2024
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Emergence of Supercoiling-Mediated Regulatory Networks through Bacterial Chromosome Organization
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- 2024
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2023
Journal articles
- titre
- Forward‐in‐time simulation of chromosomal rearrangements: The invisible backbone that sustains long‐term adaptation
- auteur
- Paul Banse, Juliette Luiselli, David P Parsons, Théotime Grohens, Marco Foley, Leonardo Trujillo, Jonathan Rouzaud‐cornabas, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- Molecular Ecology, 2023, ⟨10.1111/mec.17234⟩
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-
Conference papers
- titre
- Classifying the Post-duplication Fate of Paralogous Genes
- auteur
- Reza Kalhor, Guillaume Beslon, Manuel Lafond, Celine Scornavacca
- article
- RECOMB-CG 2023 - 20th conference on Comparative Genomics, Apr 2023, Istanbul, Turkey. pp.1-18, ⟨10.1007/978-3-031-36911-7_1⟩
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-
Poster communications
- titre
- Towards alife-generated benchmarks for phylogeny
- auteur
- Marco Foley, Jonathan Rouzaud-Cornabas, Eric Tannier, Guillaume Beslon
- article
- ALignements and PHYlogénie (Alphy), Jan 2023, Grenoble, France.
- Accès au bibtex
-
2022
Journal articles
- titre
- Digital evolution: Insights for biologists
- auteur
- Miguel A. Fortuna, Guillaume Beslon, Charles Ofria
- article
- Frontiers in Ecology and Evolution, 2022, ⟨10.3389/fevo.2022.1037040⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Genome-Wide Evolutionary Simulation of the Transcription-Supercoiling Coupling
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- Artificial Life, 2022, ⟨10.1162/artl_a_00373⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Getting higher on rugged landscapes: Inversion mutations open access to fitter adaptive peaks in NK fitness landscapes
- auteur
- Leonardo Trujillo, Paul Banse, Guillaume Beslon
- article
- PLoS Computational Biology, 2022, 18 (10), pp.e1010647. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010647⟩
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-
Documents associated with scientific events
- titre
- Inversion mutations attenuate complexity catastrophe in NK fitness landscapes
- auteur
- Leonardo Trujillo, Paul Banse, Guillaume Beslon
- article
- CCS2022, Oct 2022, Palma de Mallorca, Spain. 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- A Genome-Wide Evolutionary Simulation of the Transcription-Supercoiling Coupling: extended version
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- 2022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Variable length genetic algorithm with continuous parameters optimization of beam layout in proton therapy
- auteur
- François Smekens, Nicolas Freud, Bruno Sixou, Guillaume Beslon, Jean Michel Létang
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
- titre
- Towards the optimization of ballistics in proton therapy using genetic algorithms: implementation issues
- auteur
- François Smekens, Nicolas Freud, Bruno Sixou, Guillaume Beslon, Jean Michel Létang
- article
- 2022
- Accès au bibtex
-
2021
Conference papers
- titre
- The Complexity Ratchet
- auteur
- Guillaume Beslon, Vincent F Liard, Jonathan Rouzaud-Cornabas
- article
- CCS 2021 - International Conference on Complex Systems, Oct 2021, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Genome-Wide Evolutionary Simulation of the Transcription-Supercoiling Coupling
- auteur
- Théotime Grohens, Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- ALIFE 2021 - Conference on Artificial Life, Jul 2021, Prague, Czech Republic
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Simulating short-and long-term evolutionary dynamics on rugged landscapes
- auteur
- Leonardo Trujillo, Paul Banse, Guillaume Beslon
- article
- ALIFE 2021 - Conference on Artificial Life, Jul 2021, Prague, Czech Republic. pp.1-9
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Of Evolution, Systems and Complexity
- auteur
- Guillaume Beslon, Vincent F Liard, David P. Parsons, Jonathan Rouzaud-Cornabas
- article
- Evolutionary Systems Biology II, 2021, ⟨10.1007/978-3-030-71737-7_1⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Other publications
- titre
- Evolutionary escape from local fitness peaks through inversion mutations
- auteur
- Leonardo Trujillo, Paul Banse, Guillaume Beslon
- article
- 2021, pp.1-1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2020
Journal articles
- titre
- The Surprising Creativity of Digital Evolution: A Collection of Anecdotes from the Evolutionary Computation and Artificial Life Research Communities
- auteur
- Joel Lehman, Jeff Clune, Dusan Misevic, Christoph Adami, Julie Beaulieu, Peter J. Bentley, Samuel Bernard, Guillaume Beslon, David M. Bryson, Nick Cheney, Antoine Cully, Stéphane Doncieux, Fred C. Dyer, Kai Olav Ellefsen, Robert Feldt, Stephan Fischer, Stephanie Forrest, Antoine Frenoy, Christian Gagneé, Leni Le Goff, Laura M. Grabowski, Babak Hodjat, Laurent Keller, Carole Knibbe, Peter Krcah, Richard E. Lenski, Hod Lipson, Robert Maccurdy, Carlos Maestre, Risto Miikkulainen, Sara Mitri, David E. Moriarty, Jean-Baptiste Mouret, Anh Duc Nguyen, Charles Ofria, Marc Parizeau, David Parsons, Robert T. Pennock, William F. Punch, Thomas S. Ray, Marc Schoenauer, Eric Shulte, Karl Sims, Kenneth O. Stanley, Francois Taddei, Danesh Tarapore, Simon Thibault, Westley Weimer, Richard Watson, Jason Yosinksi
- article
- Artificial Life, 2020, 26 (2), pp.274-306. ⟨10.1162/artl_a_00319⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The complexity ratchet: Stronger than selection, stronger than evolvability, weaker than robustness
- auteur
- Vincent F Liard, David P. Parsons, Jonathan Rouzaud-Cornabas, Guillaume Beslon
- article
- Artificial Life, 2020, 26 (1), pp.38-57. ⟨10.1162/artl_a_00312⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evolutionary Subspace Clustering Using Variable Genome Length
- auteur
- Sergio Peignier, Christophe Rigotti, Guillaume Beslon
- article
