Publications HAL du labo/EPI galen

2020

Journal articles

titre: Artificial intelligence applications for thoracic imaging
auteur: Guillaume Chassagnon, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article: European Journal of Radiology, Elsevier, 2020, 123, pp.108774. ⟨10.1016/j.ejrad.2019.108774⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.ejrad.2019.108774
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2019

Journal articles

titre: Deep learning: definition and perspectives for thoracic imaging
auteur: Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article: European Radiology, Springer Verlag, 2019, 30, p. 2021-2030. ⟨10.1007/s00330-019-06564-3⟩
DOI: DOI : 10.1007/s00330-019-06564-3
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titre: Optimal Multivariate Gaussian Fitting with Applications to PSF Modeling in Two-Photon Microscopy Imaging
auteur: Emilie Chouzenoux, Tim Tsz-Kit Lau, Claire Lefort, Jean-Christophe Pesquet
article: Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2019, 61 (7), pp.1037-1050. ⟨10.1007/s10851-019-00884-1⟩
DOI: DOI : 10.1007/s10851-019-00884-1
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titre: A probabilistic incremental proximal gradient method
auteur: Ömer Deniz Akyildiz, Emilie Chouzenoux, Víctor Elvira, Joaquín Míguez
article: IEEE Signal Processing Letters, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, 26 (8), pp.1257-1261. ⟨10.1109/LSP.2019.2926926⟩
DOI: DOI : 10.1109/LSP.2019.2926926
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titre: Use of Elastic Registration in Pulmonary MRI for the Assessment of Pulmonary Fibrosis in Patients with Systemic Sclerosis
auteur: Guillaume Chassagnon, Charlotte Martin, Rafael Marini, Maria Vakalopoulou, Alexis Régent, Luc Mouthon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel
article: Radiology, Radiological Society of North America, 2019, 291 (2), pp.487-492. ⟨10.1148/radiol.2019182099⟩
DOI: DOI : 10.1148/radiol.2019182099
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titre: Generation of patient-specific cardiac vascular networks: a hybrid image-based and synthetic geometric model
auteur: Clara Jaquet, Laurent Najman, Hugues Talbot, Leo Grady, Michiel Schaap, Buzzy Spain, Hyun Jin Kim, Irene Vignon-Clementel, Charles A. Taylor
article: IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, 66 (4), pp.946-955. ⟨10.1109/TBME.2018.2865667⟩
DOI: DOI : 10.1109/TBME.2018.2865667
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titre: Stochastic Quasi-Fejér Block-Coordinate Fixed Point Iterations With Random Sweeping II: Mean-Square and Linear Convergence
auteur: Patrick L Combettes, Jean-Christophe Pesquet
article: Mathematical Programming, Springer Verlag, 2019, 174 (1-2), pp.433-451
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titre: Rational optimization for nonlinear reconstruction with approximate ℓ0 penalization
auteur: Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet, Arthur Marmin
article: IEEE Transactions on Signal Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, 67 (6), pp.1407-1417. ⟨10.1109/TSP.2018.2890065⟩
DOI: DOI : 10.1109/TSP.2018.2890065
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titre: A Novel Object-Based Deep Learning Framework for Semantic Segmentation of Very High-Resolution Remote Sensing Data: Comparison with Convolutional and Fully Convolutional Networks
auteur: Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article: Remote Sensing, MDPI, 2019, 11 (6), pp.684. ⟨10.3390/rs11060684⟩
DOI: DOI : 10.3390/rs11060684
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titre: An Alternating Proximal Approach for Blind Video Deconvolution
auteur: Feriel Abboud, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Jean-Hugues Chenot, Louis Laborelli
article: Signal Processing: Image Communication, Elsevier, 2019, 70, pp.21-36. ⟨10.1016/j.image.2018.08.007⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.image.2018.08.007
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titre: nD variational restoration of curvilinear structures with prior-based directional regularization
auteur: Odyssée Merveille, Benoît Naegel, Hugues Talbot, Nicolas Passat
article: IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, 28 (8), pp.3848-3859. ⟨10.1109/TIP.2019.2901706⟩
DOI: DOI : 10.1109/TIP.2019.2901706
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Conference papers

titre: Detecting the Rank of a Symmetric Tensor
auteur: Arthur Marmin, Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet
article: EUSIPCO 2019 - 27th European Signal Processing Conference, Sep 2019, Coruña, Spain. pp.1-5
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titre: Image Registration of Satellite Imagery with Deep Convolutional Neural Networks
auteur: Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios
article: IGARSS 2019 - 2019 IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, France. pp.4939-4942, ⟨10.1109/IGARSS.2019.8898220⟩
DOI: DOI : 10.1109/IGARSS.2019.8898220
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titre: Sparse signal reconstruction with a sign oracle
auteur: Arthur Marmin, Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet
article: SPARS 2019 - Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations - Workshop, Jul 2019, Toulouse, France
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titre: Greedy Layerwise Learning Can Scale to ImageNet
auteur: Eugene Belilovsky, Michael Eickenberg, Edouard Oyallon
article: ICML 2019 - 36th International Conference on Machine Learning, Jun 2019, Long Beach, CA, United States
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titre: Gene Expression High-Dimensional Clustering towards a Novel, Robust, Clinically Relevant and Highly Compact Cancer Signature
auteur: Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Roger Sun, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Eric Deutsch
article: IWBBIO 2019 - 7th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, May 2019, Granada, Spain
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Theses

titre: Nonconvex Alternating Direction Optimization for Graphs: Inference and Learning
auteur: Ð.Khuê Lê-Huu
article: Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. CentraleSupélec, Université Paris-Saclay, 2019. English
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2018

Journal articles

titre: Robot–Robot Gesturing for Anchoring Representations
auteur: Polychronis Kondaxakis, Khurram Gulzar, Stefan Kinauer, Iasonas Kokkinos, Ville Kyrki
article: IEEE Transactions on Robotics, IEEE, 2018, pp.1-15. ⟨10.1109/TRO.2018.2875388⟩
DOI: DOI : 10.1109/TRO.2018.2875388
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titre: MATI: An efficient algorithm for influence maximization in social networks
auteur: Maria Evgenia G. Rossi, Bowen Shi, Nikolaos Tziortziotis, Fragkiskos Malliaros, Christos Giatsidis, Michalis Vazirgiannis
article: PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, ⟨10.1371/journal.pone.0206318⟩
DOI: DOI : 10.1371/journal.pone.0206318
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titre: Scattering Networks for Hybrid Representation Learning
auteur: Edouard Oyallon, Sergey Zagoruyko, Gabriel Huang, Nikos Komodakis, Simon Lacoste-Julien, Matthew Blaschko, Eugene Belilovsky
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, pp.11. ⟨10.1109/TPAMI.2018.2855738⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2018.2855738
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titre: A radiomics approach to assess tumour-infiltrating CD8 cells and response to anti-PD-1 or anti-PD-L1 immunotherapy: an imaging biomarker, retrospective multicohort study
auteur: Roger Sun, Elaine Johanna Limkin, Maria Vakalopoulou, Laurent Dercle, Stéphane Champiat, Shan Rong Han, Loic Verlingue, David Brandao, Andrea Lancia, Samy Ammari, Antoine Hollebecque, Jean-Yves Scoazec, Aurélien Marabelle, Christophe Massard, Jean-Charles Soria, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Éric Deutsch, Charles Ferté
article: Lancet Oncology, Elsevier, 2018, 19 (9), pp.1180-1191. ⟨10.1016/S1470-2045(18)30413-3⟩
DOI: DOI : 10.1016/S1470-2045(18)30413-3
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titre: k-Degree anonymity on directed networks
auteur: Jordi Casas-Roma, Julián Salas, Fragkiskos Malliaros, Michalis Vazirgiannis
article: Knowledge and Information Systems (KAIS), Springer, 2018, 61, pp.1743-1768. ⟨10.1007/s10115-018-1251-5⟩
DOI: DOI : 10.1007/s10115-018-1251-5
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titre: Demystification of AI-driven medical image interpretation: past, present and future
auteur: Peter Savadjiev, Jaron Chong, Anthony Dohan, Maria Vakalopoulou, Caroline Reinhold, Nikos Paragios, Benoit Gallix
article: European Radiology, Springer Verlag, 2018, 29, p. 1616-1624. ⟨10.1007/s00330-018-5674-x⟩
DOI: DOI : 10.1007/s00330-018-5674-x
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titre: Detailed Land Cover Mapping from Multitemporal Landsat-8 Data of Different Cloud Cover
auteur: Christina Karakizi, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou, Georgia Antoniou
article: Remote Sensing, MDPI, 2018, 10 (8), pp.1214. ⟨10.3390/rs10081214⟩
DOI: DOI : 10.3390/rs10081214
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titre: BRANE Clust: Cluster-Assisted Gene Regulatory Network Inference Refinement
auteur: Aurélie Pirayre, Camille Couprie, Laurent Duval, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 15 (3), pp.850-860. ⟨10.1101/114769⟩
DOI: DOI : 10.1101/114769
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titre: Proximity operators of discrete information divergences
auteur: Mireille El Gheche, Giovanni Chierchia, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE Transactions on Information Theory, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 64 (2), pp.1092-1104. ⟨10.1109/TIT.2017.2782789⟩
DOI: DOI : 10.1109/TIT.2017.2782789
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titre: Graph-Based Slice-to-Volume Deformable Registration
auteur: Enzo Ferrante, Nikos Paragios
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2018, 126 (1), pp.36-58. ⟨10.1007/s11263-017-1040-8⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11263-017-1040-8
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titre: An Auxiliary Variable Method for Markov Chain Monte Carlo Algorithms in High Dimension
auteur: Yosra Marnissi, Emilie Chouzenoux, Amel Benazza-Benyahia, Jean-Christophe Pesquet
article: Entropy, MDPI, 2018, 20 (2), pp.110. ⟨10.3390/e20020110⟩
DOI: DOI : 10.3390/e20020110
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titre: Curvilinear structure analysis by ranking the orientation responses of path operators
auteur: Odyssée Merveille, Hugues Talbot, Laurent Najman, Nicolas Passat
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 40 (2), pp.304-317. ⟨10.1109/TPAMI.2017.2672972⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2017.2672972
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Conference papers

titre: Convolutional Transform learning
auteur: Jyoti Maggu, Emilie Chouzenoux, Giovanni Chierchia, Angshul Majumdar
article: ICONIP 2018 - 25th International Conference on Neural Information Processing, Dec 2018, Siem Reap, Cambodia. pp.162-174
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titre: DiffuGreedy: An Influence Maximization Algorithm based on Diffusion Cascades
auteur: George Panagopoulos, Fragkiskos Malliaros, Michalis Vazirgiannis
article: The 7th International Conference on Complex Networks and Their Applications (Complex Networks), Dec 2018, Cambridge, United Kingdom
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titre: BiasedWalk: Biased Sampling for Representation Learning on Graphs
auteur: Duong Nguyen, Fragkiskos Malliaros
article: International Workshop on High Performance Big Graph Data Management, Analysis, and Mining (BigGraphs), Dec 2018, Seattle, WA, United States. ⟨10.1109/bigdata.2018.8621872⟩
DOI: DOI : 10.1109/bigdata.2018.8621872
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titre: TNE: A Latent Model for Representation Learning on Networks
auteur: Abdulkadir Çelikkanat, Fragkiskos Malliaros
article: 32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2018), Relational Representation Learning Workshop, Dec 2018, Montréal, Canada
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titre: GraphRep: Boosting Text Mining, NLP and Information Retrieval with Graphs
auteur: Michalis Vazirgiannis, Fragkiskos Malliaros, Giannis Nikolentzos
article: 27th ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM), Oct 2018, Torino, Italy. pp.2295-2296, ⟨10.1145/3269206.3274273⟩
DOI: DOI : 10.1145/3269206.3274273
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titre: A Multicore Convex Optimization Algorithm with Applications to Video Restoration
auteur: Feriel Abboud, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Hugues Talbot
article: IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2018, Athens, Greece
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titre: AtlasNet: Multi-atlas Non-linear Deep Networks for Medical Image Segmentation
auteur: Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Norbert Bus, Rafael Marini Silva, Evangelia I. Zacharaki, Marie-Pierre Revel, Nikos Paragios
article: International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2018, Granada, Spain
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titre: Linear and Deformable Image Registration with 3D Convolutional Neural Networks
auteur: Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Marie-Pierre Revel, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios
article: Reconstruction and Analysis of Moving Body Organs, 21th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention 2018, Sep 2018, Grenada, Spain
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titre: Context Aware 3D CNNs for Brain Tumor Segmentation
auteur: Siddhartha Chandra, Maria Vakalopoulou, Lucas Fidon, Enzo Battistella, Théo Estienne, Roger Sun, Charlotte Robert, Eric Deutsch, Nikos Paragios
article: MICCAI Brainlesion Workshop, Sep 2018, Granada, Spain
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titre: Deforming Autoencoders: Unsupervised Disentangling of Shape and Appearance
auteur: Zhixin Shu, Mihir Sahasrabudhe, Riza Alp Güler, Dimitris Samaras, Nikos Paragios, Iasonas Kokkinos
article: The European Conference on Computer Vision, Sep 2018, Munich, Germany
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titre: Dense Pose Transfer
auteur: Natalia Neverova, Riza Alp Güler, Iasonas Kokkinos
article: European Conference on Computer Vision (ECCV) 2018, Sep 2018, Munich, Germany
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titre: Compressing the Input for CNNs with the First-Order Scattering Transform
auteur: Edouard Oyallon, Eugene Belilovsky, Sergey Zagoruyko, Michal Valko
article: ECCV 2018 - European Conference on Computer Vision, Sep 2018, Munich, Germany
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titre: Transformed Locally Linear Manifold Clustering
auteur: Jyoti Maggu, Angshul Majumdar, Emilie Chouzenoux
article: EUSIPCO 2018 - 26th European Signal Processing Conference, Sep 2018, Rome, Italy
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titre: Signal reconstruction from sub-sampled and nonlinearly distorted observations
auteur: Arthur Marmin, Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet, Laurent Duval
article: EUSIPCO 2018: 26th European Signal Processing Conference, Sep 2018, Roma, Italy. pp.1970-1974, ⟨10.23919/EUSIPCO.2018.8553174⟩
DOI: DOI : 10.23919/EUSIPCO.2018.8553174
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titre: Linear convergence of stochastic block-coordinate fixed point algorithms
auteur: Patrick L Combettes, Jean-Christophe Pesquet
article: European Signal and Image Processing Conference (EUSIPCO 2018), Sep 2018, Rome, Italy. ⟨10.23919/EUSIPCO.2018.8552941⟩
DOI: DOI : 10.23919/EUSIPCO.2018.8552941
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titre: Stacked Encoder-Decoders for Accurate Semantic Segmentation of Very High Resolution Satellite Datasets
auteur: Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
article: IGARSS 2018 - 38th annual International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2018, Valencia, Spain. pp.1-4
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titre: Geometry-Texture Decomposition/Reconstruction Using a Proximal Interior Point Algorithm
auteur: Marie-Caroline Corbineau, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: 10th IEEE Sensor Array and Multichannel Signal Processing Workshop (SAM 2018), Jul 2018, Sheffield, United Kingdom
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titre: Continuous Relaxation of MAP Inference: A Nonconvex Perspective
auteur: Ð.Khuê Lê-Huu, Nikos Paragios
article: CVPR 2018 - IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2018, Salt Lake City, United States. pp.1-19, ⟨10.1109/CVPR.2018.00580⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2018.00580
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titre: DensePose: Dense Human Pose Estimation In The Wild
auteur: Riza Alp Güler, Natalia Neverova, Iasonas Kokkinos
article: Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR) 2018, Jun 2018, Salt Lake City, United States
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titre: i-RevNet: Deep Invertible Networks
auteur: Jörn-Henrik Jacobsen, Arnold Smeulders, Edouard Oyallon
article: ICLR 2018 - International Conference on Learning Representations, Apr 2018, Vancouver, Canada
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titre: Nonlinear Acceleration of CNNs
auteur: Damien Scieur, Edouard Oyallon, Alexandre d'Aspremont, Francis Bach
article: ICLR Workshop track, Apr 2018, Vancouver, Canada
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titre: PIPA: A New Proximal Interior Point Algorithm for Large Scale Convex Optimization
auteur: Marie-Caroline Corbineau, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing (ICASSP 2018), Apr 2018, Calgary, Canada
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titre: Learning Filterbanks from Raw Speech for Phoneme Recognition
auteur: Neil Zeghidour, Nicolas Usunier, Iasonas Kokkinos, Thomas Schatz, Gabriel Synnaeve, Emmanuel Dupoux
article: ICASSP 2018 - IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, Apr 2018, Calgary, Alberta, Canada
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titre: Block-coordinate proximal algorithms for scale-free texture segmentation
auteur: Barbara Pascal, Nelly Pustelnik, Patrice Abry, Jean-Christophe Pesquet
article: ICASSP 2018 - IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, Apr 2018, Calgary, Canada. pp.1-5, ⟨10.1109/icassp.2018.8461991⟩
DOI: DOI : 10.1109/icassp.2018.8461991
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titre: Fast Dictionnary-Based Approach for Mass Spectrometry Data Analysis
auteur: Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, Delsuc Marc-André
article: IEEE International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing (ICASSP 2018), Apr 2018, Calgary, Canada
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titre: A Nonconvex Variational Approach for Robust Graphical Lasso.
auteur: Alessandro Benfenati, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing (ICASSP 2018), Apr 2018, Calgary, Canada
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titre: Optimal Multivariate Gaussian Fitting for PSF Modeling in Two-Photon Microscopy
auteur: Tim Tsz-Kit, Emilie Chouzenoux, Claire Lefort, Jean-Christophe Pesquet
article: 15 th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2018), Apr 2018, Washington DC, United States. ⟨10.1109/ISBI.2018.8363621⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2018.8363621
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titre: Deep patch-based priors under a fully convolutional encoder-decoder architecture for interstitial lung disease segmentation
auteur: Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel, Evangelia I. Zacharaki
article: ISBI’18 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, D.C., United States
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titre: Segmentation 3D des lésions du lymphome à partir de descripteurs multimodaux TEP/TDM
auteur: Eloïse Grossiord, Hugues Talbot, Nicolas Passat, Michel Meignan, Laurent Najman
article: Journée thématique du GdR ISIS : "Segmentation d'images biomédicales : quels outils pour l'analyse des données massives, hétérogènes et multimodales ?", 2018, Paris, France
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Reports

