Publications HAL de la structure commedia

2024

Journal articles

titre
Low-order fictitious domain method with enhanced mass conservation for an interface Stokes problem
auteur
Daniele Corti, Guillaume Delay, Miguel Angel Fernández, Fabien Vergnet, Marina Vidrascu
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2024, 58 (1), pp.303-333. ⟨10.1051/m2an/2023103⟩
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https://inria.hal.science/hal-04084162/file/paper.pdf BibTex
titre
A low-rank solver for parameter estimation and uncertainty quantification in linear time dependent systems of Partial Differential Equations
auteur
Sébastien Riffaud, Miguel Angel Fernández, Damiano Lombardi
article
Journal of Scientific Computing, In press
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03908682/file/main.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Estimates of discrete time derivatives for the parabolic-parabolic Robin-Robin coupling method
auteur
Erik Burman, Rebecca Durst, Miguel Angel Fernández, Johnny Guzmán, Sijing Liu
article
2024
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04530917/file/Parabolic_parabolicdifference-6.pdf BibTex
titre
A second-order correction method for loosely coupled discretizations applied to parabolic-parabolic interface problems
auteur
Erik Burman, Rebecca Durst, Miguel Angel Fernández, Johnny Guzmán, Sijing Liu
article
2024
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04530926/file/DefectCorrectionParabolicInterface-5.pdf BibTex
titre
A non-linear manifold reduction based on ridge regression
auteur
Damiano Lombardi
article
2024
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04428826/file/P3H_R.pdf BibTex
titre
Preconditioners for multilinear problems arising in parametric Partial Differential Equations
auteur
Damiano Lombardi, Sébastien Riffaud
article
2024
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04428792/file/Preconditioners%20%281%29.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
A continuum active structure model for the interaction of cilia with a viscous fluid
auteur
Astrid Decoene, Sébastien Martin, Fabien Vergnet
article
Journal of Applied Mathematics and Mechanics / Zeitschrift für Angewandte Mathematik und Mechanik, 2023, ⟨10.1002/zamm.202100534⟩
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https://hal.science/hal-02493513/file/DMV_preprint.pdf BibTex
titre
Tracking of blood vessels motion from 4D-flow MRI data
auteur
Mocia Agbalessi, Alain Lalande, Olivier Bouchot, Toshiyuki Hayase, Jean-Joseph Christophe, Miguel Angel Fernández, Damiano Lombardi
article
Cardiovascular Engineering and Technology, 2023, 14, pp.577-604. ⟨10.1007/s13239-023-00677-z⟩
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https://inria.hal.science/hal-03349442/file/paper_pub.pdf BibTex
titre
Propagation of an idealized infection in an airway tree, consequences of the inflammation on the oxygen transfer to blood
auteur
Frédérique Noël, Benjamin Mauroy
article
Journal of Theoretical Biology, 2023, ⟨10.1016/j.jtbi.2023.111405⟩
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https://hal.science/hal-03669474/file/main.pdf BibTex
titre
Numerical analysis of an incompressible soft material poromechanics model using T-coercivity
auteur
Mathieu Barré, Céline Grandmont, Philippe Moireau
article
Comptes Rendus. Mécanique, 2023, 351 (S1), pp.1-36. ⟨10.5802/crmeca.194⟩
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https://hal.science/hal-04098153/file/monolithic.pdf BibTex
titre
Loosely coupled, non-iterative time-splitting scheme based on Robin-Robin coupling: Unified analysis for Parabolic/Parabolic and Parabolic/Hyperbolic problems
auteur
Erik Burman, Rebecca Durst, Miguel Angel Fernández, Johnny Guzmán
article
Journal of Numerical Mathematics, 2023, 31 (1), pp.59-77. ⟨10.1515/jnma-2021-0119⟩
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https://hal.science/hal-03381765/file/paper.pdf BibTex
titre
Splitting schemes for a Lagrange multiplier formulation of FSI with immersed thin-walled structure: stability and convergence analysis
auteur
Michele Annese, Miguel Angel Fernández, Lucia Gastaldi
article
IMA Journal of Numerical Analysis, 2023, 43 (2), pp.881-919. ⟨10.1093/imanum/drac004⟩
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https://hal.science/hal-02893508/file/paper_final.pdf BibTex
titre
Convergence analysis of an unfitted mesh semi-implicit coupling scheme for incompressible fluid-structure interaction
auteur
Erik Burman, Miguel Angel Fernández, Fannie Gerosa
article
Vietnam Journal of Mathematics, 2023, 51, pp.37-69. ⟨10.1007/s10013-022-00589-w⟩
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https://inria.hal.science/hal-03065803/file/convergence.pdf BibTex
titre
A coupled model for the dynamics of gas exchanges in the human lung with Haldane and Bohr's effects
auteur
Laurent Boudin, Céline Grandmont, Bérénice Grec, Sébastien Martin
article
Journal of Theoretical Biology, In press, pp.111590. ⟨10.1016/j.jtbi.2023.111590⟩
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https://hal.science/hal-03883301/file/BoudinGrandmontGrecMartin_v2.pdf BibTex

