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Journal articles

ref_biblio: Feriel Abboud, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Jean-Hugues Chenot, Louis Laborelli. An Alternating Proximal Approach for Blind Video Deconvolution. Signal Processing: Image Communication, 2019, 70, pp.21-36. ⟨10.1016/j.image.2018.08.007⟩. ⟨hal-01668437v2⟩
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ref_biblio: Ömer Deniz Akyildiz, Emilie Chouzenoux, Víctor Elvira, Joaquín Míguez. A probabilistic incremental proximal gradient method. IEEE Signal Processing Letters, 2019, 26 (8), pp.1257-1261. ⟨10.1109/LSP.2019.2926926⟩. ⟨hal-01946642⟩
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ref_biblio: Luis Briceño-Arias, Giovanni Chierchia, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet. A Random Block-Coordinate Douglas-Rachford Splitting Method with Low Computational Complexity for Binary Logistic Regression. Computational Optimization and Applications, 2019, 72 (3), pp.707-726. ⟨10.1007/s10589-019-00060-6⟩. ⟨hal-01672507⟩
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ref_biblio: Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet, Arthur Marmin. Rational optimization for nonlinear reconstruction with approximate ℓ0 penalization. IEEE Transactions on Signal Processing, 2019, 67 (6), pp.1407-1417. ⟨10.1109/TSP.2018.2890065⟩. ⟨hal-01852289v2⟩
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ref_biblio: Guillaume Chassagnon, Charlotte Martin, Wadie Ben Hassen, Gael Freche, Souhail Bennani, et al.. High-resolution lung MRI with Ultrashort-TE: 1.5 or 3 Tesla?. Magnetic Resonance Imaging, 2019, 61, pp.97 - 103. ⟨10.1016/j.mri.2019.04.015⟩. ⟨hal-03486106⟩
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ref_biblio: Guillaume Chassagnon, Charlotte Martin, Rafael Marini, Maria Vakalopoulou, Alexis Régent, et al.. Use of Elastic Registration in Pulmonary MRI for the Assessment of Pulmonary Fibrosis in Patients with Systemic Sclerosis. Radiology, 2019, 291 (2), pp.487-492. ⟨10.1148/radiol.2019182099⟩. ⟨hal-02422529⟩
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ref_biblio: Emilie Chouzenoux, Henri Gérard, Jean-Christophe Pesquet. General risk measures for robust machine learning. Foundations of Data Science, 2019, 1 (3), pp.249-269. ⟨10.3934/fods.2019011⟩. ⟨hal-02109418⟩
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ref_biblio: Emilie Chouzenoux, Tim Tsz-Kit Lau, Claire Lefort, Jean-Christophe Pesquet. Optimal Multivariate Gaussian Fitting with Applications to PSF Modeling in Two-Photon Microscopy Imaging. Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2019, 61 (7), pp.1037-1050. ⟨10.1007/s10851-019-00884-1⟩. ⟨hal-01985663⟩
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ref_biblio: Patrick L Combettes, Jean-Christophe Pesquet. Stochastic Quasi-Fejér Block-Coordinate Fixed Point Iterations With Random Sweeping II: Mean-Square and Linear Convergence. Mathematical Programming, 2019, 174 (1-2), pp.433-451. ⟨hal-01964582⟩
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ref_biblio: Marie-Caroline Corbineau, Denis Kouamé, Emilie Chouzenoux, Jean-Yves Tourneret, Jean-Christophe Pesquet. Preconditioned P-ULA for Joint Deconvolution-Segmentation of Ultrasound Images. IEEE Signal Processing Letters, 2019, 26 (10), pp.1456-1460. ⟨10.1109/LSP.2019.2935610⟩. ⟨hal-02474585⟩
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ref_biblio: Marie-Caroline Corbineau, Denis Kouamé, Emilie Chouzenoux, Jean-Yves Tourneret, Jean-Christophe Pesquet. Preconditioned P-ULA for Joint Deconvolution-Segmentation of Ultrasound Images - Extended Version. IEEE Signal Processing Letters, 2019, 26 (10), pp.1456--1460. ⟨hal-02073283v4⟩