- Computational Intelligence, 2020, 36 (2), pp.574-612. ⟨10.1111/coin.12254⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Phenotypic noise and the cost of complexity
- auteur
- Charles Rocabert, Guillaume Beslon, Carole Knibbe, Samuel Bernard
- article
- Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2020, ⟨10.1111/evo.14083⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2019
Journal articles
- titre
- Introduction to the ECAL 2017 Special Issue
- auteur
- Carole Knibbe, Guillaume Beslon, Dusan Misevic
- article
- Artificial Life, 2019, 25 (4), pp.313-314. ⟨10.1162/artl_a_00298⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Adapting the engine to the fuel: mutator populations can reduce the mutational load by reorganizing their genome structure
- auteur
- Jacob Pieter Rutten, Paulien Hogeweg, Guillaume Beslon
- article
- BMC Evolutionary Biology, 2019, 19 (1), pp.1-17. ⟨10.1186/s12862-019-1507-z⟩
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-
Conference papers
- titre
- How to reduce a genome? ALife as a tool to teach the scientific method to school pupils
- auteur
- Quentin Carde, Marco Foley, Carole Knibbe, David P. Parsons, Jonathan Rouzaud-Cornabas, Guillaume Beslon
- article
- ALIFE 2019 - Conference on Artificial Life, Jul 2019, Newcastle, United Kingdom. pp.497-504, ⟨10.1162/isal_a_00211⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Phenotypic Noise and the Cost of Complexity
- auteur
- Charles Rocabert, Guillaume Beslon, Carole Knibbe, Samuel Bernard
- article
- EvoLyon 2019, Nov 2019, Lyon, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2018
Conference papers
- titre
- Evolving Living Technologies-Insights from the EvoEvo project
- auteur
- Guillaume Beslon, Santiago F Elena, Paulien Hogeweg, Dominique Schneider, Susan Stepney
- article
- SSBSE 2018 - 10th Symposium on Search-Based Software Engineering, Sep 2018, Montpellier, France. pp.46-62, ⟨10.1007/978-3-319-99241-9_2⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Complexity Ratchet: Stronger than selection, weaker than robustness
- auteur
- Vincent F Liard, David P. Parsons, Jonathan Rouzaud-Cornabas, Guillaume Beslon
- article
- ALIFE 2018 - the 2018 conference on artificial Life, Jul 2018, Tokyo, Japan. pp.1-8, ⟨10.1162/isal_a_00051⟩
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-
- titre
- Weight-based search to find clusters around medians in subspaces
- auteur
- Sergio Peignier, Christophe Rigotti, Anthony Rossi, Guillaume Beslon
- article
- SAC 2018 - ACM Symposium On Applied Computing, Apr 2018, Pau, France. pp.1-10
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- In silico experimental evolution shows that complexity can rise even in simple environments
- auteur
- Guillaume Beslon, Vincent F Liard, David P. Parsons, Jonathan Rouzaud-Cornabas
- article
- ICSB 2018 - 19th International Conference on Systems Biology, Oct 2018, Lyon, France. pp.1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Jump then Climb: can rearrangements predict the occurrence of mutational bursts?
- auteur
- Guillaume Beslon, Vincent F Liard, Santiago F Elena
- article
- Evolution 2018 - Congress on Evolutionary Biology, Aug 2018, Montpellier, France. pp.1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The complexity ratchet: stronger than selection
- auteur
- Vincent F Liard, Jonathan Rouzaud-Cornabas, David P. Parsons, Guillaume Beslon
- article
- Beacon congress 2018, Aug 2018, east-lansing, United States. pp.1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Evolving Instrument Based on Symbiont-Host Metaphor: a Commensal Computation
- auteur
- Jonas Abernot, Guillaume Beslon, Simon Hickinbotham, Sergio Peignier, Christophe Rigotti
- article
- Journal of Creative Music Systems, 2017, 2 (1), pp.1-10. ⟨10.5920/JCMS.2017.11⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Isee-resistance : using in silico experimental evolution to sensitize providers on antibiotic resistance
- auteur
- Guillaume Beslon, Dominique Schneider
- article
- Antimicrobial Resistance and Infection Control, 2017, Abstracts from the 4th International Conference on Prevention & Infection Control (ICPIC 2017), 6(Suppl 3) (52), pp.2
- Accès au bibtex
-
- titre
- Beware batch culture: Seasonality and niche construction predicted to favor bacterial adaptive diversification
- auteur
- Charles Rocabert, Carole Knibbe, Jessika Consuegra, Dominique Schneider, Guillaume Beslon
- article
- PLoS Computational Biology, 2017, 13 (3), e1005459 (32 p.). ⟨10.1371/journal.pcbi.1005459.s006⟩
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-
Conference papers
- titre
- Aevol-4b: Toward a new simulation platform to benchmark phylogenetic tools
- auteur
- Nicolas Comte, Vincent Liard, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- ALPHY (ALignments and PHYlogeny), Feb 2017, Villeurbanne, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A 4-base model for the Aevol in-silico experimental evolution platform
- auteur
- Vincent Liard, Jonathan Rouzaud-Cornabas, Nicolas Comte, Guillaume Beslon
- article
- European Conference on Artificial Life, Sep 2017, Villeurbanne, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoMove: Evolutionary-based living musical companion
- auteur
- Sergio Peignier, Jonas Abernot, Christophe Rigotti, Guillaume Beslon
- article
- European Conference on Artificial Life (ECAL), Sep 2017, Villeurbanne, France. pp.1-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Environmental seasonality drives digital populations towards stable cross-feeding
- auteur
- Charles Rocabert, Carole Knibbe, Jessika Consuegra, Dominique Schneider, Guillaume Beslon
- article
- European Conference on Artificial Life (ECAL), Sep 2017, Villeurbanne, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Testing evolution predictability using the aevol software
- auteur
- Guillaume Beslon, Vincent F Liard, Santiago F Elena
- article
- 16th international meeting of the European Society of Evolutionary Biology (ESEB 2017) , Aug 2017, Groningen, Netherlands. 2017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Defining and simulating open-ended novelty: requirements, guidelines, and challenges.