Conference papers

titre
An optimal recovery formulation of data assimilation in haemodynamics
auteur
Damiano Lombardi, Olga Mula, Felipe Galarce Marin
article
Data Assimilation, LJLL, Sorbonne Université, Nov 2023, Paris, France
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BibTex
titre
Parametric PDE solvers for parameter estimation and Uncertainty Quantification
auteur
Damiano Lombardi, Sébastien Riffaud, Miguel Angel Fernández
article
ENUMATH 2023 - European Conference on Numerical Mathematics and Advanced Applications, Istituto Tecnico Lisboa, Sep 2023, Lisboa, Portugal
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BibTex
titre
A continuum active structure model for the interaction of cilia with a viscous fluid
auteur
Astrid Decoene, Sébastien Martin, Fabien Vergnet
article
Enumath 2023 - European Conference on Numerical Mathematics and Advanced Applications, Sep 2023, Lisbon, Portugal
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https://hal.science/hal-04396601/file/enumath_2023_book_of_abstracts.pdf BibTex
titre
Data assimilation problems in haemodynamics
auteur
Damiano Lombardi
article
BioPhysMed23 - Workshop on Biophysics-based modeling and data assimilation in medical imaging, WIAS, Berlin, Aug 2023, Berlin, Germany
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BibTex
titre
Parametric FSI solvers for haemodynamics
auteur
Damiano Lombardi, Sébastien Riffaud, Miguel Angel Fernández
article
ICIAM 2023 - 10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics, Waseda University, Tokyo, Aug 2023, Tokyo, Japan
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BibTex
titre
Lipschitz Stabilised Autoencoders in Parameter Identification of Dynamical Systems
auteur
Haibo Liu, Damiano Lombardi, Muriel Boulakia
article
10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2023), Aug 2023, Tokyo, Japan
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BibTex
titre
SoTT: a greedy construction of a sum of Tensor Trains
auteur
Damiano Lombardi, Virginie Ehrlacher, Maria Fuente-Ruiz
article
ICOSAHOM 2023 - International Conference on Spectral and High Order Methods, Yonsei University, Seoul, Aug 2023, Seoul, South Korea
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BibTex
titre
Solving parametric PDEs via parsimonious discretizations: application to Uncertainty Quantification and Data Assimilation
auteur
Sébastien Riffaud, Damiano Lombardi, Miguel A Fernández
article
5th International Conference on Uncertainty Quantification in Computational Science and Engineering - UNCECOMP 2023, Jun 2023, Athens, Greece
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BibTex
titre
Parametric PDEs solvers, uncertainty quantification and parameter estimation
auteur
Sébastien Riffaud, Damiano Lombardi, Miguel A Fernández
article
First International Conference Math 2 Product - M2P 2023, May 2023, Taormina, Italy
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BibTex
titre
Lipschitz Stabilised Autoencoders to Study the Intrinsic Dimensionality of Dynamical Systems and Build Data-driven Models
auteur
Haibo Liu, Damiano Lombardi, Muriel Boulakia
article
Math 2 Product (M2P): Emerging Technologies in Computational Science for Industry, Sustainability and Innovation, May 2023, Taormina, Italy
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BibTex
titre
Fluid-structure interaction calibration from 4D-flow MRI data
auteur
Muriel Boulakia, Miguel Angel Fernández, Damiano Lombardi, Mihai Nechita, Mocia Agbalessi
article
CFC 2023 - IACM Computational Fluids Conference, Apr 2023, Cannes, France
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BibTex
titre
Parametric solvers for simulation of blood flows
auteur
Miguel Angel Fernández, Damiano Lombardi, Sébastien Riffaud
article
CFC 2023 - IACM Computational Fluids Conference, Apr 2023, Cannes, France
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https://inria.hal.science/hal-04010559/file/CFC_Abract.pdf BibTex