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ref_biblio: Diane Genest, Élodie Puybareau, Marc Léonard, Jean Cousty, Noémie de Crozé, et al.. High throughput automated detection of axial malformations in Medaka fish embryo. Computers in Biology and Medicine, 2019, 105, pp.157-168. ⟨10.1016/j.compbiomed.2018.12.016⟩. ⟨hal-01959606v2⟩
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ref_biblio: Eloïse Grossiord, Benoît Naegel, Hugues Talbot, Laurent Najman, Nicolas Passat. Shape-based analysis on component-graphs for multivalued image processing. Mathematical Morphology - Theory and Applications, 2019, 3 (1), pp.45-70. ⟨10.1515/mathm-2019-0003⟩. ⟨hal-01695384v3⟩
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ref_biblio: Clara Jaquet, Laurent Najman, Hugues Talbot, Leo Grady, Michiel Schaap, et al.. Generation of patient-specific cardiac vascular networks: a hybrid image-based and synthetic geometric model. IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2019, 66 (4), pp.946-955. ⟨10.1109/TBME.2018.2865667⟩. ⟨hal-01869264⟩
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ref_biblio: Fragkiskos Malliaros, Christos Giatsidis, Apostolos N Papadopoulos, Michalis Vazirgiannis. The Core Decomposition of Networks: Theory, Algorithms and Applications. The VLDB Journal, 2019. ⟨hal-01986309v3⟩
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ref_biblio: Ahmed Mekki, Laurent Dercle, Philip Lichtenstein, Ghaida Nasser, Aurélien Marabelle, et al.. Machine learning defined diagnostic criteria for differentiating pituitary metastasis from autoimmune hypophysitis in patients undergoing immune checkpoint blockade therapy. European Journal of Cancer, 2019, 119, pp.44-56. ⟨10.1016/j.ejca.2019.06.020⟩. ⟨hal-02269518⟩
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ref_biblio: Odyssée Merveille, Benoît Naegel, Hugues Talbot, Nicolas Passat. nD variational restoration of curvilinear structures with prior-based directional regularization. IEEE Transactions on Image Processing, 2019, 28 (8), pp.3848-3859. ⟨10.1109/TIP.2019.2901706⟩. ⟨hal-01832636v2⟩
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ref_biblio: Valérie Monnin-Bares, Guillaume Chassagnon, Hélène Vernhet-Kovacsik, Hamid Zarqane, Juliette Vanoverschelde, et al.. Systemic air embolism depicted on systematic whole thoracic CT acquisition after percutaneous lung biopsy: Incidence and risk factors. European Journal of Radiology, 2019, 117, pp.26-32. ⟨10.1016/j.ejrad.2019.05.016⟩. ⟨hal-02302626⟩
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ref_biblio: Maria Papadomanolaki, Maria Vakalopoulou, Konstantinos Karantzalos. A Novel Object-Based Deep Learning Framework for Semantic Segmentation of Very High-Resolution Remote Sensing Data: Comparison with Convolutional and Fully Convolutional Networks. Remote Sensing, 2019, 11 (6), pp.684. ⟨10.3390/rs11060684⟩. ⟨hal-02078539⟩
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ref_biblio: Julie Robic, Benjamin Perret, Alex Nkengne, Michel Couprie, Hugues Talbot. Three-dimensional conditional random field for the dermal–epidermal junction segmentation. Journal of Medical Imaging, 2019, 6 (02), pp.1. ⟨10.1117/1.JMI.6.2.024003⟩. ⟨hal-02155490⟩
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ref_biblio: Maria Vakalopoulou, Guillaume Chassagnon, Nikos Paragios, Marie-Pierre Revel. Deep learning: definition and perspectives for thoracic imaging. European Radiology, 2019, 30, p. 2021-2030. ⟨10.1007/s00330-019-06564-3⟩. ⟨hal-02422513⟩
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Conference papers

ref_biblio: Daniel Antunes, Jacques-Olivier Lachaud, Hugues Talbot. Digital Curvature Evolution Model for Image Segmentation. DGCI 2019 - International Conference on Discrete Geometry for Computer Imagery, Mar 2019, Noisy-le-Grand, France. pp.15-26, ⟨10.1007/978-3-030-14085-4_2⟩. ⟨hal-02426946⟩