- auteur
- Wolfgang Banzhaf, Bert Baumgaertner, Guillaume Beslon, René Doursat, James A Foster, Barry Mcmullin, Vinicius Veloso de Melo, Thomas Miconi, Lee Spector, Susan Stepney, Roger White
- article
- Theorie in den Biowissenschaften / Theory in Biosciences, 2016, ⟨10.1007/s12064-016-0229-7⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Open-Ended Evolution: Perspectives from the OEE Workshop in York
- auteur
- Tim Taylor, Mark Bedau, Alastair Channon, David Ackley, Wolfgang Banzhaf, Guillaume Beslon, Emily Dolson, Tom Froese, Simon Hickinbotham, Takashi Ikegami, Barry Mcmullin, Norman Packard, Steen Rasmussen, Virgo Nathaniel, Eran Agmon, Clark Edward, Simon Mcgregor, Charles Ofria, Glen Ropella, Lee Spector, Kenneth O. Stanley, Adam Stanton, Christopher Timperley, Anya Vostinar, Michael Wiser
- article
- Artificial Life, 2016, 22 (3), pp.408-423. ⟨10.1162/ARTL_a_00210⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- A Commensal Architecture for Evolving Living Instruments
- auteur
- Jonas Abernot, Guillaume Beslon, Simon Hickinbotham, Sergio Peignier, Christophe Rigotti
- article
- Conference on Computer Simulation of Musical Creativity, Jun 2016, Huddersfield, United Kingdom. pp.1-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolvability drives innovation in viral genomes
- auteur
- Guillaume Beslon, Vincent F Liard, Santiago F Elena
- article
- 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, Sep 2016, Amsterdam, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparative Genomics on Artificial Life
- auteur
- Priscila Biller, Carole Knibbe, Guillaume Beslon, Eric Tannier
- article
- Computability in Europe, Jun 2016, Paris, France. pp.35-44
- Accès au bibtex
-
- titre
- In silico experimental evolution provides independent and challenging benchmarks for comparative genomics
- auteur
- Priscila Biller, Eric Tannier, Guillaume Beslon, Carole Knibbe
- article
- Journées ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jun 2016, Lyon, France. pp.79-82
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- In Silico Experimental Evolution Highlights the Influence of Environmental Seasonality on Bacterial Diversification
- auteur
- Charles Rocabert, Carole Knibbe, Jessika Consuegra, Dominique Schneider, Guillaume Beslon
- article
- 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, Sep 2016, Amsterdam, Netherlands
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evolution of mutator populations in constant environments
- auteur
- Jacob Pieter Rutten, Paulien Hogeweg, Guillaume Beslon
- article
- 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, Sep 2016, Amsterdam, Netherlands
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Open-Endedness: Definitions and Shortcuts
- auteur
- Susan Stepney, Guillaume Beslon
- article
- 2nd EvoEvo Workshop, satellite workshop of CCS2016, Sep 2016, Amsterdam, Netherlands
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- In Silico Experimental Evolution suggests a complex intertwining of selection, robustness and drift in the evolution of genetic networks complexity
- auteur
- Yoram Vadée-Le-Brun, Jonathan Rouzaud-Cornabas, Guillaume Beslon
- article
- Artificial Life, Jul 2016, Cancun, Mexico
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Unexpected genome inflation and streamlining in variable environments
- auteur
- Bérénice Batut, Guillaume Beslon, Carole Knibbe
- article
- Journées ouvertes de Biologie Informatique & Mathématiques 2016, Jun 2016, Lyon, France. pp.320-322, 2016
- Accès au bibtex
-
Reports
- titre
- EvoEvo Deliverable 5.2
- auteur
- Guillaume Beslon, Jonas Abernot, Sergio Peignier, Christophe Rigotti
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 6.6
- auteur
- Guillaume Beslon, Paulien Hogeweg
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 6.8
- auteur
- Guillaume Beslon, Jonas Abernot, Santiago F. Elena, Dominique Schneider, Paulien Hogeweg, Susan Stepney, Christophe Rigotti
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 5.1
- auteur
- Guillaume Beslon, Jonas Abernot, Sergio Peignier, Christophe Rigotti
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 1.3
- auteur
- Santiago F. Elena, Guillaume Beslon, Otmane Lamrabet, Dominique Schneider
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 1.2
- auteur
- Santiago F. Elena, Dominique Schneider, Guillaume Beslon, Otmane Lamrabet
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 1.4
- auteur
- Santiago F. Elena, Guillaume Beslon, Otmane Lamrabet, Dominique Schneider
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 3.1
- auteur
- Paulien Hogeweg, Guillaume Beslon
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 3.4
- auteur
- Paulien Hogeweg, Guillaume Beslon, Susan Stepney
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 3.3
- auteur
- Paulien Hogeweg, Guillaume Beslon
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 3.2
- auteur
- Paulien Hogeweg, Guillaume Beslon
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 1.5
- auteur
- Dominique Schneider, Guillaume Beslon, José-Luis Carrasco, Santiago F. Elena, Otmane Lamrabet, A. Willemsen
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 1.6
- auteur
- Dominique Schneider, Guillaume Beslon, Santiago F. Elena, Otmane Lamrabet
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 4.3
- auteur
- Susan Stepney, Guillaume Beslon, Tim Hoverd
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2015
Journal articles
- titre
- Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells
- auteur
- Ophélie Arnaud, Sam Meyer, Elodie Vallin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- BMC Molecular Biology, 2015, 16 (20), ⟨10.1186/s12867-015-0048-2⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Subspace Clustering Using Evolvable Genome Structure
- auteur
- Sergio Peignier, Christophe Rigotti, Guillaume Beslon
- article
- Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO), Jul 2015, Madrid, Spain. pp.575-582
- Accès au bibtex
-
- titre
- Subspace Clustering for all Seasons
- auteur
- Sergio Peignier, Christophe Rigotti, Guillaume Beslon
- article
- EvoEvo Workshop (satellite workshop of ECAL 2015), Jul 2015, york, United Kingdom. pp.1-3
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards a Integrated Evolutionary Model to Study Evolution of Evolution
- auteur