titre: A review on graph optimization and algorithmic frameworks
auteur: Alessandro Benfenati, Emilie Chouzenoux, Laurent Duval, Jean-Christophe Pesquet, Aurélie Pirayre
article: [Research Report] LIGM - Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge. 2018
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Theses

titre: Structured Sparse Learning on Graphs in High-Dimensional Data with Applications to NeuroImaging
auteur: Eugene Belilovsky
article: Machine Learning [cs.LG]. CentraleSupelec, 2018. English
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Preprints, Working Papers, ...

titre: Identifying the Best Machine Learning Algorithms for Brain Tumor Segmentation, Progression Assessment, and Overall Survival Prediction in the BRATS Challenge
auteur: Spyridon Bakas, Mauricio Reyes, Enzo Battistella, Siddhartha Chandra, Théo Estienne, Lucas Fidon, Maria Vakalopoulou, Roger Sun, Et Al., Éric Deutsch, Charlotte Robert, Nikos Paragios, Bjoern Menze
article: 2018
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titre: A Variational Method for Flicker Removal in High Speed Video Sequences
auteur: Ali Kanj, Hugues Talbot, Jean-Christophe Pesquet, Raoul Rodriguez Luparello
article: 2018
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2017

Journal articles

titre: A Stochastic Majorize-Minimize Subspace Algorithm for Online Penalized Least Squares Estimation
auteur: Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE Transactions on Signal Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, 65 (18), pp.4770 - 4783. ⟨10.1109/TSP.2017.2709265⟩
DOI: DOI : 10.1109/TSP.2017.2709265
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titre: Imagerie médicale computationnelle (radiomique) et potentiel en immuno-oncologie
auteur: Roger Sun, Elaine Johanna Limkin, Laurent Dercle, Sylvain Reuzé, Evangelia I Zacharaki, Cyrus Chargari, Antoine Schernberg, Anne-Sophie Dirand, Anthony Alexis, Nikos Paragios, Eric Deutsch, Charles Ferté, Charlotte Robert
article: Cancer Radiothérapie, Elsevier Masson, 2017, 21 (6-7), pp.648-654. ⟨10.1016/j.canrad.2017.07.035⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.canrad.2017.07.035
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titre: Slice-to-volume medical image registration: A survey
auteur: Enzo Ferrante, Nikos Paragios
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2017, 39, pp.101 - 123. ⟨10.1016/j.media.2017.04.010⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2017.04.010
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titre: Promises and challenges for the implementation of computational medical imaging (radiomics) in oncology
auteur: Elaine Johanna Limkin, Roger Sun, Laurent Dercle, Evangelia I Zacharaki, Charlotte Robert, Sylvain Reuzé, Antoine Schernberg, Nikos Paragios, Eric Deutsch, Charles Ferté
article: Annals of Oncology, Elsevier, 2017, 28 (6), pp.1191 - 1206. ⟨10.1093/annonc/mdx034⟩
DOI: DOI : 10.1093/annonc/mdx034
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titre: A Variational Bayesian Approach for Image Restoration. Application to Image Deblurring with Poisson-Gaussian Noise
auteur: Yosra Marnissi, Yuling Zheng, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE Transactions on Computational Imaging, IEEE, 2017, 3 (4), pp.722-737. ⟨10.1109/TCI.2017.2700203⟩
DOI: DOI : 10.1109/TCI.2017.2700203
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titre: Learning MRI-based classification models for MGMT methylation status prediction in glioblastoma
auteur: Vasileios G. Kanas, Evangelia I. Zacharaki, Ginu A. Thomas, Pascal O. Zinn, Vasileios Megalooikonomou, Rivka R. Colen
article: Computer Methods and Programs in Biomedicine, Elsevier, 2017, 140, pp.Pages 249-257. ⟨10.1016/j.cmpb.2016.12.018⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.cmpb.2016.12.018
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titre: EEG-based Classification of Epileptic and Non-epileptic Events using Multi-array Decomposition
auteur: Evangelia Pippa, Vasileios G. Kanas, Evangelia I. Zacharaki, Vasiliki Tsirka, Michael Koutroumanidis, Vasileios Megalooikonomou
article: International Journal of Monitoring and Surveillance Technologies Research, IGI Global, 2017, 4, pp.001-015. ⟨10.4018/ijmstr.2016040101⟩
DOI: DOI : 10.4018/ijmstr.2016040101
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titre: Data fusion for paroxysmal events' classification from EEG.
auteur: Evangelia Pippa, Evangelia I Zacharaki, Michael Koutroumanidis, Vasileios Megalooikonomou
article: Journal of Neuroscience Methods, Elsevier, 2017, 275, pp.55-65. ⟨10.1016/j.jneumeth.2016.10.004⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.jneumeth.2016.10.004
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titre: A Discrete MRF Framework for Integrated Multi-Atlas Registration and Segmentation
auteur: Stavros Alchatzidis, Aristeidis Sotiras, Evangelia I. Zacharaki, Nikos Paragios
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2017, 121, pp.169-181. ⟨10.1007/s11263-016-0925-2⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11263-016-0925-2
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titre: Dual Block Coordinate Forward-Backward Algorithm with Application to Deconvolution and Deinterlacing of Video Sequences
auteur: Feriel Abboud, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Jean-Hugues Chenot, Louis Laborelli
article: Journal of Mathematical Imaging and Vision, Springer Verlag, 2017, 59 (3), pp.415-431. ⟨10.1007/s10851-016-0696-y⟩
DOI: DOI : 10.1007/s10851-016-0696-y
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titre: Automatic single- and multi-label enzymatic function prediction by machine learning
auteur: Shervine Amidi, Afshine Amidi, Dimitrios Vlachakis, Nikos Paragios, Evangelia I. Zacharaki
article: PeerJ, PeerJ, 2017, 5, pp.1-16. ⟨10.7717/peerj.3095⟩
DOI: DOI : 10.7717/peerj.3095
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titre: PALMA, an improved algorithm for DOSY signal processing
auteur: Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, Marc-André Delsuc
article: Analyst, Royal Society of Chemistry, 2017, 142 (5), pp.772 - 779. ⟨10.1039/C6AN01902A⟩
DOI: DOI : 10.1039/C6AN01902A
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titre: Prediction of protein function using a deep convolutional neural network ensemble
auteur: Evangelia I. Zacharaki
article: PeerJ Computer Science, PeerJ, 2017, 3, pp.1-17. ⟨10.7717/peerj-cs.124⟩
DOI: DOI : 10.7717/peerj-cs.124
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Conference papers

titre: A Fast Algorithm Based on a Sylvester-like Equation for LS Regression with GMRF Prior
auteur: Qi Wei, Emilie Chouzenoux, Jean-Yves Tourneret, Jean-Christophe Pesquet
article: CAMSAP 2017- IEEE International Workshop on Computational Advances in Multi-Sensor Adaptive Processing, Dec 2017, Curaçao, Netherlands Antilles
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titre: Core Decomposition of Uncertain Graphs Using Representative Instances
auteur: Damien Seux, Fragkiskos Malliaros, Apostolos N Papadopoulos, Michalis Vazirgiannis
article: 6th International Conference on Complex Networks and Their Applications, Nov 2017, Lyon, France
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titre: MATI: An Efficient Algorithm for Influence Maximization in Social Networks
auteur: Maria Evgenia G. Rossi, Bowen Shi, Nikolaos Tziortziotis, Fragkiskos Malliaros, Christos Giatsidis, Michalis Vazirgiannis
article: Complex Networks 2017 - 6th International Conference on Complex Networks and Their Applications, Nov 2017, Lyon, France. pp.1-3, ⟨10.1371/journal.pone.0206318⟩
DOI: DOI : 10.1371/journal.pone.0206318
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titre: NetGloVe: Learning Node Representations for Community Detection
auteur: Kumaran Gunasekaran, Jeyavaishnavi Muralikumar, Srinivasa Sudarshan, Balasubramaniam Srinivasan, Fragkiskos Malliaros
article: 6th International Conference on Complex Networks and Their Applications, Nov 2017, Lyon, France
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titre: Structured Output Prediction and Learning for Deep Monocular 3D Human Pose Estimation
auteur: Stefan Kinauer, Riza Alp Güler, Siddhartha Chandra, Iasonas Kokkinos
article: EMMCVPR 2017 - 11th International Conference on Energy Minimization Methods in Computer Vision and Pattern Recognition, Oct 2017, Venise, Italy. pp.1-14
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titre: Scaling the Scattering Transform: Deep Hybrid Networks
auteur: Edouard Oyallon, Eugene Belilovsky, Sergey Zagoruyko
article: International Conference on Computer Vision (ICCV), Oct 2017, Venice, Italy
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titre: Dense and Low-Rank Gaussian CRFs Using Deep Embeddings
auteur: Siddhartha Chandra, Nicolas Usunier, Iasonas Kokkinos
article: ICCV 2017 - International Conference on Computer Vision, Sep 2017, Venice, Italy
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titre: HOGMep: Variational Bayes and higher-order graphical models applied to joint image recovery and segmentation
auteur: Aurélie Pirayre, Yuling Y. Zheng, Laurent Duval, Jean-Christophe Pesquet
article: 2017 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Sep 2017, Beijing, China. ⟨10.1109/ICIP.2017.8296988⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICIP.2017.8296988
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titre: Deformable Registration through Learning of Context-Specific Metric Aggregation
auteur: Enzo Ferrante, Puneet K Dokania, Rafael Marini, Nikos Paragios
article: Machine Learning in Medical Imaging Worlshop. MLMI (MICCAI 2017), Sep 2017, Quebec City, Canada
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titre: Approche de Douglas-Rachford aléatoire par blocs appliquée à la régression logistique parcimonieuse
auteur: Giovanni Chierchia, Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: GRETSI 2017, Sep 2017, Juan les Pins, France. pp.1-4
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titre: A Two-Stage Subspace Trust Region Approach for Deep Neural Network Training
auteur: Viacheslav Dudar, Giovanni Chierchia, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Vladimir V. Semenov
article: 25th European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2017), Aug 2017, Kos Island, Greece. pp.291-295
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titre: A global optimization approach for rational sparsity promoting criteria
auteur: Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet
article: EUSIPCO 2017 - 25th European Signal Processing Conference, Aug 2017, Kos Island, Greece. pp.156 - 160, ⟨10.23919/EUSIPCO.2017.8081188⟩
DOI: DOI : 10.23919/EUSIPCO.2017.8081188
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titre: Learning to Discover Sparse Graphical Models
auteur: Eugene B Belilovsky, Kyle Kastner, Gaël Varoquaux, Matthew B Blaschko
article: International Conference on Machine Learning , Aug 2017, Sydney, Australia
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titre: Integrating edge/boundary priors with classification scores for building detection in very high resolution data
auteur: Maria Vakalopoulou, Norbert Bus, Konstantinos Karantzalos, Nikos Paragios
article: IEEE International geoscience and remote sensing symposium (IGARSS), Jul 2017, Fort Worth, TX, United States. pp.3309-3312, ⟨10.1109/IGARSS.2017.8127705⟩
DOI: DOI : 10.1109/IGARSS.2017.8127705
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titre: DenseReg: Fully Convolutional Dense Shape Regression In-the-Wild
auteur: Riza Alp Güler, George Trigeorgis, Epameinondas Antonakos, Patrick Snape, Stefanos Zafeiriou, Iasonas Kokkinos
article: 2017 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), IEEE, CVF, Jul 2017, Honolulu, United States. pp.6799-6808
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titre: Alternating Direction Graph Matching
auteur: Ð.Khuê Lê-Huu, Nikos Paragios
article: IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), Jul 2017, Honolulu, United States. ⟨10.1109/cvpr.2017.522⟩
DOI: DOI : 10.1109/cvpr.2017.522
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titre: Newton-type Methods for Inference in Higher-Order Markov Random Fields
auteur: Hariprasad Kannan, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: IEEE International Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jul 2017, Honolulu, United States. pp.7224 - 7233
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titre: Recovery of nonlinearly degraded sparse signals through rational optimization
auteur: Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet
article: SPARS 2017 - 6th Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations workshop, Jun 2017, Lisbonne, Portugal. pp.1-2
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titre: Patch-based deep learning architectures for sparse annotated very high resolution datasets
auteur: Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article: Joint Urban Remote Sensing Event (JURSE), Mar 2017, Dubai, United Arab Emirates. ⟨10.1109/JURSE.2017.7924538⟩
DOI: DOI : 10.1109/JURSE.2017.7924538
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titre: Per city-block, density estimation at build-up areas from aerial RGB imagery with deep learning
auteur: Theodosia Vardoulaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos
article: Joint Urban Remote Sensing Event (JURSE), Mar 2017, Dubai, United Arab Emirates. ⟨10.1109/JURSE.2017.7924605⟩
DOI: DOI : 10.1109/JURSE.2017.7924605
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titre: A Proximal Approach for Solving Matrix Optimization Problems Involving a Bregman Divergence
auteur: Alessandro Benfenati, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: BASP 2017 - International Biomedical and Astronomical Signal Processing Frontiers workshop, Jan 2017, villars-sur-oulon, Switzerland
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titre: A Block Parallel Majorize-Minimize Memory Gradient Algorithm
auteur: Sara Cadoni, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Caroline Chaux
article: BASP 2017 - International Biomedical and Astronomical Signal Processing Frontiers workshop, Jan 2017, Villars-sur-Oulon, Switzerland. pp.1, ⟨10.1109/ICIP.2016.7532949⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICIP.2016.7532949
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Habilitation à diriger des recherches

