Rousseau, Pierre Hellier, Christian Barillot
titre
Confhusius: A robust and fully automatic calibration method for 3D freehand ultrasound
article
Medical Image Analysis, 2005, 9 (1), pp.25-38
identifiant
inserm-00136520
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BibTex

Conference papers

auteur
Laure S. Aït-Ali, Sylvain Prima, Pierre Hellier, Béatrice Carsin, Gilles Edan, Christian Barillot
titre
STREM: a robust multidimensional parametric method to segment MS lesions in MRI.
article
MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, United States. pp.409-16, ⟨10.1007/11566465_51⟩
identifiant
inserm-00137568
DOI
DOI : 10.1007/11566465_51
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BibTex
auteur
Christian Barillot, Cybèle Ciofolo
titre
Segmentation de structures cérébrales par modèles déformables en concurrence
article
Journée "Formes: modèles et déformation", 2005, ENST, Paris, France
identifiant
inserm-00139847
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BibTex
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Noura Azzabou, Christian Barillot
titre
3D Freehand Ultrasound Reconstruction based on Probe Trajectory
article
8th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2005, Palm Springs, USA, pp.597-604, ⟨10.1007/11566465_74⟩
identifiant
inria-00131284
DOI
DOI : 10.1007/11566465_74
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00131284/file/MICCAI2005.pdf BibTex
auteur
Jean-Marie Favreau, Cybèle Ciofolo, Christian Barillot
titre
Extraction et étude statistique du sillon calcarin
article
MajecSTIC 2005 : Manifestation des Jeunes Chercheurs francophones dans les domaines des STIC, IRISA – IETR – LTSI, Nov 2005, Rennes, pp.423-426
identifiant
inria-00000830
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00000830/file/202.pdf BibTex

Book sections

auteur
Christian Barillot
titre
Synopsis on Medical Signal Processing and Biomedical Imaging (invited editorial)
article
Haux, R. and Kulikowski, C. 2005 Yearbook of Medical Informatics: Ubiquitous Health Care Systems, Schattauer, pp.0, 2005
identifiant
inserm-00137464
Accès au bibtex
BibTex
auteur
Isabelle Corouge, Pierre Hellier, Christian Barillot
titre
From Global to Local Approaches for Non-Rigid Registration
article
C. T. Leondes. Medical Imaging Systems Technology: Methods in General Anatomy World Scientific Publishing, World Scientific Publishing, pp.0, 2005
identifiant
inserm-00137134
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BibTex

Other publications

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Christian Barillot, Laurent Amsaleg, Florent Aubry, Jean Pierre Bazin, Yann Cointepas, Isabelle Corouge, Michel Dojat, Catherine Garbay, Bernard Gibaud, Patrick Gros, Serge Kinkingnéhun, Grégoire Malandain, Jean-Pierre Matsumoto, Dimitri Papadopoulos-Orfanos, M. Pélégrini, Nathalie Richard, Eric Simon, Habib Benali, Olivier Dameron
titre
Neurobase: gestion de données et de connaissances distribuées en neuroimagerie
article
2005
identifiant
inserm-00139814
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-00139814/file/WSM03neurobase.pdf BibTex

Books

auteur
Pierre Hellier, David R. Haynor, Christian Barillot
titre
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (Editorial)
article
P. Hellier, D.R. Haynor, C. Barillot. Wiley, 10, pp.197, 2005
identifiant
inria-00536247
Accès au bibtex
BibTex

Reports

auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Christian Barillot
titre
État de l'art des méthodes de correction des déformations cérébrales per-opératoires
article
[Rapport de recherche] PI 1724, 2005, pp.51
identifiant
inria-00000100
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https://inria.hal.science/inria-00000100/file/PI-1724.pdf BibTex
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Christian Barillot
titre
État de l'art des méthodes de correction des déformations cérébrales per-opératoires
article
[Rapport de recherche] RR-5589, INRIA. 2005, pp.51
identifiant
inria-00070418
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https://inria.hal.science/inria-00070418/file/RR-5589.pdf BibTex

2004

Journal articles

auteur
Isabelle Corouge, Michel Dojat, Christian Barillot
titre
Statistical shape modeling of low level visual area borders.
article
Medical Image Analysis, 2004, 8 (3), pp.353-60. ⟨10.1016/j.media.2004.06.023⟩
identifiant
inserm-00402298
DOI
DOI : 10.1016/j.media.2004.06.023
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https://inserm.hal.science/inserm-00402298/file/MedIA.pdf BibTex
auteur
Pierre Hellier, Christian Barillot
titre
A hierarchical parametric algorithm for deformable multimodal image registration
article
Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2004, 75 (2), pp.107-115. ⟨10.1016/j.cmpb.2004.01.002⟩
identifiant
inria-00536377
DOI
DOI : 10.1016/j.cmpb.2004.01.002
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Books

auteur
Christian Barillot, David R. Haynor, Pierre Hellier
titre
Proceedings of Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2004
article
Springer, pp.2044, 2004, ⟨10.1007/b100265⟩
identifiant
inria-00536234
DOI
DOI : 10.1007/b100265
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2003

Journal articles

auteur
Pierre Hellier, Christian Barillot, Isabelle Corouge, Bernard Gibaud, G. Le Goualher, D. Louis Collins, Allan Evans, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, G. E. Christensen, H.J. Johnson
titre
Retrospective evaluation of intersubject brain registration
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2003, 22 (9), pp.1120 - 1130. ⟨10.1109/TMI.2003.816961⟩
identifiant
inria-00536383
DOI
DOI : 10.1109/TMI.2003.816961
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2001

Conference papers

auteur
Isabelle Corouge, Christian Barillot
titre
Use of a probabilistic shape model for non-linear registration of 3D scattered data
article
IEEE ICIP, 2001, Greece. pp.149 - 152, ⟨10.1109/ICIP.2001.958975⟩
identifiant
inserm-00773084
DOI
DOI : 10.1109/ICIP.2001.958975
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BibTex
auteur
Pierre Hellier, Christian Barillot, Isabelle Corouge, B. Giraud, Georges Le Goualher, L. Collins, A. Evans, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache
titre
Retrospective Evaluation of Inter-subject Brain registration
article
4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.258--265
identifiant
inria-00615678
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