Poster communications

titre
An in silico approach to monitor and predict haemodynamics during safety pharmacology studies
auteur
Sara Costa Faya, Marloes Coolen, Callan Wesley, Marina Vidrascu, Pieter-Jan Guns, Miguel Angel Fernández, Damiano Lombardi
article
SPS Annual Meeting, Sep 2023, Brussels, Belgium
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https://hal.science/hal-04394917/file/Poster_SPS.pdf BibTex

Reports

titre
Bilan de la mandature 2019-2023 de la Commission d'Évaluation Inria
auteur
Anne Canteaut, Manuel Serrano, Céline Grandmont, Guillaume Pallez, Vincent Perrier, Xavier Rival, Emmanuel Thomé
article
Inria. 2023
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https://inria.hal.science/hal-04193082/file/CE_bilan-ce.pdf BibTex

Theses

titre
State estimation in fluid-structure interaction from 4D-flow MRI data
auteur
Mocia Agbalessi
article
Numerical Analysis [math.NA]. Sorbonne Université, 2023. English. ⟨NNT : 2023SORUS131⟩
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https://inria.hal.science/tel-04072648/file/AGBALESSI_Mocia_these_2023.pdf BibTex
titre
Adaptive tensor methods for high dimensional problems
auteur
María Fuente Ruiz
article
Modeling and Simulation. Sorbonne Université, 2023. English. ⟨NNT : 2023SORUS060⟩
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https://theses.hal.science/tel-04082601/file/FUENTE_RUIZ_Maria_these_2023.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Accurate and robust predictions for model order reduction via an adaptive, hybrid FOM/ROM approach
auteur
Sébastien Riffaud
article
2023
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https://inria.hal.science/hal-04361506/file/main.pdf BibTex
titre
A mixed-dimensional formulation for the simulation of slender structures immersed in an incompressible flow
auteur
Fabien Lespagnol, Céline Grandmont, Paolo Zunino, Miguel Angel Fernández
article
2023
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https://inria.hal.science/hal-04318526/file/FSI__Navier_Stokes___3D1D-18.pdf BibTex
titre
Parameter identification through gradient flow on latent variables
auteur
Muriel Boulakia, Haibo Liu, Damiano Lombardi
article
2023
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https://inria.hal.science/hal-04364114/file/BoulkiaLiuLombardi_parameterEstimation.pdf BibTex
titre
Robin-Robin loose coupling for incompressible fluid-structure interaction: non-linear setting and nearly-optimal error analysis
auteur
Erik Burman, Rebecca Durst, Miguel Angel Fernández, Johnny Guzmán, Oscar Ruz
article
2023
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04258861/file/paper.pdf BibTex
titre
On the analysis of a mechanically consistent model of fluid-structure-contact interaction
auteur
Marguerite Champion, Miguel Angel Fernández, Céline Grandmont, Fabien Vergnet, Marina Vidrascu
article
2023
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https://hal.science/hal-04229012/file/paper_m3as.pdf BibTex
titre
Numerical approximation of the Poisson problem with small holes, using augmented finite elements and defective boundary conditions.
auteur
Muriel Boulakia, Céline Grandmont, Fabien Lespagnol, Paolo Zunino
article
2023
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https://inria.hal.science/hal-03501521/file/Poisson_VERSION_FINALE.pdf BibTex