- Charles Rocabert, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- EvoEvo Workshop (Satellite workshop of ECAL 2015), Jul 2015, York, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Epigenetic inheritance speeds up evolution of artificial organisms
- auteur
- Yoram Vadée-Le-Brun, Jonathan Rouzaud-Cornabas, Guillaume Beslon
- article
- European Conference on Artificial Life, Jul 2015, York, United Kingdom. ⟨10.7551/978-0-262-33027-5-ch078⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.6
- auteur
- Guillaume Beslon, Charles Rocabert
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 6.5
- auteur
- Guillaume Beslon, Santiago F. Elena, Paulien Hogeweg, Dominique Schneider, Susan Stepney
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.2
- auteur
- Guillaume Beslon, Charles Rocabert
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.7
- auteur
- Guillaume Beslon, Charles Rocabert
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.8
- auteur
- Guillaume Beslon, Charles Rocabert
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.4
- auteur
- Guillaume Beslon, Charles Rocabert
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2014
Journal articles
- titre
- Stochastic Fluctuations and Distributed Control of Gene Expression Impact Cellular Memory
- auteur
- Guillaume Corre, Daniel Stockholm, Ophélie Arnaud, Gaël Kaneko, José Viñuelas, Yoshiaki Yamagata, Thi My Anh Neildez-Nguyen, Jean-Jacques Kupiec, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon, András Paldi
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (12), pp.e115574. ⟨10.1371/journal.pone.0115574⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Model for Genome Size Evolution
- auteur
- Stephan Fischer, Samuel Bernard, Guillaume Beslon, Carole Knibbe
- article
- Bulletin of Mathematical Biology, 2014, 76 (9), pp.2249 - 2291. ⟨10.1007/s11538-014-9997-8⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Torsion-Mediated Interaction between Adjacent Genes
- auteur
- Sam Meyer, Guillaume Beslon
- article
- PLoS Computational Biology, 2014, 10 (9), pp.e1003785. ⟨10.1371/journal.pcbi.1003785⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comments to the Editor. Reply to the Comment by V.P. Shkilev on "Anomalous versus slowed-down Brownian diffusion in the ligand-binding equilibrium
- auteur
- Hédi Soula, Bertrand Caré, Guillaume Beslon, Hugues Berry
- article
- Biophysical Journal, 2014, 106 (11), pp.2544-2546. ⟨10.1016/j.bpj.2014.03.052⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.5
- auteur
- Guillaume Beslon, Carole Knibbe, Charles Rocabert
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.3
- auteur
- Guillaume Beslon, Paulien Hogeweg, Carole Knibbe, Charles Rocabert, Susan Stepney
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 2.1
- auteur
- Guillaume Beslon, Paul Andrews, Carole Knibbe, Charles Rocabert
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 6.1
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 6.2
- auteur
- Guillaume Beslon, Santiago F. Elena, Dominique Schneider
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhône-Alpes. 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EvoEvo Deliverable 1.1
- auteur
- Dominique Schneider, Guillaume Beslon, Santiago F. Elena, Otmane Lamrabet
- article
- [Research Report] INRIA Grenoble - Rhone-Alpes. 2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- In silico experimental evolution: a tool to test evolutionary scenarios
- auteur
- Bérénice Batut, David P. Parsons, Stephan Fischer, Guillaume Beslon, Carole Knibbe
- article
- BMC Bioinformatics, 2013, 14 (Suppl 15), pp.S11
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-
- titre
- Anomalous versus slowed-down Brownian diffusion in the ligand-binding equilibrium
- auteur
- Hédi Soula, Bertrand Caré, Guillaume Beslon, Hugues Berry
- article
- Biophysical Journal, 2013, 105 (9), pp.2064-2073. ⟨10.1016/j.bpj.2013.07.023⟩
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-
- titre
- Quantifying the contribution of chromatin dynamics to stochastic gene expression reveals long, locus-dependent periods between transcriptional bursts.
- auteur
- José Viñuelas, Gaël Kaneko, Antoine Coulon, Elodie Vallin, Valérie Morin, Camila Mejia-Pous, Jean-Jacques Kupiec, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- BMC Biology, 2013, 11 (1), pp.15. ⟨10.1186/1741-7007-11-15⟩
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-
Conference papers
- titre
- An alife game to teach evolution of antibiotic resistance
- auteur
- Guillaume Beslon, Bérénice Batut, David P. Parsons, Dominique Schneider, Carole Knibbe
- article
- ECAL - 12th European Conference on Artificial Life - 2013, Sep 2013, Taormina, Italy. pp.43-50
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-
Book sections
- titre
- De la modélisation comme poésie. La modélisation de systèmes biologiques complexes vue par deux modélisateurs
- auteur
- Hugues Berry, Guillaume Beslon
- article
- Franck Varenne and Marc Silberstein. Modéliser & simuler. Epistémologies et pratiques de la modélisation et de la simulation, 1, Editions Matériologiques, Paris, 2013, 978-2-919694-19-8
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-
2012
Journal articles
- titre
- Chance at the heart of the cell
- auteur
- Olivier Gandrillon, Delphine Kolesnik-Antoine, Jean-Jacques Kupiec, Guillaume Beslon
- article
- Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2012, Special Issue: Chance at the heart of the cell, 110 (1), pp.1-4. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2012.05.006⟩
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-
- titre
- Complex Systems Science: Dreams of Universality, Reality of Interdisciplinarity
- auteur
- Sebastian Grauwin, Guillaume Beslon, Eric Fleury, Sara Franceschelli, Céline Robardet, Jean-Baptiste Rouquier, Pablo Jensen
- article
- Journal of the American Society for Information Science and Technology, 2012, 63 (7), pp.10.1002/asi.22644. ⟨10.1002/asi.22644⟩
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-
- titre
- New insights into bacterial adaptation through in vivo and in silico experimental evolution
- auteur
- Thomas Hindré, Carole Knibbe, Guillaume Beslon, Dominique Schneider
- article
- Nature Reviews Microbiology, 2012, 10 (5), pp.352-365. ⟨10.1038/nrmicro2750⟩
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-
- titre
- Membrane microdomains emergence through non-homogeneous diffusion.