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ref_biblio: Enzo Battistella, Maria Vakalopoulou, Théo Estienne, Marvin Lerousseau, Roger Sun, et al.. Gene Expression High-Dimensional Clustering towards a Novel, Robust, Clinically Relevant and Highly Compact Cancer Signature. IWBBIO 2019 - 7th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, May 2019, Granada, Spain. ⟨hal-02076104⟩
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ref_biblio: Eugene Belilovsky, Michael Eickenberg, Edouard Oyallon. Greedy Layerwise Learning Can Scale to ImageNet. ICML 2019 - 36th International Conference on Machine Learning, Jun 2019, Long Beach, CA, United States. ⟨hal-02119398⟩
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ref_biblio: Adrien Benamira, Benjamin Devillers, Etienne Lesot, Ayush K. Ray, Manal Saadi, et al.. Semi-Supervised Learning and Graph Neural Networks for Fake News Detection. ASONAM 2019 - IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Networks Analysis and Mining, Aug 2019, Vancouver, Canada. ⟨hal-02334445⟩
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ref_biblio: Abdulkadir Çelikkanat, Fragkiskos Malliaros. Learning Node Embeddings with Exponential Family Distributions. NeurIPS 2019 - 33th Annual Conference on Neural Information Processing Systems - Workshop on Graph Representation Learning, Dec 2019, Vancouver, Canada. ⟨hal-02336000⟩
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ref_biblio: Abdulkadir Çelikkanat, Fragkiskos Malliaros. Kernel Node Embeddings. GlobalSIP 2019 - 7th IEEE Global Conference on Signal and Information Processing, Nov 2019, Ottawa, Canada. ⟨hal-02423629⟩
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ref_biblio: Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, Laurent Duval, Jean-Christophe Pesquet. Forme lissée de rapports de normes lp/lq (SPOQ) pour la reconstruction des signaux avec pénalisation parcimonieuse.. GRETSI 2019 - 27ème Colloque francophonede traitement du signal et des images, Aug 2019, Lille, France. ⟨hal-02179373⟩
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ref_biblio: Afef Cherni, Emilie Chouzenoux, Laurent Duval, Jean-Christophe Pesquet. A Novel Smoothed Norm Ratio for Sparse Signal Restoration Application to Mass Spectrometry.. SPARS 2019 - Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations, Jul 2019, Toulouse, France. ⟨hal-02179379⟩
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ref_biblio: Emilie Chouzenoux, Víctor Elvira. Adaptive importance sampling with scaled Langevin proposal adaptatioń. EUROCAST 2019 - 17th International Conference on Computer Aided Systems Theory, Feb 2019, Las Palmas de Gran Canaria, Spain. ⟨hal-02454644⟩
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ref_biblio: Marie-Caroline Corbineau, Carla Bertocchi, Emilie Chouzenoux, Marco Prato, Jean-Christophe Pesquet. Learned Image Deblurring by Unfolding a Proximal Interior Point Algorithm. ICIP 2019 - 26th IEEE International Conference on Image Processing, IEEE, Sep 2019, Taipei, Taiwan. ⟨10.1109/ICIP.2019.8803438⟩. ⟨hal-02303511⟩
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ref_biblio: Loubna El Gueddari, Philippe Ciuciu, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet. OSCAR-based reconstruction for compressed sensing and parallel MR imaging. ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting and Exhibition, May 2019, Montréal, Canada. ⟨hal-02314911⟩
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ref_biblio: Loubna El Gueddari, Philippe Ciuciu, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet. Online compressed sensing MR image reconstruction for high resolution T2* imaging. ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting and Exhibition, May 2019, Montréal, Canada. ⟨hal-02314904⟩