2022

Journal articles

titre
Artificial Neural Network Comparison on hERG Channel Blockade Detection
auteur
Haibo Liu, Tessa de Korte, Sylvain Bernasconi, Christophe Bleunven, Damiano Lombardi, Muriel Boulakia
article
International Journal of Computer Applications, 2022
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03934224/file/liu-2022-ijca-922119.pdf BibTex
titre
SoTT: greedy approximation of a tensor as a sum of Tensor Trains
auteur
Virginie Ehrlacher, Maria Fuente-Ruiz, Damiano Lombardi
article
SIAM Journal on Scientific Computing, 2022, 44 (2), ⟨10.1137/20M1381472⟩
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https://inria.hal.science/hal-03018646/file/CPTT_siamFormat.pdf BibTex
titre
Analysis of a linearized poromechanics model for incompressible and nearly incompressible materials
auteur
Mathieu Barré, Céline Grandmont, Philippe Moireau
article
Evolution Equations and Control Theory, In press, 12 (3), ⟨10.3934/eect.2022053⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03501526/file/article-poro_HAL-v2.pdf BibTex
titre
Fully discrete loosely coupled Robin-Robin scheme for incompressible fluid-structure interaction: stability and error analysis
auteur
Erik Burman, Rebecca Durst, Miguel Angel Fernández, Johnny Guzmán
article
Numerische Mathematik, 2022, 151, pp.807-840. ⟨10.1007/s00211-022-01295-y⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02893444/file/paper.pdf BibTex
titre
A mechanically consistent model for fluid-structure interactions with contact including seepage
auteur
Stefan Frei, Fannie Gerosa, Erik Burman, Miguel Angel Fernández
article
Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, 2022, 392, pp.114637. ⟨10.1016/j.cma.2022.114637⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03174087/file/BurmanFernandezFreiGerosa.pdf BibTex
titre
Modelling the fluid-structure interactions of a capsule using a nonlinear thin shell model: effect of wall thickness
auteur
Claire Dupont, Marina Vidrascu, Patrick Le Tallec, Dominique Barthès-Biesel, Anne-Virginie Salsac
article
Journal of Fluids and Structures, 2022, 113 (103658), ⟨10.1016/j.jfluidstructs.2022.103658⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.utc.fr/hal-03409766/file/DupontEtAl_SMBmodelForMicrocaps_JFS21.pdf BibTex
titre
State estimation in nonlinear parametric time dependent systems using Tensor Train
auteur
Damiano Lombardi
article
International Journal for Numerical Methods in Engineering, 2022, ⟨10.1002/nme.7067⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03375811/file/art_TTState_final.pdf BibTex

Conference papers

titre
A low-rank tensor method for parameterized linear fluid-structure interaction problems
auteur
Sébastien Riffaud, Miguel Angel Fernández, Damiano Lombardi
article
CMBE 2022 - 7th International Conference on Computational and Mathematical Biomedical Engineering, Jun 2022, Milan, Italy
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-04010551/file/CMBE21TemplateAbstract.pdf BibTex

