Publications HAL

2017

Conference papers

titre
A Model to Represent Nomenclatural and Taxonomic Information as Linked Data. Application to the French Taxonomic Register, TAXREF
auteur
Franck Michel, Olivier Gargominy, Sandrine Tercerie, Catherine Faron Zucker
article
S4Biodiv 2017 - 2nd International Workshop on Semantics for Biodiversity co-located with ISWC 2017, Oct 2017, Vienna, Austria. CEUR Vol. 1933, pp.1-12, 2017, 〈http://fusion.cs.uni-jena.de/s4biodiv2017/〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01617708/file/Michel%20et%20al%20-%20S4BioDiv%20Camera%20Ready.pdf BibTex
titre
TAXREF-LD: A Reference Thesaurus for Biodiversity on the Web of Linked Data
auteur
Franck Michel, Catherine Faron Zucker, Sandrine Tercerie, Olivier Gargominy
article
TDWG 2017 - Annual Conference, Oct 2017, Ottawa, Canada. Biodiversity Information Science and Standards, 2017, Proceedings of the TDWG 2017 Annual Conference. 〈https://tdwg.github.io/conferences/2017/〉. 〈10.3897/tdwgproceedings.1.20232〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01612451/file/Abstract%20TDWG2017.pdf BibTex
titre
Integrating Heterogeneous Data Sources in the Web of Data
auteur
Franck Michel
article
JDEV2017, Jul 2017, Marseille, France. 2017
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titre
Construction du référentiel taxonomique commun TAXREF, socle pour la connaissance et l'échange de données
auteur
Olivier Gargominy, Franck Michel, Sandrine Tercerie
article
Séminaire Interopérabilité des systèmes d'information sur l'eau (INSIDE 2017), Mar 2017, Paris, France. 2017, 〈http://www.pole-inside.fr/fr/page/programme-seminaire-2017〉
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Reports

titre
xR2RML: Relational and Non-Relational Databases to RDF Mapping Language
auteur
Franck Michel, Loïc Djimenou, Catherine Faron Zucker, Johan Montagnat
article
[Research Report] ISRN I3S/RR 2014-04-FR, CNRS. 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01066663/file/xR2RML%20Language%20Specification%20v5.pdf BibTex

Theses

titre
Integrating Heterogeneous Data Sources in the Web of Data
auteur
Franck Michel
article
Databases [cs.DB]. Université Côte d'Azur, 2017. English
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01508602/file/PhD%20Manuscript.pdf BibTex

2016

Conference papers

titre
Construction d’un référentiel taxonomique commun pour des études sur l’histoire de la zoologie, l’archéozoologie et la biologie
auteur
Franck Michel, Cécile Callou, Catherine Faron Zucker, Olivier Gargominy, Chloé Martin, Johan Montagnat, Sandrine Tercerie, Frédéric Vest
article
SemWeb.Pro 2016, Nov 2016, Paris, France. 〈http://semweb.pro/semwebpro-2016.html〉
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BibTex
titre
A Mapping-based Method to Query MongoDB Documents with SPARQL
auteur
Franck Michel, Catherine Faron Zucker, Johan Montagnat
article
27th International Conference on Database and Expert Systems Applications (DEXA 2016), Sep 2016, Porto, Portugal. 2016, Proceedings of the DEXA 2016 Conference
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01330146/file/sparql2mongo.pdf BibTex
titre
A Generic Mapping-Based Query Translation from SPARQL to Various Target Database Query Languages
auteur
Franck Michel, Catherine Faron Zucker, Johan Montagnat
article
12th International Conference on Web Information Systems and Technologies (WEBIST'16), Apr 2016, Roma, Italy. 2016, Proceeding of the WEBIST'16 Conference. 〈http://www.webist.org/〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01280951/file/sparql2abstract.pdf BibTex

Book sections

titre
Translation of Heterogeneous Databases into RDF, and Application to the Construction of a SKOS Taxonomical Reference
auteur
Franck Michel, Loïc Djimenou, Catherine Faron Zucker, Johan Montagnat
article
Web Information Systems and Technologies: 11th International Conference, WEBIST 2015, Revised Selected Papers, 246, Springer, pp.275-296, 2016, Lecture Notes in Business Information Processing, 978-3-319-30995-8. 〈10.1007/978-3-319-30995-5_14〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01337308/file/WebIST-LNCS.pdf BibTex

Reports

titre
Mapping-based SPARQL access to a MongoDB database
auteur
Franck Michel, Catherine Faron Zucker, Johan Montagnat
article
[Research Report] CNRS. 2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01245883/file/SPARQL-to-MongoQL%20Rapport.pdf BibTex

2015

Conference papers

titre
Translation of Relational and Non-Relational Databases into RDF with xR2RML
auteur
Franck Michel, Loïc Djimenou, Catherine Faron Zucker, Johan Montagnat
article
11th International Confenrence on Web Information Systems and Technologies (WEBIST'15), Oct 2015, Lisbon, Portugal. pp.443-454, Proceedings of the WebIST'15 Conference. 〈http://www.webist.org〉. 〈10.5220/0005448304430454〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01207828/file/xR2RML.pdf BibTex
titre
How to make brain imaging research efficient and reproducible: building software and standards
auteur
Jean-Baptiste Poline, Samir Das, David Keator, Krysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Gang Chen, Cameron Craddock, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Yaroslav Halchenko, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Mark Jenkinson, Arno Klein, Daniel Marcus, Daniel Margulies, Camille Maumet, Franck Michel, B. Nolan Nichols, Thomas E Nichols, Russell Poldrack, Richard Reynolds, Ziad Saad, Tanya Schmah, Jason Steffener, Jessica Turner, Theo Van Erp, John Van Horn, David Kennedy
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
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BibTex
titre
Towards a Shared Reference Thesaurus for Studies on History of Zoology, Archaeozoology and Conservation Biology
auteur
Cécile Callou, Franck Michel, Catherine Faron Zucker, Chloé Martin, Johan Montagnat
article
Extended Semantic Web Confenrece 2015, workshop Semantic Web For Scientific Heritage (SW4SH), May 2015, Portoroz, Slovenia. Proceedings of the ESWC'15 workshops
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01146638/file/SW4SH.pdf BibTex