titre: Algorithmes de majoration-minimisation. Application aux problèmes inverses de grande taille en signal/image
auteur: Emilie Chouzenoux
article: Traitement du signal et de l'image [eess.SP]. Université Paris Est - Marne-la-Vallée, 2017
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titre: Computational methods towards image-based biomarkers and beyond
auteur: Evangelia I. Zacharaki
article: Medical Imaging. Université Paris-Est, 2017
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Poster communications

titre: Joint Embeddings of Scene Graphs and Images
auteur: Eugene Belilovsky, Matthew Blaschko, Jamie Ryan Kiros, Raquel Urtasun, Richard Zemel
article: International Conference On Learning Representations - Workshop, 2017, Toulon, France
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Preprints, Working Papers, ...

titre: A proximal approach for a class of matrix optimization problems
auteur: Alessandro Benfenati, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: 2017
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titre: An Auxiliary Variable Method for MCMC Algorithms in High Dimension
auteur: Yosra Marnissi, Emilie Chouzenoux, Amel Benazza-Benyahia, Jean-Christophe Pesquet
article: 2017
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titre: Joint restoration/segmentation of multicomponent images with variationalBayes and higher-order graphical models (HOGMep)
auteur: Yuling Zheng, Aurélie Pirayre, Laurent Duval, Jean-Christophe Pesquet
article: 2017
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titre: The Lovász Hinge: A Novel Convex Surrogate for Submodular Losses
auteur: Jiaqian Yu, Matthew Blaschko
article: 2017
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2016

Journal articles

titre: Higher-order Graph Principles towards Non-rigid Surface Registration
auteur: Yun Zeng, Chaohui Wang, Xianfeng Gu, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, 38 (12), pp.2416 - 2429. ⟨10.1109/TPAMI.2016.2528240⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2016.2528240
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titre: Hyper-Graphs Inference through Convex Relaxations and Move Making Algorithms: Contributions and Applications in Artificial Vision
auteur: Nikos Komodakis, M. Pawan Kumar, Nikos Paragios
article: Foundations and Trends in Computer Graphics and Vision, Now Publishers, 2016, 10 (1), pp.1-102. ⟨10.1561/0600000066⟩
DOI: DOI : 10.1561/0600000066
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titre: A block coordinate variable metric forward-backward algorithm
auteur: Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Audrey Repetti
article: Journal of Global Optimization, Springer Verlag, 2016, pp.1-29. ⟨10.1007/s10898-016-0405-9⟩
DOI: DOI : 10.1007/s10898-016-0405-9
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titre: Discovering Predictors of Mental Health Service Utilization with k-support Regularized Logistic Regression
auteur: Hakim Sidahmed, Elena Prokofyeva, Matthew Blaschko
article: Information Sciences, Elsevier, 2016, 329, pp.937-949. ⟨10.1016/j.ins.2015.03.069⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.ins.2015.03.069
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titre: A Probabilistic Atlas of Diffuse WHO Grade II Glioma Locations in the Brain
auteur: Sarah Parisot, Amélie Darlix, Cédric Baumann, Sonia Zouaoui, Yordanka Yordanova, Marie Blonski, Valérie Rigau, Stéphane Chemouny, Luc Taillandier, Luc Bauchet, Hugues Duffau, Nikos Paragios
article: PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (1), pp.e0144200. ⟨10.1371/journal.pone.0144200⟩
DOI: DOI : 10.1371/journal.pone.0144200
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titre: The Pyramid Quantized Weisfeiler-Lehman Graph Representation
auteur: Katerina Gkirtzou, Matthew Blaschko
article: Neurocomputing, Elsevier, 2016, 173, pp.1495-1507. ⟨10.1016/j.neucom.2015.09.023⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.neucom.2015.09.023
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titre: Deep filter banks for texture recognition, description, and segmentation
auteur: Mircea Cimpoi, Subhransu Maji, Iasonas Kokkinos, Andrea Vedaldi
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2016, ⟨10.1007/s11263-015-0872-3⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11263-015-0872-3
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titre: Spike pattern recognition by supervised classification in low dimensional embedding space
auteur: Evangelia I. Zacharaki, Iosif Mporas, Kyriakos Garganis, Vasileios Megalooikonomou
article: Brain Informatics, Springer, 2016, 3, p. 73-83. ⟨10.1007/s40708-016-0044-4⟩
DOI: DOI : 10.1007/s40708-016-0044-4
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titre: Graph-Based Registration, Change Detection, and Classification in Very High Resolution Multitemporal Remote Sensing Data
auteur: Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, IEEE, 2016, 9, pp.2940 - 2951. ⟨10.1109/JSTARS.2016.2557081⟩
DOI: DOI : 10.1109/JSTARS.2016.2557081
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titre: Rounding-based Moves for Semi-Metric Labeling
auteur: M. Pawan Kumar, Puneet K. Dokania
article: Journal of Machine Learning Research, Microtome Publishing, 2016, 17, pp.1 - 42
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titre: (Hyper)-Graphical Models in Biomedical Image Analysis
auteur: Nikos Paragios, Enzo Ferrante, Ben Glocker, Nikos Komodakis, Sarah Parisot, Evangelia I. Zacharaki
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2016, 33, pp.102-106. ⟨10.1016/j.media.2016.06.028⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2016.06.028
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titre: Convergence Rate Analysis of the Majorize-Minimize Subspace Algorithm
auteur: Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE Signal Processing Letters, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2016, 23 (9), pp.1284 - 1288. ⟨10.1109/LSP.2016.2593589⟩
DOI: DOI : 10.1109/LSP.2016.2593589
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Conference papers

titre: Testing for Differences in Gaussian Graphical Models: Applications to Brain Connectivity
auteur: Eugene Belilovsky, Gaël Varoquaux, Matthew B. Blaschko
article: Neural Information Processing Systems (NIPS) 2016, Dec 2016, Barcelona, Spain
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titre: Proximity Operators for a Class of Hybrid Sparsity+Entropy Priors. Application to DOSY NMR Signal Reconstruction
auteur: Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, Marc-André Delsuc
article: International Symposium on Signal, Image, Video and Communications (ISIVC 2016), Nov 2016, Tunis, Tunisia
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titre: Comparison of Multi-resolution Analysis Patterns for Texture Classification of Breast Tumors Based On DCE-MRI
auteur: Alexia Tzalavra, Kalliopi Dalakleidi, Evangelia I. Zacharaki, Nikolaos Tsiaparas, Fotios Constantinidis, Nikos Paragios, Konstantina S. Nikita
article: MICCAI 2016 - 7th International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging, Oct 2016, Athens, Greece. pp.296-304, ⟨10.1007/978-3-319-47157-0_36⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-47157-0_36
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titre: Rigid Slice-To-Volume Medical Image Registration through Markov Random Fields
auteur: Roque Porchetto, Franco Stramana, Enzo Ferrante, Nikos Paragios
article: 19th Int Conf on Med Image Comp and Comp-Assisted Intervent (MICCAI) / Int Workshop on Med Comp Vis (MCV) / 3rd Int Workshop on Bayesian and Graph Models for Biomedical Imaging (BAMBI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.172-185, ⟨10.1007/978-3-319-61188-4_16⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-61188-4_16
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titre: Human Joint Angle Estimation and Gesture Recognition for Assistive Robotic Vision
auteur: Alp Guler, Nikolaos Kardaris, Siddhartha Chandra, Vassilis Pitsikalis, Christian Werner, Klaus Hauer, Costas Tzsafestas, Petros Maragos, Iasonas Kokkinos
article: ACVR, ECCV, Oct 2016, Amsterdam, Netherlands. pp.415 - 431, ⟨10.1007/978-3-319-48881-3_29⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-48881-3_29
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titre: A block parallel majorize-minimize memory gradient algorithm
auteur: Sara Cadoni, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Caroline Chaux
article: BASP 2017 - International Biomedical and Astronomical Signal Processing Frontiers workshop, Sep 2016, Phoenix, AZ, United States. pp.3194 - 3198, ⟨10.1109/ICIP.2016.7532949⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICIP.2016.7532949
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titre: Deformable group-wise registration using a physiological model: application to DIffusion-Weighted MRI
auteur: Evgenios N. Kornaropoulos, Evangelia I. Zacharaki, Pierre Zerbib, Chieh Lin, Alain Rahmouni, Nikos Paragios
article: ICIP 2016 - IEEE International Conference on Image Processing, Sep 2016, Phoenix, Arizona, United States. pp.2345-2349, ⟨10.1109/icip.2016.7532778⟩
DOI: DOI : 10.1109/icip.2016.7532778
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titre: Efficient Learning for Discriminative Segmentation with Supermodular Losses
auteur: Jiaqian Yu, Matthew Blaschko
article: British Machine Vision Conference, Sep 2016, York, United Kingdom
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titre: Random primal-dual proximal iterations for sparse multiclass SVM
auteur: Giovanni Chierchia, Nelly Pustelnik, Jean-Christophe Pesquet
article: IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing, Sep 2016, Vietri sul Mare, Italy. ⟨10.1109/MLSP.2016.7738833⟩
DOI: DOI : 10.1109/MLSP.2016.7738833
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titre: A Convex Surrogate Operator for General Non-Modular Loss Functions
auteur: Jiaqian B Yu, Matthew Blaschko
article: The 25th Belgian-Dutch Conference on Machine Learning, Sep 2016, Kortrijk, Belgium
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titre: Fast, Exact and Multi-Scale Inference for Semantic Image Segmentation with Deep Gaussian CRFs
auteur: Siddhartha Chandra, Iasonas Kokkinos
article: European Conference on Computer Vision, Sep 2016, Amsterdam, Netherlands. ⟨10.1007/978-3-319-46478-7_25⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-46478-7_25
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titre: Surface Based Object Detection in RGBD Images
auteur: Siddhartha Chandra, Grigoris Chrysos, Iasonas Kokkinos
article: British Machine Vision Conference, Sep 2016, Swansea, Wales, United Kingdom. ⟨10.5244/C.29.187⟩
DOI: DOI : 10.5244/C.29.187
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titre: Stochastic forward-backward and primal-dual approximation algorithms with application to online image restoration
auteur: Patrick L Combettes, Jean-Christophe Pesquet
article: European Signal and Image Processing Conference (EUSIPCO 2016), Aug 2016, Budapest, Hungary. pp.1813 - 1817, ⟨10.1109/EUSIPCO.2016.7760561⟩
DOI: DOI : 10.1109/EUSIPCO.2016.7760561
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titre: Simultaneous registration, segmentation and change detection from multisensor, multitemporal satellite image pairs.
auteur: Maria Vakalopoulou, Christos Platias, Maria Papadomanolaki, Nikos Paragios, Konstantinos Karantzalos
article: International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), Jul 2016, Beijing, China. ⟨10.1109/IGARSS.2016.7729469⟩
DOI: DOI : 10.1109/IGARSS.2016.7729469
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titre: Optimal estimation of diffusion in DW-MRI by high-order MRF-based joint deformable registration and diffusion modeling
auteur: Evgenios N. Kornaropoulos, Evangelia I. Zacharaki, Pierre Zerbib, Chieh Lin, Alain Rahmouni, Nikos Paragios
article: WBIR 2016 - 7th International Workshop on Biomedical Image Registration, Jul 2016, Las Vegas, Nevada, United States
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titre: A Convex Surrogate Operator for General Non-Modular Loss Functions
auteur: Jiaqian Yu, Matthew Blaschko
article: The 19th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, May 2016, Cadiz, Spain
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titre: Pushing the boundaries of boundary detection using deep learning
auteur: Iasonas Kokkinos
article: 4th International Conference on Learning Representations, ICLR 2016, May 2016, San Juan, Puerto Rico
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titre: A Machine Learning Methodology for Enzyme Functional Classification Combining Structural and Protein Sequence Descriptors
auteur: Afshine Amidi, Shervine Amidi, Dimitrios Vlachakis, Nikos Paragios, Evangelia I. Zacharaki
article: IWBBIO 2016 - 4th International Conference Bioinformatics and Biomedical Engineering, Apr 2016, Granada, Spain. pp.728-738, ⟨10.1007/978-3-319-31744-1_63⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-31744-1_63
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titre: Sub-cortical brain structure segmentation using F-CNN's
auteur: Mahsa Shakeri, Stavros Tsogkas, Enzo Ferrante, Sarah Lippe, Samuel Kadoury, Nikos Paragios, Iasonas Kokkinos
article: ISBI 2016 - International Symposium on Biomedical Imaging, 2016, Prague, Czech Republic
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titre: Prior-based Coregistration and Cosegmentation
auteur: Mahsa Shakeri, Enzo Ferrante, Stavros Tsogkas, Sarah Lippe, Samuel Kadoury, Iasonas Kokkinos, Nikos Paragios
article: MICCAI 2016 - 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, 2016, Athens, Greece
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titre: Minding the Gaps for Block Frank-Wolfe Optimization of Structured SVMs
auteur: Anton Osokin, Jean-Baptiste Alayrac, Isabella Lukasewitz, Puneet K. Dokania, Simon Lacoste-Julien
article: International Conference on Machine Learning (ICML 2016)., 2016, New York, United States
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Book sections