Book sections

titre
Reduced order modelling for direct and inverse problems in haemodynamics
auteur
Damiano Lombardi
article
ROMs for the Biomechanics of Living Organs, In press
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03783921/file/ChapterLombardi_review.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
3D Nitsche-XFEM method for fluid-structure interaction with immersed thin-walled solids
auteur
Fannie Maria Gerosa, Daniele Corti, Frédéric Alauzet, Miguel Angel Fernández
article
2022
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03916638/file/paper.pdf BibTex
titre
Wasserstein model reduction approach for parametrized flow problems in porous media
auteur
Beatrice Battisti, Tobias Blickhan, Guillaume Enchery, Virginie Ehrlacher, Damiano Lombardi, Olga Mula
article
2022
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03664061/file/MORPOR.pdf BibTex
titre
Deep learning-based schemes for singularly perturbed convection-diffusion problems
auteur
Adrien Beguinet, Virginie Ehrlacher, Roberta Flenghi, Maria Fuente-Ruiz, Olga Mula, Agustin Somacal
article
2022
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03664049/file/Article_CEMRACS.pdf BibTex
titre
Comparison of statistical, machine learning, and mathematical modelling methods to investigate the effect of ageing on dog's cardiovascular system
auteur
Elham Ataei Alizadeh, Sara Costa Faya, Haibo Liu, Damiano Lombardi, Sylvain Bernasconi, Pieter-Jan Guns, Michael Markert
article
2022
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03933957/file/CEMRACS_Proceeding_Corrections.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Existence of solutions and continuous and semi-discrete stability estimates for 3D/0D coupled systems modelling airflows and blood flows
auteur
Céline Grandmont, Sébastien Martin
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2021, 55 (5), pp.2365-2419. ⟨10.1051/m2an/2021055⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03393268/file/m2an210004.pdf BibTex
titre
A method to enrich experimental datasets by means of numerical simulations in view of classification tasks
auteur
Damiano Lombardi, Fabien Raphel
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2021, 55 (5), pp.2259-2291. ⟨10.1051/m2an/2021060⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03377036/file/m2an210056.pdf BibTex
titre
Existence and uniqueness for a quasi-static interaction problem between a viscous fluid and an active structure
auteur
Céline Grandmont, Fabien Vergnet
article
Journal of Mathematical Fluid Mechanics, 2021, 23 (45), ⟨10.1007/s00021-020-00552-0⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02493384/file/Grandmont_Vergnet_2019.pdf BibTex
titre
On an existence theory for a fluid-beam problem encompassing possible contacts
auteur
Jean-Jérôme Casanova, Céline Grandmont, Matthieu Hillairet
article
Journal de l'École polytechnique — Mathématiques, 2021, 8, pp.933-971. ⟨10.5802/jep.162⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02396915/file/CGH.pdf BibTex
titre
Fast reconstruction of 3D blood flows from Doppler ultrasound images and reduced models
auteur
Felipe Galarce, Jean-Frédéric Gerbeau, Damiano Lombardi, Olga Mula
article
Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, 2021, ⟨10.1016/j.cma.2020.113559⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02403686/file/S0045782520307441.pdf BibTex
titre
An unfitted mesh semi-implicit coupling scheme for fluid-structure interaction with immersed solids
auteur
Miguel Angel Fernández, Fannie Gerosa
article
International Journal for Numerical Methods in Engineering, 2021, 122, pp.5384-5408. ⟨10.1002/nme.6449⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02288723/file/paper.pdf BibTex
titre
An information-theoretic framework for optimal design: analysis of protocols for estimating soft tissue parameters in biaxial experiments
auteur
Ankush Aggarwal, Damiano Lombardi, Sanjay Pant
article
Axioms, 2021
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03187110/file/Aggarwal_et_al_Axioms.pdf BibTex
titre
Numerical reconstruction based on Carleman estimates of a source term in a reaction-diffusion equation.
auteur
Muriel Boulakia, Maya de Buhan, Erica Schwindt
article
ESAIM: Control, Optimisation and Calculus of Variations, 2021, 27, pp.34. ⟨10.1051/cocv/2020086⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02185889/file/Boulakia-deBuhan-Schwindt.pdf BibTex
titre
Adaptive hierarchical subtensor partitioning for tensor compression
auteur
Virginie Ehrlacher, Laura Grigori, Damiano Lombardi, Hao Song
article
SIAM Journal on Scientific Computing, 2021, ⟨10.1137/19M128689X⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02284456/file/preprint.pdf BibTex

Conference papers

titre
Wasserstein model reduction approach for parametrized flow problems in porous media
auteur
Beatrice Battisti, Tobias Blickhan, Guillaume Enchery, Virginie Ehrlacher, Damiano Lombardi, Olga Mula
article
CEMRACS 2021 - Data Assimilation and Reduced Modeling for High Dimensional Problems, Jul 2021, Luminy, France. pp.28-47, ⟨10.1051/proc/202373028⟩
Accès au bibtex
BibTex

Reports

titre
Software Evaluation
auteur
Anne Canteaut, Miguel Angel Fernández, Luc Maranget, Sophie Perin, Mario Ricchiuto, Manuel Serrano, Emmanuel Thomé
article
[Research Report] Inria. 2021
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03110728/file/CE_gt-logiciel-en.pdf BibTex
titre
Évaluation des Logiciels
auteur
Anne Canteaut, Miguel Angel Fernández, Luc Maranget, Sophie Perin, Mario Ricchiuto, Manuel Serrano, Emmanuel Thomé
article
[Rapport de recherche] Inria. 2021
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03110723/file/CE_gt-logiciel.pdf BibTex