Lectures

titre
Make our Scientific Datasets Accessible and Interoperable on the Web
auteur
Franck Michel
article
École thématique. Journées « Conduire et construire un plan de gestion des données : De la base de données à la pérennisation », Sètes, France. 2015, pp.95
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https://hal.archives-ouvertes.fr/cel-01486617/file/RBDD15%20Make%20our%20Scientific%20Datasets%20Accessible%20and%20Interoperable%20on%20the%20Web.pdf BibTex

2014

Conference papers

titre
Developing and using the Neuroimaging and Data Sharing Data Model: the NIDASH Working Group
auteur
David Keator, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Guillaume Flandin, B. Nolan Nichols, Thomas E. Nichols, Gully Burns, Ruediger Bruehl, Cameron Craddock, Blaise Frederick, Krysztof Gorgolewski, Daniel Marcus, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Arno Klein, Michael Milham, Russel Poldrack, Franck Michel, Jason Steffener, Yannick Schwartz, Rich Stoner, Jessica Turner, David N. Kennedy, Jean-Baptiste Poline
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2014), Jun 2014, Hamburg, Germany. 2014
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BibTex
titre
Using VAPOR to improve VO administration and operations
auteur
Franck Michel
article
EGI Community Forum 2014, May 2014, Helsinki, Finland. 2014, 〈https://indico.egi.eu/indico/event/1994/〉
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BibTex

Reports

titre
A survey of RDB to RDF translation approaches and tools
auteur
Franck Michel, Johan Montagnat, Catherine Faron Zucker
article
[Research Report] I3S. 2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00903568/file/Rapport_Rech_I3S_v2_-_Michel_et_al_2013_-_A_survey_of_RDB_to_RDF_translation_approaches_and_tools.pdf BibTex

2013

Conference papers

titre
biomed VO Operational status & issues
auteur
Franck Michel, Tristan Glatard
article
EGI Community Forum 2013, Apr 2013, Manchester, United Kingdom. 2013, 〈 https://indico.egi.eu/indico/event/1222/〉
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BibTex
titre
VAPOR Vo Administration and operations PORtal
auteur
Franck Michel
article
EGI Community Forum 2013, Apr 2013, Manchester, United Kingdom. 2013, 〈https://indico.egi.eu/indico/event/1222/〉
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BibTex

2012

Conference papers

titre
Technical support for Life Sciences communities on a production grid infrastructure
auteur
Franck Michel, Johan Montagnat, Tristan Glatard
article
HealthGrid'12, May 2012, Amsterdam, Netherlands. pp.1-10, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00677839/file/hgiwsg2012_submission_10.pdf BibTex
titre
Achievements and perspectives of the biomed technical team
auteur
Franck Michel, Tristan Glatard, Johan Montagnat
article
EGI Community Forum, Mar 2012, Munich, Germany. pp.PoS(EGICF12-EMITC2)015, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00760715/file/EGICF12-EMITC2_015.pdf BibTex

2011

Conference papers

titre
NeuroLOG: sharing neuroimaging data using an ontology-based federated approach.
auteur
Bernard Gibaud, Gilles Kassel, Michel Dojat, Bénédicte Batrancourt, Franck Michel, Alban Gaignard, Johan Montagnat
article
American Medical Informatics Association, Oct 2011, Washington DC, United States. 2011, pp.472-80, 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683087/file/amia-2011-revised.pdf BibTex
titre
A federated system for sharing and reuse of images and image processing tools in neuroimaging
auteur
Bernard Gibaud, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Franck Michel, Bacem Wali, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Pascal Girard, Alban Gaignard, Diane Lingrand, Johan Montagnat, Javier Rojas Balderrama, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, David Godard, Gilles Kassel, Mélanie Pélégrini-Issac
article
Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'11), Jun 2011, Berlin, Germany. 2011
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BibTex
titre
NeuroLOG: A framework for the sharing and reuse of distributed tools and data in neuroimaging
auteur
Michel Dojat, Mélanie Pélégrini-Issac, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Alban Gaignard, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Franck Michel, Johan Montagnat, Xavier Pennec, Javier Balderrama, Bacem Wali
article
Organization for Human Brain Mapping (HBM'11), Jun 2011, Quebec, Canada. 2011
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2010

Conference papers

titre
Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.
auteur
Franck Michel, Alban Gaignard, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Mélanie Pélégrini-Issac, Xavier Pennec, Javier Rojas Balderrama, Bacem Wali
article
Tony Solomonides ; Ignacio Blanquer ; Vincent Breton ; Tristan Glatard ; Yannick Legré. HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. IOS press, 159, pp.112-123, 2010, Studies in Health Technology and Informatics. 〈10.3233/978-1-60750-583-9-112〉
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00512799/file/neurolog_healthgrid_2010.pdf http://www.hal.inserm.fr/inserm-00512799/file/inserm-00512799_edited.pdf BibTex