titre: Accelerating deformable part models with branch-and-bound
auteur: Iasonas Kokkinos
article: Perspectives in Shape Analysis, Springer Heidelberg, pp.249-271, 2016, ⟨10.1007/978-3-319-24726-7_12⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-24726-7_12
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Reports

titre: PALMA, an improved algorithm for DOSY signal processing
auteur: Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, M-A Delsuc
article: [Research Report] LIGM - Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge. 2016
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titre: A Variational Bayesian Approach for Restoring Data Corrupted with Non-Gaussian Noise
auteur: Yosra Marnissi, Yuling Zheng, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet
article: [Research Report] Laboratoire Informatique Gaspard Monge. 2016
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Preprints, Working Papers, ...

titre: A U-statistic Approach to Hypothesis Testing for Structure Discovery in Undirected Graphical Models
auteur: Wacha Bounliphone, Matthew B. Blaschko
article: 2016
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2015

Journal articles

titre: Learning Grammars for Architecture-Specific Facade Parsing
auteur: Raghudeep Gadde, Renaud Marlet, Nikos Paragios
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2015, 117 (3), pp.290-316. ⟨10.1007/s11263-016-0887-4⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11263-016-0887-4
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titre: Compressed-sensing-based content-driven hierarchical reconstruction: Theory and application to C-arm cone-beam tomography
auteur: Hélène Langet, Cyril Riddell, Aymeric Reshef, Yves Trousset, Arthur Tenenhaus, Elisabeth Lahalle, Gilles Fleury, Nikos Paragios
article: Medical Physics, American Association of Physicists in Medicine, 2015, 42 (9), pp.5222-5237. ⟨10.1118/1.4928144⟩
DOI: DOI : 10.1118/1.4928144
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titre: Convex relaxations of penalties for sparse correlated variables with bounded total variation
auteur: Eugene Belilovsky, Andreas Argyriou, Gaël Varoquaux, Matthew B. Blaschko
article: Machine Learning, Springer Verlag, 2015, pp.1-21. ⟨10.1007/s10994-015-5511-2⟩
DOI: DOI : 10.1007/s10994-015-5511-2
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titre: Easy and Quantitative Access to Fe(II) and Fe(III) Diarylalkynyl-phosphine Oxides Featuring [Fe(dppe)Cp*] Endgroups: Terminal P=O Functionality Blocks the Dimerisation of the Fe(III) Derivatives
auteur: Ayham Tohmé, Stéphanie Essafi, Arnaud Bondon, Thierry Roisnel, Duncan Carmichael, Frédéric Paul, Charles T Hagen
article: Chemical Communications, Royal Society of Chemistry, 2015, 51 (7), pp.1316-1319. ⟨10.1039/c4cc08993f⟩
DOI: DOI : 10.1039/c4cc08993f
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titre: Parameter Estimation and Energy Minimization for Region-based Semantic Segmentation
auteur: M Pawan Kumar, Haithem Turki, Dan Preston, Daphne Koller
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 37 (7), pp.1373-1386. ⟨10.1109/TPAMI.2014.2372766⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2014.2372766
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titre: Predictive sparse modeling of fMRI data for improved classification, regression, and visualization using the k-support norm
auteur: Eugene Belilovsky, Katerina Gkirtzou, Michail Misyrlis, Anna Konova, Jean Honorio, Nelly Alia-Klein, Rita Goldstein, Dimitris Samaras, Matthew Blaschko
article: Computerized Medical Imaging and Graphics, Elsevier, 2015, pp.1. ⟨10.1016/j.compmedimag.2015.03.007⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.compmedimag.2015.03.007
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titre: Guest Editors' Introduction: Special Section on Higher Order Graphical Models in Computer Vision
auteur: Karteek Alahari, Dhruv Batra, Srikumar Ramalingam, Nikos Paragios, Richard Zemel
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 37 (7), pp.1321-1322. ⟨10.1109/TPAMI.2015.2434651⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2015.2434651
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titre: Optimizing Average Precision using Weakly Supervised Data
auteur: Aseem Behl, Pritish Mohapatra, C.V. Jawahar, M Pawan Kumar
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 37 (12), pp.2545-2557. ⟨10.1109/TPAMI.2015.2414435⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2015.2414435
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titre: Slice-to-Volume Deformable Registration: Efficient one shot consensus between plane selection and in-plane deformation
auteur: Enzo Ferrante, Vivien Fecamp, Nikos Paragios
article: International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2015, 10 (6), pp.791-800. ⟨10.1007/s11548-015-1205-2⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11548-015-1205-2
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titre: Editorial introduction to the CVIU special issue on "Generative models in computer vision and medical imaging
auteur: Adrian Barbu, Iasonas Kokkinos
article: Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2015, 136, pp.1-2. ⟨10.1016/j.cviu.2015.05.005⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.cviu.2015.05.005
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Conference papers

titre: Entropy-based Latent Structured Output Prediction
auteur: Diane Bouchacourt, Sebastian Nowozin, M. Pawan Kumar
article: International Conference on Computer Vision (ICCV), Dec 2015, Santiago, Chile. ⟨10.1109/ICCV.2015.334⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2015.334
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titre: Parsimonious Labeling
auteur: Puneet Kumar Dokania, M. Pawan Kumar
article: ICCV 2015 - International Conference on Computer Vision 2015, Dec 2015, Santiago, Chile. ⟨10.1109/ICCV.2015.205⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2015.205
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titre: Accurate Human-Limb Segmentation in RGB-D images for Intelligent Mobility Assistance Robots
auteur: Siddhartha Chandra, Stavros Tsogkas, Iasonas Kokkinos
article: ACVR, ICCV 2015, Dec 2015, Santiago, Chile. ⟨10.1109/iccvw.2015.64⟩
DOI: DOI : 10.1109/iccvw.2015.64
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titre: Discriminative learning of deep convolutional feature point descriptors
auteur: Edgar Simo-Serra, Eduard Trulls, L. Ferraz, Iasonas Kokkinos, P. Fua, F. Moreno-Noguer
article: IEEE international conference on computer vision (ICCV), Dec 2015, Santiago, Chile. pp.118--126, ⟨10.1109/ICCV.2015.22⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2015.22
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titre: Deep Convolutional Feature Point Descriptors
auteur: Edgar Simo-Serra, Eduard Trulls, Luis Ferraz, Iasonas Kokkinos, Pascal Fua, Francesc Moreno-Noguer
article: International Conference on Computer Vision, Dec 2015, Santiago, Chile
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titre: Simultaneous Linear and Deformable Registration
auteur: Vivien Fécamp, Aristeidis Sotiras, Nikos Paragios
article: Medical Imaging Computing and Computer Assisted Interventions, Oct 2015, Munich, Germany
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titre: Hardness Results for Structured Learning and Inference with Multiple Correct Outputs
auteur: Matthew Blaschko, Jiaqian Yu
article: Constructive Machine Learning Workshop at ICML, Jul 2015, Lille, France
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titre: Learning Submodular Losses with the Lovász Hinge
auteur: Jiaqian Yu, Matthew Blaschko
article: International Conference on Machine Learning, Jul 2015, Lille, France
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titre: A low variance consistent test of relative dependency
auteur: Wacha Bounliphone, Arthur Gretton, Arthur Tenenhaus, Matthew Blaschko
article: International Conference on Machine Learning, Jul 2015, Lille, France
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titre: Modeling Local and Global Deformations in Deep Learning: Epitomic Convolution, Multiple Instance Learning, and Sliding Window Detection
auteur: George Papandreou, Iasonas Kokkinos, Pierre-André Savalle
article: IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2015, Boston, United States
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titre: Semantic Image Segmentation with Deep Convolutional Nets and Fully Connected CRFs
auteur: Chen Liang-Chieh, George Papandreou, Iasonas Kokkinos, Kevin Murphy, Alan Yuille
article: International Conference on Learning Representations, May 2015, San Diego, United States
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titre: Quasi real-time sub-space 3D deformable fusion
auteur: Bharat Singh, Stavros Alchatzidis, Nikos Paragios
article: Biomedical Imaging (ISBI), 2015 IEEE 12th International Symposium on, Apr 2015, New York, NY, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7164000⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2015.7164000
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titre: Local atlas selection for discrete multi-atlas segmentation
auteur: Stavros Alchatzidis, Aristeidis Sotiras, Nikos Paragios
article: International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, New York, United States. ⟨10.1109/isbi.2015.7163888⟩
DOI: DOI : 10.1109/isbi.2015.7163888
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titre: Modular linear iconic matching using higher order graphs
auteur: Vivien Fecamp, Aristeidis Sotiras, Nikos Paragios
article: ISBI 2015 - IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, New York, United States. pp.1097 - 1101, ⟨10.1109/ISBI.2015.7164063⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2015.7164063
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titre: Implicit Planar and In-Plane Deformable Mapping in Medical Images Through High Order Graphs
auteur: Enzo Ferrante, Vivien Fecamp, Nikos Paragios
article: IEEE International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro (ISBI), Apr 2015, Ney York, United States
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Book sections

titre: Monte carlo sampling for the segmentation of tubular structures
auteur: Charles Florin, Nikos Paragios, James Williams
article: Handbook of biomedical imaging : methodologies and clinical research, Springer, pp.263-275, 2015, 9780387097497; 9780387097480. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7_14⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-0-387-09749-7_14
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titre: Diffusion tensor estimation, regularization and classification
auteur: Radhouène Neji, Noura Azzabou, Gilles Fleury, Nikos Paragios
article: Handbook of biomedical imaging : methodologies and clinical research, Springer, pp.437-454, 2015, 9780387097497; 9780387097480. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7_24⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-0-387-09749-7_24
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titre: Curve propagation, level set methods and grouping
auteur: Nikios Paragios
article: Handbook of biomedical imaging : methodologies and clinical research, Springer, pp.45-62, 2015, 9780387097497; 9780387097480. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7_3⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-0-387-09749-7_3
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Books

titre: Handbook of Biomedical Imaging: Methodologies and Clinical Research
auteur: Nikos Paragios, Jim Duncan, Nicholas Ayache
article: Paragios, Nikos and Duncan, Jim and Ayache, Nicholas. Springer, pp.590, 2015, 978-0-387-09748-0. ⟨10.1007/978-0-387-09749-7⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-0-387-09749-7
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Poster communications

titre: Kernel non-parametric tests of relative dependency
auteur: Wacha Bounliphone, Arthur Gretton, Arthur Tenenhaus, Matthew B. Blaschko
article: International conference of the ERCIM WG on computational and methodological statistics - CMStatistics 2015, Dec 2015, London, United Kingdom. Elsevier, ISBN 978-9963-2227-0-4, pp.165-166, CFE-CMSTATISTICS 2015
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Reports

titre: (Hyper)-Graphs Inference via Convex Relaxations and Move Making Algorithms: Contributions and Applications in artificial vision
auteur: Pawan Kumar, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: [Research Report] RR-8798, Inria. 2015, pp.65
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titre: Graph Based Slice-to-Volume Deformable Registration
auteur: Enzo Ferrante, Nikos Paragios
article: [Research Report] RR-8803, INRIA Saclay; Center for Visual Computing, CentraleSupelec, Inria, Université Paris-Saclay. 2015, pp.30
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titre: Higher-order Graph Principles towards Non-rigid Surface Registration
auteur: Yun Zeng, Chaohui Wang, Xianfeng Gu, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: [Research Report] RR-8607, INRIA Saclay - Ile-de-France; INRIA. 2015, pp.31
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Preprints, Working Papers, ...

titre: Learning Dense Convolutional Embeddings for Semantic Segmentation
auteur: Harley Adam, Iasonas Kokkinos, Kostas Derpanis
article: 2015
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titre: Deep Learning for Semantic Part Segmentation with High-Level Guidance
auteur: Stavros Tsogkas, Iasonas Kokkinos, George Papandreou, Andrea Vedaldi
article: 2015
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titre: Surpassing Humans in Boundary Detection using Deep Learning
auteur: Iasonas Kokkinos
article: 2015
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2014