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ref_biblio: Loubna El Gueddari, Philippe Ciuciu, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet. Calibrationless oscar-based image reconstruction in compressed sensing parallel MRI. ISBI 2019 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. ⟨10.1109/isbi.2019.8759393⟩. ⟨hal-02101262⟩
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ref_biblio: Víctor Elvira, Emilie Chouzenoux. Langevin-based Strategy for Efficient Proposal Adaptation in Population Monte Carlo. ICASSP 2019 - 2019 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2019, Brighton, United Kingdom. ⟨10.1109/ICASSP.2019.8682284⟩. ⟨hal-02431677⟩
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ref_biblio: Théo Estienne, Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Enzo Battistella, Marvin Lerousseau, et al.. U-ReSNet: Ultimate Coupling of Registration and Segmentation with Deep Nets. MICCAI 2019: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2019, MICCAI, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.310-319, ⟨10.1007/978-3-030-32248-9_35⟩. ⟨hal-02365899v2⟩
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ref_biblio: Diane Genest, Marc Léonard, Jean Cousty, Noémie de Crozé, Hugues Talbot. Atlas-based automated detection of swim bladder in Medaka embryo. ISMM 2019 - International Symposium on Mathematical Morphology and Its Application to Signal and Image Processing, Bernhard Burgeth; Andreas Kleefeld; Benoit Naegel; Nicolas Passat; Benjamin Perret, Jul 2019, Saarbrücken, Germany. pp.496-507, ⟨10.1007/978-3-030-20867-7_38⟩. ⟨hal-02019658⟩
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ref_biblio: Loubna El Gueddari, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Jean-Christophe Pesquet, Philippe Ciuciu. Online MR image reconstruction for compressed sensing acquisition in T2* imaging. SPIE Conference - Wavelets and Sparsity XVIII, Aug 2019, San Diego, United States. ⟨hal-02265538⟩
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ref_biblio: Yunshi Huang, Emilie Chouzenoux, Víctor Elvira. Particle Filtering for Online Space-Varying Blur Identification. CAMSAP 2019 - IEEE International Workshop on Computational Advances in Multi-Sensor Adaptive Processing, Dec 2019, Le Gosier, France. ⟨hal-02406970⟩
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ref_biblio: Claire Lefort, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet. PLUMEE 2019 : Reconstruction numérique d'image en microscopie multiphotonique. PLUMEE 2019 - 6ème Colloque francophone PLUridisciplinaire sur les Matériaux, l’Environnement et l’Electronique, Apr 2019, Limoges, France. ⟨hal-02426765⟩
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ref_biblio: Arthur Marmin, Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet. Detecting the Rank of a Symmetric Tensor. EUSIPCO 2019 - 27th European Signal Processing Conference, Sep 2019, Coruña, Spain. pp.1-5. ⟨hal-02284991⟩
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ref_biblio: Arthur Marmin, Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet. Sparse signal reconstruction with a sign oracle. SPARS 2019 - Signal Processing with Adaptive Sparse Structured Representations - Workshop, Jul 2019, Toulouse, France. ⟨hal-02196881⟩
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ref_biblio: Arthur Marmin, Marc Castella, Jean-Christophe Pesquet. How to globally solve non-convex optimization problems involving an approximate ℓ 0 penalization. ICASSP 2019 : IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2019, Brighton, United Kingdom. pp.5601-5605, ⟨10.1109/ICASSP.2019.8683692⟩. ⟨hal-02196878⟩
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ref_biblio: Yosra Marnissi, Dany Abboud, Emilie Chouzenoux, Jean-Christophe Pesquet, Mohamed El-Badaoui, et al.. A Data Augmentation Approach for Sampling Gaussian Models in High Dimension. EUSIPCO 2019 - 27th European Signal Processing Conference, Sep 2019, La Corogne, Spain. ⟨10.23919/eusipco.2019.8902496⟩. ⟨hal-02314418⟩