Theses

titre
Immersed boundary methods for fluid-structure interaction with topological changes
auteur
Fannie Maria Gerosa
article
Numerical Analysis [cs.NA]. Sorbonne Université, 2021. English. ⟨NNT : 2021SORUS565⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://theses.hal.science/tel-03240631/file/GEROSA_Fannie_these_2021.pdf BibTex
titre
Inverse problems in haemodynamics. Fast estimation of blood flows from medical data
auteur
Felipe Galarce Marin
article
Bioengineering. Sorbonne Université, 2021. English. ⟨NNT : 2021SORUS392⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://theses.hal.science/tel-03663790/file/GALARCE_MARIN_Felipe_2021.pdf BibTex
titre
Inverse problems in hemodynamics. Fast estimation of blood flows from medical data
auteur
Felipe Galarce Marin
article
Numerical Analysis [math.NA]. Inria Paris; Sorbonne Universite; Laboratoire Jacques-Louis Lions, 2021. English. ⟨NNT : ⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/tel-03221563/file/galarce.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
An extended Krylov-like method for the solution of multi-linear systems
auteur
Hussam Al Daas, Damiano Lombardi
article
2021
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03374966/file/AD_paper.pdf BibTex
titre
State Estimation with Model Reduction and Shape Variability. Application to biomedical problems
auteur
Felipe Galarce, Damiano Lombardi, Olga Mula
article
2021
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/2106.09421 BibTex