Journal articles

titre: Detection of Correlations With Adaptive Sensing
auteur: Rui Castro, Gabor Lugosi, Pierre-André Savalle
article: IEEE Transactions on Information Theory, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 60 (12), pp.7913-7927. ⟨10.1109/TIT.2014.2364713⟩
DOI: DOI : 10.1109/TIT.2014.2364713
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titre: A Framework for Efficient Structured Max-Margin Learning of High-Order MRF models
auteur: Nikos Komodakis, Bo Xiang, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 37 (7), pp.1425-1441. ⟨10.1109/TPAMI.2014.2368990⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2014.2368990
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titre: Concurrent tumor segmentation and registration with uncertainty-based sparse non-uniform graphs
auteur: Sarah Parisot, William Wells, Stéphane Chemouny, Hugues Duffau, Nikos Paragios
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2014, 18 (4), pp.647 - 659. ⟨10.1016/j.media.2014.02.006⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2014.02.006
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titre: Machine Learning for Neurological Disorders
auteur: Matthew Blaschko
article: Centraliens, Association des centraliens, 2014, pp.40-42
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titre: An Explicit Shape-constrained MRF-based Contour Evolution Method for 2D Medical Image Segmentation
auteur: Deepak Chittajallu, Nikos Paragios, Ioannis Kakadiaris
article: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, pp.2168-2194. ⟨10.1109/JBHI.2013.2257820⟩
DOI: DOI : 10.1109/JBHI.2013.2257820
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Conference papers

titre: Lovasz Hinge for Learning Submodular Losses
auteur: Jiaqian Yu, Matthew Blaschko
article: NIPS Workshop on Representation and Learning Methods for Complex Outputs, Dec 2014, Montreal, Canada
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titre: Kernel non-parametric tests of relative dependency
auteur: Wacha Bounliphone, Arthur Gretton, Matthew Blaschko
article: NIPS Workshop on Modern Nonparametrics 3: Automating the Learning Pipeline, Dec 2014, Montreal, Canada
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titre: Approximating Combined Discrete Total Variation and Correlated Sparsity With Convex Relaxations
auteur: Eugene Belilovsky, Andreas Argyriou, Matthew Blaschko
article: NIPS Workshop on Discrete and Combinatorial Problems in Machine Learning, Dec 2014, Montreal, Canada
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titre: Learning fully-connected CRFs for blood vessel segmentation in retinal images
auteur: José Ignacio Orlando, Matthew Blaschko
article: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Sep 2014, Boston, United States. ⟨10.1007/978-3-319-10404-1_79⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-10404-1_79
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titre: Predicting cross-task behavioral variables from fMRI data using the k-support norm
auteur: Michail Misyrlis, Anna Konova, Matthew Blaschko, Jean Honorio, Nelly Alia-Klein, Rita Goldstein, Dimitris Samaras
article: Sparsity Techniques in Medical Imaging (STMI), Sep 2014, Boston, United States
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titre: Learning to Rank Using High-Order Information
auteur: Puneet Kumar Dokania, A. Behl, C. V. Jawahar, M Pawan Kumar
article: ECCV 2014 - European Conference on Computer Vision (2014), Sep 2014, Zurch, Switzerland. pp.609 - 623, ⟨10.1007/978-3-319-10593-2_40⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-10593-2_40
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titre: Deformable Part Models with CNN Features
auteur: Pierre-André Savalle, Stavros Tsogkas, George Papandreou, Iasonas Kokkinos
article: European Conference on Computer Vision, Parts and Attributes Workshop, Sep 2014, Zurich, Switzerland
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titre: An O(n log n) Cutting Plane Algorithm for Structured Output Ranking
auteur: Matthew Blaschko, Arpit Mittal, Esa Rahtu
article: German Conference on Pattern Recognition, Sep 2014, Münster, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-11752-2_11⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-319-11752-2_11
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titre: Unsupervised Spatio-Temporal Segmentation with Sparse Spectral Clustering
auteur: Mahsa Ghafarianzadeh, Matthew Blaschko, Gabe Sibley
article: British Machine Vision Conference (BMVC), Sep 2014, Nottingham, United Kingdom
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titre: Discrete Multi Atlas Segmentation using Agreement Constraints
auteur: Stavros Alchatzidis, Aristeidis Sotiras, Nikos Paragios
article: British Machine Vision Conference, British Machine Vision Association, Sep 2014, Nottingham, United Kingdom
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titre: Discrete Visual Perception
auteur: Nikos Paragios, Nikos Komodakis
article: International Conference on Pattern Recognition, Aug 2014, Stockholm, Sweden. pp.1-7, ⟨10.1109/icpr.2014.13⟩
DOI: DOI : 10.1109/icpr.2014.13
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titre: Fast and Exact: ADMM-Based Discriminative Shape Segmentation with Loopy Part Models
auteur: Haithem Boussaid, Iasonas Kokkinos
article: IEEE Conference in Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2014, Greater Columbus Convention Center in Columbus, Ohio., United States. pp.4058 - 4065, ⟨10.1109/CVPR.2014.517⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2014.517
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titre: Segmentation-Aware Deformable Part Models
auteur: Eduard Trulls, Stavros Tsogkas, Iasonas Kokkinos, Alberto Sanfeliu, Francesc Moreno-Noguer
article: IEEE Conference in Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2014, Greater Columbus Convention Center in Columbus, Ohio., United States. pp.168 - 175, ⟨10.1109/CVPR.2014.29⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2014.29
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titre: Understanding Objects in Detail with Fine-grained Attributes
auteur: Andrea Vedaldi, Siddarth Mahendran, Stavros Tsogkas, Subhransu Maji, Ross B. Girshick, Juho Kannala, Esa Rahtu, Iasonas Kokkinos, Matthew B. Blaschko, David Weiss, Ben Taskar, Karen Simonyan, Naomi Saphra, Sammy Mohamed
article: IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2014, Columbus, United States. ⟨10.1109/CVPR.2014.463⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2014.463
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titre: Describing Textures in the Wild
auteur: Mircea Cimpoi, Subhransu Maji, Iasonas Kokkinos, Sammy Mohamed, Andrea Vedaldi
article: IEEE Conference in Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2014, Greater Columbus Convention Center in Columbus, Ohio., United States. pp.3606 - 3613, ⟨10.1109/CVPR.2014.461⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2014.461
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titre: Discriminative learning of deformable contour models
auteur: Haithem Boussaid, Iasonas Kokkinos, Nikos Paragios
article: Int.l Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2014, Bejing, China. pp.624 - 628, ⟨10.1109/ISBI.2014.6867948⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2014.6867948
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titre: Rounding-based Moves for Metric Labeling
auteur: M. Pawan Kumar
article: NIPS - Advances in Neural Information Processing Systems, 2014, Montreal, Canada
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titre: Optimizing Average Precision using Weakly Supervised Data
auteur: Aseem Behl, C.V. Jawahar, M. Pawan Kumar
article: CVPR - IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, 2014, Columbus, Ohio, United States
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titre: Efficient Optimization for Average Precision SVM
auteur: Pritish Mohapatra, C. V. Jawahar, M. Pawan Kumar
article: NIPS - Advances in Neural Information Processing Systems, 2014, Montreal, Canada
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Habilitation à diriger des recherches

titre: Advances in Empirical Risk Minimization for Image Analysis and Pattern Recognition
auteur: Matthew Blaschko
article: Machine Learning [stat.ML]. ENS Cachan, 2014
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Patents

titre: Method and device for elastic registration between a two-dimensional digital image and a slice of a three-dimensional volume with overlapping content
auteur: Nikos Paragios, Enzo Ferrante, Rafael Marini Silva
article: United States, Patent n° : US 2014/0192046 A1. 2014, pp.12
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Reports

titre: Untangling Local and Global Deformations in Deep Convolutional Networks for Image Classification and Sliding Window Detection
auteur: George Papandreou, Iasonas Kokkinos, Pierre-André Savalle
article: [Research Report] Toyota Technological Institute at Chicago; Ecole Centrale Paris; Inria Saclay Ile de France. 2014
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titre: A Framework for Efficient Structured Max-Margin Learning of High-Order MRF Models
auteur: Nikos Komodakis, Bo Xiang, Nikos Paragios
article: [Research Report] RR-8645, Ecole de Ponts-ParisTech; Ecole Centrale de Paris; Inria Saclay Ile de France; INRIA. 2014, pp.1 - 34
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2013

Journal articles

titre: Spine Segmentation in Medical Images Using Manifold Embeddings and Higher-Order MRFs
auteur: Samuel Kadoury, Hubert Labelle, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 32 (7), pp.1227-1238. ⟨10.1109/TMI.2013.2244903⟩
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2013.2244903
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titre: Deformable Medical Image Registration: A Survey
auteur: Aristeidis Sotiras, Christos Davatzikos, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 32 (7), pp.1153-1190. ⟨10.1109/TMI.2013.2265603⟩
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2013.2265603
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titre: Simultaneous Cast Shadows, Illumination and Geometry Inference Using Hypergraphs
auteur: A. Panagopoulos, Chaohui Wang, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 35 (2), pp.437-449. ⟨10.1109/TPAMI.2012.110⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2012.110
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titre: Markov Random Field Modeling, Inference & Learning in Computer Vision & Image Understanding: A Survey
auteur: Chaohui Wang, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2013, 117 (11), pp.1610-1627. ⟨10.1016/j.cviu.2013.07.004⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.cviu.2013.07.004
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titre: Parsing Facades with Shape Grammars and Reinforcement Learning
auteur: Olivier Teboul, Iasonas Kokkinos, Loïc Simon, Koutsourakis Panagiotis, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 35 (7), pp.1744-1756. ⟨10.1109/TPAMI.2012.252⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2012.252
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Conference papers

titre: Uncertainty-driven Efficiently-Sampled Sparse Graphical Models for Concurrent Tumor Segmentation and Atlas Registration
auteur: Sarah Parisot, William Wells Iii, Stéphane Chemouny, Hugues Duffau, Nikos Paragios
article: ICCV - 14th International Conference on Computer Vision, Dec 2013, Sydney, Australia
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titre: A Generic Deformation Model for Dense Non-Rigid Surface Registration: a Higher-Order MRF-based Approach
auteur: Yun Zeng, Chaohui Wang, David Gu, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: ICCV 2013 - IEEE International Conference on Computer Vision, Dec 2013, Sydney, Australia. pp.3360-3367, ⟨10.1109/ICCV.2013.417⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2013.417
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titre: Taxonomic Prediction with Tree-Structured Covariances
auteur: Matthew B. Blaschko, Wojciech Zaremba, Arthur Gretton
article: European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2013, Prague, Czech Republic. pp.304-319, ⟨10.1007/978-3-642-40991-2_20⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-40991-2_20
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titre: Joint Model-Pixel Segmentation with Pose-invariant Deformable Graph-Priors
auteur: Bo Xiang, Jean-François Deux, Alain Rahmouni, Nikolaos Paragios
article: 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan
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titre: fMRI Analysis with Sparse Weisfeiler-Lehman Graph Statistics
auteur: Katerina Gkirtzou, Jean Honorio, Dimitris Samaras, Rita Goldstein, Matthew Blaschko
article: 4th International Workhop on Machine Learning in Medical Imaging, Sep 2013, Nagoya, Japan
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titre: Discriminative Parameter Estimation for Random Walks Segmentation
auteur: Pierre-Yves Baudin, Danny Goodman, Puneet Kumar, Noura Azzabou, Pierre G. Carlier, Nikos Paragios, M. Pawan Kumar
article: 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2013), Sep 2013, Nagoya, Japan. 8p
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titre: Non-rigid 2D-3D Medical Image Registration using Markov Random Fields
auteur: Enzo Ferrante, Nikos Paragios
article: 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2013, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.163-170
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titre: Sparse classification with MRI based markers for neuromuscular disease categorization
auteur: Katerina Gkirtzou, Jean-François Deux, Guillaume Bassez, Aristeidis Sotiras, Alain Rahmouni, Thibault Varacca, Nikos Paragios, Matthew Blaschko
article: 4th International Workhop on Machine Learning in Medical Imaging, Sep 2013, Nagoya, Japan
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titre: Rapid Mode Estimation for 3D Brain MRI Tumor Segmentation
auteur: Haithem Boussaid, Iasonas Kokkinos, Nikos Paragios
article: Energy Minimization Methods in Computer Vision and Pattern Recognition, Aug 2013, Lund, Sweden
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titre: Pose Invariant Deformable Shape Priors Using L1 Higher Order Sparse Graphs
auteur: Bo Xiang, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: 9th International Symposium on Visual Computing - ISVC 2013, Jul 2013, Rethymnon, Greece
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titre: Learning from M/EEG data with variable brain activation delays
auteur: Wojciech Zaremba, M. Pawan Kumar, Alexandre Gramfort, Matthew Blaschko
article: International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jun 2013, Asilomar, United States
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titre: Dense Segmentation-aware Descriptors
auteur: Eduard Trulls, Iasonas Kokkinos, Alberto Sanfeliu, Francesc Moreno-Noguer
article: Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2013, Portland, Oregon, United States
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titre: Non Maximal Suppression in Cascaded Ranking Models
auteur: Matthew Blaschko, Juho Kannala, Esa Rahtu
article: Scandanavian Conference on Image Analysis, Jun 2013, Espoo, Finland. pp.408-419, ⟨10.1007/978-3-642-38886-6_39⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-38886-6_39
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titre: Nonlinear diffusion constraints for reconstructing subsampled rotational angiography data
auteur: Hélène Langet, Aymeric Reshef, Cyril Riddell, Yves Trousset, Arthur Tenenhaus, Elisabeth Lahalle, Gilles Fleury, Nikos Paragios
article: Fully3D 2013, Jun 2013, Lake Tahoe, California, United States. pp.38-41
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titre: FMRI Analysis of Cocaine Addiction Using K-Support Sparsity
auteur: Katerina Gkirtzou, Jean Honorio, Dimitris Samaras, Rita Goldstein, Matthew B. Blaschko
article: International Symposium on Biomedical Imaging, IEEE, Apr 2013, San Francisco, United States
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titre: Shufflets: Shared Mid-level Parts for Fast Multi-Category Detection
auteur: Iasonas Kokkinos
article: ICCV - International Conference on Computer Vision, 2013, Sydney, Australia
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Book sections

titre: Modeling Shapes with Higher-Order Graphs: Methodology and Applications
auteur: Chaohui Wang, Yun Zeng, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: Shape Perception in Human and Computer Vision: An Interdisciplinary Perspective, Sven J. Dickinson and Zygmunt Pizlo, pp.459-471, 2013
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Directions of work or proceedings

titre: International Journal of Computer Vision - Special Issue : Novel Representations, Methods, and Algorithms in Computer Vision
auteur: Kostas Daniilidis, Petros Maragos, Nikos Paragios
article: France. 103 (2), Springer, pp.177-266, 2013
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Habilitation à diriger des recherches

titre: Weakly Supervised Learning for Structured Output Prediction
auteur: M. Pawan Kumar
article: Machine Learning [cs.LG]. École normale supérieure de Cachan - ENS Cachan, 2013
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titre: Learning and Optimization for Shape-based Representations
auteur: Iasonas Kokkinos
article: Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Université Paris-Est, 2013
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Reports

titre: Learning the Graph of Relations Among Multiple Tasks
auteur: Andreas Argyriou, Stéphan Clémençon, Ruocong Zhang
article: [Research Report] 2013
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titre: Discriminative Parameter Estimation for Random Walks Segmentation: Technical Report
auteur: Pierre-Yves Baudin, Danny Goodman, Puneet Kumar, Noura Azzabou, Pierre G. Carlier, Nikos Paragios, M. Pawan Kumar
article: [Research Report] 2013
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titre: Parameter Estimation and Energy Minimization for Region-based Semantic Segmentation
auteur: M. Pawan Kumar, Haithem Turki, Dan Preston, Daphne Koller
article: [Technical Report] 2013
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Preprints, Working Papers, ...