- auteur
- Hédi Soula, Antoine Coulon, Guillaume Beslon
- article
- BMC Biophysics, 2012, 5 (1), pp.6. ⟨10.1186/2046-1682-5-6⟩
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-
- titre
- Towards experimental manipulation of stochasticity in gene expression.
- auteur
- José Viñuelas, Gaël Kaneko, Antoine Coulon, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2012, 100 (1), epub ahead of print. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2012.04.010⟩
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-
Conference papers
- titre
- The Paradoxical Effects of Allelic Recombination on Fitness
- auteur
- David P. Parsons, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- Proceedings of Artificial Life XIII, Jul 2012, East Lansing, France. pp.536--537
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-
Poster communications
- titre
- Simulating evolutionary scenarios to test whether they can induce reductive evolution
- auteur
- Bérénice Batut, Mathilde Dumond, Gabriel Marais, Guillaume Beslon, Carole Knibbe
- article
- SMBE 2012 : Society for Molecular Biology and Evolution, Jun 2012, Dublin, Ireland
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-
2011
Journal articles
- titre
- Les complexités : point de vue d'un institut des systèmes complexes
- auteur
- Eric Bertin, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon, Sebastian Grauwin, Pablo Jensen, Nicolas Schabanel
- article
- Hermès, La Revue - Cognition, communication, politique, 2011, 2 (60), pp.145-150. ⟨10.4267/2042/45459⟩
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-
- titre
- Enhanced Stimulus Encoding Capabilities with Spectral Selectivity in Inhibitory Circuits by STDP
- auteur
- Antoine Coulon, Guillaume Beslon, Hédi Soula
- article
- Neural Computation, 2011, 23 (4), pp.882-908
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-
- titre
- Computing with bacterial constituents, cells and populations: from bioputing to bactoputing
- auteur
- Victor Norris, Abdallah Zemirline, Patrick Amar, Jean Nicolas Audinot, Pascal Ballet, Eshel Ben Jacob, Gilles Bernot, Guillaume Beslon, Armelle Cabin-Flaman, Eric Fanchon, Jean-Louis Giavitto, Nicolas Glade, Patrick Greussay, Yohann Grondin, James A Foster, Guillaume Hutzler, Jürgen Jost, François Kepes, Olivier Michel, Franck Molina, Jacqueline Signorini, Pasquale Stano, Alain R. Thierry
- article
- Theory in Biosciences, 2011
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-
- titre
- Computing with bacterial constituents, cells and populations: from bioputing to bactoputing
- auteur
- Vic Norris, Abdallah Zemirline, Patrick Amar, Jean Nicolas Audinot, Pascal Ballet, Eshel Ben-Jacob, Gilles Bernot, Guillaume Beslon, Armelle Cabin, Eric Fanchon, Jean-Louis Giavitto, Nicolas Glade, Patrick Greussay, Yohann Grondin, James A Foster, Guillaume Hutzler, Jürgen Jost, Francois Kepes, Olivier Michel, Franck Molina, Jacqueline Signorini, Pasquale Stano, Alain R Thierry
- article
- Theorie in den Biowissenschaften / Theory in Biosciences, 2011, 130 (3), pp.211-228. ⟨10.1007/s12064-010-0118-4⟩
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-
Conference papers
- titre
- Parsimonious modeling of scaling laws in genomes and transcriptomes
- auteur
- Carole Knibbe, David P. Parsons, Guillaume Beslon
- article
- Proceedings of the Eleventh European Conference on the Synthesis and Simulation of Living Systems (ECAL 11), Aug 2011, Paris, France. pp.414--415
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-
- titre
- Homologous and Nonhomologous Rearrangements: Interactions and Effects on Evolvability.
- auteur
- David P. Parsons, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- Proceedings of the Eleventh European Conference on the Synthesis and Simulation of Living Systems (ECAL 11), Aug 2011, Paris, France. pp.622--629
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-
Poster communications
- titre
- Optimization of proton therapy ballistics using a genetic algorithm
- auteur
- François Smekens, Jean-Michel Létang, Nicolas Freud, Bruno Sixou, Guillaume Beslon
- article
- Particle Therapy Co-Operative Group, PTCOG, May 2011, Philadelphia (US), United States. 2011
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-
- titre
- Chromatin is a major player in regulating gene expression stochasticity in higher eukaryotic cells
- auteur
- José Viñuelas, Gaël Kaneko, Valérie Morin, Elodie Vallin, Antoine Coulon, Camila Meijia-Pous, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- Stochastic Systems Biology conference, Jul 2011, Ascona, Switzerland. 2011
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-
2010
Journal articles
- titre
- From Digital Genetics to Knowledge Discovery: Perspectives in Genetic Network Understanding
- auteur
- Guillaume Beslon, David P. Parsons, Jose-Maria Pena, Christophe Rigotti, Yolanda Sanchez-Dehesa
- article
- Intelligent Data Analysis, 2010, 14 (2), pp.173--191. ⟨10.3233/IDA-2010-0415⟩
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-
- titre
- À propos de la validité des modèles
- auteur
- Guillaume Beslon, Joanna Jongwane
- article
- Interstices, 2010
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-
- titre
- Scaling Laws in Bacterial Genomes: A Side-Effect of Selection of Mutational Robustness
- auteur
- Guillaume Beslon, David P. Parsons, Yolanda Sanchez-Dehesa, Jose-Maria Peña, Carole Knibbe
- article
- BioSystems, 2010, 102 (1), pp.32-40. ⟨10.1016/j.biosystems.2010.07.009⟩
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-
- titre
- On the spontaneous stochastic dynamics of a single gene: complexity of the molecular interplay at the promoter.