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ref_biblio: Yosra Marnissi, Emilie Chouzenoux, Amel Benazza-Benyahia, Jean-Christophe Pesquet. MM Adapted MH Methods. BASP 2019 - International Biomedical and Astronomical Signal Processing Frontiers workshop, Feb 2019, Villars sur Ollon, Switzerland. ⟨hal-02314412⟩
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ref_biblio: Aanchal Mongia, Vidit Jain, Emilie Chouzenoux, Angshul Majumdar. Deep Latent Factor Model for Predicting Drug Target Interactions. ICASSP 2019 - IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing, May 2019, Brighton, United Kingdom. ⟨10.1109/icassp.2019.8683123⟩. ⟨hal-02406989⟩
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ref_biblio: Maria Papadomanolaki, Sagar Verma, Maria Vakalopoulou, Siddharth Gupta, Konstantinos Karantzalos. Detecting urban changes with recurrent neural networks from multitemporal Sentinel-2 data. IGARSS 2019 - IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, Japan. ⟨hal-02266094⟩
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ref_biblio: Maria Papadomanolaki, Konstantinos Karantzalos, Maria Vakalopoulou. A multi-task deep learning framework coupling semantic segmentation and image reconstruction for very high resolution imagery. IGARSS 2019 - IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, Japan. ⟨10.1109/igarss.2019.8898133⟩. ⟨hal-02266085⟩
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ref_biblio: Élodie Puybareau, Edwin Carlinet, Alessandro Benfenati, Hugues Talbot. Spherical Fluorescent Particle Segmentation and Tracking in 3D Confocal Microscopy. ISMM 2019 - 14th International Symposium on Mathematical Morphology, Bernhard Burgeth; Andreas Kleefeld; Benoît Naegel; Nicolas Passat; Benjamin Perret, Jul 2019, Saarbrücken, Germany. pp.520-531, ⟨10.1007/978-3-030-20867-7_40⟩. ⟨hal-02426948⟩
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ref_biblio: Harmen Reyngoudt, Benjamin Marty, Jean-Marc Boisserie, Julien Le Louër, Cedi Koumako, et al.. Can global muscle segmentation detect changes in neuromuscular disorders using quantitative nuclear magnetic resonance imaging?. Imaging in Neuromuscular Disease 2019: Second International Conference on Imaging in Neuromuscular Disease, Nov 2019, Berlin, Germany. pp.S1-S62, ⟨10.3233/JND-199002⟩. ⟨hal-03831354⟩
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ref_biblio: Julie Robic, Benjamin Perret, Alex Nkengne, Michel Couprie, Hugues Talbot. Self-dual pattern spectra for characterising the dermal-epidermal junction in 3D reflectance confocal microscopy imaging. ISMM 2019 - International Symposium on Mathematical Morphology and Its Applications to Signal and Image Processing, Jul 2019, Saarbrücken, Germany. pp.508-519, ⟨10.1007/978-3-030-20867-7_39⟩. ⟨hal-02169702⟩
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ref_biblio: Mihir Sahasrabudhe, Zhixin Shu, Edward Bartrum, Riza Alp Güler, Dimitris Samaras, et al.. Lifting AutoEncoders: Unsupervised Learning of a Fully-Disentangled 3D Morphable Model Using Deep Non-Rigid Structure From Motion. ICCV 2019 - IEEE International Conference on Computer Vision - Workshops, Oct 2019, Seoul, South Korea. ⟨hal-02422596⟩
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ref_biblio: Maissa Sghaier, Emilie Chouzenoux, Giovanni Palma, Jean-Christophe Pesquet, Serge Muller. A New Approach for Microcalcification Enhancement in Digital Breast Tomosynthesis Reconstruction. ISBI 2019 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. ⟨10.1109/ISBI.2019.8759534⟩. ⟨hal-02314420⟩