titre: Fine-Grained Visual Classification of Aircraft
auteur: Subhransu Maji, Esa Rahtu, Juho Kannala, Matthew Blaschko, Andrea Vedaldi
article: 2013
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titre: A Note on k-support Norm Regularized Risk Minimization
auteur: Matthew Blaschko
article: 2013
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titre: On Sparsity Inducing Regularization Methods for Machine Learning
auteur: Andreas Argyriou, Luca Baldassarre, Charles A. Micchelli, Massimiliano Pontil
article: 2013
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2012

Journal articles

titre: Guest Editorial: Special Issue on Structured Prediction and Inference
auteur: Matthew B. Blaschko, Christoph H. Lampert,
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2012, 99 (3), pp.257-258. ⟨10.1007/s11263-012-0530-y⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11263-012-0530-y
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Conference papers

titre: Automatic verification of boundary annotations from mechanical turk
auteur: Naomi Saphra, Juho Kannala, Esa Rahtu, Matthew Blaschko
article: Women in Machine Learning Workshop, Dec 2012, Lake Tahoe, NV, United States
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titre: Sparse Prediction with the $k$-Support Norm
auteur: Andreas Argyriou, Rina Foygel, Nathan Srebro
article: Neural Information Processing Systems, Dec 2012, Lake Tahoe, United States. pp.1466-1474
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titre: Perceptron Learning of SAT
auteur: Alex Flint, Matthew Blaschko
article: Neural Information Processing Systems, Dec 2012, Lake Tahoe, United States. pp.2780-2788
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titre: Image contextual representation and matching through hierarchies and higher order graphs
auteur: Jose Rubio, Joan Serrat, Antonio López, Nikos Paragios
article: 21st International Conference on Pattern Recognition - ICPR 2012, Nov 2012, Tsukuba, Japan. pp.2664 - 2667
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titre: MRF-Based blind image deconvolution
auteur: Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: 11th Asian Conference on Computer Vision - ACCV 2012, Nov 2012, Daejeon, North Korea. pp.361-374
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titre: Bag-of-multimedia-words for image classification
auteur: Amel Znaidia, Aymen Shabou, Hervé Le Borgne, Céline Hudelot, Nikos Paragios
article: Proceedings of the 21st International Conference on Pattern Recognition, ICPR 2012, Nov 2012, Tsukuba, Japan. pp.1509-1512
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titre: High-Level Bottom-Up Cues for Top-Down Parsing of Facade Images
auteur: David Ok, Mateusz Koziński, Renaud Marlet, Nikos Paragios
article: 3DIMPVT, Oct 2012, Zürich, Switzerland. pp.N/A
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titre: Taxonomic Multi-class Prediction and Person Layout using Efficient Structured Ranking
auteur: Arpit Mittal, Matthew Blaschko, Andrew Zisserman, Philip H.S. Torr
article: European Conference on Computer Vision, Oct 2012, Firenze, Italy. pp.245-258, ⟨10.1007/978-3-642-33709-3_18⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33709-3_18
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titre: Learning-Based Symmetry Detection in Natural Images
auteur: Stavros Tsogkas, Iasonas Kokkinos
article: ECCV - 12th European Conference on Computer Vision, Oct 2012, Florence, Italy. pp.41-54
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titre: Compressed Sensing Dynamic Reconstruction in Rotational Angiography
auteur: Hélène Langet, Cyril Riddell, Yves Trousset, Arthur Tenenhaus, Elisabeth Lahalle, Gilles Fleury, Nikos Paragios
article: MICCAI'12, Oct 2012, Nice, France. pp.223-230, ⟨10.1007/978-3-642-33415-3_28⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33415-3_28
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titre: Similarity-based appearance-prior for fitting a subdivision mesh in gene expression images.
auteur: Yen H. Le, Uday Kurkure, Nikos Paragios, Tao Ju, James P. Carson, Ioannis A. Kakadiaris
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.577-84, ⟨10.1007/978-3-642-33415-3_71⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33415-3_71
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titre: Joint Tumor Segmentation and Dense Deformable Registration of Brain MR Images
auteur: Sarah Parisot, Hugues Duffau, Stéphane Chemouny, Nikos Paragios
article: MICCAI - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.651-658, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_80⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-33418-4_80
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titre: Tomographic Reconstruction with L1-Minimization Strategy for Rotational Angiography
auteur: Hélène Langet, Cyril Riddell, Arthur Tenenhaus, Yves Trousset, Elisabeth Lahalle, Gilles Fleury, Nikos Paragios
article: 20th International Conference on computational statistics (COMPSTAT'12), Aug 2012, Limassol, Cyprus
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titre: MODELING LATENT VARIABLE UNCERTAINTY FOR LOSS-BASED LEARNING
auteur: M. Pawan Kumar, Ben Packer, Daphne Koller
article: ICML, Jun 2012, Edinburgh, United Kingdom
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titre: Discovering Discriminative Action Parts from Mid-Level Video Representations
auteur: Michalis Raptis, Iasonas Kokkinos, Stefano Soatto
article: CVPR - IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2012, Providence, United States. ⟨10.1109/cvpr.2012.6247807⟩
DOI: DOI : 10.1109/cvpr.2012.6247807
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titre: Parameter-free/Pareto-driven procedural 3D reconstruction of buildings from ground-level sequences
auteur: Loïc Simon, Olivier Teboul, Panagiotis Koutsourakis, Luc van Gool, Nikos Paragios
article: 25th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2012, Jun 2012, Rhode Island, United States. pp.518-525, ⟨10.1109/CVPR.2012.6247716⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2012.6247716
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titre: Unsupervised co-segmentation through region matching
auteur: Jose Rubio, Joan Serrat, Antonio López, Nikos Paragios
article: 25th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2012, Jun 2012, Rhode Island, United States. pp.749-756
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titre: Intrinsic shape context descriptors for deformable shapes
auteur: Iasonas Kokkinos, Michael M. Bronstein, Roee Litman, Alexander M. Bronstein
article: CVPR 2012 - IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2012, Providence, United States. pp.159-166, ⟨10.1109/CVPR.2012.6247671⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2012.6247671
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titre: Graph-based Detection, Segmentation & Characterization of Brain Tumors
auteur: Sarah Parisot, Hugues Duffau, Stéphane Chemouny, Nikos Paragios
article: CVPR - 25th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition 2012, Jun 2012, Providence, United States
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titre: Manifold-constrained embeddings for the detection of white matter lesions in brain MRI
auteur: Samuel Kadoury, Guray Erus, Evangelina I. Zacharaki, Nikos Paragios, Davatzikos Christos
article: 2012 IEEE 9th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2012, May 2012, Barcelona, Spain. pp.562 - 565
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titre: Graph-based guide-wire segmentation through fusion of contrast-enhanced and fluoroscopic images
auteur: Nicolas Honnorat, Régis Vaillant, Nikos Paragios
article: 2012 IEEE 9th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2012, May 2012, Barcelona, Spain. pp.948 - 951
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titre: Automatic skeletal muscle segmentation through random walks and graph-based seed placement
auteur: Pierre-Yves Baudin, Noura Azzabou, Pierre G. Carlier, Nikos Paragios
article: International Symposium Biomedical Imaging (ISBI), May 2012, Barcelone, Spain. pp.1036--1039, ⟨10.1109/isbi.2012.6235735⟩
DOI: DOI : 10.1109/isbi.2012.6235735
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titre: Compressed sensing subtracted rotational angiography with multiple sparse penalty
auteur: Hélène Langet, C. Riddell, Y. Trousset, Arthur Tenenhaus, Elisabeth Lahalle, Gilles Fleury, Nikos Paragios
article: 2012 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2012) , May 2012, Barcelone, Spain. pp.884-887, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235690⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2012.6235690
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titre: 3D CARDIAC SEGMENTATION WITH POSE-INVARIANT HIGHER-ORDER MRFS
auteur: Bo Xiang, Chaohui Wang, Jean-François Deux, Alain Rahmouni, Nikolaos Paragios
article: International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, May 2012, Barcelona, Spain. ⟨10.1109/isbi.2012.6235836⟩
DOI: DOI : 10.1109/isbi.2012.6235836
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titre: MAX-MARGIN MIN-ENTROPY MODELS
auteur: Kevin Miller, M. Pawan Kumar, Ben Packer, Danny Goodman, Daphne Koller
article: AISTATS, Apr 2012, La Palma, Spain
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titre: Prior Knowledge, Random Walks and Human Skeletal Muscle Segmentation
auteur: Pierre-Yves Baudin, Noura Azzabou, Pierre G. Carlier, Nikos Paragios
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), 2012, France. pp.569-576
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titre: Manifold-enhanced Segmentation through Random Walks on Linear Subspace Priors
auteur: Pierre-Yves Baudin, Noura Azzabou, Pierre G. Carlier, Nikos Paragios
article: British Machine Vision Conference, 2012, United Kingdom. pp.51.1-51.10
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titre: Discrete symmetric image registration
auteur: Aristeidis Sotiras, Nikos Paragios
article: Biomedical Imaging (ISBI), 2012 9th IEEE International Symposium on, 2012, Spain. pp.342-345
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titre: Bounding Part Scores for Rapid Detection with Deformable Part Models
auteur: Iasonas Kokkinos
article: ECCV Workshops - Parts and Attributes Workshop, European Conference on Computer Vision, 2012, Florence, Italy. pp.41-50
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Habilitation à diriger des recherches

titre: Modeling the variability of EEG/MEG data through statistical machine learning
auteur: Wojciech Zaremba
article: Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. Ecole Polytechnique X, 2012
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Reports

titre: Markov Random Fields in Vision Perception: A Survey
auteur: Chaohui Wang, Nikos Paragios
article: [Research Report] RR-7945, INRIA. 2012
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titre: Deformable Medical Image Registration: A Survey
auteur: Aristeidis Sotiras, Christos Davatzikos, Nikos Paragios
article: [Research Report] RR-7919, INRIA. 2012
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titre: Towards a detailed understanding of objects and scenes in natural images
auteur: Matthew Blaschko, Ross B. Girshick, Juho Kannala, Iasonas Kokkinos, Siddarth Mahendran, Subhransu Maji, Sammy Mohamed, Esa Rahtu, Naomi Saphra, Karen Simonyan, Ben Taskar, Andrea Vedaldi, David Weiss
article: [Technical Report] 2012
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titre: Rapid Deformable Object Detection using Bounding-based Techniques
auteur: Iasonas Kokkinos
article: [Research Report] RR-7940, INRIA. 2012
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titre: Dense Scale Invariant Descriptors for Images and Surfaces
auteur: Iasonas Kokkinos, Michael Bronstein, Alan Yuille
article: [Research Report] RR-7914, INRIA. 2012
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Preprints, Working Papers, ...

titre: PRISMA: PRoximal Iterative SMoothing Algorithm
auteur: Francesco Orabona, Andreas Argyriou, Nathan Srebro
article: 2012
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titre: Sparse Prediction with the $k$-Support Norm
auteur: Andreas Argyriou, Rina Foygel, Nathan Srebro
article: 2012
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2011

Journal articles

titre: Evaluation of registration methods on thoracic CT: the EMPIRE10 challenge.
auteur: Keelin Murphy, Bram van Ginneken, Joseph M. Reinhardt, Sven Kabus, Kai Ding, Xiang Deng, Kunlin Cao, Kaifang Du, Gary E. Christensen, Vincent Garcia, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Ben Glocker, Nikolaos Paragios, Nassir Navab, Vladlena Gorbunova, Jon Sporring, Marleen de Bruijne, Xiao Han, Mattias P. Heinrich, Julia A. Schnabel, Mark Jenkinson, Cristian Lorenz, Marc Modat, Jamie R. Mcclelland, Sébastien Ourselin, Sacha Ea Muenzing, Max A. Viergever, Dante de Nigris, Louis D. Collins, Tal Arbel, Marta Peroni, Rui Li, Gregory C. Sharp, Alexander Schmidt-Richberg, Jan Ehrhardt, René Werner, Dirk Smeets, Dirk Loeckx, Gang Song, Nicholas Tustison, Brian Avants, James C. Gee, Marius Staring, Stefan Klein, Berend C. Stoel, Martin Urschler, Manuel Werlberger, Jef Vandemeulebroucke, Simon Rit, David Sarrut, Josien Pw Pluim
article: IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 30 (11), pp.1901-20. ⟨10.1109/TMI.2011.2158349⟩
DOI: DOI : 10.1109/TMI.2011.2158349
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titre: Model-Based 3D Hand Pose Estimation from Monocular Video
auteur: Martin de La Gorce, J. Fleet D, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 33 (9), pp.1793 - 1805. ⟨10.1109/TPAMI.2011.33⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2011.33
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titre: DRAMMS: Deformable registration via attribute matching and mutual-saliency weighting.
auteur: Yangming Ou, Aristeidis Sotiras, Nikos Paragios, Christos Davatzikos
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2011, 15 (4), pp.622-639. ⟨10.1016/j.media.2010.07.002⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2010.07.002
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titre: Automatic inference of articulated spine models in CT images using high-order Markov Random Fields
auteur: Samuel Kadoury, Hubert Labelle, Nikos Paragios
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2011, 15 (4), pp.426-437. ⟨10.1016/j.media.2011.01.006⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2011.01.006
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titre: Estimation of intra-operator variability in perfusion parameter measurements using DCE-US
auteur: Marianne Gauthier, Ingrid Leguerney, Jessie Thalmensi, Mohamed Chebil, Sarah Parisot, Pierre Peronneau, Alain Roche, Nathalie Lassau
article: World Journal of Radiology, Baishideng Publishing Group, 2011, 3, ⟨10.4329/wjr.v3.i3.70⟩
DOI: DOI : 10.4329/wjr.v3.i3.70
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titre: Learning deformation and structure simultaneously: in situ endograft deformation analysis.
auteur: Georg Langs, Nikos Paragios, Pascal Desgranges, Alain Rahmouni, Hicham Kobeiter
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2011, 15 (1), pp.12-21. ⟨10.1016/j.media.2010.06.005⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2010.06.005
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titre: Inference and Learning with Hierarchical Shape Models
auteur: Iasonas Kokkinos, Alan Yuille
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2011, 93 (2), pp.201-225
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titre: Random Exploration of the Procedural Space for Single-View 3D Modeling of Buildings
auteur: Loïc Simon, O. Teboul, Koutsourakis Panagiotis, Nikos Paragios
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2011, 93 (2), pp.253-271. ⟨10.1007/s11263-010-0370-6⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11263-010-0370-6
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titre: MRF Energy Minimization and Beyond via Dual Decomposition
auteur: Nikos Komodakis, Nikos Paragios, Georgios Tziritas
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 33 (3), pp.531-552
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titre: Deformable Medical Image Registration: Setting the State of the Art with Discrete Methods
auteur: Ben Glocker, Aristeidis Sotiras, Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: Annual Review of Biomedical Engineering, Annual Reviews, 2011, 13, pp.219-244
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Conference papers