- auteur
- Antoine Coulon, Olivier Gandrillon, Guillaume Beslon
- article
- BMC Systems Biology, 2010, 4, pp.2. ⟨10.1186/1752-0509-4-2⟩
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-
Conference papers
- titre
- Aevol : un modèle individu-centré pour l’étude de la structuration des génomes
- auteur
- David P. Parsons, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- MajecSTIC, Oct 2010, Bordeaux, France
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-
- titre
- Influence of the rearrangement rates on the organization of genome transcription
- auteur
- David P. Parsons, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- JOBIM, Jun 2010, Montpellier, France
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-
- titre
- Importance of the rearrangement rates on the organization of transcription.
- auteur
- David P. Parsons, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- Proceedings of Artificial Life XII, Aug 2010, Odense, Denmark. pp.479--486
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-
- titre
- Influence of the rearrangement rates on the organization of genome transcription
- auteur
- David P. Parsons, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- Integrative Post-Genomics, Nov 2010, Lyon, France
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-
2009
Conference papers
- titre
- Scaling Laws in Digital Organisms
- auteur
- Guillaume Beslon, Yolanda Sanchez-Dehesa, David P. Parsons, Jose Maria Pena, Carole Knibbe
- article
- Proc. Information Processing in Cells and Tissues IPCAT'09, Apr 2009, Ascona, Switzerland. pp.111-114
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-
- titre
- Hyperstructures 2008-2009
- auteur
- Victor Norris, Anne-Françoise Batto, Pascal Ballet, Georgia Barlovatz, Gilles Bernot, Guillaume Beslon, Armelle Cabin-Flaman, Sylvie Chevalier, Anthony Delaune, Jean-Marc Delosme, Eric Fanchon
- article
- modelling complex biological systems, 2009, Evry, France
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-
- titre
- Evolution of scaling laws in artificial regulation networks
- auteur
- David P. Parsons, Guillaume Beslon, Carole Knibbe, Yolanda Sanchez-Dehesa, Jose Maria Pena
- article
- Integrative Post-Genomics, Nov 2009, Lyon, France. pp.22-22
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-
Book sections
- titre
- Mécanismes moléculaires et fonction biologique de la variabilité de l'expression génique à l'échelle de la cellule unique : une approche systémique
- auteur
- Antoine Coulon, Guillaume Beslon, François Chatelain, Alexandra Fuchs, Olivier Gandrillon, M Gineste, Jean-Jacques Kupiec, Camila Mejia-Perez, Andras Paldi
- article
- Le Hasard au coeur de la cellule, Syllepse edition, pp.82-111, 2009, ⟨10.3917/edmat.kupie.2011.01.0082⟩
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-
Other publications
- titre
- French Roadmap for complex Systems 2008-2009
- auteur
- David Chavalarias, Paul Bourgine, Edith Perrier, Frédéric Amblard, François Arlabosse, Pierre Auger, Jean-Bernard Baillon, Olivier Barreteau, Pierre Baudot, Elisabeth Bouchaud, Soufian Ben Amor, Hugues Berry, Cyrille Bertelle, Marc Berthod, Guillaume Beslon, Giulio Biroli, Daniel Bonamy, Daniele Bourcier, Nicolas Brodu, Marc Bui, Yves Burnod, Bertrand Chapron, Catherine Christophe, Bruno Clément, Jean-Louis Coatrieux, Jean-Philippe Cointet, Valérie Dagrain, Katia Dauchot, Olivier Dauchot, François Daviaud, Silvia de Monte, Guillaume Deffuant, Pierre Degond, Jean-Paul Delahaye, René Doursat, Francesco d'Ovidio, Marc A. Dubois, Berengère Dubruelle, Marie Dutreix, Robert Faivre, Emmanuel Farge, Patrick Flandrin, Sara Franceschelli, Cédric Gaucherel, Jean-Pierre Gaudin, Michael Ghil, Jean-Louis Giavitto, Francesco Ginelli, Vincent Ginot, François Houllier, Bernard Hubert, Pablo Jensen, Ludovic Jullien, Zoï Kapoula, Daniel Krob, François Ladieu, Gabriel Lang, Chrsitophe Lavelle, André Le Bivic, Jean-Pierre Leca, Christophe Lecerf, Pierre Legrain, Denis L'Hôte, Maud Loireau, Jean-François Mangin, Olivier Monga, Michel Morvan, Jean-Pierre Muller, Ioan Negrutiu, Nadine Peyreiras, Denise Pumain, Ovidiu Radulescu, Jean Sallantin, Eric Sanchis, D Schertzer, Marc Schoenauer, Michèle Sebag, Eric Simonet, Adrien Six, Fabien Tarissan, Patrick Vincent
- article
- 2009
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-
Poster communications
- titre
- Relationship between chromosomal features and gene expression stochasticity in higher eukaryotic cells
- auteur
- José Viñuelas, Gaël Kaneko, Antoine Coulon, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- Integrative Post-Genomics, Nov 2009, Lyon, France. pp.36-36, 2009
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-
2008
Journal articles
- titre
- Large multiprotein structures modeling and simulation: the need for mesoscopic models.