2020

Journal articles

titre
Epidemiological Forecasting with Model Reduction of Compartmental Models. Application to the COVID-19 Pandemic
auteur
Athmane Bakhta, Thomas Boiveau, Yvon Maday, Olga Mula
article
Biology, 2020, 10 (1), pp.22. ⟨10.3390/biology10010022⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03117258/file/biology-10-00022-v2.pdf BibTex
titre
A greedy classifier optimization strategy to assess ion channel blocking activity and pro-arrhythmia in hiPSC-cardiomyocytes
auteur
Fabien Raphel, Tessa de Korte, Damiano Lombardi, Stefan Braam, Jean-Frederic Gerbeau
article
PLoS Computational Biology, 2020, 16 (9), pp.e1008203. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008203⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03220162/file/pcbi.1008203.pdf BibTex
titre
Optimal reduced model algorithms for data-based state estimation
auteur
Albert Cohen, Wolfgang Dahmen, Ron Devore, Jalal Fadili, Olga Mula, James Nichols
article
SIAM Journal on Numerical Analysis, 2020, ⟨10.1137/19M1255185⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1903.07938 BibTex
titre
Data assimilation finite element method for the linearized Navier-Stokes equations in the low Reynolds regime
auteur
Muriel Boulakia, Erik Burman, Miguel Angel Fernández, Colette Voisembert
article
Inverse Problems, 2020, 36, pp.085003. ⟨10.1088/1361-6420/ab9161⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02318504/file/paper.pdf BibTex
titre
An Adaptive Parareal Algorithm
auteur
Yvon Maday, Olga Mula
article
Journal of Computational and Applied Mathematics, 2020, ⟨10.1016/j.cam.2020.112915⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01781257/file/Maday-Mula-2019.pdf BibTex
titre
Characterization of Spatio-Temporal Cardiac Action Potential Variability at Baseline and under beta-Adrenergic Stimulation by Combined Unscented Kalman Filter and Double Greedy Dimension Reduction
auteur
David Sampedro-Puente, Fabien Raphel, Jesus Fernandez-Bes, Pablo Laguna, Damiano Lombardi, Esther Pueyo
article
IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, In press, ⟨10.1109/JBHI.2020.2984647⟩
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https://inria.hal.science/hal-02532554/file/ieee_unscentedKalman.pdf BibTex
titre
Splitting schemes and unfitted mesh methods for the coupling of an incompressible fluid with a thin-walled structure
auteur
Miguel Angel Fernández, Mikel Landajuela
article
IMA Journal of Numerical Analysis, 2020, 40 (2), pp.1407-1453. ⟨10.1093/imanum/dry098⟩
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https://inria.hal.science/hal-01309462/file/paper.pdf BibTex
titre
Reducing Hypermuscularization of the Transitional Segment between Arterioles and Capillaries Protects Against Spontaneous Intracerebral Hemorrhage
auteur
Julien Ratelade, Nicholas Klug, Damiano Lombardi, Monara Kaelle Servulo Cruz Angelim, Fabrice Dabertrand, Valérie Domenga-Denier, Rustam Al-Shahi Salman, Colin Smith, Jean-Frédéric Gerbeau, Mark Nelson, Anne Joutel
article
Circulation, 2020, 141 (25), pp.2078-2094. ⟨10.1161/CIRCULATIONAHA.119.040963⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-02511921/file/RATELADE-circulation-R3clean.pdf BibTex
titre
Augmented Resistive Immersed Surfaces valve model for the simulation of cardiac hemodynamics with isovolumetric phases
auteur
Alexandre This, Ludovic Boilevin-Kayl, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2020, 36 (3), pp.e3223. ⟨10.1002/cnm.3223⟩
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https://inria.hal.science/hal-01944798/file/aris_paper.pdf BibTex
titre
An Adaptive Nested Source Term Iteration for Radiative Transfer Equations
auteur
Wolfgang Dahmen, Felix Gruber, Olga Mula
article
Mathematics of Computation, 2020, ⟨10.1090/mcom/3505⟩
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https://arxiv.org/pdf/1810.07035 BibTex
titre
A pipeline for image based intracardiac CFD modeling and application to the evaluation of the PISA method
auteur
Alexandre This, Hernan G Morales, Odile Bonnefous, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau
article
Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, 2020, 358, pp.112627. ⟨10.1016/j.cma.2019.112627⟩
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https://hal.science/hal-02142416/file/manuscript.pdf BibTex
titre
Approximation of Optimal Transport problems with marginal moments constraints
auteur
Aurélien Alfonsi, Rafaël Coyaud, Virginie Ehrlacher, Damiano Lombardi
article
Mathematics of Computation, 2020, ⟨10.1090/mcom/3568⟩
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https://hal.science/hal-02128374/file/MCOT.pdf BibTex
titre
Fast semi-automatic segmentation based on reduced basis
auteur
Damiano Lombardi, Yvon Maday, Lydie Uro
article
Comptes Rendus. Mathématique, 2020, ⟨10.5802/crmath.89⟩
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https://inria.hal.science/hal-03013545/file/CRAS-220520.pdf BibTex
titre
Nonlinear model reduction on metric spaces. Application to one-dimensional conservative PDEs in Wasserstein spaces
auteur
Virginie Ehrlacher, Damiano Lombardi, Olga Mula, François-Xavier Vialard
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, 2020, 54 (6), pp.2159-2197. ⟨10.1051/m2an/2020013⟩
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https://arxiv.org/pdf/1909.06626 BibTex
titre
Fluid-kinetic modelling for respiratory aerosols with variable size and temperature
auteur
Laurent Boudin, Céline Grandmont, Bérénice Grec, Sébastien Martin, Amina Mecherbet, Frédérique Noël
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, 2020, 67, pp.100-119. ⟨10.1051/proc/202067007⟩
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https://hal.science/hal-02092574/file/aerosol_cemracs18.pdf BibTex
titre
Reconstructing Haemodynamics Quantities of Interest from Doppler Ultrasound Imaging
auteur
Felipe Galarce, Damiano Lombardi, Olga Mula
article
International Journal for Numerical Methods in Biomedical Engineering, 2020, ⟨10.1002/cnm.3416⟩
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https://arxiv.org/pdf/2006.04174 BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Contributions to scientific computing for data-simulation interaction in biomedical applications
auteur
Damiano Lombardi
article
Modeling and Simulation. Sorbonne Université, 2020
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https://inria.hal.science/tel-03114756/file/manuscript.pdf BibTex

Special issue

titre
CEMRACS 2018: Numerical and mathematical modeling for biologicaland medical applications: deterministic, probabilisticand statistical description
auteur
Vincent Calvez, Céline Grandmont, Eva Lochërbach, Clair Poignard, Magali Ribot, Nicolas Vauchelet
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, 67, pp.336, 2020, ⟨10.1051/proc/202067000⟩
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Reports