titre: Learning Equivariant Structured Output SVM Regressors
auteur: Andrea Vedaldi, Matthew B. Blaschko, Andrew Zisserman
article: International Conference on Computer Vision, Nov 2011, Barcelona, Spain. pp.959-966, ⟨10.1109/ICCV.2011.6126339⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2011.6126339
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titre: Learning a Category Independent Object Detection Cascade
auteur: Esa Rahtu, Juho Kannala, Matthew B. Blaschko
article: International Conference on Computer Vision, Nov 2011, Barcelona, Spain. pp.1052-1059, ⟨10.1109/ICCV.2011.6126351⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2011.6126351
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titre: Efficient parallel message computation for MAP inference
auteur: Stavros Alchatzidis, Aristeidis Sotiras, Nikos Paragios
article: International Conference on Computer Vision, Nov 2011, Barcelone, Spain. pp.1379 - 1386
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titre: Markov Random Field-based fitting of a subdivision-based geometric atlas
auteur: Uday Kurkure, Yen Le, Nikos Paragios, Tao Ju, James Carson, Ioannis A. Kakadiaris
article: 13th International Conference on Computer Vision - ICCV 2011, Nov 2011, Barcelona, Spain. pp.2540-2547, ⟨10.1109/ICCV.2011.6126541⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2011.6126541
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titre: Viewpoint invariant 3D landmark model inference from monocular 2D images using higher-order priors
auteur: Chaohui Wang, Yun Zeng, Loïc Simon, Ioannis A. Kakadiaris, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: 13th International Conference on Computer Vision - ICCV 2011, Nov 2011, Barcelona, Spain. pp.319-326, ⟨10.1109/ICCV.2011.6126258⟩
DOI: DOI : 10.1109/ICCV.2011.6126258
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titre: Compressed Sensing Based 3D Tomographic Reconstruction for Rotational Angiography
auteur: Hélène Langet, C. Riddell, Y. Trousset, Arthur Tenenhaus, Elisabeth Lahalle, Gilles Fleury, Nikolaos Paragios
article: 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'11), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.97-104
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titre: Graph Based Spatial Position Mapping of Low-grade Gliomas
auteur: Sarah Parisot, Hugues Duffau, Stéphane Chemouny, Nikos Paragios
article: MICCAI - 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.508-515, ⟨10.1007/978-3-642-23629-7_62⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-23629-7_62
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titre: Graph-Based Geometric-Iconic Guide-Wire Tracking
auteur: Nicolas Honnorat, Régis Vaillant, Nikos Paragios
article: 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.9-16, ⟨10.1007/978-3-642-23623-5_2⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-23623-5_2
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titre: Pose-Invariant 3D Proximal Femur Estimation through Bi-planar Image Segmentation with Hierarchical Higher-Order Graph-Based Priors
auteur: Chaohui Wang, Haithem Boussaid, Loïc Simon, Jean-Yves Lazennec, Nikos Paragios
article: 14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2011, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.346-353, ⟨10.1007/978-3-642-23626-6_43⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-23626-6_43
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titre: 3D Model-based Reconstruction of the Proximal Femur from Low-dose Biplanar X-Ray Images
auteur: Haithem Boussaid, Samuel Kadoury, Iasonas Kokkinos, Jean-Yves Lazennec, Guoyan Zheng, Nikos Paragios
article: The 22nd British Machine Vision Conference - BMVC 2011, Aug 2011, Dundee, United Kingdom. pp.1-10, ⟨10.5244/C.25.35⟩
DOI: DOI : 10.5244/C.25.35
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titre: Sparsity constraints and dedicated acquisition protocols for improved Digital Subtraction Rotational Angiography
auteur: Hélène Langet, C. Riddell, Y. Trousset, Elisabeth Lahalle, Arthur Tenenhaus, Gilles Fleury, Nikolaos Paragios
article: 11th International Meeting on Fully Three - Dimensional Image Reconstruction in Radiology and Nuclear Medicine (Fully 3D'11), Jul 2011, Postdam, Germany. pp.427-430
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titre: Illumination estimation and cast shadow detection through a higher-order graphical model
auteur: A. Panagopoulos, Chaohui Wang, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: 2011 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2011, Jun 2011, Colorado Springs, United States. pp.673 - 680, ⟨10.1109/CVPR.2011.5995585⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2011.5995585
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titre: Intrinsic dense 3D surface tracking
auteur: Yun Zeng, Chaohui Wang, Yang Wang, Xianfeng Gu, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: 24th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2011, Jun 2011, Colorado Springs, United States. pp.1225-1232, ⟨10.1109/CVPR.2011.5995513⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2011.5995513
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titre: Landmark/image-based deformable registration of gene expression data
auteur: Uday Kurkure, Yen H. Le, Nikos Paragios, James Carson, Tao Ju, Ioannis A. Kakadiaris
article: 24th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2011, Jun 2011, Rhode Island, United States. pp.1089-1096, ⟨10.1109/CVPR.2011.5995708⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2011.5995708
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titre: Optimal similarity registration of volumetric images
auteur: Effrosini Kokiopoulou, Daniel Kressner, Michail Zervos, Nikos Paragios
article: 24th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2011, Jun 2011, Colorado Springs, United States. pp.2449-2456, ⟨10.1109/CVPR.2011.5995337⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2011.5995337
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titre: Shape grammar parsing via Reinforcement Learning
auteur: Olivier Teboul, Iasonas Kokkinos, Loïc Simon, Panagiotis Koutsourakis, Nikos Paragios
article: 24th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2011, Jun 2011, Colorado Springs, United States. pp.2273-2280, ⟨10.1109/CVPR.2011.5995319⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2011.5995319
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titre: Landmark-based segmentation of lungs while handling partial correspondences using sparse graph-based priors
auteur: Ahmed Besbes, Nikos Paragios
article: 2011 IEEE 8th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2011, Mar 2011, Chicago, United States. pp.989-995, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872568⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872568
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titre: Tagged cardiac MR image segmentation using boundary & regional-support and graph-based deformable priors
auteur: Bo Xiang, Chaohui Wang, Jean-François Deux, Alain Rahmouni, Nikos Paragios
article: 2011 IEEE 8th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2011, Mar 2011, Chicago, United States. pp.1706-1711, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872733⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872733
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titre: Curvilinear structures extraction in cluttered bioimaging data with discrete optimization methods
auteur: Nicolas Honnorat, Régis Vaillant, James Duncan, Nikos Paragios
article: 2011 IEEE 8th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2011, Mar 2011, Chicago, United States. pp.1353-1357, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872651⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872651
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titre: Boosted metric learning for 3D multi-modal deformable registration
auteur: Fabrice Michel, Michael Bronstein, Alexander Bronstein, Nikos Paragios
article: 2011 IEEE 8th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2011, Mar 2011, Chicago, United States. pp.1209-1214, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872619⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872619
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titre: Rapid Deformable Object Detection using Dual-Tree Branch-and-Bound
auteur: Iasonas Kokkinos
article: NIPS - Neural Information Processing Systems, 2011, Granada, Spain. pp.2681-2689
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Directions of work or proceedings

titre: Computer Vision and Image Understanding, Special issue on Optimization for vision, graphics and medical imaging: Theory and applications
auteur: Nikos Komodakis, Georg Langs, Horst Bischof, Nikos Paragios
article: Elsevier, pp.1597, 2011
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Reports

titre: Discrete Methods for Guide-wire Segmentation and Tracking
auteur: Nicolas Honnorat, Régis Vaillant, Nikos Paragios
article: [Research Report] RR-7718, INRIA. 2011
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titre: A Generic Local Deformation Model for Shape Registration
auteur: Yun Zeng, Chaohui Wang, Yang Wang, Xianfeng Gu, Dimitris Samaras, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-7676, INRIA. 2011
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2010

Journal articles

titre: Spatio-temporal speckle reduction in ultrasound sequences
auteur: Noura Azzabou, Nikos Paragios
article: Inverse Problems and Imaging , AIMS American Institute of Mathematical Sciences, 2010, 4 (2), pp.211-222. ⟨10.3934/ipi.2010.4.211⟩
DOI: DOI : 10.3934/ipi.2010.4.211
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titre: Large-Scale Building Reconstruction Through Information Fusion and 3-D Priors
auteur: Konstantinos Karantzalos, Nikos Paragios
article: IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, 48 (5), pp.2283-2296. ⟨10.1109/TGRS.2009.2039220⟩
DOI: DOI : 10.1109/TGRS.2009.2039220
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titre: Linear intensity-based image registration by Markov random fields and discrete optimization
auteur: Darko Zikic, Ben Glocker, Oliver Kutter, Martin Groher, Nikos Komodakis, Ali Kamen, Nikos Paragios, Nassir Navab
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2010, 14 (4), pp.550-562. ⟨10.1016/j.media.2010.04.003⟩
DOI: DOI : 10.1016/j.media.2010.04.003
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titre: Image Reconstruction Using Particle Filters and Multiple Hypotheses Testing
auteur: Noura Azzabou, Nikos Paragios, Frédéric Guichard
article: IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, pp.1181-1190
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titre: A variational approach to monocular hand-pose estimation
auteur: Martin de La Gorce, Nikos Paragios
article: Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2010, pp.363-372
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Conference papers

titre: Simultaneous Geometric - Iconic Registration
auteur: Aristeidis Sotiras, Yangming Ou, Ben Glocker, Christos Davatzikos, Nikos Paragios
article: 13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. pp.676-683, ⟨10.1007/978-3-642-15745-5_83⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-15745-5_83
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titre: Guide-Wire Extraction through Perceptual Organization of Local Segments in Fluoroscopic Images
auteur: Nicolas Honnorat, Régis Vaillant, Nikos Paragios
article: 13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. pp.440-448, ⟨10.1007/978-3-642-15711-0_55⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-15711-0_55
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titre: 3D Knowledge-Based Segmentation Using Pose-Invariant Higher-Order Graphs
auteur: Chaohui Wang, Olivier Teboul, Fabrice Michel, Salma Essafi, Nikos Paragios
article: MICCAI 2010 - 13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2010, Beijing, China. pp.189-196, ⟨10.1007/978-3-642-15711-0_24⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-15711-0_24
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titre: Model-Based Multi-view Fusion of Cinematic Flow and Optical Imaging
auteur: Mickaël Savinaud, Martin de La Gorce, S. Maitrejean, Nikos Paragios
article: 13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. pp.668-675, ⟨10.1007/978-3-642-15745-5_82⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-15745-5_82
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titre: Nonlinear Embedding towards Articulated Spine Shape Inference Using Higher-Order MRFs
auteur: Samuel Kadoury, Nikos Paragios
article: 13th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. pp.579-586, ⟨10.1007/978-3-642-15711-0_72⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-15711-0_72
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titre: Estimating Shadows with the Bright Channel Cue
auteur: Alexandros Panagoupolos, Chaohui Wang, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: 11th European Conference on Computer Vision - ECCV 2010, Sep 2010, Heraklion, Greece. pp.1-12, ⟨10.1007/978-3-642-35740-4_1⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-642-35740-4_1
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titre: Segmentation of building facades using procedural shape priors
auteur: Olivier Teboul, Loïc Simon, Panagiotis Koutsorakis, Nikos Paragios
article: 23rd IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2010, Jun 2010, San Francisco, United States. pp.3105-3112, ⟨10.1109/CVPR.2010.5540068⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2010.5540068
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titre: Dense non-rigid surface registration using high-order graph matching
auteur: Yun Zeng, Chaohui Wang, Yang Wang, Xianfeng Gu, Dimitris Samaras, Nikos Paragios
article: 23rd IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2010, Jun 2010, San Francisco, United States. pp.382-389, ⟨10.1109/CVPR.2010.5540189⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2010.5540189
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titre: Data fusion through cross-modality metric learning using similarity-sensitive hashing
auteur: Michael Bronstein, Alexander Bronstein, Fabrice Michel, Nikos Paragios
article: 23rd IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition - CVPR 2010, Jun 2010, San Francisco, United States. pp.3594-3601, ⟨10.1109/CVPR.2010.5539928⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2010.5539928
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titre: Multimodal inference of articulated spine models from higher order energy functions of discrete MRFS
auteur: Samuel Kadoury, Nikos Paragios
article: 2010 IEEE 7th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2010, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.1393-1396, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490258⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490258
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titre: Image transport regression using mixture of experts and discrete Markov random fields
auteur: Fabrice Michel, Nikos Paragios
article: 2010 IEEE 7th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2010, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.1229-1232, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490217⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490217
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titre: Needle tracking through higher-order MRF optimization
auteur: Tim Hauke Heibel, Ben Glocker, Nikos Paragios, Nassir Navab
article: 2010 IEEE 7th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2010, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.624-627, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490099⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490099
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titre: A Kernel-based graphical model for diffusion tensor registration
auteur: A. Sotiras, Radhouène Neji, Jean-François Deux, N. Komodakis, Gilles Fleury, Nikolaos Paragios
article: 2010 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI 2010), Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.524-527, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490295⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490295
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titre: Robust guidewire segmentation through boosting, clustering and linear programming
auteur: Nicolas Honnorat, Régis Vaillant, Nikos Paragios
article: 2010 IEEE 7th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2010, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.924-927, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490138⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490138
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titre: Bioluminescence enhancement through fusion of optical imaging and cinematic video flow
auteur: Mickaël Savinaud, Aristeidis Sotiras, S. Maitrejean, Nikos Paragios
article: 2010 IEEE 7th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2010, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.688-691, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490081⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490081
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titre: Detecting mutually-salient landmark pairs with MRF regularization
auteur: Yangming Ou, Ahmed Besbes, Michel Billelo, M. Mansour, Christos Davatzikos, Nikos Paragios
article: 2010 IEEE 7th International Symposium on Biomedical Imaging - ISBI 2010, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.400-403, ⟨10.1109/ISBI.2010.5490324⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2010.5490324
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titre: Boundary Detection using F-Measure-, Filter- and Feature boost
auteur: Iasonas Kokkinos
article: ECCV - Proc. European Conference on Computer Vision, 2010, Heraklion, Greece. pp.650-663
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titre: Highly Accurate Boundary Detection and Grouping
auteur: Iasonas Kokkinos
article: CVPR - IEEE Conf. on Computer Vision and Pattern Recognition, 2010, San Francisco, United States. pp.2520-2527
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titre: SHREC'10 Track: Robust Shape Retrieval.
auteur: Alexander Bronstein, Michael Bronstein, Umberto Castellani, Bianca Falcidieno, Andrea Fusiello, Afzal Godil, Leonidas Guibas, Iasonas Kokkinos, Zhouhui Lian, Maks Ovsjanikov, Giuseppe Patanè, Michela Spagnuolo, Roberto Toldo
article: 3DOR - Eurographics Workshop on 3D Object Retrieval, 2010, Norrköping, Sweden. pp.71-78
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titre: Scale-invariant heat kernel signatures for non-rigid shape recognition
auteur: Michael Bronstein, Iasonas Kokkinos
article: CVPR - IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, 2010, San Francisco, United States. pp.1704-1711
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titre: SHREC'10 Track: Feature Detection and Description
auteur: Alexander M. Bronstein, Michael M. Bronstein, Benjamin Bustos, Umberto Castellani, Marco Cristani, Bianca Falcidieno, Leonidas J. Guibas, Iasonas Kokkinos, Vittorio Murino, Maks Ovsjanikov, Giuseppe Patanè, Ivan Sipiran, Michela Spagnuolo, Jian Sun
article: 3DOR - Eurographics Workshop on 3D Object Retrieval, 2010, Norrköping, Sweden. pp.79-89
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titre: Non-rigid Registration using Discrete MRFs: Application to Thoracic CT Images
auteur: Ben Glocker, Nikos Komodakis, Nikos Paragios, Nassir Navab
article: Workshop Evaluation of Methods for Pulmonary Image Registration, MICCAI 2010, 2010, China
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titre: Markov Random Field Optimization for Intensity-based 2D-3D Registration
auteur: Darko Zikic, Ben Glocker, Oliver Kutter, Martin Groher, Nikos Komodakis, Ali Khamene, Nikos Paragios, Nassir Navab
article: SPIE 2010, Medical Imaging 2010: Image Processing, 2010, San Diego, United States. ⟨10.1117/12.837232⟩
DOI: DOI : 10.1117/12.837232
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Directions of work or proceedings