- auteur
- Antoine Coulon, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- Methods in Molecular Biology, 2008, 484, pp.537-58. ⟨10.1007/978-1-59745-398-1_32⟩
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-
- titre
- The topology of the protein network influences the dynamics of gene order: from systems biology to a systemic understanding of evolution
- auteur
- C. Knibbe, J.M. Fayard, Guillaume Beslon
- article
- Artificial Life, 2008, 14 (1), pp.149-156. ⟨10.1162/artl.2008.14.1.149⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- From Molecules to Organisms: Towards Multiscale Integrated Models of Biological Systems
- auteur
- Christophe Lavelle, Hugues Berry, Guillaume Beslon, Francisco Ginelli, Jean-Louis Giavitto, Zoï Kapoula, André Le Bivic, Nadine Peyriéras, Ovidiu Radulescu, Adrien Six, Véronique Thomas-Vaslin, Paul Bourgine
- article
- Theoretical Biology Insights, 2008, 1, pp.13-22
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modelling Evolution of Regulatory Networks in Artificial Bacteria
- auteur
- Yolanda Sanchez-Dehesa, David P. Parsons, Jose Maria Pena, Guillaume Beslon
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2008, 2, 3, pp.27-66. ⟨10.1051/mmnp:2008054⟩
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-
Conference papers
- titre
- Evolution of genome structure : a computational approach
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- Workshop “Evolutionary Dynamics” , Mar 2008, Utrecht, Netherlands
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-
- titre
- Modeling evolution of genetic regulation in artificial bacteria
- auteur
- Guillaume Beslon, Yolanda Sanchez-Dehesa, Jose Maria Pena
- article
- European Conference on Complex Systems, Sep 2008, Jérusalem, Israel. pp.4
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-
- titre
- Evolution des organismes bactériens
- auteur
- Guillaume Beslon, Federica Calevro, Hubert Charles, Jean-Michel Fayard, Carole Knibbe, Stéphane Génieys, Marie-France Sagot
- article
- Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", Jul 2008, Villeurbanne, France. 12 diapos
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-
- titre
- Petits bricolages en évolution
- auteur
- Guillaume Beslon, Sara Franceschelli, Carole Knibbe
- article
- "Génies de la Bricole et du Bricolage", colloque en hommage à Claude Levy-Strauss, Nov 2008, Lyon, France
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-
- titre
- Optimisation incrémentale de réseaux de neurones RBF pour la régression via un algorithme évolutionnaire : RBF-Gene
- auteur
- Virginie Lefort, Guillaume Beslon
- article
- Actes 8° Journées Francophones Extraction et Gestion des Connaissances EGC'08, Jan 2008, Sophia-Antipolis, France. pp.331-336
- Accès au bibtex
-
- titre
- From bioputing to bactoputing: computing with bacteria
- auteur
- Victor Norris, Abdallah Zemirline, Patrick Amar, Pascal Ballet, Eshel Ben Jacob, Gilles Bernot, Guillaume Beslon, Eric Fanchon, Jean-Louis Giavitto, Nicolas Glade, Patrick Greussay, Yohann Grondin, James A. Foster, Guillaume Hutzler, François Képès, Olivier Michel, Gradimir Misevic, Franck Molina, Jacqueline Signorini, Pasquale Stano, Alain Thierry
- article
- Lille Spring School on Modelling Complex Biological Systems in the Context of Genomics, Apr 2008, Paris, France. pp.123-150
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-
Poster communications
- titre
- Gene expression and the dynamics of transcriptional regulation : a model for theoretical and experimental investigations
- auteur
- Antoine Coulon, Olivier Gandrillon, Guillaume Beslon
- article
- Integrative Post-Genomics, IPG'08, Nov 2008, Lyon, France. 2008
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling membrane micro-domain formation through inhomogeneous diffusion
- auteur
- Hédi Soula, Guillaume Beslon
- article
- Integrative Post-Genomics, IPG'08, Nov 2008, Lyon, France. 2008
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Apprivoiser la vie
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- 2008
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-
2007
Journal articles
- titre
- Modélisation cellulaire pour l'émergence de structures multiprotéiques auto-organisées
- auteur
- Antoine Coulon, Hédi Soula, Olivier Mazet, Olivier Gandrillon, Guillaume Beslon
- article
- Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série TSI : Technique et Science Informatiques, 2007, 1-2, 26, pp.123-148. ⟨10.3166/tsi.26.123-148⟩
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-
Conference papers
- titre
- Evolution de Second Ordre : le hasard sélectionné.
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- Spring school on interdisciplinarity in biology "Hasard et Fluctuations en Biologie", May 2007, Berder, France
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-
- titre
- Digital Genetics: Modéliser la dynamique évolutive des génomes
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- Journées communes des clusters environnement et informatique à l'INRIA Montbonnot, Nov 2007, Grenoble, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Systems Biology, where is the network ?
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- Santa-Fe Institute, Jul 2007, Santa-Fe, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effect of bottlenecks on genome size: investigations by digital genetics
- auteur
- Gaël Kaneko, Carole Knibbe, Guillaume Beslon
- article
- Integrative Post-Genomics, Nov 2007, Lyon, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- RAevol, un modèle de génétique digitale des réseaux de régulation
- auteur
- Yolanda Sanchez-Dehesa, Jose Maria Pena, Guillaume Beslon
- article
- Réseaux d'Interactions : Analyse, Modélisation, Simulation, RIAMS 2007, Nov 2007, Lyon, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling evolution of Regulatory Networks in Artificial Organisms
- auteur
- Yolanda Sanchez-Dehesa, Guillaume Beslon, Jose Maria Pena
- article
- 3rd International Symposium on Computational Life Science CompLife'07, Oct 2007, Utrecht, Netherlands. pp.87-98, ⟨10.1063/1.2793407⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Generating Data form the Evolution of Artificial Regulatory Networks
- auteur
- Yolanda Sanchez-Dehesa, Jose Maria Pena, Guillaume Beslon
- article
- Workshop Data Mining in Functional Genomics and Proteomics. Current Trends and Future Directions co-located with ECML/PKDD 07, Sep 2007, Varsovie, Poland. pp.91-103
- Accès au bibtex
-
- titre
- Artificial Regulatory Networks Evolution
- auteur
- Yolanda Sanchez-Dehesa, Loïc Cerf, Jose Maria Pena, Jean-François Boulicaut, Guillaume Beslon
- article
- Proc 1st Int Workshop on Machine Learning for Systems Biology MLSB 07, Sep 2007, Evry, France. pp.47-52
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Binding cooperation and competition among transcription factors can cause complex stochastic properties in gene expression
- auteur
- Antoine Coulon, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- Integrative Post-Genomics, IPG'07, Nov 2007, Lyon, France. 2007
- Accès au bibtex
-
2006
Journal articles
- titre
- Guidelines: From artificial evolution to computational evolution: a research agenda
- auteur
- Wolfgang Banzhaf, Guillaume Beslon, Stephen Christensen, A. James, François Képès, Virginie Lefort, F. Julian, Miroslav Radman, Jeremy J. Ramsden
- article
- Nature Reviews Genetics, 2006, 7 (9), pp.729--735. ⟨10.1038/nrg1921⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Multi-Agent Modeling of Nuclear Structures.