titre
Initiative face au virus. Regards croisés sur l'épidemie de Covid-19 apportés par les données sanitaires et de géolocalisation (mars à octobre 2020)
auteur
Jamal Atif, Bertrand Cabot, Olivier Cappé, Olga Mula, Rafael Pinot
article
[Rapport de recherche] Université PSL; Inria; CNRS. 2020
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https://hal.science/hal-03084832/file/FACE-AU-VIRUS-2.pdf BibTex
titre
Indicateurs de suivi de l'activité scientifique de l'Inria
auteur
Luce Brotcorne, Anne Canteaut, Aline Carneiro Viana, Céline Grandmont, Benjamin Guedj, Stéphane Huot, Valérie Issarny, Guillaume Pallez, Valérie Perrier, Vivien Quema, Jean-Baptiste Pomet, Xavier Rival, Sylvain Salvati, Emmanuel Thomé
article
[Rapport de recherche] Inria. 2020
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-03033764/file/CE_GT-Suivi.pdf BibTex
titre
Initiative face au virus Observations sur la mobilité pendant l'épidémie de Covid-19
auteur
Jamal Atif, Olivier Cappé, Akin Kazakçi, Yannick Léo, Laurent Massoulié, Olga Mula
article
[0] Université PSL. 2020
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https://hal.science/hal-02921194/file/Rapport_num1_FaceAuVirus_25052020.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Nonlinear reduced models for state and parameter estimation
auteur
Albert Cohen, Wolfgang Dahmen, Olga Mula, James Nichols
article
2020
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https://arxiv.org/pdf/2009.02687 BibTex

2019

Journal articles

titre
Mitral valve repair based on intraoperative objective measurement
auteur
Daniel Grinberg, Minh-Quyen Le, Young Joon Kwon, Miguel Angel Fernández, David Audigier, Florent Ganet, Jean-Fabien Capsal, Jean François Obadia, Pierre-Jean Cottinet
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-41173-6⟩
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BibTex
titre
A Nitsche-based formulation for fluid-structure interactions with contact
auteur
Erik Burman, Miguel Angel Fernández, Stefan Frei
article
ESAIM: Mathematical Modelling and Numerical Analysis, In press
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https://inria.hal.science/hal-01784841/file/RR-9172.pdf BibTex
titre
Existence of local strong solutions to fluid-beam and fluid-rod interaction systems
auteur
Céline Grandmont, Matthieu Hillairet, Julien Lequeurre
article
Annales de l'Institut Henri Poincaré C, Analyse non linéaire, 2019, 36 (4), pp.1105-1149. ⟨10.1016/j.anihpc.2018.10.006⟩
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https://inria.hal.science/hal-01567661/file/NS-ondes_submitted.pdf BibTex
titre
A loosely coupled scheme for fictitious domain approximations of fluid-structure interaction problems with immersed thin-walled structures
auteur
Ludovic Boilevin-Kayl, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau
article
SIAM Journal on Scientific Computing, 2019, 41 (2), pp.351-374. ⟨10.1137/18M1192779⟩
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https://inria.hal.science/hal-01811290/file/M119277-gg%20%281%29.pdf BibTex
titre
Numerical methods for immersed FSI with thin-walled structures
auteur
Ludovic Boilevin-Kayl, Miguel Angel Fernández, Jean-Frédéric Gerbeau
article
Computers and Fluids, 2019, 179, pp.744-763. ⟨10.1016/j.compfluid.2018.05.024⟩
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https://inria.hal.science/hal-01704575/file/RR-9151.pdf BibTex
titre
Well-posedness for the coupling between a viscous incompressible fluid and an elastic structure
auteur
Muriel Boulakia, Sergio Guerrero, Takeo Takahashi
article
Nonlinearity, 2019, 32, pp.3548-3592. ⟨10.1088/1361-6544/ab128c⟩
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https://inria.hal.science/hal-01939464/file/BoulakiaGuerreroTakahashi.pdf BibTex

Conference papers

titre
3D-2D Stokes-Darcy coupling for the modelling of seepage with an application to fluid-structure interaction with contact
auteur
Erik Burman, Miguel Angel Fernández, Stefan Frei, Fannie Gerosa
article
Numerical Mathematics and Advanced Applications ENUMATH 2019, Sep 2019, Egmond aan Zee, Netherlands. ⟨10.1007/978-3-030-55874-1_20⟩
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https://inria.hal.science/hal-02417042/file/EBMFSFFG19.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
A greedy dimension reduction method for classification problems
auteur
Damiano Lombardi, Fabien Raphel
article
2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-02280502/file/preprint.pdf BibTex