titre: ECCV 2010, 11th European Conference on Computer Vision, Heraklion, Crete, Greece, September 5-11, 2010 (Part 1)
auteur: Kostas Daniilidis, Petros Maragos, Nikos Paragios
article: France. Springer, pp.8111, 2010, 978-3-642-15548-2
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titre: Inverse Problem and Imaging Journal Special Issue on Medical Image Analysis
auteur: Tony Chan, Yunmei Chen, Nikos Paragios
article: France. American Institute of Mathematical Sciences, pp.125, 2010
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Reports

titre: Curvilinear structures segmentation in fluoroscopic images
auteur: Nicolas Honnorat, Régis Vaillant, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-7414, INRIA. 2010
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titre: Discrete minimum distortion correspondence problems for non-rigid shape matching
auteur: Chaohui Wang, Michael M. Bronstein, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-7333, INRIA. 2010
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Theses

titre: Diffusion Tensor Imaging of the Human Skeletal Muscle: Contributions and Applications
auteur: Radhouène Neji
article: Signal and Image processing. Ecole Centrale Paris, 2010. English
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2009

Journal articles

titre: EEG spectral changes underlying BOLD responses contralateral to spikes in patients with focal epilepsy
auteur: Juming M. Yu, Louise Tyvaert, Pierre Levan, Rina Zelmann, François Dubeau, Jean Gotman, Eliane Kobayashi
article: Epilepsia, Wiley, 2009, 50 (7), ⟨10.1111/j.1528-1167.2009.02080.x⟩
DOI: DOI : 10.1111/j.1528-1167.2009.02080.x
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titre: Registration with Uncertainties and Statistical Modeling of Shapes with Variable Metric Kernels
auteur: Maxime Taron, Nikos Paragios, Marie-Pierre Jolly
article: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, 31 (1), pp.99-113. ⟨10.1109/TPAMI.2008.36⟩
DOI: DOI : 10.1109/TPAMI.2008.36
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Conference papers

titre: Clustering of the Human Skeletal Muscle Fibers Using Linear Programming and Angular Hilbertian Metrics
auteur: Radhouène Neji, Ahmed Besbes, Nikos Komodakis, Mezri Maatoouk, Jean-François Deux, Alain Rahmouni, Guillaume Bassez, Gilles Fleury, Nikolaos Paragios
article: 21st International Conference on Information Processing in Medical Imaging, Jul 2009, Williamsburg (Virginia), United States. pp.14-25
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titre: Unsupervised classification of skeletal fibers using diffusion maps
auteur: Radhouène Neji, Georg Langs, Jean-François Deux, Mezri Maatoouk, Alain Rahmouni, Guillaume Bassez, Gilles Fleury, Nikolaos Paragios
article: IEEE International Symposium on Biomedical Imaging : from Nano to Macro, Jun 2009, Boston, United States. pp.410-413
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titre: Classification of Tensors and Fiber Tracts Using Mercer-Kernels Encoding Soft Probabilistic Spatial and Diffusion Information
auteur: Radhouène Neji, Nikolaos Paragios, Gilles Fleury, Jean-Philippe Thiran, Georg Langs
article: IEEE Computer Society Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2009, Miami Beach, United States. pp.2168-2175
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Reports

titre: Towards Shape Constellation Inference through Higher-Order MRF Optimization in Nonlinear Embeddings
auteur: Samuel Kadoury, Nikolaos Paragios
article: [Technical Report] RT-0376, INRIA. 2009
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titre: Scale-invariance in local heat kernel descriptors without scale selection and normalization
auteur: Michael Bronstein, Iasonas Kokkinos
article: [Research Report] RR-7161, INRIA. 2009
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titre: Cue Integration and Discrete MRFs towards Knowledge-based Segmentation and Tracking
auteur: Ahmed Besbes, Nikos Paragios, Nikos Komodakis
article: [Research Report] RR-6831, INRIA. 2009, pp.24
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titre: Local Appearance Knowledge and Shape Variation Models for Muscle Segmentation
auteur: Salma Essafi, Georg Langs, Jean-Francois Deux, Guillaume Bassez, Alain Rahmouni, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-6821, INRIA. 2009
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titre: Diffusion Tensor Registration Using Probability Kernels and Discrete Optimization
auteur: Aristeidis Sotiras, Radhouène Neji, J.-F. Deux, Nikos Komodakis, Mezri Maatouk, Alain Rahmouni, Guillaume Bassez, Gilles Fleury, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-6943, INRIA. 2009
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titre: 3D Registration of Articulated Spine Models Using Markov Random Fields
auteur: Samuel Kadoury, Nikolaos Paragios
article: [Technical Report] RT-0364, INRIA. 2009, pp.14
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titre: Inferring Preoperative Reconstructed Spine Models to Volumetric CT Data through High-Order MRFs
auteur: Samuel Kadoury, Nikolaos Paragios
article: [Technical Report] RT-0374, INRIA. 2009
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titre: Manifold-driven Grouping of Skeletal Muscle Fibers
auteur: Radhouene Neji, Jean-Francois Deux, Ahmed Besbes, Nikos Komodakis, Georg Langs, Mezri Maatouk, Alain Rahmouni, Guillaume Bassez, Gilles Fleury, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-6825, INRIA. 2009
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titre: MRF-based Diffeomorphic Population Deformable Registration & Segmentation
auteur: Aristeidis Sotiras, Nikos Komodakis, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-6837, INRIA. 2009
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2008

Journal articles

titre: Prior Knowledge, Level Set Representations & Visual Grouping
auteur: Mikaël Rousson, Nikos Paragios
article: International Journal of Computer Vision, Springer Verlag, 2008, 76 (3), pp.231-243. ⟨10.1007/s11263-007-0054-z⟩
DOI: DOI : 10.1007/s11263-007-0054-z
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titre: Dense image registration through MRFs and efficient linear programming
auteur: Glocker Ben, Nikos Komodakis, Georgios Tziritas, Nassir Navab, Nikos Paragios
article: Medical Image Analysis, Elsevier, 2008, pp.731-741
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titre: Performance vs computational efficiency for optimizing single and dynamic MRFs: Setting the state of the art with primal-dual strategies
auteur: Nikos Komodakis, Georgios Tziritas, Nikos Paragios
article: Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2008, pp.14-29
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titre: Discrete optimization in computer vision
auteur: Nikos Paragios, Zabih Ramin
article: Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2008, pp.1,2
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Conference papers

titre: Spatio-temporal speckle reduction in ultrasound sequences
auteur: Noura Azzabou, Nikos Paragios
article: 11th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2008, Sep 2008, New-York, United States. pp.951-958, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_113⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-85988-8_113
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titre: Graph commute times for image representation
auteur: Régis Behmo, Nikos Paragios, Veronique Prinet
article: CVPR 2008 - Computer Vision and Pattern Recognition, Jun 2008, Anchorage, AK, United States. pp.1-8, ⟨10.1109/CVPR.2008.4587840⟩
DOI: DOI : 10.1109/CVPR.2008.4587840
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titre: Support Vector Driven Markov Random Fields towards DTI Segmentation of the Human Skeletal Muscle
auteur: Radhouène Neji, Gilles Fleury, J.-F. Deux, A. Rahmouni, G. Bassez, A. Vignaud, Nikolaos Paragios
article: ISBI International Symposium on Biomedical Imaging, May 2008, Paris, France. pp. 923-926, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541148⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541148
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titre: Conjoint use of coded-aperture collimators and MLEM algorithm: Towards large blood vessels reconstruction at 511 KEV
auteur: Xavier Hubert, Dominique Chambellan, Samuel Legoupil, Jean-Robert Deverre, Nikos Paragios
article: 2008 5th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2008, Paris, France. pp.1461 - 1464, ⟨10.1109/ISBI.2008.4541283⟩
DOI: DOI : 10.1109/ISBI.2008.4541283
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titre: Spatiotemporal Decomposition in Object-Space along Reconstruction in Emission Tomography
auteur: Xavier Hubert, Dominique Chambellan, Samuel Legoupil, Régine Trébossen, Jean-Robert Deverre, Nikos Paragios
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2008, 2008, New-York, United States. pp.255-262, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_31⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_31
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titre: Beyond Loose LP-Relaxations: Optimizing MRFs by Repairing Cycles
auteur: Nikos Komodakis, Nikos Paragios
article: ECCV, 2008, France. pp.806-820
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titre: Optical flow estimation with uncertainties through dynamic MRFs
auteur: Glocker Ben, Nikos Paragios, Nikos Komodakis, Georgios Tziritas, Nassir Navab
article: Optical flow estimation with uncertainties through dynamic MRFs, 2008, United States. pp.1-8
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titre: Deformable Mosaicing for Whole-Body MRI
auteur: Christian Wachinger, Glocker Ben, Jean-Claude Zeltner, Nikos Paragios, Nikos Komodakis, Michael Sass Hansen, Nassir Navab
article: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2008, 2008, New-York, United States. pp.113-121, ⟨10.1007/978-3-540-85990-1_14⟩
DOI: DOI : 10.1007/978-3-540-85990-1_14
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titre: Fleet: Model-based hand tracking with texture, shading and self-occlusions
auteur: Martin de La Gorce, Nikos Paragios, J. Fleet D
article: CVPR, 2008, United States. pp.1-8
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titre: Modeling the structure of multivariate manifolds: Shape maps
auteur: Georg Langs, Nikos Paragios
article: CVPR, 2008, United States. pp.1-8
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titre: Effiziente nichtlineare Registrierung mittels diskreter Optimierung.
auteur: Ben Glocker, Nikos Komodakis, Nikos Paragios, Georgios Tziritas, Nassir Navab
article: Bildverarbeitung für die Medizin 2008, 2008, Germany. pp.87-91
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titre: An Application of Graph Commute Times to Image Indexing
auteur: Régis Behmo, Nikos Paragios, Veronique Prinet
article: Geoscience and Remote Sensing Symposium, 2008. IGARSS 2008. IEEE International, 2008, Boston, United States. pp.495-498, ⟨10.1109/IGARSS.2008.4779392⟩
DOI: DOI : 10.1109/IGARSS.2008.4779392
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titre: Sparsity, redundancy and optimal image support towards knowledge-based segmentation.
auteur: Salma Essafi, Georg Langs, Nikos Paragios
article: CVPR 2008, 2008, United States. pp.1-7
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titre: Group-wise MDL based registration of small animals in video sequences
auteur: Han Yuan, Georg Langs, Nikos Paragios
article: 2008 5th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2008, Paris, France. pp.1179 - 1182
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Reports

titre: A Kernel-based Approach to Diffusion Tensor and Fiber Clustering in the Human Skeletal Muscle
auteur: Radhouène Neji, Jean-François Deux, Gilles Fleury, Mezri Maatouk, Georg Langs, Jean-Philippe Thiran, Guillaume Bassez, Alain Rahmouni, Nikolaos Paragios
article: [Research Report] RR-6686, INRIA. 2008
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