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- Spring workshop on biological systems modeling, Mar 2006, Bombannes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolution et Robustesse : un équilibre complexe aux conséquences inattendues.
- auteur
- Guillaume Beslon
- article
- Journées de Gerland "Systèmes complexes et biologie", Dec 2006, Lyon, France
- Accès au bibtex
-
2005
Journal articles
- titre
- Modeling the emergence of multi-protein dynamic structures by principles of self-organization through the use of 3DSpi, a multi-agent-based software
- auteur
- Hédi Soula, Céline Robardet, Fran\c Cois Perrin, Sébastien Gripon, Guillaume Beslon, Olivier Gandrillon
- article
- BMC Bioinformatics, 2005, 6, pp.228. ⟨10.1186/1471-2105-6-228⟩
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-
Conference papers
- titre
- The topology of the protein network influences the dynamics of gene order: From systems biology to a systemic understanding of evolution
- auteur
- Carole Knibbe, Jean-Michel Fayard, Guillaume Beslon
- article
- 8. European Conference on Artificial Life, Sep 2005, Canterbury,, United Kingdom. ⟨10.1162/artl.2008.14.1.149⟩
- Accès au bibtex
-
2004
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Spontaneous Dynamics of Asymmetric Random Recurrent Spiking Neural Networks
- auteur
- Hédi Soula, Guillaume Beslon, Olivier Mazet
- article
- 2004
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2003
Poster communications
- titre
- Bioinformatique du transcriptome de Buchnera, symbiote intracellulaire des pucerons
- auteur
- Hubert Charles, Federica Calevro, Nancie Reymond, Frederique Laforest, Anne Tchounikine, Guillaume Beslon, Hédi Soula, Vincent Dugas, J.P. P Cloarec, Jacques Bernillon, Yvan Rahbé, Gérard Febvay, Jean-Michel Fayard
- article
- Rencontres 2003 des Microbiologistes de l'INRA, May 2003, Dourdan, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- ROSO: a software to search optimized oligonucleotide probes for microarrays
- auteur
- Nancie Reymond, Hubert Charles, Guillaume Beslon, Laurent Duret, Jean-Michel Fayard
- article
- 14. Rencontres Régionales de la Recherche, Oct 2003, Saint-Etienne, France
- Accès au bibtex
-
2002
Conference papers
- titre
- ROSO: A software to search optimized oligonucleotide probes for microarrays
- auteur
- Hubert Charles, Nancie Reymond, Guillaume Beslon, Laurent Duret, Jean-Michel Fayard
- article
- COST853: Agricultural Biomarkers for Array-Technology, Sep 2002, Waedenswill, Switzerland
- Accès au bibtex
-
- titre
- 2DS'PI 2 Dimensional Dynamic Simulation of Proteins' Interactions
- auteur
- Tiphaine Martin, Céline Charavay, Audrey Herr, Céline Becquet, Hédi Soula, Aldo Deandrea, François Morlé, Olivier Gandrillon, Guillaume Beslon
- article
- Journées de post-génomique de la DOUA 2002, JPG'02, Jun 2002, Lyon, France
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Functional space approach for evolutionary algorithms
- auteur
- Guillaume Beslon, Hubert Charles, Jean-Michel Fayard, Olivier Gandrillon, Olivier Mazet, Hédi Soula
- article
- Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'02, Mar 2002, Villeurbanne, France
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-
- titre
- Modeling evolution through a genetic regulation network
- auteur
- Guillaume Beslon, Hubert Charles, Jean-Michel Fayard, Olivier Gandrillon, Olivier Mazet
- article
- Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'02, Mar 2002, Villeurbanne, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- ROSO : un logiciel de recherche et d'optimisation des sondes oligonucléotidiques destinées aux puces à ADN
- auteur
- Nancie Reymond, Hubert Charles, Guillaume Beslon, Jean-Michel Fayard
- article
- Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Jun 2002, Saint-Malo, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- ROSO : un logiciel de recherche et d'optimisation des sondes oligonucléotidiques destinées aux puces à ADN
- auteur
- Nancie Reymond, Hubert Charles, Guillaume Beslon, Jean-Michel Fayard
- article
- Intersciences 2002, Colloque des doctorants scientifiques de Lyon, Apr 2002, Villeurbanne, France
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-
- titre
- ROSO : A Software to Search Optimized Oligonucleotide Probes for Microarrays
- auteur
- Nancie Reymond, Hubert Charles, Guillaume Beslon, Laurent Duret, Jean-Michel Fayard
- article
- 10. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Aug 2002, Edmonton, Canada
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-
- titre
- ROSO : un logiciel de recherche et d'optimisation des sondes oligonucléotidiques
- auteur
- Nancie Reymond, Hubert Charles, Guillaume Beslon, Jean-Michel Fayard
- article
- Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'02, Mar 2002, Villeurbanne, France
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-
2001
Poster communications
- titre
- Développement d'un logiciel d'optimisation de sondes oligonucléotidiques destinées aux puces à ADN
- auteur
- Nancie Reymond, Hubert Charles, Guillaume Beslon, Jean-Michel Fayard
- article
- Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'01, Apr 2001, villeurbanne, France
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-