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ref_biblio: Matthieu Terris, Emilie Chouzenoux. Stochastic MM Subspace Algorithms. BASP 2019 - International Biomedical and Astronomical Signal Processing Frontiers workshop, Feb 2019, Villars sur Ollon, Switzerland. ⟨hal-02314411⟩
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ref_biblio: Antoine Jean-Pierre Tixier, Maria Evgenia G. Rossi, Fragkiskos Malliaros, Jesse Read, Michalis Vazirgiannis. Perturb and Combine to Identify Influential Spreaders in Real-World Networks. ASONAM 2019 - IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Networks Analysis and Mining, Aug 2019, Vancouver, Canada. ⟨hal-01958973⟩
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ref_biblio: Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Mihir Sahasrabudhe, Stavroula Mougiakakou, Nikos Paragios. Image Registration of Satellite Imagery with Deep Convolutional Neural Networks. IGARSS 2019 - 2019 IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium, Jul 2019, Yokohama, France. pp.4939-4942, ⟨10.1109/IGARSS.2019.8898220⟩. ⟨hal-02422555⟩
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ref_biblio: Sagar Verma, Richa Verma, P.B. B Sujit. MAPEL: Multi-Agent Pursuer-Evader Learning using Situation Report. IJCNN 2019 - International Joint Conference on Neural Networks, Jul 2019, Budapest, France. pp.1-8, ⟨10.1109/IJCNN.2019.8852457⟩. ⟨hal-02426661⟩
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Book sections

ref_biblio: Hariprasad Kannan, Nikos Komodakis, Nikos Paragios. Tighter continuous relaxations for MAP inference in discrete MRFs: A survey. Handbook of Numerical Analysis: Processing, Analyzing and Learning of Images, Shapes, and Forms: Part 2, Volume 20, pages 351 - 400, Elsevier, https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1570865919300092, Elsevier, 2019, ⟨10.1016/bs.hna.2019.06.001⟩. ⟨hal-02432873⟩
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Theses

ref_biblio: Guillaume Chassagnon. AI-driven Detection, Characterization and Classification of Chronic Lung Diseases. Signal and Image processing. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. English. ⟨NNT : 2019SACLC101⟩. ⟨tel-02885754⟩
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ref_biblio: Marie-Caroline Corbineau. Proximal and interior point optimization strategies in image recovery. Signal and Image processing. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. English. ⟨NNT : 2019SACLC085⟩. ⟨tel-02428404v3⟩
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ref_biblio: Riza Alp Guler. Learning Image-to-Surface Correspondence. Signal and Image processing. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. English. ⟨NNT : 2019SACLC024⟩. ⟨tel-02094354⟩
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ref_biblio: Ð.Khuê Lê-Huu. Nonconvex Alternating Direction Optimization for Graphs: Inference and Learning. Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV]. CentraleSupélec, Université Paris-Saclay, 2019. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-02093465⟩
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ref_biblio: Ð.Khuê Lê-Huu. Nonconvex Alternating Direction Optimization for Graphs : Inference and Learning. Signal and Image processing. Université Paris Saclay (COmUE), 2019. English. ⟨NNT : 2019SACLC005⟩. ⟨tel-02087490⟩
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Preprints, Working Papers, ...

ref_biblio: Loubna El Gueddari, Emilie Chouzenoux, Alexandre Vignaud, Philippe Ciuciu. Calibration-less parallel imaging compressed sensing reconstruction based on OSCAR regularization. 2019. ⟨hal-02292372⟩
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ref_biblio: Baptiste Kas, Hugues Talbot, Roberto Ferrara, C Richard, Benjamin Besse, et al.. Hyperprogressive disease during immunotherapy: an attempt to clarify different definitions. 2019. ⟨hal-02429762